Result of FASTA (ccds) for
pF1KB4113
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4113, 524 aa
1>>>pF1KB4113 524 - 524 aa - 524 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6202+/-0.00122; mu= 16.1825+/- 0.073
mean_var=63.4704+/-12.804, 0's: 0 Z-trim(100.4): 35 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.160986
statistics sampled from 6075 (6100) to 6075 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.531), E-opt: 0.2 (0.187), width: 16
Scan time: 2.930
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS6452.1 SLC1A1 gene_id:6505|Hs108|chr9 ( 524) 3291 773.7 0
CCDS3919.1 SLC1A3 gene_id:6507|Hs108|chr5 ( 542) 1702 404.7 1.4e-112
CCDS55756.1 SLC1A2 gene_id:6506|Hs108|chr11 ( 565) 1650 392.6 6.2e-109
CCDS31459.1 SLC1A2 gene_id:6506|Hs108|chr11 ( 574) 1650 392.6 6.3e-109
CCDS78004.1 SLC1A3 gene_id:6507|Hs108|chr5 ( 496) 1525 363.6 3e-100
CCDS54844.1 SLC1A3 gene_id:6507|Hs108|chr5 ( 497) 1317 315.3 1.1e-85
CCDS12321.1 SLC1A6 gene_id:6511|Hs108|chr19 ( 564) 1158 278.3 1.6e-74
CCDS72796.1 SLC1A7 gene_id:6512|Hs108|chr1 ( 472) 1126 270.9 2.3e-72
CCDS574.1 SLC1A7 gene_id:6512|Hs108|chr1 ( 560) 1118 269.1 9.7e-72
CCDS78003.1 SLC1A3 gene_id:6507|Hs108|chr5 ( 430) 1019 246.0 6.4e-65
CCDS1879.1 SLC1A4 gene_id:6509|Hs108|chr2 ( 532) 984 237.9 2.2e-62
CCDS12692.1 SLC1A5 gene_id:6510|Hs108|chr19 ( 541) 970 234.7 2.1e-61
CCDS46125.1 SLC1A5 gene_id:6510|Hs108|chr19 ( 339) 957 231.6 1.1e-60
CCDS46126.1 SLC1A5 gene_id:6510|Hs108|chr19 ( 313) 938 227.2 2.2e-59
CCDS72797.1 SLC1A7 gene_id:6512|Hs108|chr1 ( 619) 691 169.9 7.6e-42
CCDS54362.1 SLC1A4 gene_id:6509|Hs108|chr2 ( 234) 589 146.1 4.3e-35
CCDS62578.1 SLC1A6 gene_id:6511|Hs108|chr19 ( 312) 518 129.6 5.1e-30
CCDS72798.1 SLC1A7 gene_id:6512|Hs108|chr1 ( 158) 360 92.8 3.1e-19
>>CCDS6452.1 SLC1A1 gene_id:6505|Hs108|chr9 (524 aa)
initn: 3291 init1: 3291 opt: 3291 Z-score: 4129.5 bits: 773.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3291; 100.0% identity (100.0% similar) in 524 aa overlap (1-524:1-524)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MGKPARKGCEWKRFLKNNWVLLSTVAAVVLGITTGVLVREHSNLSTLEKFYFAFPGEILM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 MGKPARKGCEWKRFLKNNWVLLSTVAAVVLGITTGVLVREHSNLSTLEKFYFAFPGEILM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 RMLKLIILPLIISSMITGVAALDSNVSGKIGLRAVVYYFCTTLIAVILGIVLVVSIKPGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 RMLKLIILPLIISSMITGVAALDSNVSGKIGLRAVVYYFCTTLIAVILGIVLVVSIKPGV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 TQKVGEIARTGSTPEVSTVDAMLDLIRNMFPENLVQACFQQYKTKREEVKPPSDPEMNMT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 TQKVGEIARTGSTPEVSTVDAMLDLIRNMFPENLVQACFQQYKTKREEVKPPSDPEMNMT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 EESFTAVMTTAISKNKTKEYKIVGMYSDGINVLGLIVFCLVFGLVIGKMGEKGQILVDFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 EESFTAVMTTAISKNKTKEYKIVGMYSDGINVLGLIVFCLVFGLVIGKMGEKGQILVDFF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 NALSDATMKIVQIIMCYMPLGILFLIAGKIIEVEDWEIFRKLGLYMATVLTGLAIHSIVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 NALSDATMKIVQIIMCYMPLGILFLIAGKIIEVEDWEIFRKLGLYMATVLTGLAIHSIVI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 LPLIYFIVVRKNPFRFAMGMAQALLTALMISSSSATLPVTFRCAEENNQVDKRITRFVLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 LPLIYFIVVRKNPFRFAMGMAQALLTALMISSSSATLPVTFRCAEENNQVDKRITRFVLP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 VGATINMDGTALYEAVAAVFIAQLNDLDLGIGQIITISITATSASIGAAGVPQAGLVTMV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 VGATINMDGTALYEAVAAVFIAQLNDLDLGIGQIITISITATSASIGAAGVPQAGLVTMV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 IVLSAVGLPAEDVTLIIAVDWLLDRFRTMVNVLGDAFGTGIVEKLSKKELEQMDVSSEVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 IVLSAVGLPAEDVTLIIAVDWLLDRFRTMVNVLGDAFGTGIVEKLSKKELEQMDVSSEVN
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520
pF1KB4 IVNPFALESTILDNEDSDTKKSYVNGGFAVDKSDTISFTQTSQF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS64 IVNPFALESTILDNEDSDTKKSYVNGGFAVDKSDTISFTQTSQF
490 500 510 520
>>CCDS3919.1 SLC1A3 gene_id:6507|Hs108|chr5 (542 aa)
initn: 1656 init1: 916 opt: 1702 Z-score: 2134.7 bits: 404.7 E(32554): 1.4e-112
Smith-Waterman score: 1702; 55.2% identity (82.2% similar) in 493 aa overlap (14-501:45-534)
10 20 30 40
pF1KB4 MGKPARKGCEWKRFLKNNWVLLSTVAAVVLGITTGVLVREHSN
...: .::: ::.::..: : .: .
