FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB4115, 938 aa 1>>>pF1KB4115 938 - 938 aa - 938 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.6398+/-0.00103; mu= 11.3821+/- 0.062 mean_var=179.2705+/-36.458, 0's: 0 Z-trim(109.6): 80 B-trim: 9 in 1/49 Lambda= 0.095790 statistics sampled from 10947 (11025) to 10947 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.678), E-opt: 0.2 (0.339), width: 16 Scan time: 3.860 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS32704.1 DDX42 gene_id:11325|Hs108|chr17 ( 938) 6322 887.0 0 CCDS34240.1 DDX46 gene_id:9879|Hs108|chr5 (1031) 1363 201.7 5.9e-51 CCDS75306.1 DDX46 gene_id:9879|Hs108|chr5 (1032) 1363 201.7 5.9e-51 CCDS46706.1 DDX17 gene_id:10521|Hs108|chr22 ( 731) 1253 186.4 1.7e-46 CCDS33646.1 DDX17 gene_id:10521|Hs108|chr22 ( 729) 1245 185.3 3.7e-46 CCDS82190.1 DDX5 gene_id:1655|Hs108|chr17 ( 614) 1231 183.3 1.2e-45 CCDS11659.1 DDX5 gene_id:1655|Hs108|chr17 ( 614) 1231 183.3 1.2e-45 CCDS4977.1 DDX43 gene_id:55510|Hs108|chr6 ( 648) 1008 152.5 2.4e-36 CCDS35214.1 DDX53 gene_id:168400|Hs108|chrX ( 631) 978 148.3 4.3e-35 CCDS54855.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 575) 874 133.9 8.4e-31 CCDS47208.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 690) 874 134.0 9.6e-31 CCDS54854.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 704) 874 134.0 9.8e-31 CCDS3969.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 724) 874 134.0 1e-30 CCDS30964.1 DDX59 gene_id:83479|Hs108|chr1 ( 619) 823 126.9 1.2e-28 CCDS14782.1 DDX3Y gene_id:8653|Hs108|chrY ( 660) 770 119.6 2e-26 CCDS55404.1 DDX3X gene_id:1654|Hs108|chrX ( 646) 767 119.2 2.6e-26 CCDS43931.1 DDX3X gene_id:1654|Hs108|chrX ( 662) 767 119.2 2.6e-26 CCDS8655.1 DDX47 gene_id:51202|Hs108|chr12 ( 455) 759 118.0 4.3e-26 CCDS4427.1 DDX41 gene_id:51428|Hs108|chr5 ( 622) 737 115.0 4.5e-25 CCDS13416.1 DDX27 gene_id:55661|Hs108|chr20 ( 796) 720 112.8 2.7e-24 CCDS12390.1 DDX49 gene_id:54555|Hs108|chr19 ( 483) 687 108.0 4.5e-23 CCDS31907.1 DDX54 gene_id:79039|Hs108|chr12 ( 881) 690 108.7 5.2e-23 CCDS44984.1 DDX54 gene_id:79039|Hs108|chr12 ( 882) 690 108.7 5.2e-23 CCDS7283.1 DDX50 gene_id:79009|Hs108|chr10 ( 737) 667 105.4 4.1e-22 CCDS11767.1 EIF4A3 gene_id:9775|Hs108|chr17 ( 411) 662 104.5 4.3e-22 CCDS11323.1 DDX52 gene_id:11056|Hs108|chr17 ( 599) 634 100.8 8.4e-21 CCDS8342.1 DDX10 gene_id:1662|Hs108|chr11 ( 875) 636 101.2 9.1e-21 CCDS31211.1 DDX21 gene_id:9188|Hs108|chr10 ( 783) 629 100.2 1.6e-20 CCDS73144.1 DDX21 gene_id:9188|Hs108|chr10 ( 715) 626 99.7 2.1e-20 CCDS11113.1 EIF4A1 gene_id:1973|Hs108|chr17 ( 406) 621 98.8 2.2e-20 CCDS44751.1 DDX6 gene_id:1656|Hs108|chr11 ( 483) 621 98.9 2.5e-20 CCDS3282.1 EIF4A2 gene_id:1974|Hs108|chr3 ( 407) 609 97.2 6.9e-20 CCDS12308.1 DDX39A gene_id:10212|Hs108|chr19 ( 427) 579 93.1 1.3e-18 CCDS2120.1 DDX18 gene_id:8886|Hs108|chr2 ( 670) 582 93.6 1.3e-18 CCDS4697.1 DDX39B gene_id:7919|Hs108|chr6 ( 428) 578 92.9 1.4e-18 CCDS10889.1 DDX19A gene_id:55308|Hs108|chr16 ( 478) 553 89.5 1.7e-17 CCDS10888.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16 ( 479) 550 89.1 2.2e-17 CCDS8770.1 DDX23 gene_id:9416|Hs108|chr12 ( 820) 554 89.9 2.2e-17 CCDS42187.