Result of FASTA (ccds) for
pF1KB3863
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3863, 801 aa
1>>>pF1KB3863 801 - 801 aa - 801 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.2628+/-0.000915; mu= -3.2622+/- 0.056
mean_var=341.6766+/-68.067, 0's: 0 Z-trim(117.2): 49 B-trim: 201 in 1/52
Lambda= 0.069385
statistics sampled from 17811 (17860) to 17811 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.806), E-opt: 0.2 (0.549), width: 16
Scan time: 4.880
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4762.1 BRD2 gene_id:6046|Hs108|chr6 ( 801) 5299 544.2 3.1e-154
CCDS56421.1 BRD2 gene_id:6046|Hs108|chr6 ( 754) 4981 512.4 1.1e-144
CCDS56420.1 BRD2 gene_id:6046|Hs108|chr6 ( 836) 4149 429.1 1.5e-119
CCDS6980.1 BRD3 gene_id:8019|Hs108|chr9 ( 726) 1971 211.0 5.6e-54
CCDS46004.1 BRD4 gene_id:23476|Hs108|chr19 ( 722) 1101 124.0 9.1e-28
CCDS82307.1 BRD4 gene_id:23476|Hs108|chr19 ( 794) 1101 124.0 9.8e-28
CCDS12328.1 BRD4 gene_id:23476|Hs108|chr19 (1362) 1101 124.2 1.5e-27
CCDS55616.1 BRDT gene_id:676|Hs108|chr1 ( 874) 738 87.7 9.2e-17
CCDS55615.1 BRDT gene_id:676|Hs108|chr1 ( 901) 738 87.7 9.4e-17
CCDS72820.1 BRDT gene_id:676|Hs108|chr1 ( 951) 708 84.7 7.9e-16
CCDS735.1 BRDT gene_id:676|Hs108|chr1 ( 947) 701 84.0 1.3e-15
>>CCDS4762.1 BRD2 gene_id:6046|Hs108|chr6 (801 aa)
initn: 5299 init1: 5299 opt: 5299 Z-score: 2882.4 bits: 544.2 E(32554): 3.1e-154
Smith-Waterman score: 5299; 100.0% identity (100.0% similar) in 801 aa overlap (1-801:1-801)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MLQNVTPHNKLPGEGNAGLLGLGPEAAAPGKRIRKPSLLYEGFESPTMASVPALQLTPAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MLQNVTPHNKLPGEGNAGLLGLGPEAAAPGKRIRKPSLLYEGFESPTMASVPALQLTPAN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 PPPPEVSNPKKPGRVTNQLQYLHKVVMKALWKHQFAWPFRQPVDAVKLGLPDYHKIIKQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 PPPPEVSNPKKPGRVTNQLQYLHKVVMKALWKHQFAWPFRQPVDAVKLGLPDYHKIIKQP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 MDMGTIKRRLENNYYWAASECMQDFNTMFTNCYIYNKPTDDIVLMAQTLEKIFLQKVASM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MDMGTIKRRLENNYYWAASECMQDFNTMFTNCYIYNKPTDDIVLMAQTLEKIFLQKVASM
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 PQEEQELVVTIPKNSHKKGAKLAALQGSVTSAHQVPAVSSVSHTALYTPPPEIPTTVLNI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 PQEEQELVVTIPKNSHKKGAKLAALQGSVTSAHQVPAVSSVSHTALYTPPPEIPTTVLNI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 PHPSVISSPLLKSLHSAGPPLLAVTAAPPAQPLAKKKGVKRKADTTTPTPTAILAPGSPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 PHPSVISSPLLKSLHSAGPPLLAVTAAPPAQPLAKKKGVKRKADTTTPTPTAILAPGSPA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 SPPGSLEPKAARLPPMRRESGRPIKPPRKDLPDSQQQHQSSKKGKLSEQLKHCNGILKEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SPPGSLEPKAARLPPMRRESGRPIKPPRKDLPDSQQQHQSSKKGKLSEQLKHCNGILKEL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 LSKKHAAYAWPFYKPVDASALGLHDYHDIIKHPMDLSTVKRKMENRDYRDAQEFAADVRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LSKKHAAYAWPFYKPVDASALGLHDYHDIIKHPMDLSTVKRKMENRDYRDAQEFAADVRL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 MFSNCYKYNPPDHDVVAMARKLQDVFEFRYAKMPDEPLEPGPLPVSTAMPPGLAKSSSES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MFSNCYKYNPPDHDVVAMARKLQDVFEFRYAKMPDEPLEPGPLPVSTAMPPGLAKSSSES
