FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB3827, 1168 aa 1>>>pF1KB3827 1168 - 1168 aa - 1168 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6914+/-0.000955; mu= 16.9069+/- 0.058 mean_var=121.9972+/-24.569, 0's: 0 Z-trim(109.0): 22 B-trim: 4 in 1/50 Lambda= 0.116118 statistics sampled from 10605 (10615) to 10605 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.669), E-opt: 0.2 (0.326), width: 16 Scan time: 5.340 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS7559.1 SORCS1 gene_id:114815|Hs108|chr10 (1168) 7858 1328.5 0 CCDS7558.1 SORCS3 gene_id:22986|Hs108|chr10 (1222) 5064 860.4 0 CCDS47008.1 SORCS2 gene_id:57537|Hs108|chr4 (1159) 3301 565.1 3.5e-160 CCDS798.1 SORT1 gene_id:6272|Hs108|chr1 ( 831) 801 146.2 3.2e-34 CCDS55618.1 SORT1 gene_id:6272|Hs108|chr1 ( 694) 755 138.4 5.8e-32 CCDS8436.1 SORL1 gene_id:6653|Hs108|chr11 (2214) 652 121.5 2.2e-26 >>CCDS7559.1 SORCS1 gene_id:114815|Hs108|chr10 (1168 aa) initn: 7858 init1: 7858 opt: 7858 Z-score: 7115.0 bits: 1328.5 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 7858; 100.0% identity (100.0% similar) in 1168 aa overlap (1-1168:1-1168) 10 20 30 40 50 60 pF1KB3 MGKVGAGGGSQARLSALLAGAGLLILCAPGVCGGGSCCPSPHPSSAPRSASTPRGFSHQG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS75 MGKVGAGGGSQARLSALLAGAGLLILCAPGVCGGGSCCPSPHPSSAPRSASTPRGFSHQG 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB3 RPGRAPATPLPLVVRPLFSVAPGDRALSLERARGTGASMAVAARSGRRRRSGADQEKAER :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS75 RPGRAPATPLPLVVRPLFSVAPGDRALSLERARGTGASMAVAARSGRRRRSGADQEKAER 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB3 GEGASRSPRGVLRDGGQQEPGTRERDPDKATRFRMEELRLTSTTFALTGDSAHNQAMVHW :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS75 GEGASRSPRGVLRDGGQQEPGTRERDPDKATRFRMEELRLTSTTFALTGDSAHNQAMVHW 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KB3 SGHNSSVILILTKLYDYNLGSITESSLWRSTDYGTTYEKLNDKVGLKTILSYLYVCPTNK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS75 SGHNSSVILILTKLYDYNLGSITESSLWRSTDYGTTYEKLNDKVGLKTILSYLYVCPTNK 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KB3 RKIMLLTDPEIESSLLISSDEGATYQKYRLNFYIQSLLFHPKQEDWILAYSQDQKLYSSA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS75 RKIMLLTDPEIESSLLISSDEGATYQKYRLNFYIQSLLFHPKQEDWILAYSQDQKLYSSA 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KB3 EFGRRWQLIQEGVVPNRFYWSVMGSNKEPDLVHLEARTVDGHSHYLTCRMQNCTEANRNQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS75 EFGRRWQLIQEGVVPNRFYWSVMGSNKEPDLVHLEARTVDGHSHYLTCRMQNCTEANRNQ 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KB3 PFPGYIDPDSLIVQDHYVFVQLTSGGRPHYYVSYRRNAFAQMKLPKYALPKDMHVISTDE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS75 PFPGYIDPDSLIVQDHYVFVQLTSGGRPHYYVSYRRNAFAQMKLPKYALPKDMHVISTDE 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KB3 NQVFAAVQEWNQNDTYNLYISDTRGVYFTLALENVQSSRGPEGNIMIDLYEVAGIKGMFL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS75 NQVFAAVQEWNQNDTYNLYISDTRGVYFTLALENVQSSRGPEGNIMIDLYEVAGIKGMFL 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KB3 ANKKIDNQVKTFITYNKGRDWRLLQAPDTDLRGDPVHCLLPYCSLHLHLKVSENPYTSGI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS75 