Result of FASTA (omim) for
pF1KB3816
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3816, 2012 aa
1>>>pF1KB3816 2012 - 2012 aa - 2012 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.6631+/-0.000711; mu= 3.0635+/- 0.043
mean_var=371.9236+/-78.727, 0's: 0 Z-trim(112.0): 627 B-trim: 33 in 1/55
Lambda= 0.066504
statistics sampled from 20140 (20832) to 20140 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.575), E-opt: 0.2 (0.244), width: 16
Scan time: 15.750
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001380 (OMIM: 602523) Down syndrome cell adhesi (2012) 13294 1293.0 0
NP_001258463 (OMIM: 602523) Down syndrome cell adh (1994) 12532 1219.8 0
XP_016883770 (OMIM: 602523) PREDICTED: Down syndro (1776) 11733 1143.1 0
NP_065744 (OMIM: 611782) Down syndrome cell adhesi (2113) 8228 806.9 0
XP_011541220 (OMIM: 611782) PREDICTED: Down syndro (1977) 7227 710.9 3.5e-203
XP_011541219 (OMIM: 611782) PREDICTED: Down syndro (2065) 7227 710.9 3.6e-203
XP_011541221 (OMIM: 611782) PREDICTED: Down syndro (1626) 6487 639.8 7.3e-182
XP_011541222 (OMIM: 611782) PREDICTED: Down syndro (1543) 6117 604.2 3.4e-171
XP_011541223 (OMIM: 611782) PREDICTED: Down syndro (1344) 4801 477.9 3.2e-133
XP_011541226 (OMIM: 611782) PREDICTED: Down syndro (1270) 4779 475.8 1.3e-132
XP_011541227 (OMIM: 611782) PREDICTED: Down syndro (1264) 4760 473.9 4.7e-132
XP_011523218 (OMIM: 607217) PREDICTED: protein sid (1142) 1176 130.0 1.4e-28
XP_011532070 (OMIM: 601325) PREDICTED: contactin-3 (1028) 859 99.5 1.9e-19
XP_005264814 (OMIM: 601325) PREDICTED: contactin-3 (1028) 852 98.9 3.1e-19
XP_016861996 (OMIM: 601325) PREDICTED: contactin-3 (1028) 852 98.9 3.1e-19
NP_065923 (OMIM: 601325) contactin-3 precursor [Ho (1028) 852 98.9 3.1e-19
XP_011507621 (OMIM: 609145) PREDICTED: neurofascin (1347) 826 96.5 2e-18
XP_011507616 (OMIM: 609145) PREDICTED: neurofascin (1418) 826 96.5 2.1e-18
XP_011507622 (OMIM: 609145) PREDICTED: neurofascin (1443) 826 96.5 2.1e-18
XP_016877727 (OMIM: 601907) PREDICTED: neogenin is (1381) 820 95.9 3.1e-18
XP_016877720 (OMIM: 601907) PREDICTED: neogenin is (1434) 820 96.0 3.2e-18
XP_016861997 (OMIM: 601325) PREDICTED: contactin-3 ( 970) 810 94.8 4.8e-18
NP_001180513 (OMIM: 601581) neuronal cell adhesion (1180) 806 94.5 7.1e-18
NP_001180512 (OMIM: 601581) neuronal cell adhesion (1192) 806 94.5 7.2e-18
XP_016867746 (OMIM: 601581) PREDICTED: neuronal ce (1192) 806 94.5 7.2e-18
XP_016867738 (OMIM: 601581) PREDICTED: neuronal ce (1195) 806 94.5 7.2e-18
XP_016867736 (OMIM: 601581) PREDICTED: neuronal ce (1196) 806 94.5 7.2e-18
XP_016867739 (OMIM: 601581) PREDICTED: neuronal ce (1199) 806 94.5 7.2e-18
XP_016867731 (OMIM: 601581) PREDICTED: neuronal ce (1273) 806 94.6 7.5e-18
XP_016867729 (OMIM: 601581) PREDICTED: neuronal ce (1285) 806 94.6 7.5e-18
XP_016867728 (OMIM: 601581) PREDICTED: neuronal ce (1286) 806 94.6 7.5e-18
XP_016867727 (OMIM: 601581) PREDICTED: neuronal ce (1288) 806 94.6 7.5e-18
XP_016867730 (OMIM: 601581) PREDICTED: neuronal ce (1289) 806 94.6 7.5e-18
XP_011514564 (OMIM: 601581) PREDICTED: neuronal ce (1292) 806 94.6 7.5e-18
XP_016867744 (OMIM: 601581) PREDICTED: neuronal ce (1189) 757 89.8 1.9e-16
XP_011507618 (OMIM: 609145) PREDICTED: neurofascin (1364) 757 89.9 2e-16
XP_011507614 (OMIM: 609145) PREDICTED: neurofascin (1435) 757 89.9 2.1e-16
XP_011507620 (OMIM: 609145) PREDICTED: neurofascin (1460) 757 89.9 2.1e-16
XP_016860311 (OMIM: 188840,600334,603689,604145,60 (33101) 787 94.4 2.1e-16
NP_596869 (OMIM: 188840,600334,603689,604145,60880 (33423) 787 94.4 2.2e-16
XP_016860310 (OMIM: 188840,600334,603689,604145,60 (34087) 787 94.4 2.2e-16
XP_016860309 (OMIM: 188840,600334,603689,604145,60 (34088) 787 94.4 2.2e-16
NP_001243779 (OMIM: 188840,600334,603689,604145,60 (34350) 787 94.4 2.2e-16
XP_016856226 (OMIM: 609145) PREDICTED: neurofascin (1133) 754 89.5 2.2e-16
XP_016860308 (OMIM: 188840,600334,603689,604145,60 (35622) 787 94.5 2.2e-16
NP_001254479 (OMIM: 188840,600334,603689,604145,60 (35991) 787 94.5 2.3e-16
NP_001153803 (OMIM: 609145) neurofascin isoform 2 (1189) 754 89.5 2.3e-16
XP_011507627 (OMIM: 609145) PREDICTED: neurofascin (1190) 754 89.5 2.3e-16
XP_011507626 (OMIM: 609145) PREDICTED: neurofascin (1195) 754 89.5 2.3e-16
XP_005245046 (OMIM: 609145) PREDICTED: neurofascin (1266) 754 89.6 2.4e-16
>>NP_001380 (OMIM: 602523) Down syndrome cell adhesion m (2012 aa)
initn: 13294 init1: 13294 opt: 13294 Z-score: 6914.6 bits: 1293.0 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 13294; 100.0% identity (100.0% similar) in 2012 aa overlap (1-2012:1-2012)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MWILALSLFQSFANVFSEDLHSSLYFVNASLQEVVFASTTGTLVPCPAAGIPPVTLRWYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MWILALSLFQSFANVFSEDLHSSLYFVNASLQEVVFASTTGTLVPCPAAGIPPVTLRWYL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 ATGEEIYDVPGIRHVHPNGTLQIFPFPPSSFSTLIHDNTYYCTAENPSGKIRSQDVHIKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ATGEEIYDVPGIRHVHPNGTLQIFPFPPSSFSTLIHDNTYYCTAENPSGKIRSQDVHIKA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 VLREPYTVRVEDQKTMRGNVAVFKCIIPSSVEAYITVVSWEKDTVSLVSGSRFLITSTGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VLREPYTVRVEDQKTMRGNVAVFKCIIPSSVEAYITVVSWEKDTVSLVSGSRFLITSTGA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 LYIKDVQNEDGLYNYRCITRHRYTGETRQSNSARLFVSDPANSAPSILDGFEHRKAMAGQ