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 SSEESSSESSSEEEEEEDEEDEEEEESESSDSEEERAHRLAELQEQLRAVHEQLAALSQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SSEESSSESSSEEEEEEDEEDEEEEESESSDSEEERAHRLAELQEQLRAVHEQLAALSQG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 PISKPKRKREKKEKKKKRKAEKHRGRAGADEDDKGPRAPRPPQPKKSKKASGSGGGSAAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 PISKPKRKREKKEKKKKRKAEKHRGRAGADEDDKGPRAPRPPQPKKSKKASGSGGGSAAL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 GPSGFGPSGGSGTKLPKKATKTAPPALPTGYDSEEEEESRPMSYDEKRQLSLDINKLPGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 GPSGFGPSGGSGTKLPKKATKTAPPALPTGYDSEEEEESRPMSYDEKRQLSLDINKLPGE
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB3 KLGRVVHIIQAREPSLRDSNPEEIEIDFETLKPSTLRELERYVLSCLRKKPRKPYTIKKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 KLGRVVHIIQAREPSLRDSNPEEIEIDFETLKPSTLRELERYVLSCLRKKPRKPYTIKKP
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB3 VGKTKEELALEKKRELEKRLQDVSGQLNSTKKPPKKANEKTESSSAQQVAVSRLSASSSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VGKTKEELALEKKRELEKRLQDVSGQLNSTKKPPKKANEKTESSSAQQVAVSRLSASSSS
730 740 750 760 770 780
790 800
pF1KB3 SDSSSSSSSSSSSDTSDSDSG
:::::::::::::::::::::
CCDS47 SDSSSSSSSSSSSDTSDSDSG
790 800
>>CCDS56421.1 BRD2 gene_id:6046|Hs108|chr6 (754 aa)
initn: 4981 init1: 4981 opt: 4981 Z-score: 2710.8 bits: 512.4 E(32554): 1.1e-144
Smith-Waterman score: 4981; 100.0% identity (100.0% similar) in 754 aa overlap (48-801:1-754)
20 30 40 50 60 70
pF1KB3 GLLGLGPEAAAPGKRIRKPSLLYEGFESPTMASVPALQLTPANPPPPEVSNPKKPGRVTN
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 MASVPALQLTPANPPPPEVSNPKKPGRVTN
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KB3 QLQYLHKVVMKALWKHQFAWPFRQPVDAVKLGLPDYHKIIKQPMDMGTIKRRLENNYYWA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 QLQYLHKVVMKALWKHQFAWPFRQPVDAVKLGLPDYHKIIKQPMDMGTIKRRLENNYYWA
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KB3 ASECMQDFNTMFTNCYIYNKPTDDIVLMAQTLEKIFLQKVASMPQEEQELVVTIPKNSHK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 ASECMQDFNTMFTNCYIYNKPTDDIVLMAQTLEKIFLQKVASMPQEEQELVVTIPKNSHK
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KB3 KGAKLAALQGSVTSAHQVPAVSSVSHTALYTPPPEIPTTVLNIPHPSVISSPLLKSLHSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 KGAKLAALQGSVTSAHQVPAVSSVSHTALYTPPPEIPTTVLNIPHPSVISSPLLKSLHSA
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KB3 GPPLLAVTAAPPAQPLAKKKGVKRKADTTTPTPTAILAPGSPASPPGSLEPKAARLPPMR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 GPPLLAVTAAPPAQPLAKKKGVKRKADTTTPTPTAILAPGSPASPPGSLEPKAARLPPMR
220 230 240 250 260 270
320 330 340 350 360 370
pF1KB3 RESGRPIKPPRKDLPDSQQQHQSSKKGKLSEQLKHCNGILKELLSKKHAAYAWPFYKPVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 RESGRPIKPPRKDLPDSQQQHQSSKKGKLSEQLKHCNGILKELLSKKHAAYAWPFYKPVD
