Result of FASTA (ccds) for
pF1KB3652
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3652, 768 aa
1>>>pF1KB3652 768 - 768 aa - 768 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.7208+/-0.00104; mu= -2.7581+/- 0.063
mean_var=312.7086+/-62.865, 0's: 0 Z-trim(113.9): 14 B-trim: 34 in 2/51
Lambda= 0.072528
statistics sampled from 14465 (14476) to 14465 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.748), E-opt: 0.2 (0.445), width: 16
Scan time: 4.820
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3363.1 ADD1 gene_id:118|Hs108|chr4 ( 768) 5124 550.2 4.7e-156
CCDS3364.1 ADD1 gene_id:118|Hs108|chr4 ( 662) 4336 467.7 2.8e-131
CCDS75094.1 ADD1 gene_id:118|Hs108|chr4 ( 662) 3642 395.0 2e-109
CCDS43205.1 ADD1 gene_id:118|Hs108|chr4 ( 737) 3135 342.0 2e-93
CCDS7562.1 ADD3 gene_id:120|Hs108|chr10 ( 674) 1882 210.9 5.5e-54
CCDS7561.1 ADD3 gene_id:120|Hs108|chr10 ( 706) 1882 210.9 5.7e-54
CCDS46318.1 ADD2 gene_id:119|Hs108|chr2 ( 559) 1620 183.4 8.5e-46
CCDS54365.1 ADD2 gene_id:119|Hs108|chr2 ( 575) 1620 183.4 8.7e-46
CCDS1909.1 ADD2 gene_id:119|Hs108|chr2 ( 643) 1620 183.5 9.5e-46
CCDS1906.1 ADD2 gene_id:119|Hs108|chr2 ( 726) 1620 183.5 1e-45
>>CCDS3363.1 ADD1 gene_id:118|Hs108|chr4 (768 aa)
initn: 5124 init1: 5124 opt: 5124 Z-score: 2915.2 bits: 550.2 E(32554): 4.7e-156
Smith-Waterman score: 5124; 100.0% identity (100.0% similar) in 768 aa overlap (1-768:1-768)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MNGDSRAAVVTSPPPTTAPHKERYFDRVDENNPEYLRERNMAPDLRQDFNMMEQKKRVSM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MNGDSRAAVVTSPPPTTAPHKERYFDRVDENNPEYLRERNMAPDLRQDFNMMEQKKRVSM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 ILQSPAFCEELESMIQEQFKKGKNPTGLLALQQIADFMTTNVPNVYPAAPQGGMAALNMS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 ILQSPAFCEELESMIQEQFKKGKNPTGLLALQQIADFMTTNVPNVYPAAPQGGMAALNMS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 LGMVTPVNDLRGSDSIAYDKGEKLLRCKLAAFYRLADLFGWSQLIYNHITTRVNSEQEHF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LGMVTPVNDLRGSDSIAYDKGEKLLRCKLAAFYRLADLFGWSQLIYNHITTRVNSEQEHF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 LIVPFGLLYSEVTASSLVKINLQGDIVDRGSTNLGVNQAGFTLHSAIYAARPDVKCVVHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LIVPFGLLYSEVTASSLVKINLQGDIVDRGSTNLGVNQAGFTLHSAIYAARPDVKCVVHI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 HTPAGAAVSAMKCGLLPISPEALSLGEVAYHDYHGILVDEEEKVLIQKNLGPKSKVLILR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 HTPAGAAVSAMKCGLLPISPEALSLGEVAYHDYHGILVDEEEKVLIQKNLGPKSKVLILR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 NHGLVSVGESVEEAFYYIHNLVVACEIQVRTLASAGGPDNLVLLNPEKYKAKSRSPGSPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 NHGLVSVGESVEEAFYYIHNLVVACEIQVRTLASAGGPDNLVLLNPEKYKAKSRSPGSPV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 GEGTGSPPKWQIGEQEFEALMRMLDNLGYRTGYPYRYPALREKSKKYSDVEVPASVTGYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 GEGTGSPPKWQIGEQEFEALMRMLDNLGYRTGYPYRYPALREKSKKYSDVEVPASVTGYS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 FASDGDSGTCSPLRHSFQKQQREKTRWLNSGRGDEASEEGQNGSSPKSKTKVWTNITHDH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 FASDGDSGTCSPLRHSFQKQQREKTRWLNSGRGDEASEEGQNGSSPKSKTKVWTNITHDH
