Result of FASTA (ccds) for
pF1KB3963
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3963, 713 aa
1>>>pF1KB3963 713 - 713 aa - 713 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2195+/-0.00118; mu= 14.4198+/- 0.071
mean_var=71.2979+/-14.314, 0's: 0 Z-trim(102.2): 195 B-trim: 0 in 0/49
Lambda= 0.151892
statistics sampled from 6653 (6851) to 6653 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.571), E-opt: 0.2 (0.21), width: 16
Scan time: 2.740
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS58486.1 CDH13 gene_id:1012|Hs108|chr16 ( 713) 4687 1037.0 0
CCDS58485.1 CDH13 gene_id:1012|Hs108|chr16 ( 760) 4595 1016.9 0
CCDS58487.1 CDH13 gene_id:1012|Hs108|chr16 ( 674) 3623 803.8 0
CCDS77172.1 CDH2 gene_id:1000|Hs108|chr18 ( 875) 1685 379.2 1.5e-104
CCDS11891.1 CDH2 gene_id:1000|Hs108|chr18 ( 906) 1685 379.2 1.5e-104
CCDS58784.1 CDH4 gene_id:1002|Hs108|chr20 ( 842) 1593 359.0 1.6e-98
CCDS13488.1 CDH4 gene_id:1002|Hs108|chr20 ( 916) 1593 359.0 1.8e-98
CCDS10869.1 CDH1 gene_id:999|Hs108|chr16 ( 882) 1229 279.3 1.8e-74
CCDS82004.1 CDH3 gene_id:1001|Hs108|chr16 ( 784) 1210 275.1 2.8e-73
CCDS10868.1 CDH3 gene_id:1001|Hs108|chr16 ( 829) 1210 275.1 3e-73
CCDS32810.1 DSC3 gene_id:1825|Hs108|chr18 ( 896) 1201 273.1 1.3e-72
CCDS11893.1 DSC2 gene_id:1824|Hs108|chr18 ( 847) 1136 258.9 2.3e-68
CCDS11892.1 DSC2 gene_id:1824|Hs108|chr18 ( 901) 1136 258.9 2.5e-68
CCDS13485.1 CDH26 gene_id:60437|Hs108|chr20 ( 832) 1083 247.3 7.1e-65
CCDS56010.1 CDH13 gene_id:1012|Hs108|chr16 ( 190) 1071 244.5 1.1e-64
CCDS56009.1 CDH13 gene_id:1012|Hs108|chr16 ( 175) 1067 243.6 1.9e-64
CCDS11895.1 DSC1 gene_id:1823|Hs108|chr18 ( 840) 1039 237.6 5.8e-62
CCDS11894.1 DSC1 gene_id:1823|Hs108|chr18 ( 894) 1039 237.6 6.1e-62
CCDS11897.1 DSG4 gene_id:147409|Hs108|chr18 (1040) 968 222.1 3.4e-57
CCDS45845.1 DSG4 gene_id:147409|Hs108|chr18 (1059) 968 222.1 3.5e-57
CCDS42423.1 DSG2 gene_id:1829|Hs108|chr18 (1118) 904 208.1 6.1e-53
CCDS10976.1 CDH15 gene_id:1013|Hs108|chr16 ( 814) 886 204.1 6.9e-52
CCDS11898.1 DSG3 gene_id:1830|Hs108|chr18 ( 999) 859 198.2 5.1e-50
CCDS6260.1 CDH17 gene_id:1015|Hs108|chr8 ( 832) 831 192.0 3e-48
CCDS82259.1 CDH7 gene_id:1005|Hs108|chr18 ( 630) 766 177.8 4.5e-44
CCDS11993.1 CDH7 gene_id:1005|Hs108|chr18 ( 785) 766 177.8 5.5e-44
CCDS11977.1 CDH20 gene_id:28316|Hs108|chr18 ( 801) 715 166.6 1.3e-40
CCDS11896.1 DSG1 gene_id:1828|Hs108|chr18 (1049) 690 161.2 7.5e-39
CCDS13395.1 CDH22 gene_id:64405|Hs108|chr20 ( 828) 679 158.7 3.2e-38
CCDS10802.1 CDH8 gene_id:1006|Hs108|chr16 ( 799) 673 157.4 7.6e-38
CCDS81993.1 CDH11 gene_id:1009|Hs108|chr16 ( 693) 671 157.0 9.1e-38
CCDS10803.1 CDH11 gene_id:1009|Hs108|chr16 ( 796) 671 157.0 1e-37
CCDS3892.1 CDH10 gene_id:1008|Hs108|chr5 ( 788) 666 155.9 2.2e-37
CCDS3889.1 CDH18 gene_id:1016|Hs108|chr5 ( 790) 658 154.1 7.4e-37
CCDS3890.1 CDH12 gene_id:1010|Hs108|chr5 ( 794) 648 151.9 3.4e-36
CCDS3894.1 CDH6 gene_id:1004|Hs108|chr5 ( 790) 622 146.2 1.7e-34
CCDS81992.1 CDH11 gene_id:1009|Hs108|chr16 ( 670) 617 145.1 3.2e-34
CCDS3893.1 CDH9 gene_id:1007|Hs108|chr5 ( 789) 617 145.1 3.7e-34
CCDS82005.1 CDH1 gene_id:999|Hs108|chr16 ( 821) 617 145.1 3.9e-34
CCDS9586.1 CDH24 gene_id:64403|Hs108|chr14 ( 781) 608 143.2 1.5e-33
CCDS58472.1 CDH16 gene_id:1014|Hs108|chr16 ( 732) 607 142.9 1.6e-33
CCDS82991.1 CDH12 gene_id:1010|Hs108|chr5 ( 754) 578 136.6 1.3e-31
CCDS54835.1 CDH18 gene_id:1016|Hs108|chr5 ( 574) 561 132.8 1.4e-30
CCDS75229.1 CDH18 gene_id:1016|Hs108|chr5 ( 575) 561 132.8 1.4e-30
CCDS10804.1 CDH5 gene_id:1003|Hs108|chr16 ( 784) 553 131.1 6.2e-30
CCDS9585.1 CDH24 gene_id:64403|Hs108|chr14 ( 819) 512 122.1 3.3e-27
CCDS31986.1 PCDH17 gene_id:27253|Hs108|chr13 (1159) 430 104.2 1.2e-21
CCDS44429.1 CDH23 gene_id:64072|Hs108|chr10 ( 530) 357 88.1 3.6e-17
CCDS47150.1 DCHS2 gene_id:54798|Hs108|chr4 (1369) 361 89.1 4.8e-17
CCDS58471.1 CDH16 gene_id:1014|Hs108|chr16 ( 790) 355 87.7 7.2e-17
>>CCDS58486.1 CDH13 gene_id:1012|Hs108|chr16 (713 aa)
initn: 4687 init1: 4687 opt: 4687 Z-score: 5547.5 bits: 1037.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4687; 100.0% identity (100.0% similar) in 713 aa overlap (1-713:1-713)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MQPRTPLVLCVLLSQVLLLTSAEDLDCTPGFQQKVFHINQPAEFIEDQSILNLTFSDCKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MQPRTPLVLCVLLSQVLLLTSAEDLDCTPGFQQKVFHINQPAEFIEDQSILNLTFSDCKG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 NDKLRYEVSSPYFKVNSDGGLVALRNITAVGKTLFVHARTPHAEDMAELVIVGGKDIQGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 NDKLRYEVSSPYFKVNSDGGLVALRNITAVGKTLFVHARTPHAEDMAELVIVGGKDIQGS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 LQDIFKFARTSPVPRQKRSIVVSPILIPENQRQPFPRDVGKVVDSDRPERSKFRLTGKGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LQDIFKFARTSPVPRQKRSIVVSPILIPENQRQPFPRDVGKVVDSDRPERSKFRLTGKGV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 DQEPKGIFRINENTGSVSVTRTLDREVIAVYQLFVETTDVNGKTLEGPVPLEVIVIDQND