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16 ( 370) 521 85.0 3e-16 CCDS44766.1 DDX25 gene_id:29118|Hs108|chr11 ( 483) 519 84.8 4.3e-16 CCDS59053.1 DDX56 gene_id:54606|Hs108|chr7 ( 507) 514 84.1 7.3e-16 CCDS82009.1 DDX19A gene_id:55308|Hs108|chr16 ( 447) 498 81.9 3.1e-15 CCDS32475.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16 ( 448) 495 81.5 4.1e-15 CCDS58478.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16 ( 453) 495 81.5 4.1e-15 CCDS81646.1 DDX25 gene_id:29118|Hs108|chr11 ( 369) 477 78.9 2e-14 CCDS842.1 DDX20 gene_id:11218|Hs108|chr1 ( 824) 480 79.6 2.7e-14 CCDS58511.1 EIF4A1 gene_id:1973|Hs108|chr17 ( 347) 458 76.3 1.2e-13 CCDS5492.1 DDX56 gene_id:54606|Hs108|chr7 ( 547) 452 75.6 2.9e-13 CCDS6952.1 DDX31 gene_id:64794|Hs108|chr9 ( 585) 426 72.0 3.7e-12 >>CCDS32704.1 DDX42 gene_id:11325|Hs108|chr17 (938 aa) initn: 6322 init1: 6322 opt: 6322 Z-score: 4732.6 bits: 887.0 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 6322; 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CCDS34 IKKSSGFSGKGFKFDETEQALANERKKLQKAALGLQDSDDEDAAVDIDEQIESMFNSKKR 770 780 790 800 810 820 >>CCDS75306.1 DDX46 gene_id:9879|Hs108|chr5 (1032 aa) initn: 1294 init1: 561 opt: 1363 Z-score: 1028.3 bits: 201.7 E(32554): 5.9e-51 Smith-Waterman score: 1363; 40.3% identity (69.1% similar) in 583 aa overlap (94-661:207-779) 70 80 90 100 110 120 pF1KB4 SKRANFDEENAYFEDEEEDSSNVDLPYIPAENSPTRQQFHSKPVDSDSDDDPLEAFMAEV :..:.. . ... .... . :::.:.: :: CCDS75 KAMENIGELKKEIEEMKQGKKWSLEDDDDDEDDPAEAEKEGNEMEGE-ELDPLDAYMEEV 180 190 200 210 220 230 130 140 150 160 170 180 pF1KB4 EDQAAR-DMKRLEEKD-KERKNVKGIRDDIEEEDDQEAYFRYMAENPTAGVVQEEEEDNL .... . .:. .. .:.:. . . ..: . . : ..:...: . CCDS75 KEEVKKFNMRSVKGGGGNEKKSGPTVTKVVTVVTTKKAV---VDSDKKKGELMENDQDAM 240 250 260 270 280 290 190 200 210 220 230 pF1KB4 EYDSDGNPI----APT---KKIIDPLPPIDHSEIDYPPFEKNFYNEHEEITNLTPQQLID ::.:. . . : : : : :.::..:.: ::.:::: : :..... ... CCDS75 EYSSEEEEVDLQTALTGYQTKQRKLLEPVDHGKIEYEPFRKNFYVEVPELAKMSQEEVNV 300 310 320 330 340 350 240 250 260 270 280 290 pF1KB4 LRHKLN-LRVSGAAPPRPGSSFAHFGFDEQLMHQIRKSEYTQPTPIQCQGVPVALSGRDM .: ... . :.: . :.: .:... :.. .......: : .::::: :..:. .::::. CCDS75 FRLEMEGITVKGKGCPKPIKSWVQCGISMKILNSLKKHGYEKPTPIQTQAIPAIMSGRDL 360 370 380 390 400 410 300 310 320 330 340 350 pF1KB4 IGIAKTGSGKTAAFIWPMLIHIMDQKELEPGDGPIAVIVCPTRELCQQIHAECKRFGKAY ::::::::::: ::. ::. :::::. :: :.::::::. ::::: :: :::.:.:. CCDS75 IGIAKTGSGKTIAFLLPMFRHIMDQRSLEEGEGPIAVIMTPTRELALQITKECKKFSKTL 420 430 440 450 460 470 360 370 380 390 400 410 pF1KB4 NLRSVAVYGGGSMWEQAKALQEGAEIVVCTPGRLIDHVKK---KATNLQRVSYLVFDEAD .:: : :::: .. :: :..::::.::::::.:: . ..:::.::.:.:.:::: CCDS75 GLRVVCVYGGTGISEQIAELKRGAEIIVCTPGRMIDMLAANSGRVTNLRRVTYVVLDEAD 480 490 500 510 520 530 420 430 440 450 460 470 pF1KB4 RMFDMGFEYQVRSIASHVRPDRQTLLFSATFRKKIEKLARDILIDPIRVVQGDIGEANED :::::::: :: :...:::::::..::::: . .: ::: :: ::.: : . . : CCDS75 RMFDMGFEPQVMRIVDNVRPDRQTVMFSATFPRAMEALARRILSKPIEVQVGGRSVVCSD 540 550 560 570 580 590 480 490 500 510 520 530 pF1KB4 VTQIVEILHSGPSKWNWLTRRLVEFTSSGSVLLFVTKKANAEELANNLKQEGHNLGLLHG : : : ... .:. : . : .. ::::..:: :. .:. : ..: . .. ::: CCDS75 VEQQVIVIEE-EKKFLKLLELLGHYQESGSVIIFVDKQEHADGLLKDLMRASYPCMSLHG 600 610 620 630 640 650 540 550 560 570 580 590 pF1KB4 