Result of FASTA (omim) for pF1KB3769
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB3769, 639 aa
  1>>>pF1KB3769 639 - 639 aa - 639 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.7750+/-0.000431; mu= 13.5633+/- 0.027
 mean_var=130.9884+/-25.656, 0's: 0 Z-trim(114.0): 34  B-trim: 40 in 1/52
 Lambda= 0.112062
 statistics sampled from 23536 (23570) to 23536 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.611), E-opt: 0.2 (0.276), width:  16
 Scan time:  7.240

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_068814 (OMIM: 140560) heat shock-related 70 kDa ( 639) 4119 678.0 2.8e-194
XP_011541100 (OMIM: 600816) PREDICTED: heat shock  ( 646) 3590 592.5 1.6e-168
NP_006588 (OMIM: 600816) heat shock cognate 71 kDa ( 646) 3590 592.5 1.6e-168
NP_005337 (OMIM: 603012) heat shock 70 kDa protein ( 641) 3509 579.4 1.4e-164
NP_005336 (OMIM: 140550) heat shock 70 kDa protein ( 641) 3509 579.4 1.4e-164
NP_005518 (OMIM: 140559) heat shock 70 kDa protein ( 641) 3444 568.9  2e-161
NP_002146 (OMIM: 140555) heat shock 70 kDa protein ( 643) 3341 552.2 2.1e-156
NP_694881 (OMIM: 600816) heat shock cognate 71 kDa ( 493) 2739 454.8 3.3e-127
NP_005338 (OMIM: 138120) 78 kDa glucose-regulated  ( 654) 2596 431.8 3.8e-120
NP_004125 (OMIM: 182170,600548,616854) stress-70 p ( 679) 1923 323.0 2.2e-87
NP_057383 (OMIM: 610369) heat shock 70 kDa protein ( 509) 1094 188.8 3.9e-47
NP_002145 (OMIM: 601113) heat shock 70 kDa protein ( 840)  944 164.8 1.1e-39
XP_016875852 (OMIM: 610703) PREDICTED: heat shock  ( 807)  899 157.5 1.7e-37
NP_001273432 (OMIM: 610703) heat shock protein 105 ( 814)  899 157.5 1.7e-37
XP_016875850 (OMIM: 610703) PREDICTED: heat shock  ( 851)  897 157.2 2.2e-37
NP_006635 (OMIM: 610703) heat shock protein 105 kD ( 858)  897 157.2 2.3e-37
XP_016875851 (OMIM: 610703) PREDICTED: heat shock  ( 809)  815 143.9 2.1e-33
XP_005266293 (OMIM: 610703) PREDICTED: heat shock  ( 816)  815 143.9 2.1e-33
XP_011533189 (OMIM: 610703) PREDICTED: heat shock  ( 853)  813 143.6 2.8e-33
NP_001273433 (OMIM: 610703) heat shock protein 105 ( 860)  813 143.6 2.8e-33
NP_008879 (OMIM: 601100) heat shock 70 kDa protein ( 471)  709 126.6   2e-28
XP_016875853 (OMIM: 610703) PREDICTED: heat shock  ( 736)  468 87.8 1.5e-16
XP_011533190 (OMIM: 610703) PREDICTED: heat shock  ( 780)  442 83.6 2.9e-15
NP_001273434 (OMIM: 610703) heat shock protein 105 ( 782)  442 83.6 2.9e-15
XP_016872585 (OMIM: 601746) PREDICTED: hypoxia up- ( 999)  390 75.3 1.2e-12
NP_001124463 (OMIM: 601746) hypoxia up-regulated p ( 999)  390 75.3 1.2e-12
XP_016872586 (OMIM: 601746) PREDICTED: hypoxia up- ( 999)  390 75.3 1.2e-12
NP_006380 (OMIM: 601746) hypoxia up-regulated prot ( 999)  390 75.3 1.2e-12
XP_005271449 (OMIM: 601746) PREDICTED: hypoxia up- (1000)  390 75.3 1.2e-12
XP_005271450 (OMIM: 601746) PREDICTED: hypoxia up- (1000)  390 75.3 1.2e-12
XP_005271451 (OMIM: 601746) PREDICTED: hypoxia up- (1000)  390 75.3 1.2e-12
XP_016872584 (OMIM: 601746) PREDICTED: hypoxia up- (1000)  390 75.3 1.2e-12
NP_001265134 (OMIM: 610369) heat shock 70 kDa prot ( 143)  234 49.4 1.1e-05
XP_016864924 (OMIM: 609963) PREDICTED: chondroitin ( 449)  221 47.7 0.00011