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 VKPLLQSLSSGVCVPSCITNCLWTKEDGHRTSTSAVPNLFVPLNTNPKEVQEMRNKIREQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 VKPLLQSLSSGVCVPSCITNCLWTKEDGHRTSTSAVPNLFVPLNTNPKEVQEMRNKIREQ
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 NLQDIKTAGPQSQVLCGVVMDRSLVQGELVTASKAIIEKEYQPHVIVSTTGPNPFTTLTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 NLQDIKTAGPQSQVLCGVVMDRSLVQGELVTASKAIIEKEYQPHVIVSTTGPNPFTTLTD
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 RELEEYRREVERKQKGSEENLDEAREQKEKSPPDQPAVPHPPPSTPIKLEEDLVPEPTTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 RELEEYRREVERKQKGSEENLDEAREQKEKSPPDQPAVPHPPPSTPIKLEEDLVPEPTTG
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB3 DDSDAATFKPTLPDLSPDEPSEALGFPMLEKEEEAHRPPSPTEAPTEASPEPAPDPAPVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 DDSDAATFKPTLPDLSPDEPSEALGFPMLEKEEEAHRPPSPTEAPTEASPEPAPDPAPVA
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760
pF1KB3 EEAAPSAVEEGAAADPGSDGSPGKSPSKKKKKFRTPSFLKKSKKKSDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 EEAAPSAVEEGAAADPGSDGSPGKSPSKKKKKFRTPSFLKKSKKKSDS
730 740 750 760
>>CCDS3364.1 ADD1 gene_id:118|Hs108|chr4 (662 aa)
initn: 4336 init1: 4336 opt: 4336 Z-score: 2470.5 bits: 467.7 E(32554): 2.8e-131
Smith-Waterman score: 4336; 100.0% identity (100.0% similar) in 651 aa overlap (1-651:1-651)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MNGDSRAAVVTSPPPTTAPHKERYFDRVDENNPEYLRERNMAPDLRQDFNMMEQKKRVSM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MNGDSRAAVVTSPPPTTAPHKERYFDRVDENNPEYLRERNMAPDLRQDFNMMEQKKRVSM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 ILQSPAFCEELESMIQEQFKKGKNPTGLLALQQIADFMTTNVPNVYPAAPQGGMAALNMS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 ILQSPAFCEELESMIQEQFKKGKNPTGLLALQQIADFMTTNVPNVYPAAPQGGMAALNMS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 LGMVTPVNDLRGSDSIAYDKGEKLLRCKLAAFYRLADLFGWSQLIYNHITTRVNSEQEHF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LGMVTPVNDLRGSDSIAYDKGEKLLRCKLAAFYRLADLFGWSQLIYNHITTRVNSEQEHF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 LIVPFGLLYSEVTASSLVKINLQGDIVDRGSTNLGVNQAGFTLHSAIYAARPDVKCVVHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LIVPFGLLYSEVTASSLVKINLQGDIVDRGSTNLGVNQAGFTLHSAIYAARPDVKCVVHI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 HTPAGAAVSAMKCGLLPISPEALSLGEVAYHDYHGILVDEEEKVLIQKNLGPKSKVLILR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 HTPAGAAVSAMKCGLLPISPEALSLGEVAYHDYHGILVDEEEKVLIQKNLGPKSKVLILR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 NHGLVSVGESVEEAFYYIHNLVVACEIQVRTLASAGGPDNLVLLNPEKYKAKSRSPGSPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 NHGLVSVGESVEEAFYYIHNLVVACEIQVRTLASAGGPDNLVLLNPEKYKAKSRSPGSPV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 GEGTGSPPKWQIGEQEFEALMRMLDNLGYRTGYPYRYPALREKSKKYSDVEVPASVTGYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 GEGTGSPPKWQIGEQEFEALMRMLDNLGYRTGYPYRYPALREKSKKYSDVEVPASVTGYS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 FASDGDSGTCSPLRHSFQKQQREKTRWLNSGRGDEASEEGQNGSSPKSKTKVWTNITHDH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 FASDGDSGTCSPLRHSFQKQQREKTRWLNSGRGDEASEEGQNGSSPKSKTKVWTNITHDH