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::
NP_001 LYIKDVQNEDGLYNYRCITRHRYTGETRQSNSARLFVSDPANSAPSILDGFDHRKAMAGQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 RVELPCKALGHPEPDYRWLKDNMPLELSGRFQKTVTGLLIENIRPSDSGSYVCEVSNRYG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RVELPCKALGHPEPDYRWLKDNMPLELSGRFQKTVTGLLIENIRPSDSGSYVCEVSNRYG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 TAKVIGRLYVKQPLKATISPRKVKSSVGSQVSLSCSVTGTEDQELSWYRNGEILNPGKNV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TAKVIGRLYVKQPLKATISPRKVKSSVGSQVSLSCSVTGTEDQELSWYRNGEILNPGKNV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 RITGINHENLIMDHMVKSDGGAYQCFVRKDKLSAQDYVQVVLEDGTPKIISAFSEKVVSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RITGINHENLIMDHMVKSDGGAYQCFVRKDKLSAQDYVQVVLEDGTPKIISAFSEKVVSP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 AEPVSLMCNVKGTPLPTITWTLDDDPILKGGSHRISQMITSEGNVVSYLNISSSQVRDGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AEPVSLMCNVKGTPLPTITWTLDDDPILKGGSHRISQMITSEGNVVSYLNISSSQVRDGG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 VYRCTANNSAGVVLYQARINVRGPASIRPMKNITAIAGRDTYIHCRVIGYPYYSIKWYKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VYRCTANNSAGVVLYQARINVRGPASIRPMKNITAIAGRDTYIHCRVIGYPYYSIKWYKN
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 SNLLPFNHRQVAFENNGTLKLSDVQKEVDEGEYTCNVLVQPQLSTSQSVHVTVKVPPFIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SNLLPFNHRQVAFENNGTLKLSDVQKEVDEGEYTCNVLVQPQLSTSQSVHVTVKVPPFIQ
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 PFEFPRFSIGQRVFIPCVVVSGDLPITITWQKDGRPIPGSLGVTIDNIDFTSSLRISNLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PFEFPRFSIGQRVFIPCVVVSGDLPITITWQKDGRPIPGSLGVTIDNIDFTSSLRISNLS
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB3 LMHNGNYTCIARNEAAAVEHQSQLIVRVPPKFVVQPRDQDGIYGKAVILNCSAEGYPVPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LMHNGNYTCIARNEAAAVEHQSQLIVRVPPKFVVQPRDQDGIYGKAVILNCSAEGYPVPT
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB3 IVWKFSKGAGVPQFQPIALNGRIQVLSNGSLLIKHVVEEDSGYYLCKVSNDVGADVSKSM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IVWKFSKGAGVPQFQPIALNGRIQVLSNGSLLIKHVVEEDSGYYLCKVSNDVGADVSKSM
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB3 YLTVKIPAMITSYPNTTLATQGQKKEMSCTAHGEKPIIVRWEKEDRIINPEMARYLVSTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YLTVKIPAMITSYPNTTLATQGQKKEMSCTAHGEKPIIVRWEKEDRIINPEMARYLVSTK
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB3 EVGEEVISTLQILPTVREDSGFFSCHAINSYGEDRGIIQLTVQEPPDPPEIEIKDVKART
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EVGEEVISTLQILPTVREDSGFFSCHAINSYGEDRGIIQLTVQEPPDPPEIEIKDVKART
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB3 ITLRWTMGFDGNSPITGYDIECKNKSDSWDSAQRTKDVSPQLNSATIIDIHPSSTYSIRM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ITLRWTMGFDGNSPITGYDIECKNKSDSWDSAQRTKDVSPQLNSATIIDIHPSSTYSIRM
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB3 YAKNRIGKSEPSNELTITADEAAPDGPPQEVHLEPISSQSIRVTWKAPKKHLQNGIIRGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YAKNRIGKSEPSNELTITADEAAPDGPPQEVHLEPISSQSIRVTWKAPKKHLQNGIIRGY
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB3 QIGYREYSTGGNFQFNIISVDTSGDSEVYTLDNLNKFTQYGLVVQACNRAGTGPSSQEII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QIGYREYSTGGNFQFNIISVDTSGDSEVYTLDNLNKFTQYGLVVQACNRAGTGPSSQEII
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KB3 TTTLEDVPSYPPENVQAIATSPESISISWSTLSKEALNGILQGFRVIYWANLMDGELGEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TTTLEDVPSYPPENVQAIATSPESISISWSTLSKEALNGILQGFRVIYWANLMDGELGEI
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KB3 KNITTTQPSLELDGLEKYTNYSIQVLAFTRAGDGVRSEQIFTRTKEDVPGPPAGVKAAAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KNITTTQPSLELDGLEKYTNYSIQVLAFTRAGDGVRSEQIFTRTKEDVPGPPAGVKAAAA
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KB3 SASMVFVSWLPPLKLNGIIRKYTVFCSHPYPTVISEFEASPDSFSYRIPNLSRNRQYSVW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SASMVFVSWLPPLKLNGIIRKYTVFCSHPYPTVISEFEASPDSFSYRIPNLSRNRQYSVW
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KB3 VVAVTSAGRGNSSEIITVEPLAKAPARILTFSGTVTTPWMKDIVLPCKAVGDPSPAVKWM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VVAVTSAGRGNSSEIITVEPLAKAPARILTFSGTVTTPWMKDIVLPCKAVGDPSPAVKWM
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KB3 KDSNGTPSLVTIDGRRSIFSNGSFIIRTVKAEDSGYYSCIANNNWGSDEIILNLQVQVPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KDSNGTPSLVTIDGRRSIFSNGSFIIRTVKAEDSGYYSCIANNNWGSDEIILNLQVQVPP
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KB3 DQPRLTVSKTTSSSITLSWLPGDNGGSSIRGYILQYSEDNSEQWGSFPISPSERSYRLEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DQPRLTVSKTTSSSITLSWLPGDNGGSSIRGYILQYSEDNSEQWGSFPISPSERSYRLEN
