Result of FASTA (ccds) for pF1KB4088
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB4088, 760 aa
  1>>>pF1KB4088 760 - 760 aa - 760 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5393+/-0.00112; mu= 19.0666+/- 0.067
 mean_var=72.4283+/-14.248, 0's: 0 Z-trim(102.8): 19  B-trim: 0 in 0/49
 Lambda= 0.150702
 statistics sampled from 7116 (7131) to 7116 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.565), E-opt: 0.2 (0.219), width:  16
 Scan time:  3.140

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS3312.1 TFRC gene_id:7037|Hs108|chr3            ( 760) 5024 1102.3       0
CCDS82891.1 TFRC gene_id:7037|Hs108|chr3           ( 679) 4492 986.6       0
CCDS34707.1 TFR2 gene_id:7036|Hs108|chr7           ( 801)  834 191.4 4.9e-48
CCDS46960.1 NAALADL2 gene_id:254827|Hs108|chr3     ( 795)  448 107.4 8.9e-23
CCDS8288.1 NAALAD2 gene_id:10003|Hs108|chr11       ( 740)  444 106.6 1.5e-22
CCDS73364.1 NAALAD2 gene_id:10003|Hs108|chr11      ( 707)  435 104.6 5.7e-22
CCDS53627.1 FOLH1 gene_id:2346|Hs108|chr11         ( 704)  427 102.8 1.9e-21
CCDS31493.1 FOLH1 gene_id:2346|Hs108|chr11         ( 719)  427 102.9 1.9e-21
CCDS53628.1 FOLH1 gene_id:2346|Hs108|chr11         ( 735)  427 102.9   2e-21
CCDS7946.1 FOLH1 gene_id:2346|Hs108|chr11          ( 750)  427 102.9   2e-21
CCDS31604.1 NAALADL1 gene_id:10004|Hs108|chr11     ( 740)  381 92.9   2e-18
CCDS53626.1 FOLH1 gene_id:2346|Hs108|chr11         ( 442)  373 91.0 4.4e-18


>>CCDS3312.1 TFRC gene_id:7037|Hs108|chr3                 (760 aa)
 initn: 5024 init1: 5024 opt: 5024  Z-score: 5899.6  bits: 1102.3 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 5024; 100.0% identity (100.0% similar) in 760 aa overlap (1-760:1-760)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB4 MMDQARSAFSNLFGGEPLSYTRFSLARQVDGDNSHVEMKLAVDEEENADNNTKANVTKPK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MMDQARSAFSNLFGGEPLSYTRFSLARQVDGDNSHVEMKLAVDEEENADNNTKANVTKPK
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB4 RCSGSICYGTIAVIVFFLIGFMIGYLGYCKGVEPKTECERLAGTESPVREEPGEDFPAAR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 RCSGSICYGTIAVIVFFLIGFMIGYLGYCKGVEPKTECERLAGTESPVREEPGEDFPAAR
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB4 RLYWDDLKRKLSEKLDSTDFTGTIKLLNENSYVPREAGSQKDENLALYVENQFREFKLSK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 RLYWDDLKRKLSEKLDSTDFTGTIKLLNENSYVPREAGSQKDENLALYVENQFREFKLSK
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB4 VWRDQHFVKIQVKDSAQNSVIIVDKNGRLVYLVENPGGYVAYSKAATVTGKLVHANFGTK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 VWRDQHFVKIQVKDSAQNSVIIVDKNGRLVYLVENPGGYVAYSKAATVTGKLVHANFGTK
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB4 KDFEDLYTPVNGSIVIVRAGKITFAEKVANAESLNAIGVLIYMDQTKFPIVNAELSFFGH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 KDFEDLYTPVNGSIVIVRAGKITFAEKVANAESLNAIGVLIYMDQTKFPIVNAELSFFGH
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB4 AHLGTGDPYTPGFPSFNHTQFPPSRSSGLPNIPVQTISRAAAEKLFGNMEGDCPSDWKTD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 AHLGTGDPYTPGFPSFNHTQFPPSRSSGLPNIPVQTISRAAAEKLFGNMEGDCPSDWKTD
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB4 STCRMVTSESKNVKLTVSNVLKEIKILNIFGVIKGFVEPDHYVVVGAQRDAWGPGAAKSG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 STCRMVTSESKNVKLTVSNVLKEIKILNIFGVIKGFVEPDHYVVVGAQRDAWGPGAAKSG
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB4 VGTALLLKLAQMFSDMVLKDGFQPSRSIIFASWSAGDFGSVGATEWLEGYLSSLHLKAFT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 VGTALLLKLAQMFSDMVLKDGFQPSRSIIFASWSAGDFGSVGATEWLEGYLSSLHLKAFT
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB4 YINLDKAVLGTSNFKVSASPLLYTLIEKTMQNVKHPVTGQFLYQDSNWASKVEKLTLDNA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 YINLDKAVLGTSNFKVSASPLLYTLIEKTMQNVKHPVTGQFLYQDSNWASKVEKLTLDNA
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB4 AFPFLAYSGIPAVSFCFCEDTDYPYLGTTMDTYKELIERIPELNKVARAAAEVAGQFVIK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 AFPFLAYSGIPAVSFCFCEDTDYPYLGTTMDTYKELIERIPELNKVARAAAEVAGQFVIK
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB4 LTHDVELNLDYERYNSQLLSFVRDLNQYRADIKEMGLSLQWLYSARGDFFRATSRLTTDF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LTHDVELNLDYERYNSQLLSFVRDLNQYRADIKEMGLSLQWLYSARGDFFRATSRLTTDF
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB4 GNAEKTDRFVMKKLNDRVMRVEYHFLSPYVSPKESPFRHVFWGSGSHTLPALLENLKLRK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 GNAEKTDRFVMKKLNDRVMRVEYHFLSPYVSPKESPFRHVFWGSGSHTLPALLENLKLRK
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760
pF1KB4 QNNGAFNETLFRNQLALATWTIQGAANALSGDVWDIDNEF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 QNNGAFNETLFRNQLALATWTIQGAANALSGDVWDIDNEF
              730       740       750       760

