Result of FASTA (omim) for
pF1KB3647
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3647, 598 aa
1>>>pF1KB3647 598 - 598 aa - 598 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.6948+/-0.000395; mu= 22.6197+/- 0.024
mean_var=64.6178+/-12.990, 0's: 0 Z-trim(112.2): 110 B-trim: 1292 in 1/54
Lambda= 0.159551
statistics sampled from 20968 (21079) to 20968 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.614), E-opt: 0.2 (0.247), width: 16
Scan time: 10.290
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_071924 (OMIM: 615137) putative polypeptide N-ac ( 598) 4060 943.7 0
XP_011514769 (OMIM: 615137) PREDICTED: putative po ( 504) 3402 792.2 0
NP_001116108 (OMIM: 606251) polypeptide N-acetylga ( 603) 2666 622.9 9.8e-178
XP_016868010 (OMIM: 615137) PREDICTED: putative po ( 408) 2406 562.9 7.6e-160
XP_016874860 (OMIM: 606251) PREDICTED: polypeptide ( 502) 2288 535.8 1.3e-151
XP_016874862 (OMIM: 606251) PREDICTED: polypeptide ( 500) 2277 533.2 7.7e-151
XP_016874861 (OMIM: 606251) PREDICTED: polypeptide ( 500) 2277 533.2 7.7e-151
XP_016874863 (OMIM: 606251) PREDICTED: polypeptide ( 460) 2254 527.9 2.8e-149
XP_011514771 (OMIM: 615137) PREDICTED: putative po ( 325) 2120 496.9 4.2e-140
NP_940918 (OMIM: 615136) polypeptide N-acetylgalac ( 607) 2037 478.1 3.8e-134
XP_011518370 (OMIM: 615136) PREDICTED: polypeptide ( 430) 1755 413.0 1e-114
NP_059113 (OMIM: 606250) probable polypeptide N-ac ( 637) 1702 401.0 6.4e-111
XP_016874864 (OMIM: 606251) PREDICTED: polypeptide ( 454) 1576 371.8 2.7e-102
XP_016874865 (OMIM: 606251) PREDICTED: polypeptide ( 358) 1333 315.8 1.5e-85
XP_011518372 (OMIM: 615136) PREDICTED: polypeptide ( 387) 1152 274.2 5.7e-73
XP_005258296 (OMIM: 602273) PREDICTED: polypeptide ( 559) 1152 274.3 7.5e-73
NP_065207 (OMIM: 602273) polypeptide N-acetylgalac ( 559) 1152 274.3 7.5e-73
XP_016881181 (OMIM: 602273) PREDICTED: polypeptide ( 559) 1152 274.3 7.5e-73
XP_006718288 (OMIM: 615136) PREDICTED: polypeptide ( 368) 1135 270.3 8.2e-72
XP_011518371 (OMIM: 615136) PREDICTED: polypeptide ( 394) 1133 269.8 1.2e-71
XP_011518373 (OMIM: 615136) PREDICTED: polypeptide ( 372) 1132 269.6 1.3e-71
XP_006718287 (OMIM: 615136) PREDICTED: polypeptide ( 545) 1132 269.7 1.8e-71
XP_016858750 (OMIM: 608369) PREDICTED: polypeptide ( 556) 1131 269.5 2.1e-71
NP_443149 (OMIM: 608369) polypeptide N-acetylgalac ( 556) 1131 269.5 2.1e-71
NP_001288556 (OMIM: 608369) polypeptide N-acetylga ( 561) 1131 269.5 2.1e-71
XP_016858749 (OMIM: 608369) PREDICTED: polypeptide ( 561) 1131 269.5 2.1e-71
XP_016858748 (OMIM: 608369) PREDICTED: polypeptide ( 571) 1131 269.5 2.2e-71
XP_016858747 (OMIM: 608369) PREDICTED: polypeptide ( 571) 1131 269.5 2.2e-71
XP_011508839 (OMIM: 608369) PREDICTED: polypeptide ( 571) 1131 269.5 2.2e-71
NP_938080 (OMIM: 608043) polypeptide N-acetylgalac ( 603) 1092 260.5 1.1e-68
NP_001291443 (OMIM: 615130) polypeptide N-acetylga ( 527) 1076 256.8 1.3e-67
NP_003765 (OMIM: 603565) polypeptide N-acetylgalac ( 578) 1069 255.2 4.3e-67
XP_006716146 (OMIM: 615130) PREDICTED: polypeptide ( 608) 1061 253.4 1.6e-66
NP_071370 (OMIM: 615130) polypeptide N-acetylgalac ( 608) 1061 253.4 1.6e-66
XP_006716145 (OMIM: 615130) PREDICTED: polypeptide ( 608) 1061 253.4 1.6e-66
XP_006716147 (OMIM: 615130) PREDICTED: polypeptide ( 608) 1061 253.4 1.6e-66
