Result of FASTA (ccds) for
pF1KB3497
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3497, 1437 aa
1>>>pF1KB3497 1437 - 1437 aa - 1437 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.7389+/-0.00106; mu= 4.8861+/- 0.065
mean_var=256.7960+/-50.397, 0's: 0 Z-trim(112.2): 65 B-trim: 6 in 1/52
Lambda= 0.080035
statistics sampled from 12925 (12977) to 12925 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.719), E-opt: 0.2 (0.399), width: 16
Scan time: 4.700
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS43729.1 WHSC1L1 gene_id:54904|Hs108|chr8 (1437) 9958 1164.2 0
CCDS6105.1 WHSC1L1 gene_id:54904|Hs108|chr8 ( 645) 4086 485.9 1.6e-136
CCDS33940.1 WHSC1 gene_id:7468|Hs108|chr4 (1365) 2691 325.1 8.7e-88
CCDS4413.1 NSD1 gene_id:64324|Hs108|chr5 (2427) 2608 315.7 1e-84
CCDS4412.1 NSD1 gene_id:64324|Hs108|chr5 (2696) 2608 315.7 1.1e-84
CCDS2749.2 SETD2 gene_id:29072|Hs108|chr3 (2564) 672 92.2 2.1e-17
CCDS1113.2 ASH1L gene_id:55870|Hs108|chr1 (2964) 658 90.6 7.4e-17
CCDS46999.1 WHSC1 gene_id:7468|Hs108|chr4 ( 629) 560 78.8 5.6e-14
CCDS3356.1 WHSC1 gene_id:7468|Hs108|chr4 ( 647) 560 78.8 5.7e-14
>>CCDS43729.1 WHSC1L1 gene_id:54904|Hs108|chr8 (1437 aa)
initn: 9958 init1: 9958 opt: 9958 Z-score: 6224.0 bits: 1164.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 9958; 100.0% identity (100.0% similar) in 1437 aa overlap (1-1437:1-1437)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MDFSFSFMQGIMGNTIQQPPQLIDSANIRQEDAFDNNSDIAEDGGQTPYEATLQQGFQYP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MDFSFSFMQGIMGNTIQQPPQLIDSANIRQEDAFDNNSDIAEDGGQTPYEATLQQGFQYP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 ATTEDLPPLTNGYPSSISVYETQTKYQSYNQYPNGSANGFGAVRNFSPTDYYHSEIPNTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ATTEDLPPLTNGYPSSISVYETQTKYQSYNQYPNGSANGFGAVRNFSPTDYYHSEIPNTR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 PHEILEKPSPPQPPPPPSVPQTVIPKKTGSPEIKLKITKTIQNGRELFESSLCGDLLNEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PHEILEKPSPPQPPPPPSVPQTVIPKKTGSPEIKLKITKTIQNGRELFESSLCGDLLNEV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 QASEHTKSKHESRKEKRKKSNKHDSSRSEERKSHKIPKLEPEEQNRPNERVDTVSEKPRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 QASEHTKSKHESRKEKRKKSNKHDSSRSEERKSHKIPKLEPEEQNRPNERVDTVSEKPRE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 EPVLKEEAPVQPILSSVPTTEVSTGVKFQVGDLVWSKVGTYPWWPCMVSSDPQLEVHTKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 EPVLKEEAPVQPILSSVPTTEVSTGVKFQVGDLVWSKVGTYPWWPCMVSSDPQLEVHTKI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 NTRGAREYHVQFFSNQPERAWVHEKRVREYKGHKQYEELLAEATKQASNHSEKQKIRKPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 NTRGAREYHVQFFSNQPERAWVHEKRVREYKGHKQYEELLAEATKQASNHSEKQKIRKPR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 PQRERAQWDIGIAHAEKALKMTREERIEQYTFIYIDKQPEEALSQAKKSVASKTEVKKTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PQRERAQWDIGIAHAEKALKMTREERIEQYTFIYIDKQPEEALSQAKKSVASKTEVKKTR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 RPRSVLNTQPEQTNAGEVASSLSSTEIRRHSQRRHTSAEEEEPPPVKIAWKTAAARKSLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RPRSVLNTQPEQTNAGEVASSLSSTEIRRHSQRRHTSAEEEEPPPVKIAWKTAAARKSLP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 ASITMHKGSLDLQKCNMSPVVKIEQVFALQNATGDGKFIDQFVYSTKGIGNKTEISVRGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ASITMHKGSLDLQKCNMSPVVKIEQVFALQNATGDGKFIDQFVYSTKGIGNKTEISVRGQ
