Result of FASTA (ccds) for pF1KB4019
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB4019, 430 aa
  1>>>pF1KB4019 430 - 430 aa - 430 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0607+/-0.00089; mu= 16.3584+/- 0.055
 mean_var=150.5831+/-32.289, 0's: 0 Z-trim(110.6): 83  B-trim: 0 in 0/53
 Lambda= 0.104517
 statistics sampled from 11682 (11766) to 11682 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.703), E-opt: 0.2 (0.361), width:  16
 Scan time:  2.900

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS1246.1 PBX1 gene_id:5087|Hs108|chr1            ( 430) 2813 435.9 3.5e-122
CCDS55653.1 PBX1 gene_id:5087|Hs108|chr1           ( 420) 2608 405.0  7e-113
CCDS6865.1 PBX3 gene_id:5090|Hs108|chr9            ( 434) 2361 367.8 1.2e-101
CCDS55654.1 PBX1 gene_id:5087|Hs108|chr1           ( 347) 2182 340.7 1.3e-93
CCDS48021.1 PBX3 gene_id:5090|Hs108|chr9           ( 359) 2071 324.0 1.5e-88
CCDS4748.1 PBX2 gene_id:5089|Hs108|chr6            ( 430) 1864 292.9 4.2e-79
CCDS83416.1 PBX3 gene_id:5090|Hs108|chr9           ( 351) 1823 286.6 2.7e-77
CCDS12406.1 PBX4 gene_id:80714|Hs108|chr19         ( 374) 1580 250.0   3e-66


>>CCDS1246.1 PBX1 gene_id:5087|Hs108|chr1                 (430 aa)
 initn: 2813 init1: 2813 opt: 2813  Z-score: 2307.0  bits: 435.9 E(32554): 3.5e-122
Smith-Waterman score: 2813; 100.0% identity (100.0% similar) in 430 aa overlap (1-430:1-430)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB4 MDEQPRLMHSHAGVGMAGHPGLSQHLQDGAGGTEGEGGRKQDIGDILQQIMTITDQSLDE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MDEQPRLMHSHAGVGMAGHPGLSQHLQDGAGGTEGEGGRKQDIGDILQQIMTITDQSLDE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB4 AQARKHALNCHRMKPALFNVLCEIKEKTVLSIRGAQEEEPTDPQLMRLDNMLLAEGVAGP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 AQARKHALNCHRMKPALFNVLCEIKEKTVLSIRGAQEEEPTDPQLMRLDNMLLAEGVAGP
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB4 EKGGGSAAAAAAAAASGGAGSDNSVEHSDYRAKLSQIRQIYHTELEKYEQACNEFTTHVM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 EKGGGSAAAAAAAAASGGAGSDNSVEHSDYRAKLSQIRQIYHTELEKYEQACNEFTTHVM
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB4 NLLREQSRTRPISPKEIERMVSIIHRKFSSIQMQLKQSTCEAVMILRSRFLDARRKRRNF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 NLLREQSRTRPISPKEIERMVSIIHRKFSSIQMQLKQSTCEAVMILRSRFLDARRKRRNF
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB4 NKQATEILNEYFYSHLSNPYPSEEAKEELAKKCGITVSQVSNWFGNKRIRYKKNIGKFQE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 NKQATEILNEYFYSHLSNPYPSEEAKEELAKKCGITVSQVSNWFGNKRIRYKKNIGKFQE
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB4 EANIYAAKTAVTATNVSAHGSQANSPSTPNSAGSSSSFNMSNSGDLFMSVQSLNGDSYQG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 EANIYAAKTAVTATNVSAHGSQANSPSTPNSAGSSSSFNMSNSGDLFMSVQSLNGDSYQG
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB4 AQVGANVQSQVDTLRHVISQTGGYSDGLAASQMYSPQGISANGGWQDATTPSSVTSPTEG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 AQVGANVQSQVDTLRHVISQTGGYSDGLAASQMYSPQGISANGGWQDATTPSSVTSPTEG
              370       380       390       400       410       420

