Result of FASTA (omim) for pF1KB4096
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB4096, 973 aa
  1>>>pF1KB4096 973 - 973 aa - 973 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4657+/-0.00046; mu= 15.3541+/- 0.029
 mean_var=92.3345+/-18.112, 0's: 0 Z-trim(111.1): 145  B-trim: 174 in 1/53
 Lambda= 0.133473
 statistics sampled from 19493 (19650) to 19493 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.583), E-opt: 0.2 (0.23), width:  16
 Scan time: 10.150

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
XP_016885263 (OMIM: 300334) PREDICTED: short trans ( 973) 6504 1263.7       0
NP_036603 (OMIM: 300334) short transient receptor  ( 973) 6504 1263.7       0
NP_057263 (OMIM: 603651) short transient receptor  ( 977) 4171 814.5       0
NP_003297 (OMIM: 603651) short transient receptor  ( 982) 4157 811.8       0
NP_001129427 (OMIM: 603651) short transient recept ( 893) 4119 804.4       0
NP_001129429 (OMIM: 603651) short transient recept ( 836) 3975 776.7       0
NP_001129428 (OMIM: 603651) short transient recept ( 828) 3525 690.0 1.3e-197
NP_001129430 (OMIM: 603651) short transient recept ( 804) 2616 515.0 6.3e-145
NP_001238774 (OMIM: 602343) short transient recept ( 793) 2257 445.8  4e-124
XP_016862610 (OMIM: 602343) PREDICTED: short trans ( 732) 2198 434.5 9.9e-121
XP_005247795 (OMIM: 602343) PREDICTED: short trans ( 695) 2057 407.3 1.4e-112
XP_016862611 (OMIM: 602343) PREDICTED: short trans ( 709) 2001 396.5 2.5e-109
NP_003295 (OMIM: 602343) short transient receptor  ( 759) 1998 396.0  4e-109
XP_005247796 (OMIM: 602343) PREDICTED: short trans ( 661) 1978 392.1 5.1e-108
XP_016876213 (OMIM: 603651) PREDICTED: short trans ( 557) 1878 372.8 2.8e-102
XP_011533508 (OMIM: 603651) PREDICTED: short trans ( 562) 1832 363.9 1.3e-99
XP_016876212 (OMIM: 603651) PREDICTED: short trans ( 562) 1832 363.9 1.3e-99
NP_003296 (OMIM: 602345,616410) short transient re ( 848)  786 162.6 7.9e-39
XP_016864068 (OMIM: 602345,616410) PREDICTED: shor ( 893)  786 162.6 8.3e-39
XP_011530520 (OMIM: 602345,616410) PREDICTED: shor ( 920)  786 162.6 8.5e-39
NP_001124170 (OMIM: 602345,616410) short transient ( 921)  786 162.6 8.5e-39
XP_016864067 (OMIM: 602345,616410) PREDICTED: shor ( 936)  786 162.6 8.6e-39
XP_011530519 (OMIM: 602345,616410) PREDICTED: shor ( 937)  786 162.6 8.6e-39
XP_016873710 (OMIM: 603652,603965) PREDICTED: shor ( 815)  475 102.7 8.1e-21
XP_016873711 (OMIM: 603652,603965) PREDICTED: shor ( 845)  475 102.7 8.4e-21
XP_011541270 (OMIM: 603652,603965) PREDICTED: shor ( 876)  475 102.7 8.7e-21
NP_004612 (OMIM: 603652,603965) short transient re ( 931)  475 102.7 9.1e-21
NP_001307280 (OMIM: 603749) transient receptor pot (1469)  281 65.5 2.4e-09
XP_016883946 (OMIM: 603749) PREDICTED: transient r (1499)  281 65.5 2.4e-09
XP_005261228 (OMIM: 603749) PREDICTED: transient r (1503)  281 65.5 2.4e-09
NP_003298 (OMIM: 603749) transient receptor potent (1503)  281 65.5 2.4e-09
XP_016883945 (OMIM: 603749) PREDICTED: transient r (1533)  281 65.5 2.5e-09
XP_011528038 (OMIM: 603749) PREDICTED: transient r (1533)  281 65.5 2.5e-09
NP_001307279 (OMIM: 603749) transient receptor pot (1553)  281 65.5 2.5e-09
NP_002411 (OMIM: 603576,613216) transient receptor (1603)  245 58.6 3.1e-07
NP_001238953 (OMIM: 603576,613216) transient recep (1625)  245 58.6 3.2e-07
NP_001238949 (OMIM: 603576,613216) transient recep (1642)  245 58.6 3.2e-07
XP_016870647 (OMIM: 608961) PREDICTED: transient r (1260)  229 55.4 2.2e-06
XP_016870649 (OMIM: 608961) PREDICTED: transient r (1172)  216 52.9 1.1e-05
XP_016870648 (OMIM: 608961) PREDICTED: transient r (1184)  216 52.9 1.2e-05
XP_016870645 (OMIM: 608961) PREDICTED: transient r (1290)  216 52.9 1.2e-05
XP_016870646 (OMIM: 608961) PREDICTED: transient r (1315)  216 52.9 1.3e-05
XP_011517349 (OMIM: 608961) PREDICTED: transient r (1325)  216 52.9 1.3e-05
XP_016870642 (OMIM: 608961) PREDICTED: transient r (1327)  216 52.9 1.3e-05
XP_016870644 (OMIM: 608961) PREDICTED: transient r (1337)  216 52.9 1.3e-05
XP_016870640 (OMIM: 608961) PREDICTED: transient r (1339)  216 52.9 1.3e-05
XP_016870643 (OMIM: 608961) PREDICTED: transient r (1352)  216 52.9 1.3e-05
XP_016870639 (OMIM: 608961) PREDICTED: transient r (1352)  216 52.9 1.3e-05
XP_016870638 (OMIM: 608961) PREDICTED: transient r (1354)  216 52.9 1.3e-05
XP_016870641 (OMIM: 608961) PREDICTED: transient r (1362)  216 52.9 1.3e-05