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 DRLIISTPNQRNEKPTQSVSSPEATSGSTGSVEKKQQRRSIRTRSESEKSTEVVPKKKIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 DRLIISTPNQRNEKPTQSVSSPEATSGSTGSVEKKQQRRSIRTRSESEKSTEVVPKKKIK
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 KEQVETVPQATVKTGLQKGASEISDSCKPLKKRSRASTDVEMTSSAYRDTSDSDSRGLSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 KEQVETVPQATVKTGLQKGASEISDSCKPLKKRSRASTDVEMTSSAYRDTSDSDSRGLSD
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB3 LQVGFGKQVDSPSATADADVSDVQSMDSSLSRRGTGMSKKDTVCQICESSGDSLIPCEGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LQVGFGKQVDSPSATADADVSDVQSMDSSLSRRGTGMSKKDTVCQICESSGDSLIPCEGE
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB3 CCKHFHLECLGLASLPDSKFICMECKTGQHPCFSCKVSGKDVKRCSVGACGKFYHEACVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 CCKHFHLECLGLASLPDSKFICMECKTGQHPCFSCKVSGKDVKRCSVGACGKFYHEACVR
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB3 KFPTAIFESKGFRCPQHCCSACSMEKDIHKASKGRMMRCLRCPVAYHSGDACIAAGSMLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 KFPTAIFESKGFRCPQHCCSACSMEKDIHKASKGRMMRCLRCPVAYHSGDACIAAGSMLV
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB3 SSYILICSNHSKRSSNSSAVNVGFCFVCARGLIVQDHSDPMFSSYAYKSHYLLNESNRAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SSYILICSNHSKRSSNSSAVNVGFCFVCARGLIVQDHSDPMFSSYAYKSHYLLNESNRAE
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB3 LMKLPMIPSSSASKKKCEKGGRLLCCESCPASFHPECLSIEMPEGCWNCNDCKAGKKLHY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LMKLPMIPSSSASKKKCEKGGRLLCCESCPASFHPECLSIEMPEGCWNCNDCKAGKKLHY
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB3 KQIVWVKLGNYRWWPAEICNPRSVPLNIQGLKHDLGDFPVFFFGSHDYYWVHQGRVFPYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 KQIVWVKLGNYRWWPAEICNPRSVPLNIQGLKHDLGDFPVFFFGSHDYYWVHQGRVFPYV
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB3 EGDKSFAEGQTSINKTFKKALEEAAKRFQELKAQRESKEALEIEKNSRKPPPYKHIKANK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 EGDKSFAEGQTSINKTFKKALEEAAKRFQELKAQRESKEALEIEKNSRKPPPYKHIKANK
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KB3 VIGKVQIQVADLSEIPRCNCKPADENPCGLESECLNRMLQYECHPQVCPAGDRCQNQCFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 VIGKVQIQVADLSEIPRCNCKPADENPCGLESECLNRMLQYECHPQVCPAGDRCQNQCFT
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KB3 KRLYPDAEIIKTERRGWGLRTKRSIKKGEFVNEYVGELIDEEECRLRIKRAHENSVTNFY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 KRLYPDAEIIKTERRGWGLRTKRSIKKGEFVNEYVGELIDEEECRLRIKRAHENSVTNFY
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KB3 MLTVTKDRIIDAGPKGNYSRFMNHSCNPNCETQKWTVNGDVRVGLFALCDIPAGMELTFN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MLTVTKDRIIDAGPKGNYSRFMNHSCNPNCETQKWTVNGDVRVGLFALCDIPAGMELTFN
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KB3 YNLDCLGNGRTECHCGADNCSGFLGVRPKSACASTNEEKAKNAKLKQKRRKIKTEPKQMH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 YNLDCLGNGRTECHCGADNCSGFLGVRPKSACASTNEEKAKNAKLKQKRRKIKTEPKQMH
