Result of FASTA (omim) for
pF1KB3567
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3567, 714 aa
1>>>pF1KB3567 714 - 714 aa - 714 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.8077+/-0.000476; mu= 23.4554+/- 0.030
mean_var=78.2153+/-15.165, 0's: 0 Z-trim(110.7): 141 B-trim: 544 in 1/51
Lambda= 0.145020
statistics sampled from 18953 (19107) to 18953 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.574), E-opt: 0.2 (0.224), width: 16
Scan time: 10.180
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_005177 (OMIM: 114220,616907) calpain-1 catalyti ( 714) 4816 1018.0 0
NP_001185797 (OMIM: 114220,616907) calpain-1 catal ( 714) 4816 1018.0 0
XP_006718761 (OMIM: 114220,616907) PREDICTED: calp ( 714) 4816 1018.0 0
NP_001185798 (OMIM: 114220,616907) calpain-1 catal ( 714) 4816 1018.0 0
XP_011543594 (OMIM: 114220,616907) PREDICTED: calp ( 714) 4816 1018.0 0
NP_001739 (OMIM: 114230) calpain-2 catalytic subun ( 700) 3193 678.5 2.5e-194
NP_001139540 (OMIM: 114230) calpain-2 catalytic su ( 622) 2855 607.7 4.4e-173
NP_008989 (OMIM: 604822) calpain-11 [Homo sapiens] ( 739) 2770 590.0 1.1e-167
XP_006715047 (OMIM: 604822) PREDICTED: calpain-11 ( 740) 2770 590.0 1.1e-167
XP_011512577 (OMIM: 604822) PREDICTED: calpain-11 ( 743) 2770 590.0 1.1e-167
XP_011512576 (OMIM: 604822) PREDICTED: calpain-11 ( 744) 2770 590.0 1.1e-167
XP_006715048 (OMIM: 604822) PREDICTED: calpain-11 ( 724) 2694 574.1 6.8e-163
NP_775110 (OMIM: 114240,253600) calpain-3 isoform ( 729) 2691 573.5 1e-162
XP_006715050 (OMIM: 604822) PREDICTED: calpain-11 ( 650) 2436 520.1 1.1e-146
NP_006606 (OMIM: 606401) calpain-9 isoform 1 [Homo ( 690) 2200 470.7 8.5e-132
XP_011542588 (OMIM: 114230) PREDICTED: calpain-2 c ( 447) 2176 465.5 2e-130
XP_011542319 (OMIM: 606401) PREDICTED: calpain-9 i ( 721) 2163 463.0 1.9e-129
XP_016855588 (OMIM: 606401) PREDICTED: calpain-9 i ( 495) 1794 385.6 2.5e-106
XP_011542322 (OMIM: 606401) PREDICTED: calpain-9 i ( 526) 1757 377.9 5.6e-104
NP_001306605 (OMIM: 606401) calpain-9 isoform 3 [H ( 627) 1744 375.3 4.2e-103
XP_011542321 (OMIM: 606401) PREDICTED: calpain-9 i ( 658) 1707 367.5 9.2e-101
XP_016881846 (OMIM: 608839) PREDICTED: calpain-12 ( 699) 1552 335.1 5.5e-91
XP_016881847 (OMIM: 608839) PREDICTED: calpain-12 ( 698) 1538 332.2 4.2e-90
XP_016881845 (OMIM: 608839) PREDICTED: calpain-12 ( 702) 1495 323.2 2.2e-87
XP_016881854 (OMIM: 608839) PREDICTED: calpain-12 ( 503) 1375 298.0 6.2e-80
XP_016881852 (OMIM: 608839) PREDICTED: calpain-12 ( 565) 1375 298.0 6.7e-80
XP_016881851 (OMIM: 608839) PREDICTED: calpain-12 ( 590) 1375 298.0 6.9e-80
XP_016881850 (OMIM: 608839) PREDICTED: calpain-12 ( 604) 1375 298.0 7e-80
XP_016881849 (OMIM: 608839) PREDICTED: calpain-12 ( 652) 1375 298.1 7.4e-80
XP_016881848 (OMIM: 608839) PREDICTED: calpain-12 ( 676) 1375 298.1 7.6e-80
NP_653292 (OMIM: 608839) calpain-12 [Homo sapiens] ( 719) 1375 298.1 7.9e-80
XP_016881844 (OMIM: 608839) PREDICTED: calpain-12 ( 723) 1375 298.1 8e-80
XP_011531165 (OMIM: 610229) PREDICTED: calpain-14 ( 684) 1333 289.3 3.4e-77
XP_011531166 (OMIM: 610229) PREDICTED: calpain-14 ( 684) 1333 289.3 3.4e-77
NP_001138594 (OMIM: 610229) calpain-14 isoform 1 [ ( 684) 1333 289.3 3.4e-77
XP_011531167 (OMIM: 610229) PREDICTED: calpain-14 ( 684) 1333 289.3 3.4e-77
NP_057536 (OMIM: 606401) calpain-9 isoform 2 [Homo ( 664) 1154 251.8 6.2e-66
XP_011542320 (OMIM: 606401) PREDICTED: calpain-9 i ( 695) 1154 251.9 6.4e-66