ANKKIDNQVKTFITYNKGRDWRLLQAPDTDLRGDPVHCLLPYCSLHLHLKVSENPYTSGI 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 pF1KB3 IASKDTAPSIIVASGNIGSELSDTDISMFVSSDAGNTWRQIFEEEHSVLYLDQGGVLVAM :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS75 IASKDTAPSIIVASGNIGSELSDTDISMFVSSDAGNTWRQIFEEEHSVLYLDQGGVLVAM 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 pF1KB3 KHTSLPIRHLWLSFDEGRSWSKYSFTSIPLFVDGVLGEPGEETLIMTVFGHFSHRSEWQL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS75 KHTSLPIRHLWLSFDEGRSWSKYSFTSIPLFVDGVLGEPGEETLIMTVFGHFSHRSEWQL 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 pF1KB3 VKVDYKSIFDRRCAEEDYRPWQLHSQGEACIMGAKRIYKKRKSERKCMQGKYAGAMESEP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS75 VKVDYKSIFDRRCAEEDYRPWQLHSQGEACIMGAKRIYKKRKSERKCMQGKYAGAMESEP 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 pF1KB3 CVCTEADFDCDYGYERHSNGQCLPAFWFNPSSLSKDCSLGQSYLNSTGYRKVVSNNCTDG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS75 CVCTEADFDCDYGYERHSNGQCLPAFWFNPSSLSKDCSLGQSYLNSTGYRKVVSNNCTDG 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 840 pF1KB3 VREQYTAKPQKCPGKAPRGLRIVTADGKLTAEQGHNVTLMVQLEEGDVQRTLIQVDFGDG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS75 VREQYTAKPQKCPGKAPRGLRIVTADGKLTAEQGHNVTLMVQLEEGDVQRTLIQVDFGDG 790 800 810 820 830 840 850 860 870 880 890 900 pF1KB3 IAVSYVNLSSMEDGIKHVYQNVGIFRVTVQVDNSLGSDSAVLYLHVTCPLEHVHLSLPFV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS75 IAVSYVNLSSMEDGIKHVYQNVGIFRVTVQVDNSLGSDSAVLYLHVTCPLEHVHLSLPFV 850 860 870 880 890 900 910 920 930 940 950 960 pF1KB3 TTKNKEVNATAVLWPSQVGTLTYVWWYGNNTEPLITLEGSISFRFTSEGMNTITVQVSAG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS75 TTKNKEVNATAVLWPSQVGTLTYVWWYGNNTEPLITLEGSISFRFTSEGMNTITVQVSAG 910 920 930 940 950 960 970 980 990 1000 1010 1020 pF1KB3 NAILQDTKTIAVYEEFRSLRLSFSPNLDDYNPDIPEWRRDIGRVIKKSLVEATGVPGQHI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS75 NAILQDTKTIAVYEEFRSLRLSFSPNLDDYNPDIPEWRRDIGRVIKKSLVEATGVPGQHI 970 980 990 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1080 pF1KB3 LVAVLPGLPTTAELFVLPYQDPAGENKRSTDDLEQISELLIHTLNQNSVHFELKPGVRVL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS75 LVAVLPGLPTTAELFVLPYQDPAGENKRSTDDLEQISELLIHTLNQNSVHFELKPGVRVL 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1140 pF1KB3 VHAAHLTAAPLVDLTPTHSGSAMLMLLSVVFVGLAVFVIYKFKRRVALPSPPSPSTQPGD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS75 VHAAHLTAAPLVDLTPTHSGSAMLMLLSVVFVGLAVFVIYKFKRRVALPSPPSPSTQPGD 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1150 1160 pF1KB3 SSLRLQRARHATPPSTPKRGSAGAQYAI :::::::::::::::::::::::::::: CCDS75 SSLRLQRARHATPPSTPKRGSAGAQYAI 1150 1160 >>CCDS7558.1 SORCS3 gene_id:22986|Hs108|chr10 (1222 aa) initn: 5052 init1: 3031 opt: 5064 Z-score: 4585.1 bits: 860.4 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 5068; 66.3% identity (85.3% similar) in 1140 aa overlap (13-1126:12-1150) 10 20 30 40 50 pF1KB3 MGKVGAGGGSQARLSALLAGAGLLILCAPGVCG--------GGSCCPSPHPSSAPRSAS- : .: :. .:::.: . . : :: :. :.: : . : CCDS75 MEAARTERPAGRPGAPLVRTGLLLLSTWVLAGAEITWDATGGPGRPAA-PASRPPALSP 10 20 30 40 50 60 70 80 90 pF1KB3 -TPRGFSHQGRPGRAPATPLPLVVR---P-LFSVAPGDRALSLE-RARGT-------GAS .::. . : : : .. : : :. : :. .. .: :: : . CCDS75 LSPRAVASQWPEELASARRAAVLGRRAGPELLPQQGGGRGGEMQVEAGGTSPAGERRGRG 60 70 80 90 100 110 100 110 120 130 140 150 pF1KB3 MAVAARSGRRRRSGADQEKA--ERGEGASRSPRGVLRDGGQQEPGTRER-DPDKATRFRM . . :. : ::: : :::.. . .: : . :.::. .: CCDS75 IPAPAKLGGARRSRRAQPPITQERGDAWATAPADGSRGSRPLAKGSREEVKAPRAGGSAA 120 130 140 150 160 170 160 170 180 190 200 210 pF1KB3 EELRLTSTTFALTGDSAHNQAMVHWSGHNSSVILILTKLYDYNLGSITESSLWRSTDYGT :.::: ::.::::::::::::::::::::::::::::::::.::::.::::::::::::: CCDS75 EDLRLPSTSFALTGDSAHNQAMVHWSGHNSSVILILTKLYDFNLGSVTESSLWRSTDYGT 180 190 200 210 220 230 220 230 240 250 260 270 pF1KB3 TYEKLNDKVGLKTILSYLYVCPTNKRKIMLLTDPEIESSLLISSDEGATYQKYRLNFYIQ :::::::::::::.:::::: ::::::::::.:::.:::.:::::::::::::::.:::: CCDS75 TYEKLNDKVGLKTVLSYLYVNPTNKRKIMLLSDPEMESSILISSDEGATYQKYRLTFYIQ 240 250 260 270 280 290 280 290 300 310 320 330 pF1KB3 SLLFHPKQEDWILAYSQDQKLYSSAEFGRRWQLIQEGVVPNRFYWSVMGSNKEPDLVHLE :::::::::::.:::: ::::::: .:::::::..: ..:::::::: : .:: ::::.: CCDS75 SLLFHPKQEDWVLAYSLDQKLYSSMDFGRRWQLMHERITPNRFYWSVAGLDKEADLVHME 300 310 320 330 340 350 340 350 360 370 380 390 pF1KB3 ARTVDGHSHYLTCRMQNCTEANRNQPFPGYIDPDSLIVQDHYVFVQLTSGGRPHYYVSYR .::.::..::::::.:.:.:..:. :: :: .::.:::.:.:.:.:..:: :::::: CCDS75 VRTTDGYAHYLTCRIQECAETTRSGPFARSIDISSLVVQDEYIFIQVTTSGRASYYVSYR 360 370 380 390 400 410 400 410 420 430 440 450 pF1KB3 RNAFAQMKLPKYALPKDMHVISTDENQVFAAVQEWNQNDTYNLYISDTRGVYFTLALENV :.::::.:::::.::::::.::::::::::::::::::::::::::::::.:::::.::. CCDS75 REAFAQIKLPKYSLPKDMHIISTDENQVFAAVQEWNQNDTYNLYISDTRGIYFTLAMENI 420 430 440 450 460 470 460 470 480 490 500 510 pF1KB3 QSSRGPEGNIMIDLYEVAGIKGMFLANKKIDNQVKTFITYNKGRDWRLLQAPDTDLRGDP .:::: :::.:.:::::::::.::::::.:.::::.::::::::::::::::.::::.: CCDS75 KSSRGLMGNIIIELYEVAGIKGIFLANKKVDDQVKTYITYNKGRDWRLLQAPDVDLRGSP 480 490 500 510 520 530 520 530 540 550 560 570 pF1KB3 VHCLLPYCSLHLHLKVSENPYTSGIIASKDTAPSIIVASGNIGSELSDTDISMFVSSDAG ::::::.:::::::..:::::.:: :.::.:::...::.:::: ::: :::..:.:::.: CCDS75 VHCLLPFCSLHLHLQLSENPYSSGRISSKETAPGLVVATGNIGPELSYTDIGVFISSDGG 540 550 560 570 580 590 580 590 600 610 620 630 pF1KB3 NTWRQIFEEEHSVLYLDQGGVLVAMKHTSLPIRHLWLSFDEGRSWSKYSFTSIPLFVDGV :::::::.::..: .:: ::.::::::: ::.::::.:::::.::.::.:::.::::::. CCDS75 NTWRQIFDEEYNVWFLDWGGALVAMKHTPLPVRHLWVSFDEGHSWDKYGFTSVPLFVDGA 600 610 620 630 640 650 640 650 660 670 680 690 pF1KB3 LGEPGEETLIMTVFGHFSHRSEWQLVKVDYKSIFDRRCAEEDYRPWQLHSQGEACIMGAK : : : :: ::::::::: :::::::::::::::.:.:..:::. :.: .::: :.:: . CCDS75 LVEAGMETHIMTVFGHFSLRSEWQLVKVDYKSIFSRHCTKEDYQTWHLLNQGEPCVMGER 660 670 680 690 700 710 700 710 720 730 740 750 pF1KB3 RIYKKRKSERKCMQGK-YAGAMESEPCVCTEADFDCDYGYERHSNGQCLPAFWFNPSSLS .:.:::: .: :. ..:.. ::::::.. ::.::::::::...::.::::.::.: : CCDS75 KIFKKRKPGAQCALGRDHSGSVVSEPCVCANWDFECDYGYERHGESQCVPAFWYNPASPS 720 730 740 750 760 770 760 770 780 790 800 810 pF1KB3 KDCSLGQSYLNSTGYRKVVSNNCTDGVREQYTAKPQKCPGKAPRGLRIVTADGKLTAEQG ::::::::::::::::..::::::::.::.:::: : :::::::::..::.::.:.:::: CCDS75 KDCSLGQSYLNSTGYRRIVSNNCTDGLREKYTAKAQMCPGKAPRGLHVVTTDGRLVAEQG 780 790 800 810 820 830 820 830 840 850 860 870 pF1KB3 HNVTLMVQLEEGDVQRTLIQVDFGDGIAVSYVNLSSMEDGIKHVYQNVGIFRVTVQVDNS ::.:... .::::.::: ::.::::::::::.:.: .::::::::...:::.::. ..:. CCDS75 HNATFIILMEEGDLQRTNIQLDFGDGIAVSYANFSPIEDGIKHVYKSAGIFQVTAYAENN 840 850 860 870 880 890 880 890 900 910 920 930 pF1KB3 LGSDSAVLYLHVTCPLEHVHLSLPFVTTKNKEVNATAVLWPSQVGTLTYVWWYGNNTEPL ::::.:::.:::.::.::::: .:::. .::::: .::.::::.::::: ::.::.:.:: CCDS75 LGSDTAVLFLHVVCPVEHVHLRVPFVAIRNKEVNISAVVWPSQLGTLTYFWWFGNSTKPL 900 910 920 930 940 950 940 950 960 970 980 990 pF1KB3 ITLEGSISFRFTSEGMNTITVQVSAGNAILQDTKTIAVYEEFRSLRLSFSPNLDDYNPDI :::..:::: : .:: .::::::.::::..:::: :::.: :.: :::::::: .:::: CCDS75 ITLDSSISFTFLAEGTDTITVQVAAGNALIQDTKEIAVHEYFQSQLLSFSPNLDYHNPDI 960 970 980 990 1000 1010 1000 1010 1020 1030 1040 1050 pF1KB3 PEWRRDIGRVIKKSLVEATGVPGQHILVAVLPGLPTTAELFVLPYQDPAGENKRSTDDLE ::::.::: :::..::..:.:: ..::.::.:::::.::::.:: .. . . : . ::: CCDS75 PEWRKDIGNVIKRALVKVTSVPEDQILIAVFPGLPTSAELFILPPKNLTERRKGNEGDLE 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1060 1070 1080 1090 1100 1110 pF1KB3 QISELLIHTLNQNSVHFELKPGVRVLVHAAHLTAAPLVDLTPTHSGSAMLMLLSVVFVGL :: : :...:::: :.:::::::.:.:....:: ::::: . ::.:::::::::::::: CCDS75 QIVETLFNALNQNLVQFELKPGVQVIVYVTQLTLAPLVDSSAGHSSSAMLMLLSVVFVGL 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1120 1130 1140 1150 1160 pF1KB3 AVFVIYKFKRRVALPSPPSPSTQPGDSSLRLQRARHATPPSTPKRGSAGAQYAI :::.::::::.. CCDS75 AVFLIYKFKRKIPWINIYAQVQHDKEQEMIGSVSQSENAPKITLSDFTEPEELLDKELDT 1140 1150 1160 1170 1180 1190 >>CCDS47008.1 SORCS2 gene_id:57537|Hs108|chr4 (1159 aa) initn: 3159 init1: 1756 opt: 3301 Z-score: 2989.3 bits: 565.1 E(32554): 3.5e-160 Smith-Waterman score: 3319; 45.4% identity (72.8% similar) in 1113 aa overlap (33-1125:5-1105) 10 20 30 40 50 60 pF1KB3 KVGAGGGSQARLSALLAGAGLLILCAPGVCGGGSCCPSPHPSS-APRSASTPRGFSHQGR : . .: :.. :: .. : CCDS47 MAHRGPSRASKGPGPTARAPSPGAPP-------- 10 20 70 80 90 100 110 pF1KB3 PGRAPATPLPLVVRPLFSVAPGDRALSLERAR-GTGASMAVAARS---GRRRRSGADQEK : :.: . ::.. :. : : . : : .: : :... . :: :: . .:..... CCDS47 PPRSPRSR-PLLLLLLLLGACGAAGRSPEPGRLGPHAQLTRVPRSPPAGRAEPGGGEDRQ 30 40 50 60 70 80 120 130 140 150 160 170 pF1KB3 AERGE----GASRSPRGVLRDGGQQEPGTR--ERDPDKATRFRMEELRLTSTTFALTGDS :. : : : .: . : : : :: : .. : ::.:.: ::. CCDS47 ARGTEPGAPGPSPGPAPGPGEDGAPAAGYRRWERAAPLAGVASRAQVSLISTSFVLKGDA 90 100 110 120 130 140 180 190 200 210 220 230 pF1KB3 AHNQAMVHWSGHNSSVILILTKLYDYNLGSITESSLWRSTDYGTTYEKLNDKVGLKTILS .::::::::.:.:::::::::: : ..:.. :::::::.:.::.: ::. . :. :... CCDS47 THNQAMVHWTGENSSVILILTKYYHADMGKVLESSLWRSSDFGTSYTKLTLQPGVTTVID 150 160 170 180 190 200 240 250 260 270 280 pF1KB3 YLYVCPTNKRKIMLLTDP--EIESSLLISSDEGATYQKYRLNFYIQSLLFHPKQEDWILA .:.:::::::..:... . ..::..:.:::::.:: . :....:.::::.:: .:: CCDS47 NFYICPTNKRKVILVSSSLSDRDQSLFLSADEGATFQKQPIPFFVETLIFHPKEEDKVLA 210 220 230 240 250 260 290 300 310 320 330 340 pF1KB3 YSQDQKLYSSAEFGRRWQLIQEGVVPNRFYWSVMGSNKEPDLVHLEARTVDGHSHYLTCR :....::: :...:..: :.:: :. .. .::: : . .:::::.::. . : .:.:: CCDS47 YTKESKLYVSSDLGKKWTLLQERVTKDHVFWSVSGVDADPDLVHVEAQDLGGDFRYVTCA 270 280 290 300 310 320 350 360 370 380 390 400 pF1KB3 MQNCTEANRNQPFPGYIDPDSLIVQDHYVFVQLTSGGRPHYYVSYRRNAFAQMKLPKYAL ..::.: . :: : :: :: ::: :.: . ::... .:::::::: :. :::::::: CCDS47 