>>CCDS82891.1 TFRC gene_id:7037|Hs108|chr3                (679 aa)
 initn: 4492 init1: 4492 opt: 4492  Z-score: 5275.2  bits: 986.6 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 4492; 100.0% identity (100.0% similar) in 679 aa overlap (82-760:1-679)

              60        70        80        90       100       110 
pF1KB4 TKANVTKPKRCSGSICYGTIAVIVFFLIGFMIGYLGYCKGVEPKTECERLAGTESPVREE
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82                               MIGYLGYCKGVEPKTECERLAGTESPVREE
                                             10        20        30

             120       130       140       150       160       170 
pF1KB4 PGEDFPAARRLYWDDLKRKLSEKLDSTDFTGTIKLLNENSYVPREAGSQKDENLALYVEN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 PGEDFPAARRLYWDDLKRKLSEKLDSTDFTGTIKLLNENSYVPREAGSQKDENLALYVEN
               40        50        60        70        80        90

             180       190       200       210       220       230 
pF1KB4 QFREFKLSKVWRDQHFVKIQVKDSAQNSVIIVDKNGRLVYLVENPGGYVAYSKAATVTGK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 QFREFKLSKVWRDQHFVKIQVKDSAQNSVIIVDKNGRLVYLVENPGGYVAYSKAATVTGK
              100       110       120       130       140       150

             240       250       260       270       280       290 
pF1KB4 LVHANFGTKKDFEDLYTPVNGSIVIVRAGKITFAEKVANAESLNAIGVLIYMDQTKFPIV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 LVHANFGTKKDFEDLYTPVNGSIVIVRAGKITFAEKVANAESLNAIGVLIYMDQTKFPIV
              160       170       180       190       200       210

             300       310       320       330       340       350 
pF1KB4 NAELSFFGHAHLGTGDPYTPGFPSFNHTQFPPSRSSGLPNIPVQTISRAAAEKLFGNMEG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 NAELSFFGHAHLGTGDPYTPGFPSFNHTQFPPSRSSGLPNIPVQTISRAAAEKLFGNMEG
              220       230       240       250       260       270

             360       370       380       390       400       410 
pF1KB4 DCPSDWKTDSTCRMVTSESKNVKLTVSNVLKEIKILNIFGVIKGFVEPDHYVVVGAQRDA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 DCPSDWKTDSTCRMVTSESKNVKLTVSNVLKEIKILNIFGVIKGFVEPDHYVVVGAQRDA
              280       290       300       310       320       330

             420       430       440       450       460       470 
pF1KB4 WGPGAAKSGVGTALLLKLAQMFSDMVLKDGFQPSRSIIFASWSAGDFGSVGATEWLEGYL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 WGPGAAKSGVGTALLLKLAQMFSDMVLKDGFQPSRSIIFASWSAGDFGSVGATEWLEGYL
              340       350       360       370       380       390

             480       490       500       510       520       530 
pF1KB4 SSLHLKAFTYINLDKAVLGTSNFKVSASPLLYTLIEKTMQNVKHPVTGQFLYQDSNWASK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 SSLHLKAFTYINLDKAVLGTSNFKVSASPLLYTLIEKTMQNVKHPVTGQFLYQDSNWASK
              400       410       420       430       440       450

