Result of FASTA (ccds) for
pF1KB4035
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4035, 473 aa
1>>>pF1KB4035 473 - 473 aa - 473 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.6854+/-0.000907; mu= -2.5386+/- 0.055
mean_var=184.3776+/-37.503, 0's: 0 Z-trim(112.7): 29 B-trim: 5 in 1/50
Lambda= 0.094454
statistics sampled from 13385 (13408) to 13385 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.746), E-opt: 0.2 (0.412), width: 16
Scan time: 3.680
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS47245.1 MEF2C gene_id:4208|Hs108|chr5 ( 473) 3165 443.4 2.4e-124
CCDS78034.1 MEF2C gene_id:4208|Hs108|chr5 ( 465) 3092 433.4 2.4e-121
CCDS47244.1 MEF2C gene_id:4208|Hs108|chr5 ( 463) 2312 327.2 2.3e-89
CCDS54878.1 MEF2C gene_id:4208|Hs108|chr5 ( 483) 2312 327.2 2.4e-89
CCDS54877.1 MEF2C gene_id:4208|Hs108|chr5 ( 417) 2215 313.9 2e-85
CCDS78030.1 MEF2C gene_id:4208|Hs108|chr5 ( 393) 1574 226.6 3.8e-59
CCDS53978.1 MEF2A gene_id:4205|Hs108|chr15 ( 497) 1255 183.1 5.7e-46
CCDS60304.1 MEF2D gene_id:4209|Hs108|chr1 ( 514) 1042 154.1 3.2e-37
CCDS45362.1 MEF2A gene_id:4205|Hs108|chr15 ( 499) 1021 151.2 2.3e-36
CCDS81920.1 MEF2A gene_id:4205|Hs108|chr15 ( 505) 947 141.2 2.5e-33
CCDS1143.1 MEF2D gene_id:4209|Hs108|chr1 ( 521) 905 135.4 1.4e-31
CCDS46024.1 MEF2B gene_id:100271849|Hs108|chr19 ( 368) 610 95.2 1.3e-19
CCDS12394.1 MEF2B gene_id:4207|Hs108|chr19 ( 365) 609 95.1 1.4e-19
CCDS58401.1 MEF2A gene_id:4205|Hs108|chr15 ( 429) 429 70.5 3.8e-12
>>CCDS47245.1 MEF2C gene_id:4208|Hs108|chr5 (473 aa)
initn: 3165 init1: 3165 opt: 3165 Z-score: 2345.7 bits: 443.4 E(32554): 2.4e-124
Smith-Waterman score: 3165; 100.0% identity (100.0% similar) in 473 aa overlap (1-473:1-473)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MGRKKIQITRIMDERNRQVTFTKRKFGLMKKAYELSVLCDCEIALIIFNSTNKLFQYAST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MGRKKIQITRIMDERNRQVTFTKRKFGLMKKAYELSVLCDCEIALIIFNSTNKLFQYAST
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 DMDKVLLKYTEYNEPHESRTNSDIVETLRKKGLNGCDSPDPDADDSVGHSPESEDKYRKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 DMDKVLLKYTEYNEPHESRTNSDIVETLRKKGLNGCDSPDPDADDSVGHSPESEDKYRKI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 NEDIDLMISRQRLCAVPPPNFEMPVSIPVSSHNSLVYSNPVSSLGNPNLLPLAHPSLQRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 NEDIDLMISRQRLCAVPPPNFEMPVSIPVSSHNSLVYSNPVSSLGNPNLLPLAHPSLQRN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 SMSPGVTHRPPSAGNTGGLMGGDLTSGAGTSAGNGYGNPRNSPGLLVSPGNLNKNMQAKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SMSPGVTHRPPSAGNTGGLMGGDLTSGAGTSAGNGYGNPRNSPGLLVSPGNLNKNMQAKS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 PPPMNLGMNNRKPDLRVLIPPGSKNTMPSVSEDVDLLLNQRINNSQSAQSLATPVVSVAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 PPPMNLGMNNRKPDLRVLIPPGSKNTMPSVSEDVDLLLNQRINNSQSAQSLATPVVSVAT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 PTLPGQGMGGYPSAISTTYGTEYSLSSADLSSLSGFNTASALHLGSVTGWQQQHLHNMPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 PTLPGQGMGGYPSAISTTYGTEYSLSSADLSSLSGFNTASALHLGSVTGWQQQHLHNMPP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 SALSQLGACTSTHLSQSSNLSLPSTQSLNIKSEPVSPPRDRTTTPSRYPQHTRHEAGRSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SALSQLGACTSTHLSQSSNLSLPSTQSLNIKSEPVSPPRDRTTTPSRYPQHTRHEAGRSP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470
