Result of FASTA (ccds) for
pF1KB4009
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4009, 797 aa
1>>>pF1KB4009 797 - 797 aa - 797 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5919+/-0.00101; mu= 18.5899+/- 0.061
mean_var=69.8000+/-13.862, 0's: 0 Z-trim(103.5): 193 B-trim: 4 in 1/50
Lambda= 0.153514
statistics sampled from 7256 (7455) to 7256 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.583), E-opt: 0.2 (0.229), width: 16
Scan time: 3.940
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4253.1 PCDHB11 gene_id:56125|Hs108|chr5 ( 797) 5124 1144.7 0
CCDS4254.1 PCDHB12 gene_id:56124|Hs108|chr5 ( 795) 4562 1020.2 0
CCDS4256.1 PCDHB14 gene_id:56122|Hs108|chr5 ( 798) 4013 898.6 0
CCDS4245.1 PCDHB3 gene_id:56132|Hs108|chr5 ( 796) 3904 874.5 0
CCDS4244.1 PCDHB2 gene_id:56133|Hs108|chr5 ( 798) 3885 870.3 0
CCDS4251.1 PCDHB16 gene_id:57717|Hs108|chr5 ( 776) 3860 864.7 0
CCDS4250.1 PCDHB8 gene_id:56128|Hs108|chr5 ( 801) 3853 863.2 0
CCDS4247.1 PCDHB5 gene_id:26167|Hs108|chr5 ( 795) 3842 860.7 0
CCDS4246.1 PCDHB4 gene_id:56131|Hs108|chr5 ( 795) 3834 859.0 0
CCDS4257.1 PCDHB15 gene_id:56121|Hs108|chr5 ( 787) 3805 852.5 0
CCDS4255.1 PCDHB13 gene_id:56123|Hs108|chr5 ( 798) 3786 848.3 0
CCDS75328.1 PCDHB9 gene_id:56127|Hs108|chr5 ( 797) 3764 843.5 0
CCDS4249.1 PCDHB7 gene_id:56129|Hs108|chr5 ( 793) 3759 842.4 0
CCDS4252.1 PCDHB10 gene_id:56126|Hs108|chr5 ( 800) 3754 841.3 0
CCDS4248.1 PCDHB6 gene_id:56130|Hs108|chr5 ( 794) 3711 831.7 0
CCDS78067.1 PCDHB6 gene_id:56130|Hs108|chr5 ( 658) 3221 723.2 3.4e-208
CCDS4243.1 PCDHB1 gene_id:29930|Hs108|chr5 ( 818) 2563 577.5 3.1e-164
CCDS54922.1 PCDHGA1 gene_id:56114|Hs108|chr5 ( 931) 2137 483.2 8.6e-136
CCDS75336.1 PCDHGA7 gene_id:56108|Hs108|chr5 ( 817) 2128 481.1 3.1e-135
CCDS75343.1 PCDHGA10 gene_id:56106|Hs108|chr5 ( 850) 2128 481.2 3.2e-135
CCDS54927.1 PCDHGA7 gene_id:56108|Hs108|chr5 ( 932) 2128 481.2 3.4e-135
CCDS47292.1 PCDHGA10 gene_id:56106|Hs108|chr5 ( 936) 2128 481.2 3.5e-135
CCDS75345.1 PCDHGA11 gene_id:56105|Hs108|chr5 ( 837) 2121 479.6 9.2e-135
CCDS47294.1 PCDHGA11 gene_id:56105|Hs108|chr5 ( 935) 2121 479.6 1e-134
CCDS75333.1 PCDHGA5 gene_id:56110|Hs108|chr5 ( 813) 2120 479.4 1e-134
CCDS54925.1 PCDHGA5 gene_id:56110|Hs108|chr5 ( 931) 2120 479.4 1.2e-134
CCDS75331.1 PCDHGA4 gene_id:56111|Hs108|chr5 ( 851) 2100 475.0 2.3e-133
CCDS58979.2 PCDHGA4 gene_id:56111|Hs108|chr5 ( 962) 2100 475.0 2.6e-133
CCDS75332.1 PCDHGB2 gene_id:56103|Hs108|chr5 ( 811) 2099 474.7 2.6e-133
CCDS54924.1 PCDHGB2 gene_id:56103|Hs108|chr5 ( 931) 2099 474.7 2.9e-133
CCDS75340.1 PCDHGB5 gene_id:56101|Hs108|chr5 ( 818) 2072 468.7 1.7e-131
CCDS75339.1 PCDHGB5 gene_id:56101|Hs108|chr5 ( 923) 2072 468.8 1.8e-131
CCDS75346.1 PCDHGA12 gene_id:26025|Hs108|chr5 ( 820) 2071 468.5 1.9e-131
CCDS4260.1 PCDHGA12 gene_id:26025|Hs108|chr5 ( 932) 2071 468.5 2.2e-131
CCDS75341.1 PCDHGA9 gene_id:56107|Hs108|chr5 ( 828) 2068 467.9 3.1e-131
CCDS58981.1 PCDHGA9 gene_id:56107|Hs108|chr5 ( 932) 2068 467.9 3.4e-131
CCDS75342.1 PCDHGB6 gene_id:56100|Hs108|chr5 ( 820) 2063 466.8 6.6e-131
CCDS54929.1 PCDHGB6 gene_id:56100|Hs108|chr5 ( 930) 2063 466.8 7.4e-131
CCDS47289.1 PCDHGA2 gene_id:56113|Hs108|chr5 ( 932) 2063 466.8 7.4e-131
CCDS75344.1 PCDHGB7 gene_id:56099|Hs108|chr5 ( 808) 2055 465.0 2.2e-130
CCDS47293.1 PCDHGB7 gene_id:56099|Hs108|chr5 ( 929) 2055 465.0 2.5e-130
CCDS75335.1 PCDHGA6 gene_id:56109|Hs108|chr5 ( 818) 2046 463.0 9e-130
CCDS54926.1 PCDHGA6 gene_id:56109|Hs108|chr5 ( 932) 2046 463.0 1e-129
CCDS75329.1 PCDHGA3 gene_id:56112|Hs108|chr5 ( 829) 2039 461.4 2.7e-129
CCDS47290.1 PCDHGA3 gene_id:56112|Hs108|chr5 ( 932) 2039 461.5 3e-129
CCDS75337.1 PCDHGB4 gene_id:8641|Hs108|chr5 ( 803) 2025 458.3 2.2e-128
CCDS54928.1 PCDHGB4 gene_id:8641|Hs108|chr5 ( 923) 2025 458.4 2.5e-128
CCDS75338.1 PCDHGA8 gene_id:9708|Hs108|chr5 ( 820) 2017 456.6 7.7e-128
CCDS47291.1 PCDHGA8 gene_id:9708|Hs108|chr5 ( 932) 2017 456.6 8.6e-128
CCDS75334.1 PCDHGB3 gene_id:56102|Hs108|chr5 ( 814) 1992 451.0 3.6e-126
>>CCDS4253.1 PCDHB11 gene_id:56125|Hs108|chr5 (797 aa)
