Result of FASTA (omim) for
pF1KB4082
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4082, 894 aa
1>>>pF1KB4082 894 - 894 aa - 894 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0072+/-0.000382; mu= 22.7780+/- 0.024
mean_var=62.1200+/-12.834, 0's: 0 Z-trim(110.8): 126 B-trim: 0 in 0/58
Lambda= 0.162727
statistics sampled from 19166 (19294) to 19166 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.571), E-opt: 0.2 (0.226), width: 16
Scan time: 11.310
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_015564 (OMIM: 300699,305915) glutamate receptor ( 894) 5929 1401.2 0
NP_000819 (OMIM: 300699,305915) glutamate receptor ( 894) 5871 1387.6 0
XP_011541077 (OMIM: 138246) PREDICTED: glutamate r ( 884) 4590 1086.8 0
NP_001070711 (OMIM: 138246) glutamate receptor 4 i ( 884) 4558 1079.3 0
NP_000820 (OMIM: 138246) glutamate receptor 4 isof ( 902) 4448 1053.5 0
XP_006718886 (OMIM: 138246) PREDICTED: glutamate r ( 902) 4437 1050.9 0
XP_005271575 (OMIM: 138246) PREDICTED: glutamate r ( 902) 4394 1040.8 0
NP_000817 (OMIM: 138247) glutamate receptor 2 isof ( 883) 4336 1027.2 0
NP_001077088 (OMIM: 138247) glutamate receptor 2 i ( 883) 4279 1013.8 0
XP_016863605 (OMIM: 138247) PREDICTED: glutamate r ( 836) 4258 1008.9 0
XP_016863606 (OMIM: 138247) PREDICTED: glutamate r ( 836) 4258 1008.9 0
NP_001077089 (OMIM: 138247) glutamate receptor 2 i ( 836) 4252 1007.5 0
XP_016863604 (OMIM: 138247) PREDICTED: glutamate r ( 836) 4201 995.5 0
XP_016863603 (OMIM: 138247) PREDICTED: glutamate r ( 836) 4201 995.5 0
XP_016863602 (OMIM: 138247) PREDICTED: glutamate r ( 836) 4201 995.5 0
XP_016873098 (OMIM: 138246) PREDICTED: glutamate r ( 814) 4116 975.5 0
XP_016873099 (OMIM: 138246) PREDICTED: glutamate r ( 771) 3913 927.8 0
XP_011535937 (OMIM: 138248) PREDICTED: glutamate r ( 886) 3891 922.7 0
NP_001107655 (OMIM: 138248) glutamate receptor 1 i ( 906) 3891 922.7 0
NP_001244951 (OMIM: 138248) glutamate receptor 1 i ( 916) 3891 922.7 0
NP_000818 (OMIM: 138248) glutamate receptor 1 isof ( 906) 3862 915.9 0
NP_001244950 (OMIM: 138248) glutamate receptor 1 i ( 916) 3862 915.9 0
XP_016864882 (OMIM: 138248) PREDICTED: glutamate r ( 837) 3857 914.7 0
NP_001244952 (OMIM: 138248) glutamate receptor 1 i ( 837) 3828 907.9 0
NP_001244949 (OMIM: 138248) glutamate receptor 1 i ( 811) 3733 885.6 0
XP_016873100 (OMIM: 138246) PREDICTED: glutamate r ( 732) 3711 880.4 0
XP_011541079 (OMIM: 138246) PREDICTED: glutamate r ( 732) 3711 880.4 0
XP_011541078 (OMIM: 138246) PREDICTED: glutamate r ( 732) 3711 880.4 0
XP_016864881 (OMIM: 138248) PREDICTED: glutamate r ( 846) 3593 852.7 0
NP_001244948 (OMIM: 138248) glutamate receptor 1 i ( 826) 3419 811.9 0
NP_786944 (OMIM: 138244,611092) glutamate receptor ( 869) 2007 480.4 1.6e-134
XP_011534080 (OMIM: 138244,611092) PREDICTED: glut ( 869) 2007 480.4 1.6e-134
NP_001159719 (OMIM: 138244,611092) glutamate recep ( 892) 2007 480.4 1.6e-134
XP_011534079 (OMIM: 138244,611092) PREDICTED: glut ( 892) 2007 480.4 1.6e-134
XP_005267002 (OMIM: 138244,611092) PREDICTED: glut ( 908) 2007 480.4 1.7e-134
NP_068775 (OMIM: 138244,611092) glutamate receptor ( 908) 2007 480.4 1.7e-134
XP_005267003 (OMIM: 138244,611092) PREDICTED: glut ( 859) 1986 475.5 4.8e-133
XP_005261001 (OMIM: 138245) PREDICTED: glutamate r ( 903) 1951 467.3 1.5e-130
NP_783300 (OMIM: 138245) glutamate receptor ionotr ( 905) 1951 467.3 1.5e-130
NP_001317922 (OMIM: 138245) glutamate receptor ion ( 934) 1951 467.3 1.5e-130
NP_000822 (OMIM: 138243) glutamate receptor ionotr ( 919) 1931 462.6 3.9e-129
NP_001106283 (OMIM: 138246) glutamate receptor 4 i ( 433) 1834 439.6 1.5e-122
NP_001070712 (OMIM: 138246) glutamate receptor 4 i ( 433) 1834 439.6 1.5e-122
NP_001307550 (OMIM: 138245) glutamate receptor ion ( 763) 1827 438.1 7.5e-122
NP_000821 (OMIM: 138245) glutamate receptor ionotr ( 918) 1805 433.0 3.1e-120
NP_001307545 (OMIM: 138245) glutamate receptor ion ( 920) 1805 433.0 3.1e-120
NP_001317923 (OMIM: 138245) glutamate receptor ion ( 949) 1805 433.0 3.2e-120
XP_011525164 (OMIM: 600283) PREDICTED: glutamate r ( 981) 1716 412.1 6.5e-114
XP_011525167 (OMIM: 600283) PREDICTED: glutamate r ( 982) 1716 412.1 6.5e-114
XP_011525170 (OMIM: 600283) PREDICTED: glutamate r ( 901) 1692 406.5 3e-112
>>NP_015564 (OMIM: 300699,305915) glutamate receptor 3 i (894 aa)
initn: 5929 init1: 5929 opt: 5929 Z-score: 7512.1 bits: 1401.2 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5929; 100.0% identity (100.0% similar) in 894 aa overlap (1-894:1-894)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MARQKKMGQSVLRAVFFLVLGLLGHSHGGFPNTISIGGLFMRNTVQEHSAFRFAVQLYNT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_015 MARQKKMGQSVLRAVFFLVLGLLGHSHGGFPNTISIGGLFMRNTVQEHSAFRFAVQLYNT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 NQNTTEKPFHLNYHVDHLDSSNSFSVTNAFCSQFSRGVYAIFGFYDQMSMNTLTSFCGAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_015 NQNTTEKPFHLNYHVDHLDSSNSFSVTNAFCSQFSRGVYAIFGFYDQMSMNTLTSFCGAL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 HTSFVTPSFPTDADVQFVIQMRPALKGAILSLLGHYKWEKFVYLYDTERGFSILQAIMEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_015 HTSFVTPSFPTDADVQFVIQMRPALKGAILSLLGHYKWEKFVYLYDTERGFSILQAIMEA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 AVQNNWQVTARSVGNIKDVQEFRRIIEEMDRRQEKRYLIDCEVERINTILEQVVILGKHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_015 AVQNNWQVTARSVGNIKDVQEFRRIIEEMDRRQEKRYLIDCEVERINTILEQVVILGKHS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 RGYHYMLANLGFTDILLERVMHGGANITGFQIVNNENPMVQQFIQRWVRLDEREFPEAKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_015 RGYHYMLANLGFTDILLERVMHGGANITGFQIVNNENPMVQQFIQRWVRLDEREFPEAKN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 APLKYTSALTHDAILVIAEAFRYLRRQRVDVSRRGSAGDCLANPAVPWSQGIDIERALKM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_015 APLKYTSALTHDAILVIAEAFRYLRRQRVDVSRRGSAGDCLANPAVPWSQGIDIERALKM