pF1KB4 VDSLSSCSSSYDGSDREDHRNEFHSPIGLTRPSPDERESPSVKRMRLSEGWAT
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VDSLSSCSSSYDGSDREDHRNEFHSPIGLTRPSPDERESPSVKRMRLSEGWAT
430 440 450 460 470
>>CCDS78034.1 MEF2C gene_id:4208|Hs108|chr5 (465 aa)
initn: 1838 init1: 1838 opt: 3092 Z-score: 2292.1 bits: 433.4 E(32554): 2.4e-121
Smith-Waterman score: 3092; 98.3% identity (98.3% similar) in 473 aa overlap (1-473:1-465)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MGRKKIQITRIMDERNRQVTFTKRKFGLMKKAYELSVLCDCEIALIIFNSTNKLFQYAST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 MGRKKIQITRIMDERNRQVTFTKRKFGLMKKAYELSVLCDCEIALIIFNSTNKLFQYAST
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 DMDKVLLKYTEYNEPHESRTNSDIVETLRKKGLNGCDSPDPDADDSVGHSPESEDKYRKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 DMDKVLLKYTEYNEPHESRTNSDIVETLRKKGLNGCDSPDPDADDSVGHSPESEDKYRKI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 NEDIDLMISRQRLCAVPPPNFEMPVSIPVSSHNSLVYSNPVSSLGNPNLLPLAHPSLQRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 NEDIDLMISRQRLCAVPPPNFEMPVSIPVSSHNSLVYSNPVSSLGNPNLLPLAHPSLQRN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 SMSPGVTHRPPSAGNTGGLMGGDLTSGAGTSAGNGYGNPRNSPGLLVSPGNLNKNMQAKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 SMSPGVTHRPPSAGNTGGLMGGDLTSGAGTSAGNGYGNPRNSPGLLVSPGNLNKNMQAKS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 PPPMNLGMNNRKPDLRVLIPPGSKNTMPSVSEDVDLLLNQRINNSQSAQSLATPVVSVAT
:::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::
CCDS78 PPPMNLGMNNRKPDLRVLIPPGSKNTMPSV--------NQRINNSQSAQSLATPVVSVAT
250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 PTLPGQGMGGYPSAISTTYGTEYSLSSADLSSLSGFNTASALHLGSVTGWQQQHLHNMPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 PTLPGQGMGGYPSAISTTYGTEYSLSSADLSSLSGFNTASALHLGSVTGWQQQHLHNMPP
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 SALSQLGACTSTHLSQSSNLSLPSTQSLNIKSEPVSPPRDRTTTPSRYPQHTRHEAGRSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 SALSQLGACTSTHLSQSSNLSLPSTQSLNIKSEPVSPPRDRTTTPSRYPQHTRHEAGRSP
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470
pF1KB4 VDSLSSCSSSYDGSDREDHRNEFHSPIGLTRPSPDERESPSVKRMRLSEGWAT
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 VDSLSSCSSSYDGSDREDHRNEFHSPIGLTRPSPDERESPSVKRMRLSEGWAT
420 430 440 450 460
>>CCDS47244.1 MEF2C gene_id:4208|Hs108|chr5 (463 aa)
initn: 1941 init1: 1296 opt: 2312 Z-score: 1717.7 bits: 327.2 E(32554): 2.3e-89
Smith-Waterman score: 2900; 92.8% identity (96.2% similar) in 473 aa overlap (1-473:1-463)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MGRKKIQITRIMDERNRQVTFTKRKFGLMKKAYELSVLCDCEIALIIFNSTNKLFQYAST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MGRKKIQITRIMDERNRQVTFTKRKFGLMKKAYELSVLCDCEIALIIFNSTNKLFQYAST
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 DMDKVLLKYTEYNEPHESRTNSDIVETLRKKGLNGCDSPDPDADDSVGHSPESEDKYRKI
::::::::::::::::::::::::::.: :: .::.:::::. : . .:..:.::.::
CCDS47 DMDKVLLKYTEYNEPHESRTNSDIVEALNKKENKGCESPDPDS--SYALTPRTEEKYKKI
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 NEDIDLMISRQRLCAVPPPNFEMPVSIPVSSHNSLVYSNPVSSLGNPNLLPLAHPSLQRN
::..: ::. ... ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 NEEFDNMIKSHKIPAVPPPNFEMPVSIPVSSHNSLVYSNPVSSLGNPNLLPLAHPSLQRN
