FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB3614, 418 aa 1>>>pF1KB3614 418 - 418 aa - 418 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8066+/-0.00097; mu= 14.1399+/- 0.058 mean_var=65.9858+/-13.804, 0's: 0 Z-trim(103.3): 32 B-trim: 67 in 1/50 Lambda= 0.157888 statistics sampled from 7337 (7354) to 7337 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.598), E-opt: 0.2 (0.226), width: 16 Scan time: 2.520 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS7342.1 AP3M1 gene_id:26985|Hs108|chr10 ( 418) 2760 637.9 5.4e-183 CCDS6125.1 AP3M2 gene_id:10947|Hs108|chr8 ( 418) 2448 566.8 1.3e-161 CCDS77234.1 AP1M2 gene_id:10053|Hs108|chr19 ( 425) 527 129.2 7.2e-30 CCDS45964.1 AP1M2 gene_id:10053|Hs108|chr19 ( 423) 513 126.0 6.6e-29 CCDS12342.1 AP1M1 gene_id:8907|Hs108|chr19 ( 423) 482 119.0 8.8e-27 CCDS43177.1 AP2M1 gene_id:1173|Hs108|chr3 ( 435) 383 96.4 5.5e-20 CCDS43178.1 AP2M1 gene_id:1173|Hs108|chr3 ( 433) 376 94.8 1.7e-19 CCDS82880.1 AP2M1 gene_id:1173|Hs108|chr3 ( 460) 345 87.8 2.3e-17 CCDS46008.1 AP1M1 gene_id:8907|Hs108|chr19 ( 435) 273 71.4 1.9e-12 CCDS5685.1 AP4M1 gene_id:9179|Hs108|chr7 ( 453) 271 70.9 2.7e-12 >>CCDS7342.1 AP3M1 gene_id:26985|Hs108|chr10 (418 aa) initn: 2760 init1: 2760 opt: 2760 Z-score: 3398.7 bits: 637.9 E(32554): 5.4e-183 Smith-Waterman score: 2760; 100.0% identity (100.0% similar) in 418 aa overlap (1-418:1-418) 10 20 30 40 50 60 pF1KB3 MIHSLFLINCSGDIFLEKHWKSVVSQSVCDYFFEAQEKAADVENVPPVISTPHHYLISIY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS73 MIHSLFLINCSGDIFLEKHWKSVVSQSVCDYFFEAQEKAADVENVPPVISTPHHYLISIY 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB3 RDKLFFVSVIQTEVPPLFVIEFLHRVADTFQDYFGECSEAAIKDNVVIVYELLEEMLDNG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS73 RDKLFFVSVIQTEVPPLFVIEFLHRVADTFQDYFGECSEAAIKDNVVIVYELLEEMLDNG 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB3 FPLATESNILKELIKPPTILRSVVNSITGSSNVGDTLPTGQLSNIPWRRAGVKYTNNEAY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS73 FPLATESNILKELIKPPTILRSVVNSITGSSNVGDTLPTGQLSNIPWRRAGVKYTNNEAY 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KB3 FDVVEEIDAIIDKSGSTVFAEIQGVIDACIKLSGMPDLSLSFMNPRLLDDVSFHPCIRFK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS73 FDVVEEIDAIIDKSGSTVFAEIQGVIDACIKLSGMPDLSLSFMNPRLLDDVSFHPCIRFK 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KB3 