FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB3513, 1023 aa 1>>>pF1KB3513 1023 - 1023 aa - 1023 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8092+/-0.000475; mu= 18.5102+/- 0.029 mean_var=74.5724+/-15.198, 0's: 0 Z-trim(109.7): 198 B-trim: 469 in 1/51 Lambda= 0.148520 statistics sampled from 17737 (17937) to 17737 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.557), E-opt: 0.2 (0.21), width: 16 Scan time: 13.600 The best scores are: opt bits E(85289) NP_000692 (OMIM: 182310) sodium/potassium-transpor (1023) 6746 1455.9 0 NP_001153705 (OMIM: 182310) sodium/potassium-trans (1023) 6718 1449.9 0 XP_016856850 (OMIM: 182310) PREDICTED: sodium/pota ( 992) 6535 1410.7 0 XP_016856849 (OMIM: 182310) PREDICTED: sodium/pota ( 992) 6535 1410.7 0 NP_001153706 (OMIM: 182310) sodium/potassium-trans ( 992) 6535 1410.7 0 NP_001243143 (OMIM: 128235,182350,601338,614820) s (1026) 5943 1283.9 0 NP_000693 (OMIM: 104290,182340,602481) sodium/pota (1020) 5942 1283.7 0 NP_001243142 (OMIM: 128235,182350,601338,614820) s (1024) 5922 1279.4 0 NP_689509 (OMIM: 128235,182350,601338,614820) sodi (1013) 5919 1278.7 0 NP_653300 (OMIM: 607321) sodium/potassium-transpor (1029) 5336 1153.8 0 XP_011507884 (OMIM: 607321) PREDICTED: sodium/pota ( 970) 5182 1120.8 0 NP_000695 (OMIM: 137216) potassium-transporting AT (1035) 4428 959.3 0 NP_001667 (OMIM: 182360) potassium-transporting AT (1039) 4411 955.6 0 NP_001172014 (OMIM: 182360) potassium-transporting (1045) 4389 950.9 0 NP_001001734 (OMIM: 607321) sodium/potassium-trans ( 165) 946 212.8 1.2e-54 NP_777617 (OMIM: 601929) sarcoplasmic/endoplasmic ( 998) 522 122.3 1.3e-26 NP_005164 (OMIM: 601929) sarcoplasmic/endoplasmic ( 999) 522 122.3 1.3e-26 XP_016880182 (OMIM: 601929) PREDICTED: sarcoplasmi (1020) 522 122.3 1.3e-26 XP_011522191 (OMIM: 601929) PREDICTED: sarcoplasmi (1024) 522 122.3 1.3e-26 XP_011522190 (OMIM: 601929) PREDICTED: sarcoplasmi (1028) 522 122.3 1.3e-26 NP_777618 (OMIM: 601929) sarcoplasmic/endoplasmic (1029) 522 122.3 1.3e-26 NP_777616 (OMIM: 601929) sarcoplasmic/endoplasmic (1029) 522 122.3 1.3e-26 XP_011522187 (OMIM: 601929) PREDICTED: sarcoplasmi (1042) 522 122.3 1.4e-26 NP_777615 (OMIM: 601929) sarcoplasmic/endoplasmic (1043) 522 122.3 1.4e-26 NP_777614 (OMIM: 601929) sarcoplasmic/endoplasmic (1044) 522 122.3 1.4e-26 NP_777613 (OMIM: 601929) sarcoplasmic/endoplasmic (1052) 522 122.3 1.4e-26 XP_016880181 (OMIM: 601929) PREDICTED: sarcoplasmi (1062) 522 122.3 1.4e-26 XP_011522186 (OMIM: 601929) PREDICTED: sarcoplasmi (1069) 522 122.3 1.4e-26 XP_011522184 (OMIM: 601929) PREDICTED: sarcoplasmi (1084) 522 122.3 1.4e-26 XP_011522183 (OMIM: 601929) PREDICTED: sarcoplasmi (1114) 522 122.4 1.4e-26 NP_001278383 (OMIM: 613082) calcium-transporting A ( 795) 516 121.0 2.6e-26 NP_055676 (OMIM: 613082) calcium-transporting ATPa ( 946) 516 121.0 3e-26 XP_011510988 (OMIM: 169600,604384) PREDICTED: calc ( 671) 513 120.3 3.5e-26 NP_001186114 (OMIM: 169600,604384) calcium-transpo ( 888) 513 120.4 4.5e-26 NP_001001485 (OMIM: 169600,604384) calcium-transpo ( 888) 513 120.4 4.5e-26 NP_001186113 (OMIM: 169600,604384) calcium-transpo ( 903) 513 120.4 4.5e-26 NP_001186108 (OMIM: 169600,604384) calcium-transpo ( 919) 513 120.4 4.6e-26 NP_055197 (OMIM: 169600,604384) calcium-transporti ( 919) 513 120.4 4.6e-26 NP_001186112 (OMIM: 169600,604384) calcium-transpo ( 923) 513 120.4 4.6e-26 XP_005247415 (OMIM: 169600,604384) PREDICTED: calc ( 933) 513 120.4 4.7e-26 NP_001001487 (OMIM: 169600,604384) calcium-transpo ( 939) 513 120.4 4.7e-26 XP_016861653 (OMIM: 169600,604384) PREDICTED: calc ( 939) 513 120.4 4.7e-26 NP_001186111 (OMIM: 169600,604384) calcium-transpo ( 944) 513 120.4 4.7e-26 XP_005247412 (OMIM: 169600,604384) PREDICTED: calc ( 949) 513 120.4 4.7e-26 NP_001001486 (OMIM: 169600,604384) calcium-transpo ( 949) 513 120.4 4.7e-26 XP_005247413 (OMIM: 169600,604384) PREDICTED: calc ( 949) 513 120.4 4.7e-26 NP_001186110 (OMIM: 169600,604384) calcium-transpo ( 953) 513 120.4 4.8e-26 NP_001186109 (OMIM: 169600,604384) calcium-transpo ( 973) 513 120.4 4.9e-26 XP_005247411 (OMIM: 169600,604384) PREDICTED: calc ( 983) 513 120.4 4.9e-26 NP_733765 (OMIM: 101900,108740,124200) sarcoplasmi (1042) 493 116.1 1e-24 >>NP_000692 (OMIM: 182310) sodium/potassium-transporting (1023 aa) initn: 6746 init1: 6746 opt: 6746 Z-score: 7806.0 bits: 1455.9 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 6746; 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NP_689 QGLTHSKAQEILARDGPNALTPPPTTPEWVKFCRQLFGGFSILLWIGAILCFLAYGIQAG 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KB3 TEEEPQNDNLYLGVVLSAVVIITGCFSYYQEAKSSKIMESFKNMVPQQALVIRNGEKMSI ::..:..::::::.::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::.. 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NP_653 SSDTWFMLARIAGLCNRADFKANQEILPIAKRATTGDASESALLKFIEQSYSSVAEMREK 430 440 450 460 470 480 480 490 500 510 520 530 pF1KB3 YAKIVEIPFNSTNKYQLSIHKNPNTSEPQHLLVMKGAPERILDRCSSILLHGKEQPLDEE :..:::::::::::.::: ..:. :.:.:::::::::. ::..::.:.: ...: NP_653 NPKVAEIPFNSTNKYQMSIHLREDSSQT-HVLMMKGAPERILEFCSTFLLNGQEYSMNDE 490 500 510 520 530 540 540 550 560 570 580 590 pF1KB3 LKDAFQNAYLELGGLGERVLGFCHLFLPDEQFPEGFQFDTDDVNFPIDNLCFVGLISMID .:.:::::::::::::::::::: : ::. .: .:: :.::..:::.::::::::::::: NP_653 MKEAFQNAYLELGGLGERVLGFCFLNLPS-SFSKGFPFNTDEINFPMDNLCFVGLISMID 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 pF1KB3 PPRAAVPDAVGKCRSAGIKVIMVTGDHPITAKAIAKGVGIISEGNETVEDIAARLNIPVS ::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::.::.:..::::.::.: NP_653 PPRAAVPDAVSKCRSAGIKVIMVTGDHPITAKAIAKGVGIISEGTETAEEVAARLKIPIS 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 pF1KB3 QVNPRDAKACVVHGSDLKDMTSEQLDDILKYHTEIVFARTSPQQKLIIVEGCQRQGAIVA .:. ::: ::::..:::. :.:::.::. : ::::::::::::::::::::: ::.:: NP_653 KVDASAAKAIVVHGAELKDIQSKQLDQILQNHPEIVFARTSPQQKLIIVEGCQRLGAVVA 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 pF1KB3 VTGDGVNDSPALKKADIGVAMGIAGSDVSKQAADMILLDDNFASIVTGVEEGRLIFDNLK ::::::::::::::::::.::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_653 VTGDGVNDSPALKKADIGIAMGISGSDVSKQAADMILLDDNFASIVTGVEEGRLIFDNLK 720 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 pF1KB3 KSIAYTLTSNIPEITPFLIFIIANIPLPLGTVTILCIDLGTDMVPAISLAYEQAESDIMK ::: ::::::::::::::.::: .:::::::.::::::::::::::::::::.::::::: NP_653 KSIMYTLTSNIPEITPFLMFIILGIPLPLGTITILCIDLGTDMVPAISLAYESAESDIMK 780 790 800 810 820 830 840 850 860 870 880 890 pF1KB3 RQPRNPKTDKLVNERLISMAYGQIGMIQALGGFFTYFVILAENGFLPIHLLGLRVDWDDR : :::::::.:::.:::.::::::::::::.:::::::::::::: :. :::.:. :.:. NP_653 RLPRNPKTDNLVNHRLIGMAYGQIGMIQALAGFFTYFVILAENGFRPVDLLGIRLHWEDK 840 850 860 870 880 890 900 910 920 930 940 950 pF1KB3 WINDVEDSYGQQWTYEQRKIVEFTCHTAFFVSIVVVQWADLVICKTRRNSVFQQGMKNKI ..::.::::::::::::::.:::::.:::::.:::::::::.: ::::::.:::::.::. NP_653 YLNDLEDSYGQQWTYEQRKVVEFTCQTAFFVTIVVVQWADLIISKTRRNSLFQQGMRNKV 900 910 920 930 940 950 960 970 980 990 1000 1010 pF1KB3 LIFGLFEETALAAFLSYCPGMGVALRMYPLKPTWWFCAFPYSLLIFVYDEVRKLIIRRRP ::::..::: ::::::: ::: ::::::::: :::.::.:::.:::::::.:::.::..: NP_653 LIFGILEETLLAAFLSYTPGMDVALRMYPLKITWWLCAIPYSILIFVYDEIRKLLIRQHP 960 970 980 990 1000 1010 1020 pF1KB3 GGWVEKETYY ::::.:::: NP_653 DGWVERETYY 1020 1023 residues in 1 query sequences 60827320 residues in 85289 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Thu Nov 3 13:29:01 2016 done: Thu Nov 3 13:29:03 2016 Total Scan time: 13.600 Total Display time: 0.390 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]