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 SMSPGVTHRPPSAGNTGGLMGGDLTSGAGTSAGNGYGNPRNSPGLLVSPGNLNKNMQAKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SMSPGVTHRPPSAGNTGGLMGGDLTSGAGTSAGNGYGNPRNSPGLLVSPGNLNKNMQAKS
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 PPPMNLGMNNRKPDLRVLIPPGSKNTMPSVSEDVDLLLNQRINNSQSAQSLATPVVSVAT
:::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::
CCDS47 PPPMNLGMNNRKPDLRVLIPPGSKNTMPSV--------NQRINNSQSAQSLATPVVSVAT
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 PTLPGQGMGGYPSAISTTYGTEYSLSSADLSSLSGFNTASALHLGSVTGWQQQHLHNMPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 PTLPGQGMGGYPSAISTTYGTEYSLSSADLSSLSGFNTASALHLGSVTGWQQQHLHNMPP
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 SALSQLGACTSTHLSQSSNLSLPSTQSLNIKSEPVSPPRDRTTTPSRYPQHTRHEAGRSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SALSQLGACTSTHLSQSSNLSLPSTQSLNIKSEPVSPPRDRTTTPSRYPQHTRHEAGRSP
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470
pF1KB4 VDSLSSCSSSYDGSDREDHRNEFHSPIGLTRPSPDERESPSVKRMRLSEGWAT
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VDSLSSCSSSYDGSDREDHRNEFHSPIGLTRPSPDERESPSVKRMRLSEGWAT
420 430 440 450 460
>>CCDS54878.1 MEF2C gene_id:4208|Hs108|chr5 (483 aa)
initn: 2014 init1: 1296 opt: 2312 Z-score: 1717.4 bits: 327.2 E(32554): 2.4e-89
Smith-Waterman score: 2935; 91.2% identity (93.9% similar) in 491 aa overlap (1-473:1-483)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MGRKKIQITRIMDERNRQVTFTKRKFGLMKKAYELSVLCDCEIALIIFNSTNKLFQYAST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MGRKKIQITRIMDERNRQVTFTKRKFGLMKKAYELSVLCDCEIALIIFNSTNKLFQYAST
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100
pF1KB4 DMDKVLLKYTEYNEPHESRTNSDIVETLRKKGLNGCDSPDPDADDSVGH-----------
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. .
CCDS54 DMDKVLLKYTEYNEPHESRTNSDIVETLRKKGLNGCDSPDPDADDSALNKKENKGCESPD
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB4 -------SPESEDKYRKINEDIDLMISRQRLCAVPPPNFEMPVSIPVSSHNSLVYSNPVS
.:..:.::.::::..: ::. ... ::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PDSSYALTPRTEEKYKKINEEFDNMIKSHKIPAVPPPNFEMPVSIPVSSHNSLVYSNPVS
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB4 SLGNPNLLPLAHPSLQRNSMSPGVTHRPPSAGNTGGLMGGDLTSGAGTSAGNGYGNPRNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SLGNPNLLPLAHPSLQRNSMSPGVTHRPPSAGNTGGLMGGDLTSGAGTSAGNGYGNPRNS
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KB4 PGLLVSPGNLNKNMQAKSPPPMNLGMNNRKPDLRVLIPPGSKNTMPSVSEDVDLLLNQRI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::
CCDS54 PGLLVSPGNLNKNMQAKSPPPMNLGMNNRKPDLRVLIPPGSKNTMPSV--------NQRI
250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB4 NNSQSAQSLATPVVSVATPTLPGQGMGGYPSAISTTYGTEYSLSSADLSSLSGFNTASAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 NNSQSAQSLATPVVSVATPTLPGQGMGGYPSAISTTYGTEYSLSSADLSSLSGFNTASAL
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB4 HLGSVTGWQQQHLHNMPPSALSQLGACTSTHLSQSSNLSLPSTQSLNIKSEPVSPPRDRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 HLGSVTGWQQQHLHNMPPSALSQLGACTSTHLSQSSNLSLPSTQSLNIKSEPVSPPRDRT
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KB4 TTPSRYPQHTRHEAGRSPVDSLSSCSSSYDGSDREDHRNEFHSPIGLTRPSPDERESPSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 TTPSRYPQHTRHEAGRSPVDSLSSCSSSYDGSDREDHRNEFHSPIGLTRPSPDERESPSV
420 430 440 450 460 470
470
pF1KB4 KRMRLSEGWAT
:::::::::::
CCDS54 KRMRLSEGWAT
480
>>CCDS54877.1 MEF2C gene_id:4208|Hs108|chr5 (417 aa)
