FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB4032, 1134 aa 1>>>pF1KB4032 1134 - 1134 aa - 1134 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 17.0372+/-0.000548; mu= -34.1015+/- 0.034 mean_var=619.6946+/-125.352, 0's: 0 Z-trim(122.3): 74 B-trim: 1434 in 1/56 Lambda= 0.051521 statistics sampled from 40221 (40297) to 40221 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.757), E-opt: 0.2 (0.472), width: 16 Scan time: 13.980 The best scores are: opt bits E(85289) NP_001026855 (OMIM: 602143) apoptosis-stimulating (1134) 7629 582.9 3.7e-165 XP_016857709 (OMIM: 602143) PREDICTED: apoptosis-s (1067) 7150 547.3 1.8e-154 XP_011542570 (OMIM: 602143) PREDICTED: apoptosis-s (1067) 7150 547.3 1.8e-154 NP_005417 (OMIM: 602143) apoptosis-stimulating of (1005) 6718 515.2 8.1e-145 XP_011542571 (OMIM: 602143) PREDICTED: apoptosis-s (1005) 6718 515.2 8.1e-145 XP_016876605 (OMIM: 606455) PREDICTED: apoptosis-s (1125) 2854 228.0 2.6e-58 XP_016876606 (OMIM: 606455) PREDICTED: apoptosis-s (1122) 2830 226.2 8.8e-58 XP_016876607 (OMIM: 606455) PREDICTED: apoptosis-s (1122) 2830 226.2 8.8e-58 XP_011534895 (OMIM: 606455) PREDICTED: apoptosis-s (1193) 2831 226.3 8.9e-58 XP_016876608 (OMIM: 606455) PREDICTED: apoptosis-s ( 873) 1840 152.6 1e-35 NP_056131 (OMIM: 606455) apoptosis-stimulating of (1090) 1619 136.2 1.1e-30 XP_005267544 (OMIM: 606455) PREDICTED: apoptosis-s (1158) 1619 136.2 1.1e-30 XP_016881666 (OMIM: 607463) PREDICTED: relA-associ ( 828) 938 85.5 1.5e-15 XP_016881667 (OMIM: 607463) PREDICTED: relA-associ ( 828) 938 85.5 1.5e-15 NP_001135974 (OMIM: 607463) relA-associated inhibi ( 828) 938 85.5 1.5e-15 NP_006654 (OMIM: 607463) relA-associated inhibitor ( 828) 938 85.5 1.5e-15 >>NP_001026855 (OMIM: 602143) apoptosis-stimulating of p (1134 aa) initn: 7629 init1: 7629 opt: 7629 Z-score: 3086.0 bits: 582.9 E(85289): 3.7e-165 Smith-Waterman score: 7629; 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100.0% identity (100.0% similar) in 1005 aa overlap (130-1134:1-1005) 100 110 120 130 140 150 pF1KB4 PRSQDPSLKRNGVKVPGEYRRKENGVNSPRMDLTLAELQEMASRQQQQIEAQQQLLATKE :::::::::::::::::::::::::::::: NP_005 MDLTLAELQEMASRQQQQIEAQQQLLATKE 10 20 30 160 170 180 190 200 210 pF1KB4 QRLKFLKQQDQRQQQQVAEQEKLKRLKEIAENQEAKLKKVRALKGHVEQKRLSNGKLVEE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_005 QRLKFLKQQDQRQQQQVAEQEKLKRLKEIAENQEAKLKKVRALKGHVEQKRLSNGKLVEE 40 50 60 70 80 90 220 230 240 250 260 270 pF1KB4 IEQMNNLFQQKQRELVLAVSKVEELTRQLEMLKNGRIDSHHDNQSAVAELDRLYKELQLR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_005 IEQMNNLFQQKQRELVLAVSKVEELTRQLEMLKNGRIDSHHDNQSAVAELDRLYKELQLR 100 110 120 130 140 150 280 290 300 310 320 330 pF1KB4 NKLNQEQNAKLQQQRECLNKRNSEVAVMDKRVNELRDRLWKKKAALQQKENLPVSSDGNL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_005 NKLNQEQNAKLQQQRECLNKRNSEVAVMDKRVNELRDRLWKKKAALQQKENLPVSSDGNL 160 170 180 190 200 210 340 350 360 370 380 390 pF1KB4 