FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB3975, 629 aa 1>>>pF1KB3975 629 - 629 aa - 629 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 14.2538+/-0.00107; mu= -21.2564+/- 0.064 mean_var=545.2076+/-114.086, 0's: 0 Z-trim(116.8): 333 B-trim: 0 in 0/53 Lambda= 0.054928 statistics sampled from 17038 (17426) to 17038 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.805), E-opt: 0.2 (0.535), width: 16 Scan time: 4.450 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS12543.1 DYRK1B gene_id:9149|Hs108|chr19 ( 629) 4331 357.9 2.3e-98 CCDS12544.1 DYRK1B gene_id:9149|Hs108|chr19 ( 601) 2596 220.4 5.4e-57 CCDS42925.1 DYRK1A gene_id:1859|Hs108|chr21 ( 763) 2538 215.9 1.6e-55 CCDS42926.1 DYRK1A gene_id:1859|Hs108|chr21 ( 584) 2519 214.3 3.6e-55 CCDS13653.1 DYRK1A gene_id:1859|Hs108|chr21 ( 754) 2497 212.7 1.5e-54 CCDS46075.1 DYRK1B gene_id:9149|Hs108|chr19 ( 589) 2489 212.0 1.9e-54 CCDS13654.1 DYRK1A gene_id:1859|Hs108|chr21 ( 529) 2455 209.2 1.1e-53 CCDS8979.1 DYRK2 gene_id:8445|Hs108|chr12 ( 528) 982 92.5 1.5e-18 CCDS8978.1 DYRK2 gene_id:8445|Hs108|chr12 ( 601) 982 92.5 1.7e-18 CCDS31000.1 DYRK3 gene_id:8444|Hs108|chr1 ( 568) 951 90.1 9e-18 CCDS30999.1 DYRK3 gene_id:8444|Hs108|chr1 ( 588) 951 90.1 9.2e-18 CCDS8530.1 DYRK4 gene_id:8798|Hs108|chr12 ( 520) 935 88.8 2e-17 CCDS868.1 HIPK1 gene_id:204851|Hs108|chr1 (1075) 752 74.5 8.3e-13 CCDS867.1 HIPK1 gene_id:204851|Hs108|chr1 (1210) 752 74.5 9.1e-13 CCDS75666.1 HIPK2 gene_id:28996|Hs108|chr7 (1171) 729 72.7 3.1e-12 CCDS75667.1 HIPK2 gene_id:28996|Hs108|chr7 (1198) 729 72.7 3.2e-12 CCDS41634.1 HIPK3 gene_id:10114|Hs108|chr11 (1194) 713 71.4 7.7e-12 CCDS7884.1 HIPK3 gene_id:10114|Hs108|chr11 (1215) 713 71.4 7.8e-12 >>CCDS12543.1 DYRK1B gene_id:9149|Hs108|chr19 (629 aa) initn: 4331 init1: 4331 opt: 4331 Z-score: 1879.5 bits: 357.9 E(32554): 2.3e-98 Smith-Waterman score: 4331; 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CCDS13 QPYYALQHSFFKKTADEGTNTS---NSVSTSPAMEQSQSSGTTSSTSSSSGGSSGTSNSG 460 470 480 490 500 510 490 500 510 520 530 pF1KB3 RTYR---YSNRYCGG---PGPPITDCEMNSPQVPPSQPLRP--WAGGDVPHKTHQAPASA :. ...:. :: . ::: .:::: . : : :.: ..: :. . . CCDS13 RARSDPTHQHRHSGGHFTAAVQAMDCETHSPQVRQQFPA-PLGWSGTEAPT---QVTVET 520 530 540 550 560 570 540 550 560 570 580 590 pF1KB3 SSLPGTGAQLPPQPRYLGRPPSPTSPPPPELMDVSLVGGPADCSPPHPAPAPQHPAASAL . : .. :: : CCDS13 HPVQETTFHVAPQQNALHHHHGNSSHHHHHHHHHHHHHGQQALGNRTRPRVYNSPTNSSS 580 590 600 610 620 630 >>CCDS46075.1 DYRK1B gene_id:9149|Hs108|chr19 (589 aa) initn: 2545 init1: 2467 opt: 2489 Z-score: 1091.0 bits: 212.0 E(32554): 1.9e-54 