RWESERVLSFIPPDGNFRLISYRVSSQNLVAIPVYVKHSISFKENSSCGRFDITIGPKQN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS73 RWESERVLSFIPPDGNFRLISYRVSSQNLVAIPVYVKHSISFKENSSCGRFDITIGPKQN 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KB3 MGKTIEGITVTVHMPKVVLNMNLTPTQGSYTFDPVTKVLTWDVGKITPQKLPSLKGLVNL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS73 MGKTIEGITVTVHMPKVVLNMNLTPTQGSYTFDPVTKVLTWDVGKITPQKLPSLKGLVNL 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KB3 QSGAPKPEENPSLNIQFKIQQLAISGLKVNRLDMYGEKYKPFKGVKYVTKAGKFQVRT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS73 QSGAPKPEENPSLNIQFKIQQLAISGLKVNRLDMYGEKYKPFKGVKYVTKAGKFQVRT 370 380 390 400 410 >>CCDS6125.1 AP3M2 gene_id:10947|Hs108|chr8 (418 aa) initn: 2448 init1: 2448 opt: 2448 Z-score: 3014.7 bits: 566.8 E(32554): 1.3e-161 Smith-Waterman score: 2448; 84.2% identity (96.9% similar) in 418 aa overlap (1-418:1-418) 10 20 30 40 50 60 pF1KB3 MIHSLFLINCSGDIFLEKHWKSVVSQSVCDYFFEAQEKAADVENVPPVISTPHHYLISIY ::::::::: :::::::::::::::.:::::::::::.:...::::::: ::::::.:.: CCDS61 MIHSLFLINSSGDIFLEKHWKSVVSRSVCDYFFEAQERATEAENVPPVIPTPHHYLLSVY 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB3 RDKLFFVSVIQTEVPPLFVIEFLHRVADTFQDYFGECSEAAIKDNVVIVYELLEEMLDNG : :.:::.::::::::::::::::::.:::::::: ::: .::::::.:::.:::::::: CCDS61 RHKIFFVAVIQTEVPPLFVIEFLHRVVDTFQDYFGVCSEPVIKDNVVVVYEVLEEMLDNG 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB3 FPLATESNILKELIKPPTILRSVVNSITGSSNVGDTLPTGQLSNIPWRRAGVKYTNNEAY :::::::::::::::::::::.:::.::::.:::: ::::::: .::::.:::::::::: CCDS61 FPLATESNILKELIKPPTILRTVVNTITGSTNVGDQLPTGQLSVVPWRRTGVKYTNNEAY 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KB3 FDVVEEIDAIIDKSGSTVFAEIQGVIDACIKLSGMPDLSLSFMNPRLLDDVSFHPCIRFK :::.:::::::::::::. ::::::::::.::.:::::.:::::::::::::::::.::: CCDS61 FDVIEEIDAIIDKSGSTITAEIQGVIDACVKLTGMPDLTLSFMNPRLLDDVSFHPCVRFK 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KB3 RWESERVLSFIPPDGNFRLISYRVSSQNLVAIPVYVKHSISFKENSSCGRFDITIGPKQN ::::::.::::::::::::.::.::.::::::::::::.:::...:: :::.::.::::. 