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KB3 LKCGTWYKFTLTAQNGVGPGRISEIIEAKTLGKEPQFSKEQELFASINTTRVRLNLIGWN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LKCGTWYKFTLTAQNGVGPGRISEIIEAKTLGKEPQFSKEQELFASINTTRVRLNLIGWN
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KB3 DGGCPITSFTLEYRPFGTTVWTTAQRTSLSKSYILYDLQEATWYELQMRVCNSAGCAEKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DGGCPITSFTLEYRPFGTTVWTTAQRTSLSKSYILYDLQEATWYELQMRVCNSAGCAEKQ
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KB3 ANFATLNYDGSTIPPLIKSVVQNEEGLTTNEGLKMLVTISCILVGVLLLFVLLLVVRRRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ANFATLNYDGSTIPPLIKSVVQNEEGLTTNEGLKMLVTISCILVGVLLLFVLLLVVRRRR
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KB3 REQRLKRLRDAKSLAEMLMSKNTRTSDTLSKQQQTLRMHIDIPRAQLLIEERDTMETIDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 REQRLKRLRDAKSLAEMLMSKNTRTSDTLSKQQQTLRMHIDIPRAQLLIEERDTMETIDD
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KB3 RSTVLLTDADFGEAAKQKSLTVTHTVHYQSVSQATGPLVDVSDARPGTNPTTRRNAKAGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RSTVLLTDADFGEAAKQKSLTVTHTVHYQSVSQATGPLVDVSDARPGTNPTTRRNAKAGP
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1750 1760 1770 1780 1790 1800
pF1KB3 TARNRYASQWTLNRPHPTISAHTLTTDWRLPTPRAAGSVDKESDSYSVSPSQDTDRARSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TARNRYASQWTLNRPHPTISAHTLTTDWRLPTPRAAGSVDKESDSYSVSPSQDTDRARSS
1750 1760 1770 1780 1790 1800
1810 1820 1830 1840 1850 1860
pF1KB3 MVSTESASSTYEELARAYEHAKMEEQLRHAKFTITECFISDTSSEQLTAGTNEYTDSLTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MVSTESASSTYEELARAYEHAKMEEQLRHAKFTITECFISDTSSEQLTAGTNEYTDSLTS
1810 1820 1830 1840 1850 1860
1870 1880 1890 1900 1910 1920
pF1KB3 STPSESGICRFTASPPKPQDGGRVMNMAVPKAHRPGDLIHLPPYLRMDFLLNRGGPGTSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 STPSESGICRFTASPPKPQDGGRVMNMAVPKAHRPGDLIHLPPYLRMDFLLNRGGPGTSR
1870 1880 1890 1900 1910 1920
1930 1940 1950 1960 1970 1980
pF1KB3 DLSLGQACLEPQKSRTLKRPTVLEPIPMEAASSASSTREGQSWQPGAVATLPQREGAELG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DLSLGQACLEPQKSRTLKRPTVLEPIPMEAASSASSTREGQSWQPGAVATLPQREGAELG
1930 1940 1950 1960 1970 1980
1990 2000 2010
pF1KB3 QAAKMSSSQESLLDSRGHLKGNNPYAKSYTLV
::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QAAKMSSSQESLLDSRGHLKGNNPYAKSYTLV
1990 2000 2010
>>NP_001258463 (OMIM: 602523) Down syndrome cell adhesio (1994 aa)
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Smith-Waterman score: 13120; 99.1% identity (99.1% similar) in 2012 aa overlap (1-2012:1-1994)
10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MWILALSLFQSFANVFSEDLHSSLYFVNASLQEVVFASTTGTLVPCPAAGIPPVTLRWYL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ATGEEIYDVPGIRHVHPNGTLQIFPFPPSSFSTLIHDNTYYCTAENPSGKIRSQDVHIKA
70 80 90 100 110 120
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VLREPYTVRVEDQKTMRGNVAVFKCIIPSSVEAYITVVSWEKDTVSLVSGSRFLITSTGA
130 140 150 160 170 180
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::
NP_001 LYIKDVQNEDGLYNYRCITRHRYTGETRQSNSARLFVSDPANSAPSILDGFDHRKAMAGQ
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NP_001 RVELPCKALGHPEPDYRWLKDNMPLELSGRFQKTVTGLLIENIRPSDSGSYVCEVSNRYG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TAKVIGRLYVKQPLKATISPRKVKSSVGSQVSLSCSVTGTEDQELSWYRNGEILNPGKNV
310 320 330 340 350 360
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RITGINHENLIMDHMVKSDGGAYQCFVRKDKLSAQDYVQVVLEDGTPKIISAFSEKVVSP
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AEPVSLMCNVKGTPLPTITWTLDDDPILKGGSHRISQMITSEGNVVSYLNISSSQVRDGG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VYRCTANNSAGVVLYQARINVRGPASIRPMKNITAIAGRDTYIHCRVIGYPYYSIKWYKN
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SNLLPFNHRQVAFENNGTLKLSDVQKEVDEGEYTCNVLVQPQLSTSQSVHVTVKVPPFIQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PFEFPRFSIGQRVFIPCVVVSGDLPITITWQKDGRPIPGSLGVTIDNIDFTSSLRISNLS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LMHNGNYTCIARNEAAAVEHQSQLIVRVPPKFVVQPRDQDGIYGKAVILNCSAEGYPVPT
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IVWKFSKGAGVPQFQPIALNGRIQVLSNGSLLIKHVVEEDSGYYLCKVSNDVGADVSKSM
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YLTVKIPAMITSYPNTTLATQGQKKEMSCTAHGEKPIIVRWEKEDRIINPEMARYLVSTK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EVGEEVISTLQILPTVREDSGFFSCHAINSYGEDRGIIQLTVQEPPDPPEIEIKDVKART
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ITLRWTMGFDGNSPITGYDIECKNKSDSWDSAQRTKDVSPQLNSATIIDIHPSSTYSIRM
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YAKNRIGKSEPSNELTITADEAAPDGPPQEVHLEPISSQSIRVTWKAPKKHLQNGIIRGY
970 980 990 1000 1010 1020
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QIGYREYSTGGNFQFNIISVDTSGDSEVYTLDNLNKFTQYGLVVQACNRAGTGPSSQEII
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TTTLEDVPSYPPENVQAIATSPESISISWSTLSKEALNGILQGFRVIYWANLMDGELGEI
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KNITTTQPSLELDGLEKYTNYSIQVLAFTRAGDGVRSEQIFTRTKEDVPGPPAGVKAAAA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SASMVFVSWLPPLKLNGIIRKYTVFCSHPYPTVISEFEASPDSFSYRIPNLSRNRQYSVW
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VVAVTSAGRGNSSEIITVEPLAKAPARILTFSGTVTTPWMKDIVLPCKAVGDPSPAVKWM