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 VQVQGMTGNIQFDTYGRRTNYTIDVYEMKVSGSRKAGYWNEYERFVPFSDQQISNDSASS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_015 VQVQGMTGNIQFDTYGRRTNYTIDVYEMKVSGSRKAGYWNEYERFVPFSDQQISNDSASS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 ENRTIVVTTILESPYVMYKKNHEQLEGNERYEGYCVDLAYEIAKHVRIKYKLSIVGDGKY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_015 ENRTIVVTTILESPYVMYKKNHEQLEGNERYEGYCVDLAYEIAKHVRIKYKLSIVGDGKY
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 GARDPETKIWNGMVGELVYGRADIAVAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKPQKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_015 GARDPETKIWNGMVGELVYGRADIAVAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKPQKS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 KPGVFSFLDPLAYEIWMCIVFAYIGVSVVLFLVSRFSPYEWHLEDNNEEPRDPQSPPDPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_015 KPGVFSFLDPLAYEIWMCIVFAYIGVSVVLFLVSRFSPYEWHLEDNNEEPRDPQSPPDPP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 NEFGIFNSLWFSLGAFMQQGCDISPRSLSGRIVGGVWWFFTLIIISSYTANLAAFLTVER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_015 NEFGIFNSLWFSLGAFMQQGCDISPRSLSGRIVGGVWWFFTLIIISSYTANLAAFLTVER
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB4 MVSPIESAEDLAKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVYEKMWSYMKSAEPSVFTKTTAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_015 MVSPIESAEDLAKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVYEKMWSYMKSAEPSVFTKTTAD
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB4 GVARVRKSKGKFAFLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGVATPKGSALGTPVNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_015 GVARVRKSKGKFAFLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGVATPKGSALGTPVNL
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB4 AVLKLSEQGILDKLKNKWWYDKGECGAKDSGSKDKTSALSLSNVAGVFYILVGGLGLAMM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_015 AVLKLSEQGILDKLKNKWWYDKGECGAKDSGSKDKTSALSLSNVAGVFYILVGGLGLAMM
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890
pF1KB4 VALIEFCYKSRAESKRMKLTKNTQNFKPAPATNTQNYATYREGYNVYGTESVKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_015 VALIEFCYKSRAESKRMKLTKNTQNFKPAPATNTQNYATYREGYNVYGTESVKI
850 860 870 880 890
>>NP_000819 (OMIM: 300699,305915) glutamate receptor 3 i (894 aa)
initn: 5871 init1: 5871 opt: 5871 Z-score: 7438.5 bits: 1387.6 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5871; 99.0% identity (99.6% similar) in 894 aa overlap (1-894:1-894)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MARQKKMGQSVLRAVFFLVLGLLGHSHGGFPNTISIGGLFMRNTVQEHSAFRFAVQLYNT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 MARQKKMGQSVLRAVFFLVLGLLGHSHGGFPNTISIGGLFMRNTVQEHSAFRFAVQLYNT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 NQNTTEKPFHLNYHVDHLDSSNSFSVTNAFCSQFSRGVYAIFGFYDQMSMNTLTSFCGAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 NQNTTEKPFHLNYHVDHLDSSNSFSVTNAFCSQFSRGVYAIFGFYDQMSMNTLTSFCGAL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 HTSFVTPSFPTDADVQFVIQMRPALKGAILSLLGHYKWEKFVYLYDTERGFSILQAIMEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 HTSFVTPSFPTDADVQFVIQMRPALKGAILSLLGHYKWEKFVYLYDTERGFSILQAIMEA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 AVQNNWQVTARSVGNIKDVQEFRRIIEEMDRRQEKRYLIDCEVERINTILEQVVILGKHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 AVQNNWQVTARSVGNIKDVQEFRRIIEEMDRRQEKRYLIDCEVERINTILEQVVILGKHS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 RGYHYMLANLGFTDILLERVMHGGANITGFQIVNNENPMVQQFIQRWVRLDEREFPEAKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 RGYHYMLANLGFTDILLERVMHGGANITGFQIVNNENPMVQQFIQRWVRLDEREFPEAKN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 APLKYTSALTHDAILVIAEAFRYLRRQRVDVSRRGSAGDCLANPAVPWSQGIDIERALKM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 APLKYTSALTHDAILVIAEAFRYLRRQRVDVSRRGSAGDCLANPAVPWSQGIDIERALKM
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 VQVQGMTGNIQFDTYGRRTNYTIDVYEMKVSGSRKAGYWNEYERFVPFSDQQISNDSASS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 VQVQGMTGNIQFDTYGRRTNYTIDVYEMKVSGSRKAGYWNEYERFVPFSDQQISNDSASS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 ENRTIVVTTILESPYVMYKKNHEQLEGNERYEGYCVDLAYEIAKHVRIKYKLSIVGDGKY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 ENRTIVVTTILESPYVMYKKNHEQLEGNERYEGYCVDLAYEIAKHVRIKYKLSIVGDGKY
