Result of FASTA (ccds) for
pF1KB3864
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3864, 1142 aa
1>>>pF1KB3864 1142 - 1142 aa - 1142 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.8521+/-0.000948; mu= 2.2034+/- 0.057
mean_var=262.8834+/-53.480, 0's: 0 Z-trim(114.4): 45 B-trim: 184 in 1/51
Lambda= 0.079103
statistics sampled from 14905 (14946) to 14905 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.768), E-opt: 0.2 (0.459), width: 16
Scan time: 4.800
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS2445.1 SLC4A3 gene_id:6508|Hs108|chr2 (1232) 5382 628.3 3.3e-179
CCDS2446.1 SLC4A3 gene_id:6508|Hs108|chr2 (1259) 5382 628.3 3.3e-179
CCDS56521.1 SLC4A2 gene_id:6522|Hs108|chr7 (1227) 3445 407.3 1.1e-112
CCDS56520.1 SLC4A2 gene_id:6522|Hs108|chr7 (1232) 3445 407.3 1.1e-112
CCDS5917.1 SLC4A2 gene_id:6522|Hs108|chr7 (1241) 3445 407.3 1.2e-112
CCDS11481.1 SLC4A1 gene_id:6521|Hs108|chr17 ( 911) 1539 189.7 2.7e-47
CCDS58975.1 SLC4A9 gene_id:83697|Hs108|chr5 ( 945) 1107 140.4 1.9e-32
CCDS58819.1 SLC4A7 gene_id:9497|Hs108|chr3 (1090) 1012 129.6 4e-29
CCDS82750.1 SLC4A7 gene_id:9497|Hs108|chr3 (1095) 1012 129.6 4e-29
CCDS58820.1 SLC4A7 gene_id:9497|Hs108|chr3 (1131) 1012 129.6 4.1e-29
CCDS82751.1 SLC4A7 gene_id:9497|Hs108|chr3 (1206) 1012 129.6 4.3e-29
CCDS82748.1 SLC4A7 gene_id:9497|Hs108|chr3 (1210) 1012 129.6 4.3e-29
CCDS33721.1 SLC4A7 gene_id:9497|Hs108|chr3 (1214) 1012 129.6 4.3e-29
CCDS82749.1 SLC4A7 gene_id:9497|Hs108|chr3 (1246) 1012 129.6 4.4e-29
CCDS82747.1 SLC4A7 gene_id:9497|Hs108|chr3 (1259) 1012 129.6 4.5e-29
CCDS3549.1 SLC4A4 gene_id:8671|Hs108|chr4 (1035) 985 126.5 3.2e-28
CCDS43236.1 SLC4A4 gene_id:8671|Hs108|chr4 (1079) 985 126.5 3.3e-28
CCDS47071.1 SLC4A4 gene_id:8671|Hs108|chr4 (1094) 985 126.5 3.4e-28
CCDS46438.1 SLC4A10 gene_id:57282|Hs108|chr2 (1088) 977 125.6 6.3e-28
CCDS54412.1 SLC4A10 gene_id:57282|Hs108|chr2 (1099) 977 125.6 6.4e-28
CCDS54411.1 SLC4A10 gene_id:57282|Hs108|chr2 (1118) 977 125.6 6.5e-28
CCDS73470.1 SLC4A8 gene_id:9498|Hs108|chr12 (1040) 961 123.7 2.2e-27
CCDS44890.1 SLC4A8 gene_id:9498|Hs108|chr12 (1093) 961 123.8 2.3e-27
CCDS1937.1 SLC4A5 gene_id:57835|Hs108|chr2 (1121) 952 122.7 4.7e-27
CCDS47278.1 SLC4A9 gene_id:83697|Hs108|chr5 ( 959) 897 116.4 3.2e-25
CCDS58973.1 SLC4A9 gene_id:83697|Hs108|chr5 ( 983) 897 116.4 3.3e-25
CCDS58974.1 SLC4A9 gene_id:83697|Hs108|chr5 ( 896) 797 105.0 8.3e-22
CCDS54446.1 SLC4A11 gene_id:83959|Hs108|chr20 ( 875) 644 87.5 1.5e-16
CCDS13052.1 SLC4A11 gene_id:83959|Hs108|chr20 ( 891) 644 87.5 1.5e-16
CCDS54445.1 SLC4A11 gene_id:83959|Hs108|chr20 ( 918) 644 87.5 1.5e-16
CCDS58233.1 SLC4A8 gene_id:9498|Hs108|chr12 ( 638) 575 79.5 2.7e-14
CCDS58232.1 SLC4A8 gene_id:9498|Hs108|chr12 ( 747) 575 79.6 3.1e-14
CCDS1936.1 SLC4A5 gene_id:57835|Hs108|chr2 (1137) 562 78.2 1.2e-13
>>CCDS2445.1 SLC4A3 gene_id:6508|Hs108|chr2 (1232 aa)
