Result of FASTA (ccds) for
pF1KB3647
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3647, 598 aa
1>>>pF1KB3647 598 - 598 aa - 598 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4693+/-0.000913; mu= 18.0357+/- 0.055
mean_var=67.1706+/-13.411, 0's: 0 Z-trim(105.4): 28 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.156489
statistics sampled from 8388 (8415) to 8388 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.63), E-opt: 0.2 (0.258), width: 16
Scan time: 3.120
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS5540.1 WBSCR17 gene_id:64409|Hs108|chr7 ( 598) 4060 925.9 0
CCDS81755.1 GALNT9 gene_id:50614|Hs108|chr12 ( 603) 2666 611.2 1.2e-174
CCDS7807.1 GALNT18 gene_id:374378|Hs108|chr11 ( 607) 2037 469.2 7e-132
CCDS8533.1 GALNT8 gene_id:26290|Hs108|chr12 ( 637) 1702 393.5 4.2e-109
CCDS11915.1 GALNT1 gene_id:2589|Hs108|chr18 ( 559) 1152 269.3 9.1e-72
CCDS2199.1 GALNT13 gene_id:114805|Hs108|chr2 ( 556) 1131 264.6 2.4e-70
CCDS77472.1 GALNT13 gene_id:114805|Hs108|chr2 ( 561) 1131 264.6 2.4e-70
CCDS4325.1 GALNT10 gene_id:55568|Hs108|chr5 ( 603) 1092 255.8 1.2e-67
CCDS55860.1 GALNT4 gene_id:100528030|Hs108|chr12 ( 575) 1069 250.6 4.1e-66
CCDS53817.1 GALNT4 gene_id:8693|Hs108|chr12 ( 578) 1069 250.6 4.1e-66
CCDS5930.1 GALNT11 gene_id:63917|Hs108|chr7 ( 608) 1061 248.8 1.5e-65
CCDS41866.1 GALNT9 gene_id:50614|Hs108|chr12 ( 237) 1038 243.4 2.4e-64
CCDS8813.1 GALNT6 gene_id:11226|Hs108|chr12 ( 622) 1043 244.7 2.5e-64
CCDS34104.1 GALNTL6 gene_id:442117|Hs108|chr4 ( 601) 1033 242.5 1.2e-63
CCDS2203.1 GALNT5 gene_id:11227|Hs108|chr2 ( 940) 1028 241.4 3.8e-63
CCDS1582.1 GALNT2 gene_id:2590|Hs108|chr1 ( 571) 1018 239.1 1.2e-62
CCDS6737.1 GALNT12 gene_id:79695|Hs108|chr9 ( 581) 1007 236.6 6.7e-62
CCDS58705.1 GALNT14 gene_id:79623|Hs108|chr2 ( 532) 1005 236.1 8.5e-62
CCDS1773.2 GALNT14 gene_id:79623|Hs108|chr2 ( 552) 1005 236.1 8.8e-62
CCDS2226.1 GALNT3 gene_id:2591|Hs108|chr2 ( 633) 980 230.5 5e-60
CCDS32107.1 GALNT16 gene_id:57452|Hs108|chr14 ( 558) 956 225.1 1.9e-58
CCDS58706.1 GALNT14 gene_id:79623|Hs108|chr2 ( 557) 924 217.9 2.8e-56
CCDS33711.1 GALNT15 gene_id:117248|Hs108|chr3 ( 639) 921 217.2 5.1e-56
CCDS5929.1 GALNTL5 gene_id:168391|Hs108|chr7 ( 443) 872 206.1 8e-53
CCDS82742.1 GALNT15 gene_id:117248|Hs108|chr3 ( 617) 849 200.9 3.9e-51
CCDS3815.1 GALNT7 gene_id:51809|Hs108|chr4 ( 657) 788 187.2 5.7e-47
>>CCDS5540.1 WBSCR17 gene_id:64409|Hs108|chr7 (598 aa)
initn: 4060 init1: 4060 opt: 4060 Z-score: 4949.7 bits: 925.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4060; 100.0% identity (100.0% similar) in 598 aa overlap (1-598:1-598)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MASLRRVKVLLVLNLIAVAGFVLFLAKCRPIAVRSGDAFHEIRPRAEVANLSAHSASPIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MASLRRVKVLLVLNLIAVAGFVLFLAKCRPIAVRSGDAFHEIRPRAEVANLSAHSASPIQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 DAVLKRLSLLEDIVYRQLNGLSKSLGLIEGYGGRGKGGLPATLSPAEEEKAKGPHEKYGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 