Result of FASTA (ccds) for
pF1KB3902
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3902, 612 aa
1>>>pF1KB3902 612 - 612 aa - 612 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.9549+/-0.00119; mu= -0.5630+/- 0.070
mean_var=168.0105+/-34.543, 0's: 0 Z-trim(105.4): 128 B-trim: 90 in 1/52
Lambda= 0.098948
statistics sampled from 8297 (8426) to 8297 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.619), E-opt: 0.2 (0.259), width: 16
Scan time: 3.150
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS32323.1 NTRK3 gene_id:4916|Hs108|chr15 ( 612) 4191 611.4 1.1e-174
CCDS10340.1 NTRK3 gene_id:4916|Hs108|chr15 ( 825) 3608 528.3 1.5e-149
CCDS32322.1 NTRK3 gene_id:4916|Hs108|chr15 ( 839) 3608 528.3 1.6e-149
CCDS58399.1 NTRK3 gene_id:4916|Hs108|chr15 ( 817) 3524 516.3 6.3e-146
CCDS81916.1 NTRK3 gene_id:4916|Hs108|chr15 ( 617) 2920 430.0 4.4e-120
CCDS1161.1 NTRK1 gene_id:4914|Hs108|chr1 ( 796) 965 151.0 5.7e-36
CCDS30891.1 NTRK1 gene_id:4914|Hs108|chr1 ( 790) 907 142.7 1.7e-33
CCDS30890.1 NTRK1 gene_id:4914|Hs108|chr1 ( 760) 891 140.4 8.2e-33
CCDS35053.1 NTRK2 gene_id:4915|Hs108|chr9 ( 477) 849 134.3 3.5e-31
CCDS6671.1 NTRK2 gene_id:4915|Hs108|chr9 ( 838) 849 134.4 5.7e-31
CCDS35052.1 NTRK2 gene_id:4915|Hs108|chr9 ( 537) 429 74.4 4.3e-13
CCDS35050.1 NTRK2 gene_id:4915|Hs108|chr9 ( 822) 428 74.3 6.9e-13
>>CCDS32323.1 NTRK3 gene_id:4916|Hs108|chr15 (612 aa)
initn: 4191 init1: 4191 opt: 4191 Z-score: 3250.0 bits: 611.4 E(32554): 1.1e-174
Smith-Waterman score: 4191; 100.0% identity (100.0% similar) in 612 aa overlap (1-612:1-612)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MDVSLCPAKCSFWRIFLLGSVWLDYVGSVLACPANCVCSKTEINCRRPDDGNLFPLLEGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MDVSLCPAKCSFWRIFLLGSVWLDYVGSVLACPANCVCSKTEINCRRPDDGNLFPLLEGQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 DSGNSNGNASINITDISRNITSIHIENWRSLHTLNAVDMELYTGLQKLTIKNSGLRSIQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DSGNSNGNASINITDISRNITSIHIENWRSLHTLNAVDMELYTGLQKLTIKNSGLRSIQP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 RAFAKNPHLRYINLSSNRLTTLSWQLFQTLSLRELQLEQNFFNCSCDIRWMQLWQEQGEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RAFAKNPHLRYINLSSNRLTTLSWQLFQTLSLRELQLEQNFFNCSCDIRWMQLWQEQGEA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 KLNSQNLYCINADGSQLPLFRMNISQCDLPEISVSHVNLTVREGDNAVITCNGSGSPLPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KLNSQNLYCINADGSQLPLFRMNISQCDLPEISVSHVNLTVREGDNAVITCNGSGSPLPD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 VDWIVTGLQSINTHQTNLNWTNVHAINLTLVNVTSEDNGFTLTCIAENVVGMSNASVALT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VDWIVTGLQSINTHQTNLNWTNVHAINLTLVNVTSEDNGFTLTCIAENVVGMSNASVALT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 VYYPPRVVSLEEPELRLEHCIEFVVRGNPPPTLHWLHNGQPLRESKIIHVEYYQEGEISE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VYYPPRVVSLEEPELRLEHCIEFVVRGNPPPTLHWLHNGQPLRESKIIHVEYYQEGEISE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 GCLLFNKPTHYNNGNYTLIAKNPLGTANQTINGHFLKEPFPESTDNFILFDEVSPTPPIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GCLLFNKPTHYNNGNYTLIAKNPLGTANQTINGHFLKEPFPESTDNFILFDEVSPTPPIT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 