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 GARDPETKIWNGMVGELVYGRADIAVAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKPQKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 GARDPETKIWNGMVGELVYGRADIAVAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKPQKS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 KPGVFSFLDPLAYEIWMCIVFAYIGVSVVLFLVSRFSPYEWHLEDNNEEPRDPQSPPDPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 KPGVFSFLDPLAYEIWMCIVFAYIGVSVVLFLVSRFSPYEWHLEDNNEEPRDPQSPPDPP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 NEFGIFNSLWFSLGAFMQQGCDISPRSLSGRIVGGVWWFFTLIIISSYTANLAAFLTVER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 NEFGIFNSLWFSLGAFMQQGCDISPRSLSGRIVGGVWWFFTLIIISSYTANLAAFLTVER
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB4 MVSPIESAEDLAKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVYEKMWSYMKSAEPSVFTKTTAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 MVSPIESAEDLAKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVYEKMWSYMKSAEPSVFTKTTAD
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB4 GVARVRKSKGKFAFLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGVATPKGSALGTPVNL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. :::
NP_000 GVARVRKSKGKFAFLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGVATPKGSALGNAVNL
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB4 AVLKLSEQGILDKLKNKWWYDKGECGAKDSGSKDKTSALSLSNVAGVFYILVGGLGLAMM
:::::.:::.::::::::::::::::. . :::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 AVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGECGSGGGDSKDKTSALSLSNVAGVFYILVGGLGLAMM
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890
pF1KB4 VALIEFCYKSRAESKRMKLTKNTQNFKPAPATNTQNYATYREGYNVYGTESVKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 VALIEFCYKSRAESKRMKLTKNTQNFKPAPATNTQNYATYREGYNVYGTESVKI
850 860 870 880 890
>>XP_011541077 (OMIM: 138246) PREDICTED: glutamate recep (884 aa)
initn: 3144 init1: 1816 opt: 4590 Z-score: 5813.3 bits: 1086.8 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4590; 75.3% identity (92.9% similar) in 887 aa overlap (11-894:4-884)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MARQKKMGQSVLRAVFFLVLGLLGHSHGGFPNTISIGGLFMRNTVQEHSAFRFAVQLYNT
. : . .: :. : . :.::....:::::.::: ::..:::.:. :.::
XP_011 MRIISRQIVLLFSGFWGLAMGAFPSSVQIGGLFIRNTDQEYTAFRLAIFLHNT
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 NQNTTEKPFHLNYHVDHLDSSNSFSVTNAFCSQFSRGVYAIFGFYDQMSMNTLTSFCGAL
. :..: ::.: :::.....:::.::::::::.::::.::::.::. :..::::::.::
XP_011 SPNASEAPFNLVPHVDNIETANSFAVTNAFCSQYSRGVFAIFGLYDKRSVHTLTSFCSAL
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 HTSFVTPSFPTDADVQFVIQMRPALKGAILSLLGHYKWEKFVYLYDTERGFSILQAIMEA
: :..::::::... :::.:.::.:.::.:::: ::.:. ::.::::.::.::::::::
XP_011 HISLITPSFPTEGESQFVLQLRPSLRGALLSLLDHYEWNCFVFLYDTDRGYSILQAIMEK
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 AVQNNWQVTARSVGNIKDVQEFRRIIEEMDRRQEKRYLIDCEVERINTILEQVVILGKHS
: ::.:.:.: : :..::. .:...::.::::::...::::.::...::::.: .:::
XP_011 AGQNGWHVSAICVENFNDVS-YRQLLEELDRRQEKKFVIDCEIERLQNILEQIVSVGKHV
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 RGYHYMLANLGFTDILLERVMHGGANITGFQIVNNENPMVQQFIQRWVRLDEREFPEAKN
.::::..::::: :: ::: .:::::.::::.:. ..::: ....:: .::.::.: ...
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pF1KB4 APLKYTSALTHDAILVIAEAFRYLRRQRVDVSRRGSAGDCLANPAVPWSQGIDIERALKM
: :::::::.:..::.::.:: ::::..:.::::.:::::::::.::.::::.::.::.
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:..::.:::.::: ::::.:::.::.:.: .: ::.::::.....: ..: ..::.:.
XP_011 VRIQGLTGNVQFDHYGRRVNYTMDVFELKSTGPRKVGYWNDMDKLVLIQDVPTLGNDTAA
360 370 380 390 400 410
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::::.:::::.::::::::::::..:::..::::::::: :::::. ::::..:: :::
XP_011 IENRTVVVTTIMESPYVMYKKNHEMFEGNDKYEGYCVDLASEIAKHIGIKYKIAIVPDGK
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::::: .::::::::::::::.:.::.:::::::::::::::::::::::::::::::::
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480 490 500 510 520 530
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XP_011 TAEGVARVRKSKGKFAFLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGVATPKGSSLRTP
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XP_011 VNLAVLKLSEAGVLDKLKNKWWYDKGECGPKDSGSKDKTSALSLSNVAGVFYILVGGLGL
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pF1KB4 AMMVALIEFCYKSRAESKRMKLTKNTQNFKPAPATNTQNYATYREGYNVYGTESVKI
::.:::::::::::::.::::..:..:.:.:. . :::: ::::::::::::::.::
XP_011 AMLVALIEFCYKSRAEAKRMKVAKSAQTFNPTSSQNTQNLATYREGYNVYGTESIKI
830 840 850 860 870 880
>>NP_001070711 (OMIM: 138246) glutamate receptor 4 isofo (884 aa)
initn: 3112 init1: 1784 opt: 4558 Z-score: 5772.7 bits: 1079.3 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4558; 74.7% identity (92.8% similar) in 887 aa overlap (11-894:4-884)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MARQKKMGQSVLRAVFFLVLGLLGHSHGGFPNTISIGGLFMRNTVQEHSAFRFAVQLYNT
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10 20 30 40 50
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pF1KB4 NQNTTEKPFHLNYHVDHLDSSNSFSVTNAFCSQFSRGVYAIFGFYDQMSMNTLTSFCGAL
. :..: ::.: :::.....:::.::::::::.::::.::::.::. :..::::::.::
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pF1KB4 HTSFVTPSFPTDADVQFVIQMRPALKGAILSLLGHYKWEKFVYLYDTERGFSILQAIMEA
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pF1KB4 AVQNNWQVTARSVGNIKDVQEFRRIIEEMDRRQEKRYLIDCEVERINTILEQVVILGKHS
: ::.:.:.: : :..::. .:...::.::::::...::::.::...::::.: .:::
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pF1KB4 RGYHYMLANLGFTDILLERVMHGGANITGFQIVNNENPMVQQFIQRWVRLDEREFPEAKN
.::::..::::: :: ::: .:::::.::::.:. ..::: ....:: .::.::.: ...
