Result of FASTA (ccds) for pF1KB3911
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB3911, 454 aa
  1>>>pF1KB3911 454 - 454 aa - 454 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9449+/-0.00108; mu= 14.3555+/- 0.065
 mean_var=72.2588+/-14.856, 0's: 0 Z-trim(103.1): 76  B-trim: 351 in 1/47
 Lambda= 0.150879
 statistics sampled from 7188 (7265) to 7188 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.589), E-opt: 0.2 (0.223), width:  16
 Scan time:  2.900

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS13575.1 GABPA gene_id:2551|Hs108|chr21         ( 454) 2977 657.6 7.3e-189
CCDS81648.1 ETS1 gene_id:2113|Hs108|chr11          ( 354)  473 112.5   7e-25
CCDS53724.1 ETS1 gene_id:2113|Hs108|chr11          ( 225)  468 111.4 9.9e-25
CCDS8475.1 ETS1 gene_id:2113|Hs108|chr11           ( 441)  468 111.5 1.8e-24
CCDS44767.1 ETS1 gene_id:2113|Hs108|chr11          ( 485)  468 111.5   2e-24
CCDS13659.1 ETS2 gene_id:2114|Hs108|chr21          ( 469)  457 109.1   1e-23
CCDS2428.1 FEV gene_id:54738|Hs108|chr2            ( 238)  406 97.9 1.2e-20
CCDS58789.1 ERG gene_id:2078|Hs108|chr21           ( 363)  408 98.4 1.3e-20
CCDS46649.1 ERG gene_id:2078|Hs108|chr21           ( 387)  408 98.4 1.4e-20
CCDS82674.1 ERG gene_id:2078|Hs108|chr21           ( 455)  408 98.4 1.6e-20
CCDS13657.1 ERG gene_id:2078|Hs108|chr21           ( 462)  408 98.4 1.6e-20
CCDS13658.1 ERG gene_id:2078|Hs108|chr21           ( 479)  408 98.4 1.7e-20
CCDS46648.1 ERG gene_id:2078|Hs108|chr21           ( 486)  408 98.4 1.7e-20
CCDS59230.1 FLI1 gene_id:2313|Hs108|chr11          ( 259)  400 96.6 3.2e-20
CCDS59231.1 FLI1 gene_id:2313|Hs108|chr11          ( 386)  400 96.7 4.6e-20
CCDS53725.1 FLI1 gene_id:2313|Hs108|chr11          ( 419)  400 96.7 4.9e-20
CCDS44768.1 FLI1 gene_id:2313|Hs108|chr11          ( 452)  400 96.7 5.3e-20
CCDS55084.1 ETV1 gene_id:2115|Hs108|chr7           ( 374)  369 89.9 4.8e-18
CCDS55083.1 ETV1 gene_id:2115|Hs108|chr7           ( 419)  369 89.9 5.3e-18
CCDS55085.1 ETV1 gene_id:2115|Hs108|chr7           ( 437)  369 89.9 5.5e-18
CCDS55087.1 ETV1 gene_id:2115|Hs108|chr7           ( 454)  369 89.9 5.7e-18
CCDS55086.1 ETV1 gene_id:2115|Hs108|chr7           ( 459)  369 89.9 5.8e-18
CCDS55088.1 ETV1 gene_id:2115|Hs108|chr7           ( 477)  369 89.9   6e-18
CCDS33906.1 ETV5 gene_id:2119|Hs108|chr3           ( 510)  362 88.4 1.8e-17
CCDS74341.1 ETV2 gene_id:2116|Hs108|chr19          ( 249)  356 87.0 2.4e-17
CCDS32995.2 ETV2 gene_id:2116|Hs108|chr19          ( 342)  356 87.1 3.1e-17
CCDS12600.1 ERF gene_id:2077|Hs108|chr19           ( 548)  358 87.6 3.5e-17
CCDS1164.1 ETV3 gene_id:2117|Hs108|chr1            ( 143)  341 83.7 1.4e-16
CCDS59292.1 ETV4 gene_id:2118|Hs108|chr17          ( 207)  343 84.2 1.4e-16
CCDS1457.1 ELK4 gene_id:2005|Hs108|chr1            ( 405)  344 84.5 2.2e-16
CCDS1456.1 ELK4 gene_id:2005|Hs108|chr1            ( 431)  344 84.5 2.4e-16
CCDS30893.1 ETV3L gene_id:440695|Hs108|chr1        ( 361)  342 84.0 2.7e-16
CCDS58553.1 ETV4 gene_id:2118|Hs108|chr17          ( 445)  343 84.3 2.8e-16
CCDS11465.1 ETV4 gene_id:2118|Hs108|chr17          ( 484)  343 84.3   3e-16
CCDS77281.1 ETV2 gene_id:2116|Hs108|chr19          ( 155)  336 82.6 3.2e-16
CCDS44250.1 ETV3 gene_id:2117|Hs108|chr1           ( 512)  341 83.9 4.3e-16
CCDS9060.1 ELK3 gene_id:2004|Hs108|chr12           ( 407)  339 83.4 4.8e-16
CCDS59165.1 ELK1 gene_id:2002|Hs108|chrX           (  95)  322 79.5 1.7e-15
CCDS55753.1 EHF gene_id:26298|Hs108|chr11          ( 277)  325 80.3 2.8e-15
CCDS14283.1 ELK1 gene_id:2002|Hs108|chrX           ( 428)  322 79.7 6.5e-15
CCDS64062.1 ELF2 gene_id:1998|Hs108|chr4           ( 521)  300 74.9 2.1e-13
CCDS3745.1 ELF2 gene_id:1998|Hs108|chr4            ( 533)  300 74.9 2.2e-13
CCDS3744.1 ELF2 gene_id:1998|Hs108|chr4            ( 581)  300 74.9 2.4e-13
CCDS82954.1 ELF2 gene_id:1998|Hs108|chr4           ( 593)  300 74.9 2.4e-13
CCDS64063.1 ELF2 gene_id:1998|Hs108|chr4           ( 504)  288 72.3 1.3e-12
CCDS45043.1 ELF1 gene_id:1997|Hs108|chr13          ( 595)  282 71.0 3.6e-12
CCDS9374.1 ELF1 gene_id:1997|Hs108|chr13           ( 619)  280 70.6 5.1e-12
CCDS14617.1 ELF4 gene_id:2000|Hs108|chrX           ( 663)  278 70.2 7.3e-12