PQQAASAPSRVAAVGPYIQSSTMPRMPSRPELLVKPALPDGSLVIQASEGPMKIQTLPNM :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_005 PQQAASAPSRVAAVGPYIQSSTMPRMPSRPELLVKPALPDGSLVIQASEGPMKIQTLPNM 220 230 240 250 260 270 400 410 420 430 440 450 pF1KB4 RSGAASQTKGSKIHPVGPDWSPSNADLFPSQGSASVPQSTGNALDQVDDGEVPLREKEKK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_005 RSGAASQTKGSKIHPVGPDWSPSNADLFPSQGSASVPQSTGNALDQVDDGEVPLREKEKK 280 290 300 310 320 330 460 470 480 490 500 510 pF1KB4 VRPFSMFDAVDQSNAPPSFGTLRKNQSSEDILRDAQVANKNVAKVPPPVPTKPKQINLPY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_005 VRPFSMFDAVDQSNAPPSFGTLRKNQSSEDILRDAQVANKNVAKVPPPVPTKPKQINLPY 340 350 360 370 380 390 520 530 540 550 560 570 pF1KB4 FGQTNQPPSDIKPDGSSQQLSTVVPSMGTKPKPAGQQPRVLLSPSIPSVGQDQTLSPGSK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_005 FGQTNQPPSDIKPDGSSQQLSTVVPSMGTKPKPAGQQPRVLLSPSIPSVGQDQTLSPGSK 400 410 420 430 440 450 580 590 600 610 620 630 pF1KB4 QESPPAAAVRPFTPQPSKDTLLPPFRKPQTVAASSIYSMYTQQQAPGKNFQQAVQSALTK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_005 QESPPAAAVRPFTPQPSKDTLLPPFRKPQTVAASSIYSMYTQQQAPGKNFQQAVQSALTK 460 470 480 490 500 510 640 650 660 670 680 690 pF1KB4 THTRGPHFSSVYGKPVIAAAQNQQQHPENIYSNSQGKPGSPEPETEPVSSVQENHENERI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_005 THTRGPHFSSVYGKPVIAAAQNQQQHPENIYSNSQGKPGSPEPETEPVSSVQENHENERI 520 530 540 550 560 570 700 710 720 730 740 750 pF1KB4 PRPLSPTKLLPFLSNPYRNQSDADLEALRKKLSNAPRPLKKRSSITEPEGPNGPNIQKLL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_005 PRPLSPTKLLPFLSNPYRNQSDADLEALRKKLSNAPRPLKKRSSITEPEGPNGPNIQKLL 580 590 600 610 620 630 760 770 780 790 800 810 pF1KB4 YQRTTIAAMETISVPSYPSKSASVTASSESPVEIQNPYLHVEPEKEVVSLVPESLSPEDV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_005 YQRTTIAAMETISVPSYPSKSASVTASSESPVEIQNPYLHVEPEKEVVSLVPESLSPEDV 640 650 660 670 680 690 820 830 840 850 860 870 pF1KB4 GNASTENSDMPAPSPGLDYEPEGVPDNSPNLQNNPEEPNPEAPHVLDVYLEEYPPYPPPP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_005 GNASTENSDMPAPSPGLDYEPEGVPDNSPNLQNNPEEPNPEAPHVLDVYLEEYPPYPPPP 700 710 720 730 740 750 880 890 900 910 920 930 pF1KB4 YPSGEPEGPGEDSVSMRPPEITGQVSLPPGKRTNLRKTGSERIAHGMRVKFNPLALLLDS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_005 YPSGEPEGPGEDSVSMRPPEITGQVSLPPGKRTNLRKTGSERIAHGMRVKFNPLALLLDS 760 770 780 790 800 810 940 950 960 970 980 990 pF1KB4 SLEGEFDLVQRIIYEVDDPSLPNDEGITALHNAVCAGHTEIVKFLVQFGVNVNAADSDGW :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_005 SLEGEFDLVQRIIYEVDDPSLPNDEGITALHNAVCAGHTEIVKFLVQFGVNVNAADSDGW 820 830 840 850 860 870 1000 1010 1020 1030 1040 1050 pF1KB4 TPLHCAASCNNVQVCKFLVESGAAVFAMTYSDMQTAADKCEEMEEGYTQCSQFLYGVQEK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_005 TPLHCAASCNNVQVCKFLVESGAAVFAMTYSDMQTAADKCEEMEEGYTQCSQFLYGVQEK 880 890 900 910 920 930 1060 1070 1080 1090 1100 1110 pF1KB4 MGIMNKGVIYALWDYEPQNDDELPMKEGDCMTIIHREDEDEIEWWWARLNDKEGYVPRNL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_005 