IHNCSEKMLTAPFAGPIDHGSLTVQDDYIFFKATSANQTKYYVSYRRNEFVLMKLPKYAL 330 340 350 360 370 380 410 420 430 440 450 460 pF1KB3 PKDMHVISTDENQVFAAVQEWNQNDTYNLYISDTRGVYFTLALENVQSSRGPEGNIMIDL :::...:::::.:::.::::: : :::::: :: ::: ..:.:..:.::: : ...::. CCDS47 PKDLQIISTDESQVFVAVQEWYQMDTYNLYQSDPRGVRYALVLQDVRSSRQAEESVLIDI 390 400 410 420 430 440 470 480 490 500 510 520 pF1KB3 YEVAGIKGMFLANKKIDNQVKTFITYNKGRDWRLLQAPDTDLRGDPVHCLLPYCSLHLHL :: :.::.::::.:::..: :.::::::::: :. :. :. : :..: : : ::::: CCDS47 LEVRGVKGVFLANQKIDGKVMTLITYNKGRDWDYLRPPSMDMNGKPTNCKPPDCHLHLHL 450 460 470 480 490 500 530 540 550 560 570 580 pF1KB3 KVSENPYTSGIIASKDTAPSIIVASGNIGSELSDTDISMFVSSDAGNTWRQIFEEEHSVL . ..:::.:: . .:::::..:...::.::.: . :...:: :.::::.::::: .: CCDS47 RWADNPYVSGTVHTKDTAPGLIMGAGNLGSQLVEYKEEMYITSDCGHTWRQVFEEEHHIL 510 520 530 540 550 560 590 600 610 620 630 640 pF1KB3 YLDQGGVLVAMKHTSLPIRHLWLSFDEGRSWSKYSFTSIPLFVDGVLGEPGEETLIMTVF :::.:::.::.: ::.:.. : .: ::: .:: ..::: .::::.:.:::.:::.:::: CCDS47 YLDHGGVIVAIKDTSIPLKILKFSVDEGLTWSTHNFTSTSVFVDGLLSEPGDETLVMTVF 570 580 590 600 610 620 650 660 670 680 690 700 pF1KB3 GHFSHRSEWQLVKVDYKSIFDRRCAEEDYRPWQLHS-QGEACIMGAKRIYKKRKSERKCM ::.: ::.:.:::::.. :.:.:.:::: :.: . ::. :::: .: ..:::: :. CCDS47 GHISFRSDWELVKVDFRPSFSRQCGEEDYSSWELSNLQGDRCIMGQQRSFRKRKSTSWCI 630 640 650 660 670 680 710 720 730 740 750 760 pF1KB3 QGK-YAGAMESEPCVCTEADFDCDYGYERHSNGQ-----CLPAFWFNPSSLSKDCSLGQS .:. ...:. :. : : ..:: ::::.:: :... : ::::: : ::.:::. CCDS47 KGRSFTSALTSRVCECRDSDFLCDYGFERSSSSESSTNKCSANFWFNPLSPPDDCALGQT 690 700 710 720 730 740 770 780 790 800 810 820 pF1KB3 YLNSTGYRKVVSNNCTDGVREQYTAKPQKCPGKAPRGLRIVTADGKLTAEQGHNVTLMVQ : .: :::::::: : :: : . .:: ::::.. .... :..: ..:. CCDS47 YTSSLGYRKVVSNVCEGGVDMQQSQVQLQCPLTPPRGLQVSIQGEAVAVRPGEDVLFVVR 750 760 770 780 790 800 830 840 850 860 870 880 pF1KB3 LEEGDVQRTLIQVDFGDGIAVSYVNLSSMEDGIKHVYQNVGIFRVTVQVDNSLGSDSAVL :.::: : :::.:::. . ::::. . :.: :.. ::.::.:...:. : : ::: CCDS47 QEQGDVLTTKYQVDLGDGFKAMYVNLTLTGEPIRHRYESPGIYRVSVRAENTAGHDEAVL 810 820 830 840 850 860 890 900 910 920 930 940 pF1KB3 YLHVTCPLEHVHLSLPFVTTKNKEVNATAVLWPSQVGTLTYVWWYGNNTEPLITLEGSIS ...:. ::. ..: . : :.::: :::: : . . .. :: :.. .::..:..:.. CCDS47 FVQVNSPLQALYLEVVPVIGLNQEVNLTAVLLPLNPNLTVFYWWIGHSLQPLLSLDNSVT 870 880 890 900 910 920 950 960 970 980 990 1000 pF1KB3 FRFTSEGMNTITVQVSAGNAILQDTKTIAVYEEFRSLRLSFSPNLDDYNPDIPEWRRDIG ::.. : .:::.. ::..:::.... : ..:. . :.:: .:: :::. ::::.:.: CCDS47 TRFSDTGDVRVTVQAACGNSVLQDSRVLRVLDQFQVMPLQFSKELDAYNPNTPEWREDVG 930 940 950 960 970 980 1010 1020 1030 1040 1050 1060 pF1KB3 RVIKKSLVEATGVPGQHILVAVLPGLPTTAELFVLPYQDPAGENKRSTDDLEQISELLIH :. . : . :.:: . ....: ::::: :.:.:: : ::: .. .... . . CCDS47 LVVTRLLSKETSVPQELLVTVVKPGLPTLADLYVL-LPPPRPTRKRSLSSDKRLAAIQ-Q 990 1000 1010 1020 1030 1040 1070 1080 1090 1100 1110 1120 pF1KB3 TLNQNSVHFELKPGVRVLVHAAHLTAAPLVDLTPTHSGSAMLMLLSVVFVGLAVFVIYKF .:: ... : :. :::::: : . :.. .: . :...:. . . . ..:..::: CCDS47 VLNAQKISFLLRGGVRVLV-ALRDTGTGAEQLGGGGGYWAVVVLFVIGLFAAGAFILYKF 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1130 1140 1150 1160 pF1KB3 KRRVALPSPPSPSTQPGDSSLRLQRARHATPPSTPKRGSAGAQYAI ::. CCDS47 KRKRPGRTVYAQMHNEKEQEMTSPVSHSEDVQGAVQGNHSGVVLSINSREMHSYLVS 1110 