CCDS39 MERFQQGVRKRTLLAKKKVQNITKEDVKSYLFRNAFVLL-TVTAVIVGTILGFTLRPYR-
20 30 40 50 60 70
50 60 70 80 90 100
pF1KB4 LSTLEKFYFAFPGEILMRMLKLIILPLIISSMITGVAALDSNVSGKIGLRAVVYYFCTTL
.: : ::.::::.:::::....:::::::..::.:::::..:::.:.::::::. ::.
CCDS39 MSYREVKYFSFPGELLMRMLQMLVLPLIISSLVTGMAALDSKASGKMGMRAVVYYMTTTI
80 90 100 110 120 130
110 120 130 140 150 160
pF1KB4 IAVILGIVLVVSIKPGVTQKVGEIARTGSTPEVSTVDAMLDLIRNMFPENLVQACFQQYK
:::..::..:. :.:: : . . : :. .:...::.::::::::: :::.:::.:.:
CCDS39 IAVVIGIIIVIIIHPGKGTKEN-MHREGKIVRVTAADAFLDLIRNMFPPNLVEACFKQFK
140 150 160 170 180 190
170 180 190 200 210 220
pF1KB4 TKREE--VKPPSDPEMNMTEESFTAVMTTAISKNK-TKEYKIVGMYSDGINVLGLIVFCL
:. :. : : . . ... .. : . . .. :.: : .:.:.:::.:: .
CCDS39 TNYEKRSFKVPIQANETLVGAVINNVSEAMETLTRITEELVPVPGSVNGVNALGLVVFSM
200 210 220 230 240 250
230 240 250 260 270 280
pF1KB4 VFGLVIGKMGEKGQILVDFFNALSDATMKIVQIIMCYMPLGILFLIAGKIIEVEDWEIFR
::.:::.: :.:: : .::..:..: :..: .:: : :.::::::::::.:.:: ..
CCDS39 CFGFVIGNMKEQGQALREFFDSLNEAIMRLVAVIMWYAPVGILFLIAGKIVEMEDMGVIG
260 270 280 290 300 310
290 300 310 320 330
pF1KB4 -KLGLYMATVLTGLAIHSIVILPLIYFIVVRKNPFRFAMGMAQALLTALMISSSSATLPV
.:..: .::..:: ::....:::.::.:.::::. : :. :::.::: ::::::::.
CCDS39 GQLAMYTVTVIVGLLIHAVIVLPLLYFLVTRKNPWVFIGGLLQALITALGTSSSSATLPI
320 330 340 350 360 370
340 350 360 370 380 390
pF1KB4 TFRCAEENNQVDKRITRFVLPVGATINMDGTALYEAVAAVFIAQLNDLDLGIGQIITISI
::.: :::: ::::.:::::::::::::::::::::.::.::::.:...:..::::::::
CCDS39 TFKCLEENNGVDKRVTRFVLPVGATINMDGTALYEALAAIFIAQVNNFELNFGQIITISI
380 390 400 410 420 430
400 410 420 430 440 450
pF1KB4 TATSASIGAAGVPQAGLVTMVIVLSAVGLPAEDVTLIIAVDWLLDRFRTMVNVLGDAFGT
:::.:::::::.::::::::::::..::::..:.::::::::.:::.:: .:::::..:.
CCDS39 TATAASIGAAGIPQAGLVTMVIVLTSVGLPTDDITLIIAVDWFLDRLRTTTNVLGDSLGA
440 450 460 470 480 490
460 470 480 490 500 510
pF1KB4 GIVEKLSKKELEQMDVSSEVNIVNPFALESTI-LDNEDSDTKKSYVNGGFAVDKSDTISF
::::.::..::.. :: .... ... : .:..:.:
CCDS39 GIVEHLSRHELKNRDVEMGNSVIEENEMKKPYQLIAQDNETEKPIDSETKM
500 510 520 530 540
520
pF1KB4 TQTSQF
>>CCDS55756.1 SLC1A2 gene_id:6506|Hs108|chr11 (565 aa)
initn: 1644 init1: 869 opt: 1650 Z-score: 2069.1 bits: 392.6 E(32554): 6.2e-109
Smith-Waterman score: 1650; 55.4% identity (81.6% similar) in 473 aa overlap (15-480:32-502)
10 20 30 40
pF1KB4 MGKPARKGCEWKRFLKNNWVLLSTVAAVVLGITTGVLVREHSNL
: .: .: :: .:.:: . : :.: : .