             540       550       560       570       580       590 
pF1KB4 VEKLTLDNAAFPFLAYSGIPAVSFCFCEDTDYPYLGTTMDTYKELIERIPELNKVARAAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 VEKLTLDNAAFPFLAYSGIPAVSFCFCEDTDYPYLGTTMDTYKELIERIPELNKVARAAA
              460       470       480       490       500       510

             600       610       620       630       640       650 
pF1KB4 EVAGQFVIKLTHDVELNLDYERYNSQLLSFVRDLNQYRADIKEMGLSLQWLYSARGDFFR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 EVAGQFVIKLTHDVELNLDYERYNSQLLSFVRDLNQYRADIKEMGLSLQWLYSARGDFFR
              520       530       540       550       560       570

             660       670       680       690       700       710 
pF1KB4 ATSRLTTDFGNAEKTDRFVMKKLNDRVMRVEYHFLSPYVSPKESPFRHVFWGSGSHTLPA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 ATSRLTTDFGNAEKTDRFVMKKLNDRVMRVEYHFLSPYVSPKESPFRHVFWGSGSHTLPA
              580       590       600       610       620       630

             720       730       740       750       760
pF1KB4 LLENLKLRKQNNGAFNETLFRNQLALATWTIQGAANALSGDVWDIDNEF
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 LLENLKLRKQNNGAFNETLFRNQLALATWTIQGAANALSGDVWDIDNEF
              640       650       660       670         

>>CCDS34707.1 TFR2 gene_id:7036|Hs108|chr7                (801 aa)
 initn: 1452 init1: 470 opt: 834  Z-score: 975.9  bits: 191.4 E(32554): 4.9e-48
Smith-Waterman score: 1942; 45.2% identity (71.6% similar) in 726 aa overlap (68-760:84-801)

        40        50        60        70        80        90       
pF1KB4 MKLAVDEEENADNNTKANVTKPKRCSGSICYGTIAVIVFFLIGFMIGYLGYCKGVEPKTE
                                     : .......:  .:..::... .:      
CCDS34 MELRGPEPLGSRPRQPNLIPWAAAGRRAAPYLVLTALLIFTGAFLLGYVAF-RGSCQACG
            60        70        80        90       100        110  

       100       110       120       130       140       150       
pF1KB4 CERLAGTESPVREEPGEDFPAARRLYWDDLKRKLSEKLDSTDFTGTIKLLNENSYVPREA
          :. .:. :  ::  ::  .: :::.::.  . . :    .  ::.   ..:   : :
CCDS34 DSVLVVSED-VNYEPDLDFHQGR-LYWSDLQAMFLQFLGEGRLEDTIR---QTSLRERVA
            120        130        140       150          160       

       160       170       180       190        200       210      
pF1KB4 GSQKDENLALYVENQFREFKLSKVWRDQHFVKIQVKDSAQ-NSVIIVDKNGRLVYLV--E
       ::     :.  ..  . . ::..:: : :.: .:  : :. :..  ::. :..   .  :
CCDS34 GSAGMAALTQDIRAALSRQKLDHVWTDTHYVGLQFPDPAHPNTLHWVDEAGKVGEQLPLE
       170       180       190       200       210       220       