initn: 1866 init1: 1296 opt: 2215 Z-score: 1647.0 bits: 313.9 E(32554): 2e-85
Smith-Waterman score: 2651; 88.2% identity (88.2% similar) in 473 aa overlap (1-473:1-417)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MGRKKIQITRIMDERNRQVTFTKRKFGLMKKAYELSVLCDCEIALIIFNSTNKLFQYAST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MGRKKIQITRIMDERNRQVTFTKRKFGLMKKAYELSVLCDCEIALIIFNSTNKLFQYAST
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 DMDKVLLKYTEYNEPHESRTNSDIVETLRKKGLNGCDSPDPDADDSVGHSPESEDKYRKI
::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 DMDKVLLKYTEYNEPHESRTNSDIVE----------------------------------
70 80
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 NEDIDLMISRQRLCAVPPPNFEMPVSIPVSSHNSLVYSNPVSSLGNPNLLPLAHPSLQRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 --------------AVPPPNFEMPVSIPVSSHNSLVYSNPVSSLGNPNLLPLAHPSLQRN
90 100 110 120 130
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 SMSPGVTHRPPSAGNTGGLMGGDLTSGAGTSAGNGYGNPRNSPGLLVSPGNLNKNMQAKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SMSPGVTHRPPSAGNTGGLMGGDLTSGAGTSAGNGYGNPRNSPGLLVSPGNLNKNMQAKS
140 150 160 170 180 190
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 PPPMNLGMNNRKPDLRVLIPPGSKNTMPSVSEDVDLLLNQRINNSQSAQSLATPVVSVAT
:::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::
CCDS54 PPPMNLGMNNRKPDLRVLIPPGSKNTMPSV--------NQRINNSQSAQSLATPVVSVAT
200 210 220 230 240
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 PTLPGQGMGGYPSAISTTYGTEYSLSSADLSSLSGFNTASALHLGSVTGWQQQHLHNMPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 PTLPGQGMGGYPSAISTTYGTEYSLSSADLSSLSGFNTASALHLGSVTGWQQQHLHNMPP
250 260 270 280 290 300
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 SALSQLGACTSTHLSQSSNLSLPSTQSLNIKSEPVSPPRDRTTTPSRYPQHTRHEAGRSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SALSQLGACTSTHLSQSSNLSLPSTQSLNIKSEPVSPPRDRTTTPSRYPQHTRHEAGRSP
310 320 330 340 350 360
430 440 450 460 470
pF1KB4 VDSLSSCSSSYDGSDREDHRNEFHSPIGLTRPSPDERESPSVKRMRLSEGWAT
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VDSLSSCSSSYDGSDREDHRNEFHSPIGLTRPSPDERESPSVKRMRLSEGWAT
370 380 390 400 410
>>CCDS78030.1 MEF2C gene_id:4208|Hs108|chr5 (393 aa)
initn: 2069 init1: 1568 opt: 1574 Z-score: 1175.4 bits: 226.6 E(32554): 3.8e-59
Smith-Waterman score: 2445; 83.1% identity (83.1% similar) in 473 aa overlap (1-473:1-393)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MGRKKIQITRIMDERNRQVTFTKRKFGLMKKAYELSVLCDCEIALIIFNSTNKLFQYAST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 MGRKKIQITRIMDERNRQVTFTKRKFGLMKKAYELSVLCDCEIALIIFNSTNKLFQYAST
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 DMDKVLLKYTEYNEPHESRTNSDIVETLRKKGLNGCDSPDPDADDSVGHSPESEDKYRKI
::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 DMDKVLLKYTEYNEPHESRTNSDIVE----------------------------------
70 80
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 NEDIDLMISRQRLCAVPPPNFEMPVSIPVSSHNSLVYSNPVSSLGNPNLLPLAHPSLQRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 --------------AVPPPNFEMPVSIPVSSHNSLVYSNPVSSLGNPNLLPLAHPSLQRN
90 100 110 120 130
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 SMSPGVTHRPPSAGNTGGLMGGDLTSGAGTSAGNGYGNPRNSPGLLVSPGNLNKNMQAKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 SMSPGVTHRPPSAGNTGGLMGGDLTSGAGTSAGNGYGNPRNSPGLLVSPGNLNKNMQAKS
140 150 160 170 180 190