DAVLKRLSLLEDIVYRQLNGLSKSLGLIEGYGGRGKGGLPATLSPAEEEKAKGPHEKYGY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 NSYLSEKISLDRSIPDYRPTKCKELKYSKDLPQISIIFIFVNEALSVILRSVHSAVNHTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 NSYLSEKISLDRSIPDYRPTKCKELKYSKDLPQISIIFIFVNEALSVILRSVHSAVNHTP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 THLLKEIILVDDNSDEEELKVPLEEYVHKRYPGLVKVVRNQKREGLIRARIEGWKVATGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 THLLKEIILVDDNSDEEELKVPLEEYVHKRYPGLVKVVRNQKREGLIRARIEGWKVATGQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 VTGFFDAHVEFTAGWAEPVLSRIQENRKRVILPSIDNIKQDNFEVQRYENSAHGYSWELW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VTGFFDAHVEFTAGWAEPVLSRIQENRKRVILPSIDNIKQDNFEVQRYENSAHGYSWELW
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 CMYISPPKDWWDAGDPSLPIRTPAMIGCSFVVNRKFFGEIGLLDPGMDVYGGENIELGIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 CMYISPPKDWWDAGDPSLPIRTPAMIGCSFVVNRKFFGEIGLLDPGMDVYGGENIELGIK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 VWLCGGSMEVLPCSRVAHIERKKKPYNSNIGFYTKRNALRVAEVWMDDYKSHVYIAWNLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VWLCGGSMEVLPCSRVAHIERKKKPYNSNIGFYTKRNALRVAEVWMDDYKSHVYIAWNLP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 LENPGIDIGDVSERRALRKSLKCKNFQWYLDHVYPEMRRYNNTVAYGELRNNKAKDVCLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LENPGIDIGDVSERRALRKSLKCKNFQWYLDHVYPEMRRYNNTVAYGELRNNKAKDVCLD
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 QGPLENHTAILYPCHGWGPQLARYTKEGFLHLGALGTTTLLPDTRCLVDNSKSRLPQLLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 QGPLENHTAILYPCHGWGPQLARYTKEGFLHLGALGTTTLLPDTRCLVDNSKSRLPQLLD
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590
pF1KB3 CDKVKSSLYKRWNFIQNGAIMNKGTGRCLEVENRGLAGIDLILRSCTGQRWTIKNSIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 CDKVKSSLYKRWNFIQNGAIMNKGTGRCLEVENRGLAGIDLILRSCTGQRWTIKNSIK
550 560 570 580 590
>>CCDS81755.1 GALNT9 gene_id:50614|Hs108|chr12 (603 aa)
initn: 2566 init1: 2362 opt: 2666 Z-score: 3248.7 bits: 611.2 E(32554): 1.2e-174
Smith-Waterman score: 2666; 61.5% identity (84.9% similar) in 608 aa overlap (1-598:1-599)
10 20 30 40 50
pF1KB3 MASLRRVKVLLVLNLIAVAGFVLFLAKCRP-------IAVRSGDAFHEIRPR-AEVANLS
:: :....::..:... .:.::: . :: . . ::: ...: : :.:..:.
CCDS81 MAVARKIRTLLTVNILVFVGIVLFSVYCRLQGRSQELVRIVSGD--RRVRSRHAKVGTLG
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB3 AHSASPIQDAVLKRLSLLEDIVYRQLNGLSKSLGLIEGYGGRGKGGLPATLSPAEEEKAK
..:.:.::. ::..:: :::::.: .::.:: :: :.::: ::: .: :.
CCDS81 D------REAILQRLDHLEEVVYNQLNGLAKPIGLVEGPGGLGQGGLAATLRDDGQE-AE
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB3 GPHEKYGYNSYLSEKISLDRSIPDYRPTKCKELKYSKDLPQISIIFIFVNEALSVILRSV
: .:.::::. ::..:::::::::::: ::....:..::::.:..:::::::::::::::
CCDS81 GKYEEYGYNAQLSDRISLDRSIPDYRPRKCRQMSYAQDLPQVSVVFIFVNEALSVILRSV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB3 HSAVNHTPTHLLKEIILVDDNSDEEELKVPLEEYVHKRYPGLVKVVRNQKREGLIRARIE
::.:::::..::::.::::::::. ::: :..::.::::::::.:::..::::::::..