>>CCDS13575.1 GABPA gene_id:2551|Hs108|chr21              (454 aa)
 initn: 2977 init1: 2977 opt: 2977  Z-score: 3504.2  bits: 657.6 E(32554): 7.3e-189
Smith-Waterman score: 2977; 100.0% identity (100.0% similar) in 454 aa overlap (1-454:1-454)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB3 MTKREAEELIEIEIDGTEKAECTEESIVEQTYAPAECVSQAIDINEPIGNLKKLLEPRLQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MTKREAEELIEIEIDGTEKAECTEESIVEQTYAPAECVSQAIDINEPIGNLKKLLEPRLQ
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB3 CSLDAHEICLQDIQLDPERSLFDQGVKTDGTVQLSVQVISYQGIEPKLNILEIVKPADTV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 CSLDAHEICLQDIQLDPERSLFDQGVKTDGTVQLSVQVISYQGIEPKLNILEIVKPADTV
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB3 EVVIDPDAHHAESEAHLVEEAQVITLDGTKHITTISDETSEQVTRWAAALEGYRKEQERL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 EVVIDPDAHHAESEAHLVEEAQVITLDGTKHITTISDETSEQVTRWAAALEGYRKEQERL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB3 GIPYDPIQWSTDQVLHWVVWVMKEFSMTDIDLTTLNISGRELCSLNQEDFFQRVPRGEIL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GIPYDPIQWSTDQVLHWVVWVMKEFSMTDIDLTTLNISGRELCSLNQEDFFQRVPRGEIL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB3 WSHLELLRKYVLASQEQQMNEIVTIDQPVQIIPASVQSATPTTIKVINSSAKAAKVQRAP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 WSHLELLRKYVLASQEQQMNEIVTIDQPVQIIPASVQSATPTTIKVINSSAKAAKVQRAP
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB3 RISGEDRSSPGNRTGNNGQIQLWQFLLELLTDKDARDCISWVGDEGEFKLNQPELVAQKW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 RISGEDRSSPGNRTGNNGQIQLWQFLLELLTDKDARDCISWVGDEGEFKLNQPELVAQKW
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB3 GQRKNKPTMNYEKLSRALRYYYDGDMICKVQGKRFVYKFVCDLKTLIGYSAAELNRLVTE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GQRKNKPTMNYEKLSRALRYYYDGDMICKVQGKRFVYKFVCDLKTLIGYSAAELNRLVTE
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450    
pF1KB3 CEQKKLAKMQLHGIAQPVTAVALATASLQTEKDN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 CEQKKLAKMQLHGIAQPVTAVALATASLQTEKDN
              430       440       450    

