Result of FASTA (omim) for
pF1KB4113
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4113, 524 aa
1>>>pF1KB4113 524 - 524 aa - 524 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1098+/-0.000519; mu= 19.2517+/- 0.032
mean_var=68.1152+/-13.985, 0's: 0 Z-trim(107.4): 50 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.155400
statistics sampled from 15424 (15474) to 15424 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.517), E-opt: 0.2 (0.181), width: 16
Scan time: 7.840
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_004161 (OMIM: 133550,615232) excitatory amino a ( 524) 3291 747.7 1.9e-215
XP_011516310 (OMIM: 133550,615232) PREDICTED: exci ( 527) 3089 702.4 8.4e-202
XP_011516309 (OMIM: 133550,615232) PREDICTED: exci ( 547) 3089 702.4 8.7e-202
XP_011516311 (OMIM: 133550,615232) PREDICTED: exci ( 504) 3084 701.3 1.8e-201
XP_011516312 (OMIM: 133550,615232) PREDICTED: exci ( 477) 2807 639.2 8.4e-183
NP_004163 (OMIM: 600111,612656) excitatory amino a ( 542) 1702 391.5 3.5e-108
XP_005248399 (OMIM: 600111,612656) PREDICTED: exci ( 542) 1702 391.5 3.5e-108
XP_016873627 (OMIM: 600300,617105) PREDICTED: exci ( 565) 1650 379.8 1.2e-104
NP_001182657 (OMIM: 600300,617105) excitatory amin ( 565) 1650 379.8 1.2e-104
NP_001239581 (OMIM: 600300,617105) excitatory amin ( 565) 1650 379.8 1.2e-104
XP_016873626 (OMIM: 600300,617105) PREDICTED: exci ( 565) 1650 379.8 1.2e-104
XP_011518587 (OMIM: 600300,617105) PREDICTED: exci ( 570) 1650 379.8 1.2e-104
XP_005253124 (OMIM: 600300,617105) PREDICTED: exci ( 571) 1650 379.8 1.2e-104
NP_004162 (OMIM: 600300,617105) excitatory amino a ( 574) 1650 379.8 1.2e-104
XP_016873625 (OMIM: 600300,617105) PREDICTED: exci ( 579) 1650 379.8 1.2e-104
XP_016870532 (OMIM: 133550,615232) PREDICTED: exci ( 488) 1629 375.1 2.7e-103
NP_001276868 (OMIM: 600111,612656) excitatory amin ( 496) 1525 351.8 2.9e-96
XP_011512386 (OMIM: 600111,612656) PREDICTED: exci ( 435) 1500 346.1 1.3e-94
XP_016870531 (OMIM: 133550,615232) PREDICTED: exci ( 511) 1460 337.2 7.1e-92
NP_001160167 (OMIM: 600111,612656) excitatory amin ( 497) 1317 305.1 3.1e-82
XP_006722907 (OMIM: 600637) PREDICTED: excitatory ( 564) 1158 269.5 1.9e-71
XP_006722905 (OMIM: 600637) PREDICTED: excitatory ( 564) 1158 269.5 1.9e-71
XP_016882641 (OMIM: 600637) PREDICTED: excitatory ( 564) 1158 269.5 1.9e-71
NP_005062 (OMIM: 600637) excitatory amino acid tra ( 564) 1158 269.5 1.9e-71
NP_001274526 (OMIM: 604471) excitatory amino acid ( 472) 1126 262.3 2.3e-69
NP_006662 (OMIM: 604471) excitatory amino acid tra ( 560) 1118 260.5 9.3e-69
NP_001276869 (OMIM: 600111,612656) excitatory amin ( 430) 1019 238.3 3.6e-62
NP_003029 (OMIM: 600229,616657) neutral amino acid ( 532) 984 230.5 9.8e-60
NP_005619 (OMIM: 109190) neutral amino acid transp ( 541) 970 227.4 8.8e-59
NP_001138617 (OMIM: 109190) neutral amino acid tra ( 339) 957 224.3 4.6e-58
XP_006712142 (OMIM: 600229,616657) PREDICTED: neut ( 312) 954 223.6 6.8e-58
NP_001138616 (OMIM: 109190) neutral amino acid tra ( 313) 938 220.0 8.2e-57
XP_005259224 (OMIM: 109190) PREDICTED: neutral ami ( 469) 901 211.8 3.6e-54
XP_011540304 (OMIM: 604471) PREDICTED: excitatory ( 337) 691 164.7 4.1e-40
NP_001274524 (OMIM: 604471) excitatory amino acid ( 619) 691 164.8 6.6e-40
XP_016873628 (OMIM: 600300,617105) PREDICTED: exci ( 496) 671 160.3 1.2e-38
NP_001180422 (OMIM: 600229,616657) neutral amino a ( 234) 589 141.7 2.3e-33
NP_001259016 (OMIM: 600637) excitatory amino acid ( 312) 518 125.9 1.8e-28