XP_011536124 (OMIM: 605148) PREDICTED: polypeptide ( 622) 1043 249.3 2.9e-65
XP_006719277 (OMIM: 605148) PREDICTED: polypeptide ( 622) 1043 249.3 2.9e-65
XP_011536121 (OMIM: 605148) PREDICTED: polypeptide ( 622) 1043 249.3 2.9e-65
NP_009141 (OMIM: 605148) polypeptide N-acetylgalac ( 622) 1043 249.3 2.9e-65
XP_016874234 (OMIM: 605148) PREDICTED: polypeptide ( 622) 1043 249.3 2.9e-65
XP_016874233 (OMIM: 605148) PREDICTED: polypeptide ( 622) 1043 249.3 2.9e-65
XP_005268664 (OMIM: 605148) PREDICTED: polypeptide ( 622) 1043 249.3 2.9e-65
NP_068580 (OMIM: 606251) polypeptide N-acetylgalac ( 237) 1038 247.8 3.1e-65
XP_011530295 (OMIM: 615138) PREDICTED: polypeptide ( 522) 1033 246.9 1.3e-64
NP_001030017 (OMIM: 615138) polypeptide N-acetylga ( 601) 1033 247.0 1.4e-64
XP_016863733 (OMIM: 615138) PREDICTED: polypeptide ( 609) 1033 247.0 1.4e-64
NP_055383 (OMIM: 615129) polypeptide N-acetylgalac ( 940) 1028 246.0 4.3e-64
XP_016858726 (OMIM: 615129) PREDICTED: polypeptide ( 956) 1028 246.0 4.4e-64
NP_001278795 (OMIM: 602274) polypeptide N-acetylga ( 533) 1018 243.5 1.4e-63
>>NP_071924 (OMIM: 615137) putative polypeptide N-acetyl (598 aa)
initn: 4060 init1: 4060 opt: 4060 Z-score: 5046.1 bits: 943.7 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4060; 100.0% identity (100.0% similar) in 598 aa overlap (1-598:1-598)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MASLRRVKVLLVLNLIAVAGFVLFLAKCRPIAVRSGDAFHEIRPRAEVANLSAHSASPIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_071 MASLRRVKVLLVLNLIAVAGFVLFLAKCRPIAVRSGDAFHEIRPRAEVANLSAHSASPIQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 DAVLKRLSLLEDIVYRQLNGLSKSLGLIEGYGGRGKGGLPATLSPAEEEKAKGPHEKYGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_071 DAVLKRLSLLEDIVYRQLNGLSKSLGLIEGYGGRGKGGLPATLSPAEEEKAKGPHEKYGY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 NSYLSEKISLDRSIPDYRPTKCKELKYSKDLPQISIIFIFVNEALSVILRSVHSAVNHTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_071 NSYLSEKISLDRSIPDYRPTKCKELKYSKDLPQISIIFIFVNEALSVILRSVHSAVNHTP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 THLLKEIILVDDNSDEEELKVPLEEYVHKRYPGLVKVVRNQKREGLIRARIEGWKVATGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_071 THLLKEIILVDDNSDEEELKVPLEEYVHKRYPGLVKVVRNQKREGLIRARIEGWKVATGQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 VTGFFDAHVEFTAGWAEPVLSRIQENRKRVILPSIDNIKQDNFEVQRYENSAHGYSWELW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_071 VTGFFDAHVEFTAGWAEPVLSRIQENRKRVILPSIDNIKQDNFEVQRYENSAHGYSWELW
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 CMYISPPKDWWDAGDPSLPIRTPAMIGCSFVVNRKFFGEIGLLDPGMDVYGGENIELGIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_071 CMYISPPKDWWDAGDPSLPIRTPAMIGCSFVVNRKFFGEIGLLDPGMDVYGGENIELGIK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 VWLCGGSMEVLPCSRVAHIERKKKPYNSNIGFYTKRNALRVAEVWMDDYKSHVYIAWNLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_071 VWLCGGSMEVLPCSRVAHIERKKKPYNSNIGFYTKRNALRVAEVWMDDYKSHVYIAWNLP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 LENPGIDIGDVSERRALRKSLKCKNFQWYLDHVYPEMRRYNNTVAYGELRNNKAKDVCLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_071 LENPGIDIGDVSERRALRKSLKCKNFQWYLDHVYPEMRRYNNTVAYGELRNNKAKDVCLD
