Result of FASTA (ccds) for
pF1KB3513
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3513, 1023 aa
1>>>pF1KB3513 1023 - 1023 aa - 1023 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7889+/-0.00106; mu= 18.6105+/- 0.063
mean_var=71.1349+/-14.185, 0's: 0 Z-trim(103.3): 63 B-trim: 0 in 0/49
Lambda= 0.152066
statistics sampled from 7269 (7331) to 7269 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.577), E-opt: 0.2 (0.225), width: 16
Scan time: 4.480
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS887.1 ATP1A1 gene_id:476|Hs108|chr1 (1023) 6746 1490.1 0
CCDS53351.1 ATP1A1 gene_id:476|Hs108|chr1 (1023) 6718 1483.9 0
CCDS53352.1 ATP1A1 gene_id:476|Hs108|chr1 ( 992) 6535 1443.8 0
CCDS58664.1 ATP1A3 gene_id:478|Hs108|chr19 (1026) 5943 1313.9 0
CCDS1196.1 ATP1A2 gene_id:477|Hs108|chr1 (1020) 5942 1313.7 0
CCDS58663.1 ATP1A3 gene_id:478|Hs108|chr19 (1024) 5922 1309.3 0
CCDS12594.1 ATP1A3 gene_id:478|Hs108|chr19 (1013) 5919 1308.6 0
CCDS1197.1 ATP1A4 gene_id:480|Hs108|chr1 (1029) 5336 1180.7 0
CCDS12467.1 ATP4A gene_id:495|Hs108|chr19 (1035) 4428 981.5 0
CCDS31948.1 ATP12A gene_id:479|Hs108|chr13 (1039) 4411 977.8 0
CCDS53858.1 ATP12A gene_id:479|Hs108|chr13 (1045) 4389 973.0 0
CCDS44255.1 ATP1A4 gene_id:480|Hs108|chr1 ( 165) 946 217.3 2.1e-56
CCDS45580.1 ATP2A3 gene_id:489|Hs108|chr17 ( 998) 522 124.6 1e-27
CCDS45579.1 ATP2A3 gene_id:489|Hs108|chr17 ( 999) 522 124.6 1e-27
CCDS42234.1 ATP2A3 gene_id:489|Hs108|chr17 (1029) 522 124.6 1.1e-27
CCDS11041.1 ATP2A3 gene_id:489|Hs108|chr17 (1043) 522 124.6 1.1e-27
CCDS11042.1 ATP2A3 gene_id:489|Hs108|chr17 (1052) 522 124.6 1.1e-27
CCDS42207.1 ATP2C2 gene_id:9914|Hs108|chr16 ( 946) 516 123.3 2.4e-27
CCDS46913.1 ATP2C1 gene_id:27032|Hs108|chr3 ( 888) 513 122.6 3.6e-27
CCDS56281.1 ATP2C1 gene_id:27032|Hs108|chr3 ( 903) 513 122.6 3.7e-27
CCDS46914.1 ATP2C1 gene_id:27032|Hs108|chr3 ( 919) 513 122.6 3.7e-27
CCDS56280.1 ATP2C1 gene_id:27032|Hs108|chr3 ( 923) 513 122.6 3.8e-27
CCDS46912.1 ATP2C1 gene_id:27032|Hs108|chr3 ( 939) 513 122.6 3.8e-27
CCDS56279.1 ATP2C1 gene_id:27032|Hs108|chr3 ( 944) 513 122.6 3.8e-27
CCDS33856.1 ATP2C1 gene_id:27032|Hs108|chr3 ( 949) 513 122.6 3.8e-27
CCDS75006.1 ATP2C1 gene_id:27032|Hs108|chr3 ( 953) 513 122.6 3.9e-27
CCDS56278.1 ATP2C1 gene_id:27032|Hs108|chr3 ( 973) 513 122.6 3.9e-27
CCDS9144.1 ATP2A2 gene_id:488|Hs108|chr12 (1042) 493 118.3 8.7e-26
CCDS9143.1 ATP2A2 gene_id:488|Hs108|chr12 ( 997) 490 117.6 1.3e-25
CCDS66997.1 ATP2A1 gene_id:487|Hs108|chr16 ( 869) 488 117.1 1.6e-25
CCDS42139.1 ATP2A1 gene_id:487|Hs108|chr16 ( 994) 488 117.2 1.8e-25
CCDS10643.1 ATP2A1 gene_id:487|Hs108|chr16 (1001) 488 117.2 1.8e-25
CCDS67088.1 ATP2C2 gene_id:9914|Hs108|chr16 ( 975) 464 111.9 6.8e-24
CCDS30977.1 ATP2B4 gene_id:493|Hs108|chr1 (1170) 408 99.6 4e-20
CCDS1440.1 ATP2B4 gene_id:493|Hs108|chr1 (1205) 408 99.6 4.1e-20
CCDS82733.1 ATP2B2 gene_id:491|Hs108|chr3 (1154) 405 99.0 6.2e-20
CCDS41817.1 ATP2B1 gene_id:490|Hs108|chr12 (1176) 405 99.0 6.3e-20
CCDS2601.1 ATP2B2 gene_id:491|Hs108|chr3 (1198) 405 99.0 6.4e-20
CCDS9035.1 ATP2B1 gene_id:490|Hs108|chr12 (1220) 405 99.0 6.5e-20
CCDS33701.1 ATP2B2 gene_id:491|Hs108|chr3 (1243) 405 99.0 6.6e-20
CCDS14722.1 ATP2B3 gene_id:492|Hs108|chrX (1173) 401 98.1 1.2e-19
CCDS35440.1 ATP2B3 gene_id:492|Hs108|chrX (1220) 401 98.1 1.2e-19
>>CCDS887.1 ATP1A1 gene_id:476|Hs108|chr1 (1023 aa)
initn: 6746 init1: 6746 opt: 6746 Z-score: 7990.4 bits: 1490.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6746; 100.0% identity (100.0% similar) in 1023 aa overlap (1-1023:1-1023)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MGKGVGRDKYEPAAVSEQGDKKGKKGKKDRDMDELKKEVSMDDHKLSLDELHRKYGTDLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 MGKGVGRDKYEPAAVSEQGDKKGKKGKKDRDMDELKKEVSMDDHKLSLDELHRKYGTDLS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 RGLTSARAAEILARDGPNALTPPPTTPEWIKFCRQLFGGFSMLLWIGAILCFLAYSIQAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 RGLTSARAAEILARDGPNALTPPPTTPEWIKFCRQLFGGFSMLLWIGAILCFLAYSIQAA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 TEEEPQNDNLYLGVVLSAVVIITGCFSYYQEAKSSKIMESFKNMVPQQALVIRNGEKMSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 TEEEPQNDNLYLGVVLSAVVIITGCFSYYQEAKSSKIMESFKNMVPQQALVIRNGEKMSI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 NAEEVVVGDLVEVKGGDRIPADLRIISANGCKVDNSSLTGESEPQTRSPDFTNENPLETR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 NAEEVVVGDLVEVKGGDRIPADLRIISANGCKVDNSSLTGESEPQTRSPDFTNENPLETR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 NIAFFSTNCVEGTARGIVVYTGDRTVMGRIATLASGLEGGQTPIAAEIEHFIHIITGVAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 NIAFFSTNCVEGTARGIVVYTGDRTVMGRIATLASGLEGGQTPIAAEIEHFIHIITGVAV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 FLGVSFFILSLILEYTWLEAVIFLIGIIVANVPEGLLATVTVCLTLTAKRMARKNCLVKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 FLGVSFFILSLILEYTWLEAVIFLIGIIVANVPEGLLATVTVCLTLTAKRMARKNCLVKN
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 LEAVETLGSTSTICSDKTGTLTQNRMTVAHMWFDNQIHEADTTENQSGVSFDKTSATWLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 LEAVETLGSTSTICSDKTGTLTQNRMTVAHMWFDNQIHEADTTENQSGVSFDKTSATWLA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 LSRIAGLCNRAVFQANQENLPILKRAVAGDASESALLKCIELCCGSVKEMRERYAKIVEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 LSRIAGLCNRAVFQANQENLPILKRAVAGDASESALLKCIELCCGSVKEMRERYAKIVEI
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 PFNSTNKYQLSIHKNPNTSEPQHLLVMKGAPERILDRCSSILLHGKEQPLDEELKDAFQN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 PFNSTNKYQLSIHKNPNTSEPQHLLVMKGAPERILDRCSSILLHGKEQPLDEELKDAFQN