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 DQEPKGIFRINENTGSVSVTRTLDREVIAVYQLFVETTDVNGKTLEGPVPLEVIVIDQND
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 NRPIFREGPYIGHVMEGSPTGTTVMRMTAFDADDPATDNALLRYNIRQQTPDKPSPNMFY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 NRPIFREGPYIGHVMEGSPTGTTVMRMTAFDADDPATDNALLRYNIRQQTPDKPSPNMFY
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 IDPEKGDIVTVVSPALLDRETLENPKYELIIEAQDMAGLDVGLTGTATATIMIDDKNDHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 IDPEKGDIVTVVSPALLDRETLENPKYELIIEAQDMAGLDVGLTGTATATIMIDDKNDHS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 PKFTKKEFQATVEEGAVGVIVNLTVEDKDDPTTGAWRAAYTIINGNPGQSFEIHTNPQTN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PKFTKKEFQATVEEGAVGVIVNLTVEDKDDPTTGAWRAAYTIINGNPGQSFEIHTNPQTN
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 EGMLSVVKPLDYEISAFHTLLIKVENEDPLVPDVSYGPSSTATVHITVLDVNEGPVFYPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 EGMLSVVKPLDYEISAFHTLLIKVENEDPLVPDVSYGPSSTATVHITVLDVNEGPVFYPD
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 PMMVTRQEDLSVGSVLLTVNATDPDSLQHQTIRYSVYKDPAGWLNINPINGTVDTTAVLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PMMVTRQEDLSVGSVLLTVNATDPDSLQHQTIRYSVYKDPAGWLNINPINGTVDTTAVLD
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 RESPFVDNSVYTALFLAIDSGNPPATGTGTLLITLEDVNDNAPFIYPTVAEVCDDAKNLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RESPFVDNSVYTALFLAIDSGNPPATGTGTLLITLEDVNDNAPFIYPTVAEVCDDAKNLS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 VVILGASDKDLHPNTDPFKFEIHKQAVPDKVWKISKINNTHALVSLLQNLNKANYNLPIM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 VVILGASDKDLHPNTDPFKFEIHKQAVPDKVWKISKINNTHALVSLLQNLNKANYNLPIM
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710
pF1KB3 VTDSGKPPMTNITDLRVQVCSCRNSKVDCNAAGALRFSLPSVLLLSLFSLACL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 VTDSGKPPMTNITDLRVQVCSCRNSKVDCNAAGALRFSLPSVLLLSLFSLACL
670 680 690 700 710
>>CCDS58485.1 CDH13 gene_id:1012|Hs108|chr16 (760 aa)
initn: 4593 init1: 4593 opt: 4595 Z-score: 5438.1 bits: 1016.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4595; 98.5% identity (98.9% similar) in 713 aa overlap (1-713:50-760)
10 20 30
pF1KB3 MQPRTPLVLCVLLSQVLLLTSAEDLDCTPG
: : : . .. ::::::::::::::::
CCDS58 FCAFSCPRAKQPTCTAWFPQQEHPSENGPQMPGRDPPAASTM--QVLLLTSAEDLDCTPG
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80 90
pF1KB3 FQQKVFHINQPAEFIEDQSILNLTFSDCKGNDKLRYEVSSPYFKVNSDGGLVALRNITAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 FQQKVFHINQPAEFIEDQSILNLTFSDCKGNDKLRYEVSSPYFKVNSDGGLVALRNITAV
80 90 100 110 120 130
100 110 120 130 140 150
pF1KB3 GKTLFVHARTPHAEDMAELVIVGGKDIQGSLQDIFKFARTSPVPRQKRSIVVSPILIPEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GKTLFVHARTPHAEDMAELVIVGGKDIQGSLQDIFKFARTSPVPRQKRSIVVSPILIPEN
140 150 160 170 180 190
160 170 180 190 200 210
pF1KB3 QRQPFPRDVGKVVDSDRPERSKFRLTGKGVDQEPKGIFRINENTGSVSVTRTLDREVIAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 QRQPFPRDVGKVVDSDRPERSKFRLTGKGVDQEPKGIFRINENTGSVSVTRTLDREVIAV
200 210 220 230 240 250
220 230 240 250 260 270
pF1KB3 YQLFVETTDVNGKTLEGPVPLEVIVIDQNDNRPIFREGPYIGHVMEGSPTGTTVMRMTAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 YQLFVETTDVNGKTLEGPVPLEVIVIDQNDNRPIFREGPYIGHVMEGSPTGTTVMRMTAF
260 270 280 290 300 310
280 290 300 310 320 330
pF1KB3 DADDPATDNALLRYNIRQQTPDKPSPNMFYIDPEKGDIVTVVSPALLDRETLENPKYELI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 DADDPATDNALLRYNIRQQTPDKPSPNMFYIDPEKGDIVTVVSPALLDRETLENPKYELI
320 330 340 350 360 370
340 350 360 370 380 390
pF1KB3 IEAQDMAGLDVGLTGTATATIMIDDKNDHSPKFTKKEFQATVEEGAVGVIVNLTVEDKDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 IEAQDMAGLDVGLTGTATATIMIDDKNDHSPKFTKKEFQATVEEGAVGVIVNLTVEDKDD
380 390 400 410 420 430
400 410 420 430 440 450
pF1KB3 PTTGAWRAAYTIINGNPGQSFEIHTNPQTNEGMLSVVKPLDYEISAFHTLLIKVENEDPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PTTGAWRAAYTIINGNPGQSFEIHTNPQTNEGMLSVVKPLDYEISAFHTLLIKVENEDPL
440 450 460 470 480 490
460 470 480 490 500 510
pF1KB3 VPDVSYGPSSTATVHITVLDVNEGPVFYPDPMMVTRQEDLSVGSVLLTVNATDPDSLQHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 VPDVSYGPSSTATVHITVLDVNEGPVFYPDPMMVTRQEDLSVGSVLLTVNATDPDSLQHQ
500 510 520 530 540 550
520 530 540 550 560 570
pF1KB3 TIRYSVYKDPAGWLNINPINGTVDTTAVLDRESPFVDNSVYTALFLAIDSGNPPATGTGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 TIRYSVYKDPAGWLNINPINGTVDTTAVLDRESPFVDNSVYTALFLAIDSGNPPATGTGT
560 570 580 590 600 610
580 590 600 610 620 630
pF1KB3 LLITLEDVNDNAPFIYPTVAEVCDDAKNLSVVILGASDKDLHPNTDPFKFEIHKQAVPDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LLITLEDVNDNAPFIYPTVAEVCDDAKNLSVVILGASDKDLHPNTDPFKFEIHKQAVPDK
620 630 640 650 660 670
640 650 660 670 680 690
pF1KB3 VWKISKINNTHALVSLLQNLNKANYNLPIMVTDSGKPPMTNITDLRVQVCSCRNSKVDCN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 VWKISKINNTHALVSLLQNLNKANYNLPIMVTDSGKPPMTNITDLRVQVCSCRNSKVDCN
680 690 700 710 720 730
700 710
pF1KB3 AAGALRFSLPSVLLLSLFSLACL
