Result of FASTA (ccds) for
pF1KB4032
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4032, 1134 aa
1>>>pF1KB4032 1134 - 1134 aa - 1134 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 15.1195+/-0.0013; mu= -22.8729+/- 0.078
mean_var=514.6007+/-105.243, 0's: 0 Z-trim(114.2): 41 B-trim: 356 in 1/53
Lambda= 0.056538
statistics sampled from 14745 (14779) to 14745 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.746), E-opt: 0.2 (0.454), width: 16
Scan time: 4.900
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS44319.1 TP53BP2 gene_id:7159|Hs108|chr1 (1134) 7629 637.7 4.4e-182
CCDS1538.1 TP53BP2 gene_id:7159|Hs108|chr1 (1005) 6718 563.4 9.3e-160
CCDS41997.1 PPP1R13B gene_id:23368|Hs108|chr14 (1090) 1619 147.5 1.6e-34
CCDS33050.1 PPP1R13L gene_id:10848|Hs108|chr19 ( 828) 938 91.9 6.6e-18
>>CCDS44319.1 TP53BP2 gene_id:7159|Hs108|chr1 (1134 aa)
initn: 7629 init1: 7629 opt: 7629 Z-score: 3382.4 bits: 637.7 E(32554): 4.4e-182
Smith-Waterman score: 7629; 100.0% identity (100.0% similar) in 1134 aa overlap (1-1134:1-1134)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MRFGSKMMPMFLTVYLSNNEQHFTEVPVTPETICRDVVDLCKEPGESDCHLAEVWCGSER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MRFGSKMMPMFLTVYLSNNEQHFTEVPVTPETICRDVVDLCKEPGESDCHLAEVWCGSER
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 PVADNERMFDVLQRFGSQRNEVRFFLRHERPPGRDIVSGPRSQDPSLKRNGVKVPGEYRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 PVADNERMFDVLQRFGSQRNEVRFFLRHERPPGRDIVSGPRSQDPSLKRNGVKVPGEYRR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 KENGVNSPRMDLTLAELQEMASRQQQQIEAQQQLLATKEQRLKFLKQQDQRQQQQVAEQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 KENGVNSPRMDLTLAELQEMASRQQQQIEAQQQLLATKEQRLKFLKQQDQRQQQQVAEQE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 KLKRLKEIAENQEAKLKKVRALKGHVEQKRLSNGKLVEEIEQMNNLFQQKQRELVLAVSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 KLKRLKEIAENQEAKLKKVRALKGHVEQKRLSNGKLVEEIEQMNNLFQQKQRELVLAVSK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 VEELTRQLEMLKNGRIDSHHDNQSAVAELDRLYKELQLRNKLNQEQNAKLQQQRECLNKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 VEELTRQLEMLKNGRIDSHHDNQSAVAELDRLYKELQLRNKLNQEQNAKLQQQRECLNKR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 NSEVAVMDKRVNELRDRLWKKKAALQQKENLPVSSDGNLPQQAASAPSRVAAVGPYIQSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 NSEVAVMDKRVNELRDRLWKKKAALQQKENLPVSSDGNLPQQAASAPSRVAAVGPYIQSS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 TMPRMPSRPELLVKPALPDGSLVIQASEGPMKIQTLPNMRSGAASQTKGSKIHPVGPDWS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TMPRMPSRPELLVKPALPDGSLVIQASEGPMKIQTLPNMRSGAASQTKGSKIHPVGPDWS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 