initn: 5124 init1: 5124 opt: 5124 Z-score: 6127.6 bits: 1144.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5124; 99.9% identity (100.0% similar) in 797 aa overlap (1-797:1-797)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MENQGTRTQQIRQVLLLFVLLGMSQAGSETWSFSVAEEMQSGSFVGNLAKDLGLKVRELS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MENQGTRTQQIRQVLLLFVLLGMSQAGSETWSFSVAEEMQSGSFVGNLAKDLGLKVRELS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 SRGARVVSNDKKQRLQLDINTGDLLLSETLDREELCGSIEPCVLHLQVLMQNPTQFLQIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 SRGARVVSNDKKQRLQLDINTGDLLLSETLDREELCGSIEPCVLHLQVLMQNPTQFLQIE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 LQVRDINDHSPIFSEKQMLLEIPENSPVGAVFLLESAKDLDVGINAVKSYTISPNSHFHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LQVRDINDHSPIFSEKQMLLEIPENSPVGAVFLLESAKDLDVGINAVKSYTISPNSHFHI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 KMRVIPDNRKYPELVLDKALDYEELPELSFILSALDGGSPPRSGTALVRVVVVDINDNSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 KMRVIPDNRKYPELVLDKALDYEELPELSFILSALDGGSPPRSGTALVRVVVVDINDNSP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 EFEQAFYEVKIRENSILGSLILIVSAWDLDSGTNGEICYTFSHASEDIRKTFEINQKSGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 EFEQAFYEVKIRENSILGSLILIVSAWDLDSGTNGEICYTFSHASEDIRKTFEINQKSGE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 ITLRAPLDFETIESYSIIIQATDGGGLFGKSTVIIHVIDVNDNAPEITVSSITSPIPENT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 ITLRAPLDFETIESYSIIIQATDGGGLFGKSTVIIHVIDVNDNAPEITVSSITSPIPENT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 PETVVMVFSIQDIDSGDNGRIVCSIPEDLPFVLKSSVENYHTLETERPLDRESTAEYNIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::
CCDS42 PETVVMVFSIQDIDSGDNGRIVCSIPEDLPFVLKSSVENYYTLETERPLDRESTAEYNIT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 ITVTDLGIPRLKTEHNTTVLVSDVNDNAPTFTQTSYTLFVRENNSPALHIGSVSATDRDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 ITVTDLGIPRLKTEHNTTVLVSDVNDNAPTFTQTSYTLFVRENNSPALHIGSVSATDRDS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 GTNAQVNYSLLPPQDLHLPLASLVSINTDNGHLFALRSLDYEALQAFDFRVGATDRGSPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 GTNAQVNYSLLPPQDLHLPLASLVSINTDNGHLFALRSLDYEALQAFDFRVGATDRGSPA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 LSSEALVRVLVLDANDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPRAAEPGYLVTKVVAVDGDSGQNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LSSEALVRVLVLDANDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPRAAEPGYLVTKVVAVDGDSGQNA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 WLSYQLLKATEPGLFGVWAHNGEVRTARLLSERDAAKHRLVVLVKDNGEPPRSATATLQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 WLSYQLLKATEPGLFGVWAHNGEVRTARLLSERDAAKHRLVVLVKDNGEPPRSATATLQV
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB4 LLVDGFSQPYLPLPEAAPAQAQADSLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVAVRLCRRSRAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LLVDGFSQPYLPLPEAAPAQAQADSLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVAVRLCRRSRAA
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB4 SVGSCSVPKGPFPGHLVDVSGTGTLSQSYQYEVCLTGGSETNEFKFLKPVIPNIQAKGLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 SVGSCSVPKGPFPGHLVDVSGTGTLSQSYQYEVCLTGGSETNEFKFLKPVIPNIQAKGLG
730 740 750 760 770 780
790
pF1KB4 KNSEENSTFRNSFGFNF
:::::::::::::::::
CCDS42 KNSEENSTFRNSFGFNF
790
>>CCDS4254.1 PCDHB12 gene_id:56124|Hs108|chr5 (795 aa)
initn: 4562 init1: 4562 opt: 4562 Z-score: 5455.0 bits: 1020.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4562; 88.7% identity (95.3% similar) in 795 aa overlap (1-795:1-795)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MENQGTRTQQIRQVLLLFVLLGMSQAGSETWSFSVAEEMQSGSFVGNLAKDLGLKVRELS
::: :. : :::::::.::::::::::::: .: : ::.::::::::::: :::.: :::
CCDS42 MENGGAGTLQIRQVLLFFVLLGMSQAGSETGNFLVMEELQSGSFVGNLAKTLGLEVSELS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 SRGARVVSNDKKQRLQLDINTGDLLLSETLDREELCGSIEPCVLHLQVLMQNPTQFLQIE
::::::::::.:. :::: ::::::: : ::::::::: :::::..::::.:::::::::
CCDS42 SRGARVVSNDNKECLQLDTNTGDLLLREMLDREELCGSNEPCVLYFQVLMKNPTQFLQIE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 LQVRDINDHSPIFSEKQMLLEIPENSPVGAVFLLESAKDLDVGINAVKSYTISPNSHFHI
:::::::::::.: ::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::.