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 AYLELGGLGERVLGFCHLFLPDEQFPEGFQFDTDDVNFPIDNLCFVGLISMIDPPRAAVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 AYLELGGLGERVLGFCHLFLPDEQFPEGFQFDTDDVNFPIDNLCFVGLISMIDPPRAAVP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 DAVGKCRSAGIKVIMVTGDHPITAKAIAKGVGIISEGNETVEDIAARLNIPVSQVNPRDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 DAVGKCRSAGIKVIMVTGDHPITAKAIAKGVGIISEGNETVEDIAARLNIPVSQVNPRDA
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB3 KACVVHGSDLKDMTSEQLDDILKYHTEIVFARTSPQQKLIIVEGCQRQGAIVAVTGDGVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 KACVVHGSDLKDMTSEQLDDILKYHTEIVFARTSPQQKLIIVEGCQRQGAIVAVTGDGVN
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB3 DSPALKKADIGVAMGIAGSDVSKQAADMILLDDNFASIVTGVEEGRLIFDNLKKSIAYTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 DSPALKKADIGVAMGIAGSDVSKQAADMILLDDNFASIVTGVEEGRLIFDNLKKSIAYTL
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB3 TSNIPEITPFLIFIIANIPLPLGTVTILCIDLGTDMVPAISLAYEQAESDIMKRQPRNPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 TSNIPEITPFLIFIIANIPLPLGTVTILCIDLGTDMVPAISLAYEQAESDIMKRQPRNPK
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB3 TDKLVNERLISMAYGQIGMIQALGGFFTYFVILAENGFLPIHLLGLRVDWDDRWINDVED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 TDKLVNERLISMAYGQIGMIQALGGFFTYFVILAENGFLPIHLLGLRVDWDDRWINDVED
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB3 SYGQQWTYEQRKIVEFTCHTAFFVSIVVVQWADLVICKTRRNSVFQQGMKNKILIFGLFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 SYGQQWTYEQRKIVEFTCHTAFFVSIVVVQWADLVICKTRRNSVFQQGMKNKILIFGLFE
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB3 ETALAAFLSYCPGMGVALRMYPLKPTWWFCAFPYSLLIFVYDEVRKLIIRRRPGGWVEKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 ETALAAFLSYCPGMGVALRMYPLKPTWWFCAFPYSLLIFVYDEVRKLIIRRRPGGWVEKE
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB3 TYY
:::
CCDS88 TYY
>>CCDS53351.1 ATP1A1 gene_id:476|Hs108|chr1 (1023 aa)
initn: 6717 init1: 6717 opt: 6718 Z-score: 7957.2 bits: 1483.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6718; 99.7% identity (99.8% similar) in 1023 aa overlap (1-1023:1-1023)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MGKGVGRDKYEPAAVSEQGDKKGKKGKKDRDMDELKKEVSMDDHKLSLDELHRKYGTDLS
:. ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MAFKVGRDKYEPAAVSEQGDKKGKKGKKDRDMDELKKEVSMDDHKLSLDELHRKYGTDLS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 RGLTSARAAEILARDGPNALTPPPTTPEWIKFCRQLFGGFSMLLWIGAILCFLAYSIQAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 RGLTSARAAEILARDGPNALTPPPTTPEWIKFCRQLFGGFSMLLWIGAILCFLAYSIQAA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 TEEEPQNDNLYLGVVLSAVVIITGCFSYYQEAKSSKIMESFKNMVPQQALVIRNGEKMSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 TEEEPQNDNLYLGVVLSAVVIITGCFSYYQEAKSSKIMESFKNMVPQQALVIRNGEKMSI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 NAEEVVVGDLVEVKGGDRIPADLRIISANGCKVDNSSLTGESEPQTRSPDFTNENPLETR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 NAEEVVVGDLVEVKGGDRIPADLRIISANGCKVDNSSLTGESEPQTRSPDFTNENPLETR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 NIAFFSTNCVEGTARGIVVYTGDRTVMGRIATLASGLEGGQTPIAAEIEHFIHIITGVAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 NIAFFSTNCVEGTARGIVVYTGDRTVMGRIATLASGLEGGQTPIAAEIEHFIHIITGVAV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 FLGVSFFILSLILEYTWLEAVIFLIGIIVANVPEGLLATVTVCLTLTAKRMARKNCLVKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 FLGVSFFILSLILEYTWLEAVIFLIGIIVANVPEGLLATVTVCLTLTAKRMARKNCLVKN
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 LEAVETLGSTSTICSDKTGTLTQNRMTVAHMWFDNQIHEADTTENQSGVSFDKTSATWLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 LEAVETLGSTSTICSDKTGTLTQNRMTVAHMWFDNQIHEADTTENQSGVSFDKTSATWLA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 LSRIAGLCNRAVFQANQENLPILKRAVAGDASESALLKCIELCCGSVKEMRERYAKIVEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 LSRIAGLCNRAVFQANQENLPILKRAVAGDASESALLKCIELCCGSVKEMRERYAKIVEI
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 PFNSTNKYQLSIHKNPNTSEPQHLLVMKGAPERILDRCSSILLHGKEQPLDEELKDAFQN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 PFNSTNKYQLSIHKNPNTSEPQHLLVMKGAPERILDRCSSILLHGKEQPLDEELKDAFQN
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 AYLELGGLGERVLGFCHLFLPDEQFPEGFQFDTDDVNFPIDNLCFVGLISMIDPPRAAVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 AYLELGGLGERVLGFCHLFLPDEQFPEGFQFDTDDVNFPIDNLCFVGLISMIDPPRAAVP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 DAVGKCRSAGIKVIMVTGDHPITAKAIAKGVGIISEGNETVEDIAARLNIPVSQVNPRDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 DAVGKCRSAGIKVIMVTGDHPITAKAIAKGVGIISEGNETVEDIAARLNIPVSQVNPRDA
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB3 KACVVHGSDLKDMTSEQLDDILKYHTEIVFARTSPQQKLIIVEGCQRQGAIVAVTGDGVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 KACVVHGSDLKDMTSEQLDDILKYHTEIVFARTSPQQKLIIVEGCQRQGAIVAVTGDGVN
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB3 DSPALKKADIGVAMGIAGSDVSKQAADMILLDDNFASIVTGVEEGRLIFDNLKKSIAYTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 DSPALKKADIGVAMGIAGSDVSKQAADMILLDDNFASIVTGVEEGRLIFDNLKKSIAYTL
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB3 TSNIPEITPFLIFIIANIPLPLGTVTILCIDLGTDMVPAISLAYEQAESDIMKRQPRNPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 TSNIPEITPFLIFIIANIPLPLGTVTILCIDLGTDMVPAISLAYEQAESDIMKRQPRNPK