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CCDS77 -EKFSHSRVEIMVKAKGQFKKQSVANGVEISVPVPSDADSPRFKTSVGSAKYVPERNVVI 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 pF1KB3 WDVGKITPQKLPSLKGLVNLQSGAPKPEEN-PSLNIQFKIQQLAISGLKVNRLDMYGEK- :.. .. : ... .: : . :. : ....:.: ...::..: . . :: CCDS77 WSIKSFPGGKEYLMRAHFGLPSVEKEEVEGRPPIGVKFEIPYFTVSGIQVRYMKII-EKS 350 360 370 380 390 400 400 410 pF1KB3 -YKPFKGVKYVTKAGKFQVRT :. . :.:.:..: .:.:: CCDS77 GYQALPWVRYITQSGDYQLRTS 410 420 >>CCDS45964.1 AP1M2 gene_id:10053|Hs108|chr19 (423 aa) initn: 362 init1: 190 opt: 513 Z-score: 632.5 bits: 126.0 E(32554): 6.6e-29 Smith-Waterman score: 703; 29.9% identity (64.4% similar) in 435 aa overlap (4-418:5-422) 10 20 30 40 50 pF1KB3 MIHSLFLINCSGDIFLEKHWKSVVSQSVCDYFFEAQEKAADVENVPPVISTPHHYLISI ..:... .: .. ...:. :..: ..:. . . . :..: . ... : CCDS45 MSASAVFILDVKGKPLISRNYKGDVAMSKIEHFMPLLVQREEEGALAPLLSHGQVHFLWI 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KB3 YRDKLFFVSVIQTEVPPLFVIEFLHRVADTFQDYFGECSEAAIKDNVVIVYELLEEMLDN ...:..:.. . .. .: ::... ..: .:: : : .:.:: :::::::.:..: CCDS45 KHSNLYLVATTSKNANASLVYSFLYKTIEVFCEYFKELEEESIRDNFVIVYELLDELMDF 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KB3 GFPLATESNILKELIKPPTILRSVVNSI-TGSSNVGDTLPTGQLSNIPWRRAGVKYTNNE ::: .:.:.::.: : . :.. ::.: : : . . :: :.:: .:: CCDS45 GFPQTTDSKILQEYITQQS------NKLETGKSRV----PPTVTNAVSWRSEGIKYKKNE 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 pF1KB3 AYFDVVEEIDAIIDKSGSTVFAEIQGVIDACIKLSGMPDLSLSFMNPRLL---------- ...::.: .. ... .::....:: :.: . :::::.: :. .: :.: CCDS45 VFIDVIESVNLLVNANGSVLLSEIVGTIKLKVFLSGMPELRLG-LNDRVLFELTGRSKNK 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KB3 ----DDVSFHPCIRFKRWESERVLSFIPPDGNFRLISYRVSSQNLVAIPVYVKHSISFKE .::.:: :.:..:....:..:::::::.:.:.:::.:.: : .... : : CCDS45 SVELEDVKFHQCVRLSRFDNDRTISFIPPDGDFELMSYRLSTQ--VKPLIWIESVI---E 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 pF1KB3 NSSCGRFDITIGPKQNMGK--TIEGITVTVHMPKVVLNMNLTPTQGSYTFDPVTKVLTWD . : .: .: . : .. : . .:. ..: .:. . . . . :: . : .:. :. CCDS45 KFSHSRVEIMVKAKGQFKKQSVANGVEISVPVPSDADSPRFKTSVGSAKYVPERNVVIWS 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 pF1KB3 VGKITPQKLPSLKGLVNLQSGAPKPEEN-PSLNIQFKIQQLAISGLKVNRLDMYGEK--Y . .. : ... .: : . :. : ....:.: ...::..: . . :: : CCDS45 IKSFPGGKEYLMRAHFGLPSVEKEEVEGRPPIGVKFEIPYFTVSGIQVRYMKII-EKSGY 350 360 370 380 390 400 400 410 pF1KB3 KPFKGVKYVTKAGKFQVRT . . :.:.:..: .:.:: CCDS45 QALPWVRYITQSGDYQLRTS 410 420 >>CCDS12342.1 AP1M1 gene_id:8907|Hs108|chr19 (423 aa) initn: 361 init1: 193 opt: 482 Z-score: 594.3 bits: 119.0 E(32554): 8.8e-27 Smith-Waterman score: 655; 28.6% identity (63.4% similar) in 437 aa overlap (4-418:5-422) 10 20 30 40 50 pF1KB3 MIHSLFLINCSGDIFLEKHWKSVVSQSVCDYFFEAQEKAADVENVPPVISTPHHYLISI ...... .: ... ..... :..: ..:. . . . :... .. : CCDS12 MSASAVYVLDLKGKVLICRNYRGDVDMSEVEHFMPILMEKEEEGMLSPILAHGGVRFMWI 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KB3 YRDKLFFVSVIQTEVPPLFVIEFLHRVADTFQDYFGECSEAAIKDNVVIVYELLEEMLDN ...:..:.. . .. .:. ::..:...:..:: : : .:.:: ::.::::.:..: CCDS12 KHNNLYLVATSKKNACVSLVFSFLYKVVQVFSEYFKELEEESIRDNFVIIYELLDELMDF 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KB3 GFPLATESNILKELIKPPTILRSVVNSITGSS-NVGDTLPTGQLSN-IPWRRAGVKYTNN :.: .:.:.::.: : . : . ..: : . ..: . :: :.:: .: CCDS12 GYPQTTDSKILQEYI-----------TQEGHKLETGAPRPPATVTNAVSWRSEGIKYRKN 130 140 150 160 180 190 200 210 220 pF1KB3 EAYFDVVEEIDAIIDKSGSTVFAEIQGVIDACIKLSGMPDLSLSFMNPRLLD-------- :...::.: .. ... .:... .:: : : . :::::.: :.. . :.: CCDS12 EVFLDVIESVNLLVSANGNVLRSEIVGSIKMRVFLSGMPELRLGLNDKVLFDNTGRGKSK 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KB3 -----DVSFHPCIRFKRWESERVLSFIPPDGNFRLISYRVSSQNLVAIPVYVKHSISFKE ::.:: :.:..:.:..:..:::::::.:.:.:::.... : .... : : CCDS12 SVELEDVKFHQCVRLSRFENDRTISFIPPDGEFELMSYRLNTH--VKPLIWIESVI---E 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 pF1KB3 NSSCGRFDITIGPKQNMGKTIEGITVTVHMPKVVLNMNLTP----TQGSYTFDPVTKVLT . : .:.. : :... . . .: .:.: : : .: : :: . : .. .. CCDS12 KHSHSRIEYMIKAKSQFKRRSTANNVEIHIP--VPNDADSPKFKTTVGSVKWVPENSEIV 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 pF1KB3 WDVGKITPQKLPSLKGLVNLQS-GAPKPEENPSLNIQFKIQQLAISGLKVNRLDMYGEK- :.. .. : ... .: : : : .: ....:.: .. ::..: : . :: CCDS12 WSIKSFPGGKEYLMRAHFGLPSVEAEDKEGKPPISVKFEIPYFTTSGIQVRYLKII-EKS 350 360 370 380 390 400 400 410 pF1KB3 -YKPFKGVKYVTKAGKFQVRT :. . :.:.:. : .:.:: CCDS12 GYQALPWVRYITQNGDYQLRTQ 410 420 >>CCDS43177.1 AP2M1 gene_id:1173|Hs108|chr3 (435 aa) initn: 490 init1: 178 opt: 383 Z-score: 472.3 bits: 96.4 E(32554): 5.5e-20 Smith-Waterman score: 591; 26.2% identity (61.7% similar) in 447 aa overlap (1-417:1-434) 10 20 30 40 50 60 pF1KB3 MIHSLFLINCSGDIFLEKHWKSVVSQSVCDYFFEAQEKAADVENVPPVISTPHHYLISIY :: .::. : .:.... . ... ..... : : ... : . :: . . .. . CCDS43 MIGGLFIYNHKGEVLISRVYRDDIGRNAVDAF-RVNVIHARQQVRSPVTNIARTSFFHVK 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KB3 RDKLFFVSVIQTEVPPLFVIEFLHRVADTFQDYFGECSEAAIKDNVVIVYELLEEMLDNG :.......: . .: .:.:::... :.. :::. :: ::.: :..::::.:.:: : CCDS43 RSNIWLAAVTKQNVNAAMVFEFLYKMCDVMAAYFGKISEENIKNNFVLIYELLDEILDFG 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KB3 FPLATESNILKELIKPPTILRSVVNSITGSSNVGDTLPTGQLSNIPWRRAGVKYTNNEAY .: .:.. :: .: : .: .. .:.. . . ::: : ::: :.:: :: . CCDS43 YPQNSETGALKTFITQQGI-KSQHQTKEEQSQITSQV-TGQ---IGWRREGIKYRRNELF 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 pF1KB3 FDVVEEIDAIIDKSGSTVFAEIQGVIDACIKLSGMPDLSLSFMNPRL------------- .::.: .. ... .:... :...: . :::::. ... :: .. CCDS43 LDVLESVNLLMSPQGQVLSAHVSGRVVMKSYLSGMPECKFG-MNDKIVIEKQGKGTADET 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 pF1KB3 ---------LDDVSFHPCIRFKRWESERVLSFIPPDGNFRLISYRVSSQNLVAIPVYVKH .:: .:: :.:.....::: .:::::::.:.:. ::.... . .: : CCDS43 SKSGKQSIAIDDCTFHQCVRLSKFDSERSISFIPPDGEFELMRYRTTKD--IILPFRV-- 240 250 260 270 280 280 290 300 310 320 330 pF1KB3 SISFKENSSCGRFDITIGPKQNMGKTI--EGITVTVHMPKVVLNMNLTPTQGSYTFDPVT : . .. . .... . :.:. .. . : : . : . .... .:. . CCDS43 -IPLVREVGRTKLEVKVVIKSNFKPSLLAQKIEVRIPTPLNTSGVQVICMKGKAKYKASE 290 300 310 320 330 340 340 350 360 370 380 390 pF1KB3 KVLTWDVGKITPQKLPSLKGLVNL-QSGAPKPEENPSLNIQFKIQQLAISGLKVNRLDMY ....: . ... .: .... ..: .. : : ....:.. .: ::::: : .. CCDS43 NAIVWKIKRMAGMKESQISAEIELLPTNDKKKWARPPISMNFEVP-FAPSGLKVRYLKVF 350 360 370 380 390 400 400 410 pF1KB3 GEK-----YKPFKGVKYVTKAGKFQVRT : . .: :.:. ..: ...: CCDS43 EPKLNYSDHDVIKWVRYIGRSGIYETRC 410 420 430 >>CCDS43178.1 AP2M1 gene_id:1173|Hs108|chr3 (433 aa) initn: 495 init1: 183 opt: 376 Z-score: 463.7 bits: 94.8 E(32554): 1.7e-19 Smith-Waterman score: 584; 26.2% identity (61.7% similar) in 447 aa overlap (1-417:1-432) 10 20 30 40 50 60 pF1KB3 MIHSLFLINCSGDIFLEKHWKSVVSQSVCDYFFEAQEKAADVENVPPVISTPHHYLISIY :: .::. : .:.... . ... ..... : : ... : . :: . . .. . CCDS43 MIGGLFIYNHKGEVLISRVYRDDIGRNAVDAF-RVNVIHARQQVRSPVTNIARTSFFHVK 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KB3 RDKLFFVSVIQTEVPPLFVIEFLHRVADTFQDYFGECSEAAIKDNVVIVYELLEEMLDNG :.......: . .: .:.:::... :.. :::. :: ::.: :..::::.:.:: : CCDS43 RSNIWLAAVTKQNVNAAMVFEFLYKMCDVMAAYFGKISEENIKNNFVLIYELLDEILDFG 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KB3 FPLATESNILKELIKPPTILRSVVNSITGSSNVGDTLPTGQLSNIPWRRAGVKYTNNEAY .: .:.. :: .: : .: .. .:.. . . ::: : ::: :.:: :: . CCDS43 YPQNSETGALKTFITQQGI-KS--QTKEEQSQITSQV-TGQ---IGWRREGIKYRRNELF 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 