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 VKPLLQSLSSGVCVPSCITNCLWTKEDGHRTSTSAVPNLFVPLNTNPKEVQEMRNKIREQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 VKPLLQSLSSGVCVPSCITNCLWTKEDGHRTSTSAVPNLFVPLNTNPKEVQEMRNKIREQ
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 NLQDIKTAGPQSQVLCGVVMDRSLVQGELVTASKAIIEKEYQPHVIVSTTGPNPFTTLTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 NLQDIKTAGPQSQVLCGVVMDRSLVQGELVTASKAIIEKEYQPHVIVSTTGPNPFTTLTD
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 RELEEYRREVERKQKGSEENLDEAREQKEKSPPDQPAVPHPPPSTPIKLEEDLVPEPTTG
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 RELEEYRREVERKQKGSEENLDEAREQKEKSPPDQPAVPHPPPSTPIKLEEGDGCAREYL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB3 DDSDAATFKPTLPDLSPDEPSEALGFPMLEKEEEAHRPPSPTEAPTEASPEPAPDPAPVA
CCDS33 LP
>>CCDS75094.1 ADD1 gene_id:118|Hs108|chr4 (662 aa)
initn: 3599 init1: 3599 opt: 3642 Z-score: 2078.0 bits: 395.0 E(32554): 2e-109
Smith-Waterman score: 3970; 90.9% identity (90.9% similar) in 682 aa overlap (1-651:1-651)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MNGDSRAAVVTSPPPTTAPHKERYFDRVDENNPEYLRERNMAPDLRQDFNMMEQKKRVSM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 MNGDSRAAVVTSPPPTTAPHKERYFDRVDENNPEYLRERNMAPDLRQDFNMMEQKKRVSM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 ILQSPAFCEELESMIQEQFKKGKNPTGLLALQQIADFMTTNVPNVYPAAPQGGMAALNMS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 ILQSPAFCEELESMIQEQFKKGKNPTGLLALQQIADFMTTNVPNVYPAAPQGGMAALNMS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 LGMVTPVNDLRGSDSIAYDKGEKLLRCKLAAFYRLADLFGWSQLIYNHITTRVNSEQEHF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LGMVTPVNDLRGSDSIAYDKGEKLLRCKLAAFYRLADLFGWSQLIYNHITTRVNSEQEHF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 LIVPFGLLYSEVTASSLVKINLQGDIVDRGSTNLGVNQAGFTLHSAIYAARPDVKCVVHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LIVPFGLLYSEVTASSLVKINLQGDIVDRGSTNLGVNQAGFTLHSAIYAARPDVKCVVHI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 HTPAGAAVSAMKCGLLPISPEALSLGEVAYHDYHGILVDEEEKVLIQKNLGPKSKVLILR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 HTPAGAAVSAMKCGLLPISPEALSLGEVAYHDYHGILVDEEEKVLIQKNLGPKSKVLILR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 NHGLVSVGESVEEAFYYIHNLVVACEIQVRTLASAGGPDNLVLLNPEKYKAKSRSPGSPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 NHGLVSVGESVEEAFYYIHNLVVACEIQVRTLASAGGPDNLVLLNPEKYKAKSRSPGSPV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 GEGTGSPPKWQIGEQEFEALMRMLDNLGYRTGYPYRYPALREKSKKYSDVEVPASVTGYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 GEGTGSPPKWQIGEQEFEALMRMLDNLGYRTGYPYRYPALREKSKKYSDVEVPASVTGYS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 FASDGDSGTCSPLRHSFQKQQREKTRWLNSGRGDEASEEGQNGSSPKSKTKVWTNITHDH