:::::::::::::::::::::::
CCDS58 AAGALRFSLPSVLLLSLFSLACL
740 750 760
>>CCDS58487.1 CDH13 gene_id:1012|Hs108|chr16 (674 aa)
initn: 3623 init1: 3623 opt: 3623 Z-score: 4287.8 bits: 803.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4334; 94.5% identity (94.5% similar) in 713 aa overlap (1-713:1-674)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MQPRTPLVLCVLLSQVLLLTSAEDLDCTPGFQQKVFHINQPAEFIEDQSILNLTFSDCKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MQPRTPLVLCVLLSQVLLLTSAEDLDCTPGFQQKVFHINQPAEFIEDQSILNLTFSDCKG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 NDKLRYEVSSPYFKVNSDGGLVALRNITAVGKTLFVHARTPHAEDMAELVIVGGKDIQGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 NDKLRYEVSSPYFKVNSDGGLVALRNITAVGKTLFVHARTPHAEDMAELVIVGGKDIQGS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 LQDIFKFARTSPVPRQKRSIVVSPILIPENQRQPFPRDVGKVVDSDRPERSKFRLTGKGV
:: :::::::::::::::::::
CCDS58 LQ---------------------------------------VVDSDRPERSKFRLTGKGV
130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 DQEPKGIFRINENTGSVSVTRTLDREVIAVYQLFVETTDVNGKTLEGPVPLEVIVIDQND
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 DQEPKGIFRINENTGSVSVTRTLDREVIAVYQLFVETTDVNGKTLEGPVPLEVIVIDQND
150 160 170 180 190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 NRPIFREGPYIGHVMEGSPTGTTVMRMTAFDADDPATDNALLRYNIRQQTPDKPSPNMFY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 NRPIFREGPYIGHVMEGSPTGTTVMRMTAFDADDPATDNALLRYNIRQQTPDKPSPNMFY
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 IDPEKGDIVTVVSPALLDRETLENPKYELIIEAQDMAGLDVGLTGTATATIMIDDKNDHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 IDPEKGDIVTVVSPALLDRETLENPKYELIIEAQDMAGLDVGLTGTATATIMIDDKNDHS
270 280 290 300 310 320
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 PKFTKKEFQATVEEGAVGVIVNLTVEDKDDPTTGAWRAAYTIINGNPGQSFEIHTNPQTN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PKFTKKEFQATVEEGAVGVIVNLTVEDKDDPTTGAWRAAYTIINGNPGQSFEIHTNPQTN
330 340 350 360 370 380
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 EGMLSVVKPLDYEISAFHTLLIKVENEDPLVPDVSYGPSSTATVHITVLDVNEGPVFYPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 EGMLSVVKPLDYEISAFHTLLIKVENEDPLVPDVSYGPSSTATVHITVLDVNEGPVFYPD
390 400 410 420 430 440
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 PMMVTRQEDLSVGSVLLTVNATDPDSLQHQTIRYSVYKDPAGWLNINPINGTVDTTAVLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PMMVTRQEDLSVGSVLLTVNATDPDSLQHQTIRYSVYKDPAGWLNINPINGTVDTTAVLD
450 460 470 480 490 500
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 RESPFVDNSVYTALFLAIDSGNPPATGTGTLLITLEDVNDNAPFIYPTVAEVCDDAKNLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RESPFVDNSVYTALFLAIDSGNPPATGTGTLLITLEDVNDNAPFIYPTVAEVCDDAKNLS
510 520 530 540 550 560
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 VVILGASDKDLHPNTDPFKFEIHKQAVPDKVWKISKINNTHALVSLLQNLNKANYNLPIM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 VVILGASDKDLHPNTDPFKFEIHKQAVPDKVWKISKINNTHALVSLLQNLNKANYNLPIM
570 580 590 600 610 620
670 680 690 700 710
pF1KB3 VTDSGKPPMTNITDLRVQVCSCRNSKVDCNAAGALRFSLPSVLLLSLFSLACL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 VTDSGKPPMTNITDLRVQVCSCRNSKVDCNAAGALRFSLPSVLLLSLFSLACL
630 640 650 660 670
>>CCDS77172.1 CDH2 gene_id:1000|Hs108|chr18 (875 aa)
initn: 1431 init1: 770 opt: 1685 Z-score: 1990.7 bits: 379.2 E(32554): 1.5e-104
Smith-Waterman score: 1754; 43.6% identity (71.1% similar) in 660 aa overlap (51-689:25-678)
30 40 50 60 70
pF1KB3 SAEDLDCTPGFQQKVFHINQPAEFIEDQSILNLTFSDCKGNDKLRYEVSSPY-FKVNSDG
:.. ::.:.:. :..:: : : :::. ::
CCDS77 MFLLRRYVCIFTEKLKNQAELYVFLSVKFSNCNGKRKVQYESSEPADFKVDEDG
10 20 30 40 50
80 90 100 110 120
pF1KB3 GLVALRN--ITAVGKTLFVHARTPHAEDMAELVI-------VGGKDIQGS--LQDIF---
. :.:. ... ....:. .... .... . .... : ...:
CCDS77 MVYAVRSFPLSSEHAKFLIYAQDKETQEKWQVAVKLSLKPTLTEESVKESAEVEEIVFPR
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 KFARTSP-VPRQKRSIVVSPILIPENQRQPFPRDVGKV-VDSDRPERSKFRLTGKGVDQE
.:.. : . ::::. :. :: .:::.: :::... .. : :. .. .:: :.::
CCDS77 QFSKHSGHLQRQKRDWVIPPINLPENSRGPFPQELVRIRSDRDKNLSLRYSVTGPGADQP
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 PKGIFRINENTGSVSVTRTLDREVIAVYQLFVETTDVNGKTLEGPVPLEVIVIDQNDNRP
: ::: :: .:..:::. :::: :: ..: ....:.::. .:.:. . . :::.:::::
CCDS77 PTGIFIINPISGQLSVTKPLDREQIARFHLRAHAVDINGNQVENPIDIVINVIDMNDNRP
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 IFREGPYIGHVMEGSPTGTTVMRMTAFDADDPATDNALLRYNIRQQTPDKPSPNMFYIDP
: . . : : ::: :: :: .::.::::: . :..::: : .:.:. :::::: :.
CCDS77 EFLHQVWNGTVPEGSKPGTYVMTVTAIDADDPNALNGMLRYRIVSQAPSTPSPNMFTINN
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 EKGDIVTVVSPALLDRETLENPKYELIIEAQDMAGLDV-GLTGTATATIMIDDKNDHSPK
: :::.::. : :::: .. .: :::.: :: : . ::..::::.: . : ::. :.
CCDS77 ETGDIITVA--AGLDREKVQ--QYTLIIQATDMEGNPTYGLSNTATAVITVTDVNDNPPE
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 FTKKEFQATVEEGAVGVIV-NLTVEDKDDPTTGAWRAAYTIINGNPGQSFEIHTNPQTNE
:: : . : :. : .:: :::: :::.: : :: :.: : .:.: : :.:.:..:.