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 PPPMNLGMNNRKPDLRVLIPPGSKNTMPSVSEDVDLLLNQRINNSQSAQSLATPVVSVAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 PPPMNLGMNNRKPDLRVLIPPGSKNTMPSVSEDVDLLLNQRINNSQSAQSLATPVVSVAT
200 210 220 230 240 250
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 PTLPGQGMGGYPSAISTTYGTEYSLSSADLSSLSGFNTASALHLGSVTGWQQQHLHNMPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 PTLPGQGMGGYPSAISTTYGTEYSLSSADLSSLSGFNTASALHLGSVTGWQQQHLHNMPP
260 270 280 290 300 310
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 SALSQLGACTSTHLSQSSNLSLPSTQSLNIKSEPVSPPRDRTTTPSRYPQHTRHEAGRSP
::::::: :::::::::::::::::::::
CCDS78 SALSQLG--------------------------------DRTTTPSRYPQHTRHEAGRSP
320 330 340
430 440 450 460 470
pF1KB4 VDSLSSCSSSYDGSDREDHRNEFHSPIGLTRPSPDERESPSVKRMRLSEGWAT
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 VDSLSSCSSSYDGSDREDHRNEFHSPIGLTRPSPDERESPSVKRMRLSEGWAT
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10 20 30 40 50 60
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CCDS53 MGRKKIQITRIMDERNRQVTFTKRKFGLMKKAYELSVLCDCEIALIIFNSSNKLFQYAST
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CCDS53 DMDKVLLKYTEYNEPHESRTNSDIVETLRKKGLNGCESP--DADDYFEHSPLSEDRFSKL
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::..::..: ::::::::.::.:: ::. ::. :.:.:.:::.:::::.:.:::. .
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: ::.:..:::.:: . .:::.: : . .:::.::::. ..:...:::::.:::::
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:..::::: : :: . ..::::::::::. ..:.:
CCDS53 PRGDFHSPIVLGRPPNTEDRESPSVKRMRM-DAWVT
470 480 490
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pF1KB4 NEDIDLMISRQRLCAVPPPNFEMPVSIPVSSHNSLVYSNP----------VSSLGNPNLL
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CCDS60 SEELDGLF-RRYGSTVPAPNFAMPVTVPVSNQSSLQFSNPSGSLVTPSLVTSSLTDPRLL
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pF1KB4 PLAHPSLQRNSMSPGVTHRPPSAGNTGGLMGGDLTSGAG---TSAGNGYGNPRNSPGLL-
.:.:::::.:::. .:: ::: ...::::.:. : . .:::: . : :::::
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CCDS60 VANGNSLNKVIPAKSPPPPTHSTQLGAPSRKPDLRVITSQAGKGLMHHLNN------AQR
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pF1KB4 INNSQSAQSLATPVVSVATPTLPGQGMGGYP-SAISTTYGTEYSLSSADLSSLSGFNTAS
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CCDS60 LGVSQSTHSLTTPVVSVATPSLLSQGL---PFSSMPTAYNTDYQLTSAELSSLPAFSSPG
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pF1KB4 ALHLGSVTGWQQQHLHNMP---------------------------PSALSQLGACTSTH
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CCDS60 GLSLGNVTAWQQPQQPQQPQQPQPPQQQPPQPQQPQPQQPQQPQQPPQQQSHLVPVSLSN
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380 390 400 410 420
pF1KB4 LSQSS-------NLSLPSTQSLNIKSEPVSPPRDRTTTPSRYPQHTRHEAGRS-PVDSLS
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CCDS60 LIPGSPLPHVGAALTVTTHPHISIKSEPVSPSRERSPAP---PPPAVFPAARPEPGDGLS
410 420 430 440 450 460
430 440 450 460 470
pF1KB4 S-CSSSYDGSDREDHRNEFHSPIGLTRPSPD-ERESPSVKRMRLSEGWAT
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CCDS60 SPAGGSYETGDRDDGRGDFGPTLGLLRPAPEPEAEGSAVKRMRLDTWTLK
470 480 490 500 510
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CCDS45 MGRKKIQITRIMDERNRQVTFTKRKFGLMKKAYELSVLCDCEIALIIFNSSNKLFQYAST
10 20 30 40 50 60
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CCDS45 DMDKVLLKYTEYNEPHESRTNSDIVEALNKKEHRGCDSPDPDT--SYVLTPHTEEKYKKI