CCDS81 HSVVNHTPSQLLKEVILVDDNSDNVELKFNLDQYVNKRYPGLVKIVRNSRREGLIRARLQ
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB3 GWKVATGQVTGFFDAHVEFTAGWAEPVLSRIQENRKRVILPSIDNIKQDNFEVQRYENSA
:::.::. :.:::::::::..:::::.::::.:.:.:..::.::::: ..::::.: :.:
CCDS81 GWKAATAPVVGFFDAHVEFNTGWAEPALSRIREDRRRIVLPAIDNIKYSTFEVQQYANAA
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB3 HGYSWELWCMYISPPKDWWDAGDPSLPIRTPAMIGCSFVVNRKFFGEIGLLDPGMDVYGG
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CCDS81 HGYNWGLWCMYIIPPQDWLDRGDESAPIRTPAMIGCSFVVDREYFGDIGLLDPGMEVYGG
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB3 ENIELGIKVWLCGGSMEVLPCSRVAHIERKKKPYNSNIGFYTKRNALRVAEVWMDDYKSH
::.:::..:: :::::::::::::::::: .::::..: .:.::::::.:::::::.:::
CCDS81 ENVELGMRVWQCGGSMEVLPCSRVAHIERTRKPYNNDIDYYAKRNALRAAEVWMDDFKSH
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB3 VYIAWNLPLENPGIDIGDVSERRALRKSLKCKNFQWYLDHVYPEMRRYNNTVAYGELRNN
::.:::.:. :::.:.:::::: :::. :::..:.:::..:::::: ::::..:::.::.
CCDS81 VYMAWNIPMSNPGVDFGDVSERLALRQRLKCRSFKWYLENVYPEMRVYNNTLTYGEVRNS
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB3 KAKDVCLDQGPLENHTAILYPCHGWGPQLARYTKEGFLHLGALGTTTLLPDTRCLVDNSK
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CCDS81 KASAYCLDQGAEDGDRAILYPCHGMSSQLVRYSADGLLQLGPLGSTAFLPDSKCLVDDGT
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KB3 SRLPQLLDCDKVKSSLYKRWNFIQNGAIMNKGTGRCLEVENRGLA--GIDLILRSCTGQR
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CCDS81 GRMPTLKKCEDVARPTQRLWDFTQSGPIVSRATGRCLEVEMSKDANFGLRLVVQRCSGQK
540 550 560 570 580 590
pF1KB3 WTIKNSIK
: :.: ::
CCDS81 WMIRNWIKHARH
600
>>CCDS7807.1 GALNT18 gene_id:374378|Hs108|chr11 (607 aa)
initn: 1309 init1: 899 opt: 2037 Z-score: 2481.2 bits: 469.2 E(32554): 7e-132
Smith-Waterman score: 2037; 56.9% identity (82.3% similar) in 503 aa overlap (103-598:105-603)
80 90 100 110 120 130
pF1KB3 IVYRQLNGLSKSLGLIEGYGGRGKGGLPATLSPAEEEKAKGPHEKYGYNSYLSEKISLDR
::: .. : . ::::.:::... :::
CCDS78 QHIQEAPAKPEEAEAEPFTDSSLFAHWGQELSPEGRRVALKQFQYYGYNAYLSDRLPLDR
80 90 100 110 120 130
140 150 160 170 180 190
pF1KB3 SIPDYRPTKCKELKYSKDLPQISIIFIFVNEALSVILRSVHSAVNHTPTHLLKEIILVDD
.:: ::. :..:.. .::..::.::::::::::.:::.:::...:: :::::::::::
CCDS78 PLPDLRPSGCRNLSFPDSLPEVSIVFIFVNEALSVLLRSIHSAMERTPPHLLKEIILVDD
140 150 160 170 180 190
200 210 220 230 240
pF1KB3 NSDEEELKVPLEEYVHK---RYPGLVKVVRNQKREGLIRARIEGWKVATGQVTGFFDAHV
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CCDS78 NSSNEELKEKLTEYVDKVNSQKPGFIKVVRHSKQEGLIRSRVSGWRAATAPVVALFDAHV
200 210 220 230 240 250
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 EFTAGWAEPVLSRIQENRKRVILPSIDNIKQDNFEVQRYENSAHGYSWELWCMYISPPKD