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 QGPLENHTAILYPCHGWGPQLARYTKEGFLHLGALGTTTLLPDTRCLVDNSKSRLPQLLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_071 QGPLENHTAILYPCHGWGPQLARYTKEGFLHLGALGTTTLLPDTRCLVDNSKSRLPQLLD
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590
pF1KB3 CDKVKSSLYKRWNFIQNGAIMNKGTGRCLEVENRGLAGIDLILRSCTGQRWTIKNSIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_071 CDKVKSSLYKRWNFIQNGAIMNKGTGRCLEVENRGLAGIDLILRSCTGQRWTIKNSIK
550 560 570 580 590
>>XP_011514769 (OMIM: 615137) PREDICTED: putative polype (504 aa)
initn: 3402 init1: 3402 opt: 3402 Z-score: 4228.5 bits: 792.2 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 3402; 100.0% identity (100.0% similar) in 500 aa overlap (1-500:1-500)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MASLRRVKVLLVLNLIAVAGFVLFLAKCRPIAVRSGDAFHEIRPRAEVANLSAHSASPIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MASLRRVKVLLVLNLIAVAGFVLFLAKCRPIAVRSGDAFHEIRPRAEVANLSAHSASPIQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 DAVLKRLSLLEDIVYRQLNGLSKSLGLIEGYGGRGKGGLPATLSPAEEEKAKGPHEKYGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DAVLKRLSLLEDIVYRQLNGLSKSLGLIEGYGGRGKGGLPATLSPAEEEKAKGPHEKYGY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 NSYLSEKISLDRSIPDYRPTKCKELKYSKDLPQISIIFIFVNEALSVILRSVHSAVNHTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NSYLSEKISLDRSIPDYRPTKCKELKYSKDLPQISIIFIFVNEALSVILRSVHSAVNHTP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 THLLKEIILVDDNSDEEELKVPLEEYVHKRYPGLVKVVRNQKREGLIRARIEGWKVATGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 THLLKEIILVDDNSDEEELKVPLEEYVHKRYPGLVKVVRNQKREGLIRARIEGWKVATGQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 VTGFFDAHVEFTAGWAEPVLSRIQENRKRVILPSIDNIKQDNFEVQRYENSAHGYSWELW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VTGFFDAHVEFTAGWAEPVLSRIQENRKRVILPSIDNIKQDNFEVQRYENSAHGYSWELW
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 CMYISPPKDWWDAGDPSLPIRTPAMIGCSFVVNRKFFGEIGLLDPGMDVYGGENIELGIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 CMYISPPKDWWDAGDPSLPIRTPAMIGCSFVVNRKFFGEIGLLDPGMDVYGGENIELGIK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 VWLCGGSMEVLPCSRVAHIERKKKPYNSNIGFYTKRNALRVAEVWMDDYKSHVYIAWNLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VWLCGGSMEVLPCSRVAHIERKKKPYNSNIGFYTKRNALRVAEVWMDDYKSHVYIAWNLP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 LENPGIDIGDVSERRALRKSLKCKNFQWYLDHVYPEMRRYNNTVAYGELRNNKAKDVCLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LENPGIDIGDVSERRALRKSLKCKNFQWYLDHVYPEMRRYNNTVAYGELRNNKAKDVCLD
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 QGPLENHTAILYPCHGWGPQLARYTKEGFLHLGALGTTTLLPDTRCLVDNSKSRLPQLLD
::::::::::::::::::::
XP_011 QGPLENHTAILYPCHGWGPQKWKS
490 500
>>NP_001116108 (OMIM: 606251) polypeptide N-acetylgalact (603 aa)
initn: 2566 init1: 2362 opt: 2666 Z-score: 3311.9 bits: 622.9 E(85289): 9.8e-178
Smith-Waterman score: 2666; 61.5% identity (84.9% similar) in 608 aa overlap (1-598:1-599)
10 20 30 40 50
pF1KB3 MASLRRVKVLLVLNLIAVAGFVLFLAKCRP-------IAVRSGDAFHEIRPR-AEVANLS
:: :....::..:... .:.::: . :: . . ::: ...: : :.:..:.
NP_001 MAVARKIRTLLTVNILVFVGIVLFSVYCRLQGRSQELVRIVSGD--RRVRSRHAKVGTLG
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB3 AHSASPIQDAVLKRLSLLEDIVYRQLNGLSKSLGLIEGYGGRGKGGLPATLSPAEEEKAK
..:.:.::. ::..:: :::::.: .::.:: :: :.::: ::: .: :.
