FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB3919, 579 aa 1>>>pF1KB3919 579 - 579 aa - 579 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.6083+/-0.000883; mu= 10.0561+/- 0.054 mean_var=142.7385+/-29.549, 0's: 0 Z-trim(111.0): 47 B-trim: 0 in 0/52 Lambda= 0.107350 statistics sampled from 12011 (12054) to 12011 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.695), E-opt: 0.2 (0.37), width: 16 Scan time: 3.920 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS5382.1 IGF2BP3 gene_id:10643|Hs108|chr7 ( 579) 3772 595.8 5e-170 CCDS11543.1 IGF2BP1 gene_id:10642|Hs108|chr17 ( 577) 2815 447.5 2.1e-125 CCDS3273.2 IGF2BP2 gene_id:10644|Hs108|chr3 ( 599) 1676 271.1 2.7e-72 CCDS77870.1 IGF2BP2 gene_id:10644|Hs108|chr3 ( 605) 1654 267.7 2.9e-71 CCDS33903.1 IGF2BP2 gene_id:10644|Hs108|chr3 ( 556) 1573 255.2 1.6e-67 CCDS54138.1 IGF2BP1 gene_id:10642|Hs108|chr17 ( 438) 1529 248.3 1.5e-65 CCDS77869.1 IGF2BP2 gene_id:10644|Hs108|chr3 ( 536) 1351 220.8 3.5e-57 >>CCDS5382.1 IGF2BP3 gene_id:10643|Hs108|chr7 (579 aa) initn: 3772 init1: 3772 opt: 3772 Z-score: 3166.0 bits: 595.8 E(32554): 5e-170 Smith-Waterman score: 3772; 100.0% identity (100.0% similar) in 579 aa overlap (1-579:1-579) 10 20 30 40 50 60 pF1KB3 MNKLYIGNLSENAAPSDLESIFKDAKIPVSGPFLVKTGYAFVDCPDESWALKAIEALSGK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 MNKLYIGNLSENAAPSDLESIFKDAKIPVSGPFLVKTGYAFVDCPDESWALKAIEALSGK 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB3 IELHGKPIEVEHSVPKRQRIRKLQIRNIPPHLQWEVLDSLLVQYGVVESCEQVNTDSETA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 IELHGKPIEVEHSVPKRQRIRKLQIRNIPPHLQWEVLDSLLVQYGVVESCEQVNTDSETA 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB3 VVNVTYSSKDQARQALDKLNGFQLENFTLKVAYIPDEMAAQQNPLQQPRGRRGLGQRGSS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 VVNVTYSSKDQARQALDKLNGFQLENFTLKVAYIPDEMAAQQNPLQQPRGRRGLGQRGSS 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KB3 RQGSPGSVSKQKPCDLPLRLLVPTQFVGAIIGKEGATIRNITKQTQSKIDVHRKENAGAA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 RQGSPGSVSKQKPCDLPLRLLVPTQFVGAIIGKEGATIRNITKQTQSKIDVHRKENAGAA 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KB3 EKSITILSTPEGTSAACKSILEIMHKEAQDIKFTEEIPLKILAHNNFVGRLIGKEGRNLK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 EKSITILSTPEGTSAACKSILEIMHKEAQDIKFTEEIPLKILAHNNFVGRLIGKEGRNLK 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KB3 KIEQDTDTKITISPLQELTLYNPERTITVKGNVETCAKAEEEIMKKIRESYENDIASMNL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 KIEQDTDTKITISPLQELTLYNPERTITVKGNVETCAKAEEEIMKKIRESYENDIASMNL 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KB3 QAHLIPGLNLNALGLFPPTSGMPPPTSGPPSAMTPPYPQFEQSETETVHLFIPALSVGAI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 