XP_016860755 (OMIM: 610228) PREDICTED: calpain-13 ( 665) 942 207.5 1.4e-52
XP_011531465 (OMIM: 610228) PREDICTED: calpain-13 ( 433) 937 206.3 2.1e-52
XP_016860753 (OMIM: 610228) PREDICTED: calpain-13 ( 669) 937 206.4 2.9e-52
XP_011531462 (OMIM: 610228) PREDICTED: calpain-13 ( 669) 937 206.4 2.9e-52
XP_011531463 (OMIM: 610228) PREDICTED: calpain-13 ( 669) 937 206.4 2.9e-52
XP_016860754 (OMIM: 610228) PREDICTED: calpain-13 ( 669) 937 206.4 2.9e-52
NP_653176 (OMIM: 610228) calpain-13 [Homo sapiens] ( 669) 937 206.4 2.9e-52
XP_011531461 (OMIM: 610228) PREDICTED: calpain-13 ( 669) 937 206.4 2.9e-52
XP_016855587 (OMIM: 606401) PREDICTED: calpain-9 i ( 693) 923 203.5 2.3e-51
NP_077320 (OMIM: 114240,253600) calpain-3 isoform ( 815) 921 203.2 3.4e-51
NP_000061 (OMIM: 114240,253600) calpain-3 isoform ( 821) 921 203.2 3.4e-51
NP_004046 (OMIM: 193235,602537) calpain-5 [Homo sa ( 640) 828 183.6 2.1e-45
>>NP_005177 (OMIM: 114220,616907) calpain-1 catalytic su (714 aa)
initn: 4816 init1: 4816 opt: 4816 Z-score: 5445.0 bits: 1018.0 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4816; 100.0% identity (100.0% similar) in 714 aa overlap (1-714:1-714)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MSEEIITPVYCTGVSAQVQKQRARELGLGRHENAIKYLGQDYEQLRVRCLQSGTLFRDEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 MSEEIITPVYCTGVSAQVQKQRARELGLGRHENAIKYLGQDYEQLRVRCLQSGTLFRDEA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 FPPVPQSLGYKDLGPNSSKTYGIKWKRPTELLSNPQFIVDGATRTDICQGALGDCWLLAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 FPPVPQSLGYKDLGPNSSKTYGIKWKRPTELLSNPQFIVDGATRTDICQGALGDCWLLAA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 IASLTLNDTLLHRVVPHGQSFQNGYAGIFHFQLWQFGEWVDVVVDDLLPIKDGKLVFVHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 IASLTLNDTLLHRVVPHGQSFQNGYAGIFHFQLWQFGEWVDVVVDDLLPIKDGKLVFVHS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 AEGNEFWSALLEKAYAKVNGSYEALSGGSTSEGFEDFTGGVTEWYELRKAPSDLYQIILK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 AEGNEFWSALLEKAYAKVNGSYEALSGGSTSEGFEDFTGGVTEWYELRKAPSDLYQIILK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 ALERGSLLGCSIDISSVLDMEAITFKKLVKGHAYSVTGAKQVNYRGQVVSLIRMRNPWGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 ALERGSLLGCSIDISSVLDMEAITFKKLVKGHAYSVTGAKQVNYRGQVVSLIRMRNPWGE
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310 320 330 340 350 360
pF1KB3 VEWTGAWSDSSSEWNNVDPYERDQLRVKMEDGEFWMSFRDFMREFTRLEICNLTPDALKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 VEWTGAWSDSSSEWNNVDPYERDQLRVKMEDGEFWMSFRDFMREFTRLEICNLTPDALKS
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370 380 390 400 410 420
pF1KB3 RTIRKWNTTLYEGTWRRGSTAGGCRNYPATFWVNPQFKIRLDETDDPDDYGDRESGCSFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 RTIRKWNTTLYEGTWRRGSTAGGCRNYPATFWVNPQFKIRLDETDDPDDYGDRESGCSFV
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430 440 450 460 470 480
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 LALMQKHRRRERRFGRDMETIGFAVYEVPPELVGQPAVHLKRDFFLANASRARSEQFINL
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490 500 510 520 530 540
pF1KB3 REVSTRFRLPPGEYVVVPSTFEPNKEGDFVLRFFSEKSAGTVELDDQIQANLPDEQVLSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 REVSTRFRLPPGEYVVVPSTFEPNKEGDFVLRFFSEKSAGTVELDDQIQANLPDEQVLSE
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550 560 570 580 590 600