NP_001 D------REAILQRLDHLEEVVYNQLNGLAKPIGLVEGPGGLGQGGLAATLRDDGQE-AE
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB3 GPHEKYGYNSYLSEKISLDRSIPDYRPTKCKELKYSKDLPQISIIFIFVNEALSVILRSV
: .:.::::. ::..:::::::::::: ::....:..::::.:..:::::::::::::::
NP_001 GKYEEYGYNAQLSDRISLDRSIPDYRPRKCRQMSYAQDLPQVSVVFIFVNEALSVILRSV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB3 HSAVNHTPTHLLKEIILVDDNSDEEELKVPLEEYVHKRYPGLVKVVRNQKREGLIRARIE
::.:::::..::::.::::::::. ::: :..::.::::::::.:::..::::::::..
NP_001 HSVVNHTPSQLLKEVILVDDNSDNVELKFNLDQYVNKRYPGLVKIVRNSRREGLIRARLQ
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB3 GWKVATGQVTGFFDAHVEFTAGWAEPVLSRIQENRKRVILPSIDNIKQDNFEVQRYENSA
:::.::. :.:::::::::..:::::.::::.:.:.:..::.::::: ..::::.: :.:
NP_001 GWKAATAPVVGFFDAHVEFNTGWAEPALSRIREDRRRIVLPAIDNIKYSTFEVQQYANAA
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB3 HGYSWELWCMYISPPKDWWDAGDPSLPIRTPAMIGCSFVVNRKFFGEIGLLDPGMDVYGG
:::.: :::::: ::.:: : :: : ::::::::::::::.:..::.::::::::.::::
NP_001 HGYNWGLWCMYIIPPQDWLDRGDESAPIRTPAMIGCSFVVDREYFGDIGLLDPGMEVYGG
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB3 ENIELGIKVWLCGGSMEVLPCSRVAHIERKKKPYNSNIGFYTKRNALRVAEVWMDDYKSH
::.:::..:: :::::::::::::::::: .::::..: .:.::::::.:::::::.:::
NP_001 ENVELGMRVWQCGGSMEVLPCSRVAHIERTRKPYNNDIDYYAKRNALRAAEVWMDDFKSH
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB3 VYIAWNLPLENPGIDIGDVSERRALRKSLKCKNFQWYLDHVYPEMRRYNNTVAYGELRNN
::.:::.:. :::.:.:::::: :::. :::..:.:::..:::::: ::::..:::.::.
NP_001 VYMAWNIPMSNPGVDFGDVSERLALRQRLKCRSFKWYLENVYPEMRVYNNTLTYGEVRNS
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB3 KAKDVCLDQGPLENHTAILYPCHGWGPQLARYTKEGFLHLGALGTTTLLPDTRCLVDNSK
::. ::::: .. :::::::: . ::.::. .:.:.:: ::.:..:::..::::..
NP_001 KASAYCLDQGAEDGDRAILYPCHGMSSQLVRYSADGLLQLGPLGSTAFLPDSKCLVDDGT
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KB3 SRLPQLLDCDKVKSSLYKRWNFIQNGAIMNKGTGRCLEVENRGLA--GIDLILRSCTGQR
.:.: : :. : . :.: :.: :....:::::::: : :. :... :.::.
NP_001 GRMPTLKKCEDVARPTQRLWDFTQSGPIVSRATGRCLEVEMSKDANFGLRLVVQRCSGQK
540 550 560 570 580 590
pF1KB3 WTIKNSIK
: :.: ::
NP_001 WMIRNWIKHARH
600
>>XP_016868010 (OMIM: 615137) PREDICTED: putative polype (408 aa)
initn: 2406 init1: 2406 opt: 2406 Z-score: 2990.7 bits: 562.9 E(85289): 7.6e-160
Smith-Waterman score: 2406; 99.7% identity (99.7% similar) in 362 aa overlap (1-362:1-362)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MASLRRVKVLLVLNLIAVAGFVLFLAKCRPIAVRSGDAFHEIRPRAEVANLSAHSASPIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MASLRRVKVLLVLNLIAVAGFVLFLAKCRPIAVRSGDAFHEIRPRAEVANLSAHSASPIQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 DAVLKRLSLLEDIVYRQLNGLSKSLGLIEGYGGRGKGGLPATLSPAEEEKAKGPHEKYGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DAVLKRLSLLEDIVYRQLNGLSKSLGLIEGYGGRGKGGLPATLSPAEEEKAKGPHEKYGY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 NSYLSEKISLDRSIPDYRPTKCKELKYSKDLPQISIIFIFVNEALSVILRSVHSAVNHTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NSYLSEKISLDRSIPDYRPTKCKELKYSKDLPQISIIFIFVNEALSVILRSVHSAVNHTP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 THLLKEIILVDDNSDEEELKVPLEEYVHKRYPGLVKVVRNQKREGLIRARIEGWKVATGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 THLLKEIILVDDNSDEEELKVPLEEYVHKRYPGLVKVVRNQKREGLIRARIEGWKVATGQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 VTGFFDAHVEFTAGWAEPVLSRIQENRKRVILPSIDNIKQDNFEVQRYENSAHGYSWELW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VTGFFDAHVEFTAGWAEPVLSRIQENRKRVILPSIDNIKQDNFEVQRYENSAHGYSWELW
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 CMYISPPKDWWDAGDPSLPIRTPAMIGCSFVVNRKFFGEIGLLDPGMDVYGGENIELGIK
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370 380 390 400 410 420
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:
XP_016 RWGSHYVAQADVKLLTSRDCSISASQHAGTTAVSHCAWPYIEIMSHLE
370 380 390 400
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110 120 130 140 150 160
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:. : : .:....:..::::.:..::::
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:::::::::::::.:::::..::::.::::::::. ::: :..::.::::::::.:::.