CCDS42 LQVRDINDHSPVFLEKEMLLEIPENSPVGAVFLLESAKDLDVGINAVKSYTINPNSHFHV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 KMRVIPDNRKYPELVLDKALDYEELPELSFILSALDGGSPPRSGTALVRVVVVDINDNSP
:.:: ::::::::::::::::::: :::::::.:::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 KIRVNPDNRKYPELVLDKALDYEERPELSFILTALDGGSPPRSGTALVRVVVVDINDNSP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 EFEQAFYEVKIRENSILGSLILIVSAWDLDSGTNGEICYTFSHASEDIRKTFEINQKSGE
::::::::::: ::::::::.. :::::::::::.:. :::::::::::::::::::::.
CCDS42 EFEQAFYEVKILENSILGSLVVTVSAWDLDSGTNSELSYTFSHASEDIRKTFEINQKSGD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 ITLRAPLDFETIESYSIIIQATDGGGLFGKSTVIIHVIDVNDNAPEITVSSITSPIPENT
::: ::::::.:::::::::::::::::::::: :.:.::::::::::::::::::::::
CCDS42 ITLTAPLDFEAIESYSIIIQATDGGGLFGKSTVRIQVMDVNDNAPEITVSSITSPIPENT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 PETVVMVFSIQDIDSGDNGRIVCSIPEDLPFVLKSSVENYHTLETERPLDRESTAEYNIT
:::::::: :.: ::::::..:::::::.::::::::.::.:::::::::::: ::::::
CCDS42 PETVVMVFRIRDRDSGDNGKMVCSIPEDIPFVLKSSVNNYYTLETERPLDRESRAEYNIT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 ITVTDLGIPRLKTEHNTTVLVSDVNDNAPTFTQTSYTLFVRENNSPALHIGSVSATDRDS
::::::: :::::::: ::::::::::::.::::::.:::::::::::::::.:::::::
CCDS42 ITVTDLGTPRLKTEHNITVLVSDVNDNAPAFTQTSYALFVRENNSPALHIGSISATDRDS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 GTNAQVNYSLLPPQDLHLPLASLVSINTDNGHLFALRSLDYEALQAFDFRVGATDRGSPA
:::::::::::: :: :::::::::::.:::::::::::::::::.:.:::::::.::::
CCDS42 GTNAQVNYSLLPSQDPHLPLASLVSINADNGHLFALRSLDYEALQGFQFRVGATDHGSPA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 LSSEALVRVLVLDANDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPRAAEPGYLVTKVVAVDGDSGQNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::
CCDS42 LSSEALVRVLVLDANDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPWAAEPGYLVTKVVAVDGDSGQNA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 WLSYQLLKATEPGLFGVWAHNGEVRTARLLSERDAAKHRLVVLVKDNGEPPRSATATLQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:
CCDS42 WLSYQLLKATEPGLFGVWAHNGEVRTARLLSERDAAKHRLVVLVKDNGEPPRSATATLHV
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB4 LLVDGFSQPYLPLPEAAPAQAQADSLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVAVRLCRRSRAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LLVDGFSQPYLPLPEAAPAQAQADSLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVAVRLCRRSRAA
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB4 SVGSCSVPKGPFPGHLVDVSGTGTLSQSYQYEVCLTGGSETNEFKFLKPVIPNIQAKGLG
:: ::::.::::::::::::::::::::.::::.::::..:.::::::.:::. .. :
CCDS42 PVGRCSVPEGPFPGHLVDVSGTGTLSQSYHYEVCVTGGSRSNKFKFLKPIIPNFLPQSTG
730 740 750 760 770 780
790
pF1KB4 KNSEENSTFRNSFGFNF
.. ::: :.:..::
CCDS42 SEVEENPPFQNNLGF
790
>>CCDS4256.1 PCDHB14 gene_id:56122|Hs108|chr5 (798 aa)
initn: 4228 init1: 4013 opt: 4013 Z-score: 4797.8 bits: 898.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4013; 77.0% identity (90.5% similar) in 796 aa overlap (1-796:1-796)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MENQGTRTQQIRQVLLLFVLLGMSQAGSETWSFSVAEEMQSGSFVGNLAKDLGLKVRELS
:: .:. . ::::...::::.:.::.:. .::::: . ::::.:::.:::: :.:::
CCDS42 MEIRGALDLRKRQVLIFLVLLGLSRAGTESAHYSVAEETEIGSFVANLARDLGLGVEELS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 SRGARVVSNDKKQRLQLDINTGDLLLSETLDREELCGSIEPCVLHLQVLMQNPTQFLQIE
:: :::::.:.:. :.::. ::.:::.: :::.::::: ::::::.::...:: ::...:
CCDS42 SREARVVSDDNKKYLHLDLLTGNLLLNEKLDRDELCGSTEPCVLHFQVVLENPLQFFRFE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 LQVRDINDHSPIFSEKQMLLEIPENSPVGAVFLLESAKDLDVGINAVKSYTISPNSHFHI
: :.::::::: : .:..:..: :.. :::.::.:::.::::: :....:::::::::.:
CCDS42 LCVKDINDHSPTFLDKEILIKISEGTTVGATFLMESAQDLDVGSNSLQNYTISPNSHFYI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 KMRVIPDNRKYPELVLDKALDYEELPELSFILSALDGGSPPRSGTALVRVVVVDINDNSP
:. : . :::::::.:::::. :: . :.:.::::::.:::.:: . :.:::::.:
CCDS42 KIPDSSDRKIYPELVLDRALDYEQEAELRLTLTAVDGGSPPKSGTTLVLIKVLDINDNAP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 EFEQAFYEVKIRENSILGSLILIVSAWDLDSGTNGEICYTFSHASEDIRKTFEINQKSGE
:: :..:::.. :. ::: : .:: :::.:. :.: ::: ::::::::::::: :::
CCDS42 EFPQSLYEVQVPEDRPLGSWIATISAKDLDAGNYGKISYTFFHASEDIRKTFEINPISGE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 ITLRAPLDFETIESYSIIIQATDGGGLFGKSTVIIHVIDVNDNAPEITVSSITSPIPENT
..::.:::::.:.::.: ::::::::: :: :....:.:.::: ::.:.::::. ::::.
CCDS42 VNLRSPLDFEVIQSYTINIQATDGGGLSGKCTLLVKVMDINDNPPEVTISSITKRIPENA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
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::.: .::: : :::::::..::: ..::: :: . .:. :: .:. ::::: ::::::
CCDS42 SETLVALFSILDQDSGDNGRMICSIQDNLPFFLKPTFKNFFTLVSEKALDRESQAEYNIT
370 380 390 400 410 420
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::::::: ::::::.: :::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 ITVTDLGTPRLKTEYNITVLLSDVNDNAPTFTQTSYTLFVRENNSPALHIGSVSATDRDS
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::::::::::::::: :::::::::::.::::::::::::::::: :.::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LSSEALVRVLVLDANDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPRAAEPGYLVTKVVAVDGDSGQNA
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CCDS42 LLVDGFSQPYLPLPEAAPAQAQADSLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVAVRLCRRSRAA
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CCDS42 SVGRCSVPEGPFPGHLVDVSGTGTLSQSYQYEVCLTGGSGTNEFKFLKPIIPNFQVHDTG
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CCDS42 RNMGEIENFRNSFGLNIQ
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.:::.:::. .::..::. .::::::.: :::::::: :::.::.:.:.::: ::. :
CCDS42 ARGAQVVSKGNKQHFQLSHQTGDLLLNEKLDREELCGPTEPCILHFQILLQNPLQFVTNE
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:.. :.:::::.: :..: :.: :.. :.:. : .:.::::: :....:::.::::::.
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:: : .::: . ::. ..:.:. ::: :::.:. : : :.: ::::.:::::..: .:.
CCDS42 EFAQPLYEVAVLENTPVNSVIVTVSASDLDTGSFGTISYAFFHASEEIRKTFQLNPITGD
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. : :.::.:.:: . :.: ::::: ::::::..:.::::: ::.:.::..::::::.