280 290 300 310 320 330
380 390 400 410 420 430
pF1KB3 ASALGLHDYHDIIKHPMDLSTVKRKMENRDYRDAQEFAADVRLMFSNCYKYNPPDHDVVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 ASALGLHDYHDIIKHPMDLSTVKRKMENRDYRDAQEFAADVRLMFSNCYKYNPPDHDVVA
340 350 360 370 380 390
440 450 460 470 480 490
pF1KB3 MARKLQDVFEFRYAKMPDEPLEPGPLPVSTAMPPGLAKSSSESSSEESSSESSSEEEEEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 MARKLQDVFEFRYAKMPDEPLEPGPLPVSTAMPPGLAKSSSESSSEESSSESSSEEEEEE
400 410 420 430 440 450
500 510 520 530 540 550
pF1KB3 DEEDEEEEESESSDSEEERAHRLAELQEQLRAVHEQLAALSQGPISKPKRKREKKEKKKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 DEEDEEEEESESSDSEEERAHRLAELQEQLRAVHEQLAALSQGPISKPKRKREKKEKKKK
460 470 480 490 500 510
560 570 580 590 600 610
pF1KB3 RKAEKHRGRAGADEDDKGPRAPRPPQPKKSKKASGSGGGSAALGPSGFGPSGGSGTKLPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 RKAEKHRGRAGADEDDKGPRAPRPPQPKKSKKASGSGGGSAALGPSGFGPSGGSGTKLPK
520 530 540 550 560 570
620 630 640 650 660 670
pF1KB3 KATKTAPPALPTGYDSEEEEESRPMSYDEKRQLSLDINKLPGEKLGRVVHIIQAREPSLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 KATKTAPPALPTGYDSEEEEESRPMSYDEKRQLSLDINKLPGEKLGRVVHIIQAREPSLR
580 590 600 610 620 630
680 690 700 710 720 730
pF1KB3 DSNPEEIEIDFETLKPSTLRELERYVLSCLRKKPRKPYTIKKPVGKTKEELALEKKRELE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 DSNPEEIEIDFETLKPSTLRELERYVLSCLRKKPRKPYTIKKPVGKTKEELALEKKRELE
640 650 660 670 680 690
740 750 760 770 780 790
pF1KB3 KRLQDVSGQLNSTKKPPKKANEKTESSSAQQVAVSRLSASSSSSDSSSSSSSSSSSDTSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 KRLQDVSGQLNSTKKPPKKANEKTESSSAQQVAVSRLSASSSSSDSSSSSSSSSSSDTSD
700 710 720 730 740 750
800
pF1KB3 SDSG
::::
CCDS56 SDSG
>>CCDS56420.1 BRD2 gene_id:6046|Hs108|chr6 (836 aa)
initn: 4134 init1: 4134 opt: 4149 Z-score: 2260.0 bits: 429.1 E(32554): 1.5e-119
Smith-Waterman score: 5198; 95.8% identity (95.8% similar) in 833 aa overlap (1-798:1-833)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MLQNVTPHNKLPGEGNAGLLGLGPEAAAPGKRIRKPSLLYEGFESPTMASVPALQLTPAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 MLQNVTPHNKLPGEGNAGLLGLGPEAAAPGKRIRKPSLLYEGFESPTMASVPALQLTPAN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 PPPPEVSNPKKPGRVTNQLQYLHKVVMKALWKHQFAWPFRQPVDAVKLGLPDYHKIIKQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 PPPPEVSNPKKPGRVTNQLQYLHKVVMKALWKHQFAWPFRQPVDAVKLGLPDYHKIIKQP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 MDMGTIKRRLENNYYWAASECMQDFNTMFTNCYIYNKPTDDIVLMAQTLEKIFLQKVASM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 MDMGTIKRRLENNYYWAASECMQDFNTMFTNCYIYNKPTDDIVLMAQTLEKIFLQKVASM
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 PQEEQELVVTIPKNSHKKGAKLAALQGSVTSAHQVPAVSSVSHTALYTPPPEIPTTVLNI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 PQEEQELVVTIPKNSHKKGAKLAALQGSVTSAHQVPAVSSVSHTALYTPPPEIPTTVLNI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 PHPSVISSPLLKSLHSAGPPLLAVTAAPPAQPLAKKKGVKRKADTTTPTPTAILAPGSPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 PHPSVISSPLLKSLHSAGPPLLAVTAAPPAQPLAKKKGVKRKADTTTPTPTAILAPGSPA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 