pF1KB3 EEIDENFKALFRQLAGEDMEISVKELRTILNRIISKHKDLRTKGFSLESCRSMVNLMDRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 EEIDENFKALFRQLAGEDMEISVKELRTILNRIISKHKDLRTKGFSLESCRSMVNLMDRD
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610 620 630 640 650 660
pF1KB3 GNGKLGLVEFNILWNRIRNYLSIFRKFDLDKSGSMSAYEMRMAIESAGFKLNKKLYELII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 GNGKLGLVEFNILWNRIRNYLSIFRKFDLDKSGSMSAYEMRMAIESAGFKLNKKLYELII
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710
pF1KB3 TRYSEPDLAVDFDNFVCCLVRLETMFRFFKTLDTDLDGVVTFDLFKWLQLTMFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 TRYSEPDLAVDFDNFVCCLVRLETMFRFFKTLDTDLDGVVTFDLFKWLQLTMFA
670 680 690 700 710
>>NP_001185797 (OMIM: 114220,616907) calpain-1 catalytic (714 aa)
initn: 4816 init1: 4816 opt: 4816 Z-score: 5445.0 bits: 1018.0 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4816; 100.0% identity (100.0% similar) in 714 aa overlap (1-714:1-714)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MSEEIITPVYCTGVSAQVQKQRARELGLGRHENAIKYLGQDYEQLRVRCLQSGTLFRDEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MSEEIITPVYCTGVSAQVQKQRARELGLGRHENAIKYLGQDYEQLRVRCLQSGTLFRDEA
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pF1KB3 FPPVPQSLGYKDLGPNSSKTYGIKWKRPTELLSNPQFIVDGATRTDICQGALGDCWLLAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FPPVPQSLGYKDLGPNSSKTYGIKWKRPTELLSNPQFIVDGATRTDICQGALGDCWLLAA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IASLTLNDTLLHRVVPHGQSFQNGYAGIFHFQLWQFGEWVDVVVDDLLPIKDGKLVFVHS
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pF1KB3 AEGNEFWSALLEKAYAKVNGSYEALSGGSTSEGFEDFTGGVTEWYELRKAPSDLYQIILK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AEGNEFWSALLEKAYAKVNGSYEALSGGSTSEGFEDFTGGVTEWYELRKAPSDLYQIILK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 ALERGSLLGCSIDISSVLDMEAITFKKLVKGHAYSVTGAKQVNYRGQVVSLIRMRNPWGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ALERGSLLGCSIDISSVLDMEAITFKKLVKGHAYSVTGAKQVNYRGQVVSLIRMRNPWGE
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310 320 330 340 350 360
pF1KB3 VEWTGAWSDSSSEWNNVDPYERDQLRVKMEDGEFWMSFRDFMREFTRLEICNLTPDALKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VEWTGAWSDSSSEWNNVDPYERDQLRVKMEDGEFWMSFRDFMREFTRLEICNLTPDALKS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RTIRKWNTTLYEGTWRRGSTAGGCRNYPATFWVNPQFKIRLDETDDPDDYGDRESGCSFV
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pF1KB3 LALMQKHRRRERRFGRDMETIGFAVYEVPPELVGQPAVHLKRDFFLANASRARSEQFINL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LALMQKHRRRERRFGRDMETIGFAVYEVPPELVGQPAVHLKRDFFLANASRARSEQFINL
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pF1KB3 REVSTRFRLPPGEYVVVPSTFEPNKEGDFVLRFFSEKSAGTVELDDQIQANLPDEQVLSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 REVSTRFRLPPGEYVVVPSTFEPNKEGDFVLRFFSEKSAGTVELDDQIQANLPDEQVLSE
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pF1KB3 EEIDENFKALFRQLAGEDMEISVKELRTILNRIISKHKDLRTKGFSLESCRSMVNLMDRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EEIDENFKALFRQLAGEDMEISVKELRTILNRIISKHKDLRTKGFSLESCRSMVNLMDRD
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610 620 630 640 650 660
pF1KB3 GNGKLGLVEFNILWNRIRNYLSIFRKFDLDKSGSMSAYEMRMAIESAGFKLNKKLYELII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GNGKLGLVEFNILWNRIRNYLSIFRKFDLDKSGSMSAYEMRMAIESAGFKLNKKLYELII
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710
pF1KB3 TRYSEPDLAVDFDNFVCCLVRLETMFRFFKTLDTDLDGVVTFDLFKWLQLTMFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TRYSEPDLAVDFDNFVCCLVRLETMFRFFKTLDTDLDGVVTFDLFKWLQLTMFA