PSNADLFPSQGSASVPQSTGNALDQVDDGEVPLREKEKKVRPFSMFDAVDQSNAPPSFGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 PSNADLFPSQGSASVPQSTGNALDQVDDGEVPLREKEKKVRPFSMFDAVDQSNAPPSFGT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 LRKNQSSEDILRDAQVANKNVAKVPPPVPTKPKQINLPYFGQTNQPPSDIKPDGSSQQLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LRKNQSSEDILRDAQVANKNVAKVPPPVPTKPKQINLPYFGQTNQPPSDIKPDGSSQQLS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 TVVPSMGTKPKPAGQQPRVLLSPSIPSVGQDQTLSPGSKQESPPAAAVRPFTPQPSKDTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TVVPSMGTKPKPAGQQPRVLLSPSIPSVGQDQTLSPGSKQESPPAAAVRPFTPQPSKDTL
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 LPPFRKPQTVAASSIYSMYTQQQAPGKNFQQAVQSALTKTHTRGPHFSSVYGKPVIAAAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LPPFRKPQTVAASSIYSMYTQQQAPGKNFQQAVQSALTKTHTRGPHFSSVYGKPVIAAAQ
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB4 NQQQHPENIYSNSQGKPGSPEPETEPVSSVQENHENERIPRPLSPTKLLPFLSNPYRNQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 NQQQHPENIYSNSQGKPGSPEPETEPVSSVQENHENERIPRPLSPTKLLPFLSNPYRNQS
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB4 DADLEALRKKLSNAPRPLKKRSSITEPEGPNGPNIQKLLYQRTTIAAMETISVPSYPSKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 DADLEALRKKLSNAPRPLKKRSSITEPEGPNGPNIQKLLYQRTTIAAMETISVPSYPSKS
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB4 ASVTASSESPVEIQNPYLHVEPEKEVVSLVPESLSPEDVGNASTENSDMPAPSPGLDYEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ASVTASSESPVEIQNPYLHVEPEKEVVSLVPESLSPEDVGNASTENSDMPAPSPGLDYEP
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB4 EGVPDNSPNLQNNPEEPNPEAPHVLDVYLEEYPPYPPPPYPSGEPEGPGEDSVSMRPPEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 EGVPDNSPNLQNNPEEPNPEAPHVLDVYLEEYPPYPPPPYPSGEPEGPGEDSVSMRPPEI
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB4 TGQVSLPPGKRTNLRKTGSERIAHGMRVKFNPLALLLDSSLEGEFDLVQRIIYEVDDPSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TGQVSLPPGKRTNLRKTGSERIAHGMRVKFNPLALLLDSSLEGEFDLVQRIIYEVDDPSL
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB4 PNDEGITALHNAVCAGHTEIVKFLVQFGVNVNAADSDGWTPLHCAASCNNVQVCKFLVES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 PNDEGITALHNAVCAGHTEIVKFLVQFGVNVNAADSDGWTPLHCAASCNNVQVCKFLVES
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB4 GAAVFAMTYSDMQTAADKCEEMEEGYTQCSQFLYGVQEKMGIMNKGVIYALWDYEPQNDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 GAAVFAMTYSDMQTAADKCEEMEEGYTQCSQFLYGVQEKMGIMNKGVIYALWDYEPQNDD
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130
pF1KB4 ELPMKEGDCMTIIHREDEDEIEWWWARLNDKEGYVPRNLLGLYPRIKPRQRSLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ELPMKEGDCMTIIHREDEDEIEWWWARLNDKEGYVPRNLLGLYPRIKPRQRSLA
1090 1100 1110 1120 1130
>>CCDS1538.1 TP53BP2 gene_id:7159|Hs108|chr1 (1005 aa)