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KB3 EDYCFQCGDGGELVMCDKKDCPKAYHLLCLNLTQPPYGKWECPWHQCDECSSAAVSFCEF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 EDYCFQCGDGGELVMCDKKDCPKAYHLLCLNLTQPPYGKWECPWHQCDECSSAAVSFCEF
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430
pF1KB3 CPHSFCKDHEKGALVPSALEGRLCCSEHDPMAPVSPEYWSKIKCKWESQDHGEEVKE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 CPHSFCKDHEKGALVPSALEGRLCCSEHDPMAPVSPEYWSKIKCKWESQDHGEEVKE
1390 1400 1410 1420 1430
>>CCDS6105.1 WHSC1L1 gene_id:54904|Hs108|chr8 (645 aa)
initn: 4188 init1: 4086 opt: 4086 Z-score: 2564.6 bits: 485.9 E(32554): 1.6e-136
Smith-Waterman score: 4086; 99.5% identity (100.0% similar) in 622 aa overlap (1-622:1-622)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MDFSFSFMQGIMGNTIQQPPQLIDSANIRQEDAFDNNSDIAEDGGQTPYEATLQQGFQYP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 MDFSFSFMQGIMGNTIQQPPQLIDSANIRQEDAFDNNSDIAEDGGQTPYEATLQQGFQYP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 ATTEDLPPLTNGYPSSISVYETQTKYQSYNQYPNGSANGFGAVRNFSPTDYYHSEIPNTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 ATTEDLPPLTNGYPSSISVYETQTKYQSYNQYPNGSANGFGAVRNFSPTDYYHSEIPNTR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 PHEILEKPSPPQPPPPPSVPQTVIPKKTGSPEIKLKITKTIQNGRELFESSLCGDLLNEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 PHEILEKPSPPQPPPPPSVPQTVIPKKTGSPEIKLKITKTIQNGRELFESSLCGDLLNEV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 QASEHTKSKHESRKEKRKKSNKHDSSRSEERKSHKIPKLEPEEQNRPNERVDTVSEKPRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 QASEHTKSKHESRKEKRKKSNKHDSSRSEERKSHKIPKLEPEEQNRPNERVDTVSEKPRE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 EPVLKEEAPVQPILSSVPTTEVSTGVKFQVGDLVWSKVGTYPWWPCMVSSDPQLEVHTKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 EPVLKEEAPVQPILSSVPTTEVSTGVKFQVGDLVWSKVGTYPWWPCMVSSDPQLEVHTKI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 NTRGAREYHVQFFSNQPERAWVHEKRVREYKGHKQYEELLAEATKQASNHSEKQKIRKPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 NTRGAREYHVQFFSNQPERAWVHEKRVREYKGHKQYEELLAEATKQASNHSEKQKIRKPR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 PQRERAQWDIGIAHAEKALKMTREERIEQYTFIYIDKQPEEALSQAKKSVASKTEVKKTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 PQRERAQWDIGIAHAEKALKMTREERIEQYTFIYIDKQPEEALSQAKKSVASKTEVKKTR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 RPRSVLNTQPEQTNAGEVASSLSSTEIRRHSQRRHTSAEEEEPPPVKIAWKTAAARKSLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 RPRSVLNTQPEQTNAGEVASSLSSTEIRRHSQRRHTSAEEEEPPPVKIAWKTAAARKSLP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 ASITMHKGSLDLQKCNMSPVVKIEQVFALQNATGDGKFIDQFVYSTKGIGNKTEISVRGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 ASITMHKGSLDLQKCNMSPVVKIEQVFALQNATGDGKFIDQFVYSTKGIGNKTEISVRGQ
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 DRLIISTPNQRNEKPTQSVSSPEATSGSTGSVEKKQQRRSIRTRSESEKSTEVVPKKKIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 DRLIISTPNQRNEKPTQSVSSPEATSGSTGSVEKKQQRRSIRTRSESEKSTEVVPKKKIK
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 KEQVETVPQATVKTGLQKGASEISDSCKPLKKRSRASTDVEMTSSAYRDTSDSDSRGLSD
:::::::::::::::::::...