::..:::::::.::.:::::.: ::.:::: ::::...: .:.:..::::: :..:::
CCDS78 EFNVGWAEPVLTRIKENRKRIISPSFDNIKYDNFEIEEYPLAAQGFDWELWCRYLNPPKA
260 270 280 290 300 310
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 WWDAGDPSLPIRTPAMIGCSFVVNRKFFGEIGLLDPGMDVYGGENIELGIKVWLCGGSME
:: . . :::.::.::: :.:.:..: :::::: ::.::::::.::::.:: ::::.:
CCDS78 WWKLENSTAPIRSPALIGC-FIVDRQYFQEIGLLDEGMEVYGGENVELGIRVWQCGGSVE
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370 380 390 400 410 420
pF1KB3 VLPCSRVAHIERKKKPYNSNIGFYTKRNALRVAEVWMDDYKSHVYIAWNLPLENPGIDIG
::::::.::::: .:::. .. ...::::::::::::..:::::.:::.: :. :::::
CCDS78 VLPCSRIAHIERAHKPYTEDLTAHVRRNALRVAEVWMDEFKSHVYMAWNIPQEDSGIDIG
380 390 400 410 420 430
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pF1KB3 DVSERRALRKSLKCKNFQWYLDHVYPEMRRYNNTVAYGELRNNKAKDVCLDQGPLENHTA
:.. :.::::.:.::.:.::: :::::: :.. .::: :.:. :.:::::: ...
CCDS78 DITARKALRKQLQCKTFRWYLVSVYPEMRMYSDIIAYGVLQNSLKTDLCLDQGPDTENVP
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490 500 510 520 530 540
pF1KB3 ILYPCHGWGPQLARYTKEGFLHLGALGTTTLLPDTRCLVD-NSKSRLPQLLDCDKVKSSL
:.: ::: :: . ::. .:.: :. :. :.::::: ::. :.:..:. .:..
CCDS78 IMYICHGMTPQNVYYTSSQQIHVGILSPTVDDDDNRCLVDVNSR---PRLIECSYAKAKR
500 510 520 530 540 550
550 560 570 580 590
pF1KB3 YK-RWNFIQNGAIMNKGTGRCLEV-ENRGLA-GIDLILRSCTGQRWTIKNSIK
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CCDS78 MKLHWQFSQGGPIQNRKSKRCLELQENSDLEFGFQLVLQKCSGQHWSITNVLRSLAS
560 570 580 590 600
>>CCDS8533.1 GALNT8 gene_id:26290|Hs108|chr12 (637 aa)
initn: 1531 init1: 806 opt: 1702 Z-score: 2072.1 bits: 393.5 E(32554): 4.2e-109
Smith-Waterman score: 1702; 47.4% identity (78.6% similar) in 500 aa overlap (103-598:132-629)
80 90 100 110 120 130
pF1KB3 IVYRQLNGLSKSLGLIEGYGGRGKGGLPATLSPAEEEKAKGPHEKYGYNSYLSEKISLDR
:: :... :. .:.:::.:::... :.:
CCDS85 METKVNETKKHKTQMKLFPHSQLFRQWGEDLSEAQQKAAQDLFRKFGYNAYLSNQLPLNR
110 120 130 140 150 160
140 150 160 170 180 190
pF1KB3 SIPDYRPTKCKELKYSKDLPQISIIFIFVNEALSVILRSVHSAVNHTPTHLLKEIILVDD
.::: : .: . : ..::..:.:.::::::::.: :.. : .:.::..::::::::::
CCDS85 TIPDTRDYRCLRKTYPSQLPSLSVILIFVNEALSIIQRAITSIINRTPSRLLKEIILVDD
170 180 190 200 210 220
200 210 220 230 240
pF1KB3 NSDEEELKVPLEEYV---HKRYPGLVKVVRNQKREGLIRARIEGWKVATGQVTGFFDAHV
:.. :::: :.: . ...::::.:..:. .:.:: .:: ::..::..:....:::.
CCDS85 FSSNGELKVHLDEKIKLYNQKYPGLLKIIRHPERKGLAQARNTGWEAATADVVAILDAHI
230 240 250 260 270 280
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 EFTAGWAEPVLSRIQENRKRVILPSIDNIKQDNFEVQRYENSAHGYSWELWCMYISPPKD
: ..:::::.:.::::.: .. : .:::. :.:....:: .. :..::::: : . :.