CCDS42 MQLVKYLNFEAINSYEVDIEAKDGGGLSGKSTVIVQVVDVNDNPPELTLSSVNSPIPENS
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:::. :::..:.:::::::..::: ..::: :: ::::..:: .: ::::. .:::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LSSEALVRVLVLDANDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPRAAEPGYLVTKVVAVDGDSGQNA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:
CCDS42 WLSYQLLKATEPGLFGVWAHNGEVRTARLLSERDAAKHRLVVLVKDNGEPPRSATATLHV
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:::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LLVDGFSQPYLPLPEAAPAQAQADLLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVAVRLCRRSRAA
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pF1KB4 SVGSCSVPKGPFPGHLVDVSGTGTLSQSYQYEVCLTGGSETNEFKFLKPVIPNIQAKGLG
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CCDS42 SVGRCSVPEGPFPGQMVDVSGTGTLSQSYQYEVCLTGGSGTNEFKFLKPIIPNFVAQGAE
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CCDS42 RVSEANPSFRKSFEFS
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CCDS42 LAVRGARVVSKGKKMHLQFDRQTGDLLLNEKLDREELCGPTEPCVLPFQVLLENPLQFFQ
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pF1KB4 IELQVRDINDHSPIFSEKQMLLEIPENSPVGAVFLLESAKDLDVGINAVKSYTISPNSHF
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CCDS42 AELRIRDVNDHSPVFLDKEILLKIPESITPGTTFLIERAQDLDVGTNSLQNYTISPNFHF
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CCDS42 VPEFAKLLYEVQIPEDSPVGSQVAIVSARDLDIGTNGEISYAFSQASEDIRKTFRLSAKS
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::. :: ::::.:..:.. ::::::::: : .:...:.:.::: ::.:.:.. . :::
CCDS42 GELLLRQKLDFESIQTYTVNIQATDGGGLSGTCVVFVQVMDLNDNPPELTMSTLINQIPE
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: .:.. :::..: :::::::.:::: .:::: :: ::::..:: ::::. .:::
CCDS42 NLQDTLIAVFSVSDPDSGDNGRMVCSIQDDLPFFLKPSVENFYTLVISTALDRETRSEYN
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:::::::.: :::::::: ::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KB4 DSGTNAQVNYSLLPPQDLHLPLASLVSINTDNGHLFALRSLDYEALQAFDFRVGATDRGS
::::::::.:::::::: :::::::::::.::::::::.::::::::::.:::::.::::
CCDS42 DSGTNAQVTYSLLPPQDPHLPLASLVSINADNGHLFALQSLDYEALQAFEFRVGAADRGS
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pF1KB4 PALSSEALVRVLVLDANDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPRAAEPGYLVTKVVAVDGDSGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 PALSSEALVRVLVLDANDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPRAAEPGYLVTKVVAVDGDSGQ
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:::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::.::::::::::::::::::::
CCDS42 NAWLSYQLLKATEPGLFGVWAHNGEVRTARLLRERDAAKQRLVVLVKDNGEPPRSATATL
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pF1KB4 QVLLVDGFSQPYLPLPEAAPAQAQADSLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVAVRLCRRSR
.:::::::::::: :::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 HVLLVDGFSQPYLLLPEAAPAQAQADLLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVAVRLCRRSR
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pF1KB4 AASVGSCSVPKGPFPGHLVDVSGTGTLSQSYQYEVCLTGGSETNEFKFLKPVIPNIQAKG
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CCDS42 AASVGRCSVPEGPFPGQMVDVSGTGTLSQSYQYEVCLTGGSGTNEFKFLKPIIPNFVAQG
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pF1KB4 LGKNSEENSTFRNSFGFNF
. :: : .::.:: :
CCDS42 AERVSEANPSFRKSFEFT
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CCDS42 MEIGWMHNRRQRQVLVFFVLLSLSGAGAELGSYSVVEETERGSFVANLGKDLGLGLTEMS
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CCDS42 TRKARIISQGNKQHLQLKAQTGDLLINEKLDREELCGPTEPCILHFQVLMENPLEIFQAE