NP_001259017 (OMIM: 600637) excitatory amino acid ( 312) 518 125.9 1.8e-28
NP_001274525 (OMIM: 604471) excitatory amino acid ( 158) 360 90.2 4.9e-18
>>NP_004161 (OMIM: 133550,615232) excitatory amino acid (524 aa)
initn: 3291 init1: 3291 opt: 3291 Z-score: 3988.8 bits: 747.7 E(85289): 1.9e-215
Smith-Waterman score: 3291; 100.0% identity (100.0% similar) in 524 aa overlap (1-524:1-524)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MGKPARKGCEWKRFLKNNWVLLSTVAAVVLGITTGVLVREHSNLSTLEKFYFAFPGEILM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 MGKPARKGCEWKRFLKNNWVLLSTVAAVVLGITTGVLVREHSNLSTLEKFYFAFPGEILM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 RMLKLIILPLIISSMITGVAALDSNVSGKIGLRAVVYYFCTTLIAVILGIVLVVSIKPGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 RMLKLIILPLIISSMITGVAALDSNVSGKIGLRAVVYYFCTTLIAVILGIVLVVSIKPGV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 TQKVGEIARTGSTPEVSTVDAMLDLIRNMFPENLVQACFQQYKTKREEVKPPSDPEMNMT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 TQKVGEIARTGSTPEVSTVDAMLDLIRNMFPENLVQACFQQYKTKREEVKPPSDPEMNMT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 EESFTAVMTTAISKNKTKEYKIVGMYSDGINVLGLIVFCLVFGLVIGKMGEKGQILVDFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 EESFTAVMTTAISKNKTKEYKIVGMYSDGINVLGLIVFCLVFGLVIGKMGEKGQILVDFF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 NALSDATMKIVQIIMCYMPLGILFLIAGKIIEVEDWEIFRKLGLYMATVLTGLAIHSIVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 NALSDATMKIVQIIMCYMPLGILFLIAGKIIEVEDWEIFRKLGLYMATVLTGLAIHSIVI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 LPLIYFIVVRKNPFRFAMGMAQALLTALMISSSSATLPVTFRCAEENNQVDKRITRFVLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 LPLIYFIVVRKNPFRFAMGMAQALLTALMISSSSATLPVTFRCAEENNQVDKRITRFVLP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 VGATINMDGTALYEAVAAVFIAQLNDLDLGIGQIITISITATSASIGAAGVPQAGLVTMV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 VGATINMDGTALYEAVAAVFIAQLNDLDLGIGQIITISITATSASIGAAGVPQAGLVTMV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 IVLSAVGLPAEDVTLIIAVDWLLDRFRTMVNVLGDAFGTGIVEKLSKKELEQMDVSSEVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 IVLSAVGLPAEDVTLIIAVDWLLDRFRTMVNVLGDAFGTGIVEKLSKKELEQMDVSSEVN
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520
pF1KB4 IVNPFALESTILDNEDSDTKKSYVNGGFAVDKSDTISFTQTSQF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 IVNPFALESTILDNEDSDTKKSYVNGGFAVDKSDTISFTQTSQF
490 500 510 520
>>XP_011516310 (OMIM: 133550,615232) PREDICTED: excitato (527 aa)
initn: 3087 init1: 3087 opt: 3089 Z-score: 3744.0 bits: 702.4 E(85289): 8.4e-202
Smith-Waterman score: 3089; 99.0% identity (99.2% similar) in 503 aa overlap (22-524:26-527)
10 20 30 40 50
pF1KB4 MGKPARKGCEWKRFLKNNWVLLSTVAAVVLGITTGVLVREHSNLSTLEKFYFAFPG
:: :. : ::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MTARRKFACRDCKPHGDPDHMSSTELSKVV-VCTGITTGVLVREHSNLSTLEKFYFAFPG
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB4 EILMRMLKLIILPLIISSMITGVAALDSNVSGKIGLRAVVYYFCTTLIAVILGIVLVVSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EILMRMLKLIILPLIISSMITGVAALDSNVSGKIGLRAVVYYFCTTLIAVILGIVLVVSI
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB4 KPGVTQKVGEIARTGSTPEVSTVDAMLDLIRNMFPENLVQACFQQYKTKREEVKPPSDPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KPGVTQKVGEIARTGSTPEVSTVDAMLDLIRNMFPENLVQACFQQYKTKREEVKPPSDPE