CCDS85 EVNVGWAEPILARIQEDRTVIVSPVFDNIRFDTFKLDKYELAVDGFNWELWCRYDALPQA
290 300 310 320 330 340
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 WWDAGDPSLPIRTPAMIGCSFVVNRKFFGEIGLLDPGMDVYGGENIELGIKVWLCGGSME
: : : . :...:...: ...::.:.:::: :: :: .:::::.::...:: :::..:
CCDS85 WIDLHDVTAPVKSPSIMGI-LAANRHFLGEIGSLDGGMLIYGGENVELSLRVWQCGGKVE
350 360 370 380 390 400
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 VLPCSRVAHIERKKKPYNSNIGFYTKRNALRVAEVWMDDYKSHVYIAWNLPLENPGIDIG
.:::::.::.::..::: .. :::::::::.:::..: ::.:::.::.: :::.:
CCDS85 ILPCSRIAHLERHHKPYALDLTAALKRNALRVAEIWMDEHKHMVYLAWNIPLQNSGIDFG
410 420 430 440 450 460
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 DVSERRALRKSLKCKNFQWYLDHVYPEMRRYNNTVAYGELRNNKAKDVCLDQGPLENHTA
::: : :::..::::.:.::: .::: .. .. :.::...: ..:::::::. ..:
CCDS85 DVSSRMALREKLKCKTFDWYLKNVYPLLKPLHTIVGYGRMKNLLDENVCLDQGPVPGNTP
470 480 490 500 510 520
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 ILYPCHGWGPQLARYTKEGFLHLGALGTTTLLPDTRCLVDNSKSRLPQLLDCDKV-KSSL
:.: :: .. : . : : :..: : . . : :::.: .:.. : : :.:. :. :
CCDS85 IMYYCHEFSSQNVYYHLTGELYVGQLIAEASASD-RCLTDPGKAEKPTLEPCSKAAKNRL
530 540 550 560 570
550 560 570 580 590
pF1KB3 YKRWNFIQNGAIMNKGTGRCLEVENRGLAGIDLILRSCTGQRWTIKNSIK
. :.: .::..:. : ::::... :.. :.:..:. : : :.....
CCDS85 HIYWDFKPGGAVINRDTKRCLEMKKDLLGSHVLVLQTCSTQVWEIQHTVRDWGQTNSQ
580 590 600 610 620 630
>>CCDS11915.1 GALNT1 gene_id:2589|Hs108|chr18 (559 aa)
initn: 1111 init1: 334 opt: 1152 Z-score: 1401.9 bits: 269.3 E(32554): 9.1e-72
Smith-Waterman score: 1188; 37.8% identity (66.6% similar) in 518 aa overlap (93-595:57-552)
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 VLKRLSLLEDIVYRQLNGLSKSLGLIEGYGGRGKGGLPATLSPAEEEKAKGPHEKYGYNS
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CCDS11 YFSECNKCDEKKERGLPAGDVLEPVQKPHEGPGEMGKPVVIPKEDQEKMKEMFKINQFNL
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pF1KB3 YLSEKISLDRSIPDYRPTKCKELKYSKDLPQISIIFIFVNEALSVILRSVHSAVNHTPTH
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CCDS11 MASEMIALNRSLPDVRLEGCKTKVYPDNLPTTSVVIVFHNEAWSTLLRTVHSVINRSPRH
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pF1KB3 LLKEIILVDDNSDEEELKVPLEEYVHK-RYPGLVKVVRNQKREGLIRARIEGWKVATGQV
...::.:::: :... :: ::: ::.: . : :.:.: ..: ::::::..: :. :::
CCDS11 MIEEIVLVDDASERDFLKRPLESYVKKLKVP--VHVIRMEQRSGLIRARLKGAAVSKGQV
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pF1KB3 TGFFDAHVEFTAGWAEPVLSRIQENRKRVILPSIDNIKQDNFEVQRYENSAHG-YSWELW
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CCDS11 ITFLDAHCECTVGWLEPLLARIKHDRRTVVCPIIDVISDDTFEYMAGSDMTYGGFNWKLN
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pF1KB3 CMYISPPKDWWD--AGDPSLPIRTPAMIGCSFVVNRKFFGEIGLLDPGMDVYGGENIELG
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CCDS11 FRWYPVPQREMDRRKGDRTLPVRTPTMAGGLFSIDRDYFQEIGTYDAGMDIWGGENLEIS
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pF1KB3 IKVWLCGGSMEVLPCSRVAHIERKKKPYN--SNIGFYTKRNALRVAEVWMDDYKSHVYIA
...: :::..:.. ::.:.:. :: ::. .. : ..: :.::::::..:. ::
CCDS11 FRIWQCGGTLEIVTCSHVGHVFRKATPYTFPGGTGQIINKNNRRLAEVWMDEFKNFFYII
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pF1KB3 WNLPLENPGI---DIGDVSERRALRKSLKCKNFQWYLDHVYPEMRRYNNTVAYGELRNNK