QAHLIPGLNLNALGLFPPTSGMPPPTSGPPSAMTPPYPQFEQSETETVHLFIPALSVGAI 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KB3 IGKQGQHIKQLSRFAGASIKIAPAEAPDAKVRMVIITGPPEAQFKAQGRIYGKIKEENFV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 IGKQGQHIKQLSRFAGASIKIAPAEAPDAKVRMVIITGPPEAQFKAQGRIYGKIKEENFV 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KB3 SPKEEVKLEAHIRVPSFAAGRVIGKGGKTVNELQNLSSAEVVVPRDQTPDENDQVVVKIT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 SPKEEVKLEAHIRVPSFAAGRVIGKGGKTVNELQNLSSAEVVVPRDQTPDENDQVVVKIT 490 500 510 520 530 540 550 560 570 pF1KB3 GHFYACQVAQRKIQEILTQVKQHQQQKALQSGPPQSRRK ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 GHFYACQVAQRKIQEILTQVKQHQQQKALQSGPPQSRRK 550 560 570 >>CCDS11543.1 IGF2BP1 gene_id:10642|Hs108|chr17 (577 aa) initn: 2949 init1: 2709 opt: 2815 Z-score: 2365.0 bits: 447.5 E(32554): 2.1e-125 Smith-Waterman score: 2815; 74.4% identity (90.1% similar) in 585 aa overlap (1-579:1-577) 10 20 30 40 50 60 pF1KB3 MNKLYIGNLSENAAPSDLESIFKDAKIPVSGPFLVKTGYAFVDCPDESWALKAIEALSGK :::::::::.:...:.:::..: . :: :: ::::.:::::::::: ::.::::..::: CCDS11 MNKLYIGNLNESVTPADLEKVFAEHKISYSGQFLVKSGYAFVDCPDEHWAMKAIETFSGK 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB3 IELHGKPIEVEHSVPKRQRIRKLQIRNIPPHLQWEVLDSLLVQYGVVESCEQVNTDSETA .::.:: .:.::::::.:: ::.:::::::.:.::::::::.:::.::.::::::.:::: CCDS11 VELQGKRLEIEHSVPKKQRSRKIQIRNIPPQLRWEVLDSLLAQYGTVENCEQVNTESETA 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB3 VVNVTYSSKDQARQALDKLNGFQLENFTLKVAYIPDEMAAQQNPLQQPRGRRGLGQRGSS :::::::...:.:::. :::: :::: .:::.:::::. :: .: . :: :.:.::. 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CCDS77 NDMLAVNQQANLIPGLNLSALGIFSTGLSVLSPPAGPRGAPPAAPYHPFTTHSGYFSSLY 360 370 380 390 400 410 400 410 420 430 440 pF1KB3 P-----PYPQFEQ-SETETVHLFIPALSVGAIIGKQGQHIKQLSRFAGASIKIAPAEAPD : :.:. .. : : :.::::. .:::::::.: :::::.:::::::::::::.:: CCDS77 PHHQFGPFPHHHSYPEQEIVNLFIPTQAVGAIIGKKGAHIKQLARFAGASIKIAPAEGPD 420 430 440 450 460 470 450 460 470 480 490 500 pF1KB3 AKVRMVIITGPPEAQFKAQGRIYGKIKEENFVSPKEEVKLEAHIRVPSFAAGRVIGKGGK .. :::::::::::::::::::.::.::::: .::::::::::::::: .:::::::::: CCDS77 VSERMVIITGPPEAQFKAQGRIFGKLKEENFFNPKEEVKLEAHIRVPSSTAGRVIGKGGK 480 490 500 510 520 530 510 520 530 540 550 560 pF1KB3 TVNELQNLSSAEVVVPRDQTPDENDQVVVKITGHFYACQVAQRKIQEILTQVKQHQQQKA ::::::::.::::.::::::::::..:.:.: :::.: :.:::::.::. :::: :.:: CCDS77 TVNELQNLTSAEVIVPRDQTPDENEEVIVRIIGHFFASQTAQRKIREIVQQVKQ-QEQKY 540 550 560 570 580 590 570 pF1KB3 LQSGPPQSRRK : : ..: : CCDS77 PQ-GVASQRSK 600 >>CCDS33903.1 IGF2BP2 gene_id:10644|Hs108|chr3 (556 aa) initn: 2371 init1: 841 opt: 1573 Z-score: 1325.7 bits: 255.2 E(32554): 1.6e-67 Smith-Waterman score: 2390; 65.1% identity (85.4% similar) in 581 aa overlap (1-579:2-556) 10 20 30 40 50 pF1KB3 