initn: 6772 init1: 5380 opt: 5382 Z-score: 3330.9 bits: 628.3 E(32554): 3.3e-179
Smith-Waterman score: 6727; 87.8% identity (87.8% similar) in 1201 aa overlap (59-1142:59-1232)
30 40 50 60 70 80
pF1KB3 PDVEEEDDDLGKTLAVSRFGDLISKPPAWDPEKPSRSYSERDFEFHRHTSHHTHHPLSAR
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 PDVEEEDDDLGKTLAVSRFGDLISKPPAWDPEKPSRSYSERDFEFHRHTSHHTHHPLSAR
30 40 50 60 70 80
90 100 110 120 130 140
pF1KB3 LPPPHKLRRLPPTSARHTRRKRKKEKTSAPPSEGTPPIQEEGGAGVDEEEEEEEEEEGES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 LPPPHKLRRLPPTSARHTRRKRKKEKTSAPPSEGTPPIQEEGGAGVDEEEEEEEEEEGES
90 100 110 120 130 140
150 160 170 180 190 200
pF1KB3 EAEPVEPPPSGTPQKAKFSIGSDEDDSPGLPGRAAVTKPLPSVGPHTDKSPQHSSRPCSE
:::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 EAEPVEPPHSGTPQKAKFSIGSDEDDSPGLPGRAAVTKPLPSVGPHTDKSPQHSS-----
150 160 170 180 190 200
210 220 230 240 250 260
pF1KB3 LRDGDGTTDLALSSPRLLCCLPSSPSPRARASRLAGEKSRPWSPSASYDLRERLCPGSAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 ----------------------SSPSPRARASRLAGEKSRPWSPSASYDLRERLCPGSAL
210 220 230 240
270 280 290 300 310 320
pF1KB3 GNPGGPEQQVPTDEAEAQMLGSADLDDMKSHRLEDNPGVRRHLVKKPSRTQGGRGSPS--
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 GNPGGPEQQVPTDEAEAQMLGSADLDDMKSHRLEDNPGVRRHLVKKPSRTQGGRGSPSGL
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 ------------------------------------------------------------
CCDS24 APILRRKKKKKKLDRRPHEVFVELNELMLDRSQEPHWRETARWIKFEEDVEEETERWGKP
310 320 330 340 350 360
330
pF1KB3 -------------------------------------------------------VLRTL
:::::
CCDS24 HVASLSFRSLLELRRTIAHGAALLDLEQTTLPGIAHLVVETMIVSDQIRPEDRASVLRTL
370 380 390 400 410 420
340 350 360 370 380 390
pF1KB3 LLKHSHPNDDKDSGFFPRNPSSSSMNSVLGNHHPTPSHGPDGAVPTMADDLGEPAPLWPH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 LLKHSHPNDDKDSGFFPRNPSSSSMNSVLGNHHPTPSHGPDGAVPTMADDLGEPAPLWPH
430 440 450 460 470 480
400 410 420 430 440 450
pF1KB3 DPDAKEKPLHMPGGDGHRGKSLKLLEKIPEDAEATVVLVGCVPFLEQPAAAFVRLNEAVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 DPDAKEKPLHMPGGDGHRGKSLKLLEKIPEDAEATVVLVGCVPFLEQPAAAFVRLNEAVL
490 500 510 520 530 540
460 470 480 490 500 510
pF1KB3 LESVLEVPVPVRFLFVMLGPSHTSTDYHELGRSIATLMSDKLFHEAAYQADDRQDLLSAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 LESVLEVPVPVRFLFVMLGPSHTSTDYHELGRSIATLMSDKLFHEAAYQADDRQDLLSAI
550 560 570 580 590 600
520 530 540 550 560 570
pF1KB3 SEFLDGSIVIPPSEVEGRDLLRSVAAFQRELLRKRREREQTKVEMTTRGGYTAPGKELSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 SEFLDGSIVIPPSEVEGRDLLRSVAAFQRELLRKRREREQTKVEMTTRGGYTAPGKELSL
610 620 630 640 650 660
580 590 600 610 620 630
pF1KB3 ELGGSEATPEDDPLLRTGSVFGGLVRDVRRRYPHYPSDLRDALHSQCVAAVLFIYFAALS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 ELGGSEATPEDDPLLRTGSVFGGLVRDVRRRYPHYPSDLRDALHSQCVAAVLFIYFAALS
670 680 690 700 710 720
640 650 660 670 680 690