          220       230       240           250       260       270
pF1KB4 NPGGYVAYSKAATVTGKLVHANFGTKKDFEDLYT----PVNGSIVIVRAGKITFAEKVAN
       .:  :  ::  ..:::.::.:..:  .:..:: .    :: : ...::.: :.::.::.:
CCDS34 DPDVYCPYSAIGNVTGELVYAHYGRPEDLQDLRARGVDPV-GRLLLVRVGVISFAQKVTN
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pF1KB4 AESLNAIGVLIYMDQTKF------PIVNAELSFFGHAHLGTGDPYTPGFPSFNHTQFPPS
       :....: ::::: . . :      : .... . .::.::::::::::::::::.::::: 
CCDS34 AQDFGAQGVLIYPEPADFSQDPPKPSLSSQQAVYGHVHLGTGDPYTPGFPSFNQTQFPPV
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pF1KB4 RSSGLPNIPVQTISRAAAEKLFGNMEGDC-PSDWKTDSTCRMV-TSESKNVKLTVSNVLK
        :::::.::.: ::   : .:. ...:   :..:. .        . .  ..:.:.:   
CCDS34 ASSGLPSIPAQPISADIASRLLRKLKGPVAPQEWQGSLLGSPYHLGPGPRLRLVVNNHRT
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pF1KB4 EIKILNIFGVIKGFVEPDHYVVVGAQRDAWGPGAAKSGVGTALLLKLAQMFSDMVLKDGF
          : :::: :.:  :::::::.::::::::::::::.::::.::.:.. ::.:: ..::
CCDS34 STPINNIFGCIEGRSEPDHYVVIGAQRDAWGPGAAKSAVGTAILLELVRTFSSMV-SNGF
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pF1KB4 QPSRSIIFASWSAGDFGSVGATEWLEGYLSSLHLKAFTYINLDKAVLGTSNFKVSASPLL
       .: ::..: ::..:::::::.::::::::: ::::: .:..::.:::: ..:....::::
CCDS34 RPRRSLLFISWDGGDFGSVGSTEWLEGYLSVLHLKAVVYVSLDNAVLGDDKFHAKTSPLL
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pF1KB4 YTLIEKTMQNVKHPV-TGQFLYQ-----DSNWASKVEK-LTLDNAAFPFLAYSGIPAVSF
        .:::.....:  :  .:: ::.     . .: ..: . : .:..:. : :. :.::: :
CCDS34 TSLIESVLKQVDSPNHSGQTLYEQVVFTNPSWDAEVIRPLPMDSSAYSFTAFVGVPAVEF
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pF1KB4 CFCEDTD-YPYLGTTMDTYKELIERIP-ELNKVARAAAEVAGQFVIKLTHDVELNLDYER
        : :: . ::.: :  :::..: . .  .:  ::.:.:..:::..:.:.::  : ::. :
CCDS34 SFMEDDQAYPFLHTKEDTYENLHKVLQGRLPAVAQAVAQLAGQLLIRLSHDRLLPLDFGR
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pF1KB4 YNSQLLSFVRDLNQYRADIKEMGLSLQWLYSARGDFFRATSRLTTDFGNAEKTDRFVMKK
       :.. .:  . .::.. .:.:  ::.:::.::::::..::. .:  .. ..:. :. . . 
CCDS34 YGDVVLRHIGNLNEFSGDLKARGLTLQWVYSARGDYIRAAEKLRQEIYSSEERDERLTRM
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pF1KB4 LNDRVMRVEYHFLSPYVSPKESPFRHVFWGSGSHTLPALLENLKLRKQNN----GA----
        : :.::::..::: :::: .:::::.: : :.::: :::..:.: ..:.    ::    
CCDS34 YNVRIMRVEFYFLSQYVSPADSPFRHIFMGRGDHTLGALLDHLRLLRSNSSGTPGATSST
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pF1KB4 -FNETLFRNQLALATWTIQGAANALSGDVWDIDNEF
        :.:. :: :::: :::.::::::::::::.:::.:
CCDS34 GFQESRFRRQLALLTWTLQGAANALSGDVWNIDNNF
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pF1KB4 GEPLSYTRFSLARQVDGDNSHVEMKLAVDEEENADNNTKANVTKPKRCSGSICYGTIAVI
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CCDS46 NQNLGHSETIDLNLDSIQPATSPKGRFQRLQEESDYITHYTRSAPKSNRCNFCH-VLKIL
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pF1KB4 ----VFFLIGFMIGYLGYCKGVEPKTECERLAGTESPVREEPGEDFPAARRLYWDDLKRK
