Result of FASTA (omim) for
pF1KB4009
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4009, 797 aa
1>>>pF1KB4009 797 - 797 aa - 797 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5127+/-0.000428; mu= 19.2582+/- 0.027
mean_var=74.3347+/-15.104, 0's: 0 Z-trim(110.1): 410 B-trim: 9 in 2/51
Lambda= 0.148757
statistics sampled from 18007 (18432) to 18007 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.565), E-opt: 0.2 (0.216), width: 16
Scan time: 12.400
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_061754 (OMIM: 606337) protocadherin beta-11 pre ( 797) 5124 1110.0 0
NP_061755 (OMIM: 606338) protocadherin beta-12 pre ( 795) 4562 989.3 0
NP_061757 (OMIM: 606340) protocadherin beta-14 pre ( 798) 4013 871.5 0
NP_061760 (OMIM: 606329) protocadherin beta-3 prec ( 796) 3906 848.6 0
NP_061759 (OMIM: 606328) protocadherin beta-2 prec ( 798) 3885 844.0 0
NP_066008 (OMIM: 606345) protocadherin beta-16 pre ( 776) 3860 838.7 0
NP_061993 (OMIM: 606334) protocadherin beta-8 prec ( 801) 3853 837.2 0
NP_056484 (OMIM: 606331) protocadherin beta-5 prec ( 795) 3842 834.8 0
NP_061761 (OMIM: 606330) protocadherin beta-4 prec ( 795) 3834 833.1 0
NP_061758 (OMIM: 606341) protocadherin beta-15 pre ( 787) 3805 826.9 0
NP_061756 (OMIM: 606339) protocadherin beta-13 pre ( 798) 3786 822.8 0
NP_061992 (OMIM: 606335) protocadherin beta-9 prec ( 797) 3764 818.1 0
NP_061763 (OMIM: 606333) protocadherin beta-7 prec ( 793) 3759 817.0 0
NP_061753 (OMIM: 606336) protocadherin beta-10 pre ( 800) 3754 815.9 0
NP_061762 (OMIM: 606332) protocadherin beta-6 isof ( 794) 3711 806.7 0
NP_001290074 (OMIM: 606332) protocadherin beta-6 i ( 658) 3221 701.5 3e-201
NP_037472 (OMIM: 606327) protocadherin beta-1 prec ( 818) 2563 560.3 1.2e-158
NP_114382 (OMIM: 606288) protocadherin gamma-A1 is ( 823) 2137 468.9 3.9e-131
NP_061735 (OMIM: 606288) protocadherin gamma-A1 is ( 931) 2137 468.9 4.3e-131
NP_114476 (OMIM: 606294) protocadherin gamma-A7 is ( 817) 2128 467.0 1.5e-130
NP_114479 (OMIM: 606297) protocadherin gamma-A10 i ( 850) 2128 467.0 1.5e-130
NP_061743 (OMIM: 606294) protocadherin gamma-A7 is ( 932) 2128 467.0 1.6e-130
NP_061736 (OMIM: 606297) protocadherin gamma-A10 i ( 936) 2128 467.0 1.6e-130
NP_114480 (OMIM: 606298) protocadherin gamma-A11 i ( 837) 2121 465.5 4.3e-130
NP_061737 (OMIM: 606298) protocadherin gamma-A11 i ( 935) 2121 465.5 4.7e-130
NP_114443 (OMIM: 606292) protocadherin gamma-A5 is ( 813) 2120 465.3 4.8e-130
NP_061741 (OMIM: 606292) protocadherin gamma-A5 is ( 931) 2120 465.3 5.4e-130
NP_114442 (OMIM: 606291) protocadherin gamma-A4 is ( 851) 2100 461.0 9.8e-129
NP_061740 (OMIM: 606291) protocadherin gamma-A4 is ( 962) 2100 461.0 1.1e-128
NP_115267 (OMIM: 606300) protocadherin gamma-B2 is ( 811) 2099 460.8 1.1e-128
NP_061746 (OMIM: 606300) protocadherin gamma-B2 is ( 931) 2099 460.8 1.2e-128
NP_115270 (OMIM: 606302) protocadherin gamma-B5 is ( 818) 2072 455.0 6.1e-127
NP_061748 (OMIM: 606302) protocadherin gamma-B5 is ( 923) 2072 455.0 6.8e-127
NP_115265 (OMIM: 603059) protocadherin gamma-A12 i ( 820) 2071 454.8 7.1e-127