CCDS77 FTAMTFYGEVPENRVDIIVANLTVTDKDQPHTPAWNAVYRISGGDPTGRFAIQTDPNSND
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 GMLSVVKPLDYEISAFHTLLIKVENEDPLVPDVSYGPSSTATVHITVLDVNEGPVFYPDP
:...::::.:.: . . .: . .::. ::. ... :.::::: .::.::::.: : :.:
CCDS77 GLVTVVKPIDFETNRMFVLTVAAENQVPLAKGIQHPPQSTATVSVTVIDVNENPYFAPNP
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 MMVTRQEDLSVGSVLLTVNATDPDSLQHQTIRYSVYKDPAGWLNINPINGTVDTTAVLDR
.. ..: : .:..: : .: ::: ..:.:::. .:::.::.:.:.:: . : :::::
CCDS77 KIIRQEEGLHAGTMLTTFTAQDPDRYMQQNIRYTKLSDPANWLKIDPVNGQITTIAVLDR
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 ESPFVDNSVYTALFLAIDSGNPPATGTGTLLITLEDVNDNAPFIYPTVAEVCDDAKNLSV
::: : :..:.: ::: :.: :: .::::: : : :.::::: . : ::.:. :.
CCDS77 ESPNVKNNIYNATFLASDNGIPPMSGTGTLQIYLLDINDNAPQVLPQEAETCETPDPNSI
540 550 560 570 580 590
610 620 630 640 650
pF1KB3 VILGASDKDLHPNTDPFKFEIHKQAVPDKV-WKISKINNTHALVSL-LQNLNKANYNLPI
: : : :. ::. :: :.. . : : : :...:. : ..: .. :. . :..::
CCDS77 NIT-ALDYDIDPNAGPFAFDLPLSPVTIKRNWTITRLNGDFAQLNLKIKFLEAGIYEVPI
600 610 620 630 640
660 670 680 690 700 710
pF1KB3 MVTDSGKPPMTNITDLRVQVCSCRNSKVDCNAAGALRFSLPSVLLLSLFSLACL
..::::.:: .::. :::.::.: .:. ::
CCDS77 IITDSGNPPKSNISILRVKVCQC-DSNGDCTDVDRIVGAGLGTGAIIAILLCIIILLILV
650 660 670 680 690 700
>>CCDS11891.1 CDH2 gene_id:1000|Hs108|chr18 (906 aa)
initn: 1431 init1: 770 opt: 1685 Z-score: 1990.5 bits: 379.2 E(32554): 1.5e-104
Smith-Waterman score: 1813; 42.9% identity (69.6% similar) in 707 aa overlap (4-689:9-709)
10 20 30 40 50
pF1KB3 MQPRTPLVLCVLLSQVLLLTSAEDLDCTPGFQQKVFHINQPAEFIEDQSILNLTF
:: : : . : :. . .:.: : :: . :. . : : .::. :
CCDS11 MCRIAGALRTLLPLLAALLQASVEASGEIALCKTGFPEDVYSAVLSKDVHEGQPLLNVKF
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB3 SDCKGNDKLRYEVSSPY-FKVNSDGGLVALRN--ITAVGKTLFVHARTPHAEDMAELVI-
:.:.:. :..:: : : :::. :: . :.:. ... ....:. .... ....
CCDS11 SNCNGKRKVQYESSEPADFKVDEDGMVYAVRSFPLSSEHAKFLIYAQDKETQEKWQVAVK
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150
pF1KB3 ------VGGKDIQGS--LQDIF---KFARTSP-VPRQKRSIVVSPILIPENQRQPFPRDV
. .... : ...: .:.. : . ::::. :. :: .:::.: :::...
CCDS11 LSLKPTLTEESVKESAEVEEIVFPRQFSKHSGHLQRQKRDWVIPPINLPENSRGPFPQEL
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB3 GKV-VDSDRPERSKFRLTGKGVDQEPKGIFRINENTGSVSVTRTLDREVIAVYQLFVETT
.. : :. .. .:: :.:: : ::: :: .:..:::. :::: :: ..: ....
CCDS11 VRIRSDRDKNLSLRYSVTGPGADQPPTGIFIINPISGQLSVTKPLDREQIARFHLRAHAV
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KB3 DVNGKTLEGPVPLEVIVIDQNDNRPIFREGPYIGHVMEGSPTGTTVMRMTAFDADDPATD
:.::. .:.:. . . :::.::::: : . . : : ::: :: :: .::.::::: .
CCDS11 DINGNQVENPIDIVINVIDMNDNRPEFLHQVWNGTVPEGSKPGTYVMTVTAIDADDPNAL
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KB3 NALLRYNIRQQTPDKPSPNMFYIDPEKGDIVTVVSPALLDRETLENPKYELIIEAQDMAG
:..::: : .:.:. :::::: :. : :::.::. : :::: .. .: :::.: :: :
CCDS11 NGMLRYRIVSQAPSTPSPNMFTINNETGDIITVA--AGLDREKVQ--QYTLIIQATDMEG
310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KB3 LDV-GLTGTATATIMIDDKNDHSPKFTKKEFQATVEEGAVGVIV-NLTVEDKDDPTTGAW
. ::..::::.: . : ::. :.:: : . : :. : .:: :::: :::.: : ::
CCDS11 NPTYGLSNTATAVITVTDVNDNPPEFTAMTFYGEVPENRVDIIVANLTVTDKDQPHTPAW
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KB3 RAAYTIINGNPGQSFEIHTNPQTNEGMLSVVKPLDYEISAFHTLLIKVENEDPLVPDVSY
:.: : .:.: : :.:.:..:.:...::::.:.: . . .: . .::. ::. ...
CCDS11 NAVYRISGGDPTGRFAIQTDPNSNDGLVTVVKPIDFETNRMFVLTVAAENQVPLAKGIQH
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500 510
pF1KB3 GPSSTATVHITVLDVNEGPVFYPDPMMVTRQEDLSVGSVLLTVNATDPDSLQHQTIRYSV
:.::::: .::.::::.: : :.: .. ..: : .:..: : .: ::: ..:.:::.
CCDS11 PPQSTATVSVTVIDVNENPYFAPNPKIIRQEEGLHAGTMLTTFTAQDPDRYMQQNIRYTK
480 490 500 510 520 530
520 530 540 550 560 570
pF1KB3 YKDPAGWLNINPINGTVDTTAVLDRESPFVDNSVYTALFLAIDSGNPPATGTGTLLITLE
.:::.::.:.:.:: . : :::::::: : :..:.: ::: :.: :: .::::: : :
CCDS11 LSDPANWLKIDPVNGQITTIAVLDRESPNVKNNIYNATFLASDNGIPPMSGTGTLQIYLL
540 550 560 570 580 590
580 590 600 610 620 630
pF1KB3 DVNDNAPFIYPTVAEVCDDAKNLSVVILGASDKDLHPNTDPFKFEIHKQAVPDKV-WKIS
:.::::: . : ::.:. :. : : : :. ::. :: :.. . : : : :.
