Result of FASTA (ccds) for pF1KB3518
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB3518, 760 aa
  1>>>pF1KB3518 760 - 760 aa - 760 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.0313+/-0.000909; mu= 6.9647+/- 0.055
 mean_var=281.5035+/-58.517, 0's: 0 Z-trim(115.3): 49  B-trim: 0 in 0/52
 Lambda= 0.076442
 statistics sampled from 15844 (15891) to 15844 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.775), E-opt: 0.2 (0.488), width:  16
 Scan time:  5.050

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS42581.1 STRN4 gene_id:29888|Hs108|chr19        ( 760) 5129 579.3 7.9e-165
CCDS12690.1 STRN4 gene_id:29888|Hs108|chr19        ( 753) 5058 571.4 1.8e-162
CCDS9641.1 STRN3 gene_id:29966|Hs108|chr14         ( 713) 1616 191.8 3.2e-48
CCDS41938.1 STRN3 gene_id:29966|Hs108|chr14        ( 797) 1603 190.4 9.3e-48
CCDS1784.1 STRN gene_id:6801|Hs108|chr2            ( 780) 1529 182.3 2.6e-45


>>CCDS42581.1 STRN4 gene_id:29888|Hs108|chr19             (760 aa)
 initn: 5129 init1: 5129 opt: 5129  Z-score: 3072.7  bits: 579.3 E(32554): 7.9e-165
Smith-Waterman score: 5129; 100.0% identity (100.0% similar) in 760 aa overlap (1-760:1-760)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MMEERAAAAVAAAASSCRPLGSGAGPGPTGAAPVSAPAPGPGPAGKGGGGGGSPGPTAGP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MMEERAAAAVAAAASSCRPLGSGAGPGPTGAAPVSAPAPGPGPAGKGGGGGGSPGPTAGP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 EPLSLPGILHFIQHEWARFEAEKARWEAERAELQAQVAFLQGERKGQENLKTDLVRRIKM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 EPLSLPGILHFIQHEWARFEAEKARWEAERAELQAQVAFLQGERKGQENLKTDLVRRIKM
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 LEYALKQERAKYHKLKFGTDLNQGEKKADVSEQVSNGPVESVTLENSPLVWKEGRQLLRQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LEYALKQERAKYHKLKFGTDLNQGEKKADVSEQVSNGPVESVTLENSPLVWKEGRQLLRQ
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 YLEEVGYTDTILDMRSKRVRSLLGRSLELNGAVEPSEGAPRAPPGPAGLSGGESLLVKQI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 YLEEVGYTDTILDMRSKRVRSLLGRSLELNGAVEPSEGAPRAPPGPAGLSGGESLLVKQI
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 EEQIKRNAAGKDGKERLGGSVLGQIPFLQNCEDEDSDEDDELDSVQHKKQRVKLPSKALV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 EEQIKRNAAGKDGKERLGGSVLGQIPFLQNCEDEDSDEDDELDSVQHKKQRVKLPSKALV
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB3 PEMEDEDEEDDSEDAINEFDFLGSGEDGEGAPDPRRCTVDGSPHELESRRVKLQGILADL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 PEMEDEDEEDDSEDAINEFDFLGSGEDGEGAPDPRRCTVDGSPHELESRRVKLQGILADL
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB3 RDVDGLPPKVTGPPPGTPQPRPHEGSFGFSSDVFIMDTIGGGEVSLGDLADLTVTNDNDL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 RDVDGLPPKVTGPPPGTPQPRPHEGSFGFSSDVFIMDTIGGGEVSLGDLADLTVTNDNDL
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB3 SCDLSDSKDAFKKTWNPKFTLRSHYDGIRSLAFHHSQSALLTASEDGTLKLWNLQKAVTA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 SCDLSDSKDAFKKTWNPKFTLRSHYDGIRSLAFHHSQSALLTASEDGTLKLWNLQKAVTA
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB3 KKNAALDVEPIHAFRAHRGPVLAVAMGSNSEYCYSGGADACIHSWKIPDLSMDPYDGYDP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 KKNAALDVEPIHAFRAHRGPVLAVAMGSNSEYCYSGGADACIHSWKIPDLSMDPYDGYDP
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB3 SVLSHVLEGHGDAVWGLAFSPTSQRLASCSADGTVRIWDPSSSSPACLCTFPTASEHGVP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 SVLSHVLEGHGDAVWGLAFSPTSQRLASCSADGTVRIWDPSSSSPACLCTFPTASEHGVP
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB3 TSVAFTSTEPAHIVASFRSGDTVLYDMEVGSALLTLESRGSSGPTQINQVVSHPNQPLTI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 TSVAFTSTEPAHIVASFRSGDTVLYDMEVGSALLTLESRGSSGPTQINQVVSHPNQPLTI
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB3 TAHDDRGIRFLDNRTGKPVHSMVAHLDAVTCLAVDPNGAFLMSGSHDCSLRLWSLDNKTC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 TAHDDRGIRFLDNRTGKPVHSMVAHLDAVTCLAVDPNGAFLMSGSHDCSLRLWSLDNKTC
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760
pF1KB3 VQEITAHRKKHEEAIHAVACHPSKALIASAGADALAKVFV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 VQEITAHRKKHEEAIHAVACHPSKALIASAGADALAKVFV
              730       740       750       760