CCDS61 KEQVETVPQATVKTGLQKGSADRGVQGSVRFSDSSVSAAIEETVD
610 620 630 640
>>CCDS33940.1 WHSC1 gene_id:7468|Hs108|chr4 (1365 aa)
initn: 3744 init1: 1867 opt: 2691 Z-score: 1689.5 bits: 325.1 E(32554): 8.7e-88
Smith-Waterman score: 4037; 46.6% identity (69.3% similar) in 1354 aa overlap (98-1409:66-1327)
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 PLTNGYPSSISVYETQTKYQSYNQYPNGSANGFGAVRNFSPTDYYH---SEIPNTRP--H
:: :. : :.: . :.. : .: :
CCDS33 PSCEVNRECSVFLSKAQLSSSLQEGVMQKFNGHDAL-PFIPADKLKDLTSRVFNGEPGAH
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 EILEKPSPPQPPPPPSVPQTVIPKKTGSPEIKLKITKTIQNGRELFESSLCGDLLNEVQA
. . : ..: .. : :.:::::::::::: .::. :::::.::: .:.
CCDS33 DAKLR-FESQEMKGIGTPPNTTPIKNGSPEIKLKITKTYMNGKPLFESSICGDSAADVSQ
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 SEHTKSKHESR-KEKRKKSNKHDSSRSEERKSHKIPKLEPEEQNRPNERVDTVSEKPREE
::.. .: :.. ...::.: :.:: . . . .... :.: .
CCDS33 SEENGQKPENKARRNRKRSIKYDSLLEQGLVEAALVS-----------KISSPSDK--KI
160 170 180 190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 PVLKEEAPVQPILSSVPTTEVSTGVKFQVGDLVWSKVGTYPWWPCMVSSDPQLEVHTKIN
:. :: : . . .:..:::::::::. :::::::::.:: :. .::..
CCDS33 PAKKESCPNTG-------RDKDHLLKYNVGDLVWSKVSGYPWWPCMVSADPLLHSYTKLK
210 220 230 240 250
310 320 330 340 350
pF1KB3 --TRGAREYHVQFFSNQPERAWVHEKRVREYKGHKQYEELLAEATKQASNHSEKQKIRKP
..::.::::::.. :::::. :: . ..:. :.:.: :..::: ...:: :. ::
CCDS33 GQKKSARQYHVQFFGDAPERAWIFEKSLVAFEGEGQFEKLCQESAKQAPTKAEKIKLLKP
260 270 280 290 300 310
360 370 380 390 400 410
pF1KB3 RPQRERAQWDIGIAHAEKALKMTREERIEQYTFIYIDKQPEEALSQAKKSVASKTEVKKT
. ::::..::..::.: .:. ::: ..::.:. : . . ::.. . . .