initn: 6718 init1: 6718 opt: 6718 Z-score: 2981.6 bits: 563.4 E(32554): 9.3e-160
Smith-Waterman score: 6718; 100.0% identity (100.0% similar) in 1005 aa overlap (130-1134:1-1005)
100 110 120 130 140 150
pF1KB4 PRSQDPSLKRNGVKVPGEYRRKENGVNSPRMDLTLAELQEMASRQQQQIEAQQQLLATKE
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 MDLTLAELQEMASRQQQQIEAQQQLLATKE
10 20 30
160 170 180 190 200 210
pF1KB4 QRLKFLKQQDQRQQQQVAEQEKLKRLKEIAENQEAKLKKVRALKGHVEQKRLSNGKLVEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 QRLKFLKQQDQRQQQQVAEQEKLKRLKEIAENQEAKLKKVRALKGHVEQKRLSNGKLVEE
40 50 60 70 80 90
220 230 240 250 260 270
pF1KB4 IEQMNNLFQQKQRELVLAVSKVEELTRQLEMLKNGRIDSHHDNQSAVAELDRLYKELQLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 IEQMNNLFQQKQRELVLAVSKVEELTRQLEMLKNGRIDSHHDNQSAVAELDRLYKELQLR
100 110 120 130 140 150
280 290 300 310 320 330
pF1KB4 NKLNQEQNAKLQQQRECLNKRNSEVAVMDKRVNELRDRLWKKKAALQQKENLPVSSDGNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 NKLNQEQNAKLQQQRECLNKRNSEVAVMDKRVNELRDRLWKKKAALQQKENLPVSSDGNL
160 170 180 190 200 210
340 350 360 370 380 390
pF1KB4 PQQAASAPSRVAAVGPYIQSSTMPRMPSRPELLVKPALPDGSLVIQASEGPMKIQTLPNM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 PQQAASAPSRVAAVGPYIQSSTMPRMPSRPELLVKPALPDGSLVIQASEGPMKIQTLPNM
220 230 240 250 260 270
400 410 420 430 440 450
pF1KB4 RSGAASQTKGSKIHPVGPDWSPSNADLFPSQGSASVPQSTGNALDQVDDGEVPLREKEKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 RSGAASQTKGSKIHPVGPDWSPSNADLFPSQGSASVPQSTGNALDQVDDGEVPLREKEKK
280 290 300 310 320 330
460 470 480 490 500 510
pF1KB4 VRPFSMFDAVDQSNAPPSFGTLRKNQSSEDILRDAQVANKNVAKVPPPVPTKPKQINLPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 VRPFSMFDAVDQSNAPPSFGTLRKNQSSEDILRDAQVANKNVAKVPPPVPTKPKQINLPY
340 350 360 370 380 390
520 530 540 550 560 570
pF1KB4 FGQTNQPPSDIKPDGSSQQLSTVVPSMGTKPKPAGQQPRVLLSPSIPSVGQDQTLSPGSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 FGQTNQPPSDIKPDGSSQQLSTVVPSMGTKPKPAGQQPRVLLSPSIPSVGQDQTLSPGSK
400 410 420 430 440 450
580 590 600 610 620 630
pF1KB4 QESPPAAAVRPFTPQPSKDTLLPPFRKPQTVAASSIYSMYTQQQAPGKNFQQAVQSALTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 QESPPAAAVRPFTPQPSKDTLLPPFRKPQTVAASSIYSMYTQQQAPGKNFQQAVQSALTK
460 470 480 490 500 510
640 650 660 670 680 690
pF1KB4 THTRGPHFSSVYGKPVIAAAQNQQQHPENIYSNSQGKPGSPEPETEPVSSVQENHENERI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 THTRGPHFSSVYGKPVIAAAQNQQQHPENIYSNSQGKPGSPEPETEPVSSVQENHENERI
520 530 540 550 560 570
700 710 720 730 740 750
pF1KB4 PRPLSPTKLLPFLSNPYRNQSDADLEALRKKLSNAPRPLKKRSSITEPEGPNGPNIQKLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 PRPLSPTKLLPFLSNPYRNQSDADLEALRKKLSNAPRPLKKRSSITEPEGPNGPNIQKLL
580 590 600 610 620 630
760 770 780 790 800 810