DMDQSERNKVISDFKKKDIPVLVATDVAARGLDIPSIKTVINYDVARDIDTHTHRIGRTG .:: .:...:.:::. .::::.:::::::. . :.::. . ..:: :::: CCDS75 GIDQYDRDSIINDFKNGTCKLLVATSVAARGLDVKHLILVVNYSCPNHYEDYVHRAGRTG 660 670 680 690 700 710 600 610 620 630 640 pF1KB4 RAGEKGVAYTLLTPKDSNFAGDLVRNLEGANQHVSKELLDLAMQNAW--FRKSRFKGGKG :::.:: :::..: .. .:::... :: .. : .: : : :. .. :: CCDS75 RAGNKGYAYTFITEDQARYAGDIIKALELSGTAVPPDLEKL-----WSDFKDQQKAEGKI 720 730 740 750 760 650 660 670 680 690 700 pF1KB4 KKLNIGGGGLGYRERPGLGSENMDRGNNNVMSNYEAYKPSTGAMGDRLTAMKAAFQSQYK : . : .: :.. CCDS75 IKKSSGFSGKGFKFDETEQALANERKKLQKAALGLQDSDDEDAAVDIDEQIESMFNSKKR 770 780 790 800 810 820 >>CCDS46706.1 DDX17 gene_id:10521|Hs108|chr22 (731 aa) initn: 1232 init1: 714 opt: 1253 Z-score: 948.1 bits: 186.4 E(32554): 1.7e-46 Smith-Waterman score: 1264; 36.2% identity (65.6% similar) in 639 aa overlap (174-789:88-707) 150 160 170 180 190 200 pF1KB4 VKGIRDDIEEEDDQEAYFRYMAENPTAGVVQEEEEDNLEYDSDGNPIAPTKKIIDPLPPI .....: . . :. : ::. .: . CCDS46 EPQALPSPAIRAPLPDLYPFGTMRGGGFGDRDRDRDRGGFGARGGGGLPPKKFGNPGERL 60 70 80 90 100 110 210 220 230 240 250 pF1KB4 DHSEIDY---PPFEKNFYNEHEEITNLTPQQLIDLRHKLNLRVSGA-APPRPGSSFAHFG ... : : :::::: :: :.. ::: .. .::.: .. : :. . :.: .: : . CCDS46 RKKKWDLSELPKFEKNFYVEHPEVARLTPYEVDELRRKKEITVRGGDVCPKPVFAFHHAN 120 130 140 150 160 170 260 270 280 290 300 310 pF1KB4 FDEQLMHQIRKSEYTQPTPIQCQGVPVALSGRDMIGIAKTGSGKTAAFIWPMLIHIMDQK : . .: . ...:.:::::::: :.:::::::.:::.:::::: :.. : ..:: : CCDS46 FPQYVMDVLMDQHFTEPTPIQCQGFPLALSGRDMVGIAQTGSGKTLAYLLPAIVHINHQP 180 190 200 210 220 230 320 330 340 350 360 370 pF1KB4 ELEPGDGPIAVIVCPTRELCQQIHAECKRFGKAYNLRSVAVYGGGSMWEQAKALQEGAEI :: ::::: ... ::::: ::.. .:: :.:. .:::. : . :..:.:: CCDS46 YLERGDGPICLVLAPTRELAQQVQQVADDYGKCSRLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEI 240 250 260 270 280 290 380 390 400 410 420 430 pF1KB4 VVCTPGRLIDHVKKKATNLQRVSYLVFDEADRMFDMGFEYQVRSIASHVRPDRQTLLFSA . ::::::: ... :::.: .:::.::::::.::::: :.:.:....:::::::..:: CCDS46 CIATPGRLIDFLESGKTNLRRCTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRPDRQTLMWSA 300 310 320 330 340 350 440 450 460 470 480 490 pF1KB4 TFRKKIEKLARDILIDPIRVVQGDIG-EANEDVTQIVEILHSGPSKWNWLTRRLVEFTSS :. :....::.:.: : .. :.. ::... :::.. . : . : . . :. . CCDS46 TWPKEVRQLAEDFLRDYTQINVGNLELSANHNILQIVDVCMESE-KDHKLIQLMEEIMAE 360 370 380 390 400 410 500 510 520 530 540 550 pF1KB4 --GSVLLFVTKKANAEELANNLKQEGHNLGLLHGDMDQSERNKVISDFKKKDIPVLVATD .....:: : ..:. ....: .::: .: ::. :...:.. :.:.::: CCDS46 KENKTIIFVETKRRCDDLTRRMRRDGWPAMCIHGDKSQPERDWVLNEFRSGKAPILIATD 420 430 440 450 460 470 560 570 580 590 600 610 pF1KB4 VAARGLDIPSIKTVINYDVARDIDTHTHRIGRTGRAGEKGVAYTLLTPKDSNFAGDLVRN ::.::::. ..: ::::: . . ..::::::.:. .::.:::..:: . . : .:.. CCDS46 VASRGLDVEDVKFVINYDYPNSSEDYVHRIGRTARSTNKGTAYTFFTPGNLKQARELIKV 480 490 500 510 520 530 620 630 640 650 660 670 pF1KB4 LEGANQHVSKELLDLAMQNAWFRKSRFKGGKGKKLNIGGGGLGYRERPGLGSENM---DR :: ::: .. .:..:. : :: : : :: :: . .. :. :. CCDS46 LEEANQAINPKLMQLV-------DHRGGGGGGGK----GGRSRYRTTSSANNPNLMYQDE 540 550 560 570 580 680 690 700 710 720 pF1KB4 GNNNVMSNYEAYKPSTGAMGDRLTAMKAAFQ--SQY---KSHFVAA----SLSNQKAGSS . . . .. . ..... :: . .:.. : : .: : : . .. :.. CCDS46 CDRRLRGVKDGGRRDSASYRDRSETDRAGYANGSGYGSPNSAFGAQAGQYTYGQGTYGAA 