pF1KB3 PAITFGGLLGEKTEGLMGVSELIVSTAVLGVLFSLLGAQPLLVVGFSGPLLVFEEAFFKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 PAITFGGLLGEKTEGLMGVSELIVSTAVLGVLFSLLGAQPLLVVGFSGPLLVFEEAFFKF
730 740 750 760 770 780
700 710 720 730 740 750
pF1KB3 CRAQDLEYLTGRVWVGLWLVVFVLALVAAEGSFLVRYISPFTQEIFAFLISLIFIYETFY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 CRAQDLEYLTGRVWVGLWLVVFVLALVAAEGSFLVRYISPFTQEIFAFLISLIFIYETFY
790 800 810 820 830 840
760 770 780 790 800 810
pF1KB3 KLYKVFTEHPLLPFYPPEGALEGSLAAGLEPNGSALPPTEGPPSPRNQPNTALLSLILML
::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 KLYKVFTEHPLLPFYPPEGALEGSLDAGLEPNGSALPPTEGPPSPRNQPNTALLSLILML
850 860 870 880 890 900
820 830 840 850 860 870
pF1KB3 GTFFIAFFLRKFRNSRFLGGKARRIIGDFGIPISILVMVLVDYSITDTYTQKLTVPTGLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 GTFFIAFFLRKFRNSRFLGGKARRIIGDFGIPISILVMVLVDYSITDTYTQKLTVPTGLS
910 920 930 940 950 960
880 890 900 910 920 930
pF1KB3 VTSPDKRSWFIPPLGSARPFPPWMMVAAAVPALLVLILIFMETQITALIVSQKARRLLKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 VTSPDKRSWFIPPLGSARPFPPWMMVAAAVPALLVLILIFMETQITALIVSQKARRLLKG
970 980 990 1000 1010 1020
940 950 960 970 980 990
pF1KB3 SGFHLDLLLIGSLGGLCGLFGLPWLTAATVRSVTHVNALTVMRTAIAPGDKPQIQEVREQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 SGFHLDLLLIGSLGGLCGLFGLPWLTAATVRSVTHVNALTVMRTAIAPGDKPQIQEVREQ
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KB3 RVTGVLIASLVGLSIVMGAVLRRIPLAVLFGIFLYMGVTSLSGIQLSQRLLLILMPAKHH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 RVTGVLIASLVGLSIVMGAVLRRIPLAVLFGIFLYMGVTSLSGIQLSQRLLLILMPAKHH
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KB3 PEQPYVTKVKTWRMHLFTCIQLGCIALLWVVKSTAASLAFPFLLLLTVPLRHCLLPRLFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 PEQPYVTKVKTWRMHLFTCIQLGCIALLWVVKSTAASLAFPFLLLLTVPLRHCLLPRLFQ
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1120 1130 1140
pF1KB3 DRELQALDSEDAEPNFDEDGQDEYNELHMPV
:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 DRELQALDSEDAEPNFDEDGQDEYNELHMPV
1210 1220 1230
>>CCDS2446.1 SLC4A3 gene_id:6508|Hs108|chr2 (1259 aa)
initn: 5380 init1: 5380 opt: 5382 Z-score: 3330.8 bits: 628.3 E(32554): 3.3e-179
Smith-Waterman score: 6785; 89.9% identity (89.9% similar) in 1174 aa overlap (86-1142:86-1259)
60 70 80 90 100 110
pF1KB3 AWDPEKPSRSYSERDFEFHRHTSHHTHHPLSARLPPPHKLRRLPPTSARHTRRKRKKEKT
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 AWDPEKPSRSYSERDFEFHRHTSHHTHHPLSARLPPPHKLRRLPPTSARHTRRKRKKEKT
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB3 SAPPSEGTPPIQEEGGAGVDEEEEEEEEEEGESEAEPVEPPPSGTPQKAKFSIGSDEDDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::
CCDS24 SAPPSEGTPPIQEEGGAGVDEEEEEEEEEEGESEAEPVEPPHSGTPQKAKFSIGSDEDDS
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB3 PGLPGRAAVTKPLPSVGPHTDKSPQHSSRPCSELRDGDGTTDLALSSPRLLCCLPSSPSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 PGLPGRAAVTKPLPSVGPHTDKSPQHSSRPCSELRDGDGTTDLALSSPRLLCCLPSSPSP