VTHKPEEDTFGVSIAVGLAAFACVLLVVLFVMINKYGRRSKFGMKGPVAVISGEEDSASP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VTHKPEEDTFGVSIAVGLAAFACVLLVVLFVMINKYGRRSKFGMKGPVAVISGEEDSASP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 LHHINHGITTPSSLDAGPDTVVIGMTRIPVIENPQYFRQGHNCHKPDTWVFSNIDNHGIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LHHINHGITTPSSLDAGPDTVVIGMTRIPVIENPQYFRQGHNCHKPDTWVFSNIDNHGIL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 NLKDNRDHLVPSTHYIYEEPEVQSGEVSYPRSHGFREIMLNPISLPGHSKPLNHGIYVED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 NLKDNRDHLVPSTHYIYEEPEVQSGEVSYPRSHGFREIMLNPISLPGHSKPLNHGIYVED
550 560 570 580 590 600
610
pF1KB3 VNVYFSKGRHGF
::::::::::::
CCDS32 VNVYFSKGRHGF
610
>>CCDS10340.1 NTRK3 gene_id:4916|Hs108|chr15 (825 aa)
initn: 3635 init1: 3608 opt: 3608 Z-score: 2798.1 bits: 528.3 E(32554): 1.5e-149
Smith-Waterman score: 3608; 99.8% identity (100.0% similar) in 530 aa overlap (1-530:1-530)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MDVSLCPAKCSFWRIFLLGSVWLDYVGSVLACPANCVCSKTEINCRRPDDGNLFPLLEGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MDVSLCPAKCSFWRIFLLGSVWLDYVGSVLACPANCVCSKTEINCRRPDDGNLFPLLEGQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 DSGNSNGNASINITDISRNITSIHIENWRSLHTLNAVDMELYTGLQKLTIKNSGLRSIQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 DSGNSNGNASINITDISRNITSIHIENWRSLHTLNAVDMELYTGLQKLTIKNSGLRSIQP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 RAFAKNPHLRYINLSSNRLTTLSWQLFQTLSLRELQLEQNFFNCSCDIRWMQLWQEQGEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 RAFAKNPHLRYINLSSNRLTTLSWQLFQTLSLRELQLEQNFFNCSCDIRWMQLWQEQGEA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 KLNSQNLYCINADGSQLPLFRMNISQCDLPEISVSHVNLTVREGDNAVITCNGSGSPLPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KLNSQNLYCINADGSQLPLFRMNISQCDLPEISVSHVNLTVREGDNAVITCNGSGSPLPD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 VDWIVTGLQSINTHQTNLNWTNVHAINLTLVNVTSEDNGFTLTCIAENVVGMSNASVALT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 VDWIVTGLQSINTHQTNLNWTNVHAINLTLVNVTSEDNGFTLTCIAENVVGMSNASVALT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 VYYPPRVVSLEEPELRLEHCIEFVVRGNPPPTLHWLHNGQPLRESKIIHVEYYQEGEISE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 VYYPPRVVSLEEPELRLEHCIEFVVRGNPPPTLHWLHNGQPLRESKIIHVEYYQEGEISE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 GCLLFNKPTHYNNGNYTLIAKNPLGTANQTINGHFLKEPFPESTDNFILFDEVSPTPPIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GCLLFNKPTHYNNGNYTLIAKNPLGTANQTINGHFLKEPFPESTDNFILFDEVSPTPPIT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 VTHKPEEDTFGVSIAVGLAAFACVLLVVLFVMINKYGRRSKFGMKGPVAVISGEEDSASP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 VTHKPEEDTFGVSIAVGLAAFACVLLVVLFVMINKYGRRSKFGMKGPVAVISGEEDSASP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 LHHINHGITTPSSLDAGPDTVVIGMTRIPVIENPQYFRQGHNCHKPDTWVFSNIDNHGIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:
CCDS10 LHHINHGITTPSSLDAGPDTVVIGMTRIPVIENPQYFRQGHNCHKPDTYVQHIKRRDIVL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 NLKDNRDHLVPSTHYIYEEPEVQSGEVSYPRSHGFREIMLNPISLPGHSKPLNHGIYVED