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB4 MNMTEESFTAVMTTAISKNKTKEYKIVGMYSDGINVLGLIVFCLVFGLVIGKMGEKGQIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MNMTEESFTAVMTTAISKNKTKEYKIVGMYSDGINVLGLIVFCLVFGLVIGKMGEKGQIL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 VDFFNALSDATMKIVQIIMCYMPLGILFLIAGKIIEVEDWEIFRKLGLYMATVLTGLAIH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VDFFNALSDATMKIVQIIMCYMPLGILFLIAGKIIEVEDWEIFRKLGLYMATVLTGLAIH
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB4 SIVILPLIYFIVVRKNPFRFAMGMAQALLTALMISSSSATLPVTFRCAEENNQVDKRITR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SIVILPLIYFIVVRKNPFRFAMGMAQALLTALMISSSSATLPVTFRCAEENNQVDKRITR
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB4 FVLPVGATINMDGTALYEAVAAVFIAQLNDLDLGIGQIITISITATSASIGAAGVPQAGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FVLPVGATINMDGTALYEAVAAVFIAQLNDLDLGIGQIITISITATSASIGAAGVPQAGL
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB4 VTMVIVLSAVGLPAEDVTLIIAVDWLLDRFRTMVNVLGDAFGTGIVEKLSKKELEQMDVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VTMVIVLSAVGLPAEDVTLIIAVDWLLDRFRTMVNVLGDAFGTGIVEKLSKKELEQMDVS
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520
pF1KB4 SEVNIVNPFALESTILDNEDSDTKKSYVNGGFAVDKSDTISFTQTSQF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SEVNIVNPFALESTILDNEDSDTKKSYVNGGFAVDKSDTISFTQTSQF
480 490 500 510 520
>>XP_011516309 (OMIM: 133550,615232) PREDICTED: excitato (547 aa)
initn: 3087 init1: 3087 opt: 3089 Z-score: 3743.7 bits: 702.4 E(85289): 8.7e-202
Smith-Waterman score: 3235; 95.8% identity (95.8% similar) in 547 aa overlap (1-524:1-547)
10 20 30
pF1KB4 MGKPARKGCEWKRFLKNNWVLLSTVAAVVL-----------------------GITTGVL
:::::::::::::::::::::::::::::: :::::::
XP_011 MGKPARKGCEWKRFLKNNWVLLSTVAAVVLDCKPHGDPDHMSSTELSKVVVCTGITTGVL
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB4 VREHSNLSTLEKFYFAFPGEILMRMLKLIILPLIISSMITGVAALDSNVSGKIGLRAVVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VREHSNLSTLEKFYFAFPGEILMRMLKLIILPLIISSMITGVAALDSNVSGKIGLRAVVY
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB4 YFCTTLIAVILGIVLVVSIKPGVTQKVGEIARTGSTPEVSTVDAMLDLIRNMFPENLVQA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 YFCTTLIAVILGIVLVVSIKPGVTQKVGEIARTGSTPEVSTVDAMLDLIRNMFPENLVQA
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB4 CFQQYKTKREEVKPPSDPEMNMTEESFTAVMTTAISKNKTKEYKIVGMYSDGINVLGLIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 CFQQYKTKREEVKPPSDPEMNMTEESFTAVMTTAISKNKTKEYKIVGMYSDGINVLGLIV
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KB4 FCLVFGLVIGKMGEKGQILVDFFNALSDATMKIVQIIMCYMPLGILFLIAGKIIEVEDWE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FCLVFGLVIGKMGEKGQILVDFFNALSDATMKIVQIIMCYMPLGILFLIAGKIIEVEDWE
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KB4 IFRKLGLYMATVLTGLAIHSIVILPLIYFIVVRKNPFRFAMGMAQALLTALMISSSSATL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 IFRKLGLYMATVLTGLAIHSIVILPLIYFIVVRKNPFRFAMGMAQALLTALMISSSSATL
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KB4 PVTFRCAEENNQVDKRITRFVLPVGATINMDGTALYEAVAAVFIAQLNDLDLGIGQIITI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PVTFRCAEENNQVDKRITRFVLPVGATINMDGTALYEAVAAVFIAQLNDLDLGIGQIITI
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KB4 SITATSASIGAAGVPQAGLVTMVIVLSAVGLPAEDVTLIIAVDWLLDRFRTMVNVLGDAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SITATSASIGAAGVPQAGLVTMVIVLSAVGLPAEDVTLIIAVDWLLDRFRTMVNVLGDAF
430 440 450 460 470 480
460 470 480 490 500 510
pF1KB4 GTGIVEKLSKKELEQMDVSSEVNIVNPFALESTILDNEDSDTKKSYVNGGFAVDKSDTIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GTGIVEKLSKKELEQMDVSSEVNIVNPFALESTILDNEDSDTKKSYVNGGFAVDKSDTIS