NP_001 KGYHYIIANLGFKDISLERFIHGGANVTGFQLVDFNTPMVIKLMDRWKKLDQREYPGSET
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 APLKYTSALTHDAILVIAEAFRYLRRQRVDVSRRGSAGDCLANPAVPWSQGIDIERALKM
: :::::::.:..::.::.:: ::::..:.::::.:::::::::.::.::::.::.::.
NP_001 PP-KYTSALTYDGVLVMAETFRSLRRQKIDISRRGNAGDCLANPAAPWGQGIDMERTLKQ
300 310 320 330 340 350
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pF1KB4 VQVQGMTGNIQFDTYGRRTNYTIDVYEMKVSGSRKAGYWNEYERFVPFSD-QQISNDSAS
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NP_001 VRIQGLTGNVQFDHYGRRVNYTMDVFELKSTGPRKVGYWNDMDKLVLIQDVPTLGNDTAA
360 370 380 390 400 410
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pF1KB4 SENRTIVVTTILESPYVMYKKNHEQLEGNERYEGYCVDLAYEIAKHVRIKYKLSIVGDGK
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NP_001 IENRTVVVTTIMESPYVMYKKNHEMFEGNDKYEGYCVDLASEIAKHIGIKYKIAIVPDGK
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pF1KB4 YGARDPETKIWNGMVGELVYGRADIAVAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKPQK
::::: .::::::::::::::.:.::.:::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YGARDADTKIWNGMVGELVYGKAEIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKPQK
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pF1KB4 SKPGVFSFLDPLAYEIWMCIVFAYIGVSVVLFLVSRFSPYEWHLEDNNEEPRD-PQSPPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: .:::.: ..: :
NP_001 SKPGVFSFLDPLAYEIWMCIVFAYIGVSVVLFLVSRFSPYEWH----TEEPEDGKEGPSD
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pF1KB4 VERMVSPIESAEDLAKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVYEKMWSYMKSAEPSVFTKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::.::::::::.:
NP_001 VERMVSPIESAEDLAKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVYEKMWTYMRSAEPSVFTRT
650 660 670 680 690 700
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pF1KB4 TADGVARVRKSKGKFAFLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGVATPKGSALGTP
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780 790 800 810 820 830
pF1KB4 VNLAVLKLSEQGILDKLKNKWWYDKGECGAKDSGSKDKTSALSLSNVAGVFYILVGGLGL
::::::::.:::.::::::::::::::::. . ::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGECGSGGGDSKDKTSALSLSNVAGVFYILVGGLGL
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pF1KB4 AMMVALIEFCYKSRAESKRMKLTKNTQNFKPAPATNTQNYATYREGYNVYGTESVKI
::.:::::::::::::.::::..:..:.:.:. . :::: ::::::::::::::.::
NP_001 AMLVALIEFCYKSRAEAKRMKVAKSAQTFNPTSSQNTQNLATYREGYNVYGTESIKI
830 840 850 860 870 880
>>NP_000820 (OMIM: 138246) glutamate receptor 4 isoform (902 aa)
initn: 3002 init1: 1674 opt: 4448 Z-score: 5633.0 bits: 1053.5 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4448; 75.8% identity (93.1% similar) in 853 aa overlap (11-860:4-850)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MARQKKMGQSVLRAVFFLVLGLLGHSHGGFPNTISIGGLFMRNTVQEHSAFRFAVQLYNT
. : . .: :. : . :.::....:::::.::: ::..:::.:. :.::
NP_000 MRIISRQIVLLFSGFWGLAMGAFPSSVQIGGLFIRNTDQEYTAFRLAIFLHNT
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 NQNTTEKPFHLNYHVDHLDSSNSFSVTNAFCSQFSRGVYAIFGFYDQMSMNTLTSFCGAL
. :..: ::.: :::.....:::.::::::::.::::.::::.::. :..::::::.::
NP_000 SPNASEAPFNLVPHVDNIETANSFAVTNAFCSQYSRGVFAIFGLYDKRSVHTLTSFCSAL
60 70 80 90 100 110
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pF1KB4 HTSFVTPSFPTDADVQFVIQMRPALKGAILSLLGHYKWEKFVYLYDTERGFSILQAIMEA
: :..::::::... :::.:.::.:.::.:::: ::.:. ::.::::.::.::::::::
NP_000 HISLITPSFPTEGESQFVLQLRPSLRGALLSLLDHYEWNCFVFLYDTDRGYSILQAIMEK
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 AVQNNWQVTARSVGNIKDVQEFRRIIEEMDRRQEKRYLIDCEVERINTILEQVVILGKHS
: ::.:.:.: : :..::. .:...::.::::::...::::.::...::::.: .:::
NP_000 AGQNGWHVSAICVENFNDVS-YRQLLEELDRRQEKKFVIDCEIERLQNILEQIVSVGKHV
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 RGYHYMLANLGFTDILLERVMHGGANITGFQIVNNENPMVQQFIQRWVRLDEREFPEAKN
.::::..::::: :: ::: .:::::.::::.:. ..::: ....:: .::.::.: ...
NP_000 KGYHYIIANLGFKDISLERFIHGGANVTGFQLVDFNTPMVIKLMDRWKKLDQREYPGSET
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 APLKYTSALTHDAILVIAEAFRYLRRQRVDVSRRGSAGDCLANPAVPWSQGIDIERALKM
: :::::::.:..::.::.:: ::::..:.::::.:::::::::.::.::::.::.::.