MNKLYIGNLSENAAPSDLESIFKDAKIPVSGPFLVKTGYAFVDCPDESWALKAIEALSG :::::::::: .. .::...: : :.:..: :.:.:::::: ::..::..:::.::: CCDS33 MMNKLYIGNLSPAVTADDLRQLFGDRKLPLAGQVLLKSGYAFVDYPDQNWAIRAIETLSG 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KB3 KIELHGKPIEVEHSVPKRQRIRKLQIRNIPPHLQWEVLDSLLVQYGVVESCEQVNTDSET :.::::: .::..:: :. : ::.:::::::::::::::.::.:::.::. ::::::.:: CCDS33 KVELHGKIMEVDYSVSKKLRSRKIQIRNIPPHLQWEVLDGLLAQYGTVENVEQVNTDTET 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KB3 AVVNVTYSSKDQARQALDKLNGFQLENFTLKVAYIPDEMAAQQNPLQQPRGRRGLGQRGS :::::::.....:. :..::.: :.::...:..::::: ... .: : :..:: ...: CCDS33 AVVNVTYATREEAKIAMEKLSGHQFENYSFKISYIPDEEVSSPSPPQ--RAQRG--DHSS 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB3 SRQG-SPGSVSKQKPCDLPLRLLVPTQFVGAIIGKEGATIRNITKQTQSKIDVHRKENAG .:: .::..:. . :.:::.::::::::::::::: ::.::::::::..:.:::::.: CCDS33 REQGHAPGGTSQARQIDFPLRILVPTQFVGAIIGKEGLTIKNITKQTQSRVDIHRKENSG 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KB3 AAEKSITILSTPEGTSAACKSILEIMHKEAQDIKFTEEIPLKILAHNNFVGRLIGKEGRN :::: .:: .:::::: ::. :::::.:::.. :..:::::::::::..::::::::::: CCDS33 AAEKPVTIHATPEGTSEACRMILEIMQKEADETKLAEEIPLKILAHNGLVGRLIGKEGRN 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KB3 LKKIEQDTDTKITISPLQELTLYNPERTITVKGNVETCAKAEEEIMKKIRESYENDIASM :::::..: :::::: ::.:..:::::::::::.::.::.:: :::::.::..:::. .. CCDS33 LKKIEHETGTKITISSLQDLSIYNPERTITVKGTVEACASAEIEIMKKLREAFENDMLAV 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KB3 NLQAHLIPGLNLNALGLFPPTSGMPPPTSGP-PSAMTPPYPQFEQSETETVHLFIPALSV : .. : : .: .: :: : . :: : : :.::::. .: CCDS33 NTHS-----------GYF--SSLYPHHQFGPFPHHHS--YP-----EQEIVNLFIPTQAV 360 370 380 390 420 430 440 450 460 470 pF1KB3 GAIIGKQGQHIKQLSRFAGASIKIAPAEAPDAKVRMVIITGPPEAQFKAQGRIYGKIKEE ::::::.: :::::.:::::::::::::.::.. :::::::::::::::::::.::.::: CCDS33 GAIIGKKGAHIKQLARFAGASIKIAPAEGPDVSERMVIITGPPEAQFKAQGRIFGKLKEE 400 410 420 430 440 450 480 490 500 510 520 530 pF1KB3 NFVSPKEEVKLEAHIRVPSFAAGRVIGKGGKTVNELQNLSSAEVVVPRDQTPDENDQVVV :: .::::::::::::::: .::::::::::::::::::.::::.::::::::::..:.: CCDS33 NFFNPKEEVKLEAHIRVPSSTAGRVIGKGGKTVNELQNLTSAEVIVPRDQTPDENEEVIV 460 470 480 490 500 510 540 550 560 570 pF1KB3 KITGHFYACQVAQRKIQEILTQVKQHQQQKALQSGPPQSRRK .: :::.: :.:::::.::. :::: :.:: : : ..: : CCDS33 RIIGHFFASQTAQRKIREIVQQVKQ-QEQKYPQ-GVASQRSK 520 530 540 550 >>CCDS54138.1 IGF2BP1 gene_id:10642|Hs108|chr17 (438 aa) initn: 2316 init1: 1456 opt: 1529 Z-score: 1290.4 bits: 248.3 E(32554): 1.5e-65 Smith-Waterman score: 1921; 57.6% identity (69.9% similar) in 582 aa overlap (1-579:1-438) 10 20 30 40 50 60 pF1KB3 MNKLYIGNLSENAAPSDLESIFKDAKIPVSGPFLVKTGYAFVDCPDESWALKAIEALSGK :::::::::.:...:.:::..: . :: :: ::::.:::::::::: ::.::::..::: CCDS54 MNKLYIGNLNESVTPADLEKVFAEHKISYSGQFLVKSGYAFVDCPDEHWAMKAIETFSGK 