>>CCDS12690.1 STRN4 gene_id:29888|Hs108|chr19             (753 aa)
 initn: 2597 init1: 2597 opt: 5058  Z-score: 3030.4  bits: 571.4 E(32554): 1.8e-162
Smith-Waterman score: 5058; 99.1% identity (99.1% similar) in 760 aa overlap (1-760:1-753)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MMEERAAAAVAAAASSCRPLGSGAGPGPTGAAPVSAPAPGPGPAGKGGGGGGSPGPTAGP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MMEERAAAAVAAAASSCRPLGSGAGPGPTGAAPVSAPAPGPGPAGKGGGGGGSPGPTAGP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 EPLSLPGILHFIQHEWARFEAEKARWEAERAELQAQVAFLQGERKGQENLKTDLVRRIKM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 EPLSLPGILHFIQHEWARFEAEKARWEAERAELQAQVAFLQGERKGQENLKTDLVRRIKM
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 LEYALKQERAKYHKLKFGTDLNQGEKKADVSEQVSNGPVESVTLENSPLVWKEGRQLLRQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LEYALKQERAKYHKLKFGTDLNQGEKKADVSEQVSNGPVESVTLENSPLVWKEGRQLLRQ
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 YLEEVGYTDTILDMRSKRVRSLLGRSLELNGAVEPSEGAPRAPPGPAGLSGGESLLVKQI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 YLEEVGYTDTILDMRSKRVRSLLGRSLELNGAVEPSEGAPRAPPGPAGLSGGESLLVKQI
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 EEQIKRNAAGKDGKERLGGSVLGQIPFLQNCEDEDSDEDDELDSVQHKKQRVKLPSKALV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 EEQIKRNAAGKDGKERLGGSVLGQIPFLQNCEDEDSDEDDELDSVQHKKQRVKLPSKALV
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB3 PEMEDEDEEDDSEDAINEFDFLGSGEDGEGAPDPRRCTVDGSPHELESRRVKLQGILADL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PEMEDEDEEDDSEDAINEFDFLGSGEDGEGAPDPRRCTVDGSPHELESRRVKLQGILADL
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB3 RDVDGLPPKVTGPPPGTPQPRPHEGSFGFSSDVFIMDTIGGGEVSLGDLADLTVTNDNDL
       ::::::::::::::::::::::::       :::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RDVDGLPPKVTGPPPGTPQPRPHE-------DVFIMDTIGGGEVSLGDLADLTVTNDNDL
              370       380              390       400       410   

              430       440       450       460       470       480
pF1KB3 SCDLSDSKDAFKKTWNPKFTLRSHYDGIRSLAFHHSQSALLTASEDGTLKLWNLQKAVTA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SCDLSDSKDAFKKTWNPKFTLRSHYDGIRSLAFHHSQSALLTASEDGTLKLWNLQKAVTA
           420       430       440       450       460       470   

              490       500       510       520       530       540
pF1KB3 KKNAALDVEPIHAFRAHRGPVLAVAMGSNSEYCYSGGADACIHSWKIPDLSMDPYDGYDP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 KKNAALDVEPIHAFRAHRGPVLAVAMGSNSEYCYSGGADACIHSWKIPDLSMDPYDGYDP
           480       490       500       510       520       530   

              550       560       570       580       590       600
pF1KB3 SVLSHVLEGHGDAVWGLAFSPTSQRLASCSADGTVRIWDPSSSSPACLCTFPTASEHGVP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SVLSHVLEGHGDAVWGLAFSPTSQRLASCSADGTVRIWDPSSSSPACLCTFPTASEHGVP
           540       550       560       570       580       590   

              610       620       630       640       650       660
pF1KB3 TSVAFTSTEPAHIVASFRSGDTVLYDMEVGSALLTLESRGSSGPTQINQVVSHPNQPLTI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 TSVAFTSTEPAHIVASFRSGDTVLYDMEVGSALLTLESRGSSGPTQINQVVSHPNQPLTI
           600       610       620       630       640       650   