490 500 510 520 530 540
520
pF1KB4 FTQTSQF
:::::::
XP_011 FTQTSQF
>>XP_011516311 (OMIM: 133550,615232) PREDICTED: excitato (504 aa)
initn: 3084 init1: 3084 opt: 3084 Z-score: 3738.2 bits: 701.3 E(85289): 1.8e-201
Smith-Waterman score: 3084; 100.0% identity (100.0% similar) in 494 aa overlap (31-524:11-504)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MGKPARKGCEWKRFLKNNWVLLSTVAAVVLGITTGVLVREHSNLSTLEKFYFAFPGEILM
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MTARRKFACRGITTGVLVREHSNLSTLEKFYFAFPGEILM
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 RMLKLIILPLIISSMITGVAALDSNVSGKIGLRAVVYYFCTTLIAVILGIVLVVSIKPGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RMLKLIILPLIISSMITGVAALDSNVSGKIGLRAVVYYFCTTLIAVILGIVLVVSIKPGV
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 TQKVGEIARTGSTPEVSTVDAMLDLIRNMFPENLVQACFQQYKTKREEVKPPSDPEMNMT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TQKVGEIARTGSTPEVSTVDAMLDLIRNMFPENLVQACFQQYKTKREEVKPPSDPEMNMT
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 EESFTAVMTTAISKNKTKEYKIVGMYSDGINVLGLIVFCLVFGLVIGKMGEKGQILVDFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EESFTAVMTTAISKNKTKEYKIVGMYSDGINVLGLIVFCLVFGLVIGKMGEKGQILVDFF
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 NALSDATMKIVQIIMCYMPLGILFLIAGKIIEVEDWEIFRKLGLYMATVLTGLAIHSIVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NALSDATMKIVQIIMCYMPLGILFLIAGKIIEVEDWEIFRKLGLYMATVLTGLAIHSIVI
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 LPLIYFIVVRKNPFRFAMGMAQALLTALMISSSSATLPVTFRCAEENNQVDKRITRFVLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LPLIYFIVVRKNPFRFAMGMAQALLTALMISSSSATLPVTFRCAEENNQVDKRITRFVLP
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 VGATINMDGTALYEAVAAVFIAQLNDLDLGIGQIITISITATSASIGAAGVPQAGLVTMV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VGATINMDGTALYEAVAAVFIAQLNDLDLGIGQIITISITATSASIGAAGVPQAGLVTMV
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 IVLSAVGLPAEDVTLIIAVDWLLDRFRTMVNVLGDAFGTGIVEKLSKKELEQMDVSSEVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 IVLSAVGLPAEDVTLIIAVDWLLDRFRTMVNVLGDAFGTGIVEKLSKKELEQMDVSSEVN
410 420 430 440 450 460
490 500 510 520
pF1KB4 IVNPFALESTILDNEDSDTKKSYVNGGFAVDKSDTISFTQTSQF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 IVNPFALESTILDNEDSDTKKSYVNGGFAVDKSDTISFTQTSQF
470 480 490 500
>>XP_011516312 (OMIM: 133550,615232) PREDICTED: excitato (477 aa)
initn: 2806 init1: 2806 opt: 2807 Z-score: 3402.9 bits: 639.2 E(85289): 8.4e-183
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10 20 30 40 50 60
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:::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TQKVGEIARTGSTPEVSTVDAMLDLIRNMFPENLVQACFQQYKTKREEVKPPSDPEMNMT
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LPLIYFIVVRKNPFRFAMGMAQALLTALMISSSSATLPVTFRCAEENNQVDKRITRFVLP
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VGATINMDGTALYEAVAAVFIAQLNDLDLGIGQIITISITATSASIGAAGVPQAGLVTMV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 IVNPFALESTILDNEDSDTKKSYVNGGFAVDKSDTISFTQTSQF
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>>NP_004163 (OMIM: 600111,612656) excitatory amino acid (542 aa)
initn: 1656 init1: 916 opt: 1702 Z-score: 2063.2 bits: 391.5 E(85289): 3.5e-108
Smith-Waterman score: 1702; 55.2% identity (82.2% similar) in 493 aa overlap (14-501:45-534)
10 20 30 40
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...: .::: ::.::..: : .: .