SPPGSLEPKAARLPPMRRESGRPIKPPRKDLPDSQQQHQSSKKGKLSEQLKHCNGILKEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 SPPGSLEPKAARLPPMRRESGRPIKPPRKDLPDSQQQHQSSKKGKLSEQLKHCNGILKEL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 LSKKHAAYAWPFYKPVDASALGLHDYHDIIKHPMDLSTVKRKMENRDYRDAQEFAADVRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 LSKKHAAYAWPFYKPVDASALGLHDYHDIIKHPMDLSTVKRKMENRDYRDAQEFAADVRL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 MFSNCYKYNPPDHDVVAMARKLQDVFEFRYAKMPDEPLEPGPLPVSTAMPPGLAKSSSES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 MFSNCYKYNPPDHDVVAMARKLQDVFEFRYAKMPDEPLEPGPLPVSTAMPPGLAKSSSES
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 SSEESSSESSSEEEEEEDEEDEEEEESESSDSEEERAHRLAELQEQLRAVHEQLAALSQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 SSEESSSESSSEEEEEEDEEDEEEEESESSDSEEERAHRLAELQEQLRAVHEQLAALSQG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 PISKPKRKREKKEKKKKRKAEKHRGRAGADEDDKGPRAPRPPQPKKSKKASGSGGGSAAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 PISKPKRKREKKEKKKKRKAEKHRGRAGADEDDKGPRAPRPPQPKKSKKASGSGGGSAAL
550 560 570 580 590 600
610 620
pF1KB3 GPSGFGPSGGSGTKL-----------------------------------PKKATKTAPP
::::::::::::::: ::::::::::
CCDS56 GPSGFGPSGGSGTKLQAGVQWRDLGLLQPPLLGFKRFSCLSLPSSQDYRLPKKATKTAPP
610 620 630 640 650 660
630 640 650 660 670 680
pF1KB3 ALPTGYDSEEEEESRPMSYDEKRQLSLDINKLPGEKLGRVVHIIQAREPSLRDSNPEEIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 ALPTGYDSEEEEESRPMSYDEKRQLSLDINKLPGEKLGRVVHIIQAREPSLRDSNPEEIE
670 680 690 700 710 720
690 700 710 720 730 740
pF1KB3 IDFETLKPSTLRELERYVLSCLRKKPRKPYTIKKPVGKTKEELALEKKRELEKRLQDVSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 IDFETLKPSTLRELERYVLSCLRKKPRKPYTIKKPVGKTKEELALEKKRELEKRLQDVSG
730 740 750 760 770 780
750 760 770 780 790 800
pF1KB3 QLNSTKKPPKKANEKTESSSAQQVAVSRLSASSSSSDSSSSSSSSSSSDTSDSDSG
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 QLNSTKKPPKKANEKTESSSAQQVAVSRLSASSSSSDSSSSSSSSSSSDTSDSDSG
790 800 810 820 830
>>CCDS6980.1 BRD3 gene_id:8019|Hs108|chr9 (726 aa)
initn: 2503 init1: 961 opt: 1971 Z-score: 1082.6 bits: 211.0 E(32554): 5.6e-54
Smith-Waterman score: 2918; 63.5% identity (79.5% similar) in 764 aa overlap (49-799:10-726)
20 30 40 50 60 70
pF1KB3 LLGLGPEAAAPGKRIRKPSLLYEGFESPTMASVPALQLTPANPPPPEVSNPKKPGRVTNQ
:..:: :.::::::::::.:::: :::
CCDS69 MSTATTVAPAGIPATP-GPVNPPPPEVSNPSKPGRKTNQ
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KB3 LQYLHKVVMKALWKHQFAWPFRQPVDAVKLGLPDYHKIIKQPMDMGTIKRRLENNYYWAA
:::...::.:.:::::::::: :::::.::.:::::::::.::::::::.::::::::.:
CCDS69 LQYMQNVVVKTLWKHQFAWPFYQPVDAIKLNLPDYHKIIKNPMDMGTIKKRLENNYYWSA
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KB3 SECMQDFNTMFTNCYIYNKPTDDIVLMAQTLEKIFLQKVASMPQEEQELVVTIPKNSHKK
:::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::.::::: ::. ::.. .:
CCDS69 SECMQDFNTMFTNCYIYNKPTDDIVLMAQALEKIFLQKVAQMPQEEVELLPPAPKGKGRK
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KB3 GAKLAALQGSVTSAHQVPAVSSVSH-TALYTPPPEIPTT--VLNIPHPS----VISSPLL
: : :. .:: :::::: : . . :: . : . : :. : : :.