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pF1KB4 LQVRDINDHSPIFSEKQMLLEIPENSPVGAVFLLESAKDLDVGINAVKSYTISPNSHFHI
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CCDS42 LRVIDINDHSPMFTEKEMILKIPENSPLGTEFPLNHALDLDVGSNNVQNYKISPSSHFRV
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pF1KB4 KMRVIPDNRKYPELVLDKALDYEELPELSFILSALDGGSPPRSGTALVRVVVVDINDNSP
.. . :.:::::::::: :: :: :.: . :.::::::::::::: ::. :::::::.:
CCDS42 LIHEFRDGRKYPELVLDKELDREEEPQLRLTLTALDGGSPPRSGTAQVRIEVVDINDNAP
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:::: .:.:.: ::: ::::. ::: :::.:.::.: ::. . :::: ::.:.: .::
CCDS42 EFEQPIYKVQIPENSPLGSLVATVSARDLDGGANGKISYTLFQPSEDISKTLEVNPMTGE
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pF1KB4 ITLRAPLDFETIESYSIIIQATDGGGLFGKSTVIIHVIDVNDNAPEITVSSITSPIPENT
. :: .::: . :: . :.::::::: :: :....:.::::: :..:.:..:::::::.
CCDS42 VRLRKQVDFEMVTSYEVRIKATDGGGLSGKCTLLLQVVDVNDNPPQVTMSALTSPIPENS
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pF1KB4 PETVVMVFSIQDIDSGDNGRIVCSIPEDLPFVLKSSVENYHTLETERPLDRESTAEYNIT
:: :: :::..: :::.::. . :: :::::.:: ::.:..:: ::: ::::. ::::::
CCDS42 PEIVVAVFSVSDPDSGNNGKTISSIQEDLPFLLKPSVKNFYTLVTERALDREARAEYNIT
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.::::.: :::::::: :: .:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LTVTDMGTPRLKTEHNITVQISDVNDNAPTFTQTSYTLFVRENNSPALHIGSVSATDRDS
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pF1KB4 GTNAQVNYSLLPPQDLHLPLASLVSINTDNGHLFALRSLDYEALQAFDFRVGATDRGSPA
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CCDS42 GTNAQVTYSLLPPQDPHLPLASLVSINADNGHLFALRSLDYEALQAFEFRVGATDRGSPA
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:: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LSREALVRVLVLDANDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPRAAEPGYLVTKVVAVDGDSGQNA
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pF1KB4 WLSYQLLKATEPGLFGVWAHNGEVRTARLLSERDAAKHRLVVLVKDNGEPPRSATATLQV
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CCDS42 WLSYQLLKATEPGLFGVWAHNGEVRTARLLSERDAAKQRLVVLVKDNGEPPRSATATLHV
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pF1KB4 LLVDGFSQPYLPLPEAAPAQAQADSLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVAVRLCRRSRAA
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CCDS42 LLVDGFSQPFLPLPEAAPGQTQANSLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVAVRLCRRSRAA
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pF1KB4 SVGSCSVPKGPFPGHLVDVSGTGTLSQSYQYEVCLTGGSETNEFKFLKPVIPNIQAKGLG
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CCDS42 SVGRCSMPEGPFPGRLVDVSGTGTLSQSYQYEVCLTGGSETSEFKFLKPIIPNFSP
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pF1KB4 KNSEENSTFRNSFGFNF
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pF1KB4 MENQGTRTQQIRQVLLLFVLLGMSQAGS-ETWSFSVAEEMQSGSFVGNLAKDLGLKVREL
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CCDS42 MEASGKLICRQRQVLFSFLLLGLSLAGAAEPRSYSVVEETEGSSFVTNLAKDLGLEQREF
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pF1KB4 SSRGARVVSNDKKQRLQLDINTGDLLLSETLDREELCGSIEPCVLHLQVLMQNPTQFLQI
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CCDS42 SRRGVRVVSRGNKLHLQLNQETADLLLNEKLDREDLCGHTEPCVLRFQVLLESPFEFFQA
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pF1KB4 ELQVRDINDHSPIFSEKQMLLEIPENSPVGAVFLLESAKDLDVGINAVKSYTISPNSHFH
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CCDS42 ELQVIDINDHSPVFLDKQMLVKVSESSPPGTAFPLKNAEDLDIGQNNIENYIISPNSYFR
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pF1KB4 IKMRVIPDNRKYPELVLDKALDYEELPELSFILSALDGGSPPRSGTALVRVVVVDINDNS
. : :.::::::::::::: :: :: . :.::::::::::::: : . :::.:::.