Smith-Waterman score: 3954; 93.6% identity (93.6% similar) in 629 aa overlap (1-629:1-589) 10 20 30 40 50 60 pF1KB3 MAVPPGHGPFSGFPGPQEHTQVLPDVRLLPRRLPLAFRDATSAPLRKLSVDLIKTYKHIN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 MAVPPGHGPFSGFPGPQEHTQVLPDVRLLPRRLPLAFRDATSAPLRKLSVDLIKTYKHIN 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB3 EVYYAKKKRRAQQAPPQDSSNKKEKKVLNHGYDDDNHDYIVRSGERWLERYEIDSLIGKG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 EVYYAKKKRRAQQAPPQDSSNKKEKKVLNHGYDDDNHDYIVRSGERWLERYEIDSLIGKG 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB3 SFGQVVKAYDHQTQELVAIKIIKNKKAFLNQAQIELRLLELMNQHDTEMKYYIVHLKRHF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 SFGQVVKAYDHQTQELVAIKIIKNKKAFLNQAQIELRLLELMNQHDTEMKYYIVHLKRHF 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KB3 MFRNHLCLVFELLSYNLYDLLRNTHFRGVSLNLTRKLAQQLCTALLFLATPELSIIHCDL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 MFRNHLCLVFELLSYNLYDLLRNTHFRGVSLNLTRKLAQQLCTALLFLATPELSIIHCDL 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KB3 KPENILLCNPKRSAIKIVDFGSSCQLGQRIYQYIQSRFYRSPEVLLGTPYDLAIDMWSLG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 KPENILLCNPKRSAIKIVDFGSSCQLGQRIYQYIQSRFYRSPEVLLGTPYDLAIDMWSLG 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KB3 CILVEMHTGEPLFSGSNEVDQMNRIVEVLGIPPAAMLDQAPKARKYFERLPGGGWTLRRT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 CILVEMHTGEPLFSGSNEVDQMNRIVEVLGIPPAAMLDQAPKARKYFERLPGGGWTLRRT 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KB3 KELRKDYQGPGTRRLQEVLGVQTGGPGGRRAGEPGHSPADYLRFQDLVLRMLEYEPAARI :::::: :::::::::::::: CCDS46 KELRKD----------------------------------------LVLRMLEYEPAARI 370 380 430 440 450 460 470 480 pF1KB3 SPLGALQHGFFRRTADEATNTGPAGSSASTSPAPLDTCPSSSTASSISSSGGSSGSSSDN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 SPLGALQHGFFRRTADEATNTGPAGSSASTSPAPLDTCPSSSTASSISSSGGSSGSSSDN 390 400 410 420 430 440 490 500 510 520 530 540 pF1KB3 RTYRYSNRYCGGPGPPITDCEMNSPQVPPSQPLRPWAGGDVPHKTHQAPASASSLPGTGA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 RTYRYSNRYCGGPGPPITDCEMNSPQVPPSQPLRPWAGGDVPHKTHQAPASASSLPGTGA 450 460 470 480 490 500 550 560 570 580 590 600 pF1KB3 QLPPQPRYLGRPPSPTSPPPPELMDVSLVGGPADCSPPHPAPAPQHPAASALRTRMTGGR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 QLPPQPRYLGRPPSPTSPPPPELMDVSLVGGPADCSPPHPAPAPQHPAASALRTRMTGGR 510 520 530 540 550 560 610 620 pF1KB3 PPLPPPDDPATLGPHLGLRGVPQSTAASS ::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 PPLPPPDDPATLGPHLGLRGVPQSTAASS 570 580 >>CCDS13654.1 DYRK1A gene_id:1859|Hs108|chr21 (529 aa) initn: 2541 init1: 