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.: : ::.::::.:::::....:::::::..::.:::::..:::.:.::::::. ::.
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:::..::..:. :.:: : . . : :. .:...::.::::::::: :::.:::.:.:
NP_004 IAVVIGIIIVIIIHPGKGTKEN-MHREGKIVRVTAADAFLDLIRNMFPPNLVEACFKQFK
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pF1KB4 TKREE--VKPPSDPEMNMTEESFTAVMTTAISKNK-TKEYKIVGMYSDGINVLGLIVFCL
:. :. : : . . ... .. : . . .. :.: : .:.:.:::.:: .
NP_004 TNYEKRSFKVPIQANETLVGAVINNVSEAMETLTRITEELVPVPGSVNGVNALGLVVFSM
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230 240 250 260 270 280
pF1KB4 VFGLVIGKMGEKGQILVDFFNALSDATMKIVQIIMCYMPLGILFLIAGKIIEVEDWEIFR
::.:::.: :.:: : .::..:..: :..: .:: : :.::::::::::.:.:: ..
NP_004 CFGFVIGNMKEQGQALREFFDSLNEAIMRLVAVIMWYAPVGILFLIAGKIVEMEDMGVIG
260 270 280 290 300 310
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pF1KB4 -KLGLYMATVLTGLAIHSIVILPLIYFIVVRKNPFRFAMGMAQALLTALMISSSSATLPV
.:..: .::..:: ::....:::.::.:.::::. : :. :::.::: ::::::::.
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340 350 360 370 380 390
pF1KB4 TFRCAEENNQVDKRITRFVLPVGATINMDGTALYEAVAAVFIAQLNDLDLGIGQIITISI
::.: :::: ::::.:::::::::::::::::::::.::.::::.:...:..::::::::
NP_004 TFKCLEENNGVDKRVTRFVLPVGATINMDGTALYEALAAIFIAQVNNFELNFGQIITISI
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pF1KB4 TATSASIGAAGVPQAGLVTMVIVLSAVGLPAEDVTLIIAVDWLLDRFRTMVNVLGDAFGT
:::.:::::::.::::::::::::..::::..:.::::::::.:::.:: .:::::..:.
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pF1KB4 GIVEKLSKKELEQMDVSSEVNIVNPFALESTI-LDNEDSDTKKSYVNGGFAVDKSDTISF
::::.::..::.. :: .... ... : .:..:.:
NP_004 GIVEHLSRHELKNRDVEMGNSVIEENEMKKPYQLIAQDNETEKPIDSETKM
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520
pF1KB4 TQTSQF
>>XP_005248399 (OMIM: 600111,612656) PREDICTED: excitato (542 aa)
initn: 1656 init1: 916 opt: 1702 Z-score: 2063.2 bits: 391.5 E(85289): 3.5e-108
Smith-Waterman score: 1702; 55.2% identity (82.2% similar) in 493 aa overlap (14-501:45-534)
10 20 30 40
pF1KB4 MGKPARKGCEWKRFLKNNWVLLSTVAAVVLGITTGVLVREHSN
...: .::: ::.::..: : .: .
XP_005 MERFQQGVRKRTLLAKKKVQNITKEDVKSYLFRNAFVLL-TVTAVIVGTILGFTLRPYR-
20 30 40 50 60 70
50 60 70 80 90 100
pF1KB4 LSTLEKFYFAFPGEILMRMLKLIILPLIISSMITGVAALDSNVSGKIGLRAVVYYFCTTL
.: : ::.::::.:::::....:::::::..::.:::::..:::.:.::::::. ::.