CCDS10 KRELGEGAFGKVFLAECYNLSPTKDKMLVAVKALKDPTLAARKDFQREAELLTNLQHEHI
550 560 570 580 590 600
>>CCDS32322.1 NTRK3 gene_id:4916|Hs108|chr15 (839 aa)
initn: 3635 init1: 3608 opt: 3608 Z-score: 2798.0 bits: 528.3 E(32554): 1.6e-149
Smith-Waterman score: 3608; 99.8% identity (100.0% similar) in 530 aa overlap (1-530:1-530)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MDVSLCPAKCSFWRIFLLGSVWLDYVGSVLACPANCVCSKTEINCRRPDDGNLFPLLEGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MDVSLCPAKCSFWRIFLLGSVWLDYVGSVLACPANCVCSKTEINCRRPDDGNLFPLLEGQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 DSGNSNGNASINITDISRNITSIHIENWRSLHTLNAVDMELYTGLQKLTIKNSGLRSIQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DSGNSNGNASINITDISRNITSIHIENWRSLHTLNAVDMELYTGLQKLTIKNSGLRSIQP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 RAFAKNPHLRYINLSSNRLTTLSWQLFQTLSLRELQLEQNFFNCSCDIRWMQLWQEQGEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RAFAKNPHLRYINLSSNRLTTLSWQLFQTLSLRELQLEQNFFNCSCDIRWMQLWQEQGEA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 KLNSQNLYCINADGSQLPLFRMNISQCDLPEISVSHVNLTVREGDNAVITCNGSGSPLPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KLNSQNLYCINADGSQLPLFRMNISQCDLPEISVSHVNLTVREGDNAVITCNGSGSPLPD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 VDWIVTGLQSINTHQTNLNWTNVHAINLTLVNVTSEDNGFTLTCIAENVVGMSNASVALT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VDWIVTGLQSINTHQTNLNWTNVHAINLTLVNVTSEDNGFTLTCIAENVVGMSNASVALT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 VYYPPRVVSLEEPELRLEHCIEFVVRGNPPPTLHWLHNGQPLRESKIIHVEYYQEGEISE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VYYPPRVVSLEEPELRLEHCIEFVVRGNPPPTLHWLHNGQPLRESKIIHVEYYQEGEISE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 GCLLFNKPTHYNNGNYTLIAKNPLGTANQTINGHFLKEPFPESTDNFILFDEVSPTPPIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GCLLFNKPTHYNNGNYTLIAKNPLGTANQTINGHFLKEPFPESTDNFILFDEVSPTPPIT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 VTHKPEEDTFGVSIAVGLAAFACVLLVVLFVMINKYGRRSKFGMKGPVAVISGEEDSASP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VTHKPEEDTFGVSIAVGLAAFACVLLVVLFVMINKYGRRSKFGMKGPVAVISGEEDSASP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 LHHINHGITTPSSLDAGPDTVVIGMTRIPVIENPQYFRQGHNCHKPDTWVFSNIDNHGIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:
CCDS32 LHHINHGITTPSSLDAGPDTVVIGMTRIPVIENPQYFRQGHNCHKPDTYVQHIKRRDIVL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 NLKDNRDHLVPSTHYIYEEPEVQSGEVSYPRSHGFREIMLNPISLPGHSKPLNHGIYVED
CCDS32 KRELGEGAFGKVFLAECYNLSPTKDKMLVAVKALKDPTLAARKDFQREAELLTNLQHEHI
550 560 570 580 590 600
>>CCDS58399.1 NTRK3 gene_id:4916|Hs108|chr15 (817 aa)
initn: 3537 init1: 2747 opt: 3524 Z-score: 2733.4 bits: 516.3 E(32554): 6.3e-146