CCDS55 PKQVEVRMHDSHLGSEEPKHRHLGLRLCDKLGKNLLLTLTVFGVILGAVCGGLLRLASPI
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB4 STLEKFYFAFPGEILMRMLKLIILPLIISSMITGVAALDSNVSGKIGLRAVVYYFCTTLI
. .::::.:::::::..::::::::.:::...::...::..: ::.:::. ::.:
CCDS55 HPDVVMLIAFPGDILMRMLKMLILPLIISSLITGLSGLDAKASGRLGTRAMVYYMSTTII
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB4 AVILGIVLVVSIKPGVTQKVGEIARTGSTPEVSTVDAMLDLIRNMFPENLVQACFQQYKT
:..::..::..:.:: . ... .. :::..::.::::::.:::::::::::: .:
CCDS55 AAVLGVILVLAIHPGNPKLKKQLGPGKKNDEVSSLDAFLDLIRNLFPENLVQACFQQIQT
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210
pF1KB4 --KREEVKPPSDPEMNMTEESFTAVMTTAISKNKTKEYKIV---GM-YSDGINVLGLIVF
:. : :: : : : : . ..... .... .: :.: :. ..::.:::::: :
CCDS55 VTKKVLVAPPPDEEANATS-AVVSLLNETVTEVP-EETKMVIKKGLEFKDGMNVLGLIGF
190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KB4 CLVFGLVIGKMGEKGQILVDFFNALSDATMKIVQIIMCYMPLGILFLIAGKIIEVEDWEI
..::...::::......::::: :.. .::.: .:: : :::: :: :::: ..: :.
CCDS55 FIAFGIAMGKMGDQAKLMVDFFNILNEIVMKLVIMIMWYSPLGIACLICGKIIAIKDLEV
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB4 F-RKLGLYMATVLTGLAIHSIVILPLIYFIVVRKNPFRFAMGMAQALLTALMISSSSATL
:.::.::.::. :: ::. ..::::::.:.::::: : :. :: .::: .::..::
CCDS55 VARQLGMYMVTVIIGLIIHGGIFLPLIYFVVTRKNPFSFFAGIFQAWITALGTASSAGTL
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KB4 PVTFRCAEENNQVDKRITRFVLPVGATINMDGTALYEAVAAVFIAQLNDLDLGIGQIITI
:::::: ::: .:::.::::::::::::::::::::::::.::::.: . : :::.:.
CCDS55 PVTFRCLEENLGIDKRVTRFVLPVGATINMDGTALYEAVAAIFIAQMNGVVLDGGQIVTV
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KB4 SITATSASIGAAGVPQAGLVTMVIVLSAVGLPAEDVTLIIAVDWLLDRFRTMVNVLGDAF
:.::: ::.:::..:.::::::...:.:::::.::..:..::::::::.:: :::.::.:
CCDS55 SLTATLASVGAASIPSAGLVTMLLILTAVGLPTEDISLLVAVDWLLDRMRTSVNVVGDSF
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500 510
pF1KB4 GTGIVEKLSKKELEQMDVSSEVNIVNPFALESTILDNEDSDTKKSYVNGGFAVDKSDTIS
:.::: .:::.::. .: . .:.
CCDS55 GAGIVYHLSKSELDTIDSQHRVHEDIEMTKTQSIYDDMKNHRESNSNQCVYAAHNSVIVD
480 490 500 510 520 530
>>CCDS31459.1 SLC1A2 gene_id:6506|Hs108|chr11 (574 aa)
initn: 1644 init1: 869 opt: 1650 Z-score: 2069.0 bits: 392.6 E(32554): 6.3e-109
Smith-Waterman score: 1650; 55.4% identity (81.6% similar) in 473 aa overlap (15-480:41-511)
10 20 30 40
pF1KB4 MGKPARKGCEWKRFLKNNWVLLSTVAAVVLGITTGVLVREHSNL
: .: .: :: .:.:: . : :.: : .
CCDS31 PKQVEVRMHDSHLGSEEPKHRHLGLRLCDKLGKNLLLTLTVFGVILGAVCGGLLRLASPI
20 30 40 50 60 70
50 60 70 80 90 100
pF1KB4 STLEKFYFAFPGEILMRMLKLIILPLIISSMITGVAALDSNVSGKIGLRAVVYYFCTTLI
. .::::.:::::::..::::::::.:::...::...::..: ::.:::. ::.:
CCDS31 HPDVVMLIAFPGDILMRMLKMLILPLIISSLITGLSGLDAKASGRLGTRAMVYYMSTTII
80 90 100 110 120 130
110 120 130 140 150 160
pF1KB4 AVILGIVLVVSIKPGVTQKVGEIARTGSTPEVSTVDAMLDLIRNMFPENLVQACFQQYKT
:..::..::..:.:: . ... .. :::..::.::::::.:::::::::::: .:
CCDS31 AAVLGVILVLAIHPGNPKLKKQLGPGKKNDEVSSLDAFLDLIRNLFPENLVQACFQQIQT
140 150 160 170 180 190
170 180 190 200 210
pF1KB4 --KREEVKPPSDPEMNMTEESFTAVMTTAISKNKTKEYKIV---GM-YSDGINVLGLIVF
:. : :: : : : : . ..... .... .: :.: :. ..::.:::::: :
CCDS31 VTKKVLVAPPPDEEANATS-AVVSLLNETVTEVP-EETKMVIKKGLEFKDGMNVLGLIGF
200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KB4 CLVFGLVIGKMGEKGQILVDFFNALSDATMKIVQIIMCYMPLGILFLIAGKIIEVEDWEI
..::...::::......::::: :.. .::.: .:: : :::: :: :::: ..: :.