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CCDS11 ------SPGVTKVDYGDISSRVGLRHKLQCKPFSWYLENIYPDSQIPRHYFSLGEIRNVE
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pF1KB3 AKDVCLDQ-GPLENHTAILYPCHGWGP-QLARYTKEGFLHLGALGTTTLLPDTRCLVDNS
... :::. . ::. . .. ::: : :. :: .. . : :: : :
CCDS11 TNQ-CLDNMARKENEKVGIFNCHGMGGNQVFSYT----------ANKEIRTDDLCL-DVS
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pF1KB3 KSRLP-QLLDCDKVKSSLYKRWNFIQNGAIMNKGTGRCLEVENRGLAGIDLILRSCTG--
: : .: : ..:.. ... .. .... ....::. .. . . : :.:.:
CCDS11 KLNGPVTMLKCHHLKGNQLWEYDPVKL-TLQHVNSNQCLDKATEEDSQVPSI-RDCNGSR
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590
pF1KB3 -QRWTIKNSIK
:.: ..:
CCDS11 SQQWLLRNVTLPEIF
550
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pF1KB3 YGYNSYLSEKISLDRSIPDYRPTKCKELKYSKDLPQISIIFIFVNEALSVILRSVHSAVN
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pF1KB3 HTPTHLLKEIILVDDNSDEEELKVPLEEYVHKRYPGLVKVVRNQKREGLIRARIEGWKVA
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pF1KB3 WELWCMYISPPKDWWD--AGDPSLPIRTPAMIGCSFVVNRKFFGEIGLLDPGMDVYGGEN
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pF1KB3 IELGIKVWLCGGSMEVLPCSRVAHIERKKKPYN--SNIGFYTKRNALRVAEVWMDDYKSH
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CCDS21 LEMSFRIWQCGGSLEIVTCSHVGHVFRKATPYTFPGGTGHVINKNNRRLAEVWMDEFKDF
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pF1KB3 VYIAWNLPLENPGI---DIGDVSERRALRKSLKCKNFQWYLDHVYPEM---RRYNNTVAY
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CCDS21 FYII------SPGVVKVDYGDVSVRKTLRENLKCKPFSWYLENIYPDSQIPRRY---YSL
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pF1KB3 GELRNNKAKDVCLDQ-GPLENHTAILYPCHGWGP-QLARYTKEGFLHLGALGTTTLLPDT
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CCDS21 LCL-DVSRLNGPVIMLKCHHMRGN--QLWEYDAERLTLRHVNSNQCLDEPSEEDKMVPT-
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590
pF1KB3 LRSCTG---QRWTIKNSIK
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CCDS21 MQDCSGSRSQQWLLRNMTLGT
540 550
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pF1KB3 IQDAVLKRLSLLEDIVYRQLNGLSKSLGLIEGYGGRGKGGLPATLSPAEE-EKAKGPHEK
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CCDS77 NQFNLMASDLIALNRSLPDVRLEGCKTKVYPDELPNTSVVIVFHNEAWSTLLRTVYSVIN
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pF1KB3 HTPTHLLKEIILVDDNSDEEELKVPLEEYVHKRYPGLVKVVRNQKREGLIRARIEGWKVA
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CCDS77 RSPHYLLSEVILVDDASERDFLKLTLENYV-KNLEVPVKIIRMEERSGLIRARLRGAAAS
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pF1KB3 TGQVTGFFDAHVEFTAGWAEPVLSRIQENRKRVILPSIDNIKQDNFEVQRYENSAHG-YS
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CCDS77 KGQVITFLDAHCECTLGWLEPLLARIKEDRKTVVCPIIDVISDDTFEYMAGSDMTYGGFN
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pF1KB3 IELGIKVWLCGGSMEVLPCSRVAHIERKKKPYN--SNIGFYTKRNALRVAEVWMDDYKSH
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CCDS77 LEMSFRIWQCGGSLEIVTCSHVGHVFRKATPYTFPGGTGHVINKNNRRLAEVWMDEFKDF
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pF1KB3 VYIAWNLPLENPGI---DIGDVSERRALRKSLKCKNFQWYLDHVYPEM---RRYNNTVAY
:: .::. : :::: :..::..:::: :.:::...::. ::: .