590 600 610 620 630 640 730 740 750 760 770 780 pF1KB4 AAGASGWTS----AGSLNSVPTNSAQQGHNSPDSPVTSAAKGIPGFGNTGNISGAPVTYP : :.:..:. ::. .. :.:. :..: :... . :.: .:. .. CCDS46 AYGTSSYTAQEYGAGTYGASSTTST--GRSSQ-----SSSQQFSGIGRSGQQPQPLMSQQ 650 660 670 680 690 790 800 810 820 830 840 pF1KB4 SAGAQGVNNTASGNNSREGTGGSNGKRERYTENRGSSRHSHGETGNRHSDSPRHGDGGRH : :..: CCDS46 FAQPPGATNMIGYMGQTAYQYPPPPPPPPPSRK 700 710 720 730 >>CCDS33646.1 DDX17 gene_id:10521|Hs108|chr22 (729 aa) initn: 1228 init1: 714 opt: 1245 Z-score: 942.2 bits: 185.3 E(32554): 3.7e-46 Smith-Waterman score: 1265; 36.1% identity (65.9% similar) in 640 aa overlap (174-789:88-705) 150 160 170 180 190 200 pF1KB4 VKGIRDDIEEEDDQEAYFRYMAENPTAGVVQEEEEDNLEYDSDGNPIAPTKKIIDPLPPI .....: . . :. : ::. .: . CCDS33 EPQALPSPAIRAPLPDLYPFGTMRGGGFGDRDRDRDRGGFGARGGGGLPPKKFGNPGERL 60 70 80 90 100 110 210 220 230 240 250 pF1KB4 DHSEIDY---PPFEKNFYNEHEEITNLTPQQLIDLRHKLNLRVSGA-APPRPGSSFAHFG ... : : :::::: :: :.. ::: .. .::.: .. : :. . :.: .: : . CCDS33 RKKKWDLSELPKFEKNFYVEHPEVARLTPYEVDELRRKKEITVRGGDVCPKPVFAFHHAN 120 130 140 150 160 170 260 270 280 290 300 310 pF1KB4 FDEQLMHQIRKSEYTQPTPIQCQGVPVALSGRDMIGIAKTGSGKTAAFIWPMLIHIMDQK : . .: . ...:.:::::::: :.:::::::.:::.:::::: :.. : ..:: : CCDS33 FPQYVMDVLMDQHFTEPTPIQCQGFPLALSGRDMVGIAQTGSGKTLAYLLPAIVHINHQP 180 190 200 210 220 230 320 330 340 350 360 370 pF1KB4 ELEPGDGPIAVIVCPTRELCQQIHAECKRFGKAYNLRSVAVYGGGSMWEQAKALQEGAEI :: ::::: ... ::::: ::.. .:: :.:. .:::. : . :..:.:: CCDS33 YLERGDGPICLVLAPTRELAQQVQQVADDYGKCSRLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEI 240 250 260 270 280 290 380 390 400 410 420 430 pF1KB4 VVCTPGRLIDHVKKKATNLQRVSYLVFDEADRMFDMGFEYQVRSIASHVRPDRQTLLFSA . ::::::: ... :::.: .:::.::::::.::::: :.:.:....:::::::..:: CCDS33 CIATPGRLIDFLESGKTNLRRCTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRPDRQTLMWSA 300 310 320 330 340 350 440 450 460 470 480 490 pF1KB4 TFRKKIEKLARDILIDPIRVVQGDIG-EANEDVTQIVEILHSGPSKWNWLTRRLVEFTSS :. :....::.:.: : .. :.. ::... :::.. . : . : . . :. . CCDS33 TWPKEVRQLAEDFLRDYTQINVGNLELSANHNILQIVDVCMESE-KDHKLIQLMEEIMAE 360 370 380 390 400 410 500 510 520 530 540 550 pF1KB4 --GSVLLFVTKKANAEELANNLKQEGHNLGLLHGDMDQSERNKVISDFKKKDIPVLVATD .....:: : ..:. ....: .::: .: ::. :...:.. :.:.::: CCDS33 KENKTIIFVETKRRCDDLTRRMRRDGWPAMCIHGDKSQPERDWVLNEFRSGKAPILIATD 420 430 440 450 460 470 560 570 580 590 600 610 pF1KB4 VAARGLDIPSIKTVINYDVARDIDTHTHRIGRTGRAGEKGVAYTLLTPKDSNFAGDLVRN ::.::::. ..: ::::: . . ..::::::.:. .::.:::..:: . . : .:.. CCDS33 VASRGLDVEDVKFVINYDYPNSSEDYVHRIGRTARSTNKGTAYTFFTPGNLKQARELIKV 480 490 500 510 520 530 620 630 640 650 660 670 pF1KB4 LEGANQHVSKELLDLAMQNAWFRKSRFKGGKGKKLNIGGGGLG-YRERPGLGSENM---D :: ::: .. .:..:. . .:: : :::: . :: . .. :. : CCDS33 LEEANQAINPKLMQLVDH---------RGGGG-----GGGGRSRYRTTSSANNPNLMYQD 540 550 560 570 580 680 690 700 710 720 pF1KB4 RGNNNVMSNYEAYKPSTGAMGDRLTAMKAAFQ--SQY---KSHFVAA----SLSNQKAGS . . . . .. . ..... :: . .:.. : : .: : : . .. :. CCDS33 ECDRRLRGVKDGGRRDSASYRDRSETDRAGYANGSGYGSPNSAFGAQAGQYTYGQGTYGA 590 600 610 620 630 640 730 740 750 760 770 pF1KB4 SAAGASGWTS----AGSLNSVPTNSAQQGHNSPDSPVTSAAKGIPGFGNTGNISGAPVTY .: :.:..:. ::. .. :.:. :..: :... . :.: .:. .. CCDS33 AAYGTSSYTAQEYGAGTYGASSTTST--GRSSQ-----SSSQQFSGIGRSGQQPQPLMSQ 