>>NP_068814 (OMIM: 140560) heat shock-related 70 kDa pro  (639 aa)
 initn: 4119 init1: 4119 opt: 4119  Z-score: 3608.9  bits: 678.0 E(85289): 2.8e-194
Smith-Waterman score: 4119; 100.0% identity (100.0% similar) in 639 aa overlap (1-639:1-639)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MSARGPAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_068 MSARGPAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 AMNPTNTIFDAKRLIGRKFEDATVQSDMKHWPFRVVSEGGKPKVQVEYKGETKTFFPEEI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_068 AMNPTNTIFDAKRLIGRKFEDATVQSDMKHWPFRVVSEGGKPKVQVEYKGETKTFFPEEI
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 SSMVLTKMKEIAEAYLGGKVHSAVITVPAYFNDSQRQATKDAGTITGLNVLRIINEPTAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_068 SSMVLTKMKEIAEAYLGGKVHSAVITVPAYFNDSQRQATKDAGTITGLNVLRIINEPTAA
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 AIAYGLDKKGCAGGEKNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_068 AIAYGLDKKGCAGGEKNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRM
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 VSHLAEEFKRKHKKDIGPNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGVDFYTSI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_068 VSHLAEEFKRKHKKDIGPNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGVDFYTSI
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB3 TRARFEELNADLFRGTLEPVEKALRDAKLDKGQIQEIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_068 TRARFEELNADLFRGTLEPVEKALRDAKLDKGQIQEIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGK
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB3 ELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILIGDKSENVQDLLLLDVTPLSLGIETAGGVMTPLIKRN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_068 ELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILIGDKSENVQDLLLLDVTPLSLGIETAGGVMTPLIKRN
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB3 TTIPTKQTQTFTTYSDNQSSVLVQVYEGERAMTKDNNLLGKFDLTGIPPAPRGVPQIEVT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_068 TTIPTKQTQTFTTYSDNQSSVLVQVYEGERAMTKDNNLLGKFDLTGIPPAPRGVPQIEVT
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB3 FDIDANGILNVTAADKSTGKENKITITNDKGRLSKDDIDRMVQEAERYKSEDEANRDRVA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_068 FDIDANGILNVTAADKSTGKENKITITNDKGRLSKDDIDRMVQEAERYKSEDEANRDRVA
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB3 AKNALESYTYNIKQTVEDEKLRGKISEQDKNKILDKCQEVINWLDRNQMAEKDEYEHKQK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_068 AKNALESYTYNIKQTVEDEKLRGKISEQDKNKILDKCQEVINWLDRNQMAEKDEYEHKQK
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630         
pF1KB3 ELERVCNPIISKLYQGGPGGGSGGGGSGASGGPTIEEVD
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_068 ELERVCNPIISKLYQGGPGGGSGGGGSGASGGPTIEEVD
              610       620       630         

>>XP_011541100 (OMIM: 600816) PREDICTED: heat shock cogn  (646 aa)
 initn: 3686 init1: 2468 opt: 3590  Z-score: 3146.6  bits: 592.5 E(85289): 1.6e-168
Smith-Waterman score: 3624; 86.6% identity (95.8% similar) in 647 aa overlap (3-639:2-646)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MSARGPAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQV
         ..:::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011  MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQV
                10        20        30        40        50         

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 AMNPTNTIFDAKRLIGRKFEDATVQSDMKHWPFRVVSEGGKPKVQVEYKGETKTFFPEEI
       :::::::.:::::::::.:.::.:::::::::: ::...:.::::::::::::.:.:::.
XP_011 AMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEV
      60        70        80        90       100       110         

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 SSMVLTKMKEIAEAYLGGKVHSAVITVPAYFNDSQRQATKDAGTITGLNVLRIINEPTAA
       :::::::::::::::::  : .::.::::::::::::::::::::.::::::::::::::
XP_011 SSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAA
     120       130       140       150       160       170         

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 AIAYGLDKKGCAGGEKNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRM
       :::::::::  .:.:.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AIAYGLDKK--VGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRM
     180         190       200       210       220       230       

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 VSHLAEEFKRKHKKDIGPNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGVDFYTSI
       :.:.  ::::::::::. :::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::
XP_011 VNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSI
       240       250       260       270       280       290       

              310       320       330       340       350       360
pF1KB3 TRARFEELNADLFRGTLEPVEKALRDAKLDKGQIQEIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGK
       :::::::::::::::::.:::::::::::::.::..::::::::::::::::::::::::
XP_011 TRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGK
       300       310       320       330       340       350       