CCDS33 ISGKLRAQWEMGIVQAEEAASMSVEERKAKFTFLYVGDQLHLNPQVAKEAGIAAESLGEM
320 330 340 350 360 370
420 430 440 450 460 470
pF1KB3 RRPRSVLNTQPEQTNAGEVASSLSSTEI---RRHSQRRHTSAEEEEPPP---VKIAWKTA
. .: . .:.: .:. : ::. . .::: : : . :::
CCDS33 AESSGV------SEEAAENPKSVREECIPMKRRRRAKLCSSAETLESHPDIGKSTPQKTA
380 390 400 410 420
480 490 500 510 520 530
pF1KB3 AA--RKSLPASITMHKGSLDLQKCNMSPVVKIEQVFALQNATGDGKFIDQFVYSTKGI-G
: :... . .: .... . . ... :: : :. : :
CCDS33 EADPRRGVGSPPGRKKTTVSMPRSRKGDAASQFLVFCQ-------KHRDEVVAEHPDASG
430 440 450 460 470 480
540 550 560 570 580
pF1KB3 NKTEISVRGQDRLIISTPNQRNEKPTQ-SVSSPEATSGSTGSVEKKQQRRSIRTRSESEK
.. : .:.: :. . .:: . :. .. .: . ..:.:. :.. .. : .. .:
CCDS33 EEIEELLRSQWSLL--SEKQRARYNTKFALVAPVQAEEDSGNVNGKKRNHTKRIQDPTED
490 500 510 520 530
590 600 610 620 630
pF1KB3 S-TEVVPKKKIKKEQ-----VETVPQATVKTGL------------QKGASEISDSCKPLK
. .: .:.:... .. .:. . :..:. : .....::.:::::
CCDS33 AEAEDTPRKRLRTDKHSLRKRDTITDKTARTSSYKAMEAASSLKSQAATKNLSDACKPLK
540 550 560 570 580 590
640 650 660 670 680 690
pF1KB3 KRSRASTDVEMTSSAYRDTSDSDSRGLSDLQVGFGKQ-VDSPSATADADVSDVQSMDSSL
::.:::: . . . ...: : : .... . : . .:: .:: ..: :..:.
CCDS33 KRNRASTAASSALGFSKSSSPSASLTENEVSDSPGDEPSESPYESADETQTEV-SVSSKK
600 610 620 630 640 650
700 710 720 730 740 750
pF1KB3 SRRGTGMSKKDTVCQICESSGDSLIPCEGECCKHFHLECLGLASLPDSKFICMECKTGQH
:.::. .::. :::.::. : ::. ::: :: ::: ::::. :...: : :: .: :
CCDS33 SERGV-TAKKEYVCQLCEKPG-SLLLCEGPCCGAFHLACLGLSRRPEGRFTCSECASGIH
660 670 680 690 700 710
760 770 780 790 800
pF1KB3 PCFSCKVSGKDVKRCSVGACGKFYHEACVRKFPTAIFESKGFRCPQHCCSACSMEKDIH-
:: :: : ::::: : ::::::::::.:.: ..:::.::::: : : .: . .