NP_000 PP-KYTSALTYDGVLVMAETFRSLRRQKIDISRRGNAGDCLANPAAPWGQGIDMERTLKQ
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410
pF1KB4 VQVQGMTGNIQFDTYGRRTNYTIDVYEMKVSGSRKAGYWNEYERFVPFSD-QQISNDSAS
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NP_000 VRIQGLTGNVQFDHYGRRVNYTMDVFELKSTGPRKVGYWNDMDKLVLIQDVPTLGNDTAA
360 370 380 390 400 410
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pF1KB4 SENRTIVVTTILESPYVMYKKNHEQLEGNERYEGYCVDLAYEIAKHVRIKYKLSIVGDGK
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NP_000 IENRTVVVTTIMESPYVMYKKNHEMFEGNDKYEGYCVDLASEIAKHIGIKYKIAIVPDGK
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pF1KB4 YGARDPETKIWNGMVGELVYGRADIAVAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKPQK
::::: .::::::::::::::.:.::.:::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 YGARDADTKIWNGMVGELVYGKAEIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKPQK
480 490 500 510 520 530
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pF1KB4 SKPGVFSFLDPLAYEIWMCIVFAYIGVSVVLFLVSRFSPYEWHLEDNNEEPRD-PQSPPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: .:::.: ..: :
NP_000 SKPGVFSFLDPLAYEIWMCIVFAYIGVSVVLFLVSRFSPYEWH----TEEPEDGKEGPSD
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pF1KB4 -PPNEFGIFNSLWFSLGAFMQQGCDISPRSLSGRIVGGVWWFFTLIIISSYTANLAAFLT
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 QPPNEFGIFNSLWFSLGAFMQQGCDISPRSLSGRIVGGVWWFFTLIIISSYTANLAAFLT
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pF1KB4 VERMVSPIESAEDLAKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVYEKMWSYMKSAEPSVFTKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::.::::::::.:
NP_000 VERMVSPIESAEDLAKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVYEKMWTYMRSAEPSVFTRT
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pF1KB4 TADGVARVRKSKGKFAFLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGVATPKGSALGTP
::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::
NP_000 TAEGVARVRKSKGKFAFLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGVATPKGSSLGTP
710 720 730 740 750 760
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pF1KB4 VNLAVLKLSEQGILDKLKNKWWYDKGECGAKDSGSKDKTSALSLSNVAGVFYILVGGLGL
:::::::::: :.:::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 VNLAVLKLSEAGVLDKLKNKWWYDKGECGPKDSGSKDKTSALSLSNVAGVFYILVGGLGL
770 780 790 800 810 820
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pF1KB4 AMMVALIEFCYKSRAESKRMKLTKNTQNFKPAPATNTQNYATYREGYNVYGTESVKI
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NP_000 AMLVALIEFCYKSRAEAKRMKLTFSEAIRNKARLSITGSVGENGRVLTPDCPKAVHTGTA
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>>XP_006718886 (OMIM: 138246) PREDICTED: glutamate recep (902 aa)
initn: 2991 init1: 1663 opt: 4437 Z-score: 5619.0 bits: 1050.9 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4437; 75.7% identity (93.0% similar) in 853 aa overlap (11-860:4-850)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MARQKKMGQSVLRAVFFLVLGLLGHSHGGFPNTISIGGLFMRNTVQEHSAFRFAVQLYNT
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XP_006 MRIISRQIVLLFSGFWGLAMGAFPSSVQIGGLFIRNTDQEYTAFRLAIFLHNT
10 20 30 40 50
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pF1KB4 NQNTTEKPFHLNYHVDHLDSSNSFSVTNAFCSQFSRGVYAIFGFYDQMSMNTLTSFCGAL
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XP_006 SPNASEAPFNLVPHVDNIETANSFAVTNAFCSQYSRGVFAIFGLYDKRSVHTLTSFCSAL
60 70 80 90 100 110
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pF1KB4 HTSFVTPSFPTDADVQFVIQMRPALKGAILSLLGHYKWEKFVYLYDTERGFSILQAIMEA
: :..::::::... :::.:.::.:.::.:::: ::.:. ::.::::.::.::::::::
XP_006 HISLITPSFPTEGESQFVLQLRPSLRGALLSLLDHYEWNCFVFLYDTDRGYSILQAIMEK
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 AVQNNWQVTARSVGNIKDVQEFRRIIEEMDRRQEKRYLIDCEVERINTILEQVVILGKHS
: ::.:.:.: : :..::. .:...::.::::::...::::.::...::::.: .:::
XP_006 AGQNGWHVSAICVENFNDVS-YRQLLEELDRRQEKKFVIDCEIERLQNILEQIVSVGKHV
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 RGYHYMLANLGFTDILLERVMHGGANITGFQIVNNENPMVQQFIQRWVRLDEREFPEAKN
.::::..::::: :: ::: .:::::.::::.:. ..::: ....:: .::.::.: ...
XP_006 KGYHYIIANLGFKDISLERFIHGGANVTGFQLVDFNTPMVIKLMDRWKKLDQREYPGSET
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 APLKYTSALTHDAILVIAEAFRYLRRQRVDVSRRGSAGDCLANPAVPWSQGIDIERALKM
: :::::::.:..::.::.:: ::::..:.::::.:::::::::.::.::::.::.::.
XP_006 PP-KYTSALTYDGVLVMAETFRSLRRQKIDISRRGNAGDCLANPAAPWGQGIDMERTLKQ
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410
pF1KB4 VQVQGMTGNIQFDTYGRRTNYTIDVYEMKVSGSRKAGYWNEYERFVPFSD-QQISNDSAS
:..::.:::.::: ::::.:::.::.:.: .: ::.::::.....: ..: ..::.:.