CCDS11 DINDNAPQVLPQEAETCETPDPNSINIT-ALDYDIDPNAGPFAFDLPLSPVTIKRNWTIT
600 610 620 630 640 650
640 650 660 670 680 690
pF1KB3 KINNTHALVSL-LQNLNKANYNLPIMVTDSGKPPMTNITDLRVQVCSCRNSKVDCNAAGA
..:. : ..: .. :. . :..::..::::.:: .::. :::.::.: .:. ::
CCDS11 RLNGDFAQLNLKIKFLEAGIYEVPIIITDSGNPPKSNISILRVKVCQC-DSNGDCTDVDR
660 670 680 690 700 710
700 710
pF1KB3 LRFSLPSVLLLSLFSLACL
CCDS11 IVGAGLGTGAIIAILLCIIILLILVLMFVVWMKRRDKERQAKQLLIDPEDDVRDNILKYD
720 730 740 750 760 770
>>CCDS58784.1 CDH4 gene_id:1002|Hs108|chr20 (842 aa)
initn: 1317 init1: 709 opt: 1593 Z-score: 1882.0 bits: 359.0 E(32554): 1.6e-98
Smith-Waterman score: 1593; 44.9% identity (71.0% similar) in 566 aa overlap (135-695:92-651)
110 120 130 140 150 160
pF1KB3 DMAELVIVGGKDIQGSLQDIFKFARTSPVPRQKRSIVVSPILIPENQRQPFPRDVGKV-V
:.::. :. :: .:::.: :::... ..
CCDS58 GKKVVALDPSPPPKDTLLPWPQHQNANGLRRRKRDWVIPPINVPENSRGPFPQQLVRIRS
70 80 90 100 110 120
170 180 190 200 210 220
pF1KB3 DSDRPERSKFRLTGKGVDQEPKGIFRINENTGSVSVTRTLDREVIAVYQLFVETTDVNGK
:.: .. .:: :.:: : .: :. .: . ::: .::: : :.: ....:.::.
CCDS58 DKDNDIPIRYSITGVGADQPPMEVFSIDSMSGRMYVTRPMDREEHASYHLRAHAVDMNGN
130 140 150 160 170 180
230 240 250 260 270 280
pF1KB3 TLEGPVPLEVIVIDQNDNRPIFREGPYIGHVMEGSPTGTTVMRMTAFDADDPATDNALLR
.:.:. : . :::.::::: : . : : : ::: :: :: .:: :::: .: :...:
CCDS58 KVENPIDLYIYVIDMNDNRPEFINQVYNGSVDEGSKPGTYVMTVTANDADDSTTANGMVR
190 200 210 220 230 240
290 300 310 320 330 340
pF1KB3 YNIRQQTPDKPSPNMFYIDPEKGDIVTVVSPALLDRETLENPKYELIIEAQDMAG-LDVG
: : :::..:: ::: :. : ::::::. : :::: .. .: .:..: :: : :. :
CCDS58 YRIVTQTPQSPSQNMFTINSETGDIVTVA--AGLDREKVQ--QYTVIVQATDMEGNLNYG
250 260 270 280 290
350 360 370 380 390 400
pF1KB3 LTGTATATIMIDDKNDHSPKFTKKEFQATVEEGAV-GVIVNLTVEDKDDPTTGAWRAAYT
:..:::: : . : ::. :.:: . : . : :. : :..:::: :.:.: . : :.:
CCDS58 LSNTATAIITVTDVNDNPPEFTASTFAGEVPENRVETVVANLTVMDRDQPHSPNWNAVYR
300 310 320 330 340 350
410 420 430 440 450 460
pF1KB3 IINGNPGQSFEIHTNPQTNEGMLSVVKPLDYEISAFHTLLIKVENEDPLVPDVSYGPSST
::.:.:. : ..:.: :::::..::: .:::.. : . : :. ::. .... .::
CCDS58 IISGDPSGHFSVRTDPVTNEGMVTVVKAVDYELNRAFMLTVMVSNQAPLASGIQMSFQST
360 370 380 390 400 410
470 480 490 500 510 520
pF1KB3 ATVHITVLDVNEGPVFYPDPMMVTRQEDLSVGSVLLTVNATDPDSLQHQTIRYSVYKDPA
: : :...:.::.: : . .. .: . :.:: : .:.::: ...:..::: .:::
CCDS58 AGVTISIMDINEAPYFPSNHKLIRLEEGVPPGTVLTTFSAVDPDRFMQQAVRYSKLSDPA
420 430 440 450 460 470
530 540 550 560 570 580
pF1KB3 GWLNINPINGTVDTTAVLDRESPFVDNSVYTALFLAIDSGNPPATGTGTLLITLEDVNDN
.::.:: :: . :.::::::: .. :.:: : ::: :.: :::.::::: : : :.:::
CCDS58 SWLHINATNGQITTAAVLDRESLYTKNNVYEATFLAADNGIPPASGTGTLQIYLIDINDN
480 490 500 510 520 530
590 600 610 620 630 640
pF1KB3 APFIYPTVAEVCDDAKNLSVVILGASDKDLHPNTDPFKFEI-HKQAVPDKVWKISKINNT
:: . : :..:. ::... . :.: :. :: :. ::. :. : : :...:.
CCDS58 APELLPKEAQICEKP-NLNAINITAADADVDPNIGPYVFELPFVPAAVRKNWTITRLNGD
540 550 560 570 580 590
650 660 670 680 690
pF1KB3 HALVSL-LQNLNKANYNLPIMVTDSGKPPMTNITDLRVQVCSCRNSKVDCNAAGALRFSL
.: .:: . :. . :..::.:::::.::..: . ..:.:: : .. ::.. ::.
CCDS58 YAQLSLRILYLEAGMYDVPIIVTDSGNPPLSNTSIIKVKVCPCDDNG-DCTTIGAVAAAG
600 610 620 630 640 650
700 710
pF1KB3 PSVLLLSLFSLACL
CCDS58 LGTGAIVAILICILILLTMVLLFVMWMKRREKERHTKQLLIDPEDDVRDNILKYDEEGGG
660 670 680 690 700 710
>>CCDS13488.1 CDH4 gene_id:1002|Hs108|chr20 (916 aa)
initn: 1413 init1: 709 opt: 1593 Z-score: 1881.4 bits: 359.0 E(32554): 1.8e-98
Smith-Waterman score: 1662; 39.9% identity (65.8% similar) in 725 aa overlap (8-695:7-725)
10 20 30 40 50
pF1KB3 MQPRTPLVLCVLLSQVLLLTS-AEDLD----CTPGFQQKVFHINQPAEFIEDQSILNLTF
:: .::: : . ::: : ::.. . ...: ...:.. :
CCDS13 MTAGAGVLLLLLSLSGALRAHNEDLTTRETCKAGFSEDDYTALISQNILEGEKLLQVKF
10 20 30 40 50
60 70 80 90
pF1KB3 SDCKGNDKLRYEVSSPYFKVNSDGGLVALRNIT----------------------AVGKT
:.: :. .::..: :::..:: . : :.. :: .