650 660 670 680 690 780 790 800 810 820 830 pF1KB4 PSAGAQGVNNTASGNNSREGTGGSNGKRERYTENRGSSRHSHGETGNRHSDSPRHGDGGR : :..: CCDS33 QFAQPPGATNMIGYMGQTAYQYPPPPPPPPPSRK 700 710 720 >>CCDS82190.1 DDX5 gene_id:1655|Hs108|chr17 (614 aa) initn: 1147 init1: 790 opt: 1231 Z-score: 932.7 bits: 183.3 E(32554): 1.2e-45 Smith-Waterman score: 1231; 37.3% identity (67.9% similar) in 585 aa overlap (192-764:37-607) 170 180 190 200 210 220 pF1KB4 RYMAENPTAGVVQEEEEDNLEYDSDGNPIAPTKKIIDPLPPIDHSEIDYPPFEKNFYNEH : .:.. .: . : ::::::.:: CCDS82 EADEGTSVRFGAPRFGGSRAGPLSGKKFGNPGEKLVKKKWNLD----ELPKFEKNFYQEH 10 20 30 40 50 60 230 240 250 260 270 280 pF1KB4 EEITNLTPQQLIDLRHKLNLRVSGAAPPRPGSSFAHFGFDEQLMHQIRKSEYTQPTPIQC ... : :.. :.. .. : : :.: .: . .: ..: : ....:.:: :: CCDS82 PDLARRTAQEVETYRRSKEITVRGHNCPKPVLNFYEANFPANVMDVIARQNFTEPTAIQA 70 80 90 100 110 120 290 300 310 320 330 340 pF1KB4 QGVPVALSGRDMIGIAKTGSGKTAAFIWPMLIHIMDQKELEPGDGPIAVIVCPTRELCQQ :: :::::: ::.:.:.:::::: ... : ..:: : :: ::::: ... ::::: :: CCDS82 QGWPVALSGLDMVGVAQTGSGKTLSYLLPAIVHINHQPFLERGDGPICLVLAPTRELAQQ 130 140 150 160 170 180 350 360 370 380 390 400 pF1KB4 IHAECKRFGKAYNLRSVAVYGGGSMWEQAKALQEGAEIVVCTPGRLIDHVKKKATNLQRV .. .. .: :.:. .:::. : . :..:.:: . ::::::: .. :::.:. CCDS82 VQQVAAEYCRACRLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLECGKTNLRRT 190 200 210 220 230 240 410 420 430 440 450 460 pF1KB4 SYLVFDEADRMFDMGFEYQVRSIASHVRPDRQTLLFSATFRKKIEKLARDILIDPIRVVQ .:::.::::::.::::: :.:.:....:::::::..:::. :....::.:.: : :.. CCDS82 TYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRPDRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLKDYIHINI 250 260 270 280 290 300 470 480 490 500 510 pF1KB4 GDIG-EANEDVTQIVEILHSGPSKWNWLTRRLVEFTSS--GSVLLFVTKKANAEELANNL : . ::... :::.. :. : . : : . :. : .....:: : .::. .. CCDS82 GALELSANHNILQIVDVCHD-VEKDEKLIRLMEEIMSEKENKTIVFVETKRRCDELTRKM 310 320 330 340 350 360 520 530 540 550 560 570 pF1KB4 KQEGHNLGLLHGDMDQSERNKVISDFKKKDIPVLVATDVAARGLDIPSIKTVINYDVARD ...: .::: .:.::. :...::. :.:.:::::.::::. ..: ::::: . CCDS82 RRDGWPAMGIHGDKSQQERDWVLNEFKHGKAPILIATDVASRGLDVEDVKFVINYDYPNS 370 380 390 400 410 420 580 590 600 610 620 630 pF1KB4 IDTHTHRIGRTGRAGEKGVAYTLLTPKDSNFAGDLVRNLEGANQHVSKELLDLAMQNAWF . . ::::::.:. . :.:::..::.. . ..::. :. ::: .. .::.: ... CCDS82 SEDYIHRIGRTARSTKTGTAYTFFTPNNIKQVSDLISVLREANQAINPKLLQL-VEDRGS 430 440 450 460 470 480 640 650 660 670 680 690 pF1KB4 RKSRFKGG----KGKKLNIG--GGGLGYRERPGLGSENMDRGNNNVMSNYEAYKPSTGAM .:: .:: . . . : :: .:.: ::.::: ..... . : ..:.. CCDS82 GRSRGRGGMKDDRRDRYSAGKRGGFNTFRDR-----ENYDRGYSSLLKRDFGAKTQNGVY 490 500 510 520 530 700 710 720 730 740 750 pF1KB4 GDRLTAMKAAFQSQYKSHFVAASL-SNQKAGSSAAGASGWTSAGSLNSVPTNSAQQGHNS . . ...: :.. : . .:. ... .:. : .. . :: .::. ..... CCDS82 SAA-NYTNGSFGSNFVSAGIQTSFRTGNPTGTYQNGYDSTQQYGS--NVPNMHNGMNQQA 540 550 560 570 580 590 760 770 780 790 800 pF1KB4 PDSPVTSAAK--GIPGFGNTGNISGAPVTYPSAGAQGVNNTASGNNSREGTGGSNGKRER :.:.:: : : CCDS82 YAYPATAAAPMIGYPMPTGYSQ 600 610 >>CCDS11659.1 DDX5 gene_id:1655|Hs108|chr17 (614 aa) initn: 1147 init1: 790 opt: 1231 Z-score: 932.7 bits: 183.3 E(32554): 1.2e-45 Smith-Waterman score: 1231; 37.3% identity (67.9% similar) in 585 aa overlap (192-764:37-607) 170 180 190 200 210 220 