NP_003726 (OMIM: 603059) protocadherin gamma-A12 i ( 932) 2071 454.8 7.9e-127
NP_114478 (OMIM: 606296) protocadherin gamma-A9 is ( 828) 2068 454.1 1.1e-126
NP_061744 (OMIM: 606296) protocadherin gamma-A9 is ( 932) 2068 454.1 1.2e-126
NP_115271 (OMIM: 606303) protocadherin gamma-B6 is ( 820) 2063 453.0 2.3e-126
NP_114398 (OMIM: 606289) protocadherin gamma-A2 is ( 823) 2063 453.0 2.3e-126
NP_061749 (OMIM: 606303) protocadherin gamma-B6 is ( 930) 2063 453.1 2.6e-126
NP_061738 (OMIM: 606289) protocadherin gamma-A2 is ( 932) 2063 453.1 2.6e-126
NP_115272 (OMIM: 606304) protocadherin gamma-B7 is ( 808) 2055 451.3 7.6e-126
NP_061750 (OMIM: 606304) protocadherin gamma-B7 is ( 929) 2055 451.3 8.5e-126
NP_114475 (OMIM: 606293) protocadherin gamma-A6 is ( 818) 2046 449.4 2.9e-125
NP_061742 (OMIM: 606293) protocadherin gamma-A6 is ( 932) 2046 449.4 3.3e-125
NP_114400 (OMIM: 606290) protocadherin gamma-A3 is ( 829) 2039 447.9 8.4e-125
NP_061739 (OMIM: 606290) protocadherin gamma-A3 is ( 932) 2039 447.9 9.2e-125
NP_115269 (OMIM: 603058) protocadherin gamma-B4 is ( 803) 2025 444.9 6.6e-124
NP_003727 (OMIM: 603058) protocadherin gamma-B4 is ( 923) 2025 444.9 7.4e-124
NP_054723 (OMIM: 606295) protocadherin gamma-A8 is ( 820) 2017 443.2 2.2e-123
>>NP_061754 (OMIM: 606337) protocadherin beta-11 precurs (797 aa)
initn: 5124 init1: 5124 opt: 5124 Z-score: 5940.0 bits: 1110.0 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5124; 99.9% identity (100.0% similar) in 797 aa overlap (1-797:1-797)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MENQGTRTQQIRQVLLLFVLLGMSQAGSETWSFSVAEEMQSGSFVGNLAKDLGLKVRELS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 MENQGTRTQQIRQVLLLFVLLGMSQAGSETWSFSVAEEMQSGSFVGNLAKDLGLKVRELS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 SRGARVVSNDKKQRLQLDINTGDLLLSETLDREELCGSIEPCVLHLQVLMQNPTQFLQIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 SRGARVVSNDKKQRLQLDINTGDLLLSETLDREELCGSIEPCVLHLQVLMQNPTQFLQIE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 LQVRDINDHSPIFSEKQMLLEIPENSPVGAVFLLESAKDLDVGINAVKSYTISPNSHFHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 LQVRDINDHSPIFSEKQMLLEIPENSPVGAVFLLESAKDLDVGINAVKSYTISPNSHFHI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 KMRVIPDNRKYPELVLDKALDYEELPELSFILSALDGGSPPRSGTALVRVVVVDINDNSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 KMRVIPDNRKYPELVLDKALDYEELPELSFILSALDGGSPPRSGTALVRVVVVDINDNSP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 EFEQAFYEVKIRENSILGSLILIVSAWDLDSGTNGEICYTFSHASEDIRKTFEINQKSGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 EFEQAFYEVKIRENSILGSLILIVSAWDLDSGTNGEICYTFSHASEDIRKTFEINQKSGE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 ITLRAPLDFETIESYSIIIQATDGGGLFGKSTVIIHVIDVNDNAPEITVSSITSPIPENT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 ITLRAPLDFETIESYSIIIQATDGGGLFGKSTVIIHVIDVNDNAPEITVSSITSPIPENT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 PETVVMVFSIQDIDSGDNGRIVCSIPEDLPFVLKSSVENYHTLETERPLDRESTAEYNIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::