              370       380       390       400       410       420
pF1KB3 ELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILIGDKSENVQDLLLLDVTPLSLGIETAGGVMTPLIKRN
       ::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::: :::::
XP_011 ELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILSGDKSENVQDLLLLDVTPLSLGIETAGGVMTVLIKRN
       360       370       380       390       400       410       

              430       440       450       460       470       480
pF1KB3 TTIPTKQTQTFTTYSDNQSSVLVQVYEGERAMTKDNNLLGKFDLTGIPPAPRGVPQIEVT
       :::::::::::::::::: .::.:::::::::::::::::::.:::::::::::::::::
XP_011 TTIPTKQTQTFTTYSDNQPGVLIQVYEGERAMTKDNNLLGKFELTGIPPAPRGVPQIEVT
       420       430       440       450       460       470       

              490       500       510       520       530       540
pF1KB3 FDIDANGILNVTAADKSTGKENKITITNDKGRLSKDDIDRMVQEAERYKSEDEANRDRVA
       :::::::::::.:.:::::::::::::::::::::.::.:::::::.::.::: .::.:.
XP_011 FDIDANGILNVSAVDKSTGKENKITITNDKGRLSKEDIERMVQEAEKYKAEDEKQRDKVS
       480       490       500       510       520       530       

              550       560       570       580       590       600
pF1KB3 AKNALESYTYNIKQTVEDEKLRGKISEQDKNKILDKCQEVINWLDRNQMAEKDEYEHKQK
       .::.::::..:.: :::::::.:::...::.::::::.:.:::::.:: :::.:.::.::
XP_011 SKNSLESYAFNMKATVEDEKLQGKINDEDKQKILDKCNEIINWLDKNQTAEKEEFEHQQK
       540       550       560       570       580       590       

              610          620              630         
pF1KB3 ELERVCNPIISKLYQ--GG-PGGGSGG---GGS----GASGGPTIEEVD
       :::.::::::.::::  :: :::  ::   ::.    :::.::::::::
XP_011 ELEKVCNPIITKLYQSAGGMPGGMPGGFPGGGAPPSGGASSGPTIEEVD
       600       610       620       630       640      

>>NP_006588 (OMIM: 600816) heat shock cognate 71 kDa pro  (646 aa)
 initn: 3686 init1: 2468 opt: 3590  Z-score: 3146.6  bits: 592.5 E(85289): 1.6e-168
Smith-Waterman score: 3624; 86.6% identity (95.8% similar) in 647 aa overlap (3-639:2-646)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MSARGPAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQV
         ..:::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006  MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQV
                10        20        30        40        50         

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 AMNPTNTIFDAKRLIGRKFEDATVQSDMKHWPFRVVSEGGKPKVQVEYKGETKTFFPEEI
       :::::::.:::::::::.:.::.:::::::::: ::...:.::::::::::::.:.:::.
NP_006 AMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEV
      60        70        80        90       100       110         

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 SSMVLTKMKEIAEAYLGGKVHSAVITVPAYFNDSQRQATKDAGTITGLNVLRIINEPTAA
       :::::::::::::::::  : .::.::::::::::::::::::::.::::::::::::::
NP_006 SSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAA
     120       130       140       150       160       170         

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 AIAYGLDKKGCAGGEKNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRM
       :::::::::  .:.:.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 AIAYGLDKK--VGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRM
     180         190       200       210       220       230       

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 VSHLAEEFKRKHKKDIGPNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGVDFYTSI
       :.:.  ::::::::::. :::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::
NP_006 VNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSI
       240       250       260       270       280       290       

              310       320       330       340       350       360
pF1KB3 TRARFEELNADLFRGTLEPVEKALRDAKLDKGQIQEIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGK
       :::::::::::::::::.:::::::::::::.::..::::::::::::::::::::::::
NP_006 TRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGK
       300       310       320       330       340       350       

              370       380       390       400       410       420
pF1KB3 ELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILIGDKSENVQDLLLLDVTPLSLGIETAGGVMTPLIKRN
       ::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::: :::::
NP_006 ELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILSGDKSENVQDLLLLDVTPLSLGIETAGGVMTVLIKRN
       360       370       380       390       400       410       

              430       440       450       460       470       480
pF1KB3 TTIPTKQTQTFTTYSDNQSSVLVQVYEGERAMTKDNNLLGKFDLTGIPPAPRGVPQIEVT
       :::::::::::::::::: .::.:::::::::::::::::::.:::::::::::::::::
NP_006 TTIPTKQTQTFTTYSDNQPGVLIQVYEGERAMTKDNNLLGKFELTGIPPAPRGVPQIEVT
       420       430       440       450       460       470       