>>XP_016885263 (OMIM: 300334) PREDICTED: short transient  (973 aa)
 initn: 6504 init1: 6504 opt: 6504  Z-score: 6767.8  bits: 1263.7 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 6504; 100.0% identity (100.0% similar) in 973 aa overlap (1-973:1-973)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB4 MAQLYYKKVNYSPYRDRIPLQIVRAETELSAEEKAFLNAVEKGDYATVKQALQEAEIYYN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MAQLYYKKVNYSPYRDRIPLQIVRAETELSAEEKAFLNAVEKGDYATVKQALQEAEIYYN
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB4 VNINCMDPLGRSALLIAIENENLEIMELLLNHSVYVGDALLYAIRKEVVGAVELLLSYRR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VNINCMDPLGRSALLIAIENENLEIMELLLNHSVYVGDALLYAIRKEVVGAVELLLSYRR
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB4 PSGEKQVPTLMMDTQFSEFTPDITPIMLAAHTNNYEIIKLLVQKRVTIPRPHQIRCNCVE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 PSGEKQVPTLMMDTQFSEFTPDITPIMLAAHTNNYEIIKLLVQKRVTIPRPHQIRCNCVE
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB4 CVSSSEVDSLRHSRSRLNIYKALASPSLIALSSEDPILTAFRLGWELKELSKVENEFKAE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 CVSSSEVDSLRHSRSRLNIYKALASPSLIALSSEDPILTAFRLGWELKELSKVENEFKAE
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB4 YEELSQQCKLFAKDLLDQARSSRELEIILNHRDDHSEELDPQKYHDLAKLKVAIKYHQKE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 YEELSQQCKLFAKDLLDQARSSRELEIILNHRDDHSEELDPQKYHDLAKLKVAIKYHQKE
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB4 FVAQPNCQQLLATLWYDGFPGWRRKHWVVKLLTCMTIGFLFPMLSIAYLISPRSNLGLFI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FVAQPNCQQLLATLWYDGFPGWRRKHWVVKLLTCMTIGFLFPMLSIAYLISPRSNLGLFI
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB4 KKPFIKFICHTASYLTFLFMLLLASQHIVRTDLHVQGPPPTVVEWMILPWVLGFIWGEIK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KKPFIKFICHTASYLTFLFMLLLASQHIVRTDLHVQGPPPTVVEWMILPWVLGFIWGEIK
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB4 EMWDGGFTEYIHDWWNLMDFAMNSLYLATISLKIVAYVKYNGSRPREEWEMWHPTLIAEA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 EMWDGGFTEYIHDWWNLMDFAMNSLYLATISLKIVAYVKYNGSRPREEWEMWHPTLIAEA
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB4 LFAISNILSSLRLISLFTANSHLGPLQISLGRMLLDILKFLFIYCLVLLAFANGLNQLYF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LFAISNILSSLRLISLFTANSHLGPLQISLGRMLLDILKFLFIYCLVLLAFANGLNQLYF
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB4 YYETRAIDEPNNCKGIRCEKQNNAFSTLFETLQSLFWSVFGLLNLYVTNVKARHEFTEFV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 YYETRAIDEPNNCKGIRCEKQNNAFSTLFETLQSLFWSVFGLLNLYVTNVKARHEFTEFV
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB4 GATMFGTYNVISLVVLLNMLIAMMNNSYQLIADHADIEWKFARTKLWMSYFDEGGTLPPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GATMFGTYNVISLVVLLNMLIAMMNNSYQLIADHADIEWKFARTKLWMSYFDEGGTLPPP
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB4 FNIIPSPKSFLYLGNWFNNTFCPKRDPDGRRRRRNLRSFTERNADSLIQNQHYQEVIRNL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 FNIIPSPKSFLYLGNWFNNTFCPKRDPDGRRRRRNLRSFTERNADSLIQNQHYQEVIRNL
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB4 VKRYVAAMIRNSKTHEGLTEENFKELKQDISSFRYEVLDLLGNRKHPRSFSTSSTELSQR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 VKRYVAAMIRNSKTHEGLTEENFKELKQDISSFRYEVLDLLGNRKHPRSFSTSSTELSQR
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB4 DDNNDGSGGARAKSKSVSFNLGCKKKTCHGPPLIRTMPRSSGAQGKSKAESSSKRSFMGP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 DDNNDGSGGARAKSKSVSFNLGCKKKTCHGPPLIRTMPRSSGAQGKSKAESSSKRSFMGP
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KB4 SLKKLGLLFSKFNGHMSEPSSEPMYTISDGIVQQHCMWQDIRYSQMEKGKAEACSQSEIN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SLKKLGLLFSKFNGHMSEPSSEPMYTISDGIVQQHCMWQDIRYSQMEKGKAEACSQSEIN
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KB4 LSEVELGEVQGAAQSSECPLACSSSLHCASSICSSNSKLLDSSEDVFETWGEACDLLMHK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LSEVELGEVQGAAQSSECPLACSSSLHCASSICSSNSKLLDSSEDVFETWGEACDLLMHK
              910       920       930       940       950       960