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB3 TDKLVNERLISMAYGQIGMIQALGGFFTYFVILAENGFLPIHLLGLRVDWDDRWINDVED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 TDKLVNERLISMAYGQIGMIQALGGFFTYFVILAENGFLPIHLLGLRVDWDDRWINDVED
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB3 SYGQQWTYEQRKIVEFTCHTAFFVSIVVVQWADLVICKTRRNSVFQQGMKNKILIFGLFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SYGQQWTYEQRKIVEFTCHTAFFVSIVVVQWADLVICKTRRNSVFQQGMKNKILIFGLFE
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB3 ETALAAFLSYCPGMGVALRMYPLKPTWWFCAFPYSLLIFVYDEVRKLIIRRRPGGWVEKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 ETALAAFLSYCPGMGVALRMYPLKPTWWFCAFPYSLLIFVYDEVRKLIIRRRPGGWVEKE
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB3 TYY
:::
CCDS53 TYY
>>CCDS53352.1 ATP1A1 gene_id:476|Hs108|chr1 (992 aa)
initn: 6535 init1: 6535 opt: 6535 Z-score: 7740.5 bits: 1443.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6535; 100.0% identity (100.0% similar) in 992 aa overlap (32-1023:1-992)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 GKGVGRDKYEPAAVSEQGDKKGKKGKKDRDMDELKKEVSMDDHKLSLDELHRKYGTDLSR
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MDELKKEVSMDDHKLSLDELHRKYGTDLSR
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 GLTSARAAEILARDGPNALTPPPTTPEWIKFCRQLFGGFSMLLWIGAILCFLAYSIQAAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 GLTSARAAEILARDGPNALTPPPTTPEWIKFCRQLFGGFSMLLWIGAILCFLAYSIQAAT
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 EEEPQNDNLYLGVVLSAVVIITGCFSYYQEAKSSKIMESFKNMVPQQALVIRNGEKMSIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 EEEPQNDNLYLGVVLSAVVIITGCFSYYQEAKSSKIMESFKNMVPQQALVIRNGEKMSIN
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 AEEVVVGDLVEVKGGDRIPADLRIISANGCKVDNSSLTGESEPQTRSPDFTNENPLETRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 AEEVVVGDLVEVKGGDRIPADLRIISANGCKVDNSSLTGESEPQTRSPDFTNENPLETRN
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 IAFFSTNCVEGTARGIVVYTGDRTVMGRIATLASGLEGGQTPIAAEIEHFIHIITGVAVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 IAFFSTNCVEGTARGIVVYTGDRTVMGRIATLASGLEGGQTPIAAEIEHFIHIITGVAVF
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 LGVSFFILSLILEYTWLEAVIFLIGIIVANVPEGLLATVTVCLTLTAKRMARKNCLVKNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 LGVSFFILSLILEYTWLEAVIFLIGIIVANVPEGLLATVTVCLTLTAKRMARKNCLVKNL
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 EAVETLGSTSTICSDKTGTLTQNRMTVAHMWFDNQIHEADTTENQSGVSFDKTSATWLAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 EAVETLGSTSTICSDKTGTLTQNRMTVAHMWFDNQIHEADTTENQSGVSFDKTSATWLAL
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 SRIAGLCNRAVFQANQENLPILKRAVAGDASESALLKCIELCCGSVKEMRERYAKIVEIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SRIAGLCNRAVFQANQENLPILKRAVAGDASESALLKCIELCCGSVKEMRERYAKIVEIP
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 FNSTNKYQLSIHKNPNTSEPQHLLVMKGAPERILDRCSSILLHGKEQPLDEELKDAFQNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 FNSTNKYQLSIHKNPNTSEPQHLLVMKGAPERILDRCSSILLHGKEQPLDEELKDAFQNA
460 470 480 490 500 510
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 YLELGGLGERVLGFCHLFLPDEQFPEGFQFDTDDVNFPIDNLCFVGLISMIDPPRAAVPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 YLELGGLGERVLGFCHLFLPDEQFPEGFQFDTDDVNFPIDNLCFVGLISMIDPPRAAVPD
520 530 540 550 560 570
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 AVGKCRSAGIKVIMVTGDHPITAKAIAKGVGIISEGNETVEDIAARLNIPVSQVNPRDAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 AVGKCRSAGIKVIMVTGDHPITAKAIAKGVGIISEGNETVEDIAARLNIPVSQVNPRDAK
580 590 600 610 620 630
670 680 690 700 710 720
pF1KB3 ACVVHGSDLKDMTSEQLDDILKYHTEIVFARTSPQQKLIIVEGCQRQGAIVAVTGDGVND
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 ACVVHGSDLKDMTSEQLDDILKYHTEIVFARTSPQQKLIIVEGCQRQGAIVAVTGDGVND
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730 740 750 760 770 780
pF1KB3 SPALKKADIGVAMGIAGSDVSKQAADMILLDDNFASIVTGVEEGRLIFDNLKKSIAYTLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SPALKKADIGVAMGIAGSDVSKQAADMILLDDNFASIVTGVEEGRLIFDNLKKSIAYTLT
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pF1KB3 SNIPEITPFLIFIIANIPLPLGTVTILCIDLGTDMVPAISLAYEQAESDIMKRQPRNPKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SNIPEITPFLIFIIANIPLPLGTVTILCIDLGTDMVPAISLAYEQAESDIMKRQPRNPKT
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850 860 870 880 890 900
pF1KB3 DKLVNERLISMAYGQIGMIQALGGFFTYFVILAENGFLPIHLLGLRVDWDDRWINDVEDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 DKLVNERLISMAYGQIGMIQALGGFFTYFVILAENGFLPIHLLGLRVDWDDRWINDVEDS
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pF1KB3 YGQQWTYEQRKIVEFTCHTAFFVSIVVVQWADLVICKTRRNSVFQQGMKNKILIFGLFEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 YGQQWTYEQRKIVEFTCHTAFFVSIVVVQWADLVICKTRRNSVFQQGMKNKILIFGLFEE
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pF1KB3 TALAAFLSYCPGMGVALRMYPLKPTWWFCAFPYSLLIFVYDEVRKLIIRRRPGGWVEKET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 TALAAFLSYCPGMGVALRMYPLKPTWWFCAFPYSLLIFVYDEVRKLIIRRRPGGWVEKET
940 950 960 970 980 990
pF1KB3 YY
::
CCDS53 YY
>>CCDS58664.1 ATP1A3 gene_id:478|Hs108|chr19 (1026 aa)
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Smith-Waterman score: 5943; 86.4% identity (95.7% similar) in 1027 aa overlap (1-1023:1-1026)
10 20 30 40 50
pF1KB3 MGKGVGRDKYEPAAVSEQGDKKGK----KGKKDRDMDELKKEVSMDDHKLSLDELHRKYG
::.: : :.:. :. ... : : . :::. ::.:.:::::.: .::.:..:. :::.
CCDS58 MGSG-GSDSYRIATSQDKKDDKDSPKKNKGKERRDLDDLKKEVAMTEHKMSVEEVCRKYN
10 20 30 40 50
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pF1KB3 TDLSRGLTSARAAEILARDGPNALTPPPTTPEWIKFCRQLFGGFSMLLWIGAILCFLAYS
:: .::: ..: ::::::::::::::::::::.:::::::::::.:::::::::::::.