>>CCDS81648.1 ETS1 gene_id:2113|Hs108|chr11               (354 aa)
 initn: 715 init1: 459 opt: 473  Z-score: 560.2  bits: 112.5 E(32554): 7e-25
Smith-Waterman score: 670; 39.6% identity (62.0% similar) in 313 aa overlap (152-418:37-346)

             130       140       150       160       170       180 
pF1KB3 VVIDPDAHHAESEAHLVEEAQVITLDGTKHITTISDETSEQVTRWAAALEGYRKEQERLG
                                     .:  : :   :. .  :.. :. :::.:::
CCDS81 LKPTLTIIKTEKVDLELFPSPDMECADVPLLTPSSKEMMSQALK--ATFSGFTKEQQRLG
         10        20        30        40        50          60    

             190       200       210       220       230           
pF1KB3 IPYDPIQWSTDQVLHWVVWVMKEFSMTDIDLTTLNISGRELCSLNQEDFFQRVPR--GEI
       :: :: ::.  .:  ::.:...:::.  .:.  . ..:  ::.:... :.. .:   :.:
CCDS81 IPKDPRQWTETHVRDWVMWAVNEFSLKGVDFQKFCMNGAALCALGKDCFLELAPDFVGDI
           70        80        90       100       110       120    

     240       250        260                   270       280      
pF1KB3 LWSHLELLRKY-VLASQEQQMNEIV-----TID-------QPVQIIPASVQSATPT----
       :: :::.:.:  :   : . .:        : :       . .: .: : . . :.    
CCDS81 LWEHLEILQKEDVKPYQVNGVNPAYPESRYTSDYFISYGIEHAQCVPPS-EFSEPSFITE
          130       140       150       160       170        180   

                   290            300                      310     
pF1KB3 ---TIKVINS----SAKAAK-----VQRAP---------------RISGEDRSSPGNRTG
          :.. :.:    : :  .     . : :               ..   :    :  . 
CCDS81 SYQTLHPISSEELLSLKYENDYPSVILRDPLQTDTLQNDYFAIKQEVVTPDNMCMGRTSR
           190       200       210       220       230       240   

         320       330       340       350       360       370     
pF1KB3 NNGQIQLWQFLLELLTDKDARDCISWVGDEGEFKLNQPELVAQKWGQRKNKPTMNYEKLS
       ..: ::::::::::::::. .. :::.::  ::::..:. ::..::.::::: :::::::
CCDS81 GSGPIQLWQFLLELLTDKSCQSFISWTGDGWEFKLSDPDEVARRWGKRKNKPKMNYEKLS
           250       260       270       280       290       300   

         380       390       400       410       420       430     
pF1KB3 RALRYYYDGDMICKVQGKRFVYKFVCDLKTLIGYSAAELNRLVTECEQKKLAKMQLHGIA
       :.:::::: ..: :. :::.::.:::::..:.::.  ::. ..                 
CCDS81 RGLRYYYDKNIIHKTAGKRYVYRFVCDLQSLLGYTPEELHAMLDVKPDADE         
           310       320       330       340       350             