pF1KB3 FDVVEEIDAIIDKSGSTVFAEIQGVIDACIKLSGMPDLSLSFMNPRL------------- .::.: .. ... .:... :...: . :::::. ... :: .. CCDS43 LDVLESVNLLMSPQGQVLSAHVSGRVVMKSYLSGMPECKFG-MNDKIVIEKQGKGTADET 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 pF1KB3 ---------LDDVSFHPCIRFKRWESERVLSFIPPDGNFRLISYRVSSQNLVAIPVYVKH .:: .:: :.:.....::: .:::::::.:.:. ::.... . .: : CCDS43 SKSGKQSIAIDDCTFHQCVRLSKFDSERSISFIPPDGEFELMRYRTTKD--IILPFRV-- 240 250 260 270 280 280 290 300 310 320 330 pF1KB3 SISFKENSSCGRFDITIGPKQNMGKTI--EGITVTVHMPKVVLNMNLTPTQGSYTFDPVT : . .. . .... . :.:. .. . : : . : . .... .:. . CCDS43 -IPLVREVGRTKLEVKVVIKSNFKPSLLAQKIEVRIPTPLNTSGVQVICMKGKAKYKASE 290 300 310 320 330 340 340 350 360 370 380 390 pF1KB3 KVLTWDVGKITPQKLPSLKGLVNL-QSGAPKPEENPSLNIQFKIQQLAISGLKVNRLDMY ....: . ... .: .... ..: .. : : ....:.. .: ::::: : .. CCDS43 NAIVWKIKRMAGMKESQISAEIELLPTNDKKKWARPPISMNFEVP-FAPSGLKVRYLKVF 350 360 370 380 390 400 400 410 pF1KB3 GEK-----YKPFKGVKYVTKAGKFQVRT : . .: :.:. ..: ...: CCDS43 EPKLNYSDHDVIKWVRYIGRSGIYETRC 410 420 430 >>CCDS82880.1 AP2M1 gene_id:1173|Hs108|chr3 (460 aa) initn: 490 init1: 178 opt: 345 Z-score: 425.1 bits: 87.8 E(32554): 2.3e-17 Smith-Waterman score: 553; 26.9% identity (61.6% similar) in 401 aa overlap (47-417:71-459) 20 30 40 50 60 70 pF1KB3 EKHWKSVVSQSVCDYFFEAQEKAADVENVPPVISTPHHYLISIYRDKLFFVSVIQTEVPP :: . . .. . :.......: . .: CCDS82 FPGEWLEANRRNAVDAFRVNVIHARQQVRSPVTNIARTSFFHVKRSNIWLAAVTKQNVNA 50 60 70 80 90 100 80 90 100 110 120 130 pF1KB3 LFVIEFLHRVADTFQDYFGECSEAAIKDNVVIVYELLEEMLDNGFPLATESNILKELIKP .:.:::... :.. :::. :: ::.: :..::::.:.:: :.: .:.. :: .: CCDS82 AMVFEFLYKMCDVMAAYFGKISEENIKNNFVLIYELLDEILDFGYPQNSETGALKTFITQ 110 120 130 140 150 160 140 150 160 170 180 190 pF1KB3 PTILRSVVNSITGSSNVGDTLPTGQLSNIPWRRAGVKYTNNEAYFDVVEEIDAIIDKSGS : .: .. .:.. . . ::: : ::: :.:: :: ..::.: .. ... .:. CCDS82 QGI-KSQHQTKEEQSQITSQV-TGQ---IGWRREGIKYRRNELFLDVLESVNLLMSPQGQ 170 180 190 200 210 200 210 220 230 pF1KB3 TVFAEIQGVIDACIKLSGMPDLSLSFMNPRL----------------------LDDVSFH .. :...: . :::::. ... :: .. .:: .:: CCDS82 VLSAHVSGRVVMKSYLSGMPECKFG-MNDKIVIEKQGKGTADETSKSGKQSIAIDDCTFH 220 230 240 250 260 270 240 250 260 270 280 290 pF1KB3 PCIRFKRWESERVLSFIPPDGNFRLISYRVSSQNLVAIPVYVKHSISFKENSSCGRFDIT :.:.....::: .:::::::.:.:. ::.... . .: : : . .. . .... CCDS82 QCVRLSKFDSERSISFIPPDGEFELMRYRTTKD--IILPFRV---IPLVREVGRTKLEVK 