              670       680       690       700       710       720
pF1KB3 TAHDDRGIRFLDNRTGKPVHSMVAHLDAVTCLAVDPNGAFLMSGSHDCSLRLWSLDNKTC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 TAHDDRGIRFLDNRTGKPVHSMVAHLDAVTCLAVDPNGAFLMSGSHDCSLRLWSLDNKTC
           660       670       680       690       700       710   

              730       740       750       760
pF1KB3 VQEITAHRKKHEEAIHAVACHPSKALIASAGADALAKVFV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 VQEITAHRKKHEEAIHAVACHPSKALIASAGADALAKVFV
           720       730       740       750   

>>CCDS9641.1 STRN3 gene_id:29966|Hs108|chr14              (713 aa)
 initn: 2473 init1: 825 opt: 1616  Z-score: 979.2  bits: 191.8 E(32554): 3.2e-48
Smith-Waterman score: 2510; 54.7% identity (74.9% similar) in 769 aa overlap (20-760:4-713)

               10        20        30        40              50    
pF1KB3 MMEERAAAAVAAAASSCRPLGSGAGPGPTGAAPVSAPAPGPG------PAGKGGGGGGSP
                          :..:.: ::  :::      :::      :.:.:..:::.:
CCDS96                 MDELAGGGGGGPGMAAP-PRQQQGPGGNLGLSPGGNGAAGGGGP
                               10         20        30        40   

                 60             70        80        90       100   
pF1KB3 ------GPTAGPE---P--LSLPGILHFIQHEWARFEAEKARWEAERAELQAQVAFLQGE
             ::.::::   :   ..:::::.::::::::: :.:.::.:::::::..::::::
CCDS96 PASEGAGPAAGPELSRPQQYTIPGILHYIQHEWARFEMERAHWEVERAELQARIAFLQGE
            50        60        70        80        90       100   

           110       120       130       140       150       160   
pF1KB3 RKGQENLKTDLVRRIKMLEYALKQERAKYHKLKFGTDLNQGEKKADVSEQVSNGPVESVT
       :::::::: ::::::::::::::::::::::::.::.::::. :  . :.  .  .:. :
CCDS96 RKGQENLKKDLVRRIKMLEYALKQERAKYHKLKYGTELNQGDLKMPTFESEETKDTEAPT
           110       120       130       140       150       160   

            170       180       190       200        210       220 
pF1KB3 L-ENSPLVWKEGRQLLRQYLEEVGYTDTILDMRSKRVRSLLGRS-LELNGAVEPSEGAPR
         .:: :.::.:::::::::.::::::::::.::.::::::: :  : ::.:: ...  .
CCDS96 APQNSQLTWKQGRQLLRQYLQEVGYTDTILDVRSQRVRSLLGLSNSEPNGSVE-TKNLEQ
           170       180       190       200       210        220  