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.::::::::..:::.::. :.:::::::::..:::::.::::.:.:.:..::.::::: .
XP_016 RREGLIRARLQGWKAATAPVVGFFDAHVEFNTGWAEPALSRIREDRRRIVLPAIDNIKYS
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.::::.: :.::::.: :::::: ::.:: : :: : ::::::::::::::.:..::.::
XP_016 TFEVQQYANAAHGYNWGLWCMYIIPPQDWLDRGDESAPIRTPAMIGCSFVVDREYFGDIG
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::::::.::::::.:::..:: :::::::::::::::::: .::::..: .:.::::::.
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:::::::.:::::.:::.:. :::.:.:::::: :::. :::..:.:::..:::::: ::
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pF1KB3 NTVAYGELRNNKAKDVCLDQGPLENHTAILYPCHGWGPQLARYTKEGFLHLGALGTTTLL
::..:::.::.::. ::::: .. :::::::: . ::.::. .:.:.:: ::.:..:
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pF1KB3 PDTRCLVDNSKSRLPQLLDCDKVKSSLYKRWNFIQNGAIMNKGTGRCLEVENRGLA--GI
::..::::.. .:.: : :. : . :.: :.: :....:::::::: : :.
XP_016 PDSKCLVDDGTGRMPTLKKCEDVARPTQRLWDFTQSGPIVSRATGRCLEVEMSKDANFGL
420 430 440 450 460 470
580 590
pF1KB3 DLILRSCTGQRWTIKNSIK
:... :.::.: :.: ::
XP_016 RLVVQRCSGQKWMIRNWIKHARH
480 490 500
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Smith-Waterman score: 2277; 65.5% identity (88.0% similar) in 467 aa overlap (135-598:30-496)
110 120 130 140 150 160
pF1KB3 PAEEEKAKGPHEKYGYNSYLSEKISLDRSIPDYRP-TKCKELKYSKDLPQISIIFIFVNE
: : ..:....:..::::.:..::::::
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:::::::::::.:::::..::::.::::::::. ::: :..::.::::::::.:::..:
XP_016 ALSVILRSVHSVVNHTPSQLLKEVILVDDNSDNVELKFNLDQYVNKRYPGLVKIVRNSRR
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pF1KB3 EGLIRARIEGWKVATGQVTGFFDAHVEFTAGWAEPVLSRIQENRKRVILPSIDNIKQDNF
:::::::..:::.::. :.:::::::::..:::::.::::.:.:.:..::.::::: ..:
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pF1KB3 EVQRYENSAHGYSWELWCMYISPPKDWWDAGDPSLPIRTPAMIGCSFVVNRKFFGEIGLL
:::.: :.::::.: :::::: ::.:: : :: : ::::::::::::::.:..::.::::
XP_016 EVQQYANAAHGYNWGLWCMYIIPPQDWLDRGDESAPIRTPAMIGCSFVVDREYFGDIGLL
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pF1KB3 DPGMDVYGGENIELGIKVWLCGGSMEVLPCSRVAHIERKKKPYNSNIGFYTKRNALRVAE
::::.::::::.:::..:: :::::::::::::::::: .::::..: .:.::::::.::
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pF1KB3 VWMDDYKSHVYIAWNLPLENPGIDIGDVSERRALRKSLKCKNFQWYLDHVYPEMRRYNNT
:::::.:::::.:::.:. :::.:.:::::: :::. :::..:.:::..:::::: ::::
XP_016 VWMDDFKSHVYMAWNIPMSNPGVDFGDVSERLALRQRLKCRSFKWYLENVYPEMRVYNNT
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pF1KB3 VAYGELRNNKAKDVCLDQGPLENHTAILYPCHGWGPQLARYTKEGFLHLGALGTTTLLPD
..:::.::.::. ::::: .. :::::::: . ::.::. .:.:.:: ::.:..:::
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pF1KB3 TRCLVDNSKSRLPQLLDCDKVKSSLYKRWNFIQNGAIMNKGTGRCLEVENRGLA--GIDL