670 680 690 700 710
>>XP_006718761 (OMIM: 114220,616907) PREDICTED: calpain- (714 aa)
initn: 4816 init1: 4816 opt: 4816 Z-score: 5445.0 bits: 1018.0 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4816; 100.0% identity (100.0% similar) in 714 aa overlap (1-714:1-714)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MSEEIITPVYCTGVSAQVQKQRARELGLGRHENAIKYLGQDYEQLRVRCLQSGTLFRDEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 MSEEIITPVYCTGVSAQVQKQRARELGLGRHENAIKYLGQDYEQLRVRCLQSGTLFRDEA
10 20 30 40 50 60
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pF1KB3 FPPVPQSLGYKDLGPNSSKTYGIKWKRPTELLSNPQFIVDGATRTDICQGALGDCWLLAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 FPPVPQSLGYKDLGPNSSKTYGIKWKRPTELLSNPQFIVDGATRTDICQGALGDCWLLAA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 IASLTLNDTLLHRVVPHGQSFQNGYAGIFHFQLWQFGEWVDVVVDDLLPIKDGKLVFVHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 IASLTLNDTLLHRVVPHGQSFQNGYAGIFHFQLWQFGEWVDVVVDDLLPIKDGKLVFVHS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 AEGNEFWSALLEKAYAKVNGSYEALSGGSTSEGFEDFTGGVTEWYELRKAPSDLYQIILK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 AEGNEFWSALLEKAYAKVNGSYEALSGGSTSEGFEDFTGGVTEWYELRKAPSDLYQIILK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 ALERGSLLGCSIDISSVLDMEAITFKKLVKGHAYSVTGAKQVNYRGQVVSLIRMRNPWGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 ALERGSLLGCSIDISSVLDMEAITFKKLVKGHAYSVTGAKQVNYRGQVVSLIRMRNPWGE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 VEWTGAWSDSSSEWNNVDPYERDQLRVKMEDGEFWMSFRDFMREFTRLEICNLTPDALKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 VEWTGAWSDSSSEWNNVDPYERDQLRVKMEDGEFWMSFRDFMREFTRLEICNLTPDALKS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 RTIRKWNTTLYEGTWRRGSTAGGCRNYPATFWVNPQFKIRLDETDDPDDYGDRESGCSFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 RTIRKWNTTLYEGTWRRGSTAGGCRNYPATFWVNPQFKIRLDETDDPDDYGDRESGCSFV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 LALMQKHRRRERRFGRDMETIGFAVYEVPPELVGQPAVHLKRDFFLANASRARSEQFINL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 LALMQKHRRRERRFGRDMETIGFAVYEVPPELVGQPAVHLKRDFFLANASRARSEQFINL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 REVSTRFRLPPGEYVVVPSTFEPNKEGDFVLRFFSEKSAGTVELDDQIQANLPDEQVLSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 REVSTRFRLPPGEYVVVPSTFEPNKEGDFVLRFFSEKSAGTVELDDQIQANLPDEQVLSE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 EEIDENFKALFRQLAGEDMEISVKELRTILNRIISKHKDLRTKGFSLESCRSMVNLMDRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 EEIDENFKALFRQLAGEDMEISVKELRTILNRIISKHKDLRTKGFSLESCRSMVNLMDRD
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 GNGKLGLVEFNILWNRIRNYLSIFRKFDLDKSGSMSAYEMRMAIESAGFKLNKKLYELII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 GNGKLGLVEFNILWNRIRNYLSIFRKFDLDKSGSMSAYEMRMAIESAGFKLNKKLYELII
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 TRYSEPDLAVDFDNFVCCLVRLETMFRFFKTLDTDLDGVVTFDLFKWLQLTMFA
670 680 690 700 710
>>NP_001185798 (OMIM: 114220,616907) calpain-1 catalytic (714 aa)
initn: 4816 init1: 4816 opt: 4816 Z-score: 5445.0 bits: 1018.0 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4816; 100.0% identity (100.0% similar) in 714 aa overlap (1-714:1-714)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MSEEIITPVYCTGVSAQVQKQRARELGLGRHENAIKYLGQDYEQLRVRCLQSGTLFRDEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FPPVPQSLGYKDLGPNSSKTYGIKWKRPTELLSNPQFIVDGATRTDICQGALGDCWLLAA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IASLTLNDTLLHRVVPHGQSFQNGYAGIFHFQLWQFGEWVDVVVDDLLPIKDGKLVFVHS
