FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB3497, 1437 aa 1>>>pF1KB3497 1437 - 1437 aa - 1437 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.1288+/-0.00044; mu= 2.6069+/- 0.028 mean_var=304.9574+/-62.320, 0's: 0 Z-trim(120.3): 196 B-trim: 1156 in 1/59 Lambda= 0.073444 statistics sampled from 35119 (35333) to 35119 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.721), E-opt: 0.2 (0.414), width: 16 Scan time: 12.770 The best scores are: opt bits E(85289) NP_075447 (OMIM: 607083) histone-lysine N-methyltr (1437) 9958 1070.1 0 NP_060248 (OMIM: 607083) histone-lysine N-methyltr ( 645) 4086 447.6 1.4e-124 XP_005248059 (OMIM: 194190,602952) PREDICTED: hist (1296) 2692 300.2 6.8e-80 NP_579890 (OMIM: 194190,602952) histone-lysine N-m (1365) 2691 300.1 7.6e-80 XP_011511859 (OMIM: 194190,602952) PREDICTED: hist (1365) 2691 300.1 7.6e-80 NP_579877 (OMIM: 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NP_060 KEQVETVPQATVKTGLQKGSADRGVQGSVRFSDSSVSAAIEETVD 610 620 630 640 >>XP_005248059 (OMIM: 194190,602952) PREDICTED: histone- (1296 aa) initn: 3708 init1: 1867 opt: 2692 Z-score: 1555.4 bits: 300.2 E(85289): 6.8e-80 Smith-Waterman score: 3895; 46.3% identity (67.7% similar) in 1336 aa overlap (98-1409:66-1258) 70 80 90 100 110 120 pF1KB3 PLTNGYPSSISVYETQTKYQSYNQYPNGSANGFGAVRNFSPTDYYH---SEIPNTRP--H :: :. : :.: . :.. : .: : XP_005 PSCEVNRECSVFLSKAQLSSSLQEGVMQKFNGHDAL-PFIPADKLKDLTSRVFNGEPGAH 40 50 60 70 80 90 130 140 150 160 170 180 pF1KB3 EILEKPSPPQPPPPPSVPQTVIPKKTGSPEIKLKITKTIQNGRELFESSLCGDLLNEVQA . . : ..: .. : :.:::::::::::: .::. :::::.::: .:. XP_005 DAKLR-FESQEMKGIGTPPNTTPIKNGSPEIKLKITKTYMNGKPLFESSICGDSAADVSQ 100 110 120 130 140 150 190 200 210 220 230 240 pF1KB3 SEHTKSKHESR-KEKRKKSNKHDSSRSEERKSHKIPKLEPEEQNRPNERVDTVSEKPREE ::.. .: :.. ...::.: :.:: . . . .... :.: . XP_005 SEENGQKPENKARRNRKRSIKYDSLLEQGLVEAALVS-----------KISSPSDK--KI 160 170 180 190 200 250 260 270 280 290 300 pF1KB3 PVLKEEAPVQPILSSVPTTEVSTGVKFQVGDLVWSKVGTYPWWPCMVSSDPQLEVHTKIN :. :: : . . .:..:::::::::. :::::::::.:: :. .::.. XP_005 PAKKESCPNTG-------RDKDHLLKYNVGDLVWSKVSGYPWWPCMVSADPLLHSYTKLK 210 220 230 240 250 310 320 330 340 350 pF1KB3 --TRGAREYHVQFFSNQPERAWVHEKRVREYKGHKQYEELLAEATKQASNHSEKQKIRKP ..::.::::::.. :::::. :: . ..:. :.:.: :..::: ...:: :. :: XP_005 GQKKSARQYHVQFFGDAPERAWIFEKSLVAFEGEGQFEKLCQESAKQAPTKAEKIKLLKP 260 270 280 290 300 310 360 370 380 390 400 410 pF1KB3 RPQRERAQWDIGIAHAEKALKMTREERIEQYTFIYIDKQPEEALSQAKKSVASKTEVKKT . ::::..::..::.: .:. ::: ..::.:. : . . ::.. . . . 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