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB3 RARASRLAGEKSRPWSPSASYDLRERLCPGSALGNPGGPEQQVPTDEAEAQMLGSADLDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 RARASRLAGEKSRPWSPSASYDLRERLCPGSALGNPGGPEQQVPTDEAEAQMLGSADLDD
240 250 260 270 280 290
300 310 320
pF1KB3 MKSHRLEDNPGVRRHLVKKPSRTQGGRGSPS-----------------------------
:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 MKSHRLEDNPGVRRHLVKKPSRTQGGRGSPSGLAPILRRKKKKKKLDRRPHEVFVELNEL
300 310 320 330 340 350
pF1KB3 ------------------------------------------------------------
CCDS24 MLDRSQEPHWRETARWIKFEEDVEEETERWGKPHVASLSFRSLLELRRTIAHGAALLDLE
360 370 380 390 400 410
330 340 350
pF1KB3 ----------------------------VLRTLLLKHSHPNDDKDSGFFPRNPSSSSMNS
::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 QTTLPGIAHLVVETMIVSDQIRPEDRASVLRTLLLKHSHPNDDKDSGFFPRNPSSSSMNS
420 430 440 450 460 470
360 370 380 390 400 410
pF1KB3 VLGNHHPTPSHGPDGAVPTMADDLGEPAPLWPHDPDAKEKPLHMPGGDGHRGKSLKLLEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 VLGNHHPTPSHGPDGAVPTMADDLGEPAPLWPHDPDAKEKPLHMPGGDGHRGKSLKLLEK
480 490 500 510 520 530
420 430 440 450 460 470
pF1KB3 IPEDAEATVVLVGCVPFLEQPAAAFVRLNEAVLLESVLEVPVPVRFLFVMLGPSHTSTDY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 IPEDAEATVVLVGCVPFLEQPAAAFVRLNEAVLLESVLEVPVPVRFLFVMLGPSHTSTDY
540 550 560 570 580 590
480 490 500 510 520 530
pF1KB3 HELGRSIATLMSDKLFHEAAYQADDRQDLLSAISEFLDGSIVIPPSEVEGRDLLRSVAAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 HELGRSIATLMSDKLFHEAAYQADDRQDLLSAISEFLDGSIVIPPSEVEGRDLLRSVAAF
600 610 620 630 640 650
540 550 560 570 580 590
pF1KB3 QRELLRKRREREQTKVEMTTRGGYTAPGKELSLELGGSEATPEDDPLLRTGSVFGGLVRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 QRELLRKRREREQTKVEMTTRGGYTAPGKELSLELGGSEATPEDDPLLRTGSVFGGLVRD
660 670 680 690 700 710
600 610 620 630 640 650
pF1KB3 VRRRYPHYPSDLRDALHSQCVAAVLFIYFAALSPAITFGGLLGEKTEGLMGVSELIVSTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 VRRRYPHYPSDLRDALHSQCVAAVLFIYFAALSPAITFGGLLGEKTEGLMGVSELIVSTA
720 730 740 750 760 770
660 670 680 690 700 710
pF1KB3 VLGVLFSLLGAQPLLVVGFSGPLLVFEEAFFKFCRAQDLEYLTGRVWVGLWLVVFVLALV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 VLGVLFSLLGAQPLLVVGFSGPLLVFEEAFFKFCRAQDLEYLTGRVWVGLWLVVFVLALV
780 790 800 810 820 830
720 730 740 750 760 770
pF1KB3 AAEGSFLVRYISPFTQEIFAFLISLIFIYETFYKLYKVFTEHPLLPFYPPEGALEGSLAA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :
CCDS24 AAEGSFLVRYISPFTQEIFAFLISLIFIYETFYKLYKVFTEHPLLPFYPPEGALEGSLDA
840 850 860 870 880 890
780 790 800 810 820 830
pF1KB3 GLEPNGSALPPTEGPPSPRNQPNTALLSLILMLGTFFIAFFLRKFRNSRFLGGKARRIIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 GLEPNGSALPPTEGPPSPRNQPNTALLSLILMLGTFFIAFFLRKFRNSRFLGGKARRIIG
900 910 920 930 940 950
840 850 860 870 880 890
pF1KB3 DFGIPISILVMVLVDYSITDTYTQKLTVPTGLSVTSPDKRSWFIPPLGSARPFPPWMMVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 DFGIPISILVMVLVDYSITDTYTQKLTVPTGLSVTSPDKRSWFIPPLGSARPFPPWMMVA