CCDS69 PAAGAQSAGT----QQVAAVSSVSPATPFQSVPPTVSQTPVIAATPVPTITANVTSVPVP
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KB3 KSLHSAGPPLLAVTAAPPAQPLAKKKGVKRKADTTTPTPTAILAPGSPASPPGSLEPKAA
. : : ..::. :..::::::::::::::: .:: : : . :: : .:: :
CCDS69 PAAAPPPPATPIVPVVPPTPPVVKKKGVKRKADTTTPTTSAITASRSESPPPLS-DPKQA
220 230 240 250 260 270
320 330 340 350 360 370
pF1KB3 RLPPMRRESGRPIKPPRKDLPDSQQQHQSSKKGKLSEQLKHCNGILKELLSKKHAAYAWP
.. :. .:::::::.::: :.. ....:::::::.:..:..::.:.:::::::::::
CCDS69 KVVARRESGGRPIKPPKKDLEDGEVPQHAGKKGKLSEHLRYCDSILREMLSKKHAAYAWP
280 290 300 310 320 330
380 390 400 410 420 430
pF1KB3 FYKPVDASALGLHDYHDIIKHPMDLSTVKRKMENRDYRDAQEFAADVRLMFSNCYKYNPP
::::::: :: :::::::::::::::::::::..:.: ::: ::::::::::::::::::
CCDS69 FYKPVDAEALELHDYHDIIKHPMDLSTVKRKMDGREYPDAQGFAADVRLMFSNCYKYNPP
340 350 360 370 380 390
440 450 460 470 480 490
pF1KB3 DHDVVAMARKLQDVFEFRYAKMPDEPLEPGPLPVSTAMPPGLAKSSSES-SSEESSSESS
::.:::::::::::::.:.:::::::.: ::. .: : ..:.. : :::::::.:.
CCDS69 DHEVVAMARKLQDVFEMRFAKMPDEPVEAPALPAPAA--PMVSKGAESSRSSEESSSDSG
400 410 420 430 440 450
500 510 520 530 540 550
pF1KB3 SEEEEEEDEEDEEEEESESSDSEEERAHRLAELQEQLRAVHEQLAALSQGPISKPKRKRE
: :::::::: :::::::::.:::::::::::.:..:::.:.:
CCDS69 S------------------SDSEEERATRLAELQEQLKAVHEQLAALSQAPVNKPKKKKE
460 470 480 490
560 570 580 590 600
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::::.::.: ::.. .. :.:. :. :: : . ..::: .. ..:..
CCDS69 KKEKEKKKKDKEKEKEKHKVKAEEEKKAKVAP-PAKQAQQKKAPAKKANSTTT-------
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:::.::::::::::.:::::::::::.::::::::: :::.:: :::.. :: ..:.:
CCDS69 IIQSREPSLRDSNPDEIEIDFETLKPTTLRELERYVKSCLQKKQRKPFSASGKKQAAKSK
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:::: :::.:::::::::::::.:.::: .: :: .:: . . :::: :::::.:.:
CCDS69 EELAQEKKKELEKRLQDVSGQLSSSKKPARK--EKP--GSAPSGGPSRLS-SSSSSESGS
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::::.::::.:::.
CCDS69 SSSSGSSSDSSDSE
720
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.. .... :
CCDS46 SDSEDSETGPA
720
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CCDS12 KIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFL
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CCDS12 AATPQPVKTKKGVKRKADTTTPTTIDPIHEP--PSLPP---EPKTTKLG-QRRESSRPVK
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CCDS12 PPKKDVPDSQQHPAPEKSSKVSEQLKCCSGILKEMFAKKHAAYAWPFYKPVDVEALGLHD
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CCDS12 -RKEEVEENKKSKAKEPP-PKKTKKNNSSNSNVSKKEPA---P------------MKSKP
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CCDS12 P--PT-YESEEEDKCKPMSYEEKRQLSLDINKLPGEKLGRVVHIIQSREPSLKNSNPDEI
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pF1KB3 EIDFETLKPSTLRELERYVLSCLRKKPRKPYTIKKPV--GKTKEELALEKKRELEKRLQD
::::::::::::::::::: :::::: ::: . : : :..: . .. : .. ..