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KDSNGTPSLVTIDGRRSIFSNGSFIIRTVKAEDSGYYSCIANNNWGSDEIILNLQVQVPP
1330 1340 1350 1360 1370 1380
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pF1KB3 DQPRLTVSKTTSSSITLSWLPGDNGGSSIRGYILQYSEDNSEQWGSFPISPSERSYRLEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DQPRLTVSKTTSSSITLSWLPGDNGGSSIRGYILQYSEDNSEQWGSFPISPSERSYRLEN
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LKCGTWYKFTLTAQNGVGPGRISEIIEAKTLGKEPQFSKEQELFASINTTRVRLNLIGWN
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KB3 DGGCPITSFTLEYRPFGTTVWTTAQRTSLSKSYILYDLQEATWYELQMRVCNSAGCAEKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DGGCPITSFTLEYRPFGTTVWTTAQRTSLSKSYILYDLQEATWYELQMRVCNSAGCAEKQ
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KB3 ANFATLNYDGSTIPPLIKSVVQNEEGLTTNEGLKMLVTISCILVGVLLLFVLLLVVRRRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ANFATLNYDGSTIPPLIKSVVQNEEGLTTNEGLKMLVTISCILVGVLLLFVLLLVVRRRR
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KB3 REQRLKRLRDAKSLAEMLMSKNTRTSDTLSKQQQTLRMHIDIPRAQLLIEERDTMETIDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 REQRLKRLRDAKSLAEMLMSKNTRTSDTLSKQQQTLRMHIDIPRAQLLIEERDTMETIDD
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KB3 RSTVLLTDADFGEAAKQKSLTVTHTVHYQSVSQATGPLVDVSDARPGTNPTTRRNAKAGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RSTVLLTDADFGEAAKQKSLTVTHTVHYQSVSQATGPLVDVSDARPGTNPTTRRNAKAGP
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1750 1760 1770 1780 1790 1800
pF1KB3 TARNRYASQWTLNRPHPTISAHTLTTDWRLPTPRAAGSVDKESDSYSVSPSQDTDRARSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TARNRYASQWTLNRPHPTISAHTLTTDWRLPTPRAAGSVDKESDSYSVSPSQDTDRARSS
1750 1760 1770 1780 1790 1800
1810 1820 1830 1840 1850 1860
pF1KB3 MVSTESASSTYEELARAYEHAKMEEQLRHAKFTITECFISDTSSEQLTAGTNEYTDSLTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MVSTESASSTYEELARAYEHAKMEEQLRHAKFTITECFISDTSSEQLTAGTNEYTDSLTS
1810 1820 1830 1840 1850 1860
1870 1880 1890 1900 1910 1920
pF1KB3 STPSESGICRFTASPPKPQDGGRVMNMAVPKAHRPGDLIHLPPYLRMDFLLNRGGPGTSR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::
NP_001 STPSESGICRFTASPPKPQDGGRVMNMAVPKAHRPG------------------GPGTSR
1870 1880 1890 1900
1930 1940 1950 1960 1970 1980
pF1KB3 DLSLGQACLEPQKSRTLKRPTVLEPIPMEAASSASSTREGQSWQPGAVATLPQREGAELG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DLSLGQACLEPQKSRTLKRPTVLEPIPMEAASSASSTREGQSWQPGAVATLPQREGAELG
1910 1920 1930 1940 1950 1960
1990 2000 2010
pF1KB3 QAAKMSSSQESLLDSRGHLKGNNPYAKSYTLV
::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QAAKMSSSQESLLDSRGHLKGNNPYAKSYTLV
1970 1980 1990
>>XP_016883770 (OMIM: 602523) PREDICTED: Down syndrome c (1776 aa)
initn: 11733 init1: 11733 opt: 11733 Z-score: 6105.8 bits: 1143.1 E(85289): 0
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210 220 230 240 250 260
pF1KB3 TRQSNSARLFVSDPANSAPSILDGFEHRKAMAGQRVELPCKALGHPEPDYRWLKDNMPLE
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MAGQRVELPCKALGHPEPDYRWLKDNMPLE
10 20 30
270 280 290 300 310 320
pF1KB3 LSGRFQKTVTGLLIENIRPSDSGSYVCEVSNRYGTAKVIGRLYVKQPLKATISPRKVKSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LSGRFQKTVTGLLIENIRPSDSGSYVCEVSNRYGTAKVIGRLYVKQPLKATISPRKVKSS
40 50 60 70 80 90
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pF1KB3 VGSQVSLSCSVTGTEDQELSWYRNGEILNPGKNVRITGINHENLIMDHMVKSDGGAYQCF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VGSQVSLSCSVTGTEDQELSWYRNGEILNPGKNVRITGINHENLIMDHMVKSDGGAYQCF
100 110 120 130 140 150
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pF1KB3 VRKDKLSAQDYVQVVLEDGTPKIISAFSEKVVSPAEPVSLMCNVKGTPLPTITWTLDDDP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VRKDKLSAQDYVQVVLEDGTPKIISAFSEKVVSPAEPVSLMCNVKGTPLPTITWTLDDDP
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pF1KB3 ILKGGSHRISQMITSEGNVVSYLNISSSQVRDGGVYRCTANNSAGVVLYQARINVRGPAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ILKGGSHRISQMITSEGNVVSYLNISSSQVRDGGVYRCTANNSAGVVLYQARINVRGPAS
220 230 240 250 260 270
510 520 530 540 550 560
pF1KB3 IRPMKNITAIAGRDTYIHCRVIGYPYYSIKWYKNSNLLPFNHRQVAFENNGTLKLSDVQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 IRPMKNITAIAGRDTYIHCRVIGYPYYSIKWYKNSNLLPFNHRQVAFENNGTLKLSDVQK
280 290 300 310 320 330
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pF1KB3 EVDEGEYTCNVLVQPQLSTSQSVHVTVKVPPFIQPFEFPRFSIGQRVFIPCVVVSGDLPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EVDEGEYTCNVLVQPQLSTSQSVHVTVKVPPFIQPFEFPRFSIGQRVFIPCVVVSGDLPI
340 350 360 370 380 390
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pF1KB3 TITWQKDGRPIPGSLGVTIDNIDFTSSLRISNLSLMHNGNYTCIARNEAAAVEHQSQLIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TITWQKDGRPIPGSLGVTIDNIDFTSSLRISNLSLMHNGNYTCIARNEAAAVEHQSQLIV
400 410 420 430 440 450
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pF1KB3 RVPPKFVVQPRDQDGIYGKAVILNCSAEGYPVPTIVWKFSKGAGVPQFQPIALNGRIQVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RVPPKFVVQPRDQDGIYGKAVILNCSAEGYPVPTIVWKFSKGAGVPQFQPIALNGRIQVL
460 470 480 490 500 510