CCDS77 FYII------SPGVVKVDYGDVSVRKTLRENLKCKPFSWYLENIYPDSQIPRRY---YSL
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pF1KB3 GELRNNKAKDVCLDQ-GPLENHTAILYPCHGWGP-QLARYTKEGFLHLGALGTTTLLPDT
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CCDS77 GEIRNVETNQ-CLDNMGRKENEKVGIFNCHGMGGNQVFSYTADKEIRT----------DD
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CCDS77 LCL-DVSRLNGPVIMLKCHHMRGN--QLWEY---------DAESCLSVNKVADGSQHPTV
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590
pF1KB3 RSC---TGQRWTIKNSIK
..: : :.: ..:
CCDS77 ETCNDSTLQKWLLRNYTRMEIFRNIFGNSTDYIL
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pF1KB3 VLKRLSLLEDIVYRQLNGLSKSLGLIEGYGGRGKGGLPATLSPAEEEKAKGPHEKYGYNS
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CCDS43 RQKKTFFLGDGQKLKDWHDKEAIRRDAQRVGNGEQGRPYPMTDAE--RVDQAYRENGFNI
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pF1KB3 YLSEKISLDRSIPDYRPTKCKELKYSKDLPQISIIFIFVNEALSVILRSVHSAVNHTPTH
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CCDS43 YVSDKISLNRSLPDIRHPNCNSKRYLETLPNTSIIIPFHNEGWSSLLRTVHSVLNRSPPE
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pF1KB3 LLKEIILVDDNSDEEELKVPLEEYVHKRYPGLVKVVRNQKREGLIRARIEGWKVATGQVT
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CCDS43 LVAEIVLVDDFSDREHLKKPLEDYM-ALFPS-VRILRTKKREGLIRTRMLGASVATGDVI
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pF1KB3 GFFDAHVEFTAGWAEPVLSRIQENRKRVILPSIDNIKQDNF--EVQRYENSAHGYSWELW
:.:.: : ...: :.:.:: .::: .. : :: : .:.: :.: . ...::..
CCDS43 TFLDSHCEANVNWLPPLLDRIARNRKTIVCPMIDVIDHDDFRYETQAGDAMRGAFDWEMY
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pF1KB3 CMYISPPKDWWDAGDPSLPIRTPAMIGCSFVVNRKFFGEIGLLDPGMDVYGGENIELGIK
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CCDS43 YKRIPIPPELQKA-DPSDPFESPVMAGGLFAVDRKWFWELGGYDPGLEIWGGEQYEISFK
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pF1KB3 VWLCGGSMEVLPCSRVAHIERKKKPYNSNIGFYTKRNALRVAEVWMDDYKSHVYIAWNLP
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CCDS43 VWMCGGRMEDIPCSRVGHIYRKYVPYKVPAGVSLARNLKRVAEVWMDEYAEYIY--QRRP
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pF1KB3 LENPGIDIGDVSERRALRKSLKCKNFQWYLDHVYPEMRRYNNTV-----AYGELRNNKAK
: .. :::. .. ::.::.::.:.:.. .. .. .. : :.::.:: .
CCDS43 -EYRHLSAGDVAVQKKLRSSLNCKSFKWFMTKIAWDLPKFYPPVEPPAAAWGEIRNV-GT
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pF1KB3 DVCLDQGPLENHTAILYPCHGWGPQLARYTKEGFLHLGALGTTTLLPDTR----------
.: : .: :. : . : .: :. . . : : : :
CCDS43 GLCADT----KHGALGSPLRLEG--CVRGRGEAAWNNMQVFTFTWREDIRPGDPQHTKKF
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pF1KB3 CLVDNSKSRLPQLLDCDKVKSSLYKRWNFIQNGAIMNKGTGRCLEV-ENRGLAGIDLILR
:. :.. : :: ..:.. . :.. .. .... .: :.. :. ..
CCDS43 CFDAISHTSPVTLYDCHSMKGN--QLWKYRKDKTLYHPVSGSCMDCSESDHRIFMNTCNP
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590
pF1KB3 SCTGQRWTIKNSIK
: :.: ....