1120 1130 1140 1150 >>CCDS798.1 SORT1 gene_id:6272|Hs108|chr1 (831 aa) initn: 386 init1: 192 opt: 801 Z-score: 727.9 bits: 146.2 E(32554): 3.2e-34 Smith-Waterman score: 868; 25.5% identity (60.3% similar) in 697 aa overlap (130-792:67-740) 100 110 120 130 140 150 pF1KB3 AVAARSGRRRRSGADQEKAERGEGASRSPRGVLRDGGQQEPGTRERDPDKATRFRMEELR :.. ::. . .. .: .. : : . CCDS79 LDAPPPPAAPLPRWSGPIGVSWGLRAAAAGGAFPRGGRWRRSAPGED-EECGRVRDFVAK 40 50 60 70 80 90 160 170 180 190 200 210 pF1KB3 LTSTTFALTGDSAHNQAMVHWSGHNSSVILILTKLY-DYNLGSITESSLWRSTDYGTTYE :...: . :. .... . : : ...:::.:: .. . .. .:.:.:: ::: ... CCDS79 LANNTHQHVFDDLRGSVSLSWVGDSTGVILVLTTFHVPLVIMTFGQSKLYRSEDYGKNFK 100 110 120 130 140 150 220 230 240 250 260 270 pF1KB3 KLNDKVGLKTILSY--LYVCPTNKRKIMLLTDPEIESS---LLISSDEGATYQKYRLNFY ..: .. : . . . : :. :..: .. : .. ::: . .. . : :. CCDS79 DITDLINNTFIRTEFGMAIGPENSGKVVLTAEVSGGSRGGRIFRSSDFAKNFVQTDLPFH 160 170 180 190 200 210 280 290 300 310 320 pF1KB3 -IQSLLFHPKQEDWILAYSQDQKLYSSAEFGRRWQLIQEGVVPNR-------FYWSVMGS . .... :.. :..:: : .. :. : .:: .:. :...: . :. . .. CCDS79 PLTQMMYSPQNSDYLLALSTENGLWVSKNFGGKWEEIHKAVCLAKWGSDNTIFFTTYANG 220 230 240 250 260 270 330 340 350 360 370 380 pF1KB3 NKEPDLVHLEA-RTVD-GHS-HYLTCRMQNCTEANRNQPFPGYIDPDSLIVQDHYVFVQL . . :: :: :: : :.: . . .. . ..: . : :. . . :. CCDS79 SCKADLGALELWRTSDLGKSFKTIGVKIYSFGLGGRFLFASVMADKDTT----RRIHVST 280 290 300 310 320 330 390 400 410 420 430 440 pF1KB3 TSGGRPHYYVSYRRNAFAQMKLPKYALPKDMHVISTDENQVFAAVQEWNQNDTYNLYISD .: ..... .::. . . . ........:: :.: ... ... :: CCDS79 DQG-----------DTWSMAQLPSVGQEQFYSILAANDDMVFMHVDEPGDTGFGTIFTSD 340 350 360 370 380 450 460 470 480 490 500 pF1KB3 TRGVYFTLALE-NVQSSRGPEGNIMIDLYEVAGIKGMFLANK-KIDNQVKTFITYNKGRD ::. .. .:. .. .. : : :. .:....:..... . ::...:.::...: CCDS79 DRGIVYSKSLDRHLYTTTGGE----TDFTNVTSLRGVYITSVLSEDNSIQTMITFDQGGR 390 400 410 420 430 510 520 530 540 550 pF1KB3 WRLLQAPDTDLRGDPVHCLLPYCSLHLHLKVSENPYTSGIIA--SKDTAPSIIVASGNIG : :. :... . : . ::::.: . : . . .: :. .: .:..: :..: CCDS79 WTHLRKPENS-ECDATAKNKNECSLHIHASYSISQKLNVPMAPLSEPNAVGIVIAHGSVG 440 450 460 470 480 490 560 570 580 590 600 610 pF1KB3 SELSDTDISMFVSSDAGNTWRQIFEEEHSVLYLDQGGVLVAMKHTSLPIRHLWLSFDEGR . .: ....:.:.: .: ...: : ::.::..::..:.: :: . .: :::. CCDS79 DAISVMVPDVYISDDGGYSWTKMLEGPHYYTILDSGGIIVAIEHSSRPINVIKFSTDEGQ 500 510 520 530 540 550 620 630 640 650 660 670 pF1KB3 SWSKYSFTSIPLFVDGVLGEPGEETLIMTVFGHFSHR---SEWQLVKVDYKSIFDRRCAE :. :.:: :.. :. .::: ... ....: :.. :.: .:.:.:..: : : CCDS79 CWQTYTFTRDPIYFTGLASEPGARSMNISIWG-FTESFLTSQWVSYTIDFKDILERNCEE 560 570 580 590 600 610 680 690 700 710 720 pF1KB3 EDYRPWQLHSQG-----EACIMGAKRIYKKRKSERKCMQGK-YAGAMESEPCVCTEADFD .:: : :: ..::.: :. . . .. :..:. :. . . :.:. :: CCDS79 KDYTIWLAHSTDPEDYEDGCILGYKEQFLRLRKSSVCQNGRDYVVTKQPSICLCSLEDFL 620 630 640 650 660 670 730 740 750 760 770 780 pF1KB3 CDYGYERHSN-GQCLPAFWFNPSSLSKDCSLG-QSYLNSTGYRKVVSNNCTDGVREQYTA ::.:: : : ..:. .. .: . : : . .:...::::. ...: :: . CCDS79 CDFGYYRPENDSKCVEQPELKGHDL-EFCLYGREEHLTTNGYRKIPGDKCQGGVNPVREV 680 690 700 710 720 730 790 800 810 820 830 840 pF1KB3 KP--QKCPGKAPRGLRIVTADGKLTAEQGHNVTLMVQLEEGDVQRTLIQVDFGDGIAVSY : .:: CCDS79 KDLKKKCTSNFLSPEKQNSKSNSVPIILAIVGLMLVTVVAGVLIVKKYVCGGRFLVHRYS 