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pF1KB3 SNGSLLIKHVVEEDSGYYLCKVSNDVGADVSKSMYLTVKIPAMITSYPNTTLATQGQKKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SNGSLLIKHVVEEDSGYYLCKVSNDVGADVSKSMYLTVKIPAMITSYPNTTLATQGQKKE
520 530 540 550 560 570
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pF1KB3 MSCTAHGEKPIIVRWEKEDRIINPEMARYLVSTKEVGEEVISTLQILPTVREDSGFFSCH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MSCTAHGEKPIIVRWEKEDRIINPEMARYLVSTKEVGEEVISTLQILPTVREDSGFFSCH
580 590 600 610 620 630
870 880 890 900 910 920
pF1KB3 AINSYGEDRGIIQLTVQEPPDPPEIEIKDVKARTITLRWTMGFDGNSPITGYDIECKNKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AINSYGEDRGIIQLTVQEPPDPPEIEIKDVKARTITLRWTMGFDGNSPITGYDIECKNKS
640 650 660 670 680 690
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pF1KB3 DSWDSAQRTKDVSPQLNSATIIDIHPSSTYSIRMYAKNRIGKSEPSNELTITADEAAPDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DSWDSAQRTKDVSPQLNSATIIDIHPSSTYSIRMYAKNRIGKSEPSNELTITADEAAPDG
700 710 720 730 740 750
990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KB3 PPQEVHLEPISSQSIRVTWKAPKKHLQNGIIRGYQIGYREYSTGGNFQFNIISVDTSGDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PPQEVHLEPISSQSIRVTWKAPKKHLQNGIIRGYQIGYREYSTGGNFQFNIISVDTSGDS
760 770 780 790 800 810
1050 1060 1070 1080 1090 1100
pF1KB3 EVYTLDNLNKFTQYGLVVQACNRAGTGPSSQEIITTTLEDVPSYPPENVQAIATSPESIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EVYTLDNLNKFTQYGLVVQACNRAGTGPSSQEIITTTLEDVPSYPPENVQAIATSPESIS
820 830 840 850 860 870
1110 1120 1130 1140 1150 1160
pF1KB3 ISWSTLSKEALNGILQGFRVIYWANLMDGELGEIKNITTTQPSLELDGLEKYTNYSIQVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ISWSTLSKEALNGILQGFRVIYWANLMDGELGEIKNITTTQPSLELDGLEKYTNYSIQVL
880 890 900 910 920 930
1170 1180 1190 1200 1210 1220
pF1KB3 AFTRAGDGVRSEQIFTRTKEDVPGPPAGVKAAAASASMVFVSWLPPLKLNGIIRKYTVFC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AFTRAGDGVRSEQIFTRTKEDVPGPPAGVKAAAASASMVFVSWLPPLKLNGIIRKYTVFC
940 950 960 970 980 990
1230 1240 1250 1260 1270 1280
pF1KB3 SHPYPTVISEFEASPDSFSYRIPNLSRNRQYSVWVVAVTSAGRGNSSEIITVEPLAKAPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SHPYPTVISEFEASPDSFSYRIPNLSRNRQYSVWVVAVTSAGRGNSSEIITVEPLAKAPA
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1290 1300 1310 1320 1330 1340
pF1KB3 RILTFSGTVTTPWMKDIVLPCKAVGDPSPAVKWMKDSNGTPSLVTIDGRRSIFSNGSFII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RILTFSGTVTTPWMKDIVLPCKAVGDPSPAVKWMKDSNGTPSLVTIDGRRSIFSNGSFII
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1350 1360 1370 1380 1390 1400
pF1KB3 RTVKAEDSGYYSCIANNNWGSDEIILNLQVQVPPDQPRLTVSKTTSSSITLSWLPGDNGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 RTVKAEDSGYYSCIANNNWGSDEIILNLQVQVPPDQPRLTVSKTTSSSITLSWLPGDNGG
1120 1130 1140 1150 1160 1170
1410 1420 1430 1440 1450 1460
pF1KB3 SSIRGYILQYSEDNSEQWGSFPISPSERSYRLENLKCGTWYKFTLTAQNGVGPGRISEII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SSIRGYILQYSEDNSEQWGSFPISPSERSYRLENLKCGTWYKFTLTAQNGVGPGRISEII
1180 1190 1200 1210 1220 1230
1470 1480 1490 1500 1510 1520
pF1KB3 EAKTLGKEPQFSKEQELFASINTTRVRLNLIGWNDGGCPITSFTLEYRPFGTTVWTTAQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EAKTLGKEPQFSKEQELFASINTTRVRLNLIGWNDGGCPITSFTLEYRPFGTTVWTTAQR
1240 1250 1260 1270 1280 1290
1530 1540 1550 1560 1570 1580
pF1KB3 TSLSKSYILYDLQEATWYELQMRVCNSAGCAEKQANFATLNYDGSTIPPLIKSVVQNEEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TSLSKSYILYDLQEATWYELQMRVCNSAGCAEKQANFATLNYDGSTIPPLIKSVVQNEEG
1300 1310 1320 1330 1340 1350
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XP_016 LTTNEGLKMLVTISCILVGVLLLFVLLLVVRRRRREQRLKRLRDAKSLAEMLMSKNTRTS
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XP_016 DTLSKQQQTLRMHIDIPRAQLLIEERDTMETIDDRSTVLLTDADFGEAAKQKSLTVTHTV
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XP_016 HYQSVSQATGPLVDVSDARPGTNPTTRRNAKAGPTARNRYASQWTLNRPHPTISAHTLTT
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XP_016 DWRLPTPRAAGSVDKESDSYSVSPSQDTDRARSSMVSTESASSTYEELARAYEHAKMEEQ
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XP_016 MAVPKAHRPGDLIHLPPYLRMDFLLNRGGPGTSRDLSLGQACLEPQKSRTLKRPTVLEPI
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PMEAASSASSTREGQSWQPGAVATLPQREGAELGQAAKMSSSQESLLDSRGHLKGNNPYA
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2010
pF1KB3 KSYTLV
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XP_016 KSYTLV
>>NP_065744 (OMIM: 611782) Down syndrome cell adhesion m (2113 aa)
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10 20
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::... : :..:. .. ::. .::::::
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:::.:.:.:..:..::::::: : ..::::::::..::::: ::::: :::::..:: ::
NP_065 SLQQVTFSSSVGVVVPCPAAGSPSAALRWYLATGDDIYDVPHIRHVHANGTLQLYPFSPS
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.:...:::: :.::::: .::::: ....:::.:::::::::::..::::::::::.:::
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::. :..::::::::::.. ::.:: :.:::.:::.::.: .:::::.:.:.:::::
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:. : .::: : ..: :::.:.:::.: .:.:.. : :.: .::..:..:.:.:...::
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.:::.. ..::::::.:.:.::::::.:.: :::: .::.: ::.::.:::.::..