2415 opt: 2455 Z-score: 1077.1 bits: 209.2 E(32554): 1.1e-53 Smith-Waterman score: 2455; 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CCDS13 SGASAISCSSWLVRH 520 >>CCDS8979.1 DYRK2 gene_id:8445|Hs108|chr12 (528 aa) initn: 1041 init1: 476 opt: 982 Z-score: 446.3 bits: 92.5 E(32554): 1.5e-18 Smith-Waterman score: 991; 39.3% identity (66.0% similar) in 456 aa overlap (34-482:80-505) 10 20 30 40 50 60 pF1KB3 PPGHGPFSGFPGPQEHTQVLPDVRLLPRRLPLAFRDATSAPLRKLSV---DLIKTYKHIN :.. ..: . ..::.. : .: .: CCDS89 PERQLDSIHRRQGSSTSLKSMEGMGKVKATPMTPEQAMKQYMQKLTAFEHHEIFSYPEIY 50 60 70 80 90 100 70 80 90 100 110 120 pF1KB3 EVYYAKKKRRAQQAPPQDSSNKKEKKVLNHGYDDDNHDYIVRSGERWLERYEIDSLIGKG . :::... . :. : :::::. .:. .. :::. ..:::: CCDS89 FLGLNAKKRQGMTGGPN-----------NGGYDDDQGSYVQVPHDHVAYRYEVLKVIGKG 110 120 130 140 150 130 140 150 160 170 180 pF1KB3 SFGQVVKAYDHQTQELVAIKIIKNKKAFLNQAQIELRLLELMNQHDTEMKYYIVHLKRHF :::::::::::.... ::.:...:.: : :: :.:.:: . ..: . . ..:. ..: CCDS89 SFGQVVKAYDHKVHQHVALKMVRNEKRFHRQAAEEIRILEHLRKQDKDNTMNVIHMLENF 160 170 180 190 200 210 190 200 210 220 230 240 pF1KB3 MFRNHLCLVFELLSYNLYDLLRNTHFRGVSLNLTRKLAQQLCTALLFLATPELSIIHCDL ::::.:..:::::.:::.:.....:.: :: :.::.:... : : . :::::: CCDS89 TFRNHICMTFELLSMNLYELIKKNKFQGFSLPLVRKFAHSILQCL--DALHKNRIIHCDL 220 230 240 250 260 270 250 260 270 280 290 300 pF1KB3 KPENILLCNPKRSAIKIVDFGSSCQLGQRIYQYIQSRFYRSPEVLLGTPYDLAIDMWSLG ::::::: . ::.::..:::::: ::.: ::::::::.:::.::. : . ::::::: CCDS89 KPENILLKQQGRSGIKVIDFGSSCYEHQRVYTYIQSRFYRAPEVILGARYGMPIDMWSLG 280 290 300 310 320 330 310 320 330 340 350 360 pF1KB3 CILVEMHTGEPLFSGSNEVDQMNRIVEVLGIPPAAMLDQAPKARKYFERLPGGGWTLRRT :::.:. :: ::. : .: ::. ..:.::.: .:: . .:... . . :. : CCDS89 CILAELLTGYPLLPGEDEGDQLACMIELLGMPSQKLLDASKRAKNF---VSSKGYPRYCT 340 350 360 370 380 390 370 380 390 400 410 pF1KB3 KELRKD----YQGPGTRRLQEVLGVQTGGPGGRRAGEPGHSPADYLRFQDLVLRMLEYEP .: .: .:: : : : .:. :. .. : : : :.. . ::..: CCDS89 VTTLSDGSVVLNGGRSRR-----GKLRGPPESREWGNALKGCDDPL-FLDFLKQCLEWDP 400 410 420 430 440 420 430 440 450 460 470 pF1KB3 AARISPLGALQHGFFRRTADEATNTGPAGSSASTSPAPLDTCPSSSTASSISSSGGSSGS :.:..: ::.: ..:: . :.: ..:.. :... .:::. :.: CCDS89 AVRMTPGQALRHPWLRRRLPKP----PTGEKTSVK----RITESTGAITSISKLPPPSSS 450 460 470 480 490 480 490 500 510 520 530 pF1KB3 SSDNRTYRYSNRYCGGPGPPITDCEMNSPQVPPSQPLRPWAGGDVPHKTHQAPASASSLP .: :: CCDS89 ASKLRTNLAQMTDANGNIQQRTVLPKLVS 500 510 520 >>CCDS8978.1 DYRK2 gene_id:8445|Hs108|chr12 (601 aa) initn: 1014 init1: 476 opt: 982 Z-score: 445.5 bits: 92.5 E(32554): 1.7e-18 Smith-Waterman score: 991; 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