..::::.. .:.: : :. : . :.: :.: :....:::::::: : :. :
XP_016 SKCLVDDGTGRMPTLKKCEDVARPTQRLWDFTQSGPIVSRATGRCLEVEMSKDANFGLRL
420 430 440 450 460 470
590
pF1KB3 ILRSCTGQRWTIKNSIK
... :.::.: :.: ::
XP_016 VVQRCSGQKWMIRNWIKHARH
480 490 500
>>XP_016874861 (OMIM: 606251) PREDICTED: polypeptide N-a (500 aa)
initn: 2230 init1: 2206 opt: 2277 Z-score: 2829.1 bits: 533.2 E(85289): 7.7e-151
Smith-Waterman score: 2277; 65.5% identity (88.0% similar) in 467 aa overlap (135-598:30-496)
110 120 130 140 150 160
pF1KB3 PAEEEKAKGPHEKYGYNSYLSEKISLDRSIPDYRP-TKCKELKYSKDLPQISIIFIFVNE
: : ..:....:..::::.:..::::::
XP_016 MTARRRKASMRSTATTLSSATASPSIGASPTTGPESECRQMSYAQDLPQVSVVFIFVNE
10 20 30 40 50
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pF1KB3 ALSVILRSVHSAVNHTPTHLLKEIILVDDNSDEEELKVPLEEYVHKRYPGLVKVVRNQKR
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XP_016 ALSVILRSVHSVVNHTPSQLLKEVILVDDNSDNVELKFNLDQYVNKRYPGLVKIVRNSRR
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pF1KB3 EGLIRARIEGWKVATGQVTGFFDAHVEFTAGWAEPVLSRIQENRKRVILPSIDNIKQDNF
:::::::..:::.::. :.:::::::::..:::::.::::.:.:.:..::.::::: ..:
XP_016 EGLIRARLQGWKAATAPVVGFFDAHVEFNTGWAEPALSRIREDRRRIVLPAIDNIKYSTF
120 130 140 150 160 170
290 300 310 320 330 340
pF1KB3 EVQRYENSAHGYSWELWCMYISPPKDWWDAGDPSLPIRTPAMIGCSFVVNRKFFGEIGLL
:::.: :.::::.: :::::: ::.:: : :: : ::::::::::::::.:..::.::::
XP_016 EVQQYANAAHGYNWGLWCMYIIPPQDWLDRGDESAPIRTPAMIGCSFVVDREYFGDIGLL
180 190 200 210 220 230
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pF1KB3 DPGMDVYGGENIELGIKVWLCGGSMEVLPCSRVAHIERKKKPYNSNIGFYTKRNALRVAE
::::.::::::.:::..:: :::::::::::::::::: .::::..: .:.::::::.::
XP_016 DPGMEVYGGENVELGMRVWQCGGSMEVLPCSRVAHIERTRKPYNNDIDYYAKRNALRAAE
240 250 260 270 280 290
410 420 430 440 450 460
pF1KB3 VWMDDYKSHVYIAWNLPLENPGIDIGDVSERRALRKSLKCKNFQWYLDHVYPEMRRYNNT
:::::.:::::.:::.:. :::.:.:::::: :::. :::..:.:::..:::::: ::::
XP_016 VWMDDFKSHVYMAWNIPMSNPGVDFGDVSERLALRQRLKCRSFKWYLENVYPEMRVYNNT
300 310 320 330 340 350
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pF1KB3 VAYGELRNNKAKDVCLDQGPLENHTAILYPCHGWGPQLARYTKEGFLHLGALGTTTLLPD
..:::.::.::. ::::: .. :::::::: . ::.::. .:.:.:: ::.:..:::
XP_016 LTYGEVRNSKASAYCLDQGAEDGDRAILYPCHGMSSQLVRYSADGLLQLGPLGSTAFLPD
360 370 380 390 400 410
530 540 550 560 570 580
pF1KB3 TRCLVDNSKSRLPQLLDCDKVKSSLYKRWNFIQNGAIMNKGTGRCLEVENRGLA--GIDL
..::::.. .:.: : :. : . :.: :.: :....:::::::: : :. :
XP_016 SKCLVDDGTGRMPTLKKCEDVARPTQRLWDFTQSGPIVSRATGRCLEVEMSKDANFGLRL
420 430 440 450 460 470
590
pF1KB3 ILRSCTGQRWTIKNSIK
... :.::.: :.: ::
XP_016 VVQRCSGQKWMIRNWIKHARH
480 490 500
>>XP_016874863 (OMIM: 606251) PREDICTED: polypeptide N-a (460 aa)
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pF1KB3 HEKYGYNSYLSEKISLDRSIPDYRPTKCKELKYSKDLPQISIIFIFVNEALSVILRSVHS