              490       500       510       520       530       540
pF1KB3 FDIDANGILNVTAADKSTGKENKITITNDKGRLSKDDIDRMVQEAERYKSEDEANRDRVA
       :::::::::::.:.:::::::::::::::::::::.::.:::::::.::.::: .::.:.
NP_006 FDIDANGILNVSAVDKSTGKENKITITNDKGRLSKEDIERMVQEAEKYKAEDEKQRDKVS
       480       490       500       510       520       530       

              550       560       570       580       590       600
pF1KB3 AKNALESYTYNIKQTVEDEKLRGKISEQDKNKILDKCQEVINWLDRNQMAEKDEYEHKQK
       .::.::::..:.: :::::::.:::...::.::::::.:.:::::.:: :::.:.::.::
NP_006 SKNSLESYAFNMKATVEDEKLQGKINDEDKQKILDKCNEIINWLDKNQTAEKEEFEHQQK
       540       550       560       570       580       590       

              610          620              630         
pF1KB3 ELERVCNPIISKLYQ--GG-PGGGSGG---GGS----GASGGPTIEEVD
       :::.::::::.::::  :: :::  ::   ::.    :::.::::::::
NP_006 ELEKVCNPIITKLYQSAGGMPGGMPGGFPGGGAPPSGGASSGPTIEEVD
       600       610       620       630       640      

>>NP_005337 (OMIM: 603012) heat shock 70 kDa protein 1B   (641 aa)
 initn: 3506 init1: 2411 opt: 3509  Z-score: 3075.9  bits: 579.4 E(85289): 1.4e-164
Smith-Waterman score: 3509; 84.0% identity (95.0% similar) in 642 aa overlap (3-639:2-641)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MSARGPAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQV
         :.. ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005  MAKAAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQV
                10        20        30        40        50         

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 AMNPTNTIFDAKRLIGRKFEDATVQSDMKHWPFRVVSEGGKPKVQVEYKGETKTFFPEEI
       :.:: ::.::::::::::: : .::::::::::.:...: :::::: ::::::.:.::::
NP_005 ALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEI
      60        70        80        90       100       110         

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 SSMVLTKMKEIAEAYLGGKVHSAVITVPAYFNDSQRQATKDAGTITGLNVLRIINEPTAA
       :::::::::::::::::  : .:::::::::::::::::::::.:.::::::::::::::
NP_005 SSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAA
     120       130       140       150       160       170         

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 AIAYGLDKKGCAGGEKNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRM
       :::::::. :   ::.:::::::::::::::::::.:::::::.:::::::::::::::.
NP_005 AIAYGLDRTG--KGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRL
     180         190       200       210       220       230       

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 VSHLAEEFKRKHKKDIGPNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGVDFYTSI
       :.:..:::::::::::. ::::::::::::::::::::::::::.:::::.::.::::::
NP_005 VNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSI
       240       250       260       270       280       290       

              310       320       330       340       350       360
pF1KB3 TRARFEELNADLFRGTLEPVEKALRDAKLDKGQIQEIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGK
       :::::::: .::::.::::::::::::::::.::...:::::::::::.::::::::::.
NP_005 TRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGR
       300       310       320       330       340       350       

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pF1KB3 ELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILIGDKSENVQDLLLLDVTPLSLGIETAGGVMTPLIKRN
       .::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::.:::::.:::::::: :::::
NP_005 DLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMGDKSENVQDLLLLDVAPLSLGLETAGGVMTALIKRN
       360       370       380       390       400       410       

              430       440       450       460       470       480
pF1KB3 TTIPTKQTQTFTTYSDNQSSVLVQVYEGERAMTKDNNLLGKFDLTGIPPAPRGVPQIEVT
       .:::::::: :::::::: .::.:::::::::::::::::.:.:.:::::::::::::::
NP_005 STIPTKQTQIFTTYSDNQPGVLIQVYEGERAMTKDNNLLGRFELSGIPPAPRGVPQIEVT
       420       430       440       450       460       470       

              490       500       510       520       530       540
pF1KB3 FDIDANGILNVTAADKSTGKENKITITNDKGRLSKDDIDRMVQEAERYKSEDEANRDRVA
       :::::::::::::.:::::: ::::::::::::::..:.:::::::.::.:::..:.::.
NP_005 FDIDANGILNVTATDKSTGKANKITITNDKGRLSKEEIERMVQEAEKYKAEDEVQRERVS
       480       490       500       510       520       530       