         440       450    
pF1KB3 QPVTAVALATASLQTEKDN

>>CCDS53724.1 ETS1 gene_id:2113|Hs108|chr11               (225 aa)
 initn: 480 init1: 459 opt: 468  Z-score: 557.5  bits: 111.4 E(32554): 9.9e-25
Smith-Waterman score: 468; 63.8% identity (86.7% similar) in 105 aa overlap (314-418:114-217)

           290       300       310       320       330       340   
pF1KB3 IKVINSSAKAAKVQRAPRISGEDRSSPGNRTGNNGQIQLWQFLLELLTDKDARDCISWVG
                                     ::. : ::::::::::::::. .. :::.:
CCDS53 PKGTFKDYVRDRADLNKDKPVIPAAALAGYTGS-GPIQLWQFLLELLTDKSCQSFISWTG
            90       100       110        120       130       140  

           350       360       370       380       390       400   
pF1KB3 DEGEFKLNQPELVAQKWGQRKNKPTMNYEKLSRALRYYYDGDMICKVQGKRFVYKFVCDL
       :  ::::..:. ::..::.::::: ::::::::.:::::: ..: :. :::.::.:::::
CCDS53 DGWEFKLSDPDEVARRWGKRKNKPKMNYEKLSRGLRYYYDKNIIHKTAGKRYVYRFVCDL
            150       160       170       180       190       200  

           410       420       430       440       450    
pF1KB3 KTLIGYSAAELNRLVTECEQKKLAKMQLHGIAQPVTAVALATASLQTEKDN
       ..:.::.  ::. ..                                    
CCDS53 QSLLGYTPEELHAMLDVKPDADE                            
            210       220                                 

>>CCDS8475.1 ETS1 gene_id:2113|Hs108|chr11                (441 aa)
 initn: 715 init1: 459 opt: 468  Z-score: 552.8  bits: 111.5 E(32554): 1.8e-24
Smith-Waterman score: 522; 31.0% identity (51.0% similar) in 400 aa overlap (152-418:37-433)

             130       140       150       160       170       180 
pF1KB3 VVIDPDAHHAESEAHLVEEAQVITLDGTKHITTISDETSEQVTRWAAALEGYRKEQERLG
                                     .:  : :   :. .  :.. :. :::.:::
CCDS84 LKPTLTIIKTEKVDLELFPSPDMECADVPLLTPSSKEMMSQALK--ATFSGFTKEQQRLG
         10        20        30        40        50          60    

             190       200       210       220       230           
pF1KB3 IPYDPIQWSTDQVLHWVVWVMKEFSMTDIDLTTLNISGRELCSLNQEDFFQRVPR--GEI
       :: :: ::.  .:  ::.:...:::.  .:.  . ..:  ::.:... :.. .:   :.:
CCDS84 IPKDPRQWTETHVRDWVMWAVNEFSLKGVDFQKFCMNGAALCALGKDCFLELAPDFVGDI
           70        80        90       100       110       120    

     240                              250                          
pF1KB3 LWSHLELLRK-----------------------YVLA-----------------------
       :: :::.:.:                       : ..                       
CCDS84 LWEHLEILQKEDVKPYQVNGVNPAYPESRYTSDYFISYGIEHAQCVPPSEFSEPSFITES
          130       140       150       160       170       180    

                  260       270                     280            
pF1KB3 -------SQEQQMNEIVTIDQPVQIIPASVQS--------------ATPTTI--------
              :.:. ..     : :  :.   .:.              .:: ..        
CCDS84 YQTLHPISSEELLSLKYENDYPSVILRDPLQTDTLQNDYFAIKQEVVTPDNMCMGRTSRG
          190       200       210       220       230       240    

                               290       300            310        
pF1KB3 ---------------------KVINSSAKAAKVQRAPR---ISGEDRSS--PGNR-----
                            .  .:...  ..::.:    ...::  .  :...     
CCDS84 KLGGQDSFESIESYDSCDRLTQSWSSQSSFNSLQRVPSYDSFDSEDYPAALPNHKPKGTF
          250       260       270       280       290       300    