..:..::::.:..:::::::::::::::::
XP_016 MSYAQDLPQVSVVFIFVNEALSVILRSVHS
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180 190 200 210 220 230
pF1KB3 AVNHTPTHLLKEIILVDDNSDEEELKVPLEEYVHKRYPGLVKVVRNQKREGLIRARIEGW
.:::::..::::.::::::::. ::: :..::.::::::::.:::..::::::::..::
XP_016 VVNHTPSQLLKEVILVDDNSDNVELKFNLDQYVNKRYPGLVKIVRNSRREGLIRARLQGW
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pF1KB3 KVATGQVTGFFDAHVEFTAGWAEPVLSRIQENRKRVILPSIDNIKQDNFEVQRYENSAHG
:.::. :.:::::::::..:::::.::::.:.:.:..::.::::: ..::::.: :.:::
XP_016 KAATAPVVGFFDAHVEFNTGWAEPALSRIREDRRRIVLPAIDNIKYSTFEVQQYANAAHG
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pF1KB3 YSWELWCMYISPPKDWWDAGDPSLPIRTPAMIGCSFVVNRKFFGEIGLLDPGMDVYGGEN
:.: :::::: ::.:: : :: : ::::::::::::::.:..::.::::::::.::::::
XP_016 YNWGLWCMYIIPPQDWLDRGDESAPIRTPAMIGCSFVVDREYFGDIGLLDPGMEVYGGEN
160 170 180 190 200 210
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pF1KB3 IELGIKVWLCGGSMEVLPCSRVAHIERKKKPYNSNIGFYTKRNALRVAEVWMDDYKSHVY
.:::..:: :::::::::::::::::: .::::..: .:.::::::.:::::::.:::::
XP_016 VELGMRVWQCGGSMEVLPCSRVAHIERTRKPYNNDIDYYAKRNALRAAEVWMDDFKSHVY
220 230 240 250 260 270
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pF1KB3 IAWNLPLENPGIDIGDVSERRALRKSLKCKNFQWYLDHVYPEMRRYNNTVAYGELRNNKA
.:::.:. :::.:.:::::: :::. :::..:.:::..:::::: ::::..:::.::.::
XP_016 MAWNIPMSNPGVDFGDVSERLALRQRLKCRSFKWYLENVYPEMRVYNNTLTYGEVRNSKA
280 290 300 310 320 330
480 490 500 510 520 530
pF1KB3 KDVCLDQGPLENHTAILYPCHGWGPQLARYTKEGFLHLGALGTTTLLPDTRCLVDNSKSR
. ::::: .. :::::::: . ::.::. .:.:.:: ::.:..:::..::::.. .:
XP_016 SAYCLDQGAEDGDRAILYPCHGMSSQLVRYSADGLLQLGPLGSTAFLPDSKCLVDDGTGR
340 350 360 370 380 390
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pF1KB3 LPQLLDCDKVKSSLYKRWNFIQNGAIMNKGTGRCLEVENRGLA--GIDLILRSCTGQRWT
.: : :. : . :.: :.: :....:::::::: : :. :... :.::.:
XP_016 MPTLKKCEDVARPTQRLWDFTQSGPIVSRATGRCLEVEMSKDANFGLRLVVQRCSGQKWM
400 410 420 430 440 450
pF1KB3 IKNSIK
:.: ::
XP_016 IRNWIKHARH
460
>>XP_011514771 (OMIM: 615137) PREDICTED: putative polype (325 aa)
initn: 2120 init1: 2120 opt: 2120 Z-score: 2636.3 bits: 496.9 E(85289): 4.2e-140
Smith-Waterman score: 2120; 100.0% identity (100.0% similar) in 320 aa overlap (1-320:1-320)
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pF1KB3 MASLRRVKVLLVLNLIAVAGFVLFLAKCRPIAVRSGDAFHEIRPRAEVANLSAHSASPIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MASLRRVKVLLVLNLIAVAGFVLFLAKCRPIAVRSGDAFHEIRPRAEVANLSAHSASPIQ
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pF1KB3 DAVLKRLSLLEDIVYRQLNGLSKSLGLIEGYGGRGKGGLPATLSPAEEEKAKGPHEKYGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DAVLKRLSLLEDIVYRQLNGLSKSLGLIEGYGGRGKGGLPATLSPAEEEKAKGPHEKYGY
70 80 90 100 110 120