XP_006 VRIQGLTGNVQFDHYGRRVNYTMDVFELKSTGPRKVGYWNDMDKLVLIQDVPTLGNDTAA
360 370 380 390 400 410
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pF1KB4 SENRTIVVTTILESPYVMYKKNHEQLEGNERYEGYCVDLAYEIAKHVRIKYKLSIVGDGK
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XP_006 IENRTVVVTTIMESPYVMYKKNHEMFEGNDKYEGYCVDLASEIAKHIGIKYKIAIVPDGK
420 430 440 450 460 470
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pF1KB4 YGARDPETKIWNGMVGELVYGRADIAVAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKPQK
::::: .::::::::::::::.:.::.:::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 YGARDADTKIWNGMVGELVYGKAEIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKPQK
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pF1KB4 SKPGVFSFLDPLAYEIWMCIVFAYIGVSVVLFLVSRFSPYEWHLEDNNEEPRD-PQSPPD
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XP_006 SKPGVFSFLDPLAYEIWMCIVFAYIGVSVVLFLVSRFSPYEWH----TEEPEDGKEGPSD
540 550 560 570 580
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pF1KB4 -PPNEFGIFNSLWFSLGAFMQQGCDISPRSLSGRIVGGVWWFFTLIIISSYTANLAAFLT
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 QPPNEFGIFNSLWFSLGAFMQQGCDISPRSLSGRIVGGVWWFFTLIIISSYTANLAAFLT
590 600 610 620 630 640
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pF1KB4 VERMVSPIESAEDLAKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVYEKMWSYMKSAEPSVFTKT
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XP_006 VERMVSPIESAEDLAKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVYEKMWTYMRSAEPSVFTRT
650 660 670 680 690 700
720 730 740 750 760 770
pF1KB4 TADGVARVRKSKGKFAFLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGVATPKGSALGTP
::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.: ::
XP_006 TAEGVARVRKSKGKFAFLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGVATPKGSSLRTP
710 720 730 740 750 760
780 790 800 810 820 830
pF1KB4 VNLAVLKLSEQGILDKLKNKWWYDKGECGAKDSGSKDKTSALSLSNVAGVFYILVGGLGL
:::::::::: :.:::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 VNLAVLKLSEAGVLDKLKNKWWYDKGECGPKDSGSKDKTSALSLSNVAGVFYILVGGLGL
770 780 790 800 810 820
840 850 860 870 880 890
pF1KB4 AMMVALIEFCYKSRAESKRMKLTKNTQNFKPAPATNTQNYATYREGYNVYGTESVKI
::.:::::::::::::.::::::
XP_006 AMLVALIEFCYKSRAEAKRMKLTFSEAIRNKARLSITGSVGENGRVLTPDCPKAVHTGTA
830 840 850 860 870 880
>>XP_005271575 (OMIM: 138246) PREDICTED: glutamate recep (902 aa)
initn: 2948 init1: 1620 opt: 4394 Z-score: 5564.5 bits: 1040.8 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4394; 75.0% identity (92.7% similar) in 853 aa overlap (11-860:4-850)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MARQKKMGQSVLRAVFFLVLGLLGHSHGGFPNTISIGGLFMRNTVQEHSAFRFAVQLYNT
. : . .: :. : . :.::....:::::.::: ::..:::.:. :.::
XP_005 MRIISRQIVLLFSGFWGLAMGAFPSSVQIGGLFIRNTDQEYTAFRLAIFLHNT
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 NQNTTEKPFHLNYHVDHLDSSNSFSVTNAFCSQFSRGVYAIFGFYDQMSMNTLTSFCGAL
. :..: ::.: :::.....:::.::::::::.::::.::::.::. :..::::::.::
XP_005 SPNASEAPFNLVPHVDNIETANSFAVTNAFCSQYSRGVFAIFGLYDKRSVHTLTSFCSAL
60 70 80 90 100 110
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pF1KB4 HTSFVTPSFPTDADVQFVIQMRPALKGAILSLLGHYKWEKFVYLYDTERGFSILQAIMEA
: :..::::::... :::.:.::.:.::.:::: ::.:. ::.::::.::.::::::::
XP_005 HISLITPSFPTEGESQFVLQLRPSLRGALLSLLDHYEWNCFVFLYDTDRGYSILQAIMEK
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 AVQNNWQVTARSVGNIKDVQEFRRIIEEMDRRQEKRYLIDCEVERINTILEQVVILGKHS
: ::.:.:.: : :..::. .:...::.::::::...::::.::...::::.: .:::
XP_005 AGQNGWHVSAICVENFNDVS-YRQLLEELDRRQEKKFVIDCEIERLQNILEQIVSVGKHV
180 190 200 210 220 230
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pF1KB4 RGYHYMLANLGFTDILLERVMHGGANITGFQIVNNENPMVQQFIQRWVRLDEREFPEAKN
.::::..::::: :: ::: .:::::.::::.:. ..::: ....:: .::.::.: ...
XP_005 KGYHYIIANLGFKDISLERFIHGGANVTGFQLVDFNTPMVIKLMDRWKKLDQREYPGSET
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pF1KB4 APLKYTSALTHDAILVIAEAFRYLRRQRVDVSRRGSAGDCLANPAVPWSQGIDIERALKM
: :::::::.:..::.::.:: ::::..:.::::.:::::::::.::.::::.::.::.
XP_005 PP-KYTSALTYDGVLVMAETFRSLRRQKIDISRRGNAGDCLANPAAPWGQGIDMERTLKQ
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pF1KB4 VQVQGMTGNIQFDTYGRRTNYTIDVYEMKVSGSRKAGYWNEYERFVPFSD-QQISNDSAS
:..::.:::.::: ::::.:::.::.:.: .: ::.::::.....: ..: ..::.:.
XP_005 VRIQGLTGNVQFDHYGRRVNYTMDVFELKSTGPRKVGYWNDMDKLVLIQDVPTLGNDTAA
360 370 380 390 400 410
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pF1KB4 SENRTIVVTTILESPYVMYKKNHEQLEGNERYEGYCVDLAYEIAKHVRIKYKLSIVGDGK
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XP_005 IENRTVVVTTIMESPYVMYKKNHEMFEGNDKYEGYCVDLASEIAKHIGIKYKIAIVPDGK
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pF1KB4 YGARDPETKIWNGMVGELVYGRADIAVAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKPQK
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XP_005 YGARDADTKIWNGMVGELVYGKAEIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKPQK
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pF1KB4 SKPGVFSFLDPLAYEIWMCIVFAYIGVSVVLFLVSRFSPYEWHLEDNNEEPRD-PQSPPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: .:::.: ..: :
XP_005 SKPGVFSFLDPLAYEIWMCIVFAYIGVSVVLFLVSRFSPYEWH----TEEPEDGKEGPSD
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pF1KB4 -PPNEFGIFNSLWFSLGAFMQQGCDISPRSLSGRIVGGVWWFFTLIIISSYTANLAAFLT
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 QPPNEFGIFNSLWFSLGAFMQQGCDISPRSLSGRIVGGVWWFFTLIIISSYTANLAAFLT
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pF1KB4 VERMVSPIESAEDLAKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVYEKMWSYMKSAEPSVFTKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::.::::::::.:
XP_005 VERMVSPIESAEDLAKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVYEKMWTYMRSAEPSVFTRT
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pF1KB4 TADGVARVRKSKGKFAFLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGVATPKGSALGTP
::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.: .