                                    320       330       340        
pF1KB3 -------------------------TGNNGQIQLWQFLLELLTDKDARDCISWVGDEGEF
                                ::. : ::::::::::::::. .. :::.::  ::
CCDS84 KDYVRDRADLNKDKPVIPAAALAGYTGS-GPIQLWQFLLELLTDKSCQSFISWTGDGWEF
          310       320       330        340       350       360   

      350       360       370       380       390       400        
pF1KB3 KLNQPELVAQKWGQRKNKPTMNYEKLSRALRYYYDGDMICKVQGKRFVYKFVCDLKTLIG
       ::..:. ::..::.::::: ::::::::.:::::: ..: :. :::.::.:::::..:.:
CCDS84 KLSDPDEVARRWGKRKNKPKMNYEKLSRGLRYYYDKNIIHKTAGKRYVYRFVCDLQSLLG
           370       380       390       400       410       420   

      410       420       430       440       450    
pF1KB3 YSAAELNRLVTECEQKKLAKMQLHGIAQPVTAVALATASLQTEKDN
       :.  ::. ..                                    
CCDS84 YTPEELHAMLDVKPDADE                            
           430       440                             

>>CCDS44767.1 ETS1 gene_id:2113|Hs108|chr11               (485 aa)
 initn: 715 init1: 459 opt: 468  Z-score: 552.1  bits: 111.5 E(32554): 2e-24
Smith-Waterman score: 522; 31.0% identity (51.0% similar) in 400 aa overlap (152-418:81-477)

             130       140       150       160       170       180 
pF1KB3 VVIDPDAHHAESEAHLVEEAQVITLDGTKHITTISDETSEQVTRWAAALEGYRKEQERLG
                                     .:  : :   :. .  :.. :. :::.:::
CCDS44 YPFWDEMATQEVPTGLEHCVSDMECADVPLLTPSSKEMMSQALK--ATFSGFTKEQQRLG
               60        70        80        90         100        

             190       200       210       220       230           
pF1KB3 IPYDPIQWSTDQVLHWVVWVMKEFSMTDIDLTTLNISGRELCSLNQEDFFQRVPR--GEI
       :: :: ::.  .:  ::.:...:::.  .:.  . ..:  ::.:... :.. .:   :.:
CCDS44 IPKDPRQWTETHVRDWVMWAVNEFSLKGVDFQKFCMNGAALCALGKDCFLELAPDFVGDI
      110       120       130       140       150       160        

     240                              250                          
pF1KB3 LWSHLELLRK-----------------------YVLA-----------------------
       :: :::.:.:                       : ..                       
CCDS44 LWEHLEILQKEDVKPYQVNGVNPAYPESRYTSDYFISYGIEHAQCVPPSEFSEPSFITES
      170       180       190       200       210       220        

                  260       270                     280            
pF1KB3 -------SQEQQMNEIVTIDQPVQIIPASVQS--------------ATPTTI--------
              :.:. ..     : :  :.   .:.              .:: ..        
CCDS44 YQTLHPISSEELLSLKYENDYPSVILRDPLQTDTLQNDYFAIKQEVVTPDNMCMGRTSRG
      230       240       250       260       270       280        

                               290       300            310        
pF1KB3 ---------------------KVINSSAKAAKVQRAPR---ISGEDRSS--PGNR-----
                            .  .:...  ..::.:    ...::  .  :...     
CCDS44 KLGGQDSFESIESYDSCDRLTQSWSSQSSFNSLQRVPSYDSFDSEDYPAALPNHKPKGTF
      290       300       310       320       330       340        

                                    320       330       340        
pF1KB3 -------------------------TGNNGQIQLWQFLLELLTDKDARDCISWVGDEGEF
                                ::. : ::::::::::::::. .. :::.::  ::
CCDS44 KDYVRDRADLNKDKPVIPAAALAGYTGS-GPIQLWQFLLELLTDKSCQSFISWTGDGWEF
      350       360       370        380       390       400       

      350       360       370       380       390       400        
pF1KB3 KLNQPELVAQKWGQRKNKPTMNYEKLSRALRYYYDGDMICKVQGKRFVYKFVCDLKTLIG
       ::..:. ::..::.::::: ::::::::.:::::: ..: :. :::.::.:::::..:.:
CCDS44 KLSDPDEVARRWGKRKNKPKMNYEKLSRGLRYYYDKNIIHKTAGKRYVYRFVCDLQSLLG
       410       420       430       440       450       460       