pF1KB4 RYMAENPTAGVVQEEEEDNLEYDSDGNPIAPTKKIIDPLPPIDHSEIDYPPFEKNFYNEH : .:.. .: . : ::::::.:: CCDS11 DRDRGRDRGFGAPRFGGSRAGPLSGKKFGNPGEKLVKKKWNLD----ELPKFEKNFYQEH 10 20 30 40 50 60 230 240 250 260 270 280 pF1KB4 EEITNLTPQQLIDLRHKLNLRVSGAAPPRPGSSFAHFGFDEQLMHQIRKSEYTQPTPIQC ... : :.. :.. .. : : :.: .: . .: ..: : ....:.:: :: CCDS11 PDLARRTAQEVETYRRSKEITVRGHNCPKPVLNFYEANFPANVMDVIARQNFTEPTAIQA 70 80 90 100 110 120 290 300 310 320 330 340 pF1KB4 QGVPVALSGRDMIGIAKTGSGKTAAFIWPMLIHIMDQKELEPGDGPIAVIVCPTRELCQQ :: :::::: ::.:.:.:::::: ... : ..:: : :: ::::: ... ::::: :: CCDS11 QGWPVALSGLDMVGVAQTGSGKTLSYLLPAIVHINHQPFLERGDGPICLVLAPTRELAQQ 130 140 150 160 170 180 350 360 370 380 390 400 pF1KB4 IHAECKRFGKAYNLRSVAVYGGGSMWEQAKALQEGAEIVVCTPGRLIDHVKKKATNLQRV .. .. .: :.:. .:::. : . :..:.:: . ::::::: .. :::.:. CCDS11 VQQVAAEYCRACRLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLECGKTNLRRT 190 200 210 220 230 240 410 420 430 440 450 460 pF1KB4 SYLVFDEADRMFDMGFEYQVRSIASHVRPDRQTLLFSATFRKKIEKLARDILIDPIRVVQ .:::.::::::.::::: :.:.:....:::::::..:::. :....::.:.: : :.. CCDS11 TYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRPDRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLKDYIHINI 250 260 270 280 290 300 470 480 490 500 510 pF1KB4 GDIG-EANEDVTQIVEILHSGPSKWNWLTRRLVEFTSS--GSVLLFVTKKANAEELANNL : . ::... :::.. :. : . : : . :. : .....:: : .::. .. CCDS11 GALELSANHNILQIVDVCHD-VEKDEKLIRLMEEIMSEKENKTIVFVETKRRCDELTRKM 310 320 330 340 350 360 520 530 540 550 560 570 pF1KB4 KQEGHNLGLLHGDMDQSERNKVISDFKKKDIPVLVATDVAARGLDIPSIKTVINYDVARD ...: .::: .:.::. :...::. :.:.:::::.::::. ..: ::::: . CCDS11 RRDGWPAMGIHGDKSQQERDWVLNEFKHGKAPILIATDVASRGLDVEDVKFVINYDYPNS 370 380 390 400 410 420 580 590 600 610 620 630 pF1KB4 IDTHTHRIGRTGRAGEKGVAYTLLTPKDSNFAGDLVRNLEGANQHVSKELLDLAMQNAWF . . ::::::.:. . :.:::..::.. . ..::. :. ::: .. .::.: ... CCDS11 SEDYIHRIGRTARSTKTGTAYTFFTPNNIKQVSDLISVLREANQAINPKLLQL-VEDRGS 430 440 450 460 470 480 640 650 660 670 680 690 pF1KB4 RKSRFKGG----KGKKLNIG--GGGLGYRERPGLGSENMDRGNNNVMSNYEAYKPSTGAM .:: .:: . . . : :: .:.: ::.::: ..... . : ..:.. CCDS11 GRSRGRGGMKDDRRDRYSAGKRGGFNTFRDR-----ENYDRGYSSLLKRDFGAKTQNGVY 490 500 510 520 530 700 710 720 730 740 750 pF1KB4 GDRLTAMKAAFQSQYKSHFVAASL-SNQKAGSSAAGASGWTSAGSLNSVPTNSAQQGHNS . . ...: :.. : . .:. ... .:. : .. . :: .::. ..... CCDS11 SAA-NYTNGSFGSNFVSAGIQTSFRTGNPTGTYQNGYDSTQQYGS--NVPNMHNGMNQQA 540 550 560 570 580 590 760 770 780 790 800 pF1KB4 PDSPVTSAAK--GIPGFGNTGNISGAPVTYPSAGAQGVNNTASGNNSREGTGGSNGKRER :.:.:: : : CCDS11 YAYPATAAAPMIGYPMPTGYSQ 600 610 >>CCDS4977.1 DDX43 gene_id:55510|Hs108|chr6 (648 aa) initn: 946 init1: 840 opt: 1008 Z-score: 765.8 bits: 152.5 E(32554): 2.4e-36 Smith-Waterman score: 1012; 37.2% identity (65.7% similar) in 484 aa overlap (185-650:159-631) 160 170 180 190 200 pF1KB4 DDQEAYFRYMAENPTAGVVQEEEEDNLEYDSDGNPIAPTKKIID-------PLPPIDHSE .:.: .: . .:: : . CCDS49 DNFVKKLEENYNSECGIDTAFQPSVGKDGSTDNNVVAGDRPLIDWDQIREEGLKWQKTKW 130 140 150 160 170 180 210 220 230 240 250 pF1KB4 IDYPPFEKNFYNEHEEITNLTPQQLIDLRHKLNLRVS------GAA-P-PRPGSSFAH-F : ::..::::.: . .. . : .: :. .. : : : : .: : CCDS49 ADLPPIKKNFYKESTATSAMSKVE-ADSWRKENFNITWDDLKDGEKRPIPNPTCTFDDAF 190 200 210 220 230 240 260 270 280 290 300 310 pF1KB4 