              970   
pF1KB4 WGDGQEEQVTTRL
       :::::::::::::
XP_016 WGDGQEEQVTTRL
              970   

>>NP_036603 (OMIM: 300334) short transient receptor pote  (973 aa)
 initn: 6504 init1: 6504 opt: 6504  Z-score: 6767.8  bits: 1263.7 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 6504; 100.0% identity (100.0% similar) in 973 aa overlap (1-973:1-973)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB4 MAQLYYKKVNYSPYRDRIPLQIVRAETELSAEEKAFLNAVEKGDYATVKQALQEAEIYYN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 MAQLYYKKVNYSPYRDRIPLQIVRAETELSAEEKAFLNAVEKGDYATVKQALQEAEIYYN
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB4 VNINCMDPLGRSALLIAIENENLEIMELLLNHSVYVGDALLYAIRKEVVGAVELLLSYRR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 VNINCMDPLGRSALLIAIENENLEIMELLLNHSVYVGDALLYAIRKEVVGAVELLLSYRR
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB4 PSGEKQVPTLMMDTQFSEFTPDITPIMLAAHTNNYEIIKLLVQKRVTIPRPHQIRCNCVE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 PSGEKQVPTLMMDTQFSEFTPDITPIMLAAHTNNYEIIKLLVQKRVTIPRPHQIRCNCVE
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB4 CVSSSEVDSLRHSRSRLNIYKALASPSLIALSSEDPILTAFRLGWELKELSKVENEFKAE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_036 CVSSSEVDSLRHSRSRLNIYKALASPSLIALSSEDPILTAFRLGWELKELSKVENEFKAE
              190       200       210       220       230       240

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NP_036 WGDGQEEQVTTRL
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>>NP_057263 (OMIM: 603651) short transient receptor pote  (977 aa)
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NP_057 CVSSSDVDSLRHSRSRLNIYKALASPSLIALSSEDPFLTAFQLSWELQELSKVENEFKSE
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       .::::::::::::::::::.:::::::: :.::. ::::::.::::::::::::::::::
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pF1KB4 EMWDGGFTEYIHDWWNLMDFAMNSLYLATISLKIVAYVKYNGSRPREEWEMWHPTLIAEA
       .:::::. .:::::::::::.:::::::::::::::.:::..  ::: :.::::::.:::
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       ::::.::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KB4 YYE-TRAIDEPNNCKGIRCEKQNNAFSTLFETLQSLFWSVFGLLNLYVTNVKARHEFTEF
       ::: :...    .::::::::::::::::::::::::::.:::.:::::::::.::::::
NP_057 YYEETKGL----TCKGIRCEKQNNAFSTLFETLQSLFWSIFGLINLYVTNVKAQHEFTEF
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NP_057 VGATMFGTYNVISLVVLLNMLIAMMNNSYQLIADHADIEWKFARTKLWMSYFEEGGTLPT
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pF1KB4 PFNIIPSPKSFLYLGNWFNNTFCPKRDPDGRRRRRNLRSFTERNADSLIQNQHYQEVIRN
       :::.::::::. :: .:. . .: :.    ::. ... .. .: ::.: ....::::.::
NP_057 PFNVIPSPKSLWYLIKWIWTHLCKKK---MRRKPESFGTIGRRAADNLRRHHQYQEVMRN
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pF1KB4 LVKRYVAAMIRNSKTHEGLTEENFKELKQDISSFRYEVLDLLGNRK----HPRSFSTSST
       :::::::::::..::.:::::::::::::::::::.::: :: . :    .  . :  :.
NP_057 LVKRYVAAMIRDAKTEEGLTEENFKELKQDISSFRFEVLGLLRGSKLSTIQSANASKESS
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pF1KB4 ELSQRDDNNDGSGGARAKSKSVS-FNLGCKKKTCHGPPLIRTMPRSSGAQGKSKA-----
       . .. :...:. :... :.:. : :.:       :      .  : . ..:.. .     
NP_057 NSADSDEKSDSEGNSKDKKKNFSLFDL---TTLIHPRSAAIASERHNISNGSALVVQEPP
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pF1KB4 -ESSSKRSFMGPSLKKLGLLFSKFNGHMSEPSSEPMYTISDGIVQQHCMWQDIRYSQME-
        :.. : .:.  ..:..::.  . . . .: ... ....:. ...:.      :  :.: 
NP_057 REKQRKVNFV-TDIKNFGLFHRRSKQNAAEQNANQIFSVSEEVARQQAAGPLERNIQLES
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pF1KB4 KGKAEACSQSEINLSEVELGEVQGAAQSSECPLACSSSLHCASSICSSNSKLLDSSEDVF
       .: :   . :  .:::                                            
NP_057 RGLASRGDLSIPGLSEQCVLVDHRERNTDTLGLQVGKRVCPFKSEKVVVEDTVPIIPKEK
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>>NP_003297 (OMIM: 603651) short transient receptor pote  (982 aa)
 initn: 2627 init1: 1561 opt: 4157  Z-score: 4325.2  bits: 811.8 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 4157; 69.6% identity (87.1% similar) in 919 aa overlap (1-903:1-909)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB4 MAQLYYKKVNYSPYRDRIPLQIVRAETELSAEEKAFLNAVEKGDYATVKQALQEAEIYYN
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NP_003 MAQFYYKRNVNAPYRDRIPLRIVRAESELSPSEKAYLNAVEKGDYASVKKSLEEAEIYFK
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pF1KB4 VNINCMDPLGRSALLIAIENENLEIMELLLNHSVYVGDALLYAIRKEVVGAVELLLSYRR
       .::::.:::::.::::::::::::..::::. .::::::::.::::::::::::::....
NP_003 ININCIDPLGRTALLIAIENENLELIELLLSFNVYVGDALLHAIRKEVVGAVELLLNHKK
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pF1KB4 PSGEKQVPTLMMDTQFSEFTPDITPIMLAAHTNNYEIIKLLVQKRVTIPRPHQIRCNCVE
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NP_003 PSGEKQVPPILLDKQFSEFTPDITPIILAAHTNNYEIIKLLVQKGVSVPRPHEVRCNCVE
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pF1KB4 CVSSSEVDSLRHSRSRLNIYKALASPSLIALSSEDPILTAFRLGWELKELSKVENEFKAE
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NP_003 CVSSSDVDSLRHSRSRLNIYKALASPSLIALSSEDPFLTAFQLSWELQELSKVENEFKSE
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pF1KB4 YEELSQQCKLFAKDLLDQARSSRELEIILNHRDDHSEELDPQKYHDLAKLKVAIKYHQKE
       :::::.::: ::::::::.:::::::::::.:::.:  .. :. .:::.::.::::.:::
NP_003 YEELSRQCKQFAKDLLDQTRSSRELEIILNYRDDNSL-IEEQSGNDLARLKLAIKYRQKE
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pF1KB4 FVAQPNCQQLLATLWYDGFPGWRRKHWVVKLLTCMTIGFLFPMLSIAYLISPRSNLGLFI
       ::::::::::::. ::: ::::::.::.::..::. ::.:::..:. :::.:.: :::::
NP_003 FVAQPNCQQLLASRWYDEFPGWRRRHWAVKMVTCFIIGLLFPVFSVCYLIAPKSPLGLFI
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pF1KB4 KKPFIKFICHTASYLTFLFMLLLASQHIVRTDLHVQGPPPTVVEWMILPWVLGFIWGEIK
       .::::::::::::::::::.:::::::: :.::. ::::::.::::::::::::::::::
NP_003 RKPFIKFICHTASYLTFLFLLLLASQHIDRSDLNRQGPPPTIVEWMILPWVLGFIWGEIK
     360       370       380       390       400       410         

