Result of FASTA (ccds) for
pF1KB3654
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3654, 1029 aa
1>>>pF1KB3654 1029 - 1029 aa - 1029 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.8070+/-0.00192; mu= 16.6340+/- 0.116
mean_var=305.0218+/-55.867, 0's: 0 Z-trim(106.4): 959 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.073436
statistics sampled from 7925 (8976) to 7925 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.597), E-opt: 0.2 (0.276), width: 16
Scan time: 3.270
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS2717.1 ZNF197 gene_id:10168|Hs108|chr3 (1029) 7223 781.2 0
CCDS74350.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1058) 2675 299.4 2.7e-80
CCDS59379.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1090) 2675 299.4 2.7e-80
CCDS45012.1 ZNF268 gene_id:10795|Hs108|chr12 ( 947) 2615 292.9 2.1e-78
CCDS46170.1 ZNF845 gene_id:91664|Hs108|chr19 ( 970) 2599 291.3 6.9e-78
CCDS46991.1 ZNF721 gene_id:170960|Hs108|chr4 ( 923) 2578 289.0 3.1e-77
CCDS74322.1 ZNF91 gene_id:7644|Hs108|chr19 (1159) 2550 286.2 2.7e-76
CCDS42541.1 ZNF91 gene_id:7644|Hs108|chr19 (1191) 2550 286.2 2.8e-76
CCDS47357.2 ZFP62 gene_id:643836|Hs108|chr5 ( 867) 2525 283.3 1.5e-75
CCDS54955.1 ZFP62 gene_id:643836|Hs108|chr5 ( 900) 2525 283.4 1.5e-75
CCDS46162.1 ZNF836 gene_id:162962|Hs108|chr19 ( 936) 2520 282.9 2.2e-75
CCDS54240.1 ZNF208 gene_id:7757|Hs108|chr19 (1280) 2521 283.2 2.4e-75
CCDS82391.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 782) 2499 280.5 9.5e-75
CCDS12859.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 818) 2499 280.5 9.7e-75
CCDS46167.1 ZNF808 gene_id:388558|Hs108|chr19 ( 903) 2494 280.1 1.5e-74
CCDS12500.1 ZNF585B gene_id:92285|Hs108|chr19 ( 769) 2490 279.5 1.8e-74
CCDS74353.1 ZNF585A gene_id:199704|Hs108|chr19 ( 769) 2486 279.1 2.5e-74
CCDS12499.1 ZNF585A gene_id:199704|Hs108|chr19 ( 714) 2479 278.3 4e-74
CCDS82388.1 ZNF841 gene_id:284371|Hs108|chr19 ( 808) 2478 278.3 4.5e-74
CCDS46161.1 ZNF841 gene_id:284371|Hs108|chr19 ( 924) 2478 278.4 4.8e-74
CCDS11180.1 ZNF624 gene_id:57547|Hs108|chr17 ( 865) 2476 278.1 5.4e-74
CCDS77297.1 ZNF546 gene_id:339327|Hs108|chr19 ( 810) 2450 275.3 3.5e-73
CCDS12548.1 ZNF546 gene_id:339327|Hs108|chr19 ( 836) 2450 275.4 3.6e-73
CCDS59368.1 ZNF729 gene_id:100287226|Hs108|chr19 (1252) 2450 275.6 4.4e-73
CCDS33090.1 ZNF616 gene_id:90317|Hs108|chr19 ( 781) 2428 273.0 1.8e-72
CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 ( 688) 2421 272.1 2.7e-72
CCDS33097.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 839) 2401 270.2 1.3e-71
CCDS54314.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 840) 2401 270.2 1.3e-71
CCDS46077.1 ZNF780B gene_id:163131|Hs108|chr19 ( 833) 2394 269.4 2.2e-71
CCDS5527.1 ZNF107 gene_id:51427|Hs108|chr7 ( 783) 2391 269.1 2.7e-71
CCDS75606.1 ZNF107 gene_id:51427|Hs108|chr7 ( 820) 2391 269.1 2.7e-71
CCDS75605.1 ZNF107 gene_id:51427|Hs108|chr7 ( 852) 2391 269.1 2.8e-71
CCDS59367.1 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 803) 2388 268.8 3.3e-71
CCDS12413.2 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 809) 2388 268.8 3.4e-71
CCDS74321.1 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 818) 2388 268.8 3.4e-71
CCDS75846.1 ZNF658 gene_id:26149|Hs108|chr9 (1059) 2357 265.7 3.7e-70
CCDS46212.1 ZNF814 gene_id:730051|Hs108|chr19 ( 855) 2330 262.7 2.4e-69