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190 200 210 220 230 240
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AEGNEFWSALLEKAYAKVNGSYEALSGGSTSEGFEDFTGGVTEWYELRKAPSDLYQIILK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ALERGSLLGCSIDISSVLDMEAITFKKLVKGHAYSVTGAKQVNYRGQVVSLIRMRNPWGE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VEWTGAWSDSSSEWNNVDPYERDQLRVKMEDGEFWMSFRDFMREFTRLEICNLTPDALKS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RTIRKWNTTLYEGTWRRGSTAGGCRNYPATFWVNPQFKIRLDETDDPDDYGDRESGCSFV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LALMQKHRRRERRFGRDMETIGFAVYEVPPELVGQPAVHLKRDFFLANASRARSEQFINL
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pF1KB3 REVSTRFRLPPGEYVVVPSTFEPNKEGDFVLRFFSEKSAGTVELDDQIQANLPDEQVLSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 REVSTRFRLPPGEYVVVPSTFEPNKEGDFVLRFFSEKSAGTVELDDQIQANLPDEQVLSE
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pF1KB3 EEIDENFKALFRQLAGEDMEISVKELRTILNRIISKHKDLRTKGFSLESCRSMVNLMDRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EEIDENFKALFRQLAGEDMEISVKELRTILNRIISKHKDLRTKGFSLESCRSMVNLMDRD
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pF1KB3 GNGKLGLVEFNILWNRIRNYLSIFRKFDLDKSGSMSAYEMRMAIESAGFKLNKKLYELII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GNGKLGLVEFNILWNRIRNYLSIFRKFDLDKSGSMSAYEMRMAIESAGFKLNKKLYELII
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670 680 690 700 710
pF1KB3 TRYSEPDLAVDFDNFVCCLVRLETMFRFFKTLDTDLDGVVTFDLFKWLQLTMFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TRYSEPDLAVDFDNFVCCLVRLETMFRFFKTLDTDLDGVVTFDLFKWLQLTMFA
670 680 690 700 710
>>XP_011543594 (OMIM: 114220,616907) PREDICTED: calpain- (714 aa)
initn: 4816 init1: 4816 opt: 4816 Z-score: 5445.0 bits: 1018.0 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4816; 100.0% identity (100.0% similar) in 714 aa overlap (1-714:1-714)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MSEEIITPVYCTGVSAQVQKQRARELGLGRHENAIKYLGQDYEQLRVRCLQSGTLFRDEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MSEEIITPVYCTGVSAQVQKQRARELGLGRHENAIKYLGQDYEQLRVRCLQSGTLFRDEA
10 20 30 40 50 60
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pF1KB3 FPPVPQSLGYKDLGPNSSKTYGIKWKRPTELLSNPQFIVDGATRTDICQGALGDCWLLAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FPPVPQSLGYKDLGPNSSKTYGIKWKRPTELLSNPQFIVDGATRTDICQGALGDCWLLAA
70 80 90 100 110 120
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pF1KB3 IASLTLNDTLLHRVVPHGQSFQNGYAGIFHFQLWQFGEWVDVVVDDLLPIKDGKLVFVHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 IASLTLNDTLLHRVVPHGQSFQNGYAGIFHFQLWQFGEWVDVVVDDLLPIKDGKLVFVHS
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pF1KB3 AEGNEFWSALLEKAYAKVNGSYEALSGGSTSEGFEDFTGGVTEWYELRKAPSDLYQIILK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AEGNEFWSALLEKAYAKVNGSYEALSGGSTSEGFEDFTGGVTEWYELRKAPSDLYQIILK
190 200 210 220 230 240
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pF1KB3 ALERGSLLGCSIDISSVLDMEAITFKKLVKGHAYSVTGAKQVNYRGQVVSLIRMRNPWGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ALERGSLLGCSIDISSVLDMEAITFKKLVKGHAYSVTGAKQVNYRGQVVSLIRMRNPWGE
250 260 270 280 290 300
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pF1KB3 VEWTGAWSDSSSEWNNVDPYERDQLRVKMEDGEFWMSFRDFMREFTRLEICNLTPDALKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VEWTGAWSDSSSEWNNVDPYERDQLRVKMEDGEFWMSFRDFMREFTRLEICNLTPDALKS