Smith-Waterman score: 3524; 98.1% identity (98.3% similar) in 530 aa overlap (1-530:1-522)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MDVSLCPAKCSFWRIFLLGSVWLDYVGSVLACPANCVCSKTEINCRRPDDGNLFPLLEGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MDVSLCPAKCSFWRIFLLGSVWLDYVGSVLACPANCVCSKTEINCRRPDDGNLFPLLEGQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 DSGNSNGNASINITDISRNITSIHIENWRSLHTLNAVDMELYTGLQKLTIKNSGLRSIQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 DSGNSNGNASINITDISRNITSIHIENWRSLHTLNAVDMELYTGLQKLTIKNSGLRSIQP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 RAFAKNPHLRYINLSSNRLTTLSWQLFQTLSLRELQLEQNFFNCSCDIRWMQLWQEQGEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RAFAKNPHLRYINLSSNRLTTLSWQLFQTLSLRELQLEQNFFNCSCDIRWMQLWQEQGEA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 KLNSQNLYCINADGSQLPLFRMNISQCDLPEISVSHVNLTVREGDNAVITCNGSGSPLPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 KLNSQNLYCINADGSQLPLFRMNISQCDLPEISVSHVNLTVREGDNAVITCNGSGSPLPD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 VDWIVTGLQSINTHQTNLNWTNVHAINLTLVNVTSEDNGFTLTCIAENVVGMSNASVALT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 VDWIVTGLQSINTHQTNLNWTNVHAINLTLVNVTSEDNGFTLTCIAENVVGMSNASVALT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 VYYPPRVVSLEEPELRLEHCIEFVVRGNPPPTLHWLHNGQPLRESKIIHVEYYQEGEISE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 VYYPPRVVSLEEPELRLEHCIEFVVRGNPPPTLHWLHNGQPLRESKIIHVEYYQEGEISE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 GCLLFNKPTHYNNGNYTLIAKNPLGTANQTINGHFLKEPFPESTDNFILFDEVSPTPPIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::
CCDS58 GCLLFNKPTHYNNGNYTLIAKNPLGTANQTINGHFLKEPFP--------VDEVSPTPPIT
370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 VTHKPEEDTFGVSIAVGLAAFACVLLVVLFVMINKYGRRSKFGMKGPVAVISGEEDSASP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 VTHKPEEDTFGVSIAVGLAAFACVLLVVLFVMINKYGRRSKFGMKGPVAVISGEEDSASP
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 LHHINHGITTPSSLDAGPDTVVIGMTRIPVIENPQYFRQGHNCHKPDTWVFSNIDNHGIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:
CCDS58 LHHINHGITTPSSLDAGPDTVVIGMTRIPVIENPQYFRQGHNCHKPDTYVQHIKRRDIVL
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 NLKDNRDHLVPSTHYIYEEPEVQSGEVSYPRSHGFREIMLNPISLPGHSKPLNHGIYVED
CCDS58 KRELGEGAFGKVFLAECYNLSPTKDKMLVAVKALKDPTLAARKDFQREAELLTNLQHEHI
540 550 560 570 580 590
>>CCDS81916.1 NTRK3 gene_id:4916|Hs108|chr15 (617 aa)
initn: 2947 init1: 2920 opt: 2920 Z-score: 2269.3 bits: 430.0 E(32554): 4.4e-120
Smith-Waterman score: 2920; 99.8% identity (100.0% similar) in 432 aa overlap (99-530:1-432)
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 ASINITDISRNITSIHIENWRSLHTLNAVDMELYTGLQKLTIKNSGLRSIQPRAFAKNPH
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 MELYTGLQKLTIKNSGLRSIQPRAFAKNPH
10 20 30
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 LRYINLSSNRLTTLSWQLFQTLSLRELQLEQNFFNCSCDIRWMQLWQEQGEAKLNSQNLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 LRYINLSSNRLTTLSWQLFQTLSLRELQLEQNFFNCSCDIRWMQLWQEQGEAKLNSQNLY
40 50 60 70 80 90
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 CINADGSQLPLFRMNISQCDLPEISVSHVNLTVREGDNAVITCNGSGSPLPDVDWIVTGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 CINADGSQLPLFRMNISQCDLPEISVSHVNLTVREGDNAVITCNGSGSPLPDVDWIVTGL
100 110 120 130 140 150
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 QSINTHQTNLNWTNVHAINLTLVNVTSEDNGFTLTCIAENVVGMSNASVALTVYYPPRVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 QSINTHQTNLNWTNVHAINLTLVNVTSEDNGFTLTCIAENVVGMSNASVALTVYYPPRVV
160 170 180 190 200 210