pF1KB4 YQRTTIAAMETISVPSYPSKSASVTASSESPVEIQNPYLHVEPEKEVVSLVPESLSPEDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 YQRTTIAAMETISVPSYPSKSASVTASSESPVEIQNPYLHVEPEKEVVSLVPESLSPEDV
640 650 660 670 680 690
820 830 840 850 860 870
pF1KB4 GNASTENSDMPAPSPGLDYEPEGVPDNSPNLQNNPEEPNPEAPHVLDVYLEEYPPYPPPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 GNASTENSDMPAPSPGLDYEPEGVPDNSPNLQNNPEEPNPEAPHVLDVYLEEYPPYPPPP
700 710 720 730 740 750
880 890 900 910 920 930
pF1KB4 YPSGEPEGPGEDSVSMRPPEITGQVSLPPGKRTNLRKTGSERIAHGMRVKFNPLALLLDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 YPSGEPEGPGEDSVSMRPPEITGQVSLPPGKRTNLRKTGSERIAHGMRVKFNPLALLLDS
760 770 780 790 800 810
940 950 960 970 980 990
pF1KB4 SLEGEFDLVQRIIYEVDDPSLPNDEGITALHNAVCAGHTEIVKFLVQFGVNVNAADSDGW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 SLEGEFDLVQRIIYEVDDPSLPNDEGITALHNAVCAGHTEIVKFLVQFGVNVNAADSDGW
820 830 840 850 860 870
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KB4 TPLHCAASCNNVQVCKFLVESGAAVFAMTYSDMQTAADKCEEMEEGYTQCSQFLYGVQEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 TPLHCAASCNNVQVCKFLVESGAAVFAMTYSDMQTAADKCEEMEEGYTQCSQFLYGVQEK
880 890 900 910 920 930
1060 1070 1080 1090 1100 1110
pF1KB4 MGIMNKGVIYALWDYEPQNDDELPMKEGDCMTIIHREDEDEIEWWWARLNDKEGYVPRNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 MGIMNKGVIYALWDYEPQNDDELPMKEGDCMTIIHREDEDEIEWWWARLNDKEGYVPRNL
940 950 960 970 980 990
1120 1130
pF1KB4 LGLYPRIKPRQRSLA
:::::::::::::::
CCDS15 LGLYPRIKPRQRSLA
1000
>>CCDS41997.1 PPP1R13B gene_id:23368|Hs108|chr14 (1090 aa)
initn: 3077 init1: 1282 opt: 1619 Z-score: 733.3 bits: 147.5 E(32554): 1.6e-34
Smith-Waterman score: 3300; 49.1% identity (71.6% similar) in 1162 aa overlap (7-1134:1-1090)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MRFGSKMMPMFLTVYLSNNEQHFTEVPVTPETICRDVVDLCKEPGESDCHLAEVWCGSER
::::.:::.:::::: .::::.:::: :::::..::::::..::::::: :.::
CCDS41 MMPMILTVFLSNNEQILTEVPITPETTCRDVVEFCKEPGEGSCHLAEVWRGNER
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KB4 PVADNERMFDVLQRFGSQRNEVRFFLRHERPPGRDIVSGPR-SQDPSLKRNGVKVPGEYR
:. .. :.. ::..: .:.::.:::::: : .. .: : .:. .:: ..:::: .
CCDS41 PIPFDHMMYEHLQKWGPRREEVKFFLRHEDSPTENSEQGGRQTQEQRTQRNVINVPGE-K
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB4 RKENGVNSPRMDLTLAELQEMASRQQQQIEAQQQLLATKEQRLKFLKQQDQRQQQQVAEQ
: ::::..::..:::.:::.::.::::::: :::.:..:::::.:::::..::::...:.
CCDS41 RTENGVGNPRVELTLSELQDMAARQQQQIENQQQMLVAKEQRLHFLKQQERRQQQSISEN
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB4 EKLKRLKEIAENQEAKLKKVRALKGHVEQKRLSNGKLVEEIEQMNNLFQQKQRELVLAVS
:::..::: .: :: ::::.::..:.:. ... ::.: :::... .::.:..:. :.
CCDS41 EKLQKLKERVEAQENKLKKIRAMRGQVDYSKIMNGNLSAEIERFSAMFQEKKQEVQTAIL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 KVEELTRQLEMLKNGRIDSHHDNQS-----AVAELDRLYKELQLRNKLNQEQNAKLQQQR
.:..:..::: ::.:.... .. .. :..:: :::.:::.::.::::::.:::::.