              430
pF1KB4 PGSVHSDTSN
       ::::::::::
CCDS12 PGSVHSDTSN
              430

>>CCDS55653.1 PBX1 gene_id:5087|Hs108|chr1                (420 aa)
 initn: 2608 init1: 2608 opt: 2608  Z-score: 2140.1  bits: 405.0 E(32554): 7e-113
Smith-Waterman score: 2608; 100.0% identity (100.0% similar) in 400 aa overlap (1-400:1-400)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB4 MDEQPRLMHSHAGVGMAGHPGLSQHLQDGAGGTEGEGGRKQDIGDILQQIMTITDQSLDE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MDEQPRLMHSHAGVGMAGHPGLSQHLQDGAGGTEGEGGRKQDIGDILQQIMTITDQSLDE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB4 AQARKHALNCHRMKPALFNVLCEIKEKTVLSIRGAQEEEPTDPQLMRLDNMLLAEGVAGP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 AQARKHALNCHRMKPALFNVLCEIKEKTVLSIRGAQEEEPTDPQLMRLDNMLLAEGVAGP
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB4 EKGGGSAAAAAAAAASGGAGSDNSVEHSDYRAKLSQIRQIYHTELEKYEQACNEFTTHVM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 EKGGGSAAAAAAAAASGGAGSDNSVEHSDYRAKLSQIRQIYHTELEKYEQACNEFTTHVM
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB4 NLLREQSRTRPISPKEIERMVSIIHRKFSSIQMQLKQSTCEAVMILRSRFLDARRKRRNF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 NLLREQSRTRPISPKEIERMVSIIHRKFSSIQMQLKQSTCEAVMILRSRFLDARRKRRNF
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB4 NKQATEILNEYFYSHLSNPYPSEEAKEELAKKCGITVSQVSNWFGNKRIRYKKNIGKFQE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 NKQATEILNEYFYSHLSNPYPSEEAKEELAKKCGITVSQVSNWFGNKRIRYKKNIGKFQE
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB4 EANIYAAKTAVTATNVSAHGSQANSPSTPNSAGSSSSFNMSNSGDLFMSVQSLNGDSYQG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 EANIYAAKTAVTATNVSAHGSQANSPSTPNSAGSSSSFNMSNSGDLFMSVQSLNGDSYQG
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB4 AQVGANVQSQVDTLRHVISQTGGYSDGLAASQMYSPQGISANGGWQDATTPSSVTSPTEG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::                    
CCDS55 AQVGANVQSQVDTLRHVISQTGGYSDGLAASQMYSPQGISHLPRHPRQAHYHFRLPTWHP
              370       380       390       400       410       420

              430
pF1KB4 PGSVHSDTSN

>>CCDS6865.1 PBX3 gene_id:5090|Hs108|chr9                 (434 aa)
 initn: 1266 init1: 1200 opt: 2361  Z-score: 1938.6  bits: 367.8 E(32554): 1.2e-101
Smith-Waterman score: 2361; 83.2% identity (93.9% similar) in 440 aa overlap (1-430:1-434)

               10        20               30        40        50   
pF1KB4 MDEQPRLMHSHAGVGMAGHP---GLS----QHLQDGAGGTEGEGGRKQDIGDILQQIMTI
       ::.: :.... :::..:::    :..     : ..:: :     ::::::::::.:::::
CCDS68 MDDQSRMLQTLAGVNLAGHSVQGGMALPPPPHGHEGADGD----GRKQDIGDILHQIMTI
               10        20        30        40            50      

            60        70        80        90       100       110   
pF1KB4 TDQSLDEAQARKHALNCHRMKPALFNVLCEIKEKTVLSIRGAQEEEPTDPQLMRLDNMLL
       ::::::::::.::::::::::::::.::::::::: :::::::::.: ::::::::::::
CCDS68 TDQSLDEAQAKKHALNCHRMKPALFSVLCEIKEKTGLSIRGAQEEDPPDPQLMRLDNMLL
         60        70        80        90       100       110      

           120       130       140       150       160       170   
pF1KB4 AEGVAGPEKGGGSAAAAAAAAASGGAGSDNSVEHSDYRAKLSQIRQIYHTELEKYEQACN
       ::::.::::::::::::::::::::. ::::.:::::::::.::::::::::::::::::
CCDS68 AEGVSGPEKGGGSAAAAAAAAASGGS-SDNSIEHSDYRAKLTQIRQIYHTELEKYEQACN
        120       130       140        150       160       170     

           180       190       200       210       220       230   
pF1KB4 EFTTHVMNLLREQSRTRPISPKEIERMVSIIHRKFSSIQMQLKQSTCEAVMILRSRFLDA
       ::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS68 EFTTHVMNLLREQSRTRPISPKEIERMVGIIHRKFSSIQMQLKQSTCEAVMILRSRFLDA
         180       190       200       210       220       230     