XP_005 MSYREVKYFSFPGELLMRMLQMLVLPLIISSLVTGMAALDSKASGKMGMRAVVYYMTTTI
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110 120 130 140 150 160
pF1KB4 IAVILGIVLVVSIKPGVTQKVGEIARTGSTPEVSTVDAMLDLIRNMFPENLVQACFQQYK
:::..::..:. :.:: : . . : :. .:...::.::::::::: :::.:::.:.:
XP_005 IAVVIGIIIVIIIHPGKGTKEN-MHREGKIVRVTAADAFLDLIRNMFPPNLVEACFKQFK
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170 180 190 200 210 220
pF1KB4 TKREE--VKPPSDPEMNMTEESFTAVMTTAISKNK-TKEYKIVGMYSDGINVLGLIVFCL
:. :. : : . . ... .. : . . .. :.: : .:.:.:::.:: .
XP_005 TNYEKRSFKVPIQANETLVGAVINNVSEAMETLTRITEELVPVPGSVNGVNALGLVVFSM
200 210 220 230 240 250
230 240 250 260 270 280
pF1KB4 VFGLVIGKMGEKGQILVDFFNALSDATMKIVQIIMCYMPLGILFLIAGKIIEVEDWEIFR
::.:::.: :.:: : .::..:..: :..: .:: : :.::::::::::.:.:: ..
XP_005 CFGFVIGNMKEQGQALREFFDSLNEAIMRLVAVIMWYAPVGILFLIAGKIVEMEDMGVIG
260 270 280 290 300 310
290 300 310 320 330
pF1KB4 -KLGLYMATVLTGLAIHSIVILPLIYFIVVRKNPFRFAMGMAQALLTALMISSSSATLPV
.:..: .::..:: ::....:::.::.:.::::. : :. :::.::: ::::::::.
XP_005 GQLAMYTVTVIVGLLIHAVIVLPLLYFLVTRKNPWVFIGGLLQALITALGTSSSSATLPI
320 330 340 350 360 370
340 350 360 370 380 390
pF1KB4 TFRCAEENNQVDKRITRFVLPVGATINMDGTALYEAVAAVFIAQLNDLDLGIGQIITISI
::.: :::: ::::.:::::::::::::::::::::.::.::::.:...:..::::::::
XP_005 TFKCLEENNGVDKRVTRFVLPVGATINMDGTALYEALAAIFIAQVNNFELNFGQIITISI
380 390 400 410 420 430
400 410 420 430 440 450
pF1KB4 TATSASIGAAGVPQAGLVTMVIVLSAVGLPAEDVTLIIAVDWLLDRFRTMVNVLGDAFGT
:::.:::::::.::::::::::::..::::..:.::::::::.:::.:: .:::::..:.
XP_005 TATAASIGAAGIPQAGLVTMVIVLTSVGLPTDDITLIIAVDWFLDRLRTTTNVLGDSLGA
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460 470 480 490 500 510
pF1KB4 GIVEKLSKKELEQMDVSSEVNIVNPFALESTI-LDNEDSDTKKSYVNGGFAVDKSDTISF
::::.::..::.. :: .... ... : .:..:.:
XP_005 GIVEHLSRHELKNRDVEMGNSVIEENEMKKPYQLIAQDNETEKPIDSETKM
500 510 520 530 540
520
pF1KB4 TQTSQF
>>XP_016873627 (OMIM: 600300,617105) PREDICTED: excitato (565 aa)
initn: 1644 init1: 869 opt: 1650 Z-score: 2000.0 bits: 379.8 E(85289): 1.2e-104
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10 20 30 40
pF1KB4 MGKPARKGCEWKRFLKNNWVLLSTVAAVVLGITTGVLVREHSNL
: .: .: :: .:.:: . : :.: : .
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10 20 30 40 50 60
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pF1KB4 STLEKFYFAFPGEILMRMLKLIILPLIISSMITGVAALDSNVSGKIGLRAVVYYFCTTLI
. .::::.:::::::..::::::::.:::...::...::..: ::.:::. ::.:
XP_016 HPDVVMLIAFPGDILMRMLKMLILPLIISSLITGLSGLDAKASGRLGTRAMVYYMSTTII
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pF1KB4 AVILGIVLVVSIKPGVTQKVGEIARTGSTPEVSTVDAMLDLIRNMFPENLVQACFQQYKT
:..::..::..:.:: . ... .. :::..::.::::::.:::::::::::: .:
XP_016 AAVLGVILVLAIHPGNPKLKKQLGPGKKNDEVSSLDAFLDLIRNLFPENLVQACFQQIQT
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pF1KB4 --KREEVKPPSDPEMNMTEESFTAVMTTAISKNKTKEYKIV---GM-YSDGINVLGLIVF
:. : :: : : : : . ..... .... .: :.: :. ..::.:::::: :
XP_016 VTKKVLVAPPPDEEANATS-AVVSLLNETVTEVP-EETKMVIKKGLEFKDGMNVLGLIGF
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pF1KB4 CLVFGLVIGKMGEKGQILVDFFNALSDATMKIVQIIMCYMPLGILFLIAGKIIEVEDWEI
..::...::::......::::: :.. .::.: .:: : :::: :: :::: ..: :.