              550       560       570       580       590       600
pF1KB3 AKNALESYTYNIKQTVEDEKLRGKISEQDKNKILDKCQEVINWLDRNQMAEKDEYEHKQK
       ::::::::..:.:..:::: :.::::: ::.:.::::::::.::: : .:::::.:::.:
NP_005 AKNALESYAFNMKSAVEDEGLKGKISEADKKKVLDKCQEVISWLDANTLAEKDEFEHKRK
       540       550       560       570       580       590       

              610           620       630          
pF1KB3 ELERVCNPIISKLYQG----GPGGGSGGGGSGASG-GPTIEEVD
       :::.::::::: ::::    :::: .. : .:.:: ::::::::
NP_005 ELEQVCNPIISGLYQGAGGPGPGGFGAQGPKGGSGSGPTIEEVD
       600       610       620       630       640 

>>NP_005336 (OMIM: 140550) heat shock 70 kDa protein 1A   (641 aa)
 initn: 3506 init1: 2411 opt: 3509  Z-score: 3075.9  bits: 579.4 E(85289): 1.4e-164
Smith-Waterman score: 3509; 84.0% identity (95.0% similar) in 642 aa overlap (3-639:2-641)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MSARGPAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQV
         :.. ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005  MAKAAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQV
                10        20        30        40        50         

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 AMNPTNTIFDAKRLIGRKFEDATVQSDMKHWPFRVVSEGGKPKVQVEYKGETKTFFPEEI
       :.:: ::.::::::::::: : .::::::::::.:...: :::::: ::::::.:.::::
NP_005 ALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEI
      60        70        80        90       100       110         

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 SSMVLTKMKEIAEAYLGGKVHSAVITVPAYFNDSQRQATKDAGTITGLNVLRIINEPTAA
       :::::::::::::::::  : .:::::::::::::::::::::.:.::::::::::::::
NP_005 SSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAA
     120       130       140       150       160       170         

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 AIAYGLDKKGCAGGEKNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRM
       :::::::. :   ::.:::::::::::::::::::.:::::::.:::::::::::::::.
NP_005 AIAYGLDRTG--KGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRL
     180         190       200       210       220       230       

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 VSHLAEEFKRKHKKDIGPNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGVDFYTSI
       :.:..:::::::::::. ::::::::::::::::::::::::::.:::::.::.::::::
NP_005 VNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSI
       240       250       260       270       280       290       

              310       320       330       340       350       360
pF1KB3 TRARFEELNADLFRGTLEPVEKALRDAKLDKGQIQEIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGK
       :::::::: .::::.::::::::::::::::.::...:::::::::::.::::::::::.
NP_005 TRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGR
       300       310       320       330       340       350       

              370       380       390       400       410       420
pF1KB3 ELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILIGDKSENVQDLLLLDVTPLSLGIETAGGVMTPLIKRN
       .::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::.:::::.:::::::: :::::
NP_005 DLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMGDKSENVQDLLLLDVAPLSLGLETAGGVMTALIKRN
       360       370       380       390       400       410       

              430       440       450       460       470       480
pF1KB3 TTIPTKQTQTFTTYSDNQSSVLVQVYEGERAMTKDNNLLGKFDLTGIPPAPRGVPQIEVT
       .:::::::: :::::::: .::.:::::::::::::::::.:.:.:::::::::::::::
NP_005 STIPTKQTQIFTTYSDNQPGVLIQVYEGERAMTKDNNLLGRFELSGIPPAPRGVPQIEVT
       420       430       440       450       460       470       

              490       500       510       520       530       540
pF1KB3 FDIDANGILNVTAADKSTGKENKITITNDKGRLSKDDIDRMVQEAERYKSEDEANRDRVA
       :::::::::::::.:::::: ::::::::::::::..:.:::::::.::.:::..:.::.
NP_005 FDIDANGILNVTATDKSTGKANKITITNDKGRLSKEEIERMVQEAEKYKAEDEVQRERVS
       480       490       500       510       520       530       

              550       560       570       580       590       600
pF1KB3 AKNALESYTYNIKQTVEDEKLRGKISEQDKNKILDKCQEVINWLDRNQMAEKDEYEHKQK
       ::::::::..:.:..:::: :.::::: ::.:.::::::::.::: : .:::::.:::.:
NP_005 AKNALESYAFNMKSAVEDEGLKGKISEADKKKVLDKCQEVISWLDANTLAEKDEFEHKRK
       540       550       560       570       580       590       