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pF1KB3 RTIRKWNTTLYEGTWRRGSTAGGCRNYPATFWVNPQFKIRLDETDDPDDYGDRESGCSFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RTIRKWNTTLYEGTWRRGSTAGGCRNYPATFWVNPQFKIRLDETDDPDDYGDRESGCSFV
370 380 390 400 410 420
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pF1KB3 LALMQKHRRRERRFGRDMETIGFAVYEVPPELVGQPAVHLKRDFFLANASRARSEQFINL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LALMQKHRRRERRFGRDMETIGFAVYEVPPELVGQPAVHLKRDFFLANASRARSEQFINL
430 440 450 460 470 480
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pF1KB3 REVSTRFRLPPGEYVVVPSTFEPNKEGDFVLRFFSEKSAGTVELDDQIQANLPDEQVLSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 REVSTRFRLPPGEYVVVPSTFEPNKEGDFVLRFFSEKSAGTVELDDQIQANLPDEQVLSE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 EEIDENFKALFRQLAGEDMEISVKELRTILNRIISKHKDLRTKGFSLESCRSMVNLMDRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EEIDENFKALFRQLAGEDMEISVKELRTILNRIISKHKDLRTKGFSLESCRSMVNLMDRD
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 GNGKLGLVEFNILWNRIRNYLSIFRKFDLDKSGSMSAYEMRMAIESAGFKLNKKLYELII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GNGKLGLVEFNILWNRIRNYLSIFRKFDLDKSGSMSAYEMRMAIESAGFKLNKKLYELII
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710
pF1KB3 TRYSEPDLAVDFDNFVCCLVRLETMFRFFKTLDTDLDGVVTFDLFKWLQLTMFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TRYSEPDLAVDFDNFVCCLVRLETMFRFFKTLDTDLDGVVTFDLFKWLQLTMFA
670 680 690 700 710
>>NP_001739 (OMIM: 114230) calpain-2 catalytic subunit i (700 aa)
initn: 3167 init1: 1976 opt: 3193 Z-score: 3609.9 bits: 678.5 E(85289): 2.5e-194
Smith-Waterman score: 3193; 62.9% identity (86.9% similar) in 701 aa overlap (13-713:3-700)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MSEEIITPVYCTGVSAQVQKQRARELGLGRHENAIKYLGQDYEQLRVRCLQSGTLFRDEA
:..:.. :.: ::: :: :::::.:::: :: .::..::::.: .
NP_001 MAGIAAKLAKDREAAEGLGSHERAIKYLNQDYEALRNECLEAGTLFQDPS
10 20 30 40 50
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pF1KB3 FPPVPQSLGYKDLGPNSSKTYGIKWKRPTELLSNPQFIVDGATRTDICQGALGDCWLLAA
:: .:..::.:.::: :::: ::.::::::. ..::::. ::::::::::::::::::::
NP_001 FPAIPSALGFKELGPYSSKTRGIEWKRPTEICADPQFIIGGATRTDICQGALGDCWLLAA
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130 140 150 160 170 180
pF1KB3 IASLTLNDTLLHRVVPHGQSFQNGYAGIFHFQLWQFGEWVDVVVDDLLPIKDGKLVFVHS
:::::::. .: :::: .::::..::::::::.::.::::.::::: :: :::.:.::::
NP_001 IASLTLNEEILARVVPLNQSFQENYAGIFHFQFWQYGEWVEVVVDDRLPTKDGELLFVHS
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 AEGNEFWSALLEKAYAKVNGSYEALSGGSTSEGFEDFTGGVTEWYELRKAPSDLYQIILK
:::.:::::::::::::.:: :::::::.:.:::::::::..:::::.: : .:..:: :
NP_001 AEGSEFWSALLEKAYAKINGCYEALSGGATTEGFEDFTGGIAEWYELKKPPPNLFKIIQK
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 ALERGSLLGCSIDISSVLDMEAITFKKLVKGHAYSVTGAKQVNYRGQVVSLIRMRNPWGE
::..::::::::::.:. : :::::.:::::::::::::..:. :.. .:::.::::::
NP_001 ALQKGSLLGCSIDITSAADSEAITFQKLVKGHAYSVTGAEEVESNGSLQKLIRIRNPWGE
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 VEWTGAWSDSSSEWNNVDPYERDQLRVKMEDGEFWMSFRDFMREFTRLEICNLTPDALKS
::::: :.:. ::..:: ::..: . ::::::::: ::.:...::::::::::.: :
NP_001 VEWTGRWNDNCPSWNTIDPEERERLTRRHEDGEFWMSFSDFLRHYSRLEICNLTPDTLTS
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 RTIRKWNTTLYEGTWRRGSTAGGCRNYPATFWVNPQFKIRLDETDDPDDYGDRESGCSFV
: .::. : ..:.:::::::::::::: :::.:::. :.:.: : .: : ::::.:.