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 FASDGDSGTCSPLRHSFQKQQREKTRWLNSGRGDEASEEGQNGSSPKSKTK---------
430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 VKPLLQSLSSGVCVPSCITNCLWTKEDGHRTSTSAVPNLFVPLNTNPKEVQEMRNKIREQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 ----------------------WTKEDGHRTSTSAVPNLFVPLNTNPKEVQEMRNKIREQ
480 490 500
550 560
pF1KB3 NLQDIKTAGPQSQVLCGVVMDRSLVQ-------------------------------GEL
:::::::::::::::::::::::::: :::
CCDS75 NLQDIKTAGPQSQVLCGVVMDRSLVQDAPLSDCTETIEGLELTEQTFSPAKSLSFRKGEL
510 520 530 540 550 560
570 580 590 600 610 620
pF1KB3 VTASKAIIEKEYQPHVIVSTTGPNPFTTLTDRELEEYRREVERKQKGSEENLDEAREQKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 VTASKAIIEKEYQPHVIVSTTGPNPFTTLTDRELEEYRREVERKQKGSEENLDEAREQKE
570 580 590 600 610 620
630 640 650 660 670 680
pF1KB3 KSPPDQPAVPHPPPSTPIKLEEDLVPEPTTGDDSDAATFKPTLPDLSPDEPSEALGFPML
::::::::::::::::::::::
CCDS75 KSPPDQPAVPHPPPSTPIKLEEGDGCAREYLLP
630 640 650 660
>>CCDS43205.1 ADD1 gene_id:118|Hs108|chr4 (737 aa)
initn: 4888 init1: 3127 opt: 3135 Z-score: 1790.7 bits: 342.0 E(32554): 2e-93
Smith-Waterman score: 4830; 96.0% identity (96.0% similar) in 768 aa overlap (1-768:1-737)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MNGDSRAAVVTSPPPTTAPHKERYFDRVDENNPEYLRERNMAPDLRQDFNMMEQKKRVSM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MNGDSRAAVVTSPPPTTAPHKERYFDRVDENNPEYLRERNMAPDLRQDFNMMEQKKRVSM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 ILQSPAFCEELESMIQEQFKKGKNPTGLLALQQIADFMTTNVPNVYPAAPQGGMAALNMS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ILQSPAFCEELESMIQEQFKKGKNPTGLLALQQIADFMTTNVPNVYPAAPQGGMAALNMS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 LGMVTPVNDLRGSDSIAYDKGEKLLRCKLAAFYRLADLFGWSQLIYNHITTRVNSEQEHF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LGMVTPVNDLRGSDSIAYDKGEKLLRCKLAAFYRLADLFGWSQLIYNHITTRVNSEQEHF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 LIVPFGLLYSEVTASSLVKINLQGDIVDRGSTNLGVNQAGFTLHSAIYAARPDVKCVVHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LIVPFGLLYSEVTASSLVKINLQGDIVDRGSTNLGVNQAGFTLHSAIYAARPDVKCVVHI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 HTPAGAAVSAMKCGLLPISPEALSLGEVAYHDYHGILVDEEEKVLIQKNLGPKSKVLILR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 HTPAGAAVSAMKCGLLPISPEALSLGEVAYHDYHGILVDEEEKVLIQKNLGPKSKVLILR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 NHGLVSVGESVEEAFYYIHNLVVACEIQVRTLASAGGPDNLVLLNPEKYKAKSRSPGSPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 NHGLVSVGESVEEAFYYIHNLVVACEIQVRTLASAGGPDNLVLLNPEKYKAKSRSPGSPV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 GEGTGSPPKWQIGEQEFEALMRMLDNLGYRTGYPYRYPALREKSKKYSDVEVPASVTGYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GEGTGSPPKWQIGEQEFEALMRMLDNLGYRTGYPYRYPALREKSKKYSDVEVPASVTGYS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 FASDGDSGTCSPLRHSFQKQQREKTRWLNSGRGDEASEEGQNGSSPKSKTKVWTNITHDH
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 FASDGDSGTCSPLRHSFQKQQREKTRWLNSGRGDEASEEGQNGSSPKSKTK---------