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:::: :.::.::::: ::::::.:::::.::::::: :::: ..::::: :::.:: ::
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pF1KB3 PKFVVQPRDQDGIYGKAVILNCSAEGYPVPTIVWKFSKGAGVPQ-FQPIALNGRIQVLSN
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pF1KB3 GSLLIKHVVEEDSGYYLCKVSNDVGADVSKSMYLTVKIPAMITSYPNTTLATQGQKKEMS
.::::.::.::: :::::..:: ::.:.::::.:::::::::::.::::.: .:. ::..
NP_065 SSLLIRHVLEEDIGYYLCQASNGVGTDISKSMFLTVKIPAMITSHPNTTIAIKGHAKELN
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pF1KB3 CTAHGEKPIIVRWEKEDRIINPE-MARYLVSTKEVGEEVISTLQILPTVREDSGFFSCHA
:::.::.:::.:::: : .:.:. . :: ..::. :.::.:::.. :. : :: ::::::
NP_065 CTARGERPIIIRWEKGDTVIDPDRVMRYAIATKDNGDEVVSTLKLKPADRGDSVFFSCHA
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pF1KB3 INSYGEDRGIIQLTVQEPPDPPEIEIKDVKARTITLRWTMGFDGNSPITGYDIECKNKSD
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NP_065 INSYGEDRGLIQLTVQEPPDPPELEIREVKARSMNLRWTQRFDGNSIITGFDIEYKNKSD
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::: : :...:: .:.:.:.:.::.:.::::::. :.::.::::.::::...:::::::
NP_065 SWDFKQSTRNISPTINQANIVDLHPASVYSIRMYSFNKIGRSEPSKELTISTEEAAPDGP
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pF1KB3 PQEVHLEPISSQSIRVTWKAPKKHLQNGIIRGYQIGYREYSTGGNFQFNIISVDTSGDSE
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NP_065 PMDVTLQPVTSQSIQVTWKAPKKELQNGVIRGYQIGYRENSPGSNGQYSIVEMKATGDSE
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pF1KB3 VYTLDNLNKFTQYGLVVQACNRAGTGPSSQEIITTTLEDVPSYPPENVQAIATSPESISI
:::::::.::.:::.:::: :::::::::.:: .:::::::: :::::.:.. . . :
NP_065 VYTLDNLKKFAQYGVVVQAFNRAGTGPSSSEINATTLEDVPSQPPENVRALSITSDVAVI
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1110 1120 1130 1140 1150 1160
pF1KB3 SWSTLSKEALNGILQGFRVIYWANLMDGELGEIKNITTTQPSLELDGLEKYTNYSIQVLA
::: . .:::.:.:.:::.:. .::: ::..:::::. .:: :.::.::::.::::
NP_065 SWSEPPRSTLNGVLKGYRVIFWSLYVDGEWGEMQNITTTRERVELRGMEKFTNYSVQVLA
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pF1KB3 FTRAGDGVRSEQIFTRTKEDVPGPPAGVKAAAASASMVFVSWLPPLKLNGIIRKYTVFCS
.:.::::::: .. .:::::::::::.::. .::: : :::::: : ::.:::::.:::
NP_065 YTQAGDGVRSSVLYIQTKEDVPGPPAGIKAVPSSASSVVVSWLPPTKPNGVIRKYTIFCS
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pF1KB3 HP---YPTVISEFEASPDSFSYRIPNLSRNRQYSVWVVAVTSAGRGNSSEIITVEPLAKA
: :. ::.:.::... ::: .:.:..:: .::.:::::::::::: .:.:: .::
NP_065 SPGSGQPAP-SEYETSPEQLFYRIAHLNRGQQYLLWVAAVTSAGRGNSSEKVTIEPAGKA
1290 1300 1310 1320 1330 1340
1290 1300 1310 1320 1330 1340
pF1KB3 PARILTFSGTVTTPWMKDIVLPCKAVGDPSPAVKWMKDSNGTPSLVTIDGRRSIFSNGSF
::.:..:.::::::::::. :::..::::.::::: :::. . :..::.: : .::..
NP_065 PAKIISFGGTVTTPWMKDVRLPCNSVGDPAPAVKWTKDSEDSAIPVSMDGHRLIHTNGTL
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pF1KB3 IIRTVKAEDSGYYSCIANNNWGSDEIILNLQVQVPPDQPRLTVSKTTSSSITLSWLPGDN
..:.:::::::::.: :.:. : : ::.:: :::::::::::::::..:::::.:.::::
NP_065 LLRAVKAEDSGYYTCTATNTGGFDTIIVNLLVQVPPDQPRLTVSKTSASSITLTWIPGDN
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1410 1420 1430 1440 1450 1460
pF1KB3 GGSSIRGYILQYSEDNSEQWGSFPISPSERSYRLENLKCGTWYKFTLTAQNGVGPGRISE
:::::::..:::: ::::.: . :: ::::..:..:::::::: :.:.:.:: :::::
NP_065 GGSSIRGFVLQYSVDNSEEWKDVFISSSERSFKLDSLKCGTWYKVKLAAKNSVGSGRISE
1470 1480 1490 1500 1510 1520
1470 1480 1490 1500 1510 1520
pF1KB3 IIEAKTLGKEPQFSKEQELFASINTTRVRLNLIGWNDGGCPITSFTLEYRPFGTTVWTTA
:::::: :.::.:::.:.::. ::.:..:::: :::.::::::...::::: :: .: .
NP_065 IIEAKTHGREPSFSKDQHLFTHINSTHARLNLQGWNNGGCPITAIVLEYRPKGTWAWQ-G
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pF1KB3 QRTSLSKSYILYDLQEATWYELQMRVCNSAGCAEKQANFATLNYDGSTIPPLIKSVVQNE
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NP_065 LRANSSGEVFLTELREATWYELRMRACNSAGCGNETAQFATLDYDGSTIPP-IKSA-QGE
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pF1KB3 EGLTTNEGLKMLVTISCILVGVLLLFVLLLVVRRRRREQRLKRLRDAKSLAEMLMSKNTR
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NP_065 -----GDDVKKLFTIGCPVILATLGVALLFIVRKKRKEKRLKRLRDAKSLAEMLISKNNR
1650 1660 1670 1680 1690 1700
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pF1KB3 TSDTLSK-QQQTLRMHIDIPRAQLLIEERDTMETI-DDRSTVLLTDADFGEAAKQKSLTV
. :: : : :.::::::.:::::... .. . ::..:. .:::.:..:.. .:. .