CCDS13 SSCVGTKGTQYETNSMDFKVGADGTVFATRELQVPSEQVAFTVTAWDSQTAEKWDAVVRL
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140
pF1KB3 LFVHARTPHA----EDMAELVIVG-GKDIQGSLQDIFKFARTSPVPRQKRSIVVSPILIP
: ... .::. . ..: . . . .: . .. . :.::. :. :: .:
CCDS13 LVAQTSSPHSGHKPQKGKKVVALDPSPPPKDTLLPWPQHQNANGLRRRKRDWVIPPINVP
120 130 140 150 160 170
150 160 170 180 190 200
pF1KB3 ENQRQPFPRDVGKV-VDSDRPERSKFRLTGKGVDQEPKGIFRINENTGSVSVTRTLDREV
::.: :::... .. :.: .. .:: :.:: : .: :. .: . ::: .:::
CCDS13 ENSRGPFPQQLVRIRSDKDNDIPIRYSITGVGADQPPMEVFSIDSMSGRMYVTRPMDREE
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250 260
pF1KB3 IAVYQLFVETTDVNGKTLEGPVPLEVIVIDQNDNRPIFREGPYIGHVMEGSPTGTTVMRM
: :.: ....:.::. .:.:. : . :::.::::: : . : : : ::: :: :: .
CCDS13 HASYHLRAHAVDMNGNKVENPIDLYIYVIDMNDNRPEFINQVYNGSVDEGSKPGTYVMTV
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
pF1KB3 TAFDADDPATDNALLRYNIRQQTPDKPSPNMFYIDPEKGDIVTVVSPALLDRETLENPKY
:: :::: .: :...:: : :::..:: ::: :. : ::::::. : :::: .. .:
CCDS13 TANDADDSTTANGMVRYRIVTQTPQSPSQNMFTINSETGDIVTVA--AGLDREKVQ--QY
300 310 320 330 340 350
330 340 350 360 370 380
pF1KB3 ELIIEAQDMAG-LDVGLTGTATATIMIDDKNDHSPKFTKKEFQATVEEGAV-GVIVNLTV
.:..: :: : :. ::..:::: : . : ::. :.:: . : . : :. : :..::::
CCDS13 TVIVQATDMEGNLNYGLSNTATAIITVTDVNDNPPEFTASTFAGEVPENRVETVVANLTV
360 370 380 390 400 410
390 400 410 420 430 440
pF1KB3 EDKDDPTTGAWRAAYTIINGNPGQSFEIHTNPQTNEGMLSVVKPLDYEISAFHTLLIKVE
:.:.: . : :.: ::.:.:. : ..:.: :::::..::: .:::.. : . :
CCDS13 MDRDQPHSPNWNAVYRIISGDPSGHFSVRTDPVTNEGMVTVVKAVDYELNRAFMLTVMVS
420 430 440 450 460 470
450 460 470 480 490 500
pF1KB3 NEDPLVPDVSYGPSSTATVHITVLDVNEGPVFYPDPMMVTRQEDLSVGSVLLTVNATDPD
:. ::. .... .::: : :...:.::.: : . .. .: . :.:: : .:.:::
CCDS13 NQAPLASGIQMSFQSTAGVTISIMDINEAPYFPSNHKLIRLEEGVPPGTVLTTFSAVDPD
480 490 500 510 520 530
510 520 530 540 550 560
pF1KB3 SLQHQTIRYSVYKDPAGWLNINPINGTVDTTAVLDRESPFVDNSVYTALFLAIDSGNPPA
...:..::: .:::.::.:: :: . :.::::::: .. :.:: : ::: :.: :::
CCDS13 RFMQQAVRYSKLSDPASWLHINATNGQITTAAVLDRESLYTKNNVYEATFLAADNGIPPA
540 550 560 570 580 590
570 580 590 600 610 620
pF1KB3 TGTGTLLITLEDVNDNAPFIYPTVAEVCDDAKNLSVVILGASDKDLHPNTDPFKFEI-HK
.::::: : : :.::::: . : :..:. ::... . :.: :. :: :. ::.
CCDS13 SGTGTLQIYLIDINDNAPELLPKEAQICEKP-NLNAINITAADADVDPNIGPYVFELPFV
600 610 620 630 640 650
630 640 650 660 670 680
pF1KB3 QAVPDKVWKISKINNTHALVSL-LQNLNKANYNLPIMVTDSGKPPMTNITDLRVQVCSCR
:. : : :...:. .: .:: . :. . :..::.:::::.::..: . ..:.:: :
CCDS13 PAAVRKNWTITRLNGDYAQLSLRILYLEAGMYDVPIIVTDSGNPPLSNTSIIKVKVCPCD
660 670 680 690 700 710
690 700 710
pF1KB3 NSKVDCNAAGALRFSLPSVLLLSLFSLACL
.. ::.. ::.
CCDS13 DNG-DCTTIGAVAAAGLGTGAIVAILICILILLTMVLLFVMWMKRREKERHTKQLLIDPE
720 730 740 750 760 770
>>CCDS10869.1 CDH1 gene_id:999|Hs108|chr16 (882 aa)
initn: 929 init1: 311 opt: 1229 Z-score: 1450.6 bits: 279.3 E(32554): 1.8e-74
Smith-Waterman score: 1407; 36.6% identity (64.9% similar) in 716 aa overlap (11-703:12-711)
10 20 30 40 50
pF1KB3 MQPRTPLVLCVLLSQVLLLTSAEDLDCTPGFQQKVFHINQPAEFIEDQSILN-LTFSDC
.:: :: : : :::. . . .. : . .: .:. ..: ::
CCDS10 MGPWSRSLSALLLLLQVSSWLCQEPEPCHPGFDAESYTFTVPRRHLERGRVLGRVNFEDC
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB3 KGNDKLRYEVSSPYFKVNSDGGLVALRNITAVGKTL--FVHARTPHAEDMAELVI---VG
: .. : . :::..:: ... : . . . .:.: . .. : ::
CCDS10 TGRQRTAYFSLDTRFKVGTDGVITVKRPLRFHNPQIHFLVYAWDSTYRKFSTKVTLNTVG
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160
pF1KB3 GK--------DIQGSLQDIFKFARTSP-VPRQKRSIVVSPILIPENQRQPFPRDVGKV-V
. ...: ... : .:: . ::::. :. :: :::.. :::... ..
CCDS10 HHHRPPPHQASVSGIQAELLTFPNSSPGLRRQKRDWVIPPISCPENEKGPFPKNLVQIKS
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB3 DSDRPERSKFRLTGKGVDQEPKGIFRINENTGSVSVTRTLDREVIAVYQLFVETTDVNGK
..:. . . .::.:.: : :.: :...:: ..::. :::: ::.: :: .... ::.
CCDS10 NKDKEGKVFYSITGQGADTPPVGVFIIERETGWLKVTEPLDRERIATYTLFSHAVSSNGN
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KB3 TLEGPVPLEVIVIDQNDNRPIFREGPYIGHVMEGSPTGTTVMRMTAFDADDPA-TDNALL
..: :. . . : :::::.: : . . : ::::. ::.::..:: :::: . : :: .