           240       250       260       270       280       290   
pF1KB4 RRKRRNFNKQATEILNEYFYSHLSNPYPSEEAKEELAKKCGITVSQVSNWFGNKRIRYKK
       :::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::
CCDS68 RRKRRNFSKQATEILNEYFYSHLSNPYPSEEAKEELAKKCSITVSQVSNWFGNKRIRYKK
         240       250       260       270       280       290     

           300       310          320       330       340       350
pF1KB4 NIGKFQEEANIYAAKTAVTATNVSA---HGSQANSPSTPNSAGSSSSFNMSNSGDLFMSV
       ::::::::::.:::::::::... :   ...:.:::.:::: :::.:::. ::::.::..
CCDS68 NIGKFQEEANLYAAKTAVTAAHAVAAAVQNNQTNSPTTPNS-GSSGSFNLPNSGDMFMNM
         300       310       320       330        340       350    

              360       370       380       390       400       410
pF1KB4 QSLNGDSYQGAQVGANVQSQVDTLRHVISQTGGYSDGLAASQMYSPQGISANGGWQDATT
       ::::::::::.:::::::::::::::::.:::::::::.....:::....::::::::::
CCDS68 QSLNGDSYQGSQVGANVQSQVDTLRHVINQTGGYSDGLGGNSLYSPHNLNANGGWQDATT
          360       370       380       390       400       410    

              420       430
pF1KB4 PSSVTSPTEGPGSVHSDTSN
       ::::::::::::::::::::
CCDS68 PSSVTSPTEGPGSVHSDTSN
          420       430    

>>CCDS55654.1 PBX1 gene_id:5087|Hs108|chr1                (347 aa)
 initn: 2292 init1: 2182 opt: 2182  Z-score: 1793.9  bits: 340.7 E(32554): 1.3e-93
Smith-Waterman score: 2182; 99.1% identity (99.4% similar) in 337 aa overlap (1-337:1-337)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB4 MDEQPRLMHSHAGVGMAGHPGLSQHLQDGAGGTEGEGGRKQDIGDILQQIMTITDQSLDE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MDEQPRLMHSHAGVGMAGHPGLSQHLQDGAGGTEGEGGRKQDIGDILQQIMTITDQSLDE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB4 AQARKHALNCHRMKPALFNVLCEIKEKTVLSIRGAQEEEPTDPQLMRLDNMLLAEGVAGP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 AQARKHALNCHRMKPALFNVLCEIKEKTVLSIRGAQEEEPTDPQLMRLDNMLLAEGVAGP
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB4 EKGGGSAAAAAAAAASGGAGSDNSVEHSDYRAKLSQIRQIYHTELEKYEQACNEFTTHVM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 EKGGGSAAAAAAAAASGGAGSDNSVEHSDYRAKLSQIRQIYHTELEKYEQACNEFTTHVM
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB4 NLLREQSRTRPISPKEIERMVSIIHRKFSSIQMQLKQSTCEAVMILRSRFLDARRKRRNF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 NLLREQSRTRPISPKEIERMVSIIHRKFSSIQMQLKQSTCEAVMILRSRFLDARRKRRNF
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB4 NKQATEILNEYFYSHLSNPYPSEEAKEELAKKCGITVSQVSNWFGNKRIRYKKNIGKFQE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 NKQATEILNEYFYSHLSNPYPSEEAKEELAKKCGITVSQVSNWFGNKRIRYKKNIGKFQE
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB4 EANIYAAKTAVTATNVSAHGSQANSPSTPNSAGSSSSFNMSNSGDLFMSVQSLNGDSYQG
       :::::::::::::::::::::::::::::::::.  :                       
CCDS55 EANIYAAKTAVTATNVSAHGSQANSPSTPNSAGGYPSPCYQPDRRIQ             
              310       320       330       340                    

              370       380       390       400       410       420
pF1KB4 AQVGANVQSQVDTLRHVISQTGGYSDGLAASQMYSPQGISANGGWQDATTPSSVTSPTEG

>>CCDS48021.1 PBX3 gene_id:5090|Hs108|chr9                (359 aa)
 initn: 1200 init1: 1200 opt: 2071  Z-score: 1703.2  bits: 324.0 E(32554): 1.5e-88
Smith-Waterman score: 2071; 88.1% identity (97.5% similar) in 361 aa overlap (73-430:1-359)

             50        60        70        80        90       100  
pF1KB4 IGDILQQIMTITDQSLDEAQARKHALNCHRMKPALFNVLCEIKEKTVLSIRGAQEEEPTD
                                     ::::::.::::::::: :::::::::.: :
CCDS48                               MKPALFSVLCEIKEKTGLSIRGAQEEDPPD
                                             10        20        30