CCDS12 EIDFETLKPSTLRELERYVTSCLRKK-RKPQAEKVDVIAGSSKMKGFSSSESESSSESSS
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pF1KB3 VSGQLNSTKKPPKKANEKTESSSAQQVAVSRLSASSSSSDSSSSSSSSSSSDTSDSDSG
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CCDS12 SDSEDSETEMAPKSKKKGHPGREQKKHHHHHHQQMQQAPAPVPQQPPPPPQQPPPPPPPQ
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CCDS55 MDLNTIKKRLENKYYAKASECIEDFNTMFS
10 20 30
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pF1KB3 NCYIYNKPTDDIVLMAQTLEKIFLQKVASMPQEEQELVVTIPKNSHKKGAKLAALQGSVT
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CCDS55 NCYLYNKPGDDIVLMAQALEKLFMQKLSQMPQEEQ--VVGV-KERIKKGTQQNI---AVS
40 50 60 70 80
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pF1KB3 SAHQVPAVSSVSHTALYTPPPEIPTTVLNIPHPSVISSPLLKSLHSAGPPLLAVTAAPPA
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CCDS55 SAKEK---SSPSATEKVFKQQEIPSV---FPKTSI--SPL-NVVQGASVNSSSQTAAQVT
90 100 110 120 130
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CCDS55 ------KGVKRKADTTTPATSAVKA-SSEFSP--TFTEKSVALPPIKENM------PKNV
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CCDS55 LPDSQQQYNVVKTVKVTEQLRHCSEILKEMLAKKHFSYAWPFYNPVDVNALGLHNYYDVV
190 200 210 220 230 240
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:.::::.:.:.::.:..:.:: .::::::::: ::::::::::.::.::: :::::: ..
CCDS55 KNPMDLGTIKEKMDNQEYKDAYKFAADVRLMFMNCYKYNPPDHEVVTMARMLQDVFETHF
250 260 270 280 290 300
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pF1KB3 AKMPDEPLEPGPLPVSTAMPPGLAKSSSESSSEESSSESSSEEEEEEDEEDEEEEESESS
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CCDS55 SKIPIEPVESMPL---CYIKTDITETTGRENTNEASSEGNS-----------------SD
310 320 330 340
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pF1KB3 DSEEERAHRLAELQEQLRAVHEQLAALSQGPISKPKRKREKKEKKKKRKAEKHRGRAGAD
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CCDS55 DSEDERVKRLAKLQEQLKAVHQQLQVLSQVPFRKLNKKKEKSKKEKKK--EK------VN
350 360 370 380 390
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.....:: . : : : . ::: . :
CCDS55 NSNENPRKMCEQMRLKEK----------------------SKRNQPKKRKQQF-----IG
400 410 420
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CCDS55 LKSEDEDNAKPMNYDEKRQLSLNINKLPGDKLGRVVHIIQSREPSLSNSNPDEIEIDFET
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:. : ..::. :.: . ::::: ::::: :::: : ::::: :.:::
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550 560 570 580 590
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:: :::::: ...:.: ::.: .:: :.. .:....:...:.:::
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CCDS55 ---------NSSDDSEDERVKRLAKLQEQLKAVHQQLQVLSQVPFRKLNKKKEKSKKEKK
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. :: .......:: . : : : . ::
CCDS55 K--EK------VNNSNENPRKMCEQMRLKEK----------------------SKRNQPK
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CCDS55 KRKQQF-----IGLKSEDEDNAKPMNYDEKRQLSLNINKLPGDKLGRVVHIIQSREPSLS
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CCDS55 NSNPDEIEIDFETLKASTLRELEKYVSACLRKRPLKPPA--KKIMMSKEELHSQKKQELE
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CCDS55 KRLLDVNNQLNSRKRQTK--SDKTQPSKAVE-NVSRLSESSSSS-SSSSESESSSSDLSS
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800
pF1KB3 SDSG
:::
CCDS55 SDSSDSESEMFPKFTEVKPNDSPSKENVKKMKNECIPPEGRTGVTQIGYCVQDTTSANTT
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CCDS72 MSLPSRQTAIIVNPPPPEYINTKKNGRLTNQ
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CCDS72 LQYLQKVVLKDLWKHSFSWPFQRPVDAVKLQLPDYYTIIKNPMDLNTIKKRLENKYYAKA
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CCDS72 SVNSSSQTAAQVT------KGVKRKADTTTPATSAVKA-SSEFSP--TFTEKSVALPPIK
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CCDS72 VNALGLHNYYDVVKNPMDLGTIKEKMDNQEYKDAYKFAADVRLMFMNCYKYNPPDHEVVT
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]