CCDS58 TDCVQGLTHSKAQEILARDGPNALTPPPTTPEWVKFCRQLFGGFSILLWIGAILCFLAYG
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB3 IQAATEEEPQNDNLYLGVVLSAVVIITGCFSYYQEAKSSKIMESFKNMVPQQALVIRNGE
:::.::..:..::::::.::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::
CCDS58 IQAGTEDDPSGDNLYLGIVLAAVVIITGCFSYYQEAKSSKIMESFKNMVPQQALVIREGE
120 130 140 150 160 170
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pF1KB3 KMSINAEEVVVGDLVEVKGGDRIPADLRIISANGCKVDNSSLTGESEPQTRSPDFTNENP
::..::::::::::::.:::::.:::::::::.::::::::::::::::::::: :..::
CCDS58 KMQVNAEEVVVGDLVEIKGGDRVPADLRIISAHGCKVDNSSLTGESEPQTRSPDCTHDNP
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB3 LETRNIAFFSTNCVEGTARGIVVYTGDRTVMGRIATLASGLEGGQTPIAAEIEHFIHIIT
::::::.:::::::::::::.:: :::::::::::::::::: :.:::: ::::::..::
CCDS58 LETRNITFFSTNCVEGTARGVVVATGDRTVMGRIATLASGLEVGKTPIAIEIEHFIQLIT
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB3 GVAVFLGVSFFILSLILEYTWLEAVIFLIGIIVANVPEGLLATVTVCLTLTAKRMARKNC
::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GVAVFLGVSFFILSLILGYTWLEAVIFLIGIIVANVPEGLLATVTVCLTLTAKRMARKNC
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB3 LVKNLEAVETLGSTSTICSDKTGTLTQNRMTVAHMWFDNQIHEADTTENQSGVSFDKTSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.::::.:
CCDS58 LVKNLEAVETLGSTSTICSDKTGTLTQNRMTVAHMWFDNQIHEADTTEDQSGTSFDKSSH
360 370 380 390 400 410
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pF1KB3 TWLALSRIAGLCNRAVFQANQENLPILKRAVAGDASESALLKCIELCCGSVKEMRERYAK
::.:::.::::::::::...:.:.:.::: :::::::::::::::: :::: :::: :
CCDS58 TWVALSHIAGLCNRAVFKGGQDNIPVLKRDVAGDASESALLKCIELSSGSVKLMRERNKK
420 430 440 450 460 470
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pF1KB3 IVEIPFNSTNKYQLSIHKNPNTSEPQHLLVMKGAPERILDRCSSILLHGKEQPLDEELKD
..:::::::::::::::.. . .. ..::::::::::::::::.:::.:::::::::.:.
CCDS58 VAEIPFNSTNKYQLSIHETEDPNDNRYLLVMKGAPERILDRCSTILLQGKEQPLDEEMKE
480 490 500 510 520 530
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pF1KB3 AFQNAYLELGGLGERVLGFCHLFLPDEQFPEGFQFDTDDVNFPIDNLCFVGLISMIDPPR
::::::::::::::::::::: .::.::::.:: :: ::::: ::::::::.:::::::
CCDS58 AFQNAYLELGGLGERVLGFCHYYLPEEQFPKGFAFDCDDVNFTTDNLCFVGLMSMIDPPR
540 550 560 570 580 590
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pF1KB3 AAVPDAVGKCRSAGIKVIMVTGDHPITAKAIAKGVGIISEGNETVEDIAARLNIPVSQVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 AAVPDAVGKCRSAGIKVIMVTGDHPITAKAIAKGVGIISEGNETVEDIAARLNIPVSQVN
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KB3 PRDAKACVVHGSDLKDMTSEQLDDILKYHTEIVFARTSPQQKLIIVEGCQRQGAIVAVTG
::::::::.::.::::.::::.:.::. ::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PRDAKACVIHGTDLKDFTSEQIDEILQNHTEIVFARTSPQQKLIIVEGCQRQGAIVAVTG
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KB3 DGVNDSPALKKADIGVAMGIAGSDVSKQAADMILLDDNFASIVTGVEEGRLIFDNLKKSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 DGVNDSPALKKADIGVAMGIAGSDVSKQAADMILLDDNFASIVTGVEEGRLIFDNLKKSI
720 730 740 750 760 770
780 790 800 810 820 830
pF1KB3 AYTLTSNIPEITPFLIFIIANIPLPLGTVTILCIDLGTDMVPAISLAYEQAESDIMKRQP
:::::::::::::::.::.:::::::::.:::::::::::::::::::: ::::::::::
CCDS58 AYTLTSNIPEITPFLLFIMANIPLPLGTITILCIDLGTDMVPAISLAYEAAESDIMKRQP
780 790 800 810 820 830
840 850 860 870 880 890
pF1KB3 RNPKTDKLVNERLISMAYGQIGMIQALGGFFTYFVILAENGFLPIHLLGLRVDWDDRWIN
:::.:::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::: .:.:.:..:::: .:
CCDS58 RNPRTDKLVNERLISMAYGQIGMIQALGGFFSYFVILAENGFLPGNLVGIRLNWDDRTVN
840 850 860 870 880 890
900 910 920 930 940 950
pF1KB3 DVEDSYGQQWTYEQRKIVEFTCHTAFFVSIVVVQWADLVICKTRRNSVFQQGMKNKILIF
:.::::::::::::::.:::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::
CCDS58 DLEDSYGQQWTYEQRKVVEFTCHTAFFVSIVVVQWADLIICKTRRNSVFQQGMKNKILIF
900 910 920 930 940 950
960 970 980 990 1000 1010
pF1KB3 GLFEETALAAFLSYCPGMGVALRMYPLKPTWWFCAFPYSLLIFVYDEVRKLIIRRRPGGW
:::::::::::::::::: ::::::::::.:::::::::.:::::::.::::.:: ::::
CCDS58 GLFEETALAAFLSYCPGMDVALRMYPLKPSWWFCAFPYSFLIFVYDEIRKLILRRNPGGW
960 970 980 990 1000 1010
1020
pF1KB3 VEKETYY
:::::::
CCDS58 VEKETYY
1020
>>CCDS1196.1 ATP1A2 gene_id:477|Hs108|chr1 (1020 aa)
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Smith-Waterman score: 5942; 86.9% identity (95.9% similar) in 1024 aa overlap (1-1023:1-1020)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MGKGVGRDKYEPAAVSEQGDKKGKKGKKDRDMDELKKEVSMDDHKLSLDELHRKYGTDLS
::.:.::. : :::.. . . ::: .:....:::::::.::::::::::: ::: .:::
CCDS11 MGRGAGRE-YSPAATTAE-NGGGKKKQKEKELDELKKEVAMDDHKLSLDELGRKYQVDLS
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 RGLTSARAAEILARDGPNALTPPPTTPEWIKFCRQLFGGFSMLLWIGAILCFLAYSIQAA
.:::. :: ..::::::::::::::::::.:::::::::::.:::::::::::::.::::
CCDS11 KGLTNQRAQDVLARDGPNALTPPPTTPEWVKFCRQLFGGFSILLWIGAILCFLAYGIQAA
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 TEEEPQNDNLYLGVVLSAVVIITGCFSYYQEAKSSKIMESFKNMVPQQALVIRNGEKMSI
:.::.::::::::::.::::.::::::::::::::::.::::::::::::::.::::.:
CCDS11 MEDEPSNDNLYLGVVLAAVVIVTGCFSYYQEAKSSKIMDSFKNMVPQQALVIREGEKMQI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 NAEEVVVGDLVEVKGGDRIPADLRIISANGCKVDNSSLTGESEPQTRSPDFTNENPLETR
::::::::::::::::::.::::::::..::::::::::::::::::::.::.:::::::
CCDS11 NAEEVVVGDLVEVKGGDRVPADLRIISSHGCKVDNSSLTGESEPQTRSPEFTHENPLETR
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 NIAFFSTNCVEGTARGIVVYTGDRTVMGRIATLASGLEGGQTPIAAEIEHFIHIITGVAV
:: :::::::::::::::. :::::::::::::::::: :.:::: ::::::..::::::