CCDS42 VLTRKRSDGRKYPELVLDKALDREEEAELRLTLTALDGGSPPRSGTAQVYIEVVDVNDNA
190 200 210 220 230 240
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pF1KB4 PEFEQAFYEVKIRENSILGSLILIVSAWDLDSGTNGEICYTFSHASEDIRKTFEINQKSG
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CCDS42 PEFEQPFYRVQISEDSPISFLVVKVSATDVDTGVNGEISYSLFQASDEISKTFKVDFLTG
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pF1KB4 EITLRAPLDFETIESYSIIIQATDGGGLFGKSTVIIHVIDVNDNAPEITVSSITSPIPEN
:: :. :::: ..:: . :.: :.::. :: ::.:.::::::.:::.:.:..:::::::
CCDS42 EIRLKKQLDFEKFQSYEVNIEARDAGGFSGKCTVLIQVIDVNDHAPEVTMSAFTSPIPEN
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KB4 TPETVVMVFSIQDIDSGDNGRIVCSIPEDLPFVLKSSVENYHTLETERPLDRESTAEYNI
.::::: .::..:.:::.::.: ::: :::::.::::: :..:: :: :::::: ::::.
CCDS42 APETVVALFSVSDLDSGENGKISCSIQEDLPFLLKSSVGNFYTLLTETPLDRESRAEYNV
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KB4 TITVTDLGIPRLKTEHNTTVLVSDVNDNAPTFTQTSYTLFVRENNSPALHIGSVSATDRD
:::::::: ::: :. : ::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 TITVTDLGTPRLTTHLNMTVLVSDVNDNAPAFTQTSYTLFVRENNSPALHIGSVSATDRD
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
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:::::::.:::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::.:::::.:::::
CCDS42 SGTNAQVTYSLLPPQDPHLPLASLVSINTDNGHLFALRSLDYEALQAFEFRVGASDRGSP
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 ALSSEALVRVLVLDANDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPRAAEPGYLVTKVVAVDGDSGQN
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::: ::::::.
CCDS42 AWLSYQLLKATEPGLFGVWAHNGEVRTARLLSERDAAKQRLVVLVKDNGEPPCSATATLH
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:::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::: :::::::
CCDS42 VLLVDGFSQPYLPLPEAAPAQGQADSLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVAVLLCRRSRA
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:::: ::::.:::::::::: :::.:::.:::::::.::: ::::..::::.::::....
CCDS42 ASVGRCSVPEGPFPGHLVDVRGTGSLSQNYQYEVCLAGGSGTNEFQLLKPVLPNIQGHSF
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780 790
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CCDS42 GPEMEQNSNFRNGFGFSLQLK
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pF1KB4 SRGARVVSNDKKQRLQLDINTGDLLLSETLDREELCGSIEPCVLHLQVLMQNPTQFLQIE
.::::. . .:. :::::.::.::: : :::: .::. :::.::.:.:..::.::.: .