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pF1KB4 EMWDGGFTEYIHDWWNLMDFAMNSLYLATISLKIVAYVKYNGSRPREEWEMWHPTLIAEA
       .:::::. .:::::::::::.:::::::::::::::.:::..  ::: :.::::::.:::
NP_003 QMWDGGLQDYIHDWWNLMDFVMNSLYLATISLKIVAFVKYSALNPRESWDMWHPTLVAEA
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       ::::.::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 LFAIANIFSSLRLISLFTANSHLGPLQISLGRMLLDILKFLFIYCLVLLAFANGLNQLYF
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pF1KB4 YYE-TRAIDEPNNCKGIRCEKQNNAFSTLFETLQSLFWSVFGLLNLYVTNVKARHEFTEF
       ::: :...    .::::::::::::::::::::::::::.:::.:::::::::.::::::
NP_003 YYEETKGL----TCKGIRCEKQNNAFSTLFETLQSLFWSIFGLINLYVTNVKAQHEFTEF
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::: 
NP_003 VGATMFGTYNVISLVVLLNMLIAMMNNSYQLIADHADIEWKFARTKLWMSYFEEGGTLPT
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pF1KB4 PFNIIPSPKSFLYLGNWFNNTFCPK---RDPDGRRRRRNLRSFTERNADSLIQNQHYQEV
       :::.::::::. :: .:. . .: :   : :..     ..:.  .: ::.: ....::::
NP_003 PFNVIPSPKSLWYLIKWIWTHLCKKKMRRKPESFGTI-GVRTQHRRAADNLRRHHQYQEV
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pF1KB4 IRNLVKRYVAAMIRNSKTHEGLTEENFKELKQDISSFRYEVLDLLGNRK----HPRSFST
       .:::::::::::::..::.:::::::::::::::::::.::: :: . :    .  . : 
NP_003 MRNLVKRYVAAMIRDAKTEEGLTEENFKELKQDISSFRFEVLGLLRGSKLSTIQSANASK
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pF1KB4 SSTELSQRDDNNDGSGGARAKSKSVS-FNLGCKKKTCHGPPLIRTMPRSSGAQGKSKA--
        :.. .. :...:. :... :.:. : :.:       :      .  : . ..:.. .  
NP_003 ESSNSADSDEKSDSEGNSKDKKKNFSLFDL---TTLIHPRSAAIASERHNISNGSALVVQ
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pF1KB4 ----ESSSKRSFMGPSLKKLGLLFSKFNGHMSEPSSEPMYTISDGIVQQHCMWQDIRYSQ
           :.. : .:.  ..:..::.  . . . .: ... ....:. ...:.      :  :
NP_003 EPPREKQRKVNFV-TDIKNFGLFHRRSKQNAAEQNANQIFSVSEEVARQQAAGPLERNIQ
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pF1KB4 ME-KGKAEACSQSEINLSEVELGEVQGAAQSSECPLACSSSLHCASSICSSNSKLLDSSE
       .: .: :   . :  .:::                                         
NP_003 LESRGLASRGDLSIPGLSEQCVLVDHRERNTDTLGLQVGKRVCPFKSEKVVVEDTVPIIP
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>>NP_001129427 (OMIM: 603651) short transient receptor p  (893 aa)
 initn: 2624 init1: 1561 opt: 4119  Z-score: 4286.3  bits: 804.4 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 4119; 77.7% identity (92.8% similar) in 789 aa overlap (1-787:1-781)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB4 MAQLYYKKVNYSPYRDRIPLQIVRAETELSAEEKAFLNAVEKGDYATVKQALQEAEIYYN
       :::.:::.   .::::::::.:::::.:::  :::.::::::::::.::..:.:::::..
NP_001 MAQFYYKRNVNAPYRDRIPLRIVRAESELSPSEKAYLNAVEKGDYASVKKSLEEAEIYFK