XP_016 FIAFGIAMGKMGDQAKLMVDFFNILNEIVMKLVIMIMWYSPLGIACLICGKIIAIKDLEV
240 250 260 270 280 290
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pF1KB4 F-RKLGLYMATVLTGLAIHSIVILPLIYFIVVRKNPFRFAMGMAQALLTALMISSSSATL
:.::.::.::. :: ::. ..::::::.:.::::: : :. :: .::: .::..::
XP_016 VARQLGMYMVTVIIGLIIHGGIFLPLIYFVVTRKNPFSFFAGIFQAWITALGTASSAGTL
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pF1KB4 PVTFRCAEENNQVDKRITRFVLPVGATINMDGTALYEAVAAVFIAQLNDLDLGIGQIITI
:::::: ::: .:::.::::::::::::::::::::::::.::::.: . : :::.:.
XP_016 PVTFRCLEENLGIDKRVTRFVLPVGATINMDGTALYEAVAAIFIAQMNGVVLDGGQIVTV
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pF1KB4 SITATSASIGAAGVPQAGLVTMVIVLSAVGLPAEDVTLIIAVDWLLDRFRTMVNVLGDAF
:.::: ::.:::..:.::::::...:.:::::.::..:..::::::::.:: :::.::.:
XP_016 SLTATLASVGAASIPSAGLVTMLLILTAVGLPTEDISLLVAVDWLLDRMRTSVNVVGDSF
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pF1KB4 GTGIVEKLSKKELEQMDVSSEVNIVNPFALESTILDNEDSDTKKSYVNGGFAVDKSDTIS
:.::: .:::.::. .: . .:.
XP_016 GAGIVYHLSKSELDTIDSQHRVHEDIEMTKTQSIYDDMKNHRESNSNQCVYAAHNSVIVD
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>>NP_001182657 (OMIM: 600300,617105) excitatory amino ac (565 aa)
initn: 1644 init1: 869 opt: 1650 Z-score: 2000.0 bits: 379.8 E(85289): 1.2e-104
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10 20 30 40
pF1KB4 MGKPARKGCEWKRFLKNNWVLLSTVAAVVLGITTGVLVREHSNL
: .: .: :: .:.:: . : :.: : .
NP_001 PKQVEVRMHDSHLGSEEPKHRHLGLRLCDKLGKNLLLTLTVFGVILGAVCGGLLRLASPI
10 20 30 40 50 60
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. .::::.:::::::..::::::::.:::...::...::..: ::.:::. ::.:
NP_001 HPDVVMLIAFPGDILMRMLKMLILPLIISSLITGLSGLDAKASGRLGTRAMVYYMSTTII
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pF1KB4 AVILGIVLVVSIKPGVTQKVGEIARTGSTPEVSTVDAMLDLIRNMFPENLVQACFQQYKT
:..::..::..:.:: . ... .. :::..::.::::::.:::::::::::: .:
NP_001 AAVLGVILVLAIHPGNPKLKKQLGPGKKNDEVSSLDAFLDLIRNLFPENLVQACFQQIQT
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pF1KB4 --KREEVKPPSDPEMNMTEESFTAVMTTAISKNKTKEYKIV---GM-YSDGINVLGLIVF
:. : :: : : : : . ..... .... .: :.: :. ..::.:::::: :
NP_001 VTKKVLVAPPPDEEANATS-AVVSLLNETVTEVP-EETKMVIKKGLEFKDGMNVLGLIGF
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pF1KB4 CLVFGLVIGKMGEKGQILVDFFNALSDATMKIVQIIMCYMPLGILFLIAGKIIEVEDWEI
..::...::::......::::: :.. .::.: .:: : :::: :: :::: ..: :.
