FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB3761, 1068 aa 1>>>pF1KB3761 1068 - 1068 aa - 1068 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.7820+/-0.00107; mu= 13.8528+/- 0.064 mean_var=79.8799+/-16.248, 0's: 0 Z-trim(104.2): 24 B-trim: 223 in 1/50 Lambda= 0.143501 statistics sampled from 7755 (7761) to 7755 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.593), E-opt: 0.2 (0.238), width: 16 Scan time: 4.710 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS13289.1 RBL1 gene_id:5933|Hs108|chr20 (1068) 7085 1477.2 0 CCDS13290.1 RBL1 gene_id:5933|Hs108|chr20 (1014) 6727 1403.0 0 CCDS10748.1 RBL2 gene_id:5934|Hs108|chr16 (1139) 2568 542.0 2.7e-153 CCDS31973.1 RB1 gene_id:5925|Hs108|chr13 ( 928) 346 82.0 6.7e-15 >>CCDS13289.1 RBL1 gene_id:5933|Hs108|chr20 (1068 aa) initn: 7085 init1: 7085 opt: 7085 Z-score: 7920.0 bits: 1477.2 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 7085; 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