CCDS10 AVEDPMEILITVTDQNDNKPEFTQEVFKGSVMEGALPGTSVMEVTATDADDDVNTYNAAI
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KB3 RYNIRQQTPDKPSPNMFYIDPEKGDIVTVVSPALLDRETLENPKYELIIEAQDMAGLDVG
:.: .: :. :. ::: :. . : ...::. .: :::.. : : :...: :. : :
CCDS10 AYTILSQDPELPDKNMFTINRNTG-VISVVTTGL-DRESF--PTYTLVVQAADLQGE--G
310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB3 LTGTATATIMIDDKNDHSPKFTKKEFQATVEEGAVGVIVN-LTVEDKDDPTTGAWRAAYT
:. ::::.: . : ::. : :. ... : :. ..:... : : : : :.: ::.:.::
CCDS10 LSTTATAVITVTDTNDNPPIFNPTTYKGQVPENEANVVITTLKVTDADAPNTPAWEAVYT
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KB3 IINGNPGQSFEIHTNPQTNEGMLSVVKPLDYEISAFHTLLIKVENEDPLVPDVSYGPSST
:.: . :: : . ::: .:.:.:...: ::.: . . : . : : :. .:: .::
CCDS10 ILNDDGGQ-FVVTTNPVNNDGILKTAKGLDFEAKQQYILHVAVTNVVPF--EVSL-TTST
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KB3 ATVHITVLDVNEGPVFYPDPMMVTRQEDLSVGSVLLTVNATDPDSLQHQTIRYSVYKDPA
::: . ::::::.:.: : : .::..::. . . .: .::....: : : ...: :
CCDS10 ATVTVDVLDVNEAPIFVPPEKRVEVSEDFGVGQEITSYTAQEPDTFMEQKITYRIWRDTA
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KB3 GWLNINPINGTVDTTAVLDRES-PFVDNSVYTALFLAIDSGNPPATGTGTLLITLEDVND
.::.::: .:...: : ::::. : ::.::::..: :.:.: ::::::::. : ::::
CCDS10 NWLEINPDTGAISTRAELDREDFEHVKNSTYTALIIATDNGSPVATGTGTLLLILSDVND
540 550 560 570 580 590
590 600 610 620 630 640
pF1KB3 NAPFIYPTVAEVCDDAKNLSVVILGASDKDLHPNTDPFKFEIHKQAVPDKVWKISKINNT
:::. : . :. .: . ... : :: :::.:: :. . : . : :. . :
CCDS10 NAPIPEPRTIFFCE--RNPKPQVINIIDADLPPNTSPFTAELTHGASAN--WTIQYNDPT
600 610 620 630 640
650 660 670 680 690
pF1KB3 HALVSLLQN--LNKANYNLPIMVTDSGKPPMTNITDLRVQVCSCRNSKVDCNAAGALR--
. . : . :. ..:.. . . :. . ..: :.:.::.:... : : ..
CCDS10 QESIILKPKMALEVGDYKINLKLMDNQNKD--QVTTLEVSVCDCEGAAGVCRKAQPVEAG
650 660 670 680 690 700
700 710
pF1KB3 FSLPSVLLLSLFSLACL
...:..:
CCDS10 LQIPAILGILGGILALLILILLLLLFLRRRAVVKEPLLPPEDDTRDNVYYYDEEGGGEED
710 720 730 740 750 760
>>CCDS82004.1 CDH3 gene_id:1001|Hs108|chr16 (784 aa)
initn: 919 init1: 308 opt: 1210 Z-score: 1429.0 bits: 275.1 E(32554): 2.8e-73
Smith-Waterman score: 1341; 36.3% identity (62.7% similar) in 719 aa overlap (3-713:4-673)
10 20 30 40 50
pF1KB3 MQPRTPLVLCVLLSQVLLLTSAEDLDCTPGFQQKVFHINQPAEFIEDQSILNLTFSDCK
:: ::. .:: :: : : . : :.. .. . : . :. .: :
CCDS82 MGLPRGPLA-SLLLLQVCWLQCAASEPCRAVFREAEVTLEAGGAEQEPGQALGKVFMGCP
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB3 GNDKLRYEVSSPYFKVNSDGGLVALRNITAVGKTLFVHARTPHAEDMAELVIVGGKDIQG
:.. . ... : : :: .: . .. :.: : : .: :
CCDS82 GQEPALFSTDNDDFTV---------RNGETVQERRSLKERNP-------LKIFPSKRI--
60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB3 SLQDIFKFARTSPVPRQKRSIVVSPILIPENQRQPFPRDVGKV-VDSDRPERSKFRLTGK
. :.::. ::.:: .::: . :::. .... ..:: . . .::
CCDS82 -------------LRRHKRDWVVAPISVPENGKGPFPQRLNQLKSNKDRDTKIFYSITGP
110 120 130 140
180 190 200 210 220 230
pF1KB3 GVDQEPKGIFRINENTGSVSVTRTLDREVIAVYQLFVETTDVNGKTLEGPVPLEVIVIDQ
:.:. :.:.: ....:: . ... :::: :: :.:: .... :: ..: :. . .:: ::
CCDS82 GADSPPEGVFAVEKETGWLLLNKPLDREEIAKYELFGHAVSENGASVEDPMNISIIVTDQ
150 160 170 180 190 200
240 250 260 270 280 290
pF1KB3 NDNRPIFREGPYIGHVMEGSPTGTTVMRMTAFDADDPA-TDNALLRYNIRQQTPDKPSPN
::..: : . . : :.:: ::.::..:: : :: : :... :.:..: : :
CCDS82 NDHKPKFTQDTFRGSVLEGVLPGTSVMQVTATDEDDAIYTYNGVVAYSIHSQEPKDPHDL
210 220 230 240 250 260
300 310 320 330 340 350
pF1KB3 MFYIDPEKGDIVTVVSPALLDRETLENPKYELIIEAQDMAGLDVGLTGTATATIMIDDKN
:: : : : .:.: .: ::: . :.: : :.: :: : : : : ::.:.. : : :
CCDS82 MFTIHRSTGTI-SVISSGL-DREKV--PEYTLTIQATDMDG-D-GSTTTAVAVVEILDAN
270 280 290 300 310 320
360 370 380 390 400 410
pF1KB3 DHSPKFTKKEFQATVEEGAVGVIVN-LTVEDKDDPTTGAWRAAYTIINGNPGQSFEIHTN
:..: : ....: : :.::: :. ::: : : :.. ::::.: :..:. :. : : :.
CCDS82 DNAPMFDPQKYEAHVPENAVGHEVQRLTVTDLDAPNSPAWRATYLIMGGDDGDHFTITTH
330 340 350 360 370 380
420 430 440 450 460 470
pF1KB3 PQTNEGMLSVVKPLDYEISAFHTLLIKVENEDPLVPDVSYGPSSTATVHITVLDVNEGPV
:..:.:.:.. : ::.: . ::: ..: :: :.: . :.::::. . : ::::.::
CCDS82 PESNQGILTTRKGLDFEAKNQHTLYVEVTNEAPFVLKL---PTSTATIVVHVEDVNEAPV
390 400 410 420 430
480 490 500 510 520 530
pF1KB3 FYPDPMMVTRQEDLSVGSVLLTVNATDPDSLQHQTIRYSVYKDPAGWLNINPINGTVDTT
: : .: :: . .: . . .: :::. ..: : : . .:::::: ..: .: : ..
CCDS82 FVPPSKVVEVQEGIPTGEPVCVYTAEDPDK-ENQKISYRILRDPAGWLAMDPDSGQVTAV
440 450 460 470 480 490
540 550 560 570 580 590
pF1KB3 AVLDRESP-FVDNSVYTALFLAIDSGNPPATGTGTLLITLEDVNDNAPFIYPTVAEVCDD
..::::. :: :..: .. ::.:.:.::.:::::::.:: ::::..: : .:..