NP_061 PETVVMVFSIQDIDSGDNGRIVCSIPEDLPFVLKSSVENYYTLETERPLDRESTAEYNIT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 ITVTDLGIPRLKTEHNTTVLVSDVNDNAPTFTQTSYTLFVRENNSPALHIGSVSATDRDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 ITVTDLGIPRLKTEHNTTVLVSDVNDNAPTFTQTSYTLFVRENNSPALHIGSVSATDRDS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 GTNAQVNYSLLPPQDLHLPLASLVSINTDNGHLFALRSLDYEALQAFDFRVGATDRGSPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 GTNAQVNYSLLPPQDLHLPLASLVSINTDNGHLFALRSLDYEALQAFDFRVGATDRGSPA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 LSSEALVRVLVLDANDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPRAAEPGYLVTKVVAVDGDSGQNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 LSSEALVRVLVLDANDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPRAAEPGYLVTKVVAVDGDSGQNA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 WLSYQLLKATEPGLFGVWAHNGEVRTARLLSERDAAKHRLVVLVKDNGEPPRSATATLQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 WLSYQLLKATEPGLFGVWAHNGEVRTARLLSERDAAKHRLVVLVKDNGEPPRSATATLQV
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB4 LLVDGFSQPYLPLPEAAPAQAQADSLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVAVRLCRRSRAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 LLVDGFSQPYLPLPEAAPAQAQADSLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVAVRLCRRSRAA
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB4 SVGSCSVPKGPFPGHLVDVSGTGTLSQSYQYEVCLTGGSETNEFKFLKPVIPNIQAKGLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 SVGSCSVPKGPFPGHLVDVSGTGTLSQSYQYEVCLTGGSETNEFKFLKPVIPNIQAKGLG
730 740 750 760 770 780
790
pF1KB4 KNSEENSTFRNSFGFNF
:::::::::::::::::
NP_061 KNSEENSTFRNSFGFNF
790
>>NP_061755 (OMIM: 606338) protocadherin beta-12 precurs (795 aa)
initn: 4562 init1: 4562 opt: 4562 Z-score: 5288.2 bits: 989.3 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4562; 88.7% identity (95.3% similar) in 795 aa overlap (1-795:1-795)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MENQGTRTQQIRQVLLLFVLLGMSQAGSETWSFSVAEEMQSGSFVGNLAKDLGLKVRELS
::: :. : :::::::.::::::::::::: .: : ::.::::::::::: :::.: :::
NP_061 MENGGAGTLQIRQVLLFFVLLGMSQAGSETGNFLVMEELQSGSFVGNLAKTLGLEVSELS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 SRGARVVSNDKKQRLQLDINTGDLLLSETLDREELCGSIEPCVLHLQVLMQNPTQFLQIE
::::::::::.:. :::: ::::::: : ::::::::: :::::..::::.:::::::::
NP_061 SRGARVVSNDNKECLQLDTNTGDLLLREMLDREELCGSNEPCVLYFQVLMKNPTQFLQIE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 LQVRDINDHSPIFSEKQMLLEIPENSPVGAVFLLESAKDLDVGINAVKSYTISPNSHFHI
:::::::::::.: ::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::.
NP_061 LQVRDINDHSPVFLEKEMLLEIPENSPVGAVFLLESAKDLDVGINAVKSYTINPNSHFHV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 KMRVIPDNRKYPELVLDKALDYEELPELSFILSALDGGSPPRSGTALVRVVVVDINDNSP
:.:: ::::::::::::::::::: :::::::.:::::::::::::::::::::::::::
NP_061 KIRVNPDNRKYPELVLDKALDYEERPELSFILTALDGGSPPRSGTALVRVVVVDINDNSP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 EFEQAFYEVKIRENSILGSLILIVSAWDLDSGTNGEICYTFSHASEDIRKTFEINQKSGE
::::::::::: ::::::::.. :::::::::::.:. :::::::::::::::::::::.