NP_001 FIAFGIAMGKMGDQAKLMVDFFNILNEIVMKLVIMIMWYSPLGIACLICGKIIAIKDLEV
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pF1KB4 F-RKLGLYMATVLTGLAIHSIVILPLIYFIVVRKNPFRFAMGMAQALLTALMISSSSATL
:.::.::.::. :: ::. ..::::::.:.::::: : :. :: .::: .::..::
NP_001 VARQLGMYMVTVIIGLIIHGGIFLPLIYFVVTRKNPFSFFAGIFQAWITALGTASSAGTL
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340 350 360 370 380 390
pF1KB4 PVTFRCAEENNQVDKRITRFVLPVGATINMDGTALYEAVAAVFIAQLNDLDLGIGQIITI
:::::: ::: .:::.::::::::::::::::::::::::.::::.: . : :::.:.
NP_001 PVTFRCLEENLGIDKRVTRFVLPVGATINMDGTALYEAVAAIFIAQMNGVVLDGGQIVTV
360 370 380 390 400 410
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pF1KB4 SITATSASIGAAGVPQAGLVTMVIVLSAVGLPAEDVTLIIAVDWLLDRFRTMVNVLGDAF
:.::: ::.:::..:.::::::...:.:::::.::..:..::::::::.:: :::.::.:
NP_001 SLTATLASVGAASIPSAGLVTMLLILTAVGLPTEDISLLVAVDWLLDRMRTSVNVVGDSF
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500 510
pF1KB4 GTGIVEKLSKKELEQMDVSSEVNIVNPFALESTILDNEDSDTKKSYVNGGFAVDKSDTIS
:.::: .:::.::. .: . .:.
NP_001 GAGIVYHLSKSELDTIDSQHRVHEDIEMTKTQSIYDDMKNHRESNSNQCVYAAHNSVIVD
480 490 500 510 520 530
>>NP_001239581 (OMIM: 600300,617105) excitatory amino ac (565 aa)
initn: 1644 init1: 869 opt: 1650 Z-score: 2000.0 bits: 379.8 E(85289): 1.2e-104
Smith-Waterman score: 1650; 55.4% identity (81.6% similar) in 473 aa overlap (15-480:32-502)
10 20 30 40
pF1KB4 MGKPARKGCEWKRFLKNNWVLLSTVAAVVLGITTGVLVREHSNL
: .: .: :: .:.:: . : :.: : .
NP_001 PKQVEVRMHDSHLGSEEPKHRHLGLRLCDKLGKNLLLTLTVFGVILGAVCGGLLRLASPI
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB4 STLEKFYFAFPGEILMRMLKLIILPLIISSMITGVAALDSNVSGKIGLRAVVYYFCTTLI
. .::::.:::::::..::::::::.:::...::...::..: ::.:::. ::.:
NP_001 HPDVVMLIAFPGDILMRMLKMLILPLIISSLITGLSGLDAKASGRLGTRAMVYYMSTTII
70 80 90 100 110 120
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pF1KB4 AVILGIVLVVSIKPGVTQKVGEIARTGSTPEVSTVDAMLDLIRNMFPENLVQACFQQYKT
:..::..::..:.:: . ... .. :::..::.::::::.:::::::::::: .:
NP_001 AAVLGVILVLAIHPGNPKLKKQLGPGKKNDEVSSLDAFLDLIRNLFPENLVQACFQQIQT
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210
pF1KB4 --KREEVKPPSDPEMNMTEESFTAVMTTAISKNKTKEYKIV---GM-YSDGINVLGLIVF
:. : :: : : : : . ..... .... .: :.: :. ..::.:::::: :
NP_001 VTKKVLVAPPPDEEANATS-AVVSLLNETVTEVP-EETKMVIKKGLEFKDGMNVLGLIGF
190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KB4 CLVFGLVIGKMGEKGQILVDFFNALSDATMKIVQIIMCYMPLGILFLIAGKIIEVEDWEI
..::...::::......::::: :.. .::.: .:: : :::: :: :::: ..: :.
NP_001 FIAFGIAMGKMGDQAKLMVDFFNILNEIVMKLVIMIMWYSPLGIACLICGKIIAIKDLEV
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB4 F-RKLGLYMATVLTGLAIHSIVILPLIYFIVVRKNPFRFAMGMAQALLTALMISSSSATL
:.::.::.::. :: ::. ..::::::.:.::::: : :. :: .::: .::..::
NP_001 VARQLGMYMVTVIIGLIIHGGIFLPLIYFVVTRKNPFSFFAGIFQAWITALGTASSAGTL
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