GFDEQLMHQIRKSEYTQPTPIQCQGVPVALSGRDMIGIAKTGSGKTAAFIWPMLIHIMDQ ..:..:.:. . .::::: :. :..:.: :.::.:.::.::: .. : .::.. : CCDS49 QCYPEVMENIKKAGFQKPTPIQSQAWPIVLQGIDLIGVAQTGTGKTLCYLMPGFIHLVLQ 250 260 270 280 290 300 320 330 340 350 360 370 pF1KB4 KELEPG-DGPIAVIVCPTRELCQQIHAECKRFGKAYNLRSVAVYGGGSMWEQAKALQEGA :. . : ... ::::: :...:: ... .:::: :::::. :: . :..:. CCDS49 PSLKGQRNRPGMLVLTPTRELALQVEGECCKYSYK-GLRSVCVYGGGNRDEQIEELKKGV 310 320 330 340 350 360 380 390 400 410 420 430 pF1KB4 EIVVCTPGRLIDHVKKKATNLQRVSYLVFDEADRMFDMGFEYQVRSIASHVRPDRQTLLF .:.. ::::: : .. .::. ..:::.::::.:.::::: :. .: :::::::.. CCDS49 DIIIATPGRLNDLQMSNFVNLKNITYLVLDEADKMLDMGFEPQIMKILLDVRPDRQTVMT 370 380 390 400 410 420 440 450 460 470 480 490 pF1KB4 SATFRKKIEKLARDILIDPIRVVQGDIGE-ANEDVTQIVEILHSGPSKWNWLTRRLVEFT :::. .....::.. : .:. : : . : .: : . :. . ::. . : .. CCDS49 SATWPHSVHRLAQSYLKEPMIVYVGTLDLVAVSSVKQNI-IVTTEEEKWSHMQTFLQSMS 430 440 450 460 470 480 500 510 520 530 540 550 pF1KB4 SSGSVLLFVTKKANAEELANNLKQEGHNLGLLHGDMDQSERNKVISDFKKKDIPVLVATD :. .:..::..:: :..:...: . .. :::: .: .:.:.. .:: . .:.::: CCDS49 STDKVIVFVSRKAVADHLSSDLILGNISVESLHGDREQRDREKALENFKTGKVRILIATD 490 500 510 520 530 540 560 570 580 590 600 610 pF1KB4 VAARGLDIPSIKTVINYDVARDIDTHTHRIGRTGRAGEKGVAYTLLTPKDSNFAGDLVRN .:.::::. .. : :.: :.:. ..::::::::::. ::. : :: .: :..:. CCDS49 LASRGLDVHDVTHVYNFDFPRNIEEYVHRIGRTGRAGRTGVSITTLTRNDWRVASELINI 550 560 570 580 590 600 620 630 640 650 660 670 pF1KB4 LEGANQHVSKELLDLAMQNAWFRKSRFKGGKGKKLNIGGGGLGYRERPGLGSENMDRGNN :: ::: . .::...: :::. . :. CCDS49 LERANQSIPEELVSMA--------ERFKAHQQKREMERKMERPQGRPKKFH 610 620 630 640 680 690 700 710 720 730 pF1KB4 NVMSNYEAYKPSTGAMGDRLTAMKAAFQSQYKSHFVAASLSNQKAGSSAAGASGWTSAGS >>CCDS35214.1 DDX53 gene_id:168400|Hs108|chrX (631 aa) initn: 940 init1: 779 opt: 978 Z-score: 743.6 bits: 148.3 E(32554): 4.3e-35 Smith-Waterman score: 979; 36.0% identity (69.7% similar) in 455 aa overlap (209-650:170-619) 180 190 200 210 220 230 pF1KB4 DNLEYDSDGNPIAPTKKIIDPLPPIDHSEIDYPPFEKNFYNEHEEITNLTPQQLIDLRHK : :: .:::: : . . .. .:.:. : : CCDS35 RNDIVGEAEPLSNWDRIRAAVVECEKRKWADLPPVKKNFYIESKATSCMSEMQVINWR-K 140 150 160 170 180 190 240 250 260 270 280 pF1KB4 LNLRV------SGAAP--PRPGSSFAH-FGFDEQLMHQIRKSEYTQPTPIQCQGVPVALS :. . :: :.: : : .:...: . ..::::: :. :. :. CCDS35 ENFNITCDDLKSGEKRLIPKPTCRFKDAFQQYPDLLKSIIRVGIVKPTPIQSQAWPIILQ 200 210 220 230 240 250 290 300 310 320 330 340 pF1KB4 GRDMIGIAKTGSGKTAAFIWPMLIHIMDQKEL--EPGDGPIAVIVCPTRELCQQIHAECK : :.: .:.::.::: ... : .:: .:.. . : .:: ... ::::: ...:::. CCDS35 GIDLIVVAQTGTGKTLSYLMPGFIH-LDSQPISREQRNGPGMLVLTPTRELALHVEAECS 260 270 280 290 300 310 350 360 370 380 390 400 pF1KB4 RFGKAYNLRSVAVYGGGSMWEQAKALQEGAEIVVCTPGRLIDHVKKKATNLQRVSYLVFD ... .:.:. .::: . : . ...:..:.. ::::: : ....::. ..:::.: CCDS35 KYSYK-GLKSICIYGGRNRNGQIEDISKGVDIIIATPGRLNDLQMNNSVNLRSITYLVID 320 330 340 350 360 370 410 420 430 440 450 460 pF1KB4 EADRMFDMGFEYQVRSIASHVRPDRQTLLFSATFRKKIEKLARDILIDPIRVVQGDIGE- :::.:.:: :: :.:.: :::::::.. :::. ...:: . : ::. : :... CCDS35 EADKMLDMEFEPQIRKILLDVRPDRQTVMTSATWPDTVRQLALSYLKDPMIVYVGNLNLV 380 390 400 410 420 430 470 480 490 500 510 520 pF1KB4 ANEDVTQIVEILHSGPSKWNWLTRRLVE-FTSSGSVLLFVTKKANAEELANNLKQEGHNL : . : : .:. . .. ::...:: .. . .:..::..: :..:..... .: . CCDS35 