              610           620       630          
pF1KB3 ELERVCNPIISKLYQG----GPGGGSGGGGSGASG-GPTIEEVD
       :::.::::::: ::::    :::: .. : .:.:: ::::::::
NP_005 ELEQVCNPIISGLYQGAGGPGPGGFGAQGPKGGSGSGPTIEEVD
       600       610       620       630       640 

>>NP_005518 (OMIM: 140559) heat shock 70 kDa protein 1-l  (641 aa)
 initn: 3398 init1: 2358 opt: 3444  Z-score: 3019.1  bits: 568.9 E(85289): 2e-161
Smith-Waterman score: 3444; 82.1% identity (94.7% similar) in 641 aa overlap (2-639:3-641)

                10        20        30        40        50         
pF1KB3  MSARGPAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQ
         .:.: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 MATAKGIAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQ
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100       110         
pF1KB3 VAMNPTNTIFDAKRLIGRKFEDATVQSDMKHWPFRVVSEGGKPKVQVEYKGETKTFFPEE
       ::::: ::.:::::::::::.: .::.::: :::.:..::::::: : ::::.:.:.:::
NP_005 VAMNPQNTVFDAKRLIGRKFNDPVVQADMKLWPFQVINEGGKPKVLVSYKGENKAFYPEE
               70        80        90       100       110       120

     120       130       140       150       160       170         
pF1KB3 ISSMVLTKMKEIAEAYLGGKVHSAVITVPAYFNDSQRQATKDAGTITGLNVLRIINEPTA
       ::::::::.:: :::.::  : .:::::::::::::::::::::.:.:::::::::::::
NP_005 ISSMVLTKLKETAEAFLGHPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTA
              130       140       150       160       170       180

     180       190       200       210       220       230         
pF1KB3 AAIAYGLDKKGCAGGEKNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNR
       ::::::::: :   ::..::::::::::::::::::.:::::::.:::::::::::::::
NP_005 AAIAYGLDKGG--QGERHVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNR
              190         200       210       220       230        

     240       250       260       270       280       290         
pF1KB3 MVSHLAEEFKRKHKKDIGPNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGVDFYTS
       .:::..:::::::::::. :::::::::::::::::::::::::..::::::::.:::::
NP_005 LVSHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQANLEIDSLYEGIDFYTS
      240       250       260       270       280       290        

     300       310       320       330       340       350         
pF1KB3 ITRARFEELNADLFRGTLEPVEKALRDAKLDKGQIQEIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNG
       ::::::::: :::::::::::::::::::.::..:..::::::::::::.:.::::.:::
NP_005 ITRARFEELCADLFRGTLEPVEKALRDAKMDKAKIHDIVLVGGSTRIPKVQRLLQDYFNG
      300       310       320       330       340       350        

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pF1KB3 KELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILIGDKSENVQDLLLLDVTPLSLGIETAGGVMTPLIKR
       ..::::::::::::::::::::::.:::::.:::::::::.:::::.:::::::: ::::
NP_005 RDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMGDKSEKVQDLLLLDVAPLSLGLETAGGVMTALIKR
      360       370       380       390       400       410        

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pF1KB3 NTTIPTKQTQTFTTYSDNQSSVLVQVYEGERAMTKDNNLLGKFDLTGIPPAPRGVPQIEV
       :.:::::::: :::::::: .::.:::::::::::::::::.::::::::::::::::::
NP_005 NSTIPTKQTQIFTTYSDNQPGVLIQVYEGERAMTKDNNLLGRFDLTGIPPAPRGVPQIEV
      420       430       440       450       460       470        

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pF1KB3 TFDIDANGILNVTAADKSTGKENKITITNDKGRLSKDDIDRMVQEAERYKSEDEANRDRV
       ::::::::::::::.:::::: ::::::::::::::..:.::: .::.::.:::..:...
NP_005 TFDIDANGILNVTATDKSTGKVNKITITNDKGRLSKEEIERMVLDAEKYKAEDEVQREKI
      480       490       500       510       520       530        

     540       550       560       570       580       590         
pF1KB3 AAKNALESYTYNIKQTVEDEKLRGKISEQDKNKILDKCQEVINWLDRNQMAEKDEYEHKQ
       :::::::::..:.:..: :: :.:::::.:::::::::.:...::. ::.:::::..::.
NP_005 AAKNALESYAFNMKSVVSDEGLKGKISESDKNKILDKCNELLSWLEVNQLAEKDEFDHKR
      540       550       560       570       580       590        