CCDS4624.1 ZNF184 gene_id:7738|Hs108|chr6 ( 751) 2311 260.6 9.2e-69
CCDS59369.1 ZNF99 gene_id:7652|Hs108|chr19 ( 864) 2267 256.0 2.5e-67
CCDS54259.1 ZNF607 gene_id:84775|Hs108|chr19 ( 695) 2257 254.8 4.7e-67
CCDS33006.1 ZNF607 gene_id:84775|Hs108|chr19 ( 696) 2257 254.8 4.7e-67
CCDS46169.1 ZNF665 gene_id:79788|Hs108|chr19 ( 678) 2254 254.4 5.8e-67
CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12 ( 738) 2228 251.7 4.1e-66
CCDS62706.1 ZNF229 gene_id:7772|Hs108|chr19 ( 819) 2174 246.1 2.3e-64
CCDS42574.1 ZNF229 gene_id:7772|Hs108|chr19 ( 825) 2174 246.1 2.3e-64
CCDS59418.1 ZNF615 gene_id:284370|Hs108|chr19 ( 742) 2172 245.8 2.5e-64
CCDS33046.1 ZNF224 gene_id:7767|Hs108|chr19 ( 707) 2155 244.0 8.5e-64
CCDS12856.1 ZNF600 gene_id:162966|Hs108|chr19 ( 722) 2135 241.9 3.7e-63
CCDS82341.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 527) 2130 241.1 4.6e-63
CCDS46102.1 ZNF226 gene_id:7769|Hs108|chr19 ( 803) 2132 241.6 4.9e-63
>>CCDS2717.1 ZNF197 gene_id:10168|Hs108|chr3 (1029 aa)
initn: 7223 init1: 7223 opt: 7223 Z-score: 4159.2 bits: 781.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7223; 100.0% identity (100.0% similar) in 1029 aa overlap (1-1029:1-1029)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MTRENVAHNALRQEGLVKGKDDTWKWGTSFQGSSSSVWETSHLHFRQLRYHETSGPQEAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 MTRENVAHNALRQEGLVKGKDDTWKWGTSFQGSSSSVWETSHLHFRQLRYHETSGPQEAL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 SRLRELCRRWLRPEARTKAQILELLVLEQFLSILPGEIRTWVQLHHPGSGEEAVALVEEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 SRLRELCRRWLRPEARTKAQILELLVLEQFLSILPGEIRTWVQLHHPGSGEEAVALVEEL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 QKDLDGPAIQVPVLVKDQDTLQKVVSAPGTTLPPVLPGSHIAAEICPHPPTDLVAFNLQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 QKDLDGPAIQVPVLVKDQDTLQKVVSAPGTTLPPVLPGSHIAAEICPHPPTDLVAFNLQD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 PQHDSPAPEASALSQEENPRNQLMALMLLTAQPQELVMFEEVSVCFTSEEWACLGPIQRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 PQHDSPAPEASALSQEENPRNQLMALMLLTAQPQELVMFEEVSVCFTSEEWACLGPIQRA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 LYWDVMLENYGNVTSLEWETMTENEEVTSKPSSSQRADSHKGTSKRLQGSVPQVLDFEEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 LYWDVMLENYGNVTSLEWETMTENEEVTSKPSSSQRADSHKGTSKRLQGSVPQVLDFEEE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 CEWQVLASQWGNETDERADTVKKVSLCERDKKKRTPPEKQGQKWKELGDSLTFGSAISES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 CEWQVLASQWGNETDERADTVKKVSLCERDKKKRTPPEKQGQKWKELGDSLTFGSAISES
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 LIGTEGKKFYKCDMCCKHFNKISHLINHRRIHTGEKPHKCKECGKGFIQRSSLLMHLRNH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 LIGTEGKKFYKCDMCCKHFNKISHLINHRRIHTGEKPHKCKECGKGFIQRSSLLMHLRNH
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 SGEKPYKCNECGKAFSQSAYLLNHQRIHTGEKPYKCKECGKGFYRHSGLIIHLRRHSGER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 SGEKPYKCNECGKAFSQSAYLLNHQRIHTGEKPYKCKECGKGFYRHSGLIIHLRRHSGER
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 PYKCNECGKVFSQNAYLIDHQRLHKGEEPYKCNKCQKAFILKKSLILHQRIHSGEKPYKC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 PYKCNECGKVFSQNAYLIDHQRLHKGEEPYKCNKCQKAFILKKSLILHQRIHSGEKPYKC
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 DECGKTFAQTTYLIDHQRLHSAENPYKCKECGKVFIRSKSLLLHQRVHTEKKTFGCKKCG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 DECGKTFAQTTYLIDHQRLHSAENPYKCKECGKVFIRSKSLLLHQRVHTEKKTFGCKKCG