            110       120       130       140       150       160  
pF1KB4 PQLMRLDNMLLAEGVAGPEKGGGSAAAAAAAAASGGAGSDNSVEHSDYRAKLSQIRQIYH
       :::::::::::::::.::::::::::::::::::::. ::::.:::::::::.:::::::
CCDS48 PQLMRLDNMLLAEGVSGPEKGGGSAAAAAAAAASGGS-SDNSIEHSDYRAKLTQIRQIYH
               40        50        60         70        80         

            170       180       190       200       210       220  
pF1KB4 TELEKYEQACNEFTTHVMNLLREQSRTRPISPKEIERMVSIIHRKFSSIQMQLKQSTCEA
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::
CCDS48 TELEKYEQACNEFTTHVMNLLREQSRTRPISPKEIERMVGIIHRKFSSIQMQLKQSTCEA
      90       100       110       120       130       140         

            230       240       250       260       270       280  
pF1KB4 VMILRSRFLDARRKRRNFNKQATEILNEYFYSHLSNPYPSEEAKEELAKKCGITVSQVSN
       ::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::
CCDS48 VMILRSRFLDARRKRRNFSKQATEILNEYFYSHLSNPYPSEEAKEELAKKCSITVSQVSN
     150       160       170       180       190       200         

            290       300       310          320       330         
pF1KB4 WFGNKRIRYKKNIGKFQEEANIYAAKTAVTATNVSA---HGSQANSPSTPNSAGSSSSFN
       :::::::::::::::::::::.:::::::::... :   ...:.:::.:::: :::.:::
CCDS48 WFGNKRIRYKKNIGKFQEEANLYAAKTAVTAAHAVAAAVQNNQTNSPTTPNS-GSSGSFN
     210       220       230       240       250       260         

     340       350       360       370       380       390         
pF1KB4 MSNSGDLFMSVQSLNGDSYQGAQVGANVQSQVDTLRHVISQTGGYSDGLAASQMYSPQGI
       . ::::.::..::::::::::.:::::::::::::::::.:::::::::.....:::...
CCDS48 LPNSGDMFMNMQSLNGDSYQGSQVGANVQSQVDTLRHVINQTGGYSDGLGGNSLYSPHNL
      270       280       290       300       310       320        

     400       410       420       430
pF1KB4 SANGGWQDATTPSSVTSPTEGPGSVHSDTSN
       .::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 NANGGWQDATTPSSVTSPTEGPGSVHSDTSN
      330       340       350         

>>CCDS4748.1 PBX2 gene_id:5089|Hs108|chr6                 (430 aa)
 initn: 2181 init1: 1142 opt: 1864  Z-score: 1533.7  bits: 292.9 E(32554): 4.2e-79
Smith-Waterman score: 2114; 78.8% identity (91.9% similar) in 419 aa overlap (15-430:23-430)

                       10        20        30          40        50
pF1KB4         MDEQPRLMHSHAGVGMAGHPGLSQHLQDGAGGTEG-EGGR-KQDIGDILQQI
                             :  : ::      : .::. :  ::: :::::::::::
CCDS47 MDERLLGPPPPGGGRGGLGLVSGEPGGPGEPPGGGDPGGGSGGVPGGRGKQDIGDILQQI
               10        20        30        40        50        60

               60        70        80        90       100       110
pF1KB4 MTITDQSLDEAQARKHALNCHRMKPALFNVLCEIKEKTVLSIRGAQEEEPTDPQLMRLDN
       :::::::::::::.::::::::::::::.::::::::: ::::..:::::.:::::::::
CCDS47 MTITDQSLDEAQAKKHALNCHRMKPALFSVLCEIKEKTGLSIRSSQEEEPVDPQLMRLDN
               70        80        90       100       110       120

              120       130       140        150       160         
pF1KB4 MLLAEGVAGPEKGGGSAAAAAAAAASGGAGS-DNSVEHSDYRAKLSQIRQIYHTELEKYE
       ::::::::::::::::::::::::::::. : :::.::::::.::.:::.:::.::::::
CCDS47 MLLAEGVAGPEKGGGSAAAAAAAAASGGGVSPDNSIEHSDYRSKLAQIRHIYHSELEKYE
              130       140       150       160       170       180