CCDS42 TRGARMHYKGNKELLQLDIKTGNLLLYEKLDREVMCGATEPCILHFQLLLENPVQFFQTD
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CCDS42 ATHNRGDGRKYPELVLDKALDREERPELSLTLTALDGGAPPRSGTTTIRIVVLDNNDNAP
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:: :.::::.. ::: :.::...::: :::.:. : . :.. ...: . . : :..:..:
CCDS42 EFLQSFYEVQVPENSPLNSLVVVVSARDLDAGAYGSVAYALFQGDE-VTQPFVIDEKTAE
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CCDS42 IRLKRALDFEATPYYNVEIVATDGGGLSGKCTVAIEVVDVNDNAPELTMSTLSSPTPENA
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::::: :::..: :::::::..::: .::::.:: ...:..:: :.: ::::: ::::::
CCDS42 PETVVAVFSVSDPDSGDNGRMICSIQNDLPFLLKPTLKNFYTLVTQRTLDRESQAEYNIT
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:::::.: :::::::: ::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 ITVTDMGTPRLKTEHNITVLVSDVNDNAPAFTQTSYTLFVRENNSPALHIGSVSATDRDS
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::::::.:::::::. :: ::::::::.:::::::::::::::::::.::::::::::::
CCDS42 GTNAQVTYSLLPPQNPHLRLASLVSINADNGHLFALRSLDYEALQAFEFRVGATDRGSPA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LSSEALVRVLVLDANDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPRAAEPGYLVTKVVAVDGDSGQNA
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pF1KB4 WLSYQLLKATEPGLFGVWAHNGEVRTARLLSERDAAKHRLVVLVKDNGEPPRSATATLQV
:::::::::::::::..:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:
CCDS42 WLSYQLLKATEPGLFSMWAHNGEVRTARLLSERDAAKHRLVVLVKDNGEPPRSATATLHV
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pF1KB4 LLVDGFSQPYLPLPEAAPAQAQADSLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVAVRLCRRSRAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LLVDGFSQPYLPLPEAAPAQAQADSLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVAVRLCRRSRAA
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pF1KB4 SVGSCSVPKGPFPGHLVDVSGTGTLSQSYQYEVCLTGGSETNEFKFLKPVIPNIQAKGLG
:: ::::.::::::::::::::::::::.::::::: : ..:::::::.:::. .: :
CCDS42 PVGRCSVPEGPFPGHLVDVSGTGTLSQSYHYEVCLTGDSGAGEFKFLKPIIPNLLPQGAG
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790
pF1KB4 KNSEENSTFRNSFGFNF
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CCDS42 EEIGKTAAFRNSFGLN
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pF1KB4 MENQGTRTQQIRQVLLLFVLLGMSQAGSETWSFSVAEEMQSGSFVGNLAKDLGLKVRELS
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CCDS42 MKKLG-RIHPNRQVLAFILMVFLSQVRLEPIRYSVLEETESGSFVAHLAKDLGLGIGELA
10 20 30 40 50
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pF1KB4 SRGARVVSNDKKQRLQLDINTGDLLLSETLDREELCGSIEPCVLHLQVLMQNPTQFLQIE
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CCDS42 SRSARVLSDDDKQRLQLDRQTGDLLLREKLDREELCGPIEPCVLHFQVFLEMPVQFFQGE
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pF1KB4 LQVRDINDHSPIFSEKQMLLEIPENSPVGAVFLLESAKDLDVGINAVKSYTISPNSHFHI
: ..::::::::: :...::.: ::: :..: : :.::::: :....:::::::::::
CCDS42 LLIQDINDHSPIFPEREVLLKILENSQPGTLFPLLIAEDLDVGSNGLQKYTISPNSHFHI
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pF1KB4 KMRVIPDNRKYPELVLDKALDYEELPELSFILSALDGGSPPRSGTALVRVVVVDINDNSP
: ...:::.:: :: :: :: ::.:. : ::::::::::::..::....:::::.:
CCDS42 LTRNHSEGKKYPDLVQDKPLDREEQPEFSLTLVALDGGSPPRSGTVMVRILIMDINDNAP
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pF1KB4 EFEQAFYEVKIRENSILGSLILIVSAWDLDSGTNGEICYTFSHASEDIRKTFEINQKSGE
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CCDS42 EFVHTPYGVQVLENSPLDSPIVRVLARDIDAGNFGSVSYGLFQASDEIKQTFSINEVTGE
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pF1KB4 ITLRAPLDFETIESYSIIIQATDGGGLFGKSTVIIHVIDVNDNAPEITVSSITSPIPENT
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CCDS42 ILLKKKLDFEKIKSYHVEIEATDGGGLSGKGTVVIEVVDVNDNPPELIISSLTSSIPENA
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pF1KB4 PETVVMVFSIQDIDSGDNGRIVCSIPEDLPFVLKSSVENYHTLETERPLDRESTAEYNIT
::::: .: :.: :::.::...::::..:::.:: ...:..:: ::::::::..::::::
CCDS42 PETVVSIFRIRDRDSGENGKMICSIPDNLPFILKPTLKNFYTLVTERPLDRETSAEYNIT
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pF1KB4 ITVTDLGIPRLKTEHNTTVLVSDVNDNAPTFTQTSYTLFVRENNSPALHIGSVSATDRDS
:.::::: :::::..: :: :::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 IAVTDLGTPRLKTQQNITVQVSDVNDNAPAFTQTSYTLFVRENNSPALHIGSVSATDRDS
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pF1KB4 GTNAQVNYSLLPPQDLHLPLASLVSINTDNGHLFALRSLDYEALQAFDFRVGATDRGSPA
::::::.:::::::: :::::::::::.:::::::::::::::::::.:::::.::::::
CCDS42 GTNAQVTYSLLPPQDPHLPLASLVSINADNGHLFALRSLDYEALQAFEFRVGASDRGSPA
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:::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LSSEALVRVLVLDTNDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPRAAEPGYLVTKVVAVDGDSGQNA
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pF1KB4 WLSYQLLKATEPGLFGVWAHNGEVRTARLLSERDAAKHRLVVLVKDNGEPPRSATATLQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:
CCDS42 WLSYQLLKATEPGLFGVWAHNGEVRTARLLSERDAAKHRLVVLVKDNGEPPRSATATLHV
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pF1KB4 LLVDGFSQPYLPLPEAAPAQAQADSLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVAVRLCRRSRAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LLVDGFSQPYLPLPEAAPAQAQADSLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVAVRLCRRSRAA
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pF1KB4 SVGSCSVPKGPFPGHLVDVSGTGTLSQSYQYEVCLTGGSETNEFKFLKPVIPNIQAKGLG
::: ::::.:::::::::::::::::::::::::::: : :.:::::::..::. .. :
CCDS42 SVGRCSVPEGPFPGHLVDVSGTGTLSQSYQYEVCLTGDSGTGEFKFLKPIFPNLLVQDTG
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790
pF1KB4 KNSEENSTFRNSFGFNF
.. .:: ::::. :.