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pF1KB4 VNINCMDPLGRSALLIAIENENLEIMELLLNHSVYVGDALLYAIRKEVVGAVELLLSYRR
       .::::.:::::.::::::::::::..::::. .::::::::.::::::::::::::....
NP_001 ININCIDPLGRTALLIAIENENLELIELLLSFNVYVGDALLHAIRKEVVGAVELLLNHKK
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pF1KB4 PSGEKQVPTLMMDTQFSEFTPDITPIMLAAHTNNYEIIKLLVQKRVTIPRPHQIRCNCVE
       :::::::: ...: ::::::::::::.::::::::::::::::: :..::::..::::::
NP_001 PSGEKQVPPILLDKQFSEFTPDITPIILAAHTNNYEIIKLLVQKGVSVPRPHEVRCNCVE
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pF1KB4 CVSSSEVDSLRHSRSRLNIYKALASPSLIALSSEDPILTAFRLGWELKELSKVENEFKAE
       :::::.::::::::::::::::::::::::::::::.::::.:.:::.::::::::::.:
NP_001 CVSSSDVDSLRHSRSRLNIYKALASPSLIALSSEDPFLTAFQLSWELQELSKVENEFKSE
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pF1KB4 KKPFIKFICHTASYLTFLFMLLLASQHIVRTDLHVQGPPPTVVEWMILPWVLGFIWGEIK
       .::::::::::::::::::.:::::::: :.::. ::::::.::::::::::::::::::
NP_001 RKPFIKFICHTASYLTFLFLLLLASQHIDRSDLNRQGPPPTIVEWMILPWVLGFIWGEIK
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pF1KB4 EMWDGGFTEYIHDWWNLMDFAMNSLYLATISLKIVAYVKYNGSRPREEWEMWHPTLIAEA
       .:::::. .:::::::::::.:::::::::::::::.:::..  ::: :.::::::.:::
NP_001 QMWDGGLQDYIHDWWNLMDFVMNSLYLATISLKIVAFVKYSALNPRESWDMWHPTLVAEA
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pF1KB4 LFAISNILSSLRLISLFTANSHLGPLQISLGRMLLDILKFLFIYCLVLLAFANGLNQLYF
       ::::.::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LFAIANIFSSLRLISLFTANSHLGPLQISLGRMLLDILKFLFIYCLVLLAFANGLNQLYF
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pF1KB4 YYE-TRAIDEPNNCKGIRCEKQNNAFSTLFETLQSLFWSVFGLLNLYVTNVKARHEFTEF
       ::: :...    .::::::::::::::::::::::::::.:::.:::::::::.::::::
NP_001 YYEETKGL----TCKGIRCEKQNNAFSTLFETLQSLFWSIFGLINLYVTNVKAQHEFTEF
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::: 
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pF1KB4 PFNIIPSPKSFLYLGNWFNNTFCPKRDPDGRRRRRNLRSFTERNADSLIQNQHYQEVIRN
       :::.::::::. :: .:. . .: :.    ::. ... .. .: ::.: ....::::.::
NP_001 PFNVIPSPKSLWYLIKWIWTHLCKKK---MRRKPESFGTIGRRAADNLRRHHQYQEVMRN
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pF1KB4 LVKRYVAAMIRNSKTHEGLTEENFKELKQDISSFRYEVLDLL-GNRKHPRSFSTSSTELS
       :::::::::::..::.:::::::::::::::::::.::: :: :..    . ...: : :
NP_001 LVKRYVAAMIRDAKTEEGLTEENFKELKQDISSFRFEVLGLLRGSKLSTIQSANASKESS
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pF1KB4 QRDDNNDGSGGARAKSKSVSFNLGCKKKTCHGPPLIRTMPRSSGAQGKSKAESSSKRSFM
       .  :... :                                                   
NP_001 NSADSDEKSDSEEEVARQQAAGPLERNIQLESRGLASRGDLSIPGLSEQCVLVDHRERNT
            780       790       800       810       820       830  