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 KIFSSKSNFIDHKRMHSREKPYKCTECGKAFTQSAYLFDHQRLHNGEKPYECNECGKVFI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 KIFSSKSNFIDHKRMHSREKPYKCTECGKAFTQSAYLFDHQRLHNGEKPYECNECGKVFI
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB3 LKKSLILHQRFHTGENLYECKDCGKVFGSNRNLIDHERLHNGEKPYECRECGKTFIMSKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 LKKSLILHQRFHTGENLYECKDCGKVFGSNRNLIDHERLHNGEKPYECRECGKTFIMSKS
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB3 FMVHQKLHTQEKAYKCEDCGKAFSYNSSLLVHRRIHTGEKPFECSECGRAFSSNRNLIEH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 FMVHQKLHTQEKAYKCEDCGKAFSYNSSLLVHRRIHTGEKPFECSECGRAFSSNRNLIEH
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB3 KRIHSGEKPYECDECGKCFILKKSLIGHQRIHTREKSYKCNDCGKVFSYRSNLIAHQRIH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 KRIHSGEKPYECDECGKCFILKKSLIGHQRIHTREKSYKCNDCGKVFSYRSNLIAHQRIH
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB3 TGEKPYACSECGKGFTYNRNLIEHQRIHSGEKTYECHVCRKVLTSSRNLMVHQRIHTGEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 TGEKPYACSECGKGFTYNRNLIEHQRIHSGEKTYECHVCRKVLTSSRNLMVHQRIHTGEK
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB3 PYKCNECGKDFSQNKNLVVHQRMHTGEKPYECDKCRKSFTSKRNLVGHQRIHTGEKPYGC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 PYKCNECGKDFSQNKNLVVHQRMHTGEKPYECDKCRKSFTSKRNLVGHQRIHTGEKPYGC
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB3 NDCSKVFRQRKNLTVHQKIHTDEKPCECDVSEKEFSQTSNLHLQQKIHTIEEFSWLQNTN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS27 NDCSKVFRQRKNLTVHQKIHTDEKPCECDVSEKEFSQTSNLHLQQKIHTIEEFSWLQNTN
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB3 ESKIEIQKI
:::::::::
CCDS27 ESKIEIQKI
>>CCDS74350.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1058 aa)
initn: 18495 init1: 2675 opt: 2675 Z-score: 1555.0 bits: 299.4 E(32554): 2.7e-80
Smith-Waterman score: 2731; 47.6% identity (74.3% similar) in 809 aa overlap (216-1012:6-807)
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 PAPEASALSQEENPRNQLMALMLLTAQPQELVMFEEVSVCFTSEEWACLGPIQRALYWDV
::::...:. :..::: :: :. :: ::
CCDS74 MNMEGLVMFQDLSIDFSQEEWECLDAAQKDLYRDV
10 20 30
250 260 270 280 290
pF1KB3 MLENYGNVTSLEWETMTENEEVTSKP------SSSQRADSHKGTSKRLQGSVPQVLDFEE
:.:::....::. : .... . : .::: . .: : : :: .: : .
CCDS74 MMENYSSLVSLDSEFRCKTKD-SCLPKEIYEVTSSQWVRMEKCHS--LVGS--SVRD-DW
40 50 60 70 80
300 310 320 330 340 350
pF1KB3 ECEWQVLASQWGNETD-ERADTVKKVS--LCERDK---KKRTPPEKQGQKWKELGDSLTF
::. : .. ..: :.: . ... .: . . ..: : .. : : .. .
CCDS74 ECKGQFQHQDINQERYLEKAIMTYETTPTFCLQTSLTLHHRIHPGEKLYKSTECM-AFKY
90 100 110 120 130 140
360 370 380 390 400 410
pF1KB3 GSAISESLIGTEGKKFYKCDMCCKHFNKISHLINHRRIHTGEKPHKCKECGKGFIQRSSL
:: .... :.:.::: : : :...:.:..:.:::::::: ::: ::.::. : :
CCDS74 GSELTQQQETHTGEKLYKCKECGKAFHHFSYLVKHQRIHTGEKPCACKEYGKAFISGSHL
150 160 170 180 190 200
420 430 440 450 460 470
pF1KB3 LMHLRNHSGEKPYKCNECGKAFSQSAYLLNHQRIHTGEKPYKCKECGKGFYRHSGLIIHL
..: . .. :.:..:.: ::: ::.:..: :::::.:::.::::::.: : : :
CCDS74 IQHQKMYTDERPHECQESVKAFRPSAHLIQHWRIHTGDKPYECKECGKSFTSGSTLNQHQ
210 220 230 240 250 260
480 490 500 510 520 530
pF1KB3 RRHSGERPYKCNECGKVFSQNAYLIDHQRLHKGEEPYKCNKCQKAFILKKSLILHQRIHS
. :.::.::.:..::: :. .. :: ::..: ::.:: :..: :.: ..:: :::::.