CCDS42 REVKENPKFRNSLVFS
780 790
>>CCDS4257.1 PCDHB15 gene_id:56121|Hs108|chr5 (787 aa)
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pF1KB4 MENQGTRTQQIRQVLLLFVLLGMSQAGSETWSFSVAEEMQSGSFVGNLAKDLGLKVRELS
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CCDS42 MEPAGERFPEQRQVLILLLLLEVTLAGWEPRRYSVMEETERGSFVANLANDLGLGVGELA
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pF1KB4 SRGARVVSNDKKQRLQLDINTGDLLLSETLDREELCGSIEPCVLHLQVLMQNPTQFLQIE
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CCDS42 ERGARVVSEDNEQGLQLDLQTGQLILNEKLDREKLCGPTEPCIMHFQVLLKKPLEVFRAE
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pF1KB4 LQVRDINDHSPIFSEKQMLLEIPENSPVGAVFLLESAKDLDVGINAVKSYTISPNSHFHI
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CCDS42 LLVTDINDHSPEFPEREMTLKIPETSSLGTVFPLKKARDLDVGSNNVQNYNISPNSHFHV
130 140 150 160 170 180
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pF1KB4 KMRVIPDNRKYPELVLDKALDYEELPELSFILSALDGGSPPRSGTALVRVVVVDINDNSP
. :. :.::::::::: :: :: :: . :.:.::::::::::. . ..:.: :::.:
CCDS42 STRTRGDGRKYPELVLDTELDREEQAELRLTLTAVDGGSPPRSGTVQILILVLDANDNAP
190 200 210 220 230 240
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pF1KB4 EFEQAFYEVKIRENSILGSLILIVSAWDLDSGTNGEICYTFSHASEDIRKTFEINQKSGE
:: ::.:::.. ::: .:::.. ::: :::.:::::: :.. ..:..: : ::... :::
CCDS42 EFVQALYEVQVPENSPVGSLVVKVSARDLDTGTNGEISYSLYYSSQEIDKPFELSSLSGE
250 260 270 280 290 300
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pF1KB4 ITLRAPLDFETIESYSIIIQATDGGGLFGKSTVIIHVIDVNDNAPEITVSSITSPIPENT
: : :::::. ::.. :.:.::::: :: .: ..:.::::: ::...::.:::::::.
CCDS42 IRLIKKLDFETMSSYDLDIEASDGGGLSGKCSVSVKVLDVNDNFPELSISSLTSPIPENS
310 320 330 340 350 360
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pF1KB4 PETVVMVFSIQDIDSGDNGRIVCSIPEDLPFVLKSSVENYHTLETERPLDRESTAEYNIT
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CCDS42 PETEVALFRIRDRDSGENGKMICSIQDDVPFKLKPSVENFYRLVTEGALDRETRAEYNIT
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pF1KB4 ITVTDLGIPRLKTEHNTTVLVSDVNDNAPTFTQTSYTLFVRENNSPALHIGSVSATDRDS
::.:::: ::::::.. ::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 ITITDLGTPRLKTEQSITVLVSDVNDNAPAFTQTSYTLFVRENNSPALHIGSVSATDRDS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 GTNAQVNYSLLPPQDLHLPLASLVSINTDNGHLFALRSLDYEALQAFDFRVGATDRGSPA
::::::.::::::.: ::::.:::::::::::::::.::::::::::.::::::::: ::
CCDS42 GTNAQVTYSLLPPRDPHLPLTSLVSINTDNGHLFALQSLDYEALQAFEFRVGATDRGFPA
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pF1KB4 LSSEALVRVLVLDANDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPRAAEPGYLVTKVVAVDGDSGQNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LSSEALVRVLVLDANDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPRAAEPGYLVTKVVAVDGDSGQNA
550 560 570 580 590 600
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pF1KB4 WLSYQLLKATEPGLFGVWAHNGEVRTARLLSERDAAKHRLVVLVKDNGEPPRSATATLQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::
CCDS42 WLSYQLLKATEPGLFGVWAHNGEVRTARLLSERDVAKHRLVVLVKDNGEPPRSATATLQV
610 620 630 640 650 660
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pF1KB4 LLVDGFSQPYLPLPEAAPAQAQADSLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVAVRLCRRSRAA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::
CCDS42 LLVDGFSQPYLPLPEAAPAQAQADSLTVYLVVALASVSSLFLFSVFLFVAVRLCRRSRAA
670 680 690 700 710 720
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pF1KB4 SVGSCSVPKGPFPGHLVDVSGTGTLSQSYQYEVCLTGGSETNEFKFLKPVIPNIQAKGLG
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CCDS42 SVGRCSVPEGPFPGHLVDVSGTGTLSQSYQYEVCLTGGSESNDFKFLKPIFPNIVSQDSR
730 740 750 760 770 780
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pF1KB4 KNSEENSTFRNSFGFNF
..::
CCDS42 RKSEFLE
797 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 21:20:52 2016 done: Thu Nov 3 21:20:53 2016
Total Scan time: 3.940 Total Display time: 0.280
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]