MGIMNKGVIYALWDYEPQNDDELPMKEGDCMTIIHREDEDEIEWWWARLNDKEGYVPRNL 940 950 960 970 980 990 1120 1130 pF1KB4 LGLYPRIKPRQRSLA ::::::::::::::: NP_005 LGLYPRIKPRQRSLA 1000 >>XP_011542571 (OMIM: 602143) PREDICTED: apoptosis-stimu (1005 aa) initn: 6718 init1: 6718 opt: 6718 Z-score: 2720.9 bits: 515.2 E(85289): 8.1e-145 Smith-Waterman score: 6718; 100.0% identity (100.0% similar) in 1005 aa overlap (130-1134:1-1005) 100 110 120 130 140 150 pF1KB4 PRSQDPSLKRNGVKVPGEYRRKENGVNSPRMDLTLAELQEMASRQQQQIEAQQQLLATKE :::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 MDLTLAELQEMASRQQQQIEAQQQLLATKE 10 20 30 160 170 180 190 200 210 pF1KB4 QRLKFLKQQDQRQQQQVAEQEKLKRLKEIAENQEAKLKKVRALKGHVEQKRLSNGKLVEE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 QRLKFLKQQDQRQQQQVAEQEKLKRLKEIAENQEAKLKKVRALKGHVEQKRLSNGKLVEE 40 50 60 70 80 90 220 230 240 250 260 270 pF1KB4 IEQMNNLFQQKQRELVLAVSKVEELTRQLEMLKNGRIDSHHDNQSAVAELDRLYKELQLR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 IEQMNNLFQQKQRELVLAVSKVEELTRQLEMLKNGRIDSHHDNQSAVAELDRLYKELQLR 100 110 120 130 140 150 280 290 300 310 320 330 pF1KB4 NKLNQEQNAKLQQQRECLNKRNSEVAVMDKRVNELRDRLWKKKAALQQKENLPVSSDGNL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 NKLNQEQNAKLQQQRECLNKRNSEVAVMDKRVNELRDRLWKKKAALQQKENLPVSSDGNL 160 170 180 190 200 210 340 350 360 370 380 390 pF1KB4 PQQAASAPSRVAAVGPYIQSSTMPRMPSRPELLVKPALPDGSLVIQASEGPMKIQTLPNM :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 PQQAASAPSRVAAVGPYIQSSTMPRMPSRPELLVKPALPDGSLVIQASEGPMKIQTLPNM 220 230 240 250 260 270 400 410 420 430 440 450 pF1KB4 RSGAASQTKGSKIHPVGPDWSPSNADLFPSQGSASVPQSTGNALDQVDDGEVPLREKEKK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 RSGAASQTKGSKIHPVGPDWSPSNADLFPSQGSASVPQSTGNALDQVDDGEVPLREKEKK 280 290 300 310 320 330 460 470 480 490 500 510 pF1KB4 VRPFSMFDAVDQSNAPPSFGTLRKNQSSEDILRDAQVANKNVAKVPPPVPTKPKQINLPY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 VRPFSMFDAVDQSNAPPSFGTLRKNQSSEDILRDAQVANKNVAKVPPPVPTKPKQINLPY 340 350 360 370 380 390 520 530 540 550 560 570 pF1KB4 FGQTNQPPSDIKPDGSSQQLSTVVPSMGTKPKPAGQQPRVLLSPSIPSVGQDQTLSPGSK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 FGQTNQPPSDIKPDGSSQQLSTVVPSMGTKPKPAGQQPRVLLSPSIPSVGQDQTLSPGSK 400 410 420 430 440 450 580 590 600 610 620 630 pF1KB4 QESPPAAAVRPFTPQPSKDTLLPPFRKPQTVAASSIYSMYTQQQAPGKNFQQAVQSALTK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 QESPPAAAVRPFTPQPSKDTLLPPFRKPQTVAASSIYSMYTQQQAPGKNFQQAVQSALTK 460 470 480 490 500 510 640 650 660 670 680 690 pF1KB4 THTRGPHFSSVYGKPVIAAAQNQQQHPENIYSNSQGKPGSPEPETEPVSSVQENHENERI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 THTRGPHFSSVYGKPVIAAAQNQQQHPENIYSNSQGKPGSPEPETEPVSSVQENHENERI 520 530 540 550 560 570 700 710 720 730 740 750 pF1KB4 PRPLSPTKLLPFLSNPYRNQSDADLEALRKKLSNAPRPLKKRSSITEPEGPNGPNIQKLL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 PRPLSPTKLLPFLSNPYRNQSDADLEALRKKLSNAPRPLKKRSSITEPEGPNGPNIQKLL 580 590 600 610 620 630 760 770 780 790 800 810 pF1KB4 