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pF1KB3 NSYLSEKISLDRSIPDYRPTKCKELKYSKDLPQISIIFIFVNEALSVILRSVHSAVNHTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NSYLSEKISLDRSIPDYRPTKCKELKYSKDLPQISIIFIFVNEALSVILRSVHSAVNHTP
130 140 150 160 170 180
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pF1KB3 THLLKEIILVDDNSDEEELKVPLEEYVHKRYPGLVKVVRNQKREGLIRARIEGWKVATGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 THLLKEIILVDDNSDEEELKVPLEEYVHKRYPGLVKVVRNQKREGLIRARIEGWKVATGQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 VTGFFDAHVEFTAGWAEPVLSRIQENRKRVILPSIDNIKQDNFEVQRYENSAHGYSWELW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VTGFFDAHVEFTAGWAEPVLSRIQENRKRVILPSIDNIKQDNFEVQRYENSAHGYSWELW
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 CMYISPPKDWWDAGDPSLPIRTPAMIGCSFVVNRKFFGEIGLLDPGMDVYGGENIELGIK
::::::::::::::::::::
XP_011 CMYISPPKDWWDAGDPSLPISDRFS
310 320
>>NP_940918 (OMIM: 615136) polypeptide N-acetylgalactosa (607 aa)
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Smith-Waterman score: 2037; 56.9% identity (82.3% similar) in 503 aa overlap (103-598:105-603)
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pF1KB3 IVYRQLNGLSKSLGLIEGYGGRGKGGLPATLSPAEEEKAKGPHEKYGYNSYLSEKISLDR
::: .. : . ::::.:::... :::
NP_940 QHIQEAPAKPEEAEAEPFTDSSLFAHWGQELSPEGRRVALKQFQYYGYNAYLSDRLPLDR
80 90 100 110 120 130
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pF1KB3 SIPDYRPTKCKELKYSKDLPQISIIFIFVNEALSVILRSVHSAVNHTPTHLLKEIILVDD
.:: ::. :..:.. .::..::.::::::::::.:::.:::...:: :::::::::::
NP_940 PLPDLRPSGCRNLSFPDSLPEVSIVFIFVNEALSVLLRSIHSAMERTPPHLLKEIILVDD
140 150 160 170 180 190
200 210 220 230 240
pF1KB3 NSDEEELKVPLEEYVHK---RYPGLVKVVRNQKREGLIRARIEGWKVATGQVTGFFDAHV
::..:::: : ::: : . ::..::::..:.:::::.:. ::..::. :...:::::
NP_940 NSSNEELKEKLTEYVDKVNSQKPGFIKVVRHSKQEGLIRSRVSGWRAATAPVVALFDAHV
200 210 220 230 240 250
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 EFTAGWAEPVLSRIQENRKRVILPSIDNIKQDNFEVQRYENSAHGYSWELWCMYISPPKD
::..:::::::.::.:::::.: ::.:::: ::::...: .:.:..::::: :..:::
NP_940 EFNVGWAEPVLTRIKENRKRIISPSFDNIKYDNFEIEEYPLAAQGFDWELWCRYLNPPKA
260 270 280 290 300 310
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 WWDAGDPSLPIRTPAMIGCSFVVNRKFFGEIGLLDPGMDVYGGENIELGIKVWLCGGSME
:: . . :::.::.::: :.:.:..: :::::: ::.::::::.::::.:: ::::.:
NP_940 WWKLENSTAPIRSPALIGC-FIVDRQYFQEIGLLDEGMEVYGGENVELGIRVWQCGGSVE
320 330 340 350 360 370
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 VLPCSRVAHIERKKKPYNSNIGFYTKRNALRVAEVWMDDYKSHVYIAWNLPLENPGIDIG
::::::.::::: .:::. .. ...::::::::::::..:::::.:::.: :. :::::
NP_940 VLPCSRIAHIERAHKPYTEDLTAHVRRNALRVAEVWMDEFKSHVYMAWNIPQEDSGIDIG
380 390 400 410 420 430
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 DVSERRALRKSLKCKNFQWYLDHVYPEMRRYNNTVAYGELRNNKAKDVCLDQGPLENHTA
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