NP_001 DTYKKWKLTKMDGNWRRGSTAGGCRNYPNTFWMNPQYLIKLEEED--EDEEDGESGCTFL
360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 LALMQKHRRRERRFGRDMETIGFAVYEVPPELVGQPAVHLKRDFFLANASRARSEQFINL
..:.::::::.:..:.::.::::..:::: :: :: .::...:::.: .: ::. ::::
NP_001 VGLIQKHRRRQRKMGEDMHTIGFGIYEVPEELSGQTNIHLSKNFFLTNRARERSDTFINL
410 420 430 440 450 460
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 REVSTRFRLPPGEYVVVPSTFEPNKEGDFVLRFFSEKSAGTVELDDQIQANLPDEQVLSE
::: .::.::::::..:::::::::.::: .: ::::.: .::.:.::: . .. ::
NP_001 REVLNRFKLPPGEYILVPSTFEPNKDGDFCIRVFSEKKADYQAVDDEIEANLEEFDI-SE
470 480 490 500 510 520
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 EEIDENFKALFRQLAGEDMEISVKELRTILNRIISKHKDLRTKGFSLESCRSMVNLMDRD
..::..:. :: :::::: :::. ::.::: :...:..:... :::.:.:. ::...: :
NP_001 DDIDDGFRRLFAQLAGEDAEISAFELQTILRRVLAKRQDIKSDGFSIETCKIMVDMLDSD
530 540 550 560 570 580
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 GNGKLGLVEFNILWNRIRNYLSIFRKFDLDKSGSMSAYEMRMAIESAGFKLNKKLYELII
:.::::: :: :::..:..: .:.:..:.:.::.:..:::: :.: ::::. .:...:.
NP_001 GSGKLGLKEFYILWTKIQKYQKIYREIDVDRSGTMNSYEMRKALEEAGFKMPCQLHQVIV
590 600 610 620 630 640
670 680 690 700 710
pF1KB3 TRYSEPDLAVDFDNFVCCLVRLETMFRFFKTLDTDLDGVVTFDLFKWLQLTMFA
.:... .: .:::::: :::::::.:..:: :: . :.. .::..:: ....
NP_001 ARFADDQLIIDFDNFVRCLVRLETLFKIFKQLDPENTGTIELDLISWLCFSVL
650 660 670 680 690 700
>>NP_001139540 (OMIM: 114230) calpain-2 catalytic subuni (622 aa)
initn: 2846 init1: 1655 opt: 2855 Z-score: 3228.4 bits: 607.7 E(85289): 4.4e-173
Smith-Waterman score: 2855; 63.1% identity (87.3% similar) in 624 aa overlap (90-713:2-622)
60 70 80 90 100 110
pF1KB3 AFPPVPQSLGYKDLGPNSSKTYGIKWKRPTELLSNPQFIVDGATRTDICQGALGDCWLLA
:. ..::::. :::::::::::::::::::
NP_001 MEICADPQFIIGGATRTDICQGALGDCWLLA
10 20 30
120 130 140 150 160 170
pF1KB3 AIASLTLNDTLLHRVVPHGQSFQNGYAGIFHFQLWQFGEWVDVVVDDLLPIKDGKLVFVH
::::::::. .: :::: .::::..::::::::.::.::::.::::: :: :::.:.:::
NP_001 AIASLTLNEEILARVVPLNQSFQENYAGIFHFQFWQYGEWVEVVVDDRLPTKDGELLFVH
40 50 60 70 80 90
180 190 200 210 220 230
pF1KB3 SAEGNEFWSALLEKAYAKVNGSYEALSGGSTSEGFEDFTGGVTEWYELRKAPSDLYQIIL
::::.:::::::::::::.:: :::::::.:.:::::::::..:::::.: : .:..::
NP_001 SAEGSEFWSALLEKAYAKINGCYEALSGGATTEGFEDFTGGIAEWYELKKPPPNLFKIIQ
100 110 120 130 140 150
240 250 260 270 280 290
pF1KB3 KALERGSLLGCSIDISSVLDMEAITFKKLVKGHAYSVTGAKQVNYRGQVVSLIRMRNPWG
:::..::::::::::.:. : :::::.:::::::::::::..:. :.. .:::.:::::
NP_001 KALQKGSLLGCSIDITSAADSEAITFQKLVKGHAYSVTGAEEVESNGSLQKLIRIRNPWG
160 170 180 190 200 210
300 310 320 330 340 350
pF1KB3 EVEWTGAWSDSSSEWNNVDPYERDQLRVKMEDGEFWMSFRDFMREFTRLEICNLTPDALK