             230       240       250       260       270        280
pF1KB3 APPGPAGLSGGESLLVKQIEEQIKRNAAGKDGKERLGGSVLGQIPFLQNCEDEDSDED-D
              :.::::   ::  ..:::..          :.::  . ::.: .: : ::. :
CCDS96 I------LNGGES--PKQKGQEIKRSS----------GDVLETFNFLENADDSDEDEEND
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pF1KB3 ELDSV-----QHKKQRVKLPSKALVPEMEDEDEEDDSEDAINEFDFLGSGEDGEGAPDPR
        ....     .:. .. :. ...:. .. :.    :.:.:..::::: ..:::::: . :
CCDS96 MIEGIPEGKDKHRMNKHKIGNEGLAADLTDDP---DTEEALKEFDFLVTAEDGEGAGEAR
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         . ::.                     .   : .: :  :         :: ..::  .
CCDS96 S-SGDGT---------------------EWAEP-ITFPSGGGK-------SFIMGSDDVL
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       ....:     :::::::::::: : : ::  .::::.::::::.:::::.::.:.:::: 
CCDS96 LSVLG-----LGDLADLTVTNDADYSYDLPANKDAFRKTWNPKYTLRSHFDGVRALAFHP
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pF1KB3 SQSALLTASEDGTLKLWNLQKAVTAKKNAALDVEPIHAFRAHRGPVLAVAMGSNSEYCYS
        . .:.::::: :::::::::.: :::.:.::::::..:::: ::::..:..::.: :.:
CCDS96 VEPVLVTASEDHTLKLWNLQKTVPAKKSASLDVEPIYTFRAHIGPVLSLAISSNGEQCFS
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pF1KB3 GGADACIHSWKIPDLSMDPYDGYDPSVLSHVLEGHGDAVWGLAFSPTSQRLASCSADGTV
       :: :: :. :..:. :.:::: :.:.::. .: :: :::::::.:  ...: ::::::::
CCDS96 GGIDATIQWWNMPSPSVDPYDTYEPNVLAGTLVGHTDAVWGLAYSGIKNQLLSCSADGTV
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pF1KB3 RIWDPSSSSPACLCTFPTASEHGVPTSVAFTSTEPAHIVASFRSGDTVLYDMEVGSALLT
       :.:.:. . : :.::.   ..::.:::: : . .:::.:.:: .:..:.::.:....:. 
CCDS96 RLWNPQEKLP-CICTYNGDKKHGIPTSVDFIGCDPAHMVTSFNTGSAVIYDLETSQSLVI
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pF1KB3 LESRGSSG---PTQINQVVSHPNQPLTITAHDDRGIRFLDNRTGKPVHSMVAHLDAVTCL
       : :. .::    ..::.:::::. :.:::::.:: :.:.::.::: .::::::::::: :
CCDS96 LSSQVDSGLQSNNHINRVVSHPTLPVTITAHEDRHIKFFDNKTGKMIHSMVAHLDAVTSL
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       :::::: .:::::::::.:::.::.::::::::::::: .:.:. :: : ::: ::::::
CCDS96 AVDPNGIYLMSGSHDCSIRLWNLDSKTCVQEITAHRKKLDESIYDVAFHSSKAYIASAGA
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pF1KB3 DALAKVFV
       ::::::::
CCDS96 DALAKVFV
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CCDS41 PASEGAGPAAGPELSRPQQYTIPGILHYIQHEWARFEMERAHWEVERAELQARIAFLQGE
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       :::::::: ::::::::::::::::::::::::.::.::::. :  . :.  .  .:. :
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         .:: :.::.:::::::::.::::::::::.::.::::::: :  : ::.:: ...  .
CCDS41 APQNSQLTWKQGRQLLRQYLQEVGYTDTILDVRSQRVRSLLGLSNSEPNGSVE-TKNLEQ
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pF1KB3 APPGPAGLSGGESLLVKQIEEQIKRNAAGKDGKERLGGSVLGQIPFLQNCEDEDSDED-D
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CCDS41 I------LNGGES--PKQKGQEIKRSS----------GDVLETFNFLENADDSDEDEEND
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        ....     .:. .. :. ...:. .. :.    :.:.:..::::: ..:::::: . :
CCDS41 MIEGIPEGKDKHRMNKHKIGNEGLAADLTDDP---DTEEALKEFDFLVTAEDGEGAGEAR
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pF1KB3 RCTVDG--------SP------------------HELESR---------RVKLQGILADL
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CCDS41 S-SGDGTEWDKDDLSPTAEVWDVDQGLISKLKEQYKKERKGKKGVKRANRTKLYDMIADL
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pF1KB3 RDVDGLPPKVTG----PPPGTPQPRPHEGS-------FGFSSD---VFIM--DTIGGGEV
        : : ::   .:       .. .   :::.       . : :     :::  : .  . .
CCDS41 GD-DELPHIPSGIINQSRSASTRMTDHEGARAEEAEPITFPSGGGKSFIMGSDDVLLSVL
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pF1KB3 SLGDLADLTVTNDNDLSCDLSDSKDAFKKTWNPKFTLRSHYDGIRSLAFHHSQSALLTAS
       .:::::::::::: : : ::  .::::.::::::.:::::.::.:.::::  . .:.:::
CCDS41 GLGDLADLTVTNDADYSYDLPANKDAFRKTWNPKYTLRSHFDGVRALAFHPVEPVLVTAS
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pF1KB3 EDGTLKLWNLQKAVTAKKNAALDVEPIHAFRAHRGPVLAVAMGSNSEYCYSGGADACIHS
       :: :::::::::.: :::.:.::::::..:::: ::::..:..::.: :.::: :: :. 
CCDS41 EDHTLKLWNLQKTVPAKKSASLDVEPIYTFRAHIGPVLSLAISSNGEQCFSGGIDATIQW
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pF1KB3 WKIPDLSMDPYDGYDPSVLSHVLEGHGDAVWGLAFSPTSQRLASCSADGTVRIWDPSSSS
       :..:. :.:::: :.:.::. .: :: :::::::.:  ...: :::::::::.:.:. . 
CCDS41 WNMPSPSVDPYDTYEPNVLAGTLVGHTDAVWGLAYSGIKNQLLSCSADGTVRLWNPQEKL
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pF1KB3 PACLCTFPTASEHGVPTSVAFTSTEPAHIVASFRSGDTVLYDMEVGSALLTLESRGSSG-
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CCDS41 P-CICTYNGDKKHGIPTSVDFIGCDPAHMVTSFNTGSAVIYDLETSQSLVILSSQVDSGL
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pF1KB3 --PTQINQVVSHPNQPLTITAHDDRGIRFLDNRTGKPVHSMVAHLDAVTCLAVDPNGAFL
          ..::.:::::. :.:::::.:: :.:.::.::: .::::::::::: ::::::: .:
CCDS41 QSNNHINRVVSHPTLPVTITAHEDRHIKFFDNKTGKMIHSMVAHLDAVTSLAVDPNGIYL
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pF1KB3 MSGSHDCSLRLWSLDNKTCVQEITAHRKKHEEAIHAVACHPSKALIASAGADALAKVFV
       ::::::::.:::.::.::::::::::::: .:.:. :: : ::: ::::::::::::::
CCDS41 MSGSHDCSIRLWNLDSKTCVQEITAHRKKLDESIYDVAFHSSKAYIASAGADALAKVFV
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>>CCDS1784.1 STRN gene_id:6801|Hs108|chr2                 (780 aa)
 initn: 2379 init1: 750 opt: 1529  Z-score: 926.9  bits: 182.3 E(32554): 2.6e-45
Smith-Waterman score: 2359; 50.8% identity (72.3% similar) in 792 aa overlap (24-760:5-780)