CCDS74 QIHTGEKPYHCKQCGKSFTVGSTLIRHQQIHTGEKPYDCKECGKSFASGSALIRHQRIHT
270 280 290 300 310 320
540 550 560 570 580 590
pF1KB3 GEKPYKCDECGKTFAQTTYLIDHQRLHSAENPYKCKECGKVFIRSKSLLLHQRVHTEKKT
::::: : ::::.:. . :: :::.:..:.:: :::::: : ..:. :: .:: .:
CCDS74 GEKPYDCKECGKSFTFHSALIRHQRIHTGEKPYDCKECGKSFTFRSGLIGHQAIHTGEKP
330 340 350 360 370 380
600 610 620 630 640 650
pF1KB3 FGCKKCGKIFSSKSNFIDHKRMHSREKPYKCTECGKAFTQSAYLFDHQRLHNGEKPYECN
. ::.::: :.. :..:.:.:.:. :::: : ::::.:.... :..:::.:.::::: :.
CCDS74 YDCKECGKSFTAGSTLIQHQRIHTGEKPYDCKECGKSFASGSALLQHQRIHTGEKPYCCK
390 400 410 420 430 440
660 670 680 690 700 710
pF1KB3 ECGKVFILKKSLILHQRFHTGENLYECKDCGKVFGSNRNLIDHERLHNGEKPYECRECGK
:::: : .... :::.::::. :.::.::: :.:. :..:.:.:.:::::.:.::::
CCDS74 ECGKSFTFRSTRNRHQRIHTGEKPYNCKECGKSFASGSALLQHQRIHTGEKPYHCKECGK
450 460 470 480 490 500
720 730 740 750 760 770
pF1KB3 TFIMSKSFMVHQKLHTQEKAYKCEDCGKAFSYNSSLLVHRRIHTGEKPFECSECGRAFSS
.: . .... :: .:: :: : :..:::.:. :.:. :.::::::::..:.:::..:.
CCDS74 SFTFRSGLIGHQAVHTGEKPYDCKECGKSFTSRSALIQHQRIHTGEKPYHCKECGKSFTV
510 520 530 540 550 560
780 790 800 810 820 830
pF1KB3 NRNLIEHKRIHSGEKPYECDECGKCFILKKSLIGHQRIHTREKSYKCNDCGKVFSYRSNL
. .:..:..::.:::::.: :::: : :. : ::.::: :: :.:..:::.: :.:
CCDS74 GSTLLQHQQIHTGEKPYDCKECGKAFRLRLRLTQHQQIHTGEKPYQCQECGKAFVSVSGL
570 580 590 600 610 620
840 850 860 870 880 890
pF1KB3 IAHQRIHTGEKPYACSECGKGFTYNRNLIEHQRIHSGEKTYECHVCRKVLTSSRNLMVHQ
:.::::::::: : .:::.: : .:.:::.::: :::. : : .: .:. ::
CCDS74 TQHHRIHTGEKPYECPDCGKAFRQRTYLNQHRRIHTGEKPYECKECGKSFTFCSGLIQHQ
630 640 650 660 670 680
900 910 920 930 940 950
pF1KB3 RIHTGEKPYKCNECGKDFSQNKNLVVHQRMHTGEKPYECDKCRKSFTSKRNLVGHQRIHT
. :: :::: .::::.:.....:. ::..:::::::.: .: :::::. .:. ::.:::
CCDS74 QNHTDEKPYDGKECGKSFTSHSTLIQHQQIHTGEKPYDCKECGKSFTSHSTLIQHQQIHT
690 700 710 720 730 740
960 970 980 990 1000 1010
pF1KB3 GEKPYGCNDCSKVFRQRKNLTVHQKIHTDEKPCECDVSEKEFSQTSNLHLQQKIHTIEEF
::: : :..:.: : ....: :: .:: ::: .: : :. : : .. .:: :.