     170       180       190       200       210       220         
pF1KB4 QACNEFTTHVMNLLREQSRTRPISPKEIERMVSIIHRKFSSIQMQLKQSTCEAVMILRSR
       ::::::::::::::::::::::..:::.::::::::::::.:::::::::::::::::::
CCDS47 QACNEFTTHVMNLLREQSRTRPVAPKEMERMVSIIHRKFSAIQMQLKQSTCEAVMILRSR
              190       200       210       220       230       240

     230       240       250       260       270       280         
pF1KB4 FLDARRKRRNFNKQATEILNEYFYSHLSNPYPSEEAKEELAKKCGITVSQVSNWFGNKRI
       :::::::::::.:::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 FLDARRKRRNFSKQATEVLNEYFYSHLSNPYPSEEAKEELAKKCGITVSQVSNWFGNKRI
              250       260       270       280       290       300

     290       300       310       320       330       340         
pF1KB4 RYKKNIGKFQEEANIYAAKTAVTATNVSAHGSQANSPSTPNSAGSSSSFNMSNSGDLFMS
       :::::::::::::::::.::::..:. ..: :...::. :.::::..:::.:.:::.:..
CCDS47 RYKKNIGKFQEEANIYAVKTAVSVTQ-GGH-SRTSSPTPPSSAGSGGSFNLSGSGDMFLG
              310       320         330       340       350        

     350       360       370       380       390       400         
pF1KB4 VQSLNGDSYQGAQVGANVQSQVDTLRHVISQTGGYSDGLAASQMYSPQGISANGGWQDAT
       . .::::::..        :::..::: ..  :::.:.:...:::::. . :::.::.:.
CCDS47 MPGLNGDSYSA--------SQVESLRHSMGP-GGYGDNLGGGQMYSPREMRANGSWQEAV
      360               370       380        390       400         

     410       420       430
pF1KB4 TPSSVTSPTEGPGSVHSDTSN
       :::::::::::::::::::::
CCDS47 TPSSVTSPTEGPGSVHSDTSN
     410       420       430

>>CCDS83416.1 PBX3 gene_id:5090|Hs108|chr9                (351 aa)
 initn: 2045 init1: 1190 opt: 1823  Z-score: 1501.2  bits: 286.6 E(32554): 2.7e-77
Smith-Waterman score: 1823; 81.8% identity (91.5% similar) in 352 aa overlap (1-342:1-347)

               10        20               30        40        50   
pF1KB4 MDEQPRLMHSHAGVGMAGHP---GLS----QHLQDGAGGTEGEGGRKQDIGDILQQIMTI
       ::.: :.... :::..:::    :..     : ..:: :     ::::::::::.:::::
CCDS83 MDDQSRMLQTLAGVNLAGHSVQGGMALPPPPHGHEGADG----DGRKQDIGDILHQIMTI
               10        20        30            40        50      

            60        70        80        90       100       110   
pF1KB4 TDQSLDEAQARKHALNCHRMKPALFNVLCEIKEKTVLSIRGAQEEEPTDPQLMRLDNMLL
       ::::::::::.::::::::::::::.::::::::: :::::::::.: ::::::::::::
CCDS83 TDQSLDEAQAKKHALNCHRMKPALFSVLCEIKEKTGLSIRGAQEEDPPDPQLMRLDNMLL
         60        70        80        90       100       110      

           120       130       140       150       160       170   
pF1KB4 AEGVAGPEKGGGSAAAAAAAAASGGAGSDNSVEHSDYRAKLSQIRQIYHTELEKYEQACN
       ::::.::::::::::::::::::::. ::::.:::::::::.::::::::::::::::::
CCDS83 AEGVSGPEKGGGSAAAAAAAAASGGS-SDNSIEHSDYRAKLTQIRQIYHTELEKYEQACN
        120       130       140        150       160       170     

           180       190       200       210       220       230   
pF1KB4 EFTTHVMNLLREQSRTRPISPKEIERMVSIIHRKFSSIQMQLKQSTCEAVMILRSRFLDA
       ::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 EFTTHVMNLLREQSRTRPISPKEIERMVGIIHRKFSSIQMQLKQSTCEAVMILRSRFLDA
         180       190       200       210       220       230     

           240       250       260       270       280       290   
pF1KB4 RRKRRNFNKQATEILNEYFYSHLSNPYPSEEAKEELAKKCGITVSQVSNWFGNKRIRYKK
       :::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::
CCDS83 RRKRRNFSKQATEILNEYFYSHLSNPYPSEEAKEELAKKCSITVSQVSNWFGNKRIRYKK
         240       250       260       270       280       290     