CCDS41 RVDQLSQQLEDLKKGKLNGFQSYNGKLTGPAAVELKRLYQELQIRNQLNQEQNSKLQQQK
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB4 ECLNKRNSEVAVMDKRVNELRDRLWKKKAALQQKENLPVSSDGNLPQQAASAPSRVAAVG
: ::::: :::.::::..:::.::. :: :.. .. .:: ::. :. .::::::
CCDS41 ELLNKRNMEVAMMDKRISELRERLYGKKIQLNRVNG--TSS----PQSPLSTSGRVAAVG
300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KB4 PYIQSSTMPRMPSRPELLVKPALPDG-SLVIQASEGPMKIQT---LPNMRSGAASQTKGS
:::: .: : : .: : :.. :.. .:..: : . :.......:..:
CCDS41 PYIQ---VPSAGSFP-VLGDPIKPQSLSIASNAAHGRSKSANDGNWPTLKQNSSSSVKPV
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KB4 KIHPVGPDWSPSNADLFPSQGSASVPQSTGNALDQVDDGEVPLREKEKKVRPFSMFDAVD
.. .: ::. ... .::..: .:: .. . . :: : . .:
CCDS41 QV--AGADWKDPSVEGSVKQGTVSSQPVPFSALGPTEKPGIEI----GKVPP--PIPGVG
410 420 430 440 450
480 490 500 510 520
pF1KB4 QSNAPPSFGTLRKNQSSEDILRDAQVANKNVAKVPPP---VPTKPKQINLPYFGQTNQPP
.. :::.:: . . ... .. ...: : .:.. . :: :.: ::
CCDS41 KQ-LPPSYGTY-PSPTPLGPGSTSSLERRKEGSLPRPSAGLPSRQRPTLLPATGSTPQP-
460 470 480 490 500 510
530 540 550 560 570 580
pF1KB4 SDIKPDGSSQQLST--VVPSMGTKPKPAGQQPRVLLSPSIPSVGQDQTLSPGSKQESPPA
:::::.. :: : : ::: : :..:. :. :: : : .
CCDS41 ------GSSQQIQQRISVPPSPTYP-PAG--P-----PAFPA-GD-------SKPELPLT
520 530 540 550
590 600 610 620 630 640
pF1KB4 AAVRPFTPQPSKDTLLPPFRKPQTVAASSIYSMYTQQQAPGKNFQQAVQSALTKTHTRGP
.:.::: . .. : . :::: .::::::: :: .: ::.: :..:::.:.
CCDS41 VAIRPFLADKGSRPQ-SPRKGPQTVNSSSIYSMYLQQATPPKNYQPAAHSALNKS-----
560 570 580 590 600
650 660 670 680 690
pF1KB4 HFSSVYGKPVIAAAQNQQQHPENIYSNSQGKPGSPEPETEPVSSVQENHEN---------
..::::::. ..... . : . .: . :.:.:. :. .: ...
CCDS41 -VKAVYGKPVLPSGSTSPS-PLPFLHGSLST-GTPQPQPPSESTEKEPEQDGPAAPADGS
610 620 630 640 650 660
700 710 720 730 740 750
pF1KB4 --ERIPRPLSPTKLLPFLSNPYRNQSDADLEALRKKLSNAPRPLKKRSSITEPEGPNGPN
: .::::::::: :.. .: : ::::::::::.::.::::::::::::::::::.:::
CCDS41 TVESLPRPLSPTKLTPIVHSPLRYQSDADLEALRRKLANAPRPLKKRSSITEPEGPGGPN
670 680 690 700 710 720
760 770 780 790 800 810
pF1KB4 IQKLLYQRTTIAAMETISVPSY-PSKSAS---VTASSESPVEIQNPYLHVEPEKEVVSLV
:::::::: . : ..: : :: : . . :. .. : :. : . .. .
CCDS41 IQKLLYQRFNTLAGGMEGTPFYQPSPSQDFMGTLADVDNGNTNANGNLEELPPAQPTAPL
730 740 750 760 770 780
820 830 840 850 860 870
pF1KB4 PESLSPEDVGNASTENSDMPAPSPGLDYEPEGVPDNSPNLQNNPEEPNPEAPHVLDVYLE
: .: :.. .: ::: ::: . :. .. :: . . .
CCDS41 PAEPAP------SSDANDNELPSP----EPEEL--ICPQTTHQTAEPAEDNNN----NVA
790 800 810 820
880 890 900 910 920
pF1KB4 EYPPYPPPPYPSGEPEGPGEDSVSMRPPEITGQVSLPPG----KRTNLRKTGSERIAHGM
: : : .: .:::..: :: .: ::. :::::.: .::: .::.
