FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB3903, 766 aa 1>>>pF1KB3903 766 - 766 aa - 766 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.0413+/-0.000449; mu= 2.2483+/- 0.028 mean_var=502.6623+/-110.150, 0's: 0 Z-trim(122.2): 1726 B-trim: 0 in 0/59 Lambda= 0.057205 statistics sampled from 37526 (39838) to 37526 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.757), E-opt: 0.2 (0.467), width: 16 Scan time: 13.170 The best scores are: opt bits E(85289) NP_001035350 (OMIM: 613166) serine/threonine-prote ( 766) 5066 433.5 1.6e-120 XP_005262843 (OMIM: 613166) PREDICTED: serine/thre ( 765) 5047 431.9 4.7e-120 NP_001035351 (OMIM: 613166) serine/threonine-prote ( 783) 3009 263.7 2.1e-69 XP_005262842 (OMIM: 613166) PREDICTED: serine/thre ( 782) 2990 262.2 6.1e-69 NP_001317001 (OMIM: 604742) serine/threonine-prote ( 740) 2552 226.0 4.5e-58 NP_001317000 (OMIM: 604742) serine/threonine-prote ( 740) 2552 226.0 4.5e-58 NP_004725 (OMIM: 604742) serine/threonine-protein ( 729) 2485 220.5 2.1e-56 XP_016876336 (OMIM: 604742) PREDICTED: serine/thre ( 708) 2469 219.1 5e-56 XP_016863321 (OMIM: 613166) PREDICTED: serine/thre ( 717) 2462 218.6 7.6e-56 XP_016863322 (OMIM: 613166) PREDICTED: serine/thre ( 694) 2118 190.1 2.6e-47 NP_001182345 (OMIM: 604742) serine/threonine-prote ( 433) 1762 160.5 1.4e-38 NP_001182344 (OMIM: 604742) serine/threonine-prote ( 422) 1695 154.9 6.4e-37 XP_016876337 (OMIM: 604742) PREDICTED: serine/thre ( 363) 1608 147.7 8.5e-35 NP_835366 (OMIM: 300067,300121) neuronal migration ( 360) 1448 134.4 7.9e-31 NP_835364 (OMIM: 300067,300121) neuronal migration ( 360) 1448 134.4 7.9e-31 XP_011529180 (OMIM: 300067,300121) PREDICTED: neur ( 361) 1448 134.4 8e-31 NP_000546 (OMIM: 300067,300121) neuronal migration ( 441) 1448 134.6 8.9e-31 NP_835365 (OMIM: 300067,300121) neuronal migration ( 365) 1446 134.3 9e-31 NP_001182482 (OMIM: 300067,300121) neuronal migrat ( 366) 1446 134.3 9e-31 XP_016884801 (OMIM: 300067,300121) PREDICTED: neur ( 366) 1446 134.3 9e-31 XP_011529182 (OMIM: 300067,300121) PREDICTED: neur ( 319) 1439 133.6 1.2e-30 XP_011529181 (OMIM: 300067,300121) PREDICTED: neur ( 324) 1425 132.5 2.8e-30 XP_011532469 (OMIM: 613167) PREDICTED: serine/thre ( 648) 1043 101.4 1.3e-20 NP_208382 (OMIM: 613167) serine/threonine-protein ( 648) 1043 101.4 1.3e-20 NP_003647 (OMIM: 604998) calcium/calmodulin-depend ( 370) 871 86.8 1.7e-16 XP_005265573 (OMIM: 604998) PREDICTED: calcium/cal ( 413) 871 86.9 1.9e-16 NP_001034671 (OMIM: 300680) calcium/calmodulin-dep ( 426) 836 84.0 1.4e-15 XP_016884766 (OMIM: 300680) PREDICTED: calcium/cal ( 426) 836 84.0 1.4e-15 NP_705718 (OMIM: 607957) calcium/calmodulin-depend ( 385) 828 83.3 2.1e-15 XP_006717546 (OMIM: 607957) PREDICTED: calcium/cal ( 355) 824 82.9 2.5e-15 NP_065130 (OMIM: 607957) calcium/calmodulin-depend ( 357) 824 82.9 2.5e-15 XP_006717545 (OMIM: 607957) PREDICTED: calcium/cal ( 362) 824 82.9 2.5e-15 NP_001129212 (OMIM: 300680) calcium/calmodulin-dep ( 360) 823 82.9 2.7e-15 XP_011529410 (OMIM: 300680) PREDICTED: calcium/cal ( 361) 818 82.5 3.6e-15 XP_016884768 (OMIM: 300680) PREDICTED: calcium/cal ( 343) 815 82.2 4.1e-15 XP_011529409 (OMIM: 300680) PREDICTED: calcium/cal ( 343) 815 82.2 4.1e-15 XP_005274708 (OMIM: 300680) PREDICTED: calcium/cal ( 343) 815 82.2 4.1e-15 XP_011529413 (OMIM: 300680) PREDICTED: calcium/cal ( 343) 815 82.2 4.1e-15 XP_011529412 (OMIM: 300680) PREDICTED: calcium/cal ( 343) 815 82.2 4.1e-15 XP_011529414 (OMIM: 300680) PREDICTED: calcium/cal ( 343) 815 82.2 4.1e-15 XP_016884767 (OMIM: 300680) PREDICTED: calcium/cal ( 343) 815 82.2 4.1e-15 XP_006724872 (OMIM: 300680) PREDICTED: calcium/cal ( 343) 815 82.2 4.1e-15 XP_006717544 (OMIM: 607957) PREDICTED: calcium/cal ( 366) 815 82.2 4.3e-15 XP_011517893 (OMIM: 607957) PREDICTED: calcium/cal ( 372) 815 82.2 4.3e-15 NP_065172 (OMIM: 614994) calcium/calmodulin-depend ( 476) 803 81.4 9.9e-15 XP_016857355 (OMIM: 614994) PREDICTED: calcium/cal ( 476) 803 81.4 9.9e-15 XP_016862843 (OMIM: 604998) PREDICTED: calcium/cal ( 326) 759 77.5 9.8e-14 XP_005265574 (OMIM: 604998) PREDICTED: calcium/cal ( 369) 759 77.6 1.1e-13 NP_001310304 (OMIM: 114080) calcium/calmodulin-dep ( 473) 761 77.9 1.1e-13 NP_001310303 (OMIM: 114080) calcium/calmodulin-dep ( 473) 761 77.9 1.1e-13 >>NP_001035350 (OMIM: 613166) serine/threonine-protein k (766 aa) initn: 5066 init1: 5066 opt: 5066 Z-score: 2284.8 bits: 433.5 E(85289): 1.6e-120 Smith-Waterman score: 5066; 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