740 750 760 770 780 790 >>CCDS55618.1 SORT1 gene_id:6272|Hs108|chr1 (694 aa) initn: 473 init1: 192 opt: 755 Z-score: 687.3 bits: 138.4 E(32554): 5.8e-32 Smith-Waterman score: 821; 26.1% identity (60.9% similar) in 621 aa overlap (204-792:5-603) 180 190 200 210 220 230 pF1KB3 NQAMVHWSGHNSSVILILTKLYDYNLGSITESSLWRSTDYGTTYEKLNDKVGLKTILSY- .:.:.:: ::: ... ..: .. : . CCDS55 MTFGQSKLYRSEDYGKNFKDITDLINNTFIRTEF 10 20 30 240 250 260 270 280 pF1KB3 -LYVCPTNKRKIMLLTDPEIESS---LLISSDEGATYQKYRLNFY-IQSLLFHPKQEDWI . . : :. :..: .. : .. ::: . .. . : :. . .... :.. :.. CCDS55 GMAIGPENSGKVVLTAEVSGGSRGGRIFRSSDFAKNFVQTDLPFHPLTQMMYSPQNSDYL 40 50 60 70 80 90 290 300 310 320 330 340 pF1KB3 LAYSQDQKLYSSAEFGRRWQLIQEGVV------PNRFYWSVMGSNKEPDLVHLEA-RTVD :: : .. :. : .:: .:. :...: : .......... :: :: :: : CCDS55 LALSTENGLWVSKNFGGKWEEIHKAVCLAKWGSDNTIFFTTYANGSCTDLGALELWRTSD 100 110 120 130 140 150 350 360 370 380 390 pF1KB3 -GHS-HYLTCRMQNCTEANRNQPFPGYIDPDSLIVQDHYVFVQLTSGGRPHYYVSYRRNA :.: . . .. . ..: . : :. . . :. .: .. CCDS55 LGKSFKTIGVKIYSFGLGGRFLFASVMADKDTT----RRIHVSTDQG-----------DT 160 170 180 190 400 410 420 430 440 450 pF1KB3 FAQMKLPKYALPKDMHVISTDENQVFAAVQEWNQNDTYNLYISDTRGVYFTLALE-NVQS ... .::. . . . ........:: :.: ... ... :: ::. .. .:. .. . CCDS55 WSMAQLPSVGQEQFYSILAANDDMVFMHVDEPGDTGFGTIFTSDDRGIVYSKSLDRHLYT 200 210 220 230 240 250 460 470 480 490 500 510 pF1KB3 SRGPEGNIMIDLYEVAGIKGMFLANK-KIDNQVKTFITYNKGRDWRLLQAPDTDLRGDPV . : : :. .:....:..... . ::...:.::...: : :. :... . : . CCDS55 TTGGE----TDFTNVTSLRGVYITSVLSEDNSIQTMITFDQGGRWTHLRKPENS-ECDAT 260 270 280 290 300 310 520 530 540 550 560 570 pF1KB3 HCLLPYCSLHLHLKVSENPYTSGIIA--SKDTAPSIIVASGNIGSELSDTDISMFVSSDA ::::.: . : . . .: :. .: .:..: :..:. .: ....:.:. CCDS55 AKNKNECSLHIHASYSISQKLNVPMAPLSEPNAVGIVIAHGSVGDAISVMVPDVYISDDG 320 330 340 350 360 370 580 590 600 610 620 630 pF1KB3 GNTWRQIFEEEHSVLYLDQGGVLVAMKHTSLPIRHLWLSFDEGRSWSKYSFTSIPLFVDG : .: ...: : ::.::..::..:.: :: . .: :::. :. :.:: :.. : CCDS55 GYSWTKMLEGPHYYTILDSGGIIVAIEHSSRPINVIKFSTDEGQCWQTYTFTRDPIYFTG 380 390 400 410 420 430 640 650 660 670 680 pF1KB3 VLGEPGEETLIMTVFGHFSHR---SEWQLVKVDYKSIFDRRCAEEDYRPWQLHSQG---- . .::: ... ....: :.. :.: .:.:.:..: : :.:: : :: CCDS55 LASEPGARSMNISIWG-FTESFLTSQWVSYTIDFKDILERNCEEKDYTIWLAHSTDPEDY 440 450 460 470 480 490 690 700 710 720 730 740 pF1KB3 -EACIMGAKRIYKKRKSERKCMQGK-YAGAMESEPCVCTEADFDCDYGYERHSN-GQCLP ..::.: :. . . .. :..:. :. . . :.:. :: ::.:: : : ..:. CCDS55 EDGCILGYKEQFLRLRKSSVCQNGRDYVVTKQPSICLCSLEDFLCDFGYYRPENDSKCVE 500 510 520 530 540 550 750 760 770 780 790 800 pF1KB3 AFWFNPSSLSKDCSLG-QSYLNSTGYRKVVSNNCTDGVREQYTAKP--QKCPGKAPRGLR .. .: . : : . .:...::::. ...: :: .: .:: CCDS55 QPELKGHDL-EFCLYGREEHLTTNGYRKIPGDKCQGGVNPVREVKDLKKKCTSNFLSPEK 560 570 580 590 600 610 810 820 830 840 850 860 pF1KB3 IVTADGKLTAEQGHNVTLMVQLEEGDVQRTLIQVDFGDGIAVSYVNLSSMEDGIKHVYQN CCDS55 QNSKSNSVPIILAIVGLMLVTVVAGVLIVKKYVCGGRFLVHRYSVLQQHAEANGVDGVDA 620 630 640 650 660 670 >>CCDS8436.1 SORL1 gene_id:6653|Hs108|chr11 (2214 aa) initn: 411 init1: 137 opt: 652 Z-score: 587.1 bits: 121.5 E(32554): 2.2e-26 Smith-Waterman score: 992; 28.1% identity (62.9% similar) in 668 aa overlap (170-793:99-753) 