CCDS41 TVPTTEQIPSPVAEAPSPGEEQV---PPAPLPPASHPPATSTNKRTNLKKPNSERTGHGL
830 840 850 860 870 880
930 940 950 960 970 980
pF1KB4 RVKFNPLALLLDSSLEGEFDLVQRIIYEVDDPSLPNDEGITALHNAVCAGHTEIVKFLVQ
::.:::::::::.::::::::::::::::.::: ::::::: ::::::::: .:::::..
CCDS41 RVRFNPLALLLDASLEGEFDLVQRIIYEVEDPSKPNDEGITPLHNAVCAGHHHIVKFLLD
890 900 910 920 930 940
990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KB4 FGVNVNAADSDGWTPLHCAASCNNVQVCKFLVESGAAVFAMTYSDMQTAADKCEEMEEGY
:::::::::::::::::::::::.:..:: :::::::.:: : ::..:::::::::::::
CCDS41 FGVNVNAADSDGWTPLHCAASCNSVHLCKQLVESGAAIFASTISDIETAADKCEEMEEGY
950 960 970 980 990 1000
1050 1060 1070 1080 1090 1100
pF1KB4 TQCSQFLYGVQEKMGIMNKGVIYALWDYEPQNDDELPMKEGDCMTIIHREDEDEIEWWWA
::::::::::::.:.::::: ::::::: ::.::: ..::: .::..:.::.: :::::
CCDS41 IQCSQFLYGVQEKLGVMNKGVAYALWDYEAQNSDELSFHEGDALTILRRKDESETEWWWA
1010 1020 1030 1040 1050 1060
1110 1120 1130
pF1KB4 RLNDKEGYVPRNLLGLYPRIKPRQRSLA
::.:.:::::.::::::::::::::.::
CCDS41 RLGDREGYVPKNLLGLYPRIKPRQRTLA
1070 1080 1090
>>CCDS33050.1 PPP1R13L gene_id:10848|Hs108|chr19 (828 aa)
initn: 1047 init1: 826 opt: 938 Z-score: 435.0 bits: 91.9 E(32554): 6.6e-18
Smith-Waterman score: 1055; 30.2% identity (55.8% similar) in 798 aa overlap (414-1132:56-826)
390 400 410 420 430 440
pF1KB4 IQASEGPMKIQTLPNMRSGAASQTKGSKIHPVGPDWSPSNADLFPSQGSASVPQ---STG
: ::. .: . : .:.:.:. : :
CCDS33 DLKQMELDTAAAKVDELTKQLESLWSDSPAPPGPQAGPPSRP--PRYSSSSIPEPFGSRG
30 40 50 60 70 80
450 460 470 480
pF1KB4 NALDQVDDG-EVPLREKEKK--VRPFSMFDAVDQSNAP--P------SFGTLRKNQSSED
. . :: ..:. ..:. ..:.: .. . ..: : ..:.: . : .
CCDS33 SPRKAATDGADTPFGRSESAPTLHPYSPLSPKGRPSSPRTPLYLQPDAYGSLDRATSPRP
90 100 110 120 130 140
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 ILRDAQVANKNVAKVPPPVPTKPKQINLP----YFGQTNQPPSDIKPDGSSQQLSTVVPS
:. .. . : : : : .: . : ..:....: .. .: . . :
CCDS33 RAFDGAGSSLGRAPSPRPGPGPLRQQGPPTPFDFLGRAGSPRGSPLAEGPQ----AFFPE
150 160 170 180 190
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 MGTKPKP---AGQQPRVLLSPSIPSVGQDQTLSPGSKQESPPAAAVRPFTPQPSKDTLLP
: .:.: : . : .. :. . : ....: . .. . :: .: .
CCDS33 RGPSPRPPATAYDAPASAFGSSLLGSG-GSAFAPPLRAQDDLTLRRRPPKAWNESDLDVA
200 210 220 230 240 250
610 620 630 640 650
pF1KB4 PFRKPQTVAASSIYSMYTQQQAPGKNFQQAVQSALTKTHTRGPHFSSVYGKPV---IAAA
.::. .:. ..... .:. .. .:.: : . : ..