960 970 980 990 1000 1010
900 910 920 930 940 950
pF1KB3 AAVPALLVLILIFMETQITALIVSQKARRLLKGSGFHLDLLLIGSLGGLCGLFGLPWLTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 AAVPALLVLILIFMETQITALIVSQKARRLLKGSGFHLDLLLIGSLGGLCGLFGLPWLTA
1020 1030 1040 1050 1060 1070
960 970 980 990 1000 1010
pF1KB3 ATVRSVTHVNALTVMRTAIAPGDKPQIQEVREQRVTGVLIASLVGLSIVMGAVLRRIPLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 ATVRSVTHVNALTVMRTAIAPGDKPQIQEVREQRVTGVLIASLVGLSIVMGAVLRRIPLA
1080 1090 1100 1110 1120 1130
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KB3 VLFGIFLYMGVTSLSGIQLSQRLLLILMPAKHHPEQPYVTKVKTWRMHLFTCIQLGCIAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 VLFGIFLYMGVTSLSGIQLSQRLLLILMPAKHHPEQPYVTKVKTWRMHLFTCIQLGCIAL
1140 1150 1160 1170 1180 1190
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KB3 LWVVKSTAASLAFPFLLLLTVPLRHCLLPRLFQDRELQALDSEDAEPNFDEDGQDEYNEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 LWVVKSTAASLAFPFLLLLTVPLRHCLLPRLFQDRELQALDSEDAEPNFDEDGQDEYNEL
1200 1210 1220 1230 1240 1250
1140
pF1KB3 HMPV
::::
CCDS24 HMPV
>--
initn: 610 init1: 610 opt: 610 Z-score: 387.6 bits: 83.7 E(32554): 2.9e-15
Smith-Waterman score: 610; 100.0% identity (100.0% similar) in 85 aa overlap (1-85:1-85)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MANGVIPPPGGASPLPQVRVPLEEPPLSPDVEEEDDDLGKTLAVSRFGDLISKPPAWDPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 MANGVIPPPGGASPLPQVRVPLEEPPLSPDVEEEDDDLGKTLAVSRFGDLISKPPAWDPE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 KPSRSYSERDFEFHRHTSHHTHHPLSARLPPPHKLRRLPPTSARHTRRKRKKEKTSAPPS
:::::::::::::::::::::::::
CCDS24 KPSRSYSERDFEFHRHTSHHTHHPLSARLPPPHKLRRLPPTSARHTRRKRKKEKTSAPPS
70 80 90 100 110 120
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:.:
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:.: :::: ... ..:. :: : :.. .: : .::.:::::::
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>>CCDS56520.1 SLC4A2 gene_id:6522|Hs108|chr7 (1232 aa)
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pF1KB3 LGKTLAVSRFGDLISKPPAWDPEKPSRSYSERDFEFHRHTSHHTHHPLSARLPPPHKLRR
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CCDS56 VSTPSSVQFFL--QEDDSADRKAERTSPSSPAPL--PHQEATPRASKGAQAGTQVEEAEA
140 150 160 170 180 190
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:.:
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330
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pF1KB3 QEVREQRVTGVLIASLVGLSIVMGAVLRRIPLAVLFGIFLYMGVTSLSGIQLSQRLLLIL
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CCDS56 QEVKEQRVTGLLVALLVGLSIVIGDLLRQIPLAVLFGIFLYMGVTSLNGIQFYERLHLLL
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CCDS56 MPPKHHPDVTYVKKVRTLRMHLFTALQLLCLALLWAVMSTAASLAFPFILILTVPLRMVV
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pF1KB3 LPRLFQDRELQALDSEDAEPNFDE-DGQDEYNELHMPV
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CCDS56 LTRIFTDREMKCLDANEAEPVFDEREGVDEYNEMPMPV