280 290 300 310 320 300 310 320 330 340 350 pF1KB3 IGPKQNMGKTI--EGITVTVHMPKVVLNMNLTPTQGSYTFDPVTKVLTWDVGKITPQKLP . :.:. .. . : : . : . .... .:. . ....: . ... .: CCDS82 VVIKSNFKPSLLAQKIEVRIPTPLNTSGVQVICMKGKAKYKASENAIVWKIKRMAGMKES 330 340 350 360 370 380 360 370 380 390 400 pF1KB3 SLKGLVNL-QSGAPKPEENPSLNIQFKIQQLAISGLKVNRLDMYGEK-----YKPFKGVK .... ..: .. : : ....:.. .: ::::: : .. : . .: :. CCDS82 QISAEIELLPTNDKKKWARPPISMNFEVP-FAPSGLKVRYLKVFEPKLNYSDHDVIKWVR 390 400 410 420 430 440 410 pF1KB3 YVTKAGKFQVRT :. ..: ...: CCDS82 YIGRSGIYETRC 450 460 >>CCDS46008.1 AP1M1 gene_id:8907|Hs108|chr19 (435 aa) initn: 491 init1: 188 opt: 273 Z-score: 336.8 bits: 71.4 E(32554): 1.9e-12 Smith-Waterman score: 621; 27.8% identity (61.7% similar) in 449 aa overlap (4-418:5-434) 10 20 30 40 50 pF1KB3 MIHSLFLINCSGDIFLEKHWKSVVSQSVCDYFFEAQEKAADVENVPPVISTPHHYLISI ...... .: ... ..... :..: ..:. . . . :... .. : CCDS46 MSASAVYVLDLKGKVLICRNYRGDVDMSEVEHFMPILMEKEEEGMLSPILAHGGVRFMWI 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KB3 YRDKLFFVSVIQTEVPPLFVIEFLHRVADTFQDYFGECSEAAIKDNVVIVYELLEEMLDN ...:..:.. . .. .:. ::..:...:..:: : : .:.:: ::.::::.:..: CCDS46 KHNNLYLVATSKKNACVSLVFSFLYKVVQVFSEYFKELEEESIRDNFVIIYELLDELMDF 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KB3 GFPLATESNILKELIKPPTILRSVVNSITGSS-NVGDTLPTGQLSN-IPWRRAGVKYTNN :.: .:.:.::.: : . : . ..: : . ..: . :: :.:: .: CCDS46 GYPQTTDSKILQEYI-----------TQEGHKLETGAPRPPATVTNAVSWRSEGIKYRKN 130 140 150 160 180 190 200 210 220 pF1KB3 EAYFDVVEEIDAI------------IDKSGSTVFAEIQGVIDACIKLSGMPDLSLSFMNP :...::.: .. . .. .:... .:: : : . :::::.: :.. . CCDS46 EVFLDVIESVNLLGKYPGVGWLGHTVSANGNVLRSEIVGSIKMRVFLSGMPELRLGLNDK 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 pF1KB3 RLLD-------------DVSFHPCIRFKRWESERVLSFIPPDGNFRLISYRVSSQNLVAI :.: ::.:: :.:..:.:..:..:::::::.:.:.:::.... : CCDS46 VLFDNTGRGKSKSVELEDVKFHQCVRLSRFENDRTISFIPPDGEFELMSYRLNTH--VKP 230 240 250 260 270 280 280 290 300 310 320 pF1KB3 PVYVKHSISFKENSSCGRFDITIGPKQNMGKTIEGITVTVHMPKVVLNMNLTP----TQG .... : :. : .:.. : :... . . .: .:.: : : .: : : CCDS46 LIWIESVI---EKHSHSRIEYMIKAKSQFKRRSTANNVEIHIP--VPNDADSPKFKTTVG 290 300 310 320 330 340 330 340 350 360 370 380 pF1KB3 SYTFDPVTKVLTWDVGKITPQKLPSLKGLVNLQS-GAPKPEENPSLNIQFKIQQLAISGL : . : .. ..:.. .. : ... .: : : : .: ....:.: .. ::. CCDS46 SVKWVPENSEIVWSIKSFPGGKEYLMRAHFGLPSVEAEDKEGKPPISVKFEIPYFTTSGI 