      410       420       430       440       450    
pF1KB3 YSAAELNRLVTECEQKKLAKMQLHGIAQPVTAVALATASLQTEKDN
       :.  ::. ..                                    
CCDS44 YTPEELHAMLDVKPDADE                            
       470       480                                 

>>CCDS13659.1 ETS2 gene_id:2114|Hs108|chr21               (469 aa)
 initn: 730 init1: 448 opt: 457  Z-score: 539.4  bits: 109.1 E(32554): 1e-23
Smith-Waterman score: 552; 32.5% identity (53.4% similar) in 378 aa overlap (168-418:85-461)

       140       150       160       170       180       190       
pF1KB3 VEEAQVITLDGTKHITTISDETSEQVTRWAAALEGYRKEQERLGIPYDPIQWSTDQVLHW
                                     :.. :..:::.::::: .:  :: .:: .:
CCDS13 GLDSISHDSANCELPLLTPCSKAVMSQALKATFSGFKKEQRRLGIPKNPWLWSEQQVCQW
           60        70        80        90       100       110    

       200       210       220       230         240       250     
pF1KB3 VVWVMKEFSMTDIDLTTLNISGRELCSLNQEDFFQRVPR--GEILWSHLELLRKYVLASQ
       ..:. .:::.....:  ....:. ::.:..: :.. .:   :.::: ::: . :    . 
CCDS13 LLWATNEFSLVNVNLQRFGMNGQMLCNLGKERFLELAPDFVGDILWEHLEQMIKENQEKT
          120       130       140       150       160       170    

         260                                                       
pF1KB3 EQQMNE------------------------------------------------IVTIDQ
       :.:..:                                                ... .:
CCDS13 EDQYEENSHLTSVPHWINSNTLGFGTEQAPYGMQTQNYPKGGLLDSMCPASTPSVLSSEQ
          180       190       200       210       220       230    

       270                                280                      
pF1KB3 PVQIIPASV-------------------------QSATP-----------------TTIK
         :..: :                          .:.::                 . ..
CCDS13 EFQMFPKSRLSSVSVTYCSVSQDFPGSNLNLLTNNSGTPKDHDSPENGADSFESSDSLLQ
          240       250       260       270       280       290    

         290       300                             310             
pF1KB3 VINSSAKAAKVQRAPRI-SGED---------------------RSSPGNR----------
         ::...   :::.: . : ::                     ::.: ..          
CCDS13 SWNSQSSLLDVQRVPSFESFEDDCSQSLCLNKPTMSFKDYIQERSDPVEQGKPVIPAAVL
          300       310       320       330       340       350    

              320       330       340       350       360       370
pF1KB3 ---TGNNGQIQLWQFLLELLTDKDARDCISWVGDEGEFKLNQPELVAQKWGQRKNKPTMN
          ::. : :::::::::::.::. .. :::.::  :::: .:. ::..::.::::: ::
CCDS13 AGFTGS-GPIQLWQFLLELLSDKSCQSFISWTGDGWEFKLADPDEVARRWGKRKNKPKMN
          360        370       380       390       400       410   

              380       390       400       410       420       430
pF1KB3 YEKLSRALRYYYDGDMICKVQGKRFVYKFVCDLKTLIGYSAAELNRLVTECEQKKLAKMQ
       ::::::.:::::: ..: :..:::.::.:::::..:.:..  ::. ..            
CCDS13 YEKLSRGLRYYYDKNIIHKTSGKRYVYRFVCDLQNLLGFTPEELHAILGVQPDTED    
           420       430       440       450       460             

              440       450    
pF1KB3 LHGIAQPVTAVALATASLQTEKDN

>>CCDS2428.1 FEV gene_id:54738|Hs108|chr2                 (238 aa)
 initn: 418 init1: 397 opt: 406  Z-score: 484.2  bits: 97.9 E(32554): 1.2e-20
Smith-Waterman score: 406; 61.5% identity (86.8% similar) in 91 aa overlap (309-399:37-126)