140 150 160 170 180 190 pF1KB3 PGTRERDPDKATRFRMEELRLTSTTFALTGDSAHNQAMVHWSGHNSSVILILTKLYDYNL ...::: .:::.:..:.::. :.. . : CCDS84 ASRADEKPLRRKRSAALQPEPIKVYGQVSLNDSHNQMVVHWAGEKSNVIVALAR-DSLAL 70 80 90 100 110 120 200 210 220 230 240 250 pF1KB3 GSITESSLWRSTDYGTTYEKLNDKV--GL----KTILSYLYVCPTNKRKIMLLTDPEIES . :... : ::: ...:..::. :: ..... .: :..... ....: . CCDS84 ARPKSSDVYVSYDYGKSFKKISDKLNFGLGNRSEAVIAQFYHSPADNKR-YIFADAYAQY 130 140 150 160 170 180 260 270 280 290 300 310 pF1KB3 SLLISSDEGATYQKYRLNFYIQSLLFHPKQEDWILAYSQ---DQKLYSSAEFGRRWQLIQ : :. : : : . . : .::.: : . .:.... ...:..: .::. : .:: CCDS84 -LWITFDFCNTLQGFSIPFRAADLLLHSKASNLLLGFDRSHPNKQLWKSDDFGQTWIMIQ 190 200 210 220 230 240 320 330 340 350 360 370 pF1KB3 EGVVPNRFYWSVMGSNKEPDLVHLEARTVDGHSHYLTCRMQNCTEANRNQPFPGYIDPDS : : . : :.. .: :. ...: . .:.: . : . .. .:: . . CCDS84 EHV--KSFSWGIDPYDK-PNTIYIERHEPSGYSTVF--RSTDFFQSRENQEVI-LEEVRD 250 260 270 280 290 380 390 400 410 420 pF1KB3 LIVQDHYVF----VQLTSGGRP---HYYVSYRRNAFAQMKLPKYALPKDMHVISTDENQV . ..:.:.: :.: .. . . .::. :. . .. ..... ...:.:: CCDS84 FQLRDKYMFATKVVHLLGSEQQSSVQLWVSFGRKPMRAAQFVTRHPINEYYIADASEDQV 300 310 320 330 340 350 430 440 450 460 470 pF1KB3 FAAVQEWNQNDTYNLYISDTRGVYFTLALENV--QSSRGPEGNIMI---------DLYEV :. :. ..:. :::::...:. :.:.:::: : : .. .. :...: CCDS84 FVCVS--HSNNRTNLYISEAEGLKFSLSLENVLYYSPGGAGSDTLVRYFANEPFADFHRV 360 370 380 390 400 410 480 490 500 510 520 pF1KB3 AGIKGMFLA---NKKIDNQ-VKTFITYNKGRDWRLLQAPDTDLRGDPVHCLLPY-CSLHL :..:...: : ..... ... ::..:: :..:::: :. ..: : ::::: CCDS84 EGLQGVYIATLINGSMNEENMRSVITFDKGGTWEFLQAPAFTGYGEKINCELSQGCSLHL 420 430 440 450 460 470 530 540 550 560 570 580 pF1KB3 HLKVSE--NPYTSGI-IASKDTAPSIIVASGNIGSELSDTDISMFVSSDAGNTWRQIFEE ..:. : . : ::..::..:.:.:..:..:. . ....::.:: ::. . CCDS84 AQRLSQLLNLQLRRMPILSKESAPGLIIATGSVGKNLA-SKTNVYISSSAGARWREALPG 480 490 500 510 520 530 590 600 610 620 630 640 pF1KB3 EHSVLYLDQGGVLVAMKHTSLPIRHLWLSFDEGRSWSKYSFTSIPLFVDGVLGEPGEETL : . :.::...:. . .. .: : .::..:. . :. :.:: :.: ::::.. CCDS84 PHYYTWGDHGGIITAIAQ-GMETNELKYSTNEGETWKTFIFSEKPVFVYGLLTEPGEKST 540 550 560 570 580 590 650 660 670 680 690 700 pF1KB3 IMTVFGHFSHRSE-WQLVKVDYKSIFDRRCAEEDYRPWQLHSQ-GEACIMGAKRIYKKRK ..:.:: .. . : ...:. . . :.:.::. :. .. :. :..: : ..:.: CCDS84 VFTIFGSNKENVHSWLILQVNATDALGVPCTENDYKLWSPSDERGNECLLGHKTVFKRRT 600 610 620 630 640 650 710 720 730 740 750 pF1KB3 SERKCMQGK-YAGAMESEPCVCTEADFDCDYGY---ERHSNGQCLPAFWFNPSSLSKD-- . :..:. . . : ::. :..::.:. : : :.: :. .: : CCDS84 PHATCFNGEDFDRPVVVSNCSCTREDYECDFGFKMSEDLSLEVCVPDPEFSGKSYSPPVP 660 670 680 690 700 710 760 770 780 790 800 810 pF1KB3 CSLGQSYLNSTGYRKVVSNNCTDG-VREQYTAKPQKCPGKAPRGLRIVTADGKLTAEQGH : .:..: . ::::. ...:. : :. . .. :: CCDS84 CPVGSTYRRTRGYRKISGDTCSGGDVEARLEGELVPCPLAEENEFILYAVRKSIYRYDLA 720 730 740 750 760 770 820 830 840 850 860 870 pF1KB3 NVTLMVQLEEGDVQRTLIQVDFGDGIAVSYVNLSSMEDGIKHVYQNVGIFRVTVQVDNSL CCDS84 SGATEQLPLTGLRAAVALDFDYEHNCLYWSDLALDVIQRLCLNGSTGQEVIINSGLETVE 780 790 800 810 820 830 1168 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Thu Nov 3 14:01:48 2016 done: Thu Nov 3 14:01:49 2016 Total Scan time: 5.340 Total Display time: 0.290 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]