>>NP_001129429 (OMIM: 603651) short transient receptor p  (836 aa)
 initn: 2496 init1: 1561 opt: 3975  Z-score: 4136.9  bits: 776.7 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 3975; 75.3% identity (91.5% similar) in 789 aa overlap (1-788:1-779)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB4 MAQLYYKKVNYSPYRDRIPLQIVRAETELSAEEKAFLNAVEKGDYATVKQALQEAEIYYN
       :::.:::.   .::::::::.:::::.:::  :::.::::::::::.::..:.:::::..
NP_001 MAQFYYKRNVNAPYRDRIPLRIVRAESELSPSEKAYLNAVEKGDYASVKKSLEEAEIYFK
               10        20        30        40        50        60

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pF1KB4 VNINCMDPLGRSALLIAIENENLEIMELLLNHSVYVGDALLYAIRKEVVGAVELLLSYRR
       .::::.:::::.::::::::::::..::::. .::::::::.::::::::::::::....
NP_001 ININCIDPLGRTALLIAIENENLELIELLLSFNVYVGDALLHAIRKEVVGAVELLLNHKK
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pF1KB4 PSGEKQVPTLMMDTQFSEFTPDITPIMLAAHTNNYEIIKLLVQKRVTIPRPHQIRCNCVE
       :::::::: ...: ::::::::::::.::::::::::::::::: :..::::..::::::
NP_001 PSGEKQVPPILLDKQFSEFTPDITPIILAAHTNNYEIIKLLVQKGVSVPRPHEVRCNCVE
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pF1KB4 CVSSSEVDSLRHSRSRLNIYKALASPSLIALSSEDPILTAFRLGWELKELSKVENEFKAE
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NP_001 CVSSSDVDSLRHSRSRLNIYKALASPSLIALSSEDPFLTAFQLSWELQELSKVENEFKSE
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pF1KB4 YEELSQQCKLFAKDLLDQARSSRELEIILNHRDDHSEELDPQKYHDLAKLKVAIKYHQKE
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NP_001 YEELSRQCKQFAKDLLDQTRSSRELEIILNYRDDNSL-IEEQSGNDLARLKLAIKYRQKE
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pF1KB4 FVAQPNCQQLLATLWYDGFPGWRRKHWVVKLLTCMTIGFLFPMLSIAYLISPRSNLGLFI
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NP_001 FVAQPNCQQLLASRWYDEFPGWRRRHWAVKMVTCFIIGLLFPVFSVCYLIAPKSPLGLFI
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pF1KB4 KKPFIKFICHTASYLTFLFMLLLASQHIVRTDLHVQGPPPTVVEWMILPWVLGFIWGEIK
       .::::::::::::::::::.:::::::: :.::. ::::::.::::::::::::::::::
NP_001 RKPFIKFICHTASYLTFLFLLLLASQHIDRSDLNRQGPPPTIVEWMILPWVLGFIWGEIK
     360       370       380       390       400       410         

              430       440       450       460       470       480
pF1KB4 EMWDGGFTEYIHDWWNLMDFAMNSLYLATISLKIVAYVKYNGSRPREEWEMWHPTLIAEA
       .:::::. .:::::::::::.:::::::::::::::.:::..  ::: :.::::::.:::
NP_001 QMWDGGLQDYIHDWWNLMDFVMNSLYLATISLKIVAFVKYSALNPRESWDMWHPTLVAEA
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pF1KB4 LFAISNILSSLRLISLFTANSHLGPLQISLGRMLLDILKFLFIYCLVLLAFANGLNQLYF
       ::::.::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LFAIANIFSSLRLISLFTANSHLGPLQISLGRMLLDILKFLFIYCLVLLAFANGLNQLYF
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pF1KB4 YYE-TRAIDEPNNCKGIRCEKQNNAFSTLFETLQSLFWSVFGLLNLYVTNVKARHEFTEF
       ::: :...    .::::::::::::::::::::::::::.:::.:::::::::.::::::
NP_001 YYEETKGL----TCKGIRCEKQNNAFSTLFETLQSLFWSIFGLINLYVTNVKAQHEFTEF
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     600       610       620       630       640       650         
pF1KB4 VGATMFGTYNVISLVVLLNMLIAMMNNSYQLIADHADIEWKFARTKLWMSYFDEGGTLPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::: 
NP_001 VGATMFGTYNVISLVVLLNMLIAMMNNSYQLIADHADIEWKFARTKLWMSYFEEGGTLPT
         600       610       620       630       640       650     

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pF1KB4 PFNIIPSPKSFLYLGNWFNNTFCPKRDPDGRRRRRNLRSFTERNADSLIQNQHYQEVIRN
       :::.::::::. :: .:. . .: :.    ::. ... .. .: ::.: ....::::.::
NP_001 PFNVIPSPKSLWYLIKWIWTHLCKKK---MRRKPESFGTIGRRAADNLRRHHQYQEVMRN
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pF1KB4 LVKRYVAAMIRNSKTHEGLTEENFKELKQDISSFRYEVLDLLGNRKHPRSFSTSSTELSQ
       :::::::::::..::.:   ..    :...:. .. . :   :. . : ..: . . ...
NP_001 LVKRYVAAMIRDAKTEEVARQQAAGPLERNIQ-LESRGLASRGDLSIP-GLSEQCVLVDH
            720       730       740        750        760       770