     600       610          620       630         
pF1KB3 KELERVCNPIISKLYQGG---PGGGSGGGGSGASGGPTIEEVD
       ::::..:::::.::::::   :. :.:   .  . ::::::::
NP_005 KELEQMCNPIITKLYQGGCTGPACGTGYVPGRPATGPTIEEVD
      600       610       620       630       640 

>>NP_002146 (OMIM: 140555) heat shock 70 kDa protein 6 [  (643 aa)
 initn: 3329 init1: 2246 opt: 3341  Z-score: 2929.1  bits: 552.2 E(85289): 2.1e-156
Smith-Waterman score: 3341; 78.7% identity (94.2% similar) in 639 aa overlap (7-639:8-643)

                10        20        30        40        50         
pF1KB3  MSARGPAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQ
              :.:::::::::::::::.:.:::.:::::::::::::::::::::.:::::.:
NP_002 MQAPRELAVGIDLGTTYSCVGVFQQGRVEILANDQGNRTTPSYVAFTDTERLVGDAAKSQ
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100       110         
pF1KB3 VAMNPTNTIFDAKRLIGRKFEDATVQSDMKHWPFRVVSEGGKPKVQVEYKGETKTFFPEE
       .:.:: ::.::::::::::: :.::::::::::::::::::::::.: :.:: :::.:::
NP_002 AALNPHNTVFDAKRLIGRKFADTTVQSDMKHWPFRVVSEGGKPKVRVCYRGEDKTFYPEE
               70        80        90       100       110       120

     120       130       140       150       160       170         
pF1KB3 ISSMVLTKMKEIAEAYLGGKVHSAVITVPAYFNDSQRQATKDAGTITGLNVLRIINEPTA
       ::::::.:::: ::::::  :. :::::::::::::::::::::.:.:::::::::::::
NP_002 ISSMVLSKMKETAEAYLGQPVKHAVITVPAYFNDSQRQATKDAGAIAGLNVLRIINEPTA
              130       140       150       160       170       180

     180       190       200       210       220       230         
pF1KB3 AAIAYGLDKKGCAGGEKNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNR
       ::::::::..:  .::.:::::::::::::::.:.:. :.::::.:::::::::::::::
NP_002 AAIAYGLDRRG--AGERNVLIFDLGGGTFDVSVLSIDAGVFEVKATAGDTHLGGEDFDNR
              190         200       210       220       230        

     240       250       260       270       280       290         
pF1KB3 MVSHLAEEFKRKHKKDIGPNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGVDFYTS
       .:.:. :::.::: ::.. ::::.::::::::::::::::::::..:::::.::::::::
NP_002 LVNHFMEEFRRKHGKDLSGNKRALRRLRTACERAKRTLSSSTQATLEIDSLFEGVDFYTS
      240       250       260       270       280       290        

     300       310       320       330       340       350         
pF1KB3 ITRARFEELNADLFRGTLEPVEKALRDAKLDKGQIQEIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNG
       ::::::::: .::::.::::::::::::::::.::...:::::::::::.::::::::::
NP_002 ITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDVVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNG
      300       310       320       330       340       350        

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pF1KB3 KELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILIGDKSENVQDLLLLDVTPLSLGIETAGGVMTPLIKR
       ::::::::::::::::::::::.:.::: :.:::::::::.:::::.:::::::: ::.:
NP_002 KELNKSINPDEAVAYGAAVQAAVLMGDKCEKVQDLLLLDVAPLSLGLETAGGVMTTLIQR
      360       370       380       390       400       410        

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pF1KB3 NTTIPTKQTQTFTTYSDNQSSVLVQVYEGERAMTKDNNLLGKFDLTGIPPAPRGVPQIEV
       :.::::::::::::::::: .:..:::::::::::::::::.:.:.::::::::::::::
NP_002 NATIPTKQTQTFTTYSDNQPGVFIQVYEGERAMTKDNNLLGRFELSGIPPAPRGVPQIEV
      420       430       440       450       460       470        

     480       490       500       510       520       530         
pF1KB3 TFDIDANGILNVTAADKSTGKENKITITNDKGRLSKDDIDRMVQEAERYKSEDEANRDRV
       ::::::::::.:::.:.:::: ::::::::::::::....:::.:::.::.::::.::::
NP_002 TFDIDANGILSVTATDRSTGKANKITITNDKGRLSKEEVERMVHEAEQYKAEDEAQRDRV
      480       490       500       510       520       530        

     540       550       560       570       580       590         
pF1KB3 AAKNALESYTYNIKQTVEDEKLRGKISEQDKNKILDKCQEVINWLDRNQMAEKDEYEHKQ
       ::::.::......: ....:.:: :: :.:. :. :::.::. ::..::.:::.::::..
NP_002 AAKNSLEAHVFHVKGSLQEESLRDKIPEEDRRKMQDKCREVLAWLEHNQLAEKEEYEHQK
      540       550       560       570       580       590        