CCDS82 GTLDREDEQFVRNNIYEVMVLAMDNGSPPTTGTGTLLLTLIDVNDHGPVPEPRQITICNQ
500 510 520 530 540 550
600 610 620 630 640 650
pF1KB3 AKNLSVVILGASDKDLHPNTDPFKFEIHKQAVPDKVW--KISKINNTHALVSLLQNLNKA
. .: :. .:::: :.:.::. .. .. : : .... ..: ...:: . :..
CCDS82 SPVRQV--LNITDKDLSPHTSPFQAQLTDDS--DIYWTAEVNEEGDT-VVLSLKKFLKQD
560 570 580 590 600 610
660 670 680 690 700 710
pF1KB3 NYNLPIMVTDSGKPPMTNITDLRVQVCSCRNSKVDCNAAGALRFSLP--SVLLLSLFSLA
.:.. . ..: :. ..: .:. ::.:.. : . : :: ...: :: :
CCDS82 TYDVHLSLSDHGNKE--QLTVIRATVCDCHGHVETCPGPWKGGFILPVLGAVLALLFLLL
620 630 640 650 660 670
pF1KB3 CL
:
CCDS82 VLLLLVRKKRKIKEPLLLPEDDTRDNVFYYGEEGGGEEDQDYDITQLHRGLEARPEVVLR
680 690 700 710 720 730
>>CCDS10868.1 CDH3 gene_id:1001|Hs108|chr16 (829 aa)
initn: 919 init1: 308 opt: 1210 Z-score: 1428.6 bits: 275.1 E(32554): 3e-73
Smith-Waterman score: 1341; 36.3% identity (62.7% similar) in 719 aa overlap (3-713:4-673)
10 20 30 40 50
pF1KB3 MQPRTPLVLCVLLSQVLLLTSAEDLDCTPGFQQKVFHINQPAEFIEDQSILNLTFSDCK
:: ::. .:: :: : : . : :.. .. . : . :. .: :
CCDS10 MGLPRGPLA-SLLLLQVCWLQCAASEPCRAVFREAEVTLEAGGAEQEPGQALGKVFMGCP
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB3 GNDKLRYEVSSPYFKVNSDGGLVALRNITAVGKTLFVHARTPHAEDMAELVIVGGKDIQG
:.. . ... : : :: .: . .. :.: : : .: :
CCDS10 GQEPALFSTDNDDFTV---------RNGETVQERRSLKERNP-------LKIFPSKRI--
60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB3 SLQDIFKFARTSPVPRQKRSIVVSPILIPENQRQPFPRDVGKV-VDSDRPERSKFRLTGK
. :.::. ::.:: .::: . :::. .... ..:: . . .::
CCDS10 -------------LRRHKRDWVVAPISVPENGKGPFPQRLNQLKSNKDRDTKIFYSITGP
110 120 130 140
180 190 200 210 220 230
pF1KB3 GVDQEPKGIFRINENTGSVSVTRTLDREVIAVYQLFVETTDVNGKTLEGPVPLEVIVIDQ
:.:. :.:.: ....:: . ... :::: :: :.:: .... :: ..: :. . .:: ::
CCDS10 GADSPPEGVFAVEKETGWLLLNKPLDREEIAKYELFGHAVSENGASVEDPMNISIIVTDQ
150 160 170 180 190 200
240 250 260 270 280 290
pF1KB3 NDNRPIFREGPYIGHVMEGSPTGTTVMRMTAFDADDPA-TDNALLRYNIRQQTPDKPSPN
::..: : . . : :.:: ::.::..:: : :: : :... :.:..: : :
CCDS10 NDHKPKFTQDTFRGSVLEGVLPGTSVMQVTATDEDDAIYTYNGVVAYSIHSQEPKDPHDL
210 220 230 240 250 260
300 310 320 330 340 350
pF1KB3 MFYIDPEKGDIVTVVSPALLDRETLENPKYELIIEAQDMAGLDVGLTGTATATIMIDDKN
:: : : : .:.: .: ::: . :.: : :.: :: : : : : ::.:.. : : :
CCDS10 MFTIHRSTGTI-SVISSGL-DREKV--PEYTLTIQATDMDG-D-GSTTTAVAVVEILDAN
270 280 290 300 310 320
360 370 380 390 400 410
pF1KB3 DHSPKFTKKEFQATVEEGAVGVIVN-LTVEDKDDPTTGAWRAAYTIINGNPGQSFEIHTN
:..: : ....: : :.::: :. ::: : : :.. ::::.: :..:. :. : : :.
CCDS10 DNAPMFDPQKYEAHVPENAVGHEVQRLTVTDLDAPNSPAWRATYLIMGGDDGDHFTITTH
330 340 350 360 370 380
420 430 440 450 460 470
pF1KB3 PQTNEGMLSVVKPLDYEISAFHTLLIKVENEDPLVPDVSYGPSSTATVHITVLDVNEGPV
:..:.:.:.. : ::.: . ::: ..: :: :.: . :.::::. . : ::::.::
CCDS10 PESNQGILTTRKGLDFEAKNQHTLYVEVTNEAPFVLKL---PTSTATIVVHVEDVNEAPV
390 400 410 420 430
480 490 500 510 520 530
pF1KB3 FYPDPMMVTRQEDLSVGSVLLTVNATDPDSLQHQTIRYSVYKDPAGWLNINPINGTVDTT
: : .: :: . .: . . .: :::. ..: : : . .:::::: ..: .: : ..
CCDS10 FVPPSKVVEVQEGIPTGEPVCVYTAEDPDK-ENQKISYRILRDPAGWLAMDPDSGQVTAV
440 450 460 470 480 490
540 550 560 570 580 590
pF1KB3 AVLDRESP-FVDNSVYTALFLAIDSGNPPATGTGTLLITLEDVNDNAPFIYPTVAEVCDD
..::::. :: :..: .. ::.:.:.::.:::::::.:: ::::..: : .:..
CCDS10 GTLDREDEQFVRNNIYEVMVLAMDNGSPPTTGTGTLLLTLIDVNDHGPVPEPRQITICNQ
500 510 520 530 540 550
600 610 620 630 640 650
pF1KB3 AKNLSVVILGASDKDLHPNTDPFKFEIHKQAVPDKVW--KISKINNTHALVSLLQNLNKA
. .: :. .:::: :.:.::. .. .. : : .... ..: ...:: . :..
CCDS10 SPVRQV--LNITDKDLSPHTSPFQAQLTDDS--DIYWTAEVNEEGDT-VVLSLKKFLKQD
560 570 580 590 600 610
660 670 680 690 700 710
pF1KB3 NYNLPIMVTDSGKPPMTNITDLRVQVCSCRNSKVDCNAAGALRFSLP--SVLLLSLFSLA
.:.. . ..: :. ..: .:. ::.:.. : . : :: ...: :: :
CCDS10 TYDVHLSLSDHGNKE--QLTVIRATVCDCHGHVETCPGPWKGGFILPVLGAVLALLFLLL
620 630 640 650 660 670
pF1KB3 CL
:
CCDS10 VLLLLVRKKRKIKEPLLLPEDDTRDNVFYYGEEGGGEEDQDYDITQLHRGLEARPEVVLR
680 690 700 710 720 730
713 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 21:18:02 2016 done: Thu Nov 3 21:18:03 2016
Total Scan time: 2.740 Total Display time: 0.170
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]