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pF1KB4 RDDNNDGSGGARAKSKSVSFNLGCKKKTCHGPPLIRTMPRSSGAQGKSKAESSSKRSFMG
       :. :.:  :                                                   
NP_001 RERNTDTLGLQVGKRVCPFKSEKVVVEDTVPIIPKEKHAKEEDSSIDYDLNLPDTVTHED
              780       790       800       810       820       830

>>NP_001129428 (OMIM: 603651) short transient receptor p  (828 aa)
 initn: 2330 init1: 1561 opt: 3525  Z-score: 3668.7  bits: 690.0 E(85289): 1.3e-197
Smith-Waterman score: 3685; 72.5% identity (85.8% similar) in 789 aa overlap (1-787:1-716)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB4 MAQLYYKKVNYSPYRDRIPLQIVRAETELSAEEKAFLNAVEKGDYATVKQALQEAEIYYN
       :::.:::.   .::::::::.:::::.:::  :::.::::::::::.::..:.:::::..
NP_001 MAQFYYKRNVNAPYRDRIPLRIVRAESELSPSEKAYLNAVEKGDYASVKKSLEEAEIYFK
               10        20        30        40        50        60

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pF1KB4 VNINCMDPLGRSALLIAIENENLEIMELLLNHSVYVGDALLYAIRKEVVGAVELLLSYRR
       .::::.:::::.::::::::::::..::::. .::::::::.::::::::::::::....
NP_001 ININCIDPLGRTALLIAIENENLELIELLLSFNVYVGDALLHAIRKEVVGAVELLLNHKK
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pF1KB4 PSGEKQVPTLMMDTQFSEFTPDITPIMLAAHTNNYEIIKLLVQKRVTIPRPHQIRCNCVE
       :::::::: ...: ::::::::::::.::::::::::::::::: :..::::..::::::
NP_001 PSGEKQVPPILLDKQFSEFTPDITPIILAAHTNNYEIIKLLVQKGVSVPRPHEVRCNCVE
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pF1KB4 CVSSSEVDSLRHSRSRLNIYKALASPSLIALSSEDPILTAFRLGWELKELSKVENEFKAE
       :::::.::::::::::::::::::::::::::::::.::::.:.:::.::::::::::.:
NP_001 CVSSSDVDSLRHSRSRLNIYKALASPSLIALSSEDPFLTAFQLSWELQELSKVENEFKSE
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pF1KB4 YEELSQQCKLFAKDLLDQARSSRELEIILNHRDDHSEELDPQKYHDLAKLKVAIKYHQKE
       :::::.::: ::::::::.:::::::::::.:::.:  .. :. .:::.::.::::.:::
NP_001 YEELSRQCKQFAKDLLDQTRSSRELEIILNYRDDNSL-IEEQSGNDLARLKLAIKYRQKE
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pF1KB4 FVAQPNCQQLLATLWYDGFPGWRRKHWVVKLLTCMTIGFLFPMLSIAYLISPRSNLGLFI
       ::::::::::::. ::: ::::::.::.::..::. ::.:::..:. :::.:.: :::::
NP_001 FVAQPNCQQLLASRWYDEFPGWRRRHWAVKMVTCFIIGLLFPVFSVCYLIAPKSPLGLFI
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pF1KB4 KKPFIKFICHTASYLTFLFMLLLASQHIVRTDLHVQGPPPTVVEWMILPWVLGFIWGEIK
       .::::::::::::::::::.:::::::: :.::. ::::::.::::::::::::::::::
NP_001 RKPFIKFICHTASYLTFLFLLLLASQHIDRSDLNRQGPPPTIVEWMILPWVLGFIWGEIK
     360       370       380       390       400       410         

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pF1KB4 EMWDGGFTEYIHDWWNLMDFAMNSLYLATISLKIVAYVKYNGSRPREEWEMWHPTLIAEA
       .:::::. .:::::::::::.:::::::::::::::.:::..  ::: :.::::::.:::
NP_001 QMWDGGLQDYIHDWWNLMDFVMNSLYLATISLKIVAFVKYSALNPRESWDMWHPTLVAEA
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pF1KB4 LFAISNILSSLRLISLFTANSHLGPLQISLGRMLLDILKFLFIYCLVLLAFANGLNQLYF
       ::::.::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LFAIANIFSSLRLISLFTANSHLGPLQISLGRMLLDILKFLFIYCLVLLAFANGLNQLYF
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pF1KB4 YYE-TRAIDEPNNCKGIRCEKQNNAFSTLFETLQSLFWSVFGLLNLYVTNVKARHEFTEF
       ::: :...    .::::::::::::::::::::::::::.:::.:::::::::.::::::
NP_001 YYEETKGL----TCKGIRCEKQNNAFSTLFETLQSLFWSIFGLINLYVTNVKAQHEFTEF
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pF1KB4 VGATMFGTYNVISLVVLLNMLIAMMNNSYQLIADHADIEWKFARTKLWMSYFDEGGTLPP
       :::::::::::::::::::::::::::::::::                           
NP_001 VGATMFGTYNVISLVVLLNMLIAMMNNSYQLIA---------------------------
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pF1KB4 PFNIIPSPKSFLYLGNWFNNTFCPKRDPDGRRRRRNLRSFTERNADSLIQNQHYQEVIRN
                                                .: ::.: ....::::.::
NP_001 -----------------------------------------RRAADNLRRHHQYQEVMRN
                                               630       640       