CCDS31 FIAFGIAMGKMGDQAKLMVDFFNILNEIVMKLVIMIMWYSPLGIACLICGKIIAIKDLEV
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KB4 F-RKLGLYMATVLTGLAIHSIVILPLIYFIVVRKNPFRFAMGMAQALLTALMISSSSATL
:.::.::.::. :: ::. ..::::::.:.::::: : :. :: .::: .::..::
CCDS31 VARQLGMYMVTVIIGLIIHGGIFLPLIYFVVTRKNPFSFFAGIFQAWITALGTASSAGTL
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KB4 PVTFRCAEENNQVDKRITRFVLPVGATINMDGTALYEAVAAVFIAQLNDLDLGIGQIITI
:::::: ::: .:::.::::::::::::::::::::::::.::::.: . : :::.:.
CCDS31 PVTFRCLEENLGIDKRVTRFVLPVGATINMDGTALYEAVAAIFIAQMNGVVLDGGQIVTV
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KB4 SITATSASIGAAGVPQAGLVTMVIVLSAVGLPAEDVTLIIAVDWLLDRFRTMVNVLGDAF
:.::: ::.:::..:.::::::...:.:::::.::..:..::::::::.:: :::.::.:
CCDS31 SLTATLASVGAASIPSAGLVTMLLILTAVGLPTEDISLLVAVDWLLDRMRTSVNVVGDSF
430 440 450 460 470 480
460 470 480 490 500 510
pF1KB4 GTGIVEKLSKKELEQMDVSSEVNIVNPFALESTILDNEDSDTKKSYVNGGFAVDKSDTIS
:.::: .:::.::. .: . .:.
CCDS31 GAGIVYHLSKSELDTIDSQHRVHEDIEMTKTQSIYDDMKNHRESNSNQCVYAAHNSVIVD
490 500 510 520 530 540
>>CCDS78004.1 SLC1A3 gene_id:6507|Hs108|chr5 (496 aa)
initn: 1528 init1: 916 opt: 1525 Z-score: 1913.1 bits: 363.6 E(32554): 3e-100
Smith-Waterman score: 1525; 55.4% identity (82.8% similar) in 437 aa overlap (70-501:53-488)
40 50 60 70 80 90
pF1KB4 EHSNLSTLEKFYFAFPGEILMRMLKLIILPLIISSMITGVAALDSNVSGKIGLRAVVYYF
: ....:.:.:::::..:::.:.::::::.
CCDS78 RKRTLLAKKKVQNITKEDVKSYLFRNAFVLLTVTAVIVGMAALDSKASGKMGMRAVVYYM
30 40 50 60 70 80
100 110 120 130 140 150
pF1KB4 CTTLIAVILGIVLVVSIKPGVTQKVGEIARTGSTPEVSTVDAMLDLIRNMFPENLVQACF
::.:::..::..:. :.:: : . . : :. .:...::.::::::::: :::.:::
CCDS78 TTTIIAVVIGIIIVIIIHPGKGTKEN-MHREGKIVRVTAADAFLDLIRNMFPPNLVEACF
90 100 110 120 130 140
160 170 180 190 200 210
pF1KB4 QQYKTKREE--VKPPSDPEMNMTEESFTAVMTTAISKNK-TKEYKIVGMYSDGINVLGLI
.:.::. :. : : . . ... .. : . . .. :.: : .:.:.:::.
CCDS78 KQFKTNYEKRSFKVPIQANETLVGAVINNVSEAMETLTRITEELVPVPGSVNGVNALGLV
150 160 170 180 190 200
220 230 240 250 260 270
pF1KB4 VFCLVFGLVIGKMGEKGQILVDFFNALSDATMKIVQIIMCYMPLGILFLIAGKIIEVEDW
:: . ::.:::.: :.:: : .::..:..: :..: .:: : :.::::::::::.:.::
CCDS78 VFSMCFGFVIGNMKEQGQALREFFDSLNEAIMRLVAVIMWYAPVGILFLIAGKIVEMEDM
210 220 230 240 250 260
280 290 300 310 320 330
pF1KB4 EIFR-KLGLYMATVLTGLAIHSIVILPLIYFIVVRKNPFRFAMGMAQALLTALMISSSSA
.. .:..: .::..:: ::....:::.::.:.::::. : :. :::.::: :::::
CCDS78 GVIGGQLAMYTVTVIVGLLIHAVIVLPLLYFLVTRKNPWVFIGGLLQALITALGTSSSSA
270 280 290 300 310 320
340 350 360 370 380 390
pF1KB4 TLPVTFRCAEENNQVDKRITRFVLPVGATINMDGTALYEAVAAVFIAQLNDLDLGIGQII
:::.::.: :::: ::::.:::::::::::::::::::::.::.::::.:...:..::::
CCDS78 TLPITFKCLEENNGVDKRVTRFVLPVGATINMDGTALYEALAAIFIAQVNNFELNFGQII
330 340 350 360 370 380
400 410 420 430 440 450
pF1KB4 TISITATSASIGAAGVPQAGLVTMVIVLSAVGLPAEDVTLIIAVDWLLDRFRTMVNVLGD
:::::::.:::::::.::::::::::::..::::..:.::::::::.:::.:: .:::::
CCDS78 TISITATAASIGAAGIPQAGLVTMVIVLTSVGLPTDDITLIIAVDWFLDRLRTTTNVLGD
390 400 410 420 430 440
460 470 480 490 500 510
pF1KB4 AFGTGIVEKLSKKELEQMDVSSEVNIVNPFALESTI-LDNEDSDTKKSYVNGGFAVDKSD
..:.::::.::..::.. :: .... ... : .:..:.:
CCDS78 SLGAGIVEHLSRHELKNRDVEMGNSVIEENEMKKPYQLIAQDNETEKPIDSETKM
450 460 470 480 490
520
pF1KB4 TISFTQTSQF
>>CCDS54844.1 SLC1A3 gene_id:6507|Hs108|chr5 (497 aa)
initn: 1395 init1: 539 opt: 1317 Z-score: 1652.1 bits: 315.3 E(32554): 1.1e-85
Smith-Waterman score: 1354; 47.5% identity (72.8% similar) in 493 aa overlap (14-501:45-489)
10 20 30 40
pF1KB4 MGKPARKGCEWKRFLKNNWVLLSTVAAVVLGITTGVLVREHSN
...: .::: ::.::..: : .: .