CCDS33 SCFVCKESKTDVKRCVVTQCGKFYHEACVKKYPLTVFESRGFRCPLHSCVSCHASNPSNP
720 730 740 750 760 770
810 820 830 840 850 860
pF1KB3 KASKGRMMRCLRCPVAYHSGDACIAAGSMLVSSYILICSNH---SKRSSNSSAVNVGFCF
. :::.::::.::::::::::::.::: ...: .::. : : . . . :::..::
CCDS33 RPSKGKMMRCVRCPVAYHSGDACLAAGCSVIASNSIICTAHFTARKGKRHHAHVNVSWCF
780 790 800 810 820 830
870 880 890 900 910 920
pF1KB3 VCARGLIVQDHSDPMFSSYAYKSHYLLNESNRAELMKLPMIPSSSASKKKCEKGGRLLCC
::. ::: ::::
CCDS33 VCS-------------------------------------------------KGGSLLCC
840
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CCDS44 RCNCKATDENPCGIDSECINRMLLYECHPTVCPAGGRCQNQCFSKRQYPEVEIFRTLQRG
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CCDS44 WGLRTKTDIKKGEFVNEYVGELIDEEECRARIRYAQEHDITNFYMLTLDKDRIIDAGPKG
1960 1970 1980 1990 2000 2010
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pF1KB3 ADNCSGFLGVRPKSACASTNEEKAKNAKLKQKRRKIKTEPKQMHEDYCFQCGDGGELVMC
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CCDS44 KKPGCPKVYHADCLNLTKRPAGKWECPWHQCDICGKEAASFCEMCPSSFCKQHREGMLFI
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CCDS44 SKLDGRLSCTEHDPCGPNPLEPGEIREYVPPPVPLPPGPSTHLAEQSTGMAAQAPKMSDK
2200 2210 2220 2230 2240 2250
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CCDS27 CAKQGKMPCYFDLIEENVYLTERKKNKSHRDIKRMQCECTPLSKDERAQ----GEIACG-
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CCDS27 VLEYCGEVLDHKEFKARVKEYARNKNIHYYFMALKNDEIIDATQKGNCSRFMNHSCEPNC
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. .: ..:.:..: . :
CCDS27 SI------RAAGGKMKKERSRKKDSVDGELEALMENGEGLSDKNQVLSLSRLMVRIETLE
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. . .: . .:.: .:. : ::. . .::: : : . :
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pF1KB3 -GNKTEISVRGQDRLIISTPNQRNEKPTQ-SVSSPEATSGSTGSVEKKQQRRSIRTRSES
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::::.:::: . .:. . :.: : .:.. .:
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pF1KB3 PLTNGYPSSISVYETQTKYQSYNQYPNGSANGFGAVRNFSPTDYYH---SEIPNTRP--H
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CCDS33 PSCEVNRECSVFLSKAQLSSSLQEGVMQKFNGHDAL-PFIPADKLKDLTSRVFNGEPGAH
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pF1KB3 EILEKPSPPQPPPPPSVPQTVIPKKTGSPEIKLKITKTIQNGRELFESSLCGDLLNEVQA
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CCDS33 DAKLR-FESQEMKGIGTPPNTTPIKNGSPEIKLKITKTYMNGKPLFESSICGDSAADVSQ
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pF1KB3 SEHTKSKHESR-KEKRKKSNKHDSSRSEERKSHKIPKLEPEEQNRPNERVDTVSEKPREE
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CCDS33 SEENGQKPENKARRNRKRSIKYDSLLEQGLVEAALVS-----------KISSPSDK--KI
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CCDS33 PAKKESCPNTG-------RDKDHLLKYNVGDLVWSKVSGYPWWPCMVSADPLLHSYTKLK
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pF1KB3 --TRGAREYHVQFFSNQPERAWVHEKRVREYKGHKQYEELLAEATKQASNHSEKQKIRKP
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CCDS33 GQKKSARQYHVQFFGDAPERAWIFEKSLVAFEGEGQFEKLCQESAKQAPTKAEKIKLLKP
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CCDS33 ISGKLRAQWEMGIVQAEEAASMSVEERKAKFTFLYVGDQLHLNPQVAKEAGIAAESLGEM
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CCDS33 AESSGV------SEEAAENPKSVREECIPMKRRRRAKLCSSAETLESHPDIGKSTPQKTA
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CCDS33 EADPRRGVGSPPGRKKTTVSMPRSRKGDAASQFLVFC-------QKHRDEVVAEHPDASG
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CCDS33 EEIEELLRSQWSLL--SEKQRARYNTKFALVAPVQAEEDSGNVNGKKRNHTKRIQDPTED
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CCDS33 AEAEDTPRKRLRTDKHSLRKRDTITDKTARTSSYKAMEAASSLKSQAATKNLSDACKPLK
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CCDS33 KRNRASTAASSALGFSKSSSPSASLTENELLWEPTPVKLDLNPAALYCT
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1437 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Wed Nov 2 22:46:59 2016 done: Wed Nov 2 22:47:00 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]