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pF1KB4 LVKRYVAAMIRNSKTHEGLTEENFKELKQDISSFRYEVLDLL-GNRKHPRSFSTSSTELS
       :::::::::::..::.:::::::::::::::::::.::: :: :..    . ...: : :
NP_001 LVKRYVAAMIRDAKTEEGLTEENFKELKQDISSFRFEVLGLLRGSKLSTIQSANASKESS
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pF1KB4 QRDDNNDGSGGARAKSKSVSFNLGCKKKTCHGPPLIRTMPRSSGAQGKSKAESSSKRSFM
       .  :... :                                                   
NP_001 NSADSDEKSDSEEEVARQQAAGPLERNIQLESRGLASRGDLSIPGLSEQCVLVDHRERNT
       710       720       730       740       750       760       

>>NP_001129430 (OMIM: 603651) short transient receptor p  (804 aa)
 initn: 2578 init1: 1483 opt: 2616  Z-score: 2722.9  bits: 515.0 E(85289): 6.3e-145
Smith-Waterman score: 2883; 54.4% identity (69.3% similar) in 916 aa overlap (1-903:1-731)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB4 MAQLYYKKVNYSPYRDRIPLQIVRAETELSAEEKAFLNAVEKGDYATVKQALQEAEIYYN
       :::.:::.   .::::::::.:::::.:::  :::.::::::::::.::..:.:::::..
NP_001 MAQFYYKRNVNAPYRDRIPLRIVRAESELSPSEKAYLNAVEKGDYASVKKSLEEAEIYFK
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB4 VNINCMDPLGRSALLIAIENENLEIMELLLNHSVYVGDALLYAIRKEVVGAVELLLSYRR
       .::::.:::::.::::::::::::..::::. .::::::::.::::::::::::::....
NP_001 ININCIDPLGRTALLIAIENENLELIELLLSFNVYVGDALLHAIRKEVVGAVELLLNHKK
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB4 PSGEKQVPTLMMDTQFSEFTPDITPIMLAAHTNNYEIIKLLVQKRVTIPRPHQIRCNCVE
       ::::::                                                      
NP_001 PSGEKQ------------------------------------------------------
                                                                   

              190       200       210       220       230       240
pF1KB4 CVSSSEVDSLRHSRSRLNIYKALASPSLIALSSEDPILTAFRLGWELKELSKVENEFKAE
                                                                   
NP_001 ------------------------------------------------------------
                                                                   

              250       260       270       280       290       300
pF1KB4 YEELSQQCKLFAKDLLDQARSSRELEIILNHRDDHSEELDPQKYHDLAKLKVAIKYHQKE
                                                                   
NP_001 ------------------------------------------------------------
                                                                   

              310       320       330       340       350       360
pF1KB4 FVAQPNCQQLLATLWYDGFPGWRRKHWVVKLLTCMTIGFLFPMLSIAYLISPRSNLGLFI
       ::::::::::::. ::: ::::::.::.::..::. ::.:::..:. :::.:.: :::::
NP_001 FVAQPNCQQLLASRWYDEFPGWRRRHWAVKMVTCFIIGLLFPVFSVCYLIAPKSPLGLFI
        130       140       150       160       170       180      

              370       380       390       400       410       420
pF1KB4 KKPFIKFICHTASYLTFLFMLLLASQHIVRTDLHVQGPPPTVVEWMILPWVLGFIWGEIK
       .::::::::::::::::::.:::::::: :.::. ::::::.::::::::::::::::::
NP_001 RKPFIKFICHTASYLTFLFLLLLASQHIDRSDLNRQGPPPTIVEWMILPWVLGFIWGEIK
        190       200       210       220       230       240      

              430       440       450       460       470       480
pF1KB4 EMWDGGFTEYIHDWWNLMDFAMNSLYLATISLKIVAYVKYNGSRPREEWEMWHPTLIAEA
       .:::::. .:::::::::::.:::::::::::::::.:::..  ::: :.::::::.:::
NP_001 QMWDGGLQDYIHDWWNLMDFVMNSLYLATISLKIVAFVKYSALNPRESWDMWHPTLVAEA
        250       260       270       280       290       300      

              490       500       510       520       530       540
pF1KB4 LFAISNILSSLRLISLFTANSHLGPLQISLGRMLLDILKFLFIYCLVLLAFANGLNQLYF
       ::::.::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LFAIANIFSSLRLISLFTANSHLGPLQISLGRMLLDILKFLFIYCLVLLAFANGLNQLYF
        310       320       330       340       350       360      

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pF1KB4 YYE-TRAIDEPNNCKGIRCEKQNNAFSTLFETLQSLFWSVFGLLNLYVTNVKARHEFTEF
       ::: :...    .::::::::::::::::::::::::::.:::.:::::::::.::::::
NP_001 YYEETKGL----TCKGIRCEKQNNAFSTLFETLQSLFWSIFGLINLYVTNVKAQHEFTEF
        370           380       390       400       410       420  

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pF1KB4 VGATMFGTYNVISLVVLLNMLIAMMNNSYQLIADHADIEWKFARTKLWMSYFDEGGTLPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::: 
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NP_001 FWYIFSLAHVAIFVTRFSYGEELQSFVGAVIVGTYNVVVVIVLTKLLVAMLHKSFQLIAN
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NP_001 RNEIRDLLGFRTSKYAMFYPRN                                      
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