CCDS54 MERFQQGVRKRTLLAKKKVQNITKEDVKSYLFRNAFVLL-TVTAVIVGTILGFTLRPYR-
20 30 40 50 60 70
50 60 70 80 90 100
pF1KB4 LSTLEKFYFAFPGEILMRMLKLIILPLIISSMITGVAALDSNVSGKIGLRAVVYYFCTTL
.: : ::.::::.:::::....:::::::..::.:::::..:::.:.::::::. ::.
CCDS54 MSYREVKYFSFPGELLMRMLQMLVLPLIISSLVTGMAALDSKASGKMGMRAVVYYMTTTI
80 90 100 110 120 130
110 120 130 140 150 160
pF1KB4 IAVILGIVLVVSIKPGVTQKVGEIARTGSTPEVSTVDAMLDLIRNMFPENLVQACFQQYK
:::..::..:. :.:: : . . : :. .:...::.::::::::: :::.:::.:.:
CCDS54 IAVVIGIIIVIIIHPGKGTKEN-MHREGKIVRVTAADAFLDLIRNMFPPNLVEACFKQFK
140 150 160 170 180 190
170 180 190 200 210 220
pF1KB4 TKREE--VKPPSDPEMNMTEESFTAVMTTAISKNK-TKEYKIVGMYSDGINVLGLIVFCL
:. :. : : . . ... .. : . . .. :.: : .:.:.:::.:: .
CCDS54 TNYEKRSFKVPIQANETLVGAVINNVSEAMETLTRITEELVPVPGSVNGVNALGLVVFSM
200 210 220 230 240 250
230 240 250 260 270 280
pF1KB4 VFGLVIGKMGEKGQILVDFFNALSDATMKIVQIIMCYMPLGILFLIAGKIIEVEDWEIFR
::.:::.: :.:: : .::..:..: :..: .:: : :.::::::::::.:.:: ..
CCDS54 CFGFVIGNMKEQGQALREFFDSLNEAIMRLVAVIMWYAPVGILFLIAGKIVEMEDMGVIG
260 270 280 290 300 310
290 300 310 320 330
pF1KB4 -KLGLYMATVLTGLAIHSIVILPLIYFIVVRKNPFRFAMGMAQALLTALMISSSSATLPV
.:..: .::..:: ::....:::.::.:.::::. : :. :::.::: ::::::::.
CCDS54 GQLAMYTVTVIVGLLIHAVIVLPLLYFLVTRKNPWVFIGGLLQALITALGTSSSSATLPI
320 330 340 350 360 370
340 350 360 370 380 390
pF1KB4 TFRCAEENNQVDKRITRFVLPVGATINMDGTALYEAVAAVFIAQLNDLDLGIGQIITISI
::.: :::: ::::.:::::::::::::::::::::.::.::::.:...:..::::::
CCDS54 TFKCLEENNGVDKRVTRFVLPVGATINMDGTALYEALAAIFIAQVNNFELNFGQIITIR-
380 390 400 410 420 430
400 410 420 430 440 450
pF1KB4 TATSASIGAAGVPQAGLVTMVIVLSAVGLPAEDVTLIIAVDWLLDRFRTMVNVLGDAFGT
::.:: .:::::..:.
CCDS54 --------------------------------------------DRLRTTTNVLGDSLGA
440
460 470 480 490 500 510
pF1KB4 GIVEKLSKKELEQMDVSSEVNIVNPFALESTI-LDNEDSDTKKSYVNGGFAVDKSDTISF
::::.::..::.. :: .... ... : .:..:.:
CCDS54 GIVEHLSRHELKNRDVEMGNSVIEENEMKKPYQLIAQDNETEKPIDSETKM
450 460 470 480 490
520
pF1KB4 TQTSQF
>>CCDS12321.1 SLC1A6 gene_id:6511|Hs108|chr19 (564 aa)
initn: 1642 init1: 885 opt: 1158 Z-score: 1451.6 bits: 278.3 E(32554): 1.6e-74
Smith-Waterman score: 1635; 54.6% identity (80.0% similar) in 480 aa overlap (13-471:51-528)
10 20 30 40
pF1KB4 MGKPARKGCEWKRFLKNNWVLLSTVAAVVLGITTGVLVREHS
:::. : .: ::.:::.:.. . .: ..