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 SLEEPELRLEHCIEFVVRGNPPPTLHWLHNGQPLRESKIIHVEYYQEGEISEGCLLFNKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 SLEEPELRLEHCIEFVVRGNPPPTLHWLHNGQPLRESKIIHVEYYQEGEISEGCLLFNKP
220 230 240 250 260 270
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 THYNNGNYTLIAKNPLGTANQTINGHFLKEPFPESTDNFILFDEVSPTPPITVTHKPEED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 THYNNGNYTLIAKNPLGTANQTINGHFLKEPFPESTDNFILFDEVSPTPPITVTHKPEED
280 290 300 310 320 330
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 TFGVSIAVGLAAFACVLLVVLFVMINKYGRRSKFGMKGPVAVISGEEDSASPLHHINHGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 TFGVSIAVGLAAFACVLLVVLFVMINKYGRRSKFGMKGPVAVISGEEDSASPLHHINHGI
340 350 360 370 380 390
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 TTPSSLDAGPDTVVIGMTRIPVIENPQYFRQGHNCHKPDTWVFSNIDNHGILNLKDNRDH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:
CCDS81 TTPSSLDAGPDTVVIGMTRIPVIENPQYFRQGHNCHKPDTYVQHIKRRDIVLKRELGEGA
400 410 420 430 440 450
550 560 570 580 590 600
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. . . . .::: .:.::: :::::::.: ::.: :. .: . :. .:: . .. :
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. . :. .: .: ::::.:::::.:::..: .:....:: :::.:::.. :
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CCDS30 DIVLKWELGEGAFGKVFLAECHNLLPEQDKMLVAVKALKEASESARQDFQREAELLTMLQ
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:. : .... : : :: : .. ..: .: .:. . : :::.:
CCDS35 PDVIYEDYGTAANDIGDTTNRSNEIPSTDVTDKTGREHLSVYAVVVIASVVGFC-LLVML
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CCDS66 MSSWIRWHGPAMARLW-----GFCWL-VVGFWRAAFACPTSCKCSASRIWCSDPSPGIVA
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pF1KB3 FPLLEGQDSGNSNGNASINITDISRNITSIHIENWRSLHTLNAVDMELYTGLQKLTIKNS
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CCDS66 FPRLEP------------NSVD-PENITEIFIANQKRLEIINEDDVEAYVGLRNLTIVDS
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CCDS66 GLKFVAHKAFLKNSNLQHINFTRNKLTSLSRKHFRHLDLSELILVGNPFTCSCDIMWIKT
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CCDS66 LQE-AKSSPDTQDLYCLNESSKNIPLANLQIPNCGLPSANLAAPNLTVEEGKSITLSCSV
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pF1KB3 SGSPLPDVDWIVTGLQSINTHQTNLNWTNVHAINLTLVNVTSEDNGFTLTCIAENVVGMS
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CCDS66 AGDPVPNMYWDVGNL--VSKH---MNETSHTQGSLRITNISSDDSGKQISCVAENLVGED
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CCDS66 VTNHTE---YHGCLQLDNPTHMNNGDYTLIAKNEYGKDEKQISAHFMGWPGIDDGANPNY
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CCDS66 PDVIYEDYGTAANDIGDTTNRSNEIPSTDVTDKTGREHLSVYAVVVIASVVGFC-LLVML
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CCDS66 FLL--KLARHSKFGMKDFSWFGFGKVKSRQGVGPASVISNDDDSASPLHHISNGSNTPSS
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..:::.:.::::.:::::::::: .. ::::.: ..: :.:.
CCDS66 SEGGPDAVIIGMTKIPVIENPQYFGITNSQLKPDTFV-QHIKRHNIVLKRELGEGAFGKV
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570 580 590 600 610 620
612 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 14:08:38 2016 done: Thu Nov 3 14:08:39 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]