     600       610         620       630             
pF1KB3 KELERVCNPIISKLYQGGPG--GGSGGGGSGASG----GPTIEEVD
       .:::..: ::.:.:: ::::  :::. : .. .:    :: :::::
NP_002 RELEQICRPIFSRLY-GGPGVPGGSSCGTQARQGDPSTGPIIEEVD
      600       610        620       630       640   

>>NP_694881 (OMIM: 600816) heat shock cognate 71 kDa pro  (493 aa)
 initn: 2833 init1: 1615 opt: 2739  Z-score: 2404.7  bits: 454.8 E(85289): 3.3e-127
Smith-Waterman score: 2739; 89.7% identity (96.6% similar) in 474 aa overlap (3-475:2-473)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MSARGPAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQV
         ..:::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_694  MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQV
                10        20        30        40        50         

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 AMNPTNTIFDAKRLIGRKFEDATVQSDMKHWPFRVVSEGGKPKVQVEYKGETKTFFPEEI
       :::::::.:::::::::.:.::.:::::::::: ::...:.::::::::::::.:.:::.
NP_694 AMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEV
      60        70        80        90       100       110         

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 SSMVLTKMKEIAEAYLGGKVHSAVITVPAYFNDSQRQATKDAGTITGLNVLRIINEPTAA
       :::::::::::::::::  : .::.::::::::::::::::::::.::::::::::::::
NP_694 SSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAA
     120       130       140       150       160       170         

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 AIAYGLDKKGCAGGEKNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRM
       :::::::::  .:.:.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_694 AIAYGLDKK--VGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRM
     180         190       200       210       220       230       

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 VSHLAEEFKRKHKKDIGPNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGVDFYTSI
       :.:.  ::::::::::. :::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::
NP_694 VNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSI
       240       250       260       270       280       290       

              310       320       330       340       350       360
pF1KB3 TRARFEELNADLFRGTLEPVEKALRDAKLDKGQIQEIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGK
       :::::::::::::::::.:::::::::::::.::..::::::::::::::::::::::::
NP_694 TRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGK
       300       310       320       330       340       350       

              370       380       390       400       410       420
pF1KB3 ELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILIGDKSENVQDLLLLDVTPLSLGIETAGGVMTPLIKRN
       ::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::: :::::
NP_694 ELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILSGDKSENVQDLLLLDVTPLSLGIETAGGVMTVLIKRN
       360       370       380       390       400       410       

              430       440       450       460       470          
pF1KB3 TTIPTKQTQTFTTYSDNQSSVLVQVYEGERAMTKDNNLLGKFDLTGIPPA-PRGVPQIEV
       :::::::::::::::::: .::.:::::::::::::::::::.:::.: . : : :    
NP_694 TTIPTKQTQTFTTYSDNQPGVLIQVYEGERAMTKDNNLLGKFELTGMPGGMPGGFPGGGA
       420       430       440       450       460       470       

     480       490       500       510       520       530         
pF1KB3 TFDIDANGILNVTAADKSTGKENKITITNDKGRLSKDDIDRMVQEAERYKSEDEANRDRV
                                                                   
NP_694 PPSGGASSGPTIEEVD                                            
       480       490                                               

>>NP_005338 (OMIM: 138120) 78 kDa glucose-regulated prot  (654 aa)
 initn: 2201 init1: 844 opt: 2596  Z-score: 2278.0  bits: 431.8 E(85289): 3.8e-120
Smith-Waterman score: 2596; 64.7% identity (86.1% similar) in 618 aa overlap (5-618:28-640)

                                      10        20        30       
pF1KB3                        MSARGPAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNR
                                  : ..::::::::::::::..:.:::::::::::
NP_005 MKLSLVAAMLLLLSAARAEEEDKKEDVGTVVGIDLGTTYSCVGVFKNGRVEIIANDQGNR
               10        20        30        40        50        60

        40         50        60        70        80        90      
pF1KB3 TTPSYVAFT-DTERLIGDAAKNQVAMNPTNTIFDAKRLIGRKFEDATVQSDMKHWPFRVV
        :::::::: . :::::::::::.. :: ::.::::::::: ..: .::.:.:  ::.::
NP_005 ITPSYVAFTPEGERLIGDAAKNQLTSNPENTVFDAKRLIGRTWNDPSVQQDIKFLPFKVV
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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