      280       290       300       310       320       330        
pF1KB3 ATPTTIKVINSSAKAAKVQRAPRISGEDRSSPGNRTGNNGQIQLWQFLLELLTDKDARDC
                                     ::. . :. :::::::::::::.:.    :
CCDS24 SQPLLINMYLPDPVGDGLFKDGKNPSWGPLSPAVQKGS-GQIQLWQFLLELLADRANAGC
         10        20        30        40         50        60     

      340       350       360       370       380       390        
pF1KB3 ISWVGDEGEFKLNQPELVAQKWGQRKNKPTMNYEKLSRALRYYYDGDMICKVQGKRFVYK
       :.: : .:::::..:. ::..::.::.::.:::.::::::::::: ... ::.:::..:.
CCDS24 IAWEGGHGEFKLTDPDEVARRWGERKSKPNMNYDKLSRALRYYYDKNIMSKVHGKRYAYR
          70        80        90       100       110       120     

      400       410       420       430       440       450        
pF1KB3 FVCDLKTLIGYSAAELNRLVTECEQKKLAKMQLHGIAQPVTAVALATASLQTEKDN    
       :                                                           
CCDS24 FDFQGLAQACQPPPAHAHAAAAAAAAAAAAQDGALYKLPAGLAPLPFPGLSKLNLMAASA
         130       140       150       160       170       180     

>>CCDS58789.1 ERG gene_id:2078|Hs108|chr21                (363 aa)
 initn: 591 init1: 403 opt: 408  Z-score: 483.6  bits: 98.4 E(32554): 1.3e-20
Smith-Waterman score: 587; 39.6% identity (71.0% similar) in 245 aa overlap (177-399:30-274)

        150       160       170       180       190       200      
pF1KB3 DGTKHITTISDETSEQVTRWAAALEGYRKEQERLGIPYDPIQWSTDQVLHWVVWVMKEFS
                                     ..:. .: ::  ::::.: .:. :..::..
CCDS58  MVGSPDTVGMNYGSYMEEKHMPPPNMTTNERRVIVPADPTLWSTDHVRQWLEWAVKEYG
                10        20        30        40        50         

        210        220       230         240       250             
pF1KB3 MTDIDLTTL-NISGRELCSLNQEDFFQRVPR--GEILWSHLELLRKYVL----------A
       . :...  . ::.:.:::.....:: . .:   ..:: :::. ::.  :          :
CCDS58 LPDVNILLFQNIDGKELCKMTKDDFQRLTPSYNADILLSHLHYLRETPLPHLTSDDVDKA
      60        70        80        90       100       110         

            260       270           280       290        300       
pF1KB3 SQEQ-QMNEIVTIDQPVQIIPASVQSA----TPTTIKVINSSAKAAKVQ-RAPRISGEDR
        :.. .. .  . : : .    :. ..    :: .  .  : . . :.. . :...  . 
CCDS58 LQNSPRLMHARNTDLPYEPPRRSAWTGHGHPTPQSKAAQPSPSTVPKTEDQRPQLDPYQI
     120       130       140       150       160       170         

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        .: ..: .:  .:::::::::::::.:..  .::.: : .::::...:. ::..::.::
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       .::.:::.::::::::::: ... ::.:::..:::                         
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       . :...  . ::.:.:::.....:: . .:   ..:: :::. ::.  :    ..  . .
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        .  : . . :.. . :...  .  .: ..: .:  .:::::::::::::.:..  .::.
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>>CCDS82674.1 ERG gene_id:2078|Hs108|chr21                (455 aa)
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pF1KB3 SSP-GNRTGN--NGQIQLWQFLLELLTDKDARDCISWVGDEGEFKLNQPELVAQKWGQRK
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CCDS82 LGPTSSRLANPGSGQIQLWQFLLELLSDSSNSSCITWEGTNGEFKMTDPDEVARRWGERK
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pF1KB3 NKPTMNYEKLSRALRYYYDGDMICKVQGKRFVYKFVCDLKTLIGYSAAELNRLVTECEQK
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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