AVNTVKQ--NIIVTTEKEKRALTQEFVENMSPNDKVIMFVSQKHIADDLSSDFNIQGISA 440 450 460 470 480 490 530 540 550 560 570 580 pF1KB4 GLLHGDMDQSERNKVISDFKKKDIPVLVATDVAARGLDIPSIKTVINYDVARDIDTHTHR :::. .::...... :::. .: .:..::...::::. .. : ::: :.::...:: CCDS35 ESLHGNSEQSDQERAVEDFKSGNIKILITTDIVSRGLDLNDVTHVYNYDFPRNIDVYVHR 500 510 520 530 540 550 590 600 610 620 630 640 pF1KB4 IGRTGRAGEKGVAYTLLTPKDSNFAGDLVRNLEGANQHVSKELLDLAMQNAWFRKSRFKG .: ::.:. :.. ::.: .::..::.:.. :. ::: : ..:. .: : ...: . CCDS35 VGYIGRTGKTGTSVTLITQRDSKMAGELIKILDRANQSVPEDLVVMAEQYKLNQQKRHRE 560 570 580 590 600 610 650 660 670 680 690 700 pF1KB4 GKGKKLNIGGGGLGYRERPGLGSENMDRGNNNVMSNYEAYKPSTGAMGDRLTAMKAAFQS ...: CCDS35 TRSRKPGQRRKEFYFLS 620 630 >>CCDS54855.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 (575 aa) initn: 819 init1: 292 opt: 874 Z-score: 666.4 bits: 133.9 E(32554): 8.4e-31 Smith-Waterman score: 874; 36.3% identity (65.4% similar) in 474 aa overlap (177-632:74-526) 150 160 170 180 190 200 pF1KB4 IRDDIEEEDDQEAYFRYMAENPTAGVVQEEEEDNLEYDSDGNPIAPTK--KI--IDPLPP :.:. . ...:. . :. :. : : :: CCDS54 RTGGLFGSRRPVLSGTGNGDTSQSRSGSGSERDSWKSEAEGGESSDTQGPKVTYIPPPPP 50 60 70 80 90 100 210 220 230 240 250 260 pF1KB4 IDHSEIDYPPFEKNFYNEHEEITNLTPQQLIDLRHKLNLRVSGAAPPRPGSSFAHFGFDE : : ... ... :. : . ..::: : .: . .. . CCDS54 ED---------EDSIFAHYQTGINF------DKYDTILVEVSGHDAPPAILTFEEANLCQ 110 120 130 140 270 280 290 300 310 pF1KB4 QLMHQIRKSEYTQPTPIQCQGVPVALSGRDMIGIAKTGSGKTAAFIWPMLIHIMDQ---- : ..: :. ::. ::.: ..:. :.:::... :.:::::::::. :.: :.: . CCDS54 TLNNNIAKAGYTKLTPVQKYSIPIILAGRDLMACAQTGSGKTAAFLLPILAHMMHDGITA 150 160 170 180 190 200 320 330 340 350 360 370 pF1KB4 ---KELEPGDGPIAVIVCPTRELCQQIHAECKRFGKAYNLRSVAVYGGGSMWEQAKALQE :::. : .:: ::::: .::. : ..:. . .:.:..::: .. .. . . . CCDS54 SRFKELQE---PECIIVAPTRELVNQIYLEARKFSFGTCVRAVVIYGGTQLGHSIRQIVQ 210 220 230 240 250 260 380 390 400 410 420 430 pF1KB4 GAEIVVCTPGRLIDHVKKKATNLQRVSYLVFDEADRMFDMGFEYQVRSIAS----HVRPD : .:. :::::.: . :. .:....:::.::::::.:::: ..... : . . CCDS54 GCNILCATPGRLMDIIGKEKIGLKQIKYLVLDEADRMLDMGFGPEMKKLISCPGMPSKEQ 270 280 290 300 310 320 440 450 460 470 480 pF1KB4 RQTLLFSATFRKKIEKLARDILI-DPIRVVQGDIGEANEDVTQIVEILHSGP-SKWNWLT ::::.::::: ..:..:: ..: . . :. :..: : .:: : : :. : :: . :. CCDS54 RQTLMFSATFPEEIQRLAAEFLKSNYLFVAVGQVGGACRDVQQTV--LQVGQFSKREKLV 330 340 350 360 370 380 490 500 510 520 530 540 pF1KB4 RRLVEFTSSGSVLLFVTKKANAEELANNLKQEGHNLGLLHGDMDQSERNKVISDFKKKDI . ... .. ...:: : .:. .:. : :: . .::: .: ::.....::. CCDS54 E-ILRNIGDERTMVFVETKKKADFIATFLCQEKISTTSIHGDREQREREQALGDFRFGKC 390 400 410 420 430 440 550 560 570 580 590 600 pF1KB4 PVLVATDVAARGLDIPSIKTVINYDVARDIDTHTHRIGRTGRAGEKGVAYTLLT-PKDSN ::::::.:::::::: ... :::.:. :: ..:::::::: :. : : ... .:.. CCDS54 PVLVATSVAARGLDIENVQHVINFDLPSTIDEYVHRIGRTGRCGNTGRAISFFDLESDNH 450 460 470 480 490 500 610 620 630 640 650 660 pF1KB4 FAGDLVRNLEGANQHVSKELLDLAMQNAWFRKSRFKGGKGKKLNIGGGGLGYRERPGLGS .: ::. : :.: : : ..: CCDS54 LAQPLVKVLTDAQQDVPAWLEEIAFSTYIPGFSGSTRGNVFASVDTRKGKSTLNTAGFSS 510 520 530 540 550 560 938 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Thu Nov 3 14:25:16 2016 done: Thu Nov 3 14:25:17 2016 Total Scan time: 3.860 Total Display time: 0.200 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]