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB3 IELHGKPIEVEHSVPKRQRIRKLQIRNIPPHLQWEVLDSLLVQYGVVESCEQVNTDSETA .::.:: .:.::::::.:: ::.:::::::.:.::::::::.:::.::.::::::.:::: CCDS54 VELQGKRLEIEHSVPKKQRSRKIQIRNIPPQLRWEVLDSLLAQYGTVENCEQVNTESETA 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB3 VVNVTYSSKDQARQALDKLNGFQLENFTLKVAYIPDEMAAQQNPLQQPRGRRGLGQRGSS :::::::...:.::: CCDS54 VVNVTYSNREQTRQA--------------------------------------------- 130 190 200 210 220 230 240 pF1KB3 RQGSPGSVSKQKPCDLPLRLLVPTQFVGAIIGKEGATIRNITKQTQSKIDVHRKENAGAA CCDS54 ------------------------------------------------------------ 250 260 270 280 290 300 pF1KB3 EKSITILSTPEGTSAACKSILEIMHKEAQDIKFTEEIPLKILAHNNFVGRLIGKEGRNLK .:.::::::::::::::::::::::: CCDS54 ----------------------------------DEVPLKILAHNNFVGRLIGKEGRNLK 140 150 160 310 320 330 340 350 360 pF1KB3 KIEQDTDTKITISPLQELTLYNPERTITVKGNVETCAKAEEEIMKKIRESYENDIASMNL :.::::.:::::: ::.:::::::::::::: .:.: .::.:::::.::.::::.:.:.: CCDS54 KVEQDTETKITISSLQDLTLYNPERTITVKGAIENCCRAEQEIMKKVREAYENDVAAMSL 170 180 190 200 210 220 370 380 390 400 410 pF1KB3 QAHLIPGLNLNALGLFPPTSGMPPPTSGPPSAMT--PPYPQFEQS-ETETVHLFIPALSV :.:::::::: :.:::: .:. :: :::..: :: .: :. : : :..:::: .: CCDS54 QSHLIPGLNLAAVGLFPASSSAVPP---PPSSVTGAAPYSSFMQAPEQEMVQVFIPAQAV 230 240 250 260 270 420 430 440 450 460 470 pF1KB3 GAIIGKQGQHIKQLSRFAGASIKIAPAEAPDAKVRMVIITGPPEAQFKAQGRIYGKIKEE ::::::.:::::::::::.::::::: :.::.::::::::::::::::::::::::.::: CCDS54 GAIIGKKGQHIKQLSRFASASIKIAPPETPDSKVRMVIITGPPEAQFKAQGRIYGKLKEE 280 290 300 310 320 330 480 490 500 510 520 530 pF1KB3 NFVSPKEEVKLEAHIRVPSFAAGRVIGKGGKTVNELQNLSSAEVVVPRDQTPDENDQVVV :: .::::::::.:::::. :::::::::::::::::::..:::::::::::::::::.: CCDS54 NFFGPKEEVKLETHIRVPASAAGRVIGKGGKTVNELQNLTAAEVVVPRDQTPDENDQVIV 340 350 360 370 380 390 540 550 560 570 pF1KB3 KITGHFYACQVAQRKIQEILTQVKQHQQQKALQSGPPQSRRK :: ::::: :.:::::..::.:::: :.::. ::. :.::: CCDS54 KIIGHFYASQMAQRKIRDILAQVKQ-QHQKG-QSNQAQARRK 400 410 420 430 >>CCDS77869.1 IGF2BP2 gene_id:10644|Hs108|chr3 (536 aa) initn: 2244 init1: 942 opt: 1351 Z-score: 1140.1 bits: 220.8 E(32554): 3.5e-57 Smith-Waterman score: 2171; 66.0% identity (85.9% similar) in 524 aa overlap (81-579:19-536) 60 70 80 90 100 110 pF1KB3 LKAIEALSGKIELHGKPIEVEHSVPKRQRIRKLQIRNIPPHLQWEVLDSLLVQYGVVESC ::.:::::::::::::::.::.:::.::. 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CCDS77 GGKTVNELQNLTSAEVIVPRDQTPDENEEVIVRIIGHFFASQTAQRKIREIVQQVKQ-QE 470 480 490 500 510 520 570 pF1KB3 QKALQSGPPQSRRK :: : : ..: : CCDS77 QKYPQ-GVASQRSK 530 579 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sat Nov 5 05:27:08 2016 done: Sat Nov 5 05:27:09 2016 Total Scan time: 3.920 Total Display time: 0.100 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]