NP_061 EFEQAFYEVKILENSILGSLVVTVSAWDLDSGTNSELSYTFSHASEDIRKTFEINQKSGD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 ITLRAPLDFETIESYSIIIQATDGGGLFGKSTVIIHVIDVNDNAPEITVSSITSPIPENT
::: ::::::.:::::::::::::::::::::: :.:.::::::::::::::::::::::
NP_061 ITLTAPLDFEAIESYSIIIQATDGGGLFGKSTVRIQVMDVNDNAPEITVSSITSPIPENT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 PETVVMVFSIQDIDSGDNGRIVCSIPEDLPFVLKSSVENYHTLETERPLDRESTAEYNIT
:::::::: :.: ::::::..:::::::.::::::::.::.:::::::::::: ::::::
NP_061 PETVVMVFRIRDRDSGDNGKMVCSIPEDIPFVLKSSVNNYYTLETERPLDRESRAEYNIT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 ITVTDLGIPRLKTEHNTTVLVSDVNDNAPTFTQTSYTLFVRENNSPALHIGSVSATDRDS
::::::: :::::::: ::::::::::::.::::::.:::::::::::::::.:::::::
NP_061 ITVTDLGTPRLKTEHNITVLVSDVNDNAPAFTQTSYALFVRENNSPALHIGSISATDRDS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 GTNAQVNYSLLPPQDLHLPLASLVSINTDNGHLFALRSLDYEALQAFDFRVGATDRGSPA
:::::::::::: :: :::::::::::.:::::::::::::::::.:.:::::::.::::
NP_061 GTNAQVNYSLLPSQDPHLPLASLVSINADNGHLFALRSLDYEALQGFQFRVGATDHGSPA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 LSSEALVRVLVLDANDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPRAAEPGYLVTKVVAVDGDSGQNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::
NP_061 LSSEALVRVLVLDANDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPWAAEPGYLVTKVVAVDGDSGQNA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 WLSYQLLKATEPGLFGVWAHNGEVRTARLLSERDAAKHRLVVLVKDNGEPPRSATATLQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:
NP_061 WLSYQLLKATEPGLFGVWAHNGEVRTARLLSERDAAKHRLVVLVKDNGEPPRSATATLHV
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB4 LLVDGFSQPYLPLPEAAPAQAQADSLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVAVRLCRRSRAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 LLVDGFSQPYLPLPEAAPAQAQADSLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVAVRLCRRSRAA
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB4 SVGSCSVPKGPFPGHLVDVSGTGTLSQSYQYEVCLTGGSETNEFKFLKPVIPNIQAKGLG
:: ::::.::::::::::::::::::::.::::.::::..:.::::::.:::. .. :
NP_061 PVGRCSVPEGPFPGHLVDVSGTGTLSQSYHYEVCVTGGSRSNKFKFLKPIIPNFLPQSTG
730 740 750 760 770 780
790
pF1KB4 KNSEENSTFRNSFGFNF
.. ::: :.:..::
NP_061 SEVEENPPFQNNLGF
790
>>NP_061757 (OMIM: 606340) protocadherin beta-14 precurs (798 aa)
initn: 4228 init1: 4013 opt: 4013 Z-score: 4651.4 bits: 871.5 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4013; 77.0% identity (90.5% similar) in 796 aa overlap (1-796:1-796)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MENQGTRTQQIRQVLLLFVLLGMSQAGSETWSFSVAEEMQSGSFVGNLAKDLGLKVRELS
:: .:. . ::::...::::.:.::.:. .::::: . ::::.:::.:::: :.:::
NP_061 MEIRGALDLRKRQVLIFLVLLGLSRAGTESAHYSVAEETEIGSFVANLARDLGLGVEELS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 SRGARVVSNDKKQRLQLDINTGDLLLSETLDREELCGSIEPCVLHLQVLMQNPTQFLQIE
:: :::::.:.:. :.::. ::.:::.: :::.::::: ::::::.::...:: ::...:
NP_061 SREARVVSDDNKKYLHLDLLTGNLLLNEKLDRDELCGSTEPCVLHFQVVLENPLQFFRFE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 LQVRDINDHSPIFSEKQMLLEIPENSPVGAVFLLESAKDLDVGINAVKSYTISPNSHFHI
: :.::::::: : .:..:..: :.. :::.::.:::.::::: :....:::::::::.:
NP_061 LCVKDINDHSPTFLDKEILIKISEGTTVGATFLMESAQDLDVGSNSLQNYTISPNSHFYI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 KMRVIPDNRKYPELVLDKALDYEELPELSFILSALDGGSPPRSGTALVRVVVVDINDNSP
:. : . :::::::.:::::. :: . :.:.::::::.:::.:: . :.:::::.:
NP_061 KIPDSSDRKIYPELVLDRALDYEQEAELRLTLTAVDGGSPPKSGTTLVLIKVLDINDNAP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 EFEQAFYEVKIRENSILGSLILIVSAWDLDSGTNGEICYTFSHASEDIRKTFEINQKSGE
:: :..:::.. :. ::: : .:: :::.:. :.: ::: ::::::::::::: :::
NP_061 EFPQSLYEVQVPEDRPLGSWIATISAKDLDAGNYGKISYTFFHASEDIRKTFEINPISGE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 ITLRAPLDFETIESYSIIIQATDGGGLFGKSTVIIHVIDVNDNAPEITVSSITSPIPENT
..::.:::::.:.::.: ::::::::: :: :....:.:.::: ::.:.::::. ::::.