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>>CCDS5917.1 SLC4A2 gene_id:6522|Hs108|chr7 (1241 aa)
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pF1KB3 LGKTLAVSRFGDLISKPPAWDPEKPSRSYSERDFEFHRHTSHHTHHPLSARLPPPHKLRR
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CCDS59 LHRTLGVERFEEILQEAGSRGGEEPGRSYGEEDFEYHRQSSHHIHHPLSTHLPPDARRRK
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CCDS59 TPQGPGRKPRRR-----PGASPTGETPTI-EEG------EEDEDEASEAEGARALTQPSP
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pF1KB3 SGTPQKAKFSIGSDEDDSPGLPG-RAAVTKPLPSVGPHTDKSPQHS--SRPCSELRDGDG
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CCDS59 VSTPSSVQFFL--QEDDSADRKAERTSPSSPAPL--PHQEATPRASKGAQAGTQVEEAEA
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pF1KB3 TTDLALSSPRLLCCLPSSPSPRARASRLAGEKSRPWSPSASYDLRERLCPGSALGNPGGP
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CCDS59 EA-VAVASG-------TAGGDDGGASGRPLPKAQP--GHRSYNLQERRRIGSMTGAEQAL
210 220 230 240 250
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pF1KB3 EQQVPTDEAEAQMLGSADLDDMKSHRLEDNPGVRRHLVKKPSR--TQGGR----------
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CCDS59 LPRVPTDEIEAQTLATADLDLMKSHRFEDVPGVRRHLVRKNAKGSTQSGREGREPGPTPR
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CCDS59 ARPRAPHKPHEVFVELNELLLDKNQEPQWRETARWIKFEEDVEEETERWGKPHVASLSFR
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CCDS59 SLLELRRTLAHGAVLLDLDQQTLPGVAHQVVEQMVISDQIKAEDRANVLRALLLKHSHPS
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CCDS59 DEKDFSF-PRNISAGSLGSLLGHHHGQGAESDPHVTEPLMG---GVPETRLEVERE-REL
440 450 460 470 480
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pF1KB3 PLHMPGGDGHRGKS---LKLLEKIPEDAEATVVLVGCVPFLEQPAAAFVRLNEAVLLESV
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CCDS59 PPPAPPAGITRSKSKHELKLLEKIPENAEATVVLVGCVEFLSRPTMAFVRLREAVELDAV
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:::::::::::..:::: .. ::::.::::.:::::: :::::: ::.:.:::.::. ::
CCDS59 LEVPVPVRFLFLLLGPSSANMDYHEIGRSISTLMSDKQFHEAAYLADEREDLLTAINAFL
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520 530 540 550 560 570
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CCDS59 DCSVVLPPSEVQGEELLRSVAHFQRQMLKKREE--QGRLLPTGAGLEPKSAQDKAL-LQM
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CCDS59 VEAAGAAEDDPLRRTGRPFGGLIRDVRRRYPHYLSDFRDALDPQCLAAVIFIYFAALSPA
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CCDS59 ITFGGLLGEKTQDLIGVSELIMSTALQGVVFCLLGAQPLLVIGFSGPLLVFEEAFFSFCS
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.. ::::.::::.:.::: ..: .:: :::::::..: ::::::::::::::::::::::
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:.: :::: ... ..:. :: : :.. .: : .::.:::::::
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810 820 830 840 850 860
pF1KB3 SLILMLGTFFIAFFLRKFRNSRFLGGKARRIIGDFGIPISILVMVLVDYSITDTYTQKLT
::.:: ::::::::::::.::::. :. ::.:::::.::.::.:::::::: :::::::.