CCDS11 NICFFSTNCVEGTARGIVIATGDRTVMGRIATLASGLEVGRTPIAMEIEHFIQLITGVAV
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 FLGVSFFILSLILEYTWLEAVIFLIGIIVANVPEGLLATVTVCLTLTAKRMARKNCLVKN
:::::::.::::: :.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 FLGVSFFVLSLILGYSWLEAVIFLIGIIVANVPEGLLATVTVCLTLTAKRMARKNCLVKN
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 LEAVETLGSTSTICSDKTGTLTQNRMTVAHMWFDNQIHEADTTENQSGVSFDKTSATWLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::..::: : :: :
CCDS11 LEAVETLGSTSTICSDKTGTLTQNRMTVAHMWFDNQIHEADTTEDQSGATFDKRSPTWTA
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 LSRIAGLCNRAVFQANQENLPILKRAVAGDASESALLKCIELCCGSVKEMRERYAKIVEI
:::::::::::::.:.:::. . :: .::::::::::::::: ::::..::.: :..::
CCDS11 LSRIAGLCNRAVFKAGQENISVSKRDTAGDASESALLKCIELSCGSVRKMRDRNPKVAEI
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530
pF1KB3 PFNSTNKYQLSIHKNPNTSEPQ-HLLVMKGAPERILDRCSSILLHGKEQPLDEELKDAFQ
:::::::::::::. .. :: :.:::::::::::::::.::..::: :::.:..::::
CCDS11 PFNSTNKYQLSIHEREDS--PQSHVLVMKGAPERILDRCSTILVQGKEIPLDKEMQDAFQ
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KB3 NAYLELGGLGERVLGFCHLFLPDEQFPEGFQFDTDDVNFPIDNLCFVGLISMIDPPRAAV
:::.:::::::::::::.: ::. .::.::.::::..::: ..::::::.::::::::::
CCDS11 NAYMELGGLGERVLGFCQLNLPSGKFPRGFKFDTDELNFPTEKLCFVGLMSMIDPPRAAV
540 550 560 570 580 590
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pF1KB3 PDAVGKCRSAGIKVIMVTGDHPITAKAIAKGVGIISEGNETVEDIAARLNIPVSQVNPRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::.
CCDS11 PDAVGKCRSAGIKVIMVTGDHPITAKAIAKGVGIISEGNETVEDIAARLNIPMSQVNPRE
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KB3 AKACVVHGSDLKDMTSEQLDDILKYHTEIVFARTSPQQKLIIVEGCQRQGAIVAVTGDGV
::::::::::::::::::::.::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 AKACVVHGSDLKDMTSEQLDEILKNHTEIVFARTSPQQKLIIVEGCQRQGAIVAVTGDGV
660 670 680 690 700 710
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pF1KB3 NDSPALKKADIGVAMGIAGSDVSKQAADMILLDDNFASIVTGVEEGRLIFDNLKKSIAYT
::::::::::::.::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 NDSPALKKADIGIAMGISGSDVSKQAADMILLDDNFASIVTGVEEGRLIFDNLKKSIAYT
720 730 740 750 760 770
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pF1KB3 LTSNIPEITPFLIFIIANIPLPLGTVTILCIDLGTDMVPAISLAYEQAESDIMKRQPRNP
::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::
CCDS11 LTSNIPEITPFLLFIIANIPLPLGTVTILCIDLGTDMVPAISLAYEAAESDIMKRQPRNS
780 790 800 810 820 830
840 850 860 870 880 890
pF1KB3 KTDKLVNERLISMAYGQIGMIQALGGFFTYFVILAENGFLPIHLLGLRVDWDDRWINDVE
.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: .:::.:.::::: .::.:
CCDS11 QTDKLVNERLISMAYGQIGMIQALGGFFTYFVILAENGFLPSRLLGIRLDWDDRTMNDLE
840 850 860 870 880 890
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pF1KB3 DSYGQQWTYEQRKIVEFTCHTAFFVSIVVVQWADLVICKTRRNSVFQQGMKNKILIFGLF
:::::.:::::::.::::::::::.::::::::::.:::::::::::::::::::::::.
CCDS11 DSYGQEWTYEQRKVVEFTCHTAFFASIVVVQWADLIICKTRRNSVFQQGMKNKILIFGLL
900 910 920 930 940 950
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pF1KB3 EETALAAFLSYCPGMGVALRMYPLKPTWWFCAFPYSLLIFVYDEVRKLIIRRRPGGWVEK
::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::.::::::::.:: :::::::
CCDS11 EETALAAFLSYCPGMGVALRMYPLKVTWWFCAFPYSLLIFIYDEVRKLILRRYPGGWVEK
960 970 980 990 1000 1010
1020
pF1KB3 ETYY
::::
CCDS11 ETYY
1020
>>CCDS58663.1 ATP1A3 gene_id:478|Hs108|chr19 (1024 aa)
initn: 5919 init1: 5919 opt: 5922 Z-score: 7013.4 bits: 1309.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5922; 87.1% identity (96.2% similar) in 1013 aa overlap (14-1023:12-1024)
10 20 30 40 50
pF1KB3 MGKGVGRDKYEPAAVSEQGDK---KGKKGKKDRDMDELKKEVSMDDHKLSLDELHRKYGT
:.... :: : .:::. ::.:.:::::.: .::.:..:. :::.:
CCDS58 MGGWEEERNRRATDKKDDKDSPKKNKGKERRDLDDLKKEVAMTEHKMSVEEVCRKYNT
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB3 DLSRGLTSARAAEILARDGPNALTPPPTTPEWIKFCRQLFGGFSMLLWIGAILCFLAYSI
: .::: ..: ::::::::::::::::::::.:::::::::::.:::::::::::::.:
CCDS58 DCVQGLTHSKAQEILARDGPNALTPPPTTPEWVKFCRQLFGGFSILLWIGAILCFLAYGI
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB3 QAATEEEPQNDNLYLGVVLSAVVIITGCFSYYQEAKSSKIMESFKNMVPQQALVIRNGEK
::.::..:..::::::.::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::
CCDS58 QAGTEDDPSGDNLYLGIVLAAVVIITGCFSYYQEAKSSKIMESFKNMVPQQALVIREGEK
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB3 MSINAEEVVVGDLVEVKGGDRIPADLRIISANGCKVDNSSLTGESEPQTRSPDFTNENPL
:..::::::::::::.:::::.:::::::::.::::::::::::::::::::: :..:::
CCDS58 MQVNAEEVVVGDLVEIKGGDRVPADLRIISAHGCKVDNSSLTGESEPQTRSPDCTHDNPL
180 190 200 210 220 230
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pF1KB3 ETRNIAFFSTNCVEGTARGIVVYTGDRTVMGRIATLASGLEGGQTPIAAEIEHFIHIITG
:::::.:::::::::::::.:: :::::::::::::::::: :.:::: ::::::..:::
CCDS58 ETRNITFFSTNCVEGTARGVVVATGDRTVMGRIATLASGLEVGKTPIAIEIEHFIQLITG
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB3 VAVFLGVSFFILSLILEYTWLEAVIFLIGIIVANVPEGLLATVTVCLTLTAKRMARKNCL
:::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 VAVFLGVSFFILSLILGYTWLEAVIFLIGIIVANVPEGLLATVTVCLTLTAKRMARKNCL
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB3 VKNLEAVETLGSTSTICSDKTGTLTQNRMTVAHMWFDNQIHEADTTENQSGVSFDKTSAT
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.::::.: :
CCDS58 VKNLEAVETLGSTSTICSDKTGTLTQNRMTVAHMWFDNQIHEADTTEDQSGTSFDKSSHT
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB3 WLALSRIAGLCNRAVFQANQENLPILKRAVAGDASESALLKCIELCCGSVKEMRERYAKI
:.:::.::::::::::...:.:.:.::: :::::::::::::::: :::: :::: :.