XP_005 TAEGVARVRKSKGKFAFLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGVATPKGSSLRNA
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pF1KB4 VNLAVLKLSEQGILDKLKNKWWYDKGECGAKDSGSKDKTSALSLSNVAGVFYILVGGLGL
::::::::.:::.::::::::::::::::. . ::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGECGSGGGDSKDKTSALSLSNVAGVFYILVGGLGL
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pF1KB4 AMMVALIEFCYKSRAESKRMKLTKNTQNFKPAPATNTQNYATYREGYNVYGTESVKI
::.:::::::::::::.::::::
XP_005 AMLVALIEFCYKSRAEAKRMKLTFSEAIRNKARLSITGSVGENGRVLTPDCPKAVHTGTA
830 840 850 860 870 880
>>NP_000817 (OMIM: 138247) glutamate receptor 2 isoform (883 aa)
initn: 3462 init1: 1771 opt: 4336 Z-score: 5491.0 bits: 1027.2 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4336; 71.5% identity (90.3% similar) in 890 aa overlap (9-894:2-883)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MARQKKMGQSVLRAVFFLVLGLLGHSHGGFPNTISIGGLFMRNTVQEHSAFRFAVQLYNT
:.... .: : : : :.:.::::: :.. ::.:::: .. ..:
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pF1KB4 NQNTTEKPFHLNYHVDHLDSSNSFSVTNAFCSQFSRGVYAIFGFYDQMSMNTLTSFCGAL
.. :.:. :.:.:. .:::.:::::::::::::::::::::. :.::.:::::.:
NP_000 SE------FRLTPHIDNLEVANSFAVTNAFCSQFSRGVYAIFGFYDKKSVNTITSFCGTL
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pF1KB4 HTSFVTPSFPTDADVQFVIQMRPALKGAILSLLGHYKWEKFVYLYDTERGFSILQAIMEA
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pF1KB4 AVQNNWQVTARSVGNIKDVQE---FRRIIEEMDRRQEKRYLIDCEVERINTILEQVVILG
:....::::: .::::.. .. .: ...... ..:.: ..::: ...: :..::. .:
NP_000 AAEKKWQVTAINVGNINNDKKDEMYRSLFQDLELKKERRVILDCERDKVNDIVDQVITIG
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pF1KB4 KHSRGYHYMLANLGFTDILLERVMHGGANITGFQIVNNENPMVQQFIQRWVRLDEREFPE
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NP_000 KHVKGYHYIIANLGFTDGDLLKIQFGGANVSGFQIVDYDDSLVSKFIERWSTLEEKEYPG
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pF1KB4 AKNAPLKYTSALTHDAILVIAEAFRYLRRQRVDVSRRGSAGDCLANPAVPWSQGIDIERA
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NP_000 AHTTTIKYTSALTYDAVQVMTEAFRNLRKQRIEISRRGNAGDCLANPAVPWGQGVEIERA
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pF1KB4 LKMVQVQGMTGNIQFDTYGRRTNYTIDVYEMKVSGSRKAGYWNEYERFV-PFSDQQISND
::.:::.:..:::.:: :.: ::::...:.:..: :: :::.: ...: ... .::
NP_000 LKQVQVEGLSGNIKFDQNGKRINYTINIMELKTNGPRKIGYWSEVDKMVVTLTELPSGND
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pF1KB4 SASSENRTIVVTTILESPYVMYKKNHEQLEGNERYEGYCVDLAYEIAKHVRIKYKLSIVG
... ::.:.::::::::::::.:::::.::::::::::::::: ::::: .::::.:::
NP_000 TSGLENKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVG
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pF1KB4 DGKYGARDPETKIWNGMVGELVYGRADIAVAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKK
:::::::: .::::::::::::::.::::.::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 DGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKK
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pF1KB4 PQKSKPGVFSFLDPLAYEIWMCIVFAYIGVSVVLFLVSRFSPYEWHLEDNNEEPRDPQSP
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NP_000 PQKSKPGVFSFLDPLAYEIWMCIVFAYIGVSVVLFLVSRFSPYEWHTEEF-EDGRETQSS
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pF1KB4 PDPPNEFGIFNSLWFSLGAFMQQGCDISPRSLSGRIVGGVWWFFTLIIISSYTANLAAFL
. :::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 -ESTNEFGIFNSLWFSLGAFMRQGCDISPRSLSGRIVGGVWWFFTLIIISSYTANLAAFL
590 600 610 620 630 640
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pF1KB4 TVERMVSPIESAEDLAKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVYEKMWSYMKSAEPSVFTK
:::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::..:::.::.:::::::..
NP_000 TVERMVSPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVR
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pF1KB4 TTADGVARVRKSKGKFAFLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGVATPKGSALGT
:::.:::::::::::.:.:::::::::::::::::::::::::::::::.::::::.: :
NP_000 TTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLRT
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pF1KB4 PVNLAVLKLSEQGILDKLKNKWWYDKGECGAKDSGSKDKTSALSLSNVAGVFYILVGGLG
:::::::::::::.:::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::
NP_000 PVNLAVLKLSEQGVLDKLKNKWWYDKGECGAKDSGSKEKTSALSLSNVAGVFYILVGGLG
770 780 790 800 810 820
840 850 860 870 880 890
pF1KB4 LAMMVALIEFCYKSRAESKRMKLTKNTQNFKPAPATNTQNYATYREGYNVYGTESVKI
:::.:::::::::::::.::::..::.::..:. . :.::.:::.::::::: :::::
NP_000 LAMLVALIEFCYKSRAEAKRMKVAKNAQNINPSSSQNSQNFATYKEGYNVYGIESVKI
830 840 850 860 870 880
>>NP_001077088 (OMIM: 138247) glutamate receptor 2 isofo (883 aa)
initn: 3405 init1: 1714 opt: 4279 Z-score: 5418.7 bits: 1013.8 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4279; 70.6% identity (89.9% similar) in 890 aa overlap (9-894:2-883)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MARQKKMGQSVLRAVFFLVLGLLGHSHGGFPNTISIGGLFMRNTVQEHSAFRFAVQLYNT
:.... .: : : : :.:.::::: :.. ::.:::: .. ..:
NP_001 MQKIMHISVLLSPVLWGLIFGVSSNSIQIGGLFPRGADQEYSAFRVGMVQFST
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 NQNTTEKPFHLNYHVDHLDSSNSFSVTNAFCSQFSRGVYAIFGFYDQMSMNTLTSFCGAL
.. :.:. :.:.:. .:::.:::::::::::::::::::::. :.::.:::::.:
NP_001 SE------FRLTPHIDNLEVANSFAVTNAFCSQFSRGVYAIFGFYDKKSVNTITSFCGTL
60 70 80 90 100
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pF1KB4 HTSFVTPSFPTDADVQFVIQMRPALKGAILSLLGHYKWEKFVYLYDTERGFSILQAIMEA
:.::.:::::::. ::::::: ::::.:::. .:.:.::.::::..::.: :::....