350 360 370 380 390 400 390 400 410 pF1KB3 KVNRLDMYGEK--YKPFKGVKYVTKAGKFQVRT .: : . :: :. . :.:.:. : .:.:: CCDS46 QVRYLKII-EKSGYQALPWVRYITQNGDYQLRTQ 410 420 430 >>CCDS5685.1 AP4M1 gene_id:9179|Hs108|chr7 (453 aa) initn: 350 init1: 181 opt: 271 Z-score: 334.1 bits: 70.9 E(32554): 2.7e-12 Smith-Waterman score: 407; 23.8% identity (60.3% similar) in 411 aa overlap (1-384:1-402) 10 20 30 40 50 pF1KB3 MIHSLFLINCSGDIFLEKHWKSVVS-QSVCDYFFEAQEKAADVENVPPVISTPH-HYLIS :: ..:... .:: .. : ... . ..: . :.. :. ::. : ...: CCDS56 MISQFFILSSKGDPLIYKDFRGDSGGRDVAELFYRKLTGLPGDES--PVVMHHHGRHFIH 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KB3 IYRDKLFFVSVIQTEVPPLFVIEFLHRVADTFQDYFGECSEAAIKDNVVIVYELLEEMLD : .. :..: . . .: :. ..:.: :.: . :: : .:..:. ::..:::::.:.:: CCDS56 IRHSGLYLVVTTSENVSPFSLLELLSRLATLLGDYCGSLGEGTISRNVALVYELLDEVLD 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB3 NGFPLATESNILKELIKPPTILRSVVNSITGSSNVGDTLPTGQLSNIPWRRAGVKYT--- :. .: ...:...:. ... . :. :.:: : :.. :. . . CCDS56 YGYVQTTSTEMLRNFIQTEAVVSKPF-SLFDLSSVGLFGAETQQSKVAPSSAASRPVLSS 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 pF1KB3 ------NNEAYFDVVEEIDAIIDKSGSTVFAEIQGVIDACIKLSGMPDLSLSF------- .::...::::.....: ..:: . ...:: : : . .. ... CCDS56 RSDQSQKNEVFLDVVERLSVLIASNGSLLKVDVQGEIRLKSFLPSGSEMRIGLTEEFCVG 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 pF1KB3 ------MNPRL-LDDVSFHPCIRFKRWESERVLSFIPPDGNFRLISYRVSSQNLVAIPVY ..: . .:.:::: . . ..::.:.: . ::.:.. .. :..:.. .: CCDS56 KSELRGYGPGIRVDEVSFHSSVNLDEFESHRILRLQPPQGELTVMRYQLSDDLPSPLPFR 240 250 260 270 280 290 280 290 300 310 320 330 pF1KB3 VKHSISFKENSSCGRFDITIGPKQNMGKTIEGITVTVHMP--KVVLNMNLTPTQGSYTFD . :... ..: ::... . . .. . ....: .:.: . :.... .. . CCDS56 LFPSVQWDRGS--GRLQVYLKLRCDLLSKSQALNVRLHLPLPRGVVSLSQELSSPEQKAE 300 310 320 330 340 350 340 350 360 370 380 390 pF1KB3 PVTKVLTWDVGKITPQKLPSLKGLVNLQSGAPKPEENPSLNIQFKIQQLAISGLKVNRLD . .: ::. .. : .:.:: .: .: : :: ... . . :.. CCDS56 LAEGALRWDLPRV--QGGSQLSGL--FQMDVPGPPGPPSHGLSTSASPLGLGPASLSFEL 360 370 380 390 400 410 400 410 pF1KB3 MYGEKYKPFKGVKYVTKAGKFQVRT CCDS56 PRHTCSGLQVRFLRLAFRPCGNANPHKWVRHLSHSDAYVIRI 420 430 440 450 418 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sat Nov 5 05:14:47 2016 done: Sat Nov 5 05:14:48 2016 Total Scan time: 2.520 Total Display time: 0.050 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]