           300       310          320       330       340       350
pF1KB4 NIGKFQEEANIYAAKTAVTATNVSA---HGSQANSPSTPNSAGSSSSFNMSNSGDLFMSV
       ::::::::::.:::::::::... :   ...:.:::.::::.:   :  .:.        
CCDS83 NIGKFQEEANLYAAKTAVTAAHAVAAAVQNNQTNSPTTPNSGGYPPSCYQSDGRLQ    
         300       310       320       330       340       350     

              360       370       380       390       400       410
pF1KB4 QSLNGDSYQGAQVGANVQSQVDTLRHVISQTGGYSDGLAASQMYSPQGISANGGWQDATT

>>CCDS12406.1 PBX4 gene_id:80714|Hs108|chr19              (374 aa)
 initn: 1603 init1: 1042 opt: 1580  Z-score: 1302.9  bits: 250.0 E(32554): 3e-66
Smith-Waterman score: 1610; 65.9% identity (81.2% similar) in 393 aa overlap (39-430:15-374)

       10        20        30        40        50        60        
pF1KB4 HSHAGVGMAGHPGLSQHLQDGAGGTEGEGGRKQDIGDILQQIMTITDQSLDEAQARKHAL
                                     :. : .:.:::::.::::::::::::::::
CCDS12                 MAAPPRPAPSPPAPRRLDTSDVLQQIMAITDQSLDEAQARKHAL
                               10        20        30        40    

       70        80        90       100       110       120        
pF1KB4 NCHRMKPALFNVLCEIKEKTVLSIRGAQEEEPTDPQLMRLDNMLLAEGVAGPEKGG-GSA
       ::::::::::.::::::::::.:::: :.:.: : ::.:::::::::::  ::: : :.:
CCDS12 NCHRMKPALFSVLCEIKEKTVVSIRGIQDEDPPDAQLLRLDNMLLAEGVCRPEKRGRGGA
           50        60        70        80        90       100    

       130       140       150       160       170       180       
pF1KB4 AAAAAAAASGGAGSDNSVEHSDYRAKLSQIRQIYHTELEKYEQACNEFTTHVMNLLREQS
       .: :..:. ::  .:::.:::::::::::::::::.::::::::: :::::: :::.:::
CCDS12 VARAGTATPGGCPNDNSIEHSDYRAKLSQIRQIYHSELEKYEQACREFTTHVTNLLQEQS
          110       120       130       140       150       160    

       190       200       210       220       230       240       
pF1KB4 RTRPISPKEIERMVSIIHRKFSSIQMQLKQSTCEAVMILRSRFLDARRKRRNFNKQATEI
       : ::.:::::::::. :: :::.:::::::::::::: ::::.::::::::::.:::::.
CCDS12 RMRPVSPKEIERMVGAIHGKFSAIQMQLKQSTCEAVMTLRSRLLDARRKRRNFSKQATEV
          170       180       190       200       210       220    

       250       260       270       280       290       300       
pF1KB4 LNEYFYSHLSNPYPSEEAKEELAKKCGITVSQVSNWFGNKRIRYKKNIGKFQEEANIYAA
       :::::::::.:::::::::::::.: :.:.:::::::::::::::::.:::::::.::..
CCDS12 LNEYFYSHLNNPYPSEEAKEELARKGGLTISQVSNWFGNKRIRYKKNMGKFQEEATIYTG
          230       240       250       260       270       280    

       310       320       330       340       350       360       
pF1KB4 KTAVTATNVSAHGSQANSPSTPNSAGSSSSFNMSNSGDLFMSVQSLNGDSYQGAQVGANV
       :::: .:.:.. :..:.  ::: :.:::. : . ..:: :.....:   : :    :. .
CCDS12 KTAVDTTEVGVPGNHASCLSTP-SSGSSGPFPLPSAGDAFLTLRTLA--SLQPPPGGGCL
          290       300        310       320       330         340 

       370       380       390       400       410       420       
pF1KB4 QSQVDTLRHVISQTGGYSDGLAASQMYSPQGISANGGWQDATTPSSVTSPTEGPGSVHSD
       :::                              :.:.:: ::   ...::.  :::..:.
CCDS12 QSQ------------------------------AQGSWQGATPQPATASPAGDPGSINSS
                                           350       360       370 

       430
pF1KB4 TSN
       :::
CCDS12 TSN
          




430 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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 start: Thu Nov  3 21:21:36 2016 done: Thu Nov  3 21:21:37 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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