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pF1KB3 MMEERAAAAVAAAASSCRPLGSGAGPGP--TGAAPVSAPAPGPGP-AGKGGGGGGSPGPT
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CCDS17                    MDEQAGPGVFFSNNHPGAGGAKGLGPLAEAAAAGDGAAAAG
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pF1KB3 AGPEPLSLPGILHFIQHEWARFEAEKARWEAERAELQAQVAFLQGERKGQENLKTDLVRR
       :.    ::::::::.::::::::.:.:.::.::::::::.:::::::::::::: :::::
CCDS17 AARAQYSLPGILHFLQHEWARFEVERAQWEVERAELQAQIAFLQGERKGQENLKKDLVRR
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       :::::::::::::::::::.::.::::. :    ..  .. .:    .:: :.::.::::
CCDS17 IKMLEYALKQERAKYHKLKYGTELNQGDMKPPSYDSDEGNETEVQPQQNSQLMWKQGRQL
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pF1KB3 LRQYLEEVGYTDTILDMRSKRVRSLLGRSLELNGAVEPSEGAPRAPPGPAGLSGGESLLV
       :::::.::::::::::..:::::.::: : ...   . ..               .. .:
CCDS17 LRQYLQEVGYTDTILDVKSKRVRALLGFSSDVTDREDDKN---------------QDSVV
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pF1KB3 KQIEEQIKRNAAGKDGKERLGGSVLGQIPFLQNCEDEDSDEDDELDSVQHKKQRVKLPSK
       .  : ..:..:    ..   ..::: .. ::..   . ::::.. :   ..:. .   . 
CCDS17 NGTEAEVKETAMIAKSELTDSASVLDNFKFLESAAADFSDEDEDDDVDGREKSVIDTSTI
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pF1KB3 ALVPEMEDEDEEDDSEDAINEFDFLGSGEDGEG----APD------------PRRCTVD-
       .    . :  :. :...:..::::: ..:.:..    : :            :.  .:: 
CCDS17 VRKKALPDSGEDRDTKEALKEFDFLVTSEEGDNESRSAGDGTDWEKEDQCLMPEAWNVDQ
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pF1KB3 GSPHELESR---------------RVKLQGILADLRDVDGLP---PKVTGPP-PGTPQPR
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CCDS17 GVITKLKEQYKKERKGKKGVKRPNRSKLQDMLANLRDVDELPSLQPSVGSPSRPSSSRLP
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pF1KB3 PHEG---------SFGFSSD-VFIM--DTIGGGEVSLGDLADLTVTNDND-LSCDLSDSK
        ::          .:  ::   :::  :    .:..::.:: :::.:. : :. :....:
CCDS17 EHEINRADEVEALTFPPSSGKSFIMGADEALESELGLGELAGLTVANEADSLTYDIANNK
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CCDS17 DALRKTWNPKFTLRSHFDGIRALAFHPIEPVLITASEDHTLKMWNLQKTAPAKKSTSLDV
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