YQRTTIAAMETISVPSYPSKSASVTASSESPVEIQNPYLHVEPEKEVVSLVPESLSPEDV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 YQRTTIAAMETISVPSYPSKSASVTASSESPVEIQNPYLHVEPEKEVVSLVPESLSPEDV 640 650 660 670 680 690 820 830 840 850 860 870 pF1KB4 GNASTENSDMPAPSPGLDYEPEGVPDNSPNLQNNPEEPNPEAPHVLDVYLEEYPPYPPPP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 GNASTENSDMPAPSPGLDYEPEGVPDNSPNLQNNPEEPNPEAPHVLDVYLEEYPPYPPPP 700 710 720 730 740 750 880 890 900 910 920 930 pF1KB4 YPSGEPEGPGEDSVSMRPPEITGQVSLPPGKRTNLRKTGSERIAHGMRVKFNPLALLLDS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 YPSGEPEGPGEDSVSMRPPEITGQVSLPPGKRTNLRKTGSERIAHGMRVKFNPLALLLDS 760 770 780 790 800 810 940 950 960 970 980 990 pF1KB4 SLEGEFDLVQRIIYEVDDPSLPNDEGITALHNAVCAGHTEIVKFLVQFGVNVNAADSDGW :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 SLEGEFDLVQRIIYEVDDPSLPNDEGITALHNAVCAGHTEIVKFLVQFGVNVNAADSDGW 820 830 840 850 860 870 1000 1010 1020 1030 1040 1050 pF1KB4 TPLHCAASCNNVQVCKFLVESGAAVFAMTYSDMQTAADKCEEMEEGYTQCSQFLYGVQEK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 TPLHCAASCNNVQVCKFLVESGAAVFAMTYSDMQTAADKCEEMEEGYTQCSQFLYGVQEK 880 890 900 910 920 930 1060 1070 1080 1090 1100 1110 pF1KB4 MGIMNKGVIYALWDYEPQNDDELPMKEGDCMTIIHREDEDEIEWWWARLNDKEGYVPRNL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 MGIMNKGVIYALWDYEPQNDDELPMKEGDCMTIIHREDEDEIEWWWARLNDKEGYVPRNL 940 950 960 970 980 990 1120 1130 pF1KB4 LGLYPRIKPRQRSLA ::::::::::::::: XP_011 LGLYPRIKPRQRSLA 1000 >>XP_016876605 (OMIM: 606455) PREDICTED: apoptosis-stimu (1125 aa) initn: 2980 init1: 1282 opt: 2854 Z-score: 1167.9 bits: 228.0 E(85289): 2.6e-58 Smith-Waterman score: 3348; 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XP_016 PIPFDHMMYEHLQKWGPRREEVKFFLRHEDSPTENSEQGGRQTQEQRTQRNVINVPGE-K 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB4 RKENGVNSPRMDLTLAELQEMASRQQQQIEAQQQLLATKEQRLKFLKQQDQRQQQQVAEQ : ::::..::..:::.:::.::.::::::: :::.:..:::::.:::::..::::...:. XP_016 RTENGVGNPRVELTLSELQDMAARQQQQIENQQQMLVAKEQRLHFLKQQERRQQQSISEN 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB4 EKLKRLKEIAENQEAKLKKVRALKGHVEQKRLSNGKLVEEIEQMNNLFQQKQRELVLAVS :::..::: .: :: ::::.::..:.:. ... ::.: :::... .::.:..:. :. XP_016 EKLQKLKERVEAQENKLKKIRAMRGQVDYSKIMNGNLSAEIERFSAMFQEKKQEVQTAIL 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KB4 KVEELTRQLEMLKNGRIDSHHDNQS-----AVAELDRLYKELQLRNKLNQEQNAKLQQQR .:..:..::: ::.:.... .. .. :..:: :::.:::.::.::::::.:::::. XP_016 RVDQLSQQLEDLKKGKLNGFQSYNGKLTGPAAVELKRLYQELQIRNQLNQEQNSKLQQQK 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KB4 ECLNKRNSEVAVMDKRVNELRDRLWKKKAALQQKENLPVSSDGNLPQQAASAPSRVAAVG : ::::: :::.::::..:::.::. :: :.. .. .:: ::. :. .:::::: XP_016 ELLNKRNMEVAMMDKRISELRERLYGKKIQLNRVNG--TSS----PQSPLSTSGRVAAVG 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 pF1KB4 PYIQSSTMPRMPSRPELLVKPALPDGSLVIQASEGPMKIQTLPNMRSGAA---SQTKGSK :::: .:: . :.: : :.: :.: .. :.:: :.. : . 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