430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 VKPLLQSLSSGVCVPSCITNCLWTKEDGHRTSTSAVPNLFVPLNTNPKEVQEMRNKIREQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ----------------------WTKEDGHRTSTSAVPNLFVPLNTNPKEVQEMRNKIREQ
480 490 500
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 NLQDIKTAGPQSQVLCGVVMDRSLVQGELVTASKAIIEKEYQPHVIVSTTGPNPFTTLTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 NLQDIKTAGPQSQVLCGVVMDRSLVQGELVTASKAIIEKEYQPHVIVSTTGPNPFTTLTD
510 520 530 540 550 560
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 RELEEYRREVERKQKGSEENLDEAREQKEKSPPDQPAVPHPPPSTPIKLEEDLVPEPTTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RELEEYRREVERKQKGSEENLDEAREQKEKSPPDQPAVPHPPPSTPIKLEEDLVPEPTTG
570 580 590 600 610 620
670 680 690 700 710 720
pF1KB3 DDSDAATFKPTLPDLSPDEPSEALGFPMLEKEEEAHRPPSPTEAPTEASPEPAPDPAPVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 DDSDAATFKPTLPDLSPDEPSEALGFPMLEKEEEAHRPPSPTEAPTEASPEPAPDPAPVA
630 640 650 660 670 680
730 740 750 760
pF1KB3 EEAAPSAVEEGAAADPGSDGSPGKSPSKKKKKFRTPSFLKKSKKKSDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 EEAAPSAVEEGAAADPGSDGSPGKSPSKKKKKFRTPSFLKKSKKKSDS
690 700 710 720 730
>>CCDS7562.1 ADD3 gene_id:120|Hs108|chr10 (674 aa)
initn: 2095 init1: 1093 opt: 1882 Z-score: 1082.7 bits: 210.9 E(32554): 5.5e-54
Smith-Waterman score: 2218; 50.0% identity (70.9% similar) in 774 aa overlap (1-765:1-669)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MNGDSRAAVVTSPPPTTAPHKERYFDRVDENNPEYLRERNMAPDLRQDFNMMEQKKRVSM
:..:. .:.:.::: . :::::::::..::.:::.:::::.::::::::::::.:::..
CCDS75 MSSDASQGVITTPPPPSMPHKERYFDRINENDPEYIRERNMSPDLRQDFNMMEQRKRVTQ
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::::::: :.:: .::::.:::.:::::::::::::.. .: . . . : .:
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.:: . :. :::.. :.::::::::::: .. ::..:: .::..: .:
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. ..: : .:.: .: : :: :: ::::::::.:: : :
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:: ... .: . :. ..: :.: . . : . :
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::::::: :.:: .::::.:::.:::::::::::::.. .: . . . : .:
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.:: . :. :::.. :.::::::::::: .. ::..:: .::..: .:
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::::::: :.::::::::.: :.:.:. : .: : . .. : . :
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pF1KB3 PAPDPAPVAEEAAPSAVEEGAAADPGSDGSPGKSPSKKKKKFRTPSFLKKSKKKSDS
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:.: .. :::. : : : :: :::: :.:.:: :::::
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::::: ::.:.::::::.: .:. ..:
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...: ::..::.:::: : :. ::::::::.:.:. :..:..::. . :. .:: :::
CCDS54 DTYVTLRVSKEQDHFLISPKGVSCSEVTASSLIKVNILGEVVEKGSSCFPVDTTGFCLHS
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pF1KB3 AIYAARPDVKCVVHIHTPAGAAVSAMKCGLLPISPEALSLGEVAYHDYHGILVDEEEKVL
:::::::::.:..:.:::: ::::::: ::::.: .:: .:..::.:..: . .: ...