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CCDS45 NEEFDNMMRNHKIAPGLPPQNFSMSVTVPVTSPNALSYTNPGSSLVSPSLAASSTLTDSS
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pF1KB4 -LAHP--SLQRNSMSPGVTHRPPSAGNTGGLMGG-DLT--SGAGTS-AGNGYGNPRNSPG
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CCDS45 MLSPPQTTLHRN-VSPGAPQRPPSTGNAGGMLSTTDLTVPNGAGSSPVGNGFVNSRASPN
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CCDS45 LIGATGANSLGKVMPTKSPPPPGGGNLGMNSRKPDLRVVIPPSSKGMMPPLN-------T
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pF1KB4 QRINNSQSAQSLATPVVSVATPTLPGQGMGGYPSAISTTYGTEYSLSSADLSSLSGFNTA
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CCDS45 QRISSSQATQPLATPVVSVTTPSLPPQGL--VYSAMPTAYNTDYSLTSADLSALQGFNSP
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CCDS45 GMLSLGQVSAWQQHHLGQ---AALSSLVA--GGQLSQGSNLSINTNQNISIKSEPISPPR
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CCDS45 DRMTPSGFQQQQQQQQQQQPPPPPQPQPQPPQPQPRQEMGRSPVDSLSSSSSSYDGSDRE
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CCDS45 DPRGDFHSPIVLGRPPNTEDRESPSVKRMRM-DAWVT
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pF1KB4 MGRKKIQITRIMDERNRQVTFTKRKFGLMKKAYELSVLCDCEIALIIFNSTNKLFQYAST
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CCDS81 MGRKKIQITRIMDERNRQVTFTKRKFGLMKKAYELSVLCDCEIALIIFNSSNKLFQYAST
10 20 30 40 50 60
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pF1KB4 DMDKVLLKYTEYNEPHESRTNSDIVETLRKKGLNGCDSPDPDADDSVGHSPESEDKYRKI
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CCDS81 DMDKVLLKYTEYNEPHESRTNSDIVETLRKKGLNGCESP--DADDYFEHSPLSEDRFSKL
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pF1KB4 NEDIDLMISRQRLCAVPPPNFEMPVSIPVSSHNSLVYSNPVSSLGNPNLLP---------
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CCDS81 NEDSDFIFKRGPP-GLPPQNFSMSVTVPVTSPNALSYTNPGSSLVSPSLAASSTLTDSSM
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KB4 LAHP--SLQRNSMSPGVTHRPPSAGNTGGLMGG-DLT--SGAGTS-AGNGYGNPRNSPGL
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CCDS81 LSPPQTTLHRN-VSPGAPQRPPSTGNAGGMLSTTDLTVPNGAGSSPVGNGFVNSRASPNL
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270
pF1KB4 LVSPG--NLNKNMQAKSPPPM---NLGMNNRKPDLRVLIPPGSKNTMPSVSEDVDLLLN-
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CCDS81 IGATGANSLGKVMPTKSPPPPGGGNLGMNSRKPDLRVVIPPSSKGMMPPLSEEEELELNT
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB4 QRINNSQSAQSLATPVVSVATPTLPGQGMGGYPSAISTTYGTEYSLSSADLSSLSGFNTA
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CCDS81 QRISSSQATQPLATPVVSVTTPSLPPQGL--VYSAMPTAYNTDYSLTSADLSALQGFNSP
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CCDS81 GMLSLGQVSAWQQHHLGQ---AALSSLVA--GGQLSQGSNLSINTNQNISIKSEPISPPR
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CCDS81 DRMTPSGFQQQQQQQQQQQPPPPPQPQPQPPQPQPRQEMGRSPVDSLSSSSSSYDGSDRE
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440 450 460 470
pF1KB4 DHRNEFHSPIGLTRP-SPDERESPSVKRMRLSEGWAT
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CCDS81 DPRGDFHSPIVLGRPPNTEDRESPSVKRMRM-DAWVT
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473 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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start: Thu Nov 3 14:17:02 2016 done: Thu Nov 3 14:17:03 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]