           ..:..:..:::  : .     :.:   : . . :  .:        .:: . ::  
CCDS46 CTATILFIFGILIGY--YVH-----TNCPSDAPSSGTV--DP--------QLYQEILKTI
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pF1KB4 LSEKLDSTDFTGTIKLLNENSYVPREAGSQKDENLALYVENQFREFKLSKVWRDQHFVKI
        .: . .. : . ..: .          .. : ...  ...:.  . :  :   .. : .
CCDS46 QAEDIKKS-FRNLVQLYK----------NEDDMEISKKIKTQWTSLGLEDVQFVNYSVLL
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pF1KB4 QVKDSAQNSVIIVDKNGRLVYLVENPGG--------------YVAYSKAATVTGKLVHAN
       ..   . ..: . ...:.  .   .: .              :.:::  .:. .... ..
CCDS46 DLPGPSPSTVTL-SSSGQCFHPNGQPCSEEARKDSSQDLLYSYAAYSAKGTLKAEVIDVS
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pF1KB4 FGTKKDFEDLYT--PVNGSIVIVRAGKITFAEKVANAESLNAIGVLIYMDQTKFP-IVNA
       .:   :.. .     :...:.... ::. .  :... :. .  :::.:.:   .:  :: 
CCDS46 YGMADDLKRIRKIKNVTNQIALLKLGKLPLLYKLSSLEKAGFGGVLLYIDPCDLPKTVNP
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pF1KB4 ELSFFGHAHLGTGDPYTPGFPSFNHTQFPPSRSSGLPNIPVQTISRAAAEKLFGNMEGDC
         . :  .    ::: :::.:: ... :  :::. : .. :: ::   . ::... ..  
CCDS46 SHDTFMVSLNPGGDPSTPGYPSVDES-FRQSRSN-LTSLLVQPISAPLVAKLISSPKART
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pF1KB4 PSDWKTDSTCRMVTSESKNVKLTVSNVLKEIKILNIFGVIKGFVEPDHYVVVGAQRD-AW
        ..  . :. .. ..: . :.. :..: :   . :. : . :.. ::.:..::...  : 
CCDS46 KNE--ACSSLELPNNEIRVVSMQVQTVTKLKTVTNVVGFVMGLTSPDRYIIVGSHHHTAH
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pF1KB4 GPGAAKSGVGTALLLKLAQMFSDMVLKDGFQPSRSIIFASWSAGDFGSVGATEWLEGYLS
       . .. . . .::..  . . . . : : :..:.:.:.: ::..  ::..:. :: : . .
CCDS46 SYNGQEWASSTAIITAFIRALMSKV-KRGWRPDRTIVFCSWGGTAFGNIGSYEWGEDFKK
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pF1KB4 SLHLKAFTYINLDKAVLGTSNFKVSASPLLYTLI-EKTMQNVKHPVTGQFLYQDSNWASK
        :. .. .::.: . . :.:..   ::: :  :. ::.  :     : .    ..:    
CCDS46 VLQKNVVAYISLHSPIRGNSSLYPVASPSLQQLVVEKNNFN----CTRRAQCPETN----
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pF1KB4 VEKLTLDNAAFPFLAYSGIPAVSFCFCEDT---DYP-YLGTT-MDTYKELIERI-PELNK
       . .. ... :  :. . :.: :.: . ::    . : .:. . ..:    ::.. : .: 
CCDS46 ISSIQIQGDADYFINHLGVPIVQFAY-EDIKTLEGPSFLSEARFSTRATKIEEMDPSFN-
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pF1KB4 VARAAAEVAGQFVIKLTHDVELNLDYERYNSQLLSFVRDLNQYRADIKEMGLSLQWLYSA
       . .. ....:. .......  : ..      .. . ..  .    ..  :.: :.     
CCDS46 LHETITKLSGEVILQIANEPVLPFNALDIALEVQNNLKGDQPNTHQLLAMALRLR----E
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pF1KB4 RGDFFRATSRLTTDFGNAEKTDRFVMKKLNDRVMRVEYHFLSPYVSPKESPFRHVFWGSG
        ...:..     ..  . .   :. :  ::: .. .:  ::   . :  . .:....   
CCDS46 SAELFQSDEMRPANDPKERAPIRIRM--LNDILQDMEKSFLVKQAPP--GFYRNILYHLD
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pF1KB4 SHTLPALLENLKLRKQNNGAFNETLFRNQLALATWTIQGAANALSGDVWDIDNEF   
                                                                 