NP_065 SFDTPVKGPPQGPRLHIDIPRVQLLIEDKEGIKQLGDDKATIPVTDAEFSQAVNPQSFCT
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pF1KB3 THTVHYQSVSQATGPLVDVSDARPGTNPTTRRNAKAGPTARNRYASQWTLNRPHPTISAH
..:. .. :.::::.:.:: ::::::..:.:.:.. ..::::.:::::.. . . :.
NP_065 GVSLHHPTLIQSTGPLIDMSDIRPGTNPVSRKNVKSAHSTRNRYSSQWTLTKCQASTPAR
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pF1KB3 TLTTDWRLPTPRAAGSVDKESDSYSVSPSQDTDRARSSMVSTESASSTYEELARAYEHAK
:::.::: . : . ::::::.: :::::..:.:::::::::::::::::::::::
NP_065 TLTSDWRT-VGSQHGVTVTESDSYSASLSQDTDKGRNSMVSTESASSTYEELARAYEHAK
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pF1KB3 MEEQLRHAKFTITECFISDTSSEQLTAGTNEYTDSLTS-STPSESGICRFTASPPKPQDG
.::::.:::: ::::::::.::.:.:.:::: .::.:: ::::: ::::::::::::::.
NP_065 LEEQLQHAKFEITECFISDSSSDQMTTGTNENADSMTSMSTPSEPGICRFTASPPKPQDA
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pF1KB3 GRVMNMAVPKAHRPG--DLIHLPPYLRMDFLLNRGGPGTSRDLSLGQAC--LEPQKS--R
: :.::: :: . : .:: : . . .. : . : . : . :... :
NP_065 DRGKNVAVPIPHRANKSDYCNLPLYAKSEAFF-RKADGR-------EPCPVVPPREASIR
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1940 1950 1960 1970 1980 1990
pF1KB3 TLKRP--TVLEPIPMEAASSASSTREGQSWQPGAVATLPQREGAELGQAAKMSSSQESLL
.: : : . . .. ::.. . . . ...::::::
NP_065 NLARTYHTQARHLTLDPASKSLGLPHPGAPAAASTATLPQRTLAMPAPPAGTAPPAPGPT
2000 2010 2020 2030 2040 2050
2000 2010
pF1KB3 DSRGHLKGNNPYAKSYTLV
NP_065 PAEPPTAPSAAPPAPSTEPPRAGGPHTKMGGSRDSLLEMSTSGVGRSQKQGAGAYSKSYT
2060 2070 2080 2090 2100 2110
>>XP_011541220 (OMIM: 611782) PREDICTED: Down syndrome c (1977 aa)
initn: 5296 init1: 1862 opt: 7227 Z-score: 3768.8 bits: 710.9 E(85289): 3.5e-203
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pF1KB3 TGEEIYDVPGIRHVHPNGTLQIFPFPPSSFSTLIHDNTYYCTAENPSGKIRSQDVHIKAV
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XP_011 MTPCSSFIHDNDYFCTAENAAGKIRSPNIRVKAV
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pF1KB3 LREPYTVRVEDQKTMRGNVAVFKCIIPSSVEAYITVVSWEKDTVSLVSGSRFLITSTGAL
.:::::::::::..::::::::::.:::::. :..::::::::::.. ::.:: :.:
XP_011 FREPYTVRVEDQRSMRGNVAVFKCLIPSSVQEYVSVVSWEKDTVSIIPEHRFFITYHGGL
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pF1KB3 YIKDVQNEDGLYNYRCITRHRYTGETRQSNSARLFVS------------DPANSAPSILD
::.:::.::.: .:::::.:.:.:::::::.::: :. :::.: :.:::
XP_011 YISDVQKEDALSTYRCITKHKYSGETRQSNGARLSVTGLARAADPLCLPDPAESIPTILD
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pF1KB3 GFEHRKAMAGQRVELPCKALGHPEPDYRWLKDNMPLELSGRFQKTVTGLLIENIRPSDSG
::. ... ::. ::::: : :.: : :::::. :: ..:. : .::: : ..: :::
XP_011 GFHSQEVWAGHTVELPCTASGYPIPAIRWLKDGRPLPADSRWTKRITGLTISDLRTEDSG
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pF1KB3 SYVCEVSNRYGTAKVIGRLYVKQPLKATISPRKVKSSVGSQVSLSCSVTGTEDQELSWYR
.:.:::.: .:.:.. : :.: .::..:..:.:.:...:: : :::..::. . . :::
XP_011 TYICEVTNTFGSAEATGILMVIDPLHVTLTPKKLKTGIGSTVILSCALTGSPEFTIRWYR
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pF1KB3 NGEILNPGKNVRITGINHENLIMDHMVKSDGGAYQCFVRKDKLSAQDYVQVVLEDGTPKI
: :.. : . . : :...:.:.. :: .::::::. . .:::.. ..::::::.:
XP_011 NTELVLPDEAISIRGLSNETLLITSAQKSHSGAYQCFATRKAQTAQDFAIIALEDGTPRI
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pF1KB3 ISAFSEKVVSPAEPVSLMCNVKGTPLPTITWTLDDDPILKGGSHRISQMITSEGNVVSYL
.:.::::::.:.: :::: .::.: ::.::.:::.::.. :::: .:. :.:...:..