:::::: :.:. ::..:: ::..: . ::::::::: ::.:...::::::::::.:
NP_001 EVEWTGRWNDNCPSWNTIDPEERERLTRRHEDGEFWMSFSDFLRHYSRLEICNLTPDTLT
220 230 240 250 260 270
360 370 380 390 400 410
pF1KB3 SRTIRKWNTTLYEGTWRRGSTAGGCRNYPATFWVNPQFKIRLDETDDPDDYGDRESGCSF
: : .::. : ..:.:::::::::::::: :::.:::. :.:.: : .: : ::::.:
NP_001 SDTYKKWKLTKMDGNWRRGSTAGGCRNYPNTFWMNPQYLIKLEEED--EDEEDGESGCTF
280 290 300 310 320
420 430 440 450 460 470
pF1KB3 VLALMQKHRRRERRFGRDMETIGFAVYEVPPELVGQPAVHLKRDFFLANASRARSEQFIN
...:.::::::.:..:.::.::::..:::: :: :: .::...:::.: .: ::. :::
NP_001 LVGLIQKHRRRQRKMGEDMHTIGFGIYEVPEELSGQTNIHLSKNFFLTNRARERSDTFIN
330 340 350 360 370 380
480 490 500 510 520 530
pF1KB3 LREVSTRFRLPPGEYVVVPSTFEPNKEGDFVLRFFSEKSAGTVELDDQIQANLPDEQVLS
:::: .::.::::::..:::::::::.::: .: ::::.: .::.:.::: . .. :
NP_001 LREVLNRFKLPPGEYILVPSTFEPNKDGDFCIRVFSEKKADYQAVDDEIEANLEEFDI-S
390 400 410 420 430 440
540 550 560 570 580 590
pF1KB3 EEEIDENFKALFRQLAGEDMEISVKELRTILNRIISKHKDLRTKGFSLESCRSMVNLMDR
:..::..:. :: :::::: :::. ::.::: :...:..:... :::.:.:. ::...:
NP_001 EDDIDDGFRRLFAQLAGEDAEISAFELQTILRRVLAKRQDIKSDGFSIETCKIMVDMLDS
450 460 470 480 490 500
600 610 620 630 640 650
pF1KB3 DGNGKLGLVEFNILWNRIRNYLSIFRKFDLDKSGSMSAYEMRMAIESAGFKLNKKLYELI
::.::::: :: :::..:..: .:.:..:.:.::.:..:::: :.: ::::. .:...:
NP_001 DGSGKLGLKEFYILWTKIQKYQKIYREIDVDRSGTMNSYEMRKALEEAGFKMPCQLHQVI
510 520 530 540 550 560
660 670 680 690 700 710
pF1KB3 ITRYSEPDLAVDFDNFVCCLVRLETMFRFFKTLDTDLDGVVTFDLFKWLQLTMFA
..:... .: .:::::: :::::::.:..:: :: . :.. .::..:: ....
NP_001 VARFADDQLIIDFDNFVRCLVRLETLFKIFKQLDPENTGTIELDLISWLCFSVL
570 580 590 600 610 620
>>NP_008989 (OMIM: 604822) calpain-11 [Homo sapiens] (739 aa)
initn: 2773 init1: 1758 opt: 2770 Z-score: 3131.3 bits: 590.0 E(85289): 1.1e-167
Smith-Waterman score: 2770; 54.6% identity (83.4% similar) in 710 aa overlap (8-713:31-738)
10 20 30
pF1KB3 MSEEIITPVYC-TGVSAQVQKQRARELGLGRHENAIK
:.. ::. :.....: . :.:.:.:: .
NP_008 MLYSPGPSLPESAESLDGSQEDKPRGSCAEPTFTDTGMVAHINNSRLKAKGVGQHDNAQN
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB3 YLGQDYEQLRVRCLQSGTLFRDEAFPPVPQSLGYKDLGPNSSKTYGIKWKRPTELLSNPQ
. .:..:.::. ::..: ::.: :: :.:::.:::::::... .:.:.:: ....::
NP_008 FGNQSFEELRAACLRKGELFEDPLFPAEPSSLGFKDLGPNSKNVQNISWQRPKDIINNPL
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB3 FIVDGATRTDICQGALGDCWLLAAIASLTLNDTLLHRVVPHGQSFQNGYAGIFHFQLWQF
::.:: . :::::: ::::::::::.::: ::.::::.::::...::::::::.:::
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60827320 residues in 85289 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]