CCDS58 WVALSHIAGLCNRAVFKGGQDNIPVLKRDVAGDASESALLKCIELSSGSVKLMRERNKKV
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB3 VEIPFNSTNKYQLSIHKNPNTSEPQHLLVMKGAPERILDRCSSILLHGKEQPLDEELKDA
.:::::::::::::::.. . .. ..::::::::::::::::.:::.:::::::::.:.:
CCDS58 AEIPFNSTNKYQLSIHETEDPNDNRYLLVMKGAPERILDRCSTILLQGKEQPLDEEMKEA
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KB3 FQNAYLELGGLGERVLGFCHLFLPDEQFPEGFQFDTDDVNFPIDNLCFVGLISMIDPPRA
:::::::::::::::::::: .::.::::.:: :: ::::: ::::::::.::::::::
CCDS58 FQNAYLELGGLGERVLGFCHYYLPEEQFPKGFAFDCDDVNFTTDNLCFVGLMSMIDPPRA
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KB3 AVPDAVGKCRSAGIKVIMVTGDHPITAKAIAKGVGIISEGNETVEDIAARLNIPVSQVNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 AVPDAVGKCRSAGIKVIMVTGDHPITAKAIAKGVGIISEGNETVEDIAARLNIPVSQVNP
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KB3 RDAKACVVHGSDLKDMTSEQLDDILKYHTEIVFARTSPQQKLIIVEGCQRQGAIVAVTGD
:::::::.::.::::.::::.:.::. :::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RDAKACVIHGTDLKDFTSEQIDEILQNHTEIVFARTSPQQKLIIVEGCQRQGAIVAVTGD
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KB3 GVNDSPALKKADIGVAMGIAGSDVSKQAADMILLDDNFASIVTGVEEGRLIFDNLKKSIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GVNDSPALKKADIGVAMGIAGSDVSKQAADMILLDDNFASIVTGVEEGRLIFDNLKKSIA
720 730 740 750 760 770
780 790 800 810 820 830
pF1KB3 YTLTSNIPEITPFLIFIIANIPLPLGTVTILCIDLGTDMVPAISLAYEQAESDIMKRQPR
::::::::::::::.::.:::::::::.:::::::::::::::::::: :::::::::::
CCDS58 YTLTSNIPEITPFLLFIMANIPLPLGTITILCIDLGTDMVPAISLAYEAAESDIMKRQPR
780 790 800 810 820 830
840 850 860 870 880 890
pF1KB3 NPKTDKLVNERLISMAYGQIGMIQALGGFFTYFVILAENGFLPIHLLGLRVDWDDRWIND
::.:::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::: .:.:.:..:::: .::
CCDS58 NPRTDKLVNERLISMAYGQIGMIQALGGFFSYFVILAENGFLPGNLVGIRLNWDDRTVND
840 850 860 870 880 890
900 910 920 930 940 950
pF1KB3 VEDSYGQQWTYEQRKIVEFTCHTAFFVSIVVVQWADLVICKTRRNSVFQQGMKNKILIFG
.::::::::::::::.:::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::
CCDS58 LEDSYGQQWTYEQRKVVEFTCHTAFFVSIVVVQWADLIICKTRRNSVFQQGMKNKILIFG
900 910 920 930 940 950
960 970 980 990 1000 1010
pF1KB3 LFEETALAAFLSYCPGMGVALRMYPLKPTWWFCAFPYSLLIFVYDEVRKLIIRRRPGGWV
::::::::::::::::: ::::::::::.:::::::::.:::::::.::::.:: :::::
CCDS58 LFEETALAAFLSYCPGMDVALRMYPLKPSWWFCAFPYSFLIFVYDEIRKLILRRNPGGWV
960 970 980 990 1000 1010
1020
pF1KB3 EKETYY
::::::
CCDS58 EKETYY
1020
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10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MGKGVGRDKYEPAAVSEQGDKKGKKGKKDRDMDELKKEVSMDDHKLSLDELHRKYGTDLS
.. . : .:::. ::.:.:::::.: .::.:..:. :::.::
CCDS12 MGDKKDDKDSPKKNKGKERRDLDDLKKEVAMTEHKMSVEEVCRKYNTDCV
10 20 30 40 50
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pF1KB3 RGLTSARAAEILARDGPNALTPPPTTPEWIKFCRQLFGGFSMLLWIGAILCFLAYSIQAA
.::: ..: ::::::::::::::::::::.:::::::::::.:::::::::::::.:::.
CCDS12 QGLTHSKAQEILARDGPNALTPPPTTPEWVKFCRQLFGGFSILLWIGAILCFLAYGIQAG
60 70 80 90 100 110
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pF1KB3 TEEEPQNDNLYLGVVLSAVVIITGCFSYYQEAKSSKIMESFKNMVPQQALVIRNGEKMSI
::..:..::::::.::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::..