CCDS46 EKTSRFSILIEAWEHCKPLASNETLQEALSEVLNSINSAQVYFKAGLDVFKSVLDGKN
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>>CCDS8288.1 NAALAD2 gene_id:10003|Hs108|chr11            (740 aa)
 initn: 557 init1: 195 opt: 444  Z-score: 518.1  bits: 106.6 E(32554): 1.5e-22
Smith-Waterman score: 794; 26.6% identity (58.5% similar) in 751 aa overlap (72-749:16-736)

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pF1KB4 VDEEENADNNTKANVTKPKRCSGSICYGTIAVIVFFLIGFMIGYLGYCKGVEPKTECERL
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CCDS82                MAESRGRLYLWMCLAAALASFLMGFMVGWF-----IKPLKE----
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pF1KB4 AGTESPVREEPGEDFPAARRLYWDDLKRKLSEKLDSTDFTGTIKLLNENSYVPREAGSQK
         : . ::             : .... ::  .. . .. . .. ...   .:. ::...
CCDS82 --TTTSVR-------------YHQSIRWKLVSEMKAENIKSFLRSFTK---LPHLAGTEQ
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pF1KB4 DENLALYVENQFREFKLSKVWRDQHFVKIQV-KDSAQNSVIIVDKNGRLV----YLVENP
       .  ::  ...:...: :...   .. : ..  ...  : . :::..   .    ::   :
CCDS82 NFLLAKKIQTQWKKFGLDSAKLVHYDVLLSYPNETNANYISIVDEHETEIFKTSYLEPPP
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pF1KB4 GGYV----------AYSKAATVTGKLVHANFGTKKDFEDLYTPVN----GSIVIVRAGKI
        ::           :.:  .   : ::..:..  .::  :   ..    :.:::.: :::
CCDS82 DGYENVTNIVPPYNAFSAQGMPEGDLVYVNYARTEDFFKLEREMGINCTGKIVIARYGKI
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pF1KB4 TFAEKVANAESLNAIGVLIYMDQTKF--PIVNAE---LSFFGHAHL--------GTGDPY
         ..:: ::   .:::...: : . .  : :.      .. : :          :.::: 
CCDS82 FRGNKVKNAMLAGAIGIILYSDPADYFAPEVQPYPKGWNLPGTAAQRGNVLNLNGAGDPL
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pF1KB4 TPGFPSFNHT-QFPPSRSSGLPNIPVQTISRAAAEKLFGNMEGDCPSD--WKTDSTCRM-
       :::.:. ..: ..   .. :.: :::. :.   :: :.  . :  : :  ::   .  . 
CCDS82 TPGYPAKEYTFRLDVEEGVGIPRIPVHPIGYNDAEILLRYLGGIAPPDKSWKGALNVSYS
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pF1KB4 -----VTSES-KNVKLTVSNVLKEIKILNIFGVIKGFVEPDHYVVVGAQRDAWGPGAAKS
            . :.: ..:.. : :. :  .: :. :.:.: ::::.::..:..::.:  ::   
CCDS82 IGPGFTGSDSFRKVRMHVYNINKITRIYNVVGTIRGSVEPDRYVILGGHRDSWVFGAIDP
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pF1KB4 GVGTALLLKLAQMFSDMVLKDGFQPSRSIIFASWSAGDFGSVGATEWLEGYLSSLHLKAF
         :.:.: ..:. :. .. : :..: :.::::::.: .:: .:.::: :  .. :. ...
CCDS82 TSGVAVLQEIARSFGKLMSK-GWRPRRTIIFASWDAEEFGLLGSTEWAEENVKILQERSI
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pF1KB4 TYINLDKAVLGTSNFKVSASPLLYTLIEKTMQNVKHPVTG--------QFLYQDSNWASK
       .::: :... :. ...:. .:::: :. :  ...  :  :        ..: .: .  .:
CCDS82 AYINSDSSIEGNYTLRVDCTPLLYQLVYKLTKEIPSPDDGFESKSLYESWLEKDPSPENK
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pF1KB4 ----VEKLTLDNAAFPFLAYSGIPA--VSFCFCEDTD----YPYLGTTMDTYKELIERI-
           ..::   .    ..   :: .  . .   . ::    ::   : ..:. ::.:.. 
CCDS82 NLPRINKLGSGSDFEAYFQRLGIASGRARYTKNKKTDKYSSYPVYHTIYETF-ELVEKFY
       500       510       520       530       540        550      

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pF1KB4 -PELNKVARAAAEVAGQFVIKLTHDVELNLDYERYNSQLLSF---VRDLNQ-YRADIKEM
        : ..:   ..:.. : .: .:. .  . .. . :   : ..   . .:.. .  .. . 
CCDS82 DPTFKK-QLSVAQLRGALVYELVDSKIIPFNIQDYAEALKNYAASIYNLSKKHDQQLTDH
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pF1KB4 GLSLQWLYSARGDFFRATSRLTTDFGNAEKTDRFVMKKLNDRVMRVEYHFLSPYVSPKES
       :.:.. :.::  .: .:.: .   . ... .. .... .::..: .:  :..:   : . 
CCDS82 GVSFDSLFSAVKNFSEAASDFHKRLIQVDLNNPIAVRMMNDQLMLLERAFIDPLGLPGKL
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pF1KB4 PFRHVFWGSGSH------TLPALLENL-KLRKQNNGAFNETLFRNQLALATWTIQGAANA
        .::.... .::      ..:.. . .  .... :. .     ......:..:::.::..
CCDS82 FYRHIIFAPSSHNKYAGESFPGIYDAIFDIENKANSRLAWKEVKKHISIAAFTIQAAAGT
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pF1KB4 LSGDVWDIDNEF
       :           
CCDS82 LKEVL       
         740       