CCDS12 GWLQRLQESLQQRALRTRLRLQTMTLEHVLRFLRRNAFILLTVSAVVIGVSLAFALRPYQ
30 40 50 60 70 80
50 60 70 80 90 100
pF1KB4 NLSTLEKFYFAFPGEILMRMLKLIILPLIISSMITGVAALDSNVSGKIGLRAVVYYFCTT
:. . ::.::::.:::::....::::.::..::.:.::....:..:.::.:::. ::
CCDS12 -LTYRQIKYFSFPGELLMRMLQMLVLPLIVSSLVTGMASLDNKATGRMGMRAAVYYMVTT
90 100 110 120 130
110 120 130 140 150 160
pF1KB4 LIAVILGIVLVVSIKPGVTQKVGEIARTGSTPEVSTVDAMLDLIRNMFPENLVQACFQQY
.:::..::..:. :.:: .: : . : : . :.::..:::::::: :::.:::.:.
CCDS12 IIAVFIGILMVTIIHPGKGSKEG-LHREGRIETIPTADAFMDLIRNMFPPNLVEACFKQF
140 150 160 170 180 190
170 180 190 200
pF1KB4 KTK-------REEVKPP--SDPEMNMTEE-------SFTAVMTTAISKNKT----KEYKI
::. : :. :.: .: :: .: :.. . .:
CCDS12 KTQYSTRVVTRTMVRTENGSEPGASMPPPFSVENGTSFLENVTRALGTLQEMLSFEETVP
200 210 220 230 240 250
210 220 230 240 250 260
pF1KB4 VGMYSDGINVLGLIVFCLVFGLVIGKMGEKGQILVDFFNALSDATMKIVQIIMCYMPLGI
: ..:::.:::.:: ..:::::: : .::..: :::..:..: :..: ::. : :.::
CCDS12 VPGSANGINALGLVVFSVAFGLVIGGMKHKGRVLRDFFDSLNEAIMRLVGIIIWYAPVGI
260 270 280 290 300 310
270 280 290 300 310 320
pF1KB4 LFLIAGKIIEVEDWEIFR-KLGLYMATVLTGLAIHSIVILPLIYFIVVRKNPFRFAMGMA
::::::::.:.:: .. .::.: ::..:: .:. ..::::::.:...::: : ::
CCDS12 LFLIAGKILEMEDMAVLGGQLGMYTLTVIVGLFLHAGIVLPLIYFLVTHRNPFPFIGGML
320 330 340 350 360 370
330 340 350 360 370 380
pF1KB4 QALLTALMISSSSATLPVTFRCAEENNQVDKRITRFVLPVGATINMDGTALYEAVAAVFI
:::.::. ::::::::.:::: ::. ::.::::::::::::.::::::::::.::.::
CCDS12 QALITAMGTSSSSATLPITFRCLEEGLGVDRRITRFVLPVGATVNMDGTALYEALAAIFI
380 390 400 410 420 430
390 400 410 420 430 440
pF1KB4 AQLNDLDLGIGQIITISITATSASIGAAGVPQAGLVTMVIVLSAVGLPAEDVTLIIAVDW
::.:. .:..::: :::::::.::.::::.::::::::::::..::::.::.::::::::
CCDS12 AQVNNYELNLGQITTISITATAASVGAAGIPQAGLVTMVIVLTSVGLPTEDITLIIAVDW
440 450 460 470 480 490
450 460 470 480 490 500
pF1KB4 LLDRFRTMVNVLGDAFGTGIVEKLSKKELEQMDVSSEVNIVNPFALESTILDNEDSDTKK
.:::.:::.:::::..:....:.::..:::
CCDS12 FLDRLRTMTNVLGDSIGAAVIEHLSQRELELQEAELTLPSLGKPYKSLMAQEKGASRGRG
500 510 520 530 540 550
>>CCDS72796.1 SLC1A7 gene_id:6512|Hs108|chr1 (472 aa)
initn: 1310 init1: 871 opt: 1126 Z-score: 1412.7 bits: 270.9 E(32554): 2.3e-72
Smith-Waterman score: 1213; 44.9% identity (67.2% similar) in 497 aa overlap (16-498:15-433)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MGKPARKGCEWKRFLKNNWVLLSTVAAVVLGITTGVLVREHSNLSTLEKFYFAFPGEILM
. : .:. .: .:..: : ..: . :: : :: ::::.::
CCDS72 MVPHAILARGRDVCRRNGLLILSVLSVIVGCLLGFFLRTRR-LSPQEISYFQFPGELLM
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 RMLKLIILPLIISSMITGVAALDSNVSGKIGLRAVVYYFCTTLIAVILGIVLVVSIKPGV
::::..::::..:
CCDS72 RMLKMMILPLVVS-----------------------------------------------
60 70
130 140 150 160 170
pF1KB4 TQKVGEIARTGSTPEVSTVDAMLDLIRNMFPENLVQACFQQYKTKREEV--KPPSDPE--
::::: :::.: :.::.:: : .: ::
CCDS72 --------------------------RNMFPANLVEATFKQYRTKTTPVVKSPKVAPEEA
80 90 100
180 190 200 210 220
pF1KB4 -------MNMTEESFTAVMTTAISKNKTKE--YKIVGMYSDGINVLGLIVFCLVFGLVIG
... ::. . :.. :.. . : :: :::.::::.. : ..:...:
CCDS72 PPRRILIYGVQEENGSHVQNFALDLTPPPEVVYKSEPGTSDGMNVLGIVFFSATMGIMLG
110 120 130 140 150 160
230 240 250 260 270 280
pF1KB4 KMGEKGQILVDFFNALSDATMKIVQIIMCYMPLGILFLIAGKIIEVEDWE-IFRKLGLYM
.::..: ::.: . :....:::: . . :.:.::.:::::::.:..: . . .:::.:
CCDS72 RMGDSGAPLVSFCQCLNESVMKIVAVAVWYFPFGIVFLIAGKILEMDDPRAVGKKLGFYS
170 180 190 200 210 220
290 300 310 320 330 340
pF1KB4 ATVLTGLAIHSIVILPLIYFIVVRKNPFRFAMGMAQALLTALMISSSSATLPVTFRCAEE
.::. ::..:.. ::::.::....:::. : :. :::: :: ::::::::.::.: :
CCDS72 VTVVCGLVLHGLFILPLLYFFITKKNPIVFIRGILQALLIALATSSSSATLPITFKCLLE
230 240 250 260 270 280
350 360 370 380 390 400
pF1KB4 NNQVDKRITRFVLPVGATINMDGTALYEAVAAVFIAQLNDLDLGIGQIITISITATSASI
::..:.::.:::::::::::::::::::::::.::::.:. .: .:::::::::::.:::
CCDS72 NNHIDRRIARFVLPVGATINMDGTALYEAVAAIFIAQVNNYELDFGQIITISITATAASI
290 300 310 320 330 340
410 420 430 440 450 460
pF1KB4 GAAGVPQAGLVTMVIVLSAVGLPAEDVTLIIAVDWLLDRFRTMVNVLGDAFGTGIVEKLS
::::.::::::::::::..::::..:.:::::::: :::::::.::::::...::. ..
CCDS72 GAAGIPQAGLVTMVIVLTSVGLPTDDITLIIAVDWALDRFRTMINVLGDALAAGIMAHIC
350 360 370 380 390 400
470 480 490 500 510 520
pF1KB4 KKELEQMDVSSEVNIVNPFALESTILDNEDSDTKKSYVNGGFAVDKSDTISFTQTSQF
.:.. . :...:. . .: :.. : .. :.
CCDS72 RKDFAR-DTGTETCFPSP---ETAALRDQASEPPGDRGSPAEWLCEECSRGLRAHPGPHL
410 420 430 440 450 460
CCDS72 PPPRPRSSGAG
470
>>CCDS574.1 SLC1A7 gene_id:6512|Hs108|chr1 (560 aa)
initn: 1508 init1: 871 opt: 1118 Z-score: 1401.4 bits: 269.1 E(32554): 9.7e-72
Smith-Waterman score: 1544; 52.5% identity (80.3% similar) in 478 aa overlap (16-478:15-488)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MGKPARKGCEWKRFLKNNWVLLSTVAAVVLGITTGVLVREHSNLSTLEKFYFAFPGEILM
. : .:. .: .:..: : ..: . :: : :: ::::.::
CCDS57 MVPHAILARGRDVCRRNGLLILSVLSVIVGCLLGFFLRTRR-LSPQEISYFQFPGELLM
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KB4 RMLKLIILPLIISSMITGVAALDSNVSGKIGLRAVVYYFCTTLIAVILGIVLVVSIKPG-
::::..::::..::...:.:.::...:...:. .:.::. ::..:::.:: .: :.::
CCDS57 RMLKMMILPLVVSSLMSGLASLDAKTSSRLGVLTVAYYLWTTFMAVIVGIFMVSIIHPGS
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB4 VTQKVGEIARTGSTPEVSTVDAMLDLIRNMFPENLVQACFQQYKTKREEV--KPPSDPE-
..:: : .. .. : .:..::.::::::::: :::.: :.::.:: : .: ::
CCDS57 AAQK--ETTEQSGKPIMSSADALLDLIRNMFPANLVEATFKQYRTKTTPVVKSPKVAPEE
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KB4 --------MNMTEESFTAVMTTAISKNKTKE--YKIVGMYSDGINVLGLIVFCLVFGLVI
... ::. . :.. :.. . : :: :::.::::.. : ..:...
CCDS57 APPRRILIYGVQEENGSHVQNFALDLTPPPEVVYKSEPGTSDGMNVLGIVFFSATMGIML
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB4 GKMGEKGQILVDFFNALSDATMKIVQIIMCYMPLGILFLIAGKIIEVEDWE-IFRKLGLY
:.::..: ::.: . :....:::: . . :.:.::.:::::::.:..: . . .:::.:
CCDS57 GRMGDSGAPLVSFCQCLNESVMKIVAVAVWYFPFGIVFLIAGKILEMDDPRAVGKKLGFY
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB4 MATVLTGLAIHSIVILPLIYFIVVRKNPFRFAMGMAQALLTALMISSSSATLPVTFRCAE
.::. ::..:.. ::::.::....:::. : :. :::: :: ::::::::.::.:
CCDS57 SVTVVCGLVLHGLFILPLLYFFITKKNPIVFIRGILQALLIALATSSSSATLPITFKCLL
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB4 ENNQVDKRITRFVLPVGATINMDGTALYEAVAAVFIAQLNDLDLGIGQIITISITATSAS
:::..:.::.:::::::::::::::::::::::.::::.:. .: .:::::::::::.::
CCDS57 ENNHIDRRIARFVLPVGATINMDGTALYEAVAAIFIAQVNNYELDFGQIITISITATAAS
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KB4 IGAAGVPQAGLVTMVIVLSAVGLPAEDVTLIIAVDWLLDRFRTMVNVLGDAFGTGIVEKL
:::::.::::::::::::..::::..:.:::::::: :::::::.::::::...::. ..