CCDS33 YEKKPSQTASYERLDVFARPASPSLQLLPWRESSLDGLGGTGKDNLTSATLPRNYKVSPL
260 270 280 290 300 310
660 670 680 690 700 710
pF1KB4 QNQQQHPENIYSNSQGK--PGSPEPET-EPVSSVQ---ENHENERIPR--PLSPTKLLPF
.... . : : :. :.. :.. .::: . . . . :: :. : ...
CCDS33 ASDRRSDAGSYRRSLGSAGPSGTLPRSWQPVSRIPMPPSSPQPRGAPRQRPI-PLSMIFK
320 330 340 350 360 370
720 730 740 750 760
pF1KB4 LSNPY--RNQSDADL-------EALRKKLSNAPRPLKKRSSITEPEGPNGPNIQKLLYQR
:.: . .. : : : .: ::. :.: . .: .:. : :. : :
CCDS33 LQNAFWEHGASRAMLPGSPLFTRAPPPKLQPQPQPQPQPQSQPQPQLPPQPQTQP---QT
380 390 400 410 420 430
770 780 790 800 810 820
pF1KB4 TTIAAMETISVPSYPSKSASVTASSESPVEIQNPYLHVEPEKEVVSLVPESLSPEDVGNA
: : :..:... . .:.: .: ..::: :. .:. : :: ..
CCDS33 PTPA-------PQHPQQTWPPV--NEGP---PKPPTELEPEPEIEGLLTPVLEAGDVDEG
440 450 460 470 480
830 840 850 860 870
pF1KB4 STENSDMPAP-SPGLDYEPEGVPDNSPNLQNNPEEPNP--------EAPHVL--DVYLEE
. :. .:.: : ..::. . : : : .:: : .. ..
CCDS33 PVARPLSPTRLQPALPPEAQSVPELEEVARVLAEIPRPLKRRGSMEQAPAVALPPTHKKQ
490 500 510 520 530 540
880 890 900 910
pF1KB4 YP------------PYPPPPYPSGEP--EG-------PGEDSVSMRPPEITGQVSLPPGK
: : : : : : :: :. . :: .: : :: .
CCDS33 YQQIISRLFHRHGGPGPGGPEPELSPITEGSEARAGPPAPAPPAPIPPPAPSQSS-PPEQ
550 560 570 580 590 600
920 930 940 950 960
pF1KB4 ------RTNLRKTGSERIAHGMRVKFNPLALLLDSSLEGEFDLVQRIIYEVDDPSLPNDE
:. :::.:: : :. :...:::.::::..: ::...::. . :..::: ::.:
CCDS33 PQSMEMRSVLRKAGSPRKAR--RARLNPLVLLLDAALTGELEVVQQAVKEMNDPSQPNEE
610 620 630 640 650
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB4 GITALHNAVCAGHTEIVKFLVQFGVNVNAADSDGWTPLHCAASCNNVQVCKFLVESGAAV
::::::::.:... :: ::. :.:::. :: ::::::::::::.. .: ::. :::.
CCDS33 GITALHNAICGANYSIVDFLITAGANVNSPDSHGWTPLHCAASCNDTVICMALVQHGAAI
660 670 680 690 700 710
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB4 FAMTYSDMQTAADKCEEMEEGYTQCSQFLYGVQEKMGIMNKGVIYALWDYEPQNDDELPM
:: : :: :: .::. ..:::..:. .: :...::.::.:..:::::: . ::: .
CCDS33 FATTLSDGATAFEKCDPYREGYADCATYLADVEQSMGLMNSGAVYALWDYSAEFGDELSF
720 730 740 750 760 770
1090 1100 1110 1120 1130
pF1KB4 KEGDCMTIIHREDEDEIEWWWARLNDKEGYVPRNLLGLYPRIKPRQRSLA
.::. .:...:. .: .:::: :. .::::::: .::.::.:: :::
CCDS33 REGESVTVLRRDGPEETDWWWAALHGQEGYVPRNYFGLFPRVKP-QRSKV
780 790 800 810 820
1134 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Wed Nov 2 22:51:31 2016 done: Wed Nov 2 22:51:32 2016
Total Scan time: 4.900 Total Display time: 0.140
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]