CCDS12 TEDDPSGDNLYLGIVLAAVVIITGCFSYYQEAKSSKIMESFKNMVPQQALVIREGEKMQV
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pF1KB3 NAEEVVVGDLVEVKGGDRIPADLRIISANGCKVDNSSLTGESEPQTRSPDFTNENPLETR
::::::::::::.:::::.:::::::::.::::::::::::::::::::: :..::::::
CCDS12 NAEEVVVGDLVEIKGGDRVPADLRIISAHGCKVDNSSLTGESEPQTRSPDCTHDNPLETR
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pF1KB3 NIAFFSTNCVEGTARGIVVYTGDRTVMGRIATLASGLEGGQTPIAAEIEHFIHIITGVAV
::.:::::::::::::.:: :::::::::::::::::: :.:::: ::::::..::::::
CCDS12 NITFFSTNCVEGTARGVVVATGDRTVMGRIATLASGLEVGKTPIAIEIEHFIQLITGVAV
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310 320 330 340 350 360
pF1KB3 FLGVSFFILSLILEYTWLEAVIFLIGIIVANVPEGLLATVTVCLTLTAKRMARKNCLVKN
::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 FLGVSFFILSLILGYTWLEAVIFLIGIIVANVPEGLLATVTVCLTLTAKRMARKNCLVKN
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pF1KB3 LEAVETLGSTSTICSDKTGTLTQNRMTVAHMWFDNQIHEADTTENQSGVSFDKTSATWLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.::::.: ::.:
CCDS12 LEAVETLGSTSTICSDKTGTLTQNRMTVAHMWFDNQIHEADTTEDQSGTSFDKSSHTWVA
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pF1KB3 LSRIAGLCNRAVFQANQENLPILKRAVAGDASESALLKCIELCCGSVKEMRERYAKIVEI
::.::::::::::...:.:.:.::: :::::::::::::::: :::: :::: :..::
CCDS12 LSHIAGLCNRAVFKGGQDNIPVLKRDVAGDASESALLKCIELSSGSVKLMRERNKKVAEI
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pF1KB3 PFNSTNKYQLSIHKNPNTSEPQHLLVMKGAPERILDRCSSILLHGKEQPLDEELKDAFQN
:::::::::::::.. . .. ..::::::::::::::::.:::.:::::::::.:.::::
CCDS12 PFNSTNKYQLSIHETEDPNDNRYLLVMKGAPERILDRCSTILLQGKEQPLDEEMKEAFQN
480 490 500 510 520 530
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pF1KB3 AYLELGGLGERVLGFCHLFLPDEQFPEGFQFDTDDVNFPIDNLCFVGLISMIDPPRAAVP
::::::::::::::::: .::.::::.:: :: ::::: ::::::::.:::::::::::
CCDS12 AYLELGGLGERVLGFCHYYLPEEQFPKGFAFDCDDVNFTTDNLCFVGLMSMIDPPRAAVP
540 550 560 570 580 590
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pF1KB3 DAVGKCRSAGIKVIMVTGDHPITAKAIAKGVGIISEGNETVEDIAARLNIPVSQVNPRDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 DAVGKCRSAGIKVIMVTGDHPITAKAIAKGVGIISEGNETVEDIAARLNIPVSQVNPRDA
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pF1KB3 KACVVHGSDLKDMTSEQLDDILKYHTEIVFARTSPQQKLIIVEGCQRQGAIVAVTGDGVN
::::.::.::::.::::.:.::. ::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 KACVIHGTDLKDFTSEQIDEILQNHTEIVFARTSPQQKLIIVEGCQRQGAIVAVTGDGVN
660 670 680 690 700 710
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pF1KB3 DSPALKKADIGVAMGIAGSDVSKQAADMILLDDNFASIVTGVEEGRLIFDNLKKSIAYTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 DSPALKKADIGVAMGIAGSDVSKQAADMILLDDNFASIVTGVEEGRLIFDNLKKSIAYTL
720 730 740 750 760 770
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pF1KB3 TSNIPEITPFLIFIIANIPLPLGTVTILCIDLGTDMVPAISLAYEQAESDIMKRQPRNPK
:::::::::::.::.:::::::::.:::::::::::::::::::: :::::::::::::.
CCDS12 TSNIPEITPFLLFIMANIPLPLGTITILCIDLGTDMVPAISLAYEAAESDIMKRQPRNPR
780 790 800 810 820 830
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pF1KB3 TDKLVNERLISMAYGQIGMIQALGGFFTYFVILAENGFLPIHLLGLRVDWDDRWINDVED
:::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::: .:.:.:..:::: .::.::
CCDS12 TDKLVNERLISMAYGQIGMIQALGGFFSYFVILAENGFLPGNLVGIRLNWDDRTVNDLED
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pF1KB3 SYGQQWTYEQRKIVEFTCHTAFFVSIVVVQWADLVICKTRRNSVFQQGMKNKILIFGLFE
::::::::::::.:::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SYGQQWTYEQRKVVEFTCHTAFFVSIVVVQWADLIICKTRRNSVFQQGMKNKILIFGLFE
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pF1KB3 ETALAAFLSYCPGMGVALRMYPLKPTWWFCAFPYSLLIFVYDEVRKLIIRRRPGGWVEKE
:::::::::::::: ::::::::::.:::::::::.:::::::.::::.:: ::::::::
CCDS12 ETALAAFLSYCPGMDVALRMYPLKPSWWFCAFPYSFLIFVYDEIRKLILRRNPGGWVEKE
960 970 980 990 1000 1010
pF1KB3 TYY
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CCDS12 TYY
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10 20 30 40 50
pF1KB3 MGKGVGRDKYEPAAVSEQGDKKGKKGKKDRDMDELKKEVSMDDHKLSLDELHR
:. :. :.:.:::::: ::::::.:.::
CCDS11 GLWGKKGTVAPHDQSPRRRPKKGLIKKKMVKREKQKRNMEELKKEVVMDDHKLTLEELST
10 20 30 40 50 60
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pF1KB3 KYGTDLSRGLTSARAAEILARDGPNALTPPPTTPEWIKFCRQLFGGFSMLLWIGAILCFL
::..::..: . :: :::.: :::..:::::::::.:::.:::::::.::: ::::::.
CCDS11 KYSVDLTKGHSHQRAKEILTRGGPNTVTPPPTTPEWVKFCKQLFGGFSLLLWTGAILCFV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB3 AYSIQAATEEEPQNDNLYLGVVLSAVVIITGCFSYYQEAKSSKIMESFKNMVPQQALVIR
::::: .::: .:::::..:::.:::.:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 AYSIQIYFNEEPTKDNLYLSIVLSVVVIVTGCFSYYQEAKSSKIMESFKNMVPQQALVIR
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB3 NGEKMSINAEEVVVGDLVEVKGGDRIPADLRIISANGCKVDNSSLTGESEPQTRSPDFTN
.::::.::..:::.:::::.:::::.:::::.:::.::::::::::::::::.::::::.
CCDS11 GGEKMQINVQEVVLGDLVEIKGGDRVPADLRLISAQGCKVDNSSLTGESEPQSRSPDFTH
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB3 ENPLETRNIAFFSTNCVEGTARGIVVYTGDRTVMGRIATLASGLEGGQTPIAAEIEHFIH
::::::::: :::::::::::::::. ::: :::::::.:.::: ::::::::::::::
CCDS11 ENPLETRNICFFSTNCVEGTARGIVIATGDSTVMGRIASLTSGLAVGQTPIAAEIEHFIH
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB3 IITGVAVFLGVSFFILSLILEYTWLEAVIFLIGIIVANVPEGLLATVTVCLTLTAKRMAR
.:: :::::::.:: :::.: : ::::.::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LITVVAVFLGVTFFALSLLLGYGWLEAIIFLIGIIVANVPEGLLATVTVCLTLTAKRMAR
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KB3 KNCLVKNLEAVETLGSTSTICSDKTGTLTQNRMTVAHMWFDNQIHEADTTENQSGVSFDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ..::::::.:.: .: :
CCDS11 KNCLVKNLEAVETLGSTSTICSDKTGTLTQNRMTVAHMWFDMTVYEADTTEEQTGKTFTK
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KB3 TSATWLALSRIAGLCNRAVFQANQENLPILKRAVAGDASESALLKCIELCCGSVKEMRER
.: ::. :.::::::::: :.:::: ::: :::..:::::::::: :: .:: ::::.