CCDS57 IGAAGIPQAGLVTMVIVLTSVGLPTDDITLIIAVDWALDRFRTMINVLGDALAAGIMAHI
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KB4 SKKELEQMDVSSEVNIVNPFALESTILDNEDSDTKKSYVNGGFAVDKSDTISFTQTSQF
.:.. . :...:
CCDS57 CRKDFAR-DTGTEKLLPCETKPVSLQEIVAAQQNGCVKSVAEASELTLGPTCPHHVPVQV
480 490 500 510 520 530
>>CCDS78003.1 SLC1A3 gene_id:6507|Hs108|chr5 (430 aa)
initn: 1369 init1: 916 opt: 1019 Z-score: 1279.0 bits: 246.0 E(32554): 6.4e-65
Smith-Waterman score: 1211; 46.3% identity (66.7% similar) in 490 aa overlap (14-501:45-422)
10 20 30 40
pF1KB4 MGKPARKGCEWKRFLKNNWVLLSTVAAVVLGITTGVLVREHSN
...: .::: ::.::..: : .: .
CCDS78 MERFQQGVRKRTLLAKKKVQNITKEDVKSYLFRNAFVLL-TVTAVIVGTILGFTLRPYR-
20 30 40 50 60 70
50 60 70 80 90 100
pF1KB4 LSTLEKFYFAFPGEILMRMLKLIILPLIISSMITGVAALDSNVSGKIGLRAVVYYFCTTL
.: : ::.::::.:::::....:::::::..::.:::::..:::.:.::::::. ::.
CCDS78 MSYREVKYFSFPGELLMRMLQMLVLPLIISSLVTGMAALDSKASGKMGMRAVVYYMTTTI
80 90 100 110 120 130
110 120 130 140 150 160
pF1KB4 IAVILGIVLVVSIKPGVTQKVGEIARTGSTPEVSTVDAMLDLIRNMFPENLVQACFQQYK
:::..::..:. :.:: : . . : :. .:...::.:::::
CCDS78 IAVVIGIIIVIIIHPGKGTKEN-MHREGKIVRVTAADAFLDLIR----------------
140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB4 TKREEVKPPSDPEMNMTEESFTAVMTTAISKNKTKEYKIVGMYSDGINVLGLIVFCLVFG
CCDS78 ------------------------------------------------------------
230 240 250 260 270 280
pF1KB4 LVIGKMGEKGQILVDFFNALSDATMKIVQIIMCYMPLGILFLIAGKIIEVEDWEIFR-KL
: :.::::::::::.:.:: .. .:
CCDS78 ---------------------------------YAPVGILFLIAGKIVEMEDMGVIGGQL
180 190 200
290 300 310 320 330 340
pF1KB4 GLYMATVLTGLAIHSIVILPLIYFIVVRKNPFRFAMGMAQALLTALMISSSSATLPVTFR
..: .::..:: ::....:::.::.:.::::. : :. :::.::: ::::::::.::.
CCDS78 AMYTVTVIVGLLIHAVIVLPLLYFLVTRKNPWVFIGGLLQALITALGTSSSSATLPITFK
210 220 230 240 250 260
350 360 370 380 390 400
pF1KB4 CAEENNQVDKRITRFVLPVGATINMDGTALYEAVAAVFIAQLNDLDLGIGQIITISITAT
: :::: ::::.:::::::::::::::::::::.::.::::.:...:..:::::::::::
CCDS78 CLEENNGVDKRVTRFVLPVGATINMDGTALYEALAAIFIAQVNNFELNFGQIITISITAT
270 280 290 300 310 320
410 420 430 440 450 460
pF1KB4 SASIGAAGVPQAGLVTMVIVLSAVGLPAEDVTLIIAVDWLLDRFRTMVNVLGDAFGTGIV
.:::::::.::::::::::::..::::..:.::::::::.:::.:: .:::::..:.:::
CCDS78 AASIGAAGIPQAGLVTMVIVLTSVGLPTDDITLIIAVDWFLDRLRTTTNVLGDSLGAGIV
330 340 350 360 370 380
470 480 490 500 510 520
pF1KB4 EKLSKKELEQMDVSSEVNIVNPFALESTI-LDNEDSDTKKSYVNGGFAVDKSDTISFTQT
:.::..::.. :: .... ... : .:..:.:
CCDS78 EHLSRHELKNRDVEMGNSVIEENEMKKPYQLIAQDNETEKPIDSETKM
390 400 410 420 430
pF1KB4 SQF
524 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 23:00:42 2016 done: Fri Nov 4 23:00:42 2016
Total Scan time: 2.930 Total Display time: 0.080
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]