NP_061 VNLRSPLDFEVIQSYTINIQATDGGGLSGKCTLLVKVMDINDNPPEVTISSITKRIPENA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
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::.: .::: : :::::::..::: ..::: :: . .:. :: .:. ::::: ::::::
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::::::: ::::::.: :::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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NP_061 LSSEALVRVLVLDANDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPRAAEPGYLVTKVVAVDGDSGQNA
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NP_061 LLVDGFSQPYLPLPEAAPAQAQADLLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVAVRLCRRSRAA
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NP_061 SVGRCSVPEGPFPGQMVDVSGTGTLSQSYQYEVCLTGGSGTNEFKFLKPIIPNFVAQGAE
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: .:.. :::..: :::::::.:::: .:::: :: ::::..:: ::::. .:::
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:::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::.::::::::::::::::::::
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pF1KB4 LGKNSEENSTFRNSFGFNF
. :: : .::.:: :
NP_061 AERVSEANPSFRKSFEFT
790
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. :: .::: . :: . :.::::::: :: :....:.::::: :..:.:..:::::::.
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pF1KB4 ITVTDLGIPRLKTEHNTTVLVSDVNDNAPTFTQTSYTLFVRENNSPALHIGSVSATDRDS
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pF1KB4 KNSEENSTFRNSFGFNF
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NP_061 MEASGKLICRQRQVLFSFLLLGLSLAGAAEPRSYSVVEETEGSSFVTNLAKDLGLEQREF
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pF1KB4 SSRGARVVSNDKKQRLQLDINTGDLLLSETLDREELCGSIEPCVLHLQVLMQNPTQFLQI
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NP_061 SRRGVRVVSRGNKLHLQLNQETADLLLNEKLDREDLCGHTEPCVLRFQVLLESPFEFFQA
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NP_061 ELQVIDINDHSPVFLDKQMLVKVSESSPPGTAFPLKNAEDLDIGQNNIENYIISPNSYFR
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pF1KB4 IKMRVIPDNRKYPELVLDKALDYEELPELSFILSALDGGSPPRSGTALVRVVVVDINDNS
. : :.::::::::::::: :: :: . :.::::::::::::: : . :::.:::.
NP_061 VLTRKRSDGRKYPELVLDKALDREEEAELRLTLTALDGGSPPRSGTAQVYIEVVDVNDNA
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NP_061 PEFEQPFYRVQISEDSPISFLVVKVSATDVDTGVNGEISYSLFQASDEISKTFKVDFLTG
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NP_061 LLVDGFSQPYLPLPEAAPAQAQADSLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVAVRLCRRSRAA
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pF1KB4 KNSEENSTFRNSFGFNF
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NP_061 REVKENPKFRNSLVFS
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NP_061 STRTRGDGRKYPELVLDTELDREEQAELRLTLTAVDGGSPPRSGTVQILILVLDANDNAP
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NP_061 EFVQALYEVQVPENSPVGSLVVKVSARDLDTGTNGEISYSLYYSSQEIDKPFELSSLSGE
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NP_061 IRLIKKLDFETMSSYDLDIEASDGGGLSGKCSVSVKVLDVNDNFPELSISSLTSPIPENS
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NP_061 PETEVALFRIRDRDSGENGKMICSIQDDVPFKLKPSVENFYRLVTEGALDRETRAEYNIT
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NP_061 ITITDLGTPRLKTEQSITVLVSDVNDNAPAFTQTSYTLFVRENNSPALHIGSVSATDRDS
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pF1KB4 GTNAQVNYSLLPPQDLHLPLASLVSINTDNGHLFALRSLDYEALQAFDFRVGATDRGSPA
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NP_061 GTNAQVTYSLLPPRDPHLPLTSLVSINTDNGHLFALQSLDYEALQAFEFRVGATDRGFPA
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NP_061 SVGRCSVPEGPFPGHLVDVSGTGTLSQSYQYEVCLTGGSESNDFKFLKPIFPNIVSQDSR
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pF1KB4 KNSEENSTFRNSFGFNF
..::
NP_061 RKSEFLE
797 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 21:20:53 2016 done: Thu Nov 3 21:20:55 2016
Total Scan time: 12.400 Total Display time: 0.300
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]