CCDS11 SSDTWFMLARIAGLCNRADFKANQEILPIAKRATTGDASESALLKFIEQSYSSVAEMREK
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KB3 YAKIVEIPFNSTNKYQLSIHKNPNTSEPQHLLVMKGAPERILDRCSSILLHGKEQPLDEE
:..:::::::::::.::: ..:. :.:.:::::::::. ::..::.:.: ...:
CCDS11 NPKVAEIPFNSTNKYQMSIHLREDSSQT-HVLMMKGAPERILEFCSTFLLNGQEYSMNDE
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KB3 LKDAFQNAYLELGGLGERVLGFCHLFLPDEQFPEGFQFDTDDVNFPIDNLCFVGLISMID
.:.:::::::::::::::::::: : ::. .: .:: :.::..:::.:::::::::::::
CCDS11 MKEAFQNAYLELGGLGERVLGFCFLNLPS-SFSKGFPFNTDEINFPMDNLCFVGLISMID
550 560 570 580 590
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pF1KB3 PPRAAVPDAVGKCRSAGIKVIMVTGDHPITAKAIAKGVGIISEGNETVEDIAARLNIPVS
::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::.::.:..::::.::.:
CCDS11 PPRAAVPDAVSKCRSAGIKVIMVTGDHPITAKAIAKGVGIISEGTETAEEVAARLKIPIS
600 610 620 630 640 650
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pF1KB3 QVNPRDAKACVVHGSDLKDMTSEQLDDILKYHTEIVFARTSPQQKLIIVEGCQRQGAIVA
.:. ::: ::::..:::. :.:::.::. : ::::::::::::::::::::: ::.::
CCDS11 KVDASAAKAIVVHGAELKDIQSKQLDQILQNHPEIVFARTSPQQKLIIVEGCQRLGAVVA
660 670 680 690 700 710
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pF1KB3 VTGDGVNDSPALKKADIGVAMGIAGSDVSKQAADMILLDDNFASIVTGVEEGRLIFDNLK
::::::::::::::::::.::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VTGDGVNDSPALKKADIGIAMGISGSDVSKQAADMILLDDNFASIVTGVEEGRLIFDNLK
720 730 740 750 760 770
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pF1KB3 KSIAYTLTSNIPEITPFLIFIIANIPLPLGTVTILCIDLGTDMVPAISLAYEQAESDIMK
::: ::::::::::::::.::: .:::::::.::::::::::::::::::::.:::::::
CCDS11 KSIMYTLTSNIPEITPFLMFIILGIPLPLGTITILCIDLGTDMVPAISLAYESAESDIMK
780 790 800 810 820 830
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pF1KB3 RQPRNPKTDKLVNERLISMAYGQIGMIQALGGFFTYFVILAENGFLPIHLLGLRVDWDDR
: :::::::.:::.:::.::::::::::::.:::::::::::::: :. :::.:. :.:.
CCDS11 RLPRNPKTDNLVNHRLIGMAYGQIGMIQALAGFFTYFVILAENGFRPVDLLGIRLHWEDK
840 850 860 870 880 890
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pF1KB3 WINDVEDSYGQQWTYEQRKIVEFTCHTAFFVSIVVVQWADLVICKTRRNSVFQQGMKNKI
..::.::::::::::::::.:::::.:::::.:::::::::.: ::::::.:::::.::.
CCDS11 YLNDLEDSYGQQWTYEQRKVVEFTCQTAFFVTIVVVQWADLIISKTRRNSLFQQGMRNKV
900 910 920 930 940 950
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pF1KB3 LIFGLFEETALAAFLSYCPGMGVALRMYPLKPTWWFCAFPYSLLIFVYDEVRKLIIRRRP
::::..::: ::::::: ::: ::::::::: :::.::.:::.:::::::.:::.::..:
CCDS11 LIFGILEETLLAAFLSYTPGMDVALRMYPLKITWWLCAIPYSILIFVYDEIRKLLIRQHP
960 970 980 990 1000 1010
1020
pF1KB3 GGWVEKETYY
::::.::::
CCDS11 DGWVERETYY
1020
>>CCDS12467.1 ATP4A gene_id:495|Hs108|chr19 (1035 aa)
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Smith-Waterman score: 4428; 62.9% identity (86.5% similar) in 1024 aa overlap (1-1023:14-1035)
10 20 30 40
pF1KB3 MGKGVGRDKYEPAAVSEQGDKKGKKGKKDRDMDELKKEVSMDDHKLS
.: : : : : .:.. : ::. . ....:::. ..::.::
CCDS12 MGKAENYELYSVELGPGPGGDM--AAKMSKKKKAGGGGGKRKEKLENMKKEMEINDHQLS
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KB3 LDELHRKYGTDLSRGLTSARAAEILARDGPNALTPPPTTPEWIKFCRQLFGGFSMLLWIG
. ::..:: :. ..::... :::.: ::::::: :: :::..:: ::: ::.. :.:..
CCDS12 VAELEQKYQTSATKGLSASLAAELLLRDGPNALRPPRGTPEYVKFARQLAGGLQCLMWVA
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KB3 AILCFLAYSIQAATEEEPQNDNLYLGVVLSAVVIITGCFSYYQEAKSSKIMESFKNMVPQ
: .:..:..:::. . .:::::...: :::..::::.:::: ::..:. ::::.:::
CCDS12 AAICLIAFAIQASEGDLTTDDNLYLAIALIAVVVVTGCFGYYQEFKSTNIIASFKNLVPQ
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB3 QALVIRNGEKMSINAEEVVVGDLVEVKGGDRIPADLRIISANGCKVDNSSLTGESEPQTR
:: :::.:.:..:::...:::::::.:::::.:::.::..:.::::::::::::::::::
CCDS12 QATVIRDGDKFQINADQLVVGDLVEMKGGDRVPADIRILAAQGCKVDNSSLTGESEPQTR
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB3 SPDFTNENPLETRNIAFFSTNCVEGTARGIVVYTGDRTVMGRIATLASGLEGGQTPIAAE
::. :.:.:::::::::::: :.:::..:.:: :::::..::::.::::.:. .:::: :
CCDS12 SPECTHESPLETRNIAFFSTMCLEGTVQGLVVNTGDRTIIGRIASLASGVENEKTPIAIE
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB3 IEHFIHIITGVAVFLGVSFFILSLILEYTWLEAVIFLIGIIVANVPEGLLATVTVCLTLT
::::. ::.:.:...:..:::... . ::.:.:..:...:.:: :::::::::::::.::
CCDS12 IEHFVDIIAGLAILFGATFFIVAMCIGYTFLRAMVFFMAIVVAYVPEGLLATVTVCLSLT
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB3 AKRMARKNCLVKNLEAVETLGSTSTICSDKTGTLTQNRMTVAHMWFDNQIHEADTTENQS
:::.: :::.::::::::::::::.::::::::::::::::.:.::::.:: :::::.::
CCDS12 AKRLASKNCVVKNLEAVETLGSTSVICSDKTGTLTQNRMTVSHLWFDNHIHTADTTEDQS
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KB3 GVSFDKTSATWLALSRIAGLCNRAVFQANQENLPILKRAVAGDASESALLKCIELCCGSV
: .::..: :: :: :. :::::.:...:. .:. :: : :::::.:::: :: :..
CCDS12 GQTFDQSSETWRALCRVLTLCNRAAFKSGQDAVPVPKRIVIGDASETALLKFSELTLGNA
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KB3 KEMRERYAKIVEIPFNSTNKYQLSIHKNPNTSEPQHLLVMKGAPERILDRCSSILLHGKE
.:.:. :. :::::::::.::::: . .:.:::::::::::.:.::::::..:.:
CCDS12 MGYRDRFPKVCEIPFNSTNKFQLSIHTLEDPRDPRHLLVMKGAPERVLERCSSILIKGQE
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KB3 QPLDEELKDAFQNAYLELGGLGERVLGFCHLFLPDEQFPEGFQFDTDDVNFPIDNLCFVG
::::. ..:::.::: ::::::::::::.:.: ....: :. ::.. .::: ..:::.:
CCDS12 LPLDEQWREAFQTAYLSLGGLGERVLGFCQLYLNEKDYPPGYAFDVEAMNFPSSGLCFAG
540 550 560 570 580 590
590 600 610 620 630 640
pF1KB3 LISMIDPPRAAVPDAVGKCRSAGIKVIMVTGDHPITAKAIAKGVGIISEGNETVEDIAAR
:.::::::::.::::: :::.:::.:::::::::::::::: .:::::::.:::::::::
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]