CCDS43 SSLTQQWLFEHTNSTVLEKFNRN
590 600
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pF1KB3 SGDAFHEIRPRAEVANLSAHSASPIQDAVLKRLSLLEDIVYRQLNGLSKSLGLIEGYGGR
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pF1KB3 --GKGGLPATLSPAEEEKAKGPH--EKYGYNSYLSEKISLDRSIPDYRPTKCKELKYS-K
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CCDS55 ALGEWGKASKLQLNEDELKQQEELIERYAINIYLSDRISLHRHIEDKRMYECKSQKFNYR
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CCDS55 TLPTTSVIIAFYNEAWSTLLRTIHSVLETSPAVLLKEIILVDDLSDRVYLKTQLETYISN
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CCDS55 L--DRVRLIRTNKREGLVRARLIGATFATGDVLTFLDCHCECNSGWLEPLLERIGRDETA
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CCDS55 VVCPVIDTIDWNTFEFYMQIGEPMIGGFDWRLTFQWHSVPKQERDRRISRIDPIRSPTMA
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pF1KB3 GCSFVVNRKFFGEIGLLDPGMDVYGGENIELGIKVWLCGGSMEVLPCSRVAHIERKKKPY
: :.:..:.: .: : ::.:.::::.::...:: :::..:. :::.:.:. :. ::
CCDS55 GGLFAVSKKYFQYLGTYDTGMEVWGGENLELSFRVWQCGGKLEIHPCSHVGHVFPKRAPY
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pF1KB3 NSNIGFYTKRNALRVAEVWMDDYKSHVYIAWNLPLENPGIDIGDVSERRALRKSLKCKNF
. .: .:. :.::::::.:: : : : : .. . ::.:::. ::. :.::.:
CCDS55 -ARPNFL--QNTARAAEVWMDEYKEHFY-NRNPPARKEAY--GDISERKLLRERLRCKSF
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pF1KB3 QWYLDHVYPEMRRYNNTVAY-GELRNNKAKDVCLD-QGPLENHTAI---LYPCHGWGP-Q
.::: .:.:... .. .. : .:. .. ::: ..: .: :. :. ::: : :
CCDS55 DWYLKNVFPNLHVPEDRPGWHGAIRSRGISSECLDYNSPDNNPTGANLSLFGCHGQGGNQ
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pF1KB3 LARYTKEGFLHLGALGTTTL-LPDTRCLVDNSKSRLPQLLDCDKVKSSLYKRWNFIQNGA
. .::.. ...... .:. . : .. :. : : ... :.: ..:.
CCDS55 FFEYTSNKEIRFNSVTELCAEVPEQKNYVGMQNC--PK--DGFPVPANII--WHFKEDGT
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pF1KB3 IMNKGTGRCLEVENRGLAGIDLILRSCTG----QRWTIKNSIK
:.. .: :: . . :. .:.: . : :...
CCDS55 IFHPHSGLCLSAYRTPEGRPDVQMRTCDALDKNQIWSFEK
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>>CCDS53817.1 GALNT4 gene_id:8693|Hs108|chr12 (578 aa)
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40 50 60 70 80 90
pF1KB3 SGDAFHEIRPRAEVANLSAHSASPIQDAVLKRLSLLEDIVYRQLNGLSKSLGLIEGYGGR
.::: :. .. . ::. : .:
CCDS53 FLTVAYIFVELLVSTFHASAGAGRARELGSRRLSDLQ----KNTEDLSRPLYKKPPADSR
20 30 40 50 60 70
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pF1KB3 --GKGGLPATLSPAEEEKAKGPH--EKYGYNSYLSEKISLDRSIPDYRPTKCKELKYS-K
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CCDS53 ALGEWGKASKLQLNEDELKQQEELIERYAINIYLSDRISLHRHIEDKRMYECKSQKFNYR
80 90 100 110 120 130
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pF1KB3 DLPQISIIFIFVNEALSVILRSVHSAVNHTPTHLLKEIILVDDNSDEEELKVPLEEYVHK
:: :.:. : ::: :..::..::... .:. :::::::::: ::. ::. :: :. .
CCDS53 TLPTTSVIIAFYNEAWSTLLRTIHSVLETSPAVLLKEIILVDDLSDRVYLKTQLETYISN
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pF1KB3 RYPGLVKVVRNQKREGLIRARIEGWKVATGQVTGFFDAHVEFTAGWAEPVLSRIQENRKR
:...:..:::::.:::. : :::.: :.: : : ..:: ::.: :: ...
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