CCDS74 GEKLYDCKECGKSFTSHSTLIQHQPLHTGEKPYHCKECGKSFTLRSALIQHRPVHTGEKR
750 760 770 780 790 800
1020
pF1KB3 SWLQNTNESKIEIQKI
CCDS74 YSCKECGKSFTSRSTLIEHQRIHTGEKPYHCKECGKSFAFRSAIIQHRRIHTGEKPYDCK
810 820 830 840 850 860
>--
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CCDS46 HLPELHMFQTEGKIGNQVEKSINSASLVSTSQRISCRPKTHISKNYGNNFLNSSLLTQKQ
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CCDS46 EVHMREKSFQCNESGKAFNYSSVLRKHQIIHLGAKQYKCDVCGKVFNQKRYLACHRRCHT
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CCDS46 ECSRTFSRKSSLTRHRRLHTGEKPYKCNDCGKTFSQMSSLVYHRRLHTGEKPYKCEECDE
390 400 410 420 430 440
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pF1KB3 IFSSKSNFIDHKRMHSREKPYKCTECGKAFTQSAYLFDHQRLHNGEKPYECNECGKVFIL
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CCDS46 AFSFKSNLERHRRIHTGEKPYKCNDCGKTFSQTSSLVYHRRLHTGEKPYKCEECDEAFSF
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CCDS46 KSNLERHRIIHTGEKLYKCNECGKTFSRKSSLTRHCRLHTGEKPYQCNECGKAFRGQSAL
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CCDS46 IYHQAIHGIGKLYKCNDCHQVFSNATTIANHWRIHNEERSYKCNRCGKFFRHRSYLAVHW
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pF1KB3 RIHTGEKPFECSECGRAFSSNRNLIEHKRIHSGEKPYECDECGKCFILKKSLIGHQRIHT
: :.::::..: :: .::: . :: .:.:::.:::::.:.:::: : :. : :.:.::
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:: ::::.:::.:. : :: :. :::::::: :.::::.:. . .: : :.:.:::
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:.:. : ::.. . .: :.:::::::::::. : : :.....:. : :.:::::::.:.
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.: :.: . :: :. ::.::::: ::.:.:.::. . : .:. ::: ::: .:. :
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:.. .:: ....:: :.
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.::::.::::.:.... : :.:.: :.:: :. .:: :. .: ...::.:.::::
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1020
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:: ..:. . . . .: .. : :. . .: .. :: :.:
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: .:. : . :: .::.::::.:. :.: : : :.:::::::.:::::::.:. : .:
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:.: . .: :. .: :.: :.:.::::.: :.:. .:. .:: ::.::::.:::::
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::
CCDS74 HTITPVIPLLWEAEAGGSRGQEMETILANTVKPLLY
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CCDS42 IHAGEKLYKCEECGKAFNRSSNLTIHKFIHTGEKPYKCEECGKAFNWSSSLTKHKRFHTR
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CCDS42 KFEECGKAFRQSLTLNKHKIIHSREKPYKCKECGKAFKQFSTLTTHKIIHAGKKLYKCEE
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CCDS42 CGKAFNHSSSLSTHKIIHTGEKSYKCEECGKAFLWSSTLRRHKRIHTGEKPYKCEECGKA
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CCDS42 FSHSSALAKHKRIHTGEKPYKCKECGKAFSNSSTLANHKITHTEEKPYKCKECDKTFKRL
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CCDS42 STLTKHKIIHAGEKLYKCEECGKAFNRSSNLTIHKFIHTGEKPYKCEECGKAFNWSSSLT
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CCDS42 KHKRIHTREKPFKCKECGKAFIWSSTLTRHKRIHTGEKPYKCEECGKAFSRSSTLTKHKT
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CCDS42 IHTGEKPYKCKECGKAFKHSSALAKHKIIHAGEKLYKCEECGKAFNQSSNLTTHKIIHTK
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CCDS42 KCEECGKAFSQSSTLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKAFRKSSTLTEHKIIHTGEKPYKCEE
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:.:.: : ..:: : ..:: ::: .:. : :...:.: .. ::: :.
CCDS42 CGKAFSQSSTLTRHTRMHTGEKPYKCEECGKAFNRSSKLTTHKIIHTGEKPYKCEECGKA
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pF1KB3 KIEIQKI
CCDS42 FISSSTLNGHKRIHTREKPYKCEECGKAFSQSSTLTRHKRLHTGEKPYKCGECGKAFKES
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CCDS54 AKSTANIKTEQEGEASEKSLHLS-PQHITHQT-----MPIGQRGSEQGKRVENINGTSY-
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]