NP_001 HVSFITPSFPTDGTHPFVIQMRPDLKGALLSLIEYYQWDKFAYLYDSDRGLSTLQAVLDS
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230
pF1KB4 AVQNNWQVTARSVGNIKDVQE---FRRIIEEMDRRQEKRYLIDCEVERINTILEQVVILG
:....::::: .::::.. .. .: ...... ..:.: ..::: ...: :..::. .:
NP_001 AAEKKWQVTAINVGNINNDKKDEMYRSLFQDLELKKERRVILDCERDKVNDIVDQVITIG
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 KHSRGYHYMLANLGFTDILLERVMHGGANITGFQIVNNENPMVQQFIQRWVRLDEREFPE
:: .::::..::::::: : ... ::::..:::::. .. .:..::.:: :.:.:.:
NP_001 KHVKGYHYIIANLGFTDGDLLKIQFGGANVSGFQIVDYDDSLVSKFIERWSTLEEKEYPG
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pF1KB4 AKNAPLKYTSALTHDAILVIAEAFRYLRRQRVDVSRRGSAGDCLANPAVPWSQGIDIERA
:... .:::::::.::. :..:::: ::.::...::::.::::::::::::.::..::::
NP_001 AHTTTIKYTSALTYDAVQVMTEAFRNLRKQRIEISRRGNAGDCLANPAVPWGQGVEIERA
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KB4 LKMVQVQGMTGNIQFDTYGRRTNYTIDVYEMKVSGSRKAGYWNEYERFV-PFSDQQISND
::.:::.:..:::.:: :.: ::::...:.:..: :: :::.: ...: ... .::
NP_001 LKQVQVEGLSGNIKFDQNGKRINYTINIMELKTNGPRKIGYWSEVDKMVVTLTELPSGND
350 360 370 380 390 400
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pF1KB4 SASSENRTIVVTTILESPYVMYKKNHEQLEGNERYEGYCVDLAYEIAKHVRIKYKLSIVG
... ::.:.::::::::::::.:::::.::::::::::::::: ::::: .::::.:::
NP_001 TSGLENKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVG
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pF1KB4 DGKYGARDPETKIWNGMVGELVYGRADIAVAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKK
:::::::: .::::::::::::::.::::.::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKK
470 480 490 500 510 520
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pF1KB4 PQKSKPGVFSFLDPLAYEIWMCIVFAYIGVSVVLFLVSRFSPYEWHLEDNNEEPRDPQSP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :. :. :. ::
NP_001 PQKSKPGVFSFLDPLAYEIWMCIVFAYIGVSVVLFLVSRFSPYEWHTEEF-EDGRETQSS
530 540 550 560 570 580
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pF1KB4 PDPPNEFGIFNSLWFSLGAFMQQGCDISPRSLSGRIVGGVWWFFTLIIISSYTANLAAFL
. :::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 -ESTNEFGIFNSLWFSLGAFMRQGCDISPRSLSGRIVGGVWWFFTLIIISSYTANLAAFL
590 600 610 620 630 640
660 670 680 690 700 710
pF1KB4 TVERMVSPIESAEDLAKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVYEKMWSYMKSAEPSVFTK
:::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::..:::.::.:::::::..
NP_001 TVERMVSPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVR
650 660 670 680 690 700
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pF1KB4 TTADGVARVRKSKGKFAFLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGVATPKGSALGT
:::.:::::::::::.:.:::::::::::::::::::::::::::::::.::::::.: .
NP_001 TTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLRN
710 720 730 740 750 760
780 790 800 810 820 830
pF1KB4 PVNLAVLKLSEQGILDKLKNKWWYDKGECGAKDSGSKDKTSALSLSNVAGVFYILVGGLG
::::::::.:::.::::::::::::::::. . ::.::::::::::::::::::::::
NP_001 AVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGECGSGGGDSKEKTSALSLSNVAGVFYILVGGLG
770 780 790 800 810 820
840 850 860 870 880 890
pF1KB4 LAMMVALIEFCYKSRAESKRMKLTKNTQNFKPAPATNTQNYATYREGYNVYGTESVKI
:::.:::::::::::::.::::..::.::..:. . :.::.:::.::::::: :::::
NP_001 LAMLVALIEFCYKSRAEAKRMKVAKNAQNINPSSSQNSQNFATYKEGYNVYGIESVKI
830 840 850 860 870 880
>>XP_016863605 (OMIM: 138247) PREDICTED: glutamate recep (836 aa)
initn: 3394 init1: 1777 opt: 4258 Z-score: 5392.4 bits: 1008.9 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4258; 74.3% identity (92.5% similar) in 830 aa overlap (69-894:9-836)
40 50 60 70 80 90
pF1KB4 LFMRNTVQEHSAFRFAVQLYNTNQNTTEKPFHLNYHVDHLDSSNSFSVTNAFCSQFSRGV
:.:. :.:.:. .:::.:::::::::::::
XP_016 MVQFSTSEFRLTPHIDNLEVANSFAVTNAFCSQFSRGV
10 20 30
100 110 120 130 140 150
pF1KB4 YAIFGFYDQMSMNTLTSFCGALHTSFVTPSFPTDADVQFVIQMRPALKGAILSLLGHYKW
::::::::. :.::.:::::.::.::.:::::::. ::::::: ::::.:::. .:.:
XP_016 YAIFGFYDKKSVNTITSFCGTLHVSFITPSFPTDGTHPFVIQMRPDLKGALLSLIEYYQW
40 50 60 70 80 90
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pF1KB4 EKFVYLYDTERGFSILQAIMEAAVQNNWQVTARSVGNIKDVQE---FRRIIEEMDRRQEK
.::.::::..::.: :::....:....::::: .::::.. .. .: ...... ..:.
XP_016 DKFAYLYDSDRGLSTLQAVLDSAAEKKWQVTAINVGNINNDKKDEMYRSLFQDLELKKER
100 110 120 130 140 150
220 230 240 250 260 270
pF1KB4 RYLIDCEVERINTILEQVVILGKHSRGYHYMLANLGFTDILLERVMHGGANITGFQIVNN
: ..::: ...: :..::. .::: .::::..::::::: : ... ::::..:::::.
XP_016 RVILDCERDKVNDIVDQVITIGKHVKGYHYIIANLGFTDGDLLKIQFGGANVSGFQIVDY
160 170 180 190 200 210
280 290 300 310 320 330
pF1KB4 ENPMVQQFIQRWVRLDEREFPEAKNAPLKYTSALTHDAILVIAEAFRYLRRQRVDVSRRG
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