CCDS59 SLVLMAGTFFIAFFLRKFKNSRFFPGRIRRVIGDFGVPIAILIMVLVDYSIEDTYTQKLS
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870 880 890 900 910 920
pF1KB3 VPTGLSVTSPDKRSWFIPPLGSARPFPPWMMVAAAVPALLVLILIFMETQITALIVSQKA
::.:.:::.:.::.: : ::: ::: :::::. .::.::.::::::::::.::.:.:
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: : :::::::::::: ..::.:.:::::::.:::::::::.:::::: :.::::::.:
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990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KB3 QEVREQRVTGVLIASLVGLSIVMGAVLRRIPLAVLFGIFLYMGVTSLSGIQLSQRLLLIL
:::.::::::.:.: :::::::.: .::.::::::::::::::::::.:::. .:: :.:
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1050 1060 1070 1080 1090 1100
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:: ::::. :: ::.: :::::: .:: :.::::.: ::::::::::.:.:::::: .
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: :..:.. . :.: : ::: :: ::: :.:.:::::.::::.:.:::.::::. :
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...:::::::::::. ..::. .:::.:::.:.:::::::.:::::: : .:: :::
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CCDS58 YVSATVISLAHMDSLRRESRACAPGERPNFLGIREQRLTGLVVFILTGASIFLAPVLKFI
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pF1KB3 PLAVLFGIFLYMGVTSLSGIQLSQRLLLILMPAKHHPEQPYVTKVKTWRMHLFTCIQLGC
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CCDS58 PMPVLYGIFLYMGVAALSSIQFTNRVKLLLMPAKHQPDLLLLRHVPLTRVHLFTAIQLAC
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pF1KB3 IALLWVVKSTAASLAFPFLLLLTVPLRHCLLPRLFQDRELQALDS--EDAEPNFDEDGQD
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CCDS58 LGLLWIIKSTPAAIIFPLMLLGLVGVRKAL-ERVFSPQELLWLDELMPEEERSIPEKGLE
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CCDS58 MIASGQLDESIR--ENVREALLKRHHHQNEKR---FTSRIPLVRSFADI-GKKHSDPHLL
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CCDS58 AYSLFAGQPLTILGSTGPVLVFEKILYKFCRDYQLSYLSLRTSIGLWTSFLCIVLVATDA
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CCDS58 SSLVCYITRFTEEAFAALICIIFIYEALEKLFDLGETYAFNMHNNLDKLTSYSCVCTEPP
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CCDS58 NPSNE-TLAQWKKDNITAHNISWRNLTVSECKKLRGVFLGSACGHHGPYI-PDVLFWCVI
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CCDS58 LFFTTFFLSSFLKQFKTKRYFPTKVRSTISDFAVFLTIVIMVTIDY-LVGVPSPKLHVPE
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CCDS58 KFEPTHPE-RGWIISPLGDN---PWWTLLIAAIPALLCTILIFMDQQITAVIINRKEHKL
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CCDS58 KKGAGYHLDLLMVGVMLGVCSVMGLPWFVAATVLSISHVNSLKVESECSAPGEQPKFLGI
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CCDS58 REQRVTGLMIFILMGLSVFMTSVLKFIPMPVLYGVFLYMGVSSLKGIQLFDRIKLFGMPA
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CCDS58 KHQPDLIYLRYVPLWKVHIFTVIQLTCLVLLWVIKVSAAAVVFPMMVLALVFVRK-LMDL
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CCDS58 CFTKRELSWLD--DLMPESKKKKEDDKKKKEKEEAERMLQDDDDTVHLPFEGGSLLQIPV
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