CCDS54 AIYAARPDVRCIIHLHTPATAAVSAMKWGLLPVSHNALLVGDMAYYDFNGEMEQEADRIN
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pF1KB3 IQKNLGPKSKVLILRNHGLVSVGESVEEAFYYIHNLVVACEIQVRTLASAGGPDNLVLLN
.:: ::: :.:.:::::.:..:..:::::: : .: .:::::: .:.:::: .::.::.
CCDS54 LQKCLGPTCKILVLRNHGVVALGDTVEEAFYKIFHLQAACEIQVSALSSAGGVENLILLE
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pF1KB3 PEKYKAKSRSPGSPVGEGTGSPPKWQIGEQEFEALMRMLDNLGYRTGYPYRYPALREKSK
::.. . . . .: : : ..::.:::::::::::::::::: ::.: ..::.:
CCDS54 QEKHRPHEVGSVQWAGSTFGPMQKSRLGEHEFEALMRMLDNLGYRTGYTYRHPFVQEKTK
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. :.::.::.::.. : :: . ::. ::::.:::::::. : . :.: .
CCDS54 HKSEVEIPATVTAFVFEEDG--APVPALRQHAQKQQKEKTRWLNTPNTYLRVNVADEVQR
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pF1KB3 NGSSPKSKTKVWTNITHDHVKPLLQSLSSGVCVPSCITNCLWTKEDGHRTSTSAVPNLFV
. .::. :: .: . :.: .. :::. : : : :: ::
CCDS54 SMGSPRPKT-TW--MKADEV----EKSSSGM--PIRIEN----------------PNQFV
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pF1KB3 PLNTNPKEVQEMRNKIREQNLQDIKTAGPQSQVLCGVVMDRSLVQGELVTASKAIIEKEY
:: :.:.:: :::::::::: ::.:.::::::.: .:. ..:
CCDS54 PLYTDPQEVLEMRNKIREQNRQDVKSAGPQSQLLASVIAEKSRSPVEQRLPLTGGETCLP
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pF1KB3 QPHVIVSTTGPNPFTTLTDRELEEYRREVERKQKGSEENLDEAREQKEKSPPDQPAVPHP
CCDS54 SGSSVPGAGLQDP
570
>>CCDS1909.1 ADD2 gene_id:119|Hs108|chr2 (643 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MNGDSRAAVVTSPPPTTAPHKERYFDRVDENNPEYLRERNMAPDLRQDFNMMEQKKRVSM
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CCDS19 MSEETVPEAASPPP---PQGQPYFDRFSEDDPEYMRLRNRAADLRQDFNLMEQKKRVTM
10 20 30 40 50
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pF1KB3 ILQSPAFCEELESMIQEQFKKGKNPTGLLALQQIADFMTTNVPNVYPAAPQGGMAALNMS
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CCDS19 ILQSPSFREELEGLIQEQMKKGNNSSNIWALRQIADFMASTSHAVFPTS--------SMN
60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 LGMVTPVNDLRGSDSIAYDKGEKLLRCKLAAFYRLADLFGWSQLIYNHITTRVNSEQEHF
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CCDS19 VSMMTPINDLHTADSLNLAKGERLMRCKISSVYRLLDLYGWAQLSDTYVTLRVSKEQDHF
110 120 130 140 150 160
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pF1KB3 LIVPFGLLYSEVTASSLVKINLQGDIVDRGSTNLGVNQAGFTLHSAIYAARPDVKCVVHI
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CCDS19 LISPKGVSCSEVTASSLIKVNILGEVVEKGSSCFPVDTTGFCLHSAIYAARPDVRCIIHL
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 HTPAGAAVSAMKCGLLPISPEALSLGEVAYHDYHGILVDEEEKVLIQKNLGPKSKVLILR
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CCDS19 HTPATAAVSAMKWGLLPVSHNALLVGDMAYYDFNGEMEQEADRINLQKCLGPTCKILVLR
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pF1KB3 NHGLVSVGESVEEAFYYIHNLVVACEIQVRTLASAGGPDNLVLLNPEKYKAKSRSPGSPV
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CCDS19 NHGVVALGDTVEEAFYKIFHLQAACEIQVSALSSAGGVENLILLEQEKHRPHEVGSVQWA
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]