XP_011 VSSFSEKVVNPGEQFSLMCAAKGAPPPTVTWALDDEPIVRDGSHRTNQYTMSDGTTISHM
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pF1KB3 NISSSQVRDGGVYRCTANNSAGVVLYQARINVRGPASIRPMKNITAIAGRDTYIHCRVIG
:... :.:::::::::: : .: . :::::::::: ::: :.::::.::::: :.:::::
XP_011 NVTGPQIRDGGVYRCTARNLVGSAEYQARINVRGPPSIRAMRNITAVAGRDTLINCRVIG
400 410 420 430 440 450
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pF1KB3 YPYYSIKWYKNSNLLPFNHRQVAFENNGTLKLSDVQKEVDEGEYTCNVLVQPQLSTSQSV
::::::::::.. ::: :::::.::: :::::.:::: .::::: :.::.::::: ::::
XP_011 YPYYSIKWYKDALLLPDNHRQVVFEN-GTLKLTDVQKGMDEGEYLCSVLIQPQLSISQSV
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:::.:::::... .. . ::..:. .:::.:..:.. .:. . ..:. .. :.::::.:
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2010
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pF1KB3 SMYLTVKIPAMITSYPNTTLATQGQKKEMSCTAHGEKPIIVRWEKEDRIINPE-MARYLV
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XP_011 SMFLTVKIPAMITSHPNTTIAIKGHAKELNCTARGERPIIIRWEKGDTVIDPDRVMRYAI
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pF1KB3 EIITTTLEDVPSYPPENVQAIATSPESISISWSTLSKEALNGILQGFRVIYWANLMDGEL
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pF1KB3 GEIKNITTTQPSLELDGLEKYTNYSIQVLAFTRAGDGVRSEQIFTRTKEDVPGPPAGVKA
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XP_011 GEMQNITTTRERVELRGMEKFTNYSVQVLAYTQAGDGVRSSVLYIQTKEDVPGPPAGIKA
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pF1KB3 QVQVPPDQPRLTVSKTTSSSITLSWLPGDNGGSSIRGYILQYSEDNSEQWGSFPISPSER
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XP_011 LVQVPPDQPRLTVSKTSASSITLTWIPGDNGGSSIRGFVLQYSVDNSEEWKDVFISSSER
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pF1KB3 SYRLENLKCGTWYKFTLTAQNGVGPGRISEIIEAKTLGKEPQFSKEQELFASINTTRVRL
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::... :.::::.:::::::: :::. :.: .. .: : ::.: .. . : .::.
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.. . ::..:. .:::.:..:.. .:. . ..:. .. :.::::.:.:: ::::::..
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:.:.:.. ..::::.:::::.. . . :.:::.::: . : . ::::::.: ::
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:::..:.:::::::::::::::::::::::.::::.:::: ::::::::.::.:.:.:::
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.. : . : . : . :... :.: : : . . .. ::.. . . .
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. . .: ::::::.: :::::..:.:::::::::::::::::::::::.::::.::::
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XP_011 HRANKSDYCNLPLYAKSEAFF-RKADGR-------EPCPVVPPREASIRNLARTYHTQAR
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pF1KB3 PIPMEAASSASSTREGQSWQPGAVATLPQREGAELGQAAKMSSSQESLLDSRGHLKGNNP
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>>XP_011541226 (OMIM: 611782) PREDICTED: Down syndrome c (1270 aa)
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pF1KB3 VVEEDSGYYLCKVSNDVGADVSKSMYLTVKIPAMITSYPNTTLATQGQKKEMSCTAHGEK
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XP_011 PIIIRWEKGDTVIDPDRVMRYAIATKDNGDEVVSTLKLKPADRGDSVFFSCHAINSYGED
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pF1KB3 RGIIQLTVQEPPDPPEIEIKDVKARTITLRWTMGFDGNSPITGYDIECKNKSDSWDSAQR
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XP_011 RGLIQLTVQEPPDPPELEIREVKARSMNLRWTQRFDGNSIITGFDIEYKNKSDSWDFKQS
100 110 120 130 140 150
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pF1KB3 TKDVSPQLNSATIIDIHPSSTYSIRMYAKNRIGKSEPSNELTITADEAAPDGPPQEVHLE
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XP_011 TRNISPTINQANIVDLHPASVYSIRMYSFNKIGRSEPSKELTISTEEAAPDGPPMDVTLQ
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XP_011 PVTSQSIQVTWKAPKKELQNGVIRGYQIGYRENSPGSNGQYSIVEMKATGDSEVYTLDNL
220 230 240 250 260 270
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XP_011 KKFAQYGVVVQAFNRAGTGPSSSEINATTLEDVPSQPPENVRALSITSDVAVISWSEPPR
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XP_011 STLNGVLKGYRVIFWSLYVDGEWGEMQNITTTRERVELRGMEKFTNYSVQVLAYTQAGDG
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pF1KB3 VRSEQIFTRTKEDVPGPPAGVKAAAASASMVFVSWLPPLKLNGIIRKYTVFCSHPYP--T
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XP_011 VRSSVLYIQTKEDVPGPPAGIKAVPSSASSVVVSWLPPTKPNGVIRKYTIFCSSPGSGQP
400 410 420 430 440 450
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pF1KB3 VISEFEASPDSFSYRIPNLSRNRQYSVWVVAVTSAGRGNSSEIITVEPLAKAPARILTFS
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XP_011 APSEYETSPEQLFYRIAHLNRGQQYLLWVAAVTSAGRGNSSEKVTIEPAGKAPAKIISFG
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pF1KB3 GTVTTPWMKDIVLPCKAVGDPSPAVKWMKDSNGTPSLVTIDGRRSIFSNGSFIIRTVKAE
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XP_011 GTVTTPWMKDVRLPCNSVGDPAPAVKWTKDSEDSAIPVSMDGHRLIHTNGTLLLRAVKAE
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pF1KB3 DSGYYSCIANNNWGSDEIILNLQVQVPPDQPRLTVSKTTSSSITLSWLPGDNGGSSIRGY
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XP_011 DSGYYTCTATNTGGFDTIIVNLLVQVPPDQPRLTVSKTSASSITLTWIPGDNGGSSIRGF
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pF1KB3 ILQYSEDNSEQWGSFPISPSERSYRLENLKCGTWYKFTLTAQNGVGPGRISEIIEAKTLG
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XP_011 VLQYSVDNSEEWKDVFISSSERSFKLDSLKCGTWYKVKLAAKNSVGSGRISEIIEAKTHG
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XP_011 REPSFSKDQHLFTHINSTHARLNLQGWNNGGCPITAIVLEYRPKGTWAWQ-GLRANSSGE
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XP_011 VFLTELREATWYELRMRACNSAGCGNETAQFATLDYDGSTIPP-IKSA-QGE-----GDD
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XP_011 VKKLFTIGCPVILATLGVALLFIVRKKRKEKRLKRLRDAKSLAEMLISKNNRSFDTPVKG
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pF1KB3 VSQATGPLVDVSDARPGTNPTTRRNAKAGPTARNRYASQWTLNRPHPTISAHTLTTDWRL
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XP_011 LIQSTGPLIDMSDIRPGTNPVSRKNVKSAHSTRNRYSSQWTLTKCQASTPARTLTSDWRT
930 940 950 960 970 980
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pF1KB3 PTPRAAGSVDKESDSYSVSPSQDTDRARSSMVSTESASSTYEELARAYEHAKMEEQLRHA
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XP_011 -VGSQHGVTVTESDSYSASLSQDTDKGRNSMVSTESASSTYEELARAYEHAKLEEQLQHA
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