>>CCDS73364.1 NAALAD2 gene_id:10003|Hs108|chr11           (707 aa)
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                                     :... ::.:::.:..     ..:  :    
CCDS73                MAESRGRLYLWMCLAAALASFLMGFMVGWF-----IKPLKE----
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pF1KB4 AGTESPVREEPGEDFPAARRLYWDDLKRKLSEKLDSTDFTGTIKLLNENSYVPREAGSQK
         : . ::             : .... ::  .. . .. . .. ...   .:. ::...
CCDS73 --TTTSVR-------------YHQSIRWKLVSEMKAENIKSFLRSFTK---LPHLAGTEQ
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pF1KB4 DENLALYVENQFREFKLSKVWRDQHFVKIQV-KDSAQNSVIIVDKNGRLV----YLVENP
       .  ::  ...:...: :...   .. : ..  ...  : . :::..   .    ::   :
CCDS73 NFLLAKKIQTQWKKFGLDSAKLVHYDVLLSYPNETNANYISIVDEHETEIFKTSYLEPPP
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pF1KB4 GGYV----------AYSKAATVTGKLVHANFGTKKDFEDLYTPVN----GSIVIVRAGKI
        ::           :.:  .   : ::..:..  .::  :   ..    :.:::.: :::
CCDS73 DGYENVTNIVPPYNAFSAQGMPEGDLVYVNYARTEDFFKLEREMGINCTGKIVIARYGKI
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pF1KB4 TFAEKVANAESLNAIGVLIYMDQTKF--PIVNAE---LSFFGHAHL--------GTGDPY
         ..:: ::   .:::...: : . .  : :.      .. : :          :.::: 
CCDS73 FRGNKVKNAMLAGAIGIILYSDPADYFAPEVQPYPKGWNLPGTAAQRGNVLNLNGAGDPL
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pF1KB4 TPGFPSFNHT-QFPPSRSSGLPNIPVQTISRAAAEKLFGNMEGDCPSDWKTDSTCRMVTS
       :::.:. ..: ..   .. :.: :::. :.   :: :.                      
CCDS73 TPGYPAKEYTFRLDVEEGVGIPRIPVHPIGYNDAEILL----------------------
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pF1KB4 ESKNVKLTVSNVLKEIKILNIFGVIKGFVEPDHYVVVGAQRDAWGPGAAKSGVGTALLLK
         ..:.. : :. :  .: :. :.:.: ::::.::..:..::.:  ::     :.:.: .
CCDS73 --RKVRMHVYNINKITRIYNVVGTIRGSVEPDRYVILGGHRDSWVFGAIDPTSGVAVLQE
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pF1KB4 LAQMFSDMVLKDGFQPSRSIIFASWSAGDFGSVGATEWLEGYLSSLHLKAFTYINLDKAV
       .:. :. .. : :..: :.::::::.: .:: .:.::: :  .. :. ....::: :...
CCDS73 IARSFGKLMSK-GWRPRRTIIFASWDAEEFGLLGSTEWAEENVKILQERSIAYINSDSSI
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pF1KB4 LGTSNFKVSASPLLYTLIEKTMQNVKHPVTG--------QFLYQDSNWASK----VEKLT
        :. ...:. .:::: :. :  ...  :  :        ..: .: .  .:    ..:: 
CCDS73 EGNYTLRVDCTPLLYQLVYKLTKEIPSPDDGFESKSLYESWLEKDPSPENKNLPRINKLG
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pF1KB4 LDNAAFPFLAYSGIPA--VSFCFCEDTD----YPYLGTTMDTYKELIERI--PELNKVAR
         .    ..   :: .  . .   . ::    ::   : ..:. ::.:..  : ..:   
CCDS73 SGSDFEAYFQRLGIASGRARYTKNKKTDKYSSYPVYHTIYETF-ELVEKFYDPTFKK-QL
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pF1KB4 AAAEVAGQFVIKLTHDVELNLDYERYNSQLLSF---VRDLNQ-YRADIKEMGLSLQWLYS
       ..:.. : .: .:. .  . .. . :   : ..   . .:.. .  .. . :.:.. :.:
CCDS73 SVAQLRGALVYELVDSKIIPFNIQDYAEALKNYAASIYNLSKKHDQQLTDHGVSFDSLFS
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pF1KB4 ARGDFFRATSRLTTDFGNAEKTDRFVMKKLNDRVMRVEYHFLSPYVSPKESPFRHVFWGS
       :  .: .:.: .   . ... .. .... .::..: .:  :..:   : .  .::.... 
CCDS73 AVKNFSEAASDFHKRLIQVDLNNPIAVRMMNDQLMLLERAFIDPLGLPGKLFYRHIIFAP
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pF1KB4 GSH------TLPALLENL-KLRKQNNGAFNETLFRNQLALATWTIQGAANALSGDVWDID
       .::      ..:.. . .  .... :. .     ......:..:::.::..:        
CCDS73 SSHNKYAGESFPGIYDAIFDIENKANSRLAWKEVKKHISIAAFTIQAAAGTLKEVL    
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       760
pF1KB4 NEF

>>CCDS53627.1 FOLH1 gene_id:2346|Hs108|chr11              (704 aa)
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Smith-Waterman score: 705; 26.6% identity (60.3% similar) in 610 aa overlap (128-670:40-645)

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pF1KB4 CERLAGTESPVREEPGEDFPAARRLYWDDLKRKLSEKLDSTDFTGTIKLLNENSYVPREA
                                     :....  ::     .  :.: . . .:. :
CCDS53 FLAAYACTGCLAERLGWFIKSSNEATNITPKHNMKAFLDELKAENIKKFLYNFTQIPHLA
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pF1KB4 GSQKDENLALYVENQFREFKLSKVWRDQHFVKIQVKDSAQ-NSVIIVDKNGRLVY---LV
       :.... .::  ...:..:: :..:   .. : ..  .... : . :....:  ..   : 
CCDS53 GTEQNFQLAKQIQSQWKEFGLDSVELAHYDVLLSYPNKTHPNYISIINEDGNEIFNTSLF
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pF1KB4 ENPG-GY----------VAYSKAATVTGKLVHANFGTKKDF----EDLYTPVNGSIVIVR
       : :  ::           :.:  .   : ::..:..  .::    .:.    .:.:::.:
CCDS53 EPPPPGYENVSDIVPPFSAFSPQGMPEGDLVYVNYARTEDFFKLERDMKINCSGKIVIAR
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pF1KB4 AGKITFAEKVANAESLNAIGVLIYMDQTKF--PIVNA-----ELSFFG--HAHL----GT
        ::.  ..:: ::.  .: ::..: : . .  : :..     .:   :  ....    :.
CCDS53 YGKVFRGNKVKNAQLAGAKGVILYSDPADYFAPGVKSYPDGWNLPGGGVQRGNILNLNGA
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pF1KB4 GDPYTPGFPSFNHT-QFPPSRSSGLPNIPVQTISRAAAEKLFGNMEGDCPSD--WKTDST
       ::: :::.:. ... .   ... :::.:::. :.   :.::. .: :. : :  :. .  
CCDS53 GDPLTPGYPANEYAYRRGIAEAVGLPSIPVHPIGYYDAQKLLEKMGGSAPPDSSWRGSLK
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pF1KB4 CRMVTSE-------SKNVKLTVSNVLKEIKILNIFGVIKGFVEPDHYVVVGAQRDAWGPG
         . ..        ...::. . .. .  .: :..:...: ::::.::..:..::.:  :
CCDS53 VPYNVGPGFTGNFSTQKVKMHIHSTNEVTRIYNVIGTLRGAVEPDRYVILGGHRDSWVFG
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pF1KB4 AAKSGVGTALLLKLAQMFSDMVLKDGFQPSRSIIFASWSAGDFGSVGATEWLEGYLSSLH
       .     :.:.. .... :. .  :.:..: :.:.::::.: .:: .:.::: :     :.
CCDS53 GIDPQSGAAVVHEIVRSFGTLK-KEGWRPRRTILFASWDAEEFGLLGSTEWAEENSRLLQ
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pF1KB4 LKAFTYINLDKAVLGTSNFKVSASPLLYTLIEKTMQNVKHP---VTGQFLYQDSNWASK-
        .. .::: :... :. ...:. .::.:.:...  ...: :     :. ::.  .:..: 
CCDS53 ERGVAYINADSSIEGNYTLRVDCTPLMYSLVHNLTKELKSPDEGFEGKSLYE--SWTKKS
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pF1KB4 ----------VEKLTLDNAAFPFLAYSGIPAVSFCFCED------TDYPYLGTTMDTYKE
                 . ::   :    :.   :: .    . ..      . ::   ....:: :
CCDS53 PSPEFSGMPRISKLGSGNDFEVFFQRLGIASGRARYTKNWETNKFSGYPLYHSVYETY-E
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pF1KB4 LIERIPE-LNKVARAAAEVAGQFVIKLTHDVELNLDYERYNSQLLSFVRDLN----QYRA
       :.:.. . . :   ..:.: : .:..:.... : .: . :   : ...  .     ..  
CCDS53 LVEKFYDPMFKYHLTVAQVRGGMVFELANSIVLPFDCRDYAVVLRKYADKIYSISMKHPQ
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pF1KB4 DIKEMGLSLQWLYSARGDFFRATSRLTTDFGNAEKTDRFVMKKLNDRVMRVEYHFLSPYV
       ..: ...:.. :.::  .: . .:...  . . .:. . .                    
CCDS53 EMKTYSVSFDSLFSAVKNFTEIASKFSERLQDFDKSKHVIYAPSSHNKYAGESFPGIYDA
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pF1KB4 SPKESPFRHVFWGSGSHTLPALLENLKLRKQNNGAFNETLFRNQLALATWTIQGAANALS
                                                                   
CCDS53 LFDIESKVDPSKAWGEVKRQIYVAAFTVQAAAETLSEVA                     
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>>CCDS31493.1 FOLH1 gene_id:2346|Hs108|chr11              (719 aa)
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>>CCDS53628.1 FOLH1 gene_id:2346|Hs108|chr11              (735 aa)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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