Result of FASTA (ccds) for pF1KB4115
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB4115, 938 aa
  1>>>pF1KB4115 938 - 938 aa - 938 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.6398+/-0.00103; mu= 11.3821+/- 0.062
 mean_var=179.2705+/-36.458, 0's: 0 Z-trim(109.6): 80  B-trim: 9 in 1/49
 Lambda= 0.095790
 statistics sampled from 10947 (11025) to 10947 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.678), E-opt: 0.2 (0.339), width:  16
 Scan time:  3.860

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS32704.1 DDX42 gene_id:11325|Hs108|chr17        ( 938) 6322 887.0       0
CCDS34240.1 DDX46 gene_id:9879|Hs108|chr5          (1031) 1363 201.7 5.9e-51
CCDS75306.1 DDX46 gene_id:9879|Hs108|chr5          (1032) 1363 201.7 5.9e-51
CCDS46706.1 DDX17 gene_id:10521|Hs108|chr22        ( 731) 1253 186.4 1.7e-46
CCDS33646.1 DDX17 gene_id:10521|Hs108|chr22        ( 729) 1245 185.3 3.7e-46
CCDS82190.1 DDX5 gene_id:1655|Hs108|chr17          ( 614) 1231 183.3 1.2e-45
CCDS11659.1 DDX5 gene_id:1655|Hs108|chr17          ( 614) 1231 183.3 1.2e-45
CCDS4977.1 DDX43 gene_id:55510|Hs108|chr6          ( 648) 1008 152.5 2.4e-36
CCDS35214.1 DDX53 gene_id:168400|Hs108|chrX        ( 631)  978 148.3 4.3e-35
CCDS54855.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5          ( 575)  874 133.9 8.4e-31
CCDS47208.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5          ( 690)  874 134.0 9.6e-31
CCDS54854.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5          ( 704)  874 134.0 9.8e-31
CCDS3969.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5           ( 724)  874 134.0   1e-30
CCDS30964.1 DDX59 gene_id:83479|Hs108|chr1         ( 619)  823 126.9 1.2e-28
CCDS14782.1 DDX3Y gene_id:8653|Hs108|chrY          ( 660)  770 119.6   2e-26
CCDS55404.1 DDX3X gene_id:1654|Hs108|chrX          ( 646)  767 119.2 2.6e-26
CCDS43931.1 DDX3X gene_id:1654|Hs108|chrX          ( 662)  767 119.2 2.6e-26
CCDS8655.1 DDX47 gene_id:51202|Hs108|chr12         ( 455)  759 118.0 4.3e-26
CCDS4427.1 DDX41 gene_id:51428|Hs108|chr5          ( 622)  737 115.0 4.5e-25
CCDS13416.1 DDX27 gene_id:55661|Hs108|chr20        ( 796)  720 112.8 2.7e-24
CCDS12390.1 DDX49 gene_id:54555|Hs108|chr19        ( 483)  687 108.0 4.5e-23
CCDS31907.1 DDX54 gene_id:79039|Hs108|chr12        ( 881)  690 108.7 5.2e-23
CCDS44984.1 DDX54 gene_id:79039|Hs108|chr12        ( 882)  690 108.7 5.2e-23
CCDS7283.1 DDX50 gene_id:79009|Hs108|chr10         ( 737)  667 105.4 4.1e-22
CCDS11767.1 EIF4A3 gene_id:9775|Hs108|chr17        ( 411)  662 104.5 4.3e-22
CCDS11323.1 DDX52 gene_id:11056|Hs108|chr17        ( 599)  634 100.8 8.4e-21
CCDS8342.1 DDX10 gene_id:1662|Hs108|chr11          ( 875)  636 101.2 9.1e-21
CCDS31211.1 DDX21 gene_id:9188|Hs108|chr10         ( 783)  629 100.2 1.6e-20
CCDS73144.1 DDX21 gene_id:9188|Hs108|chr10         ( 715)  626 99.7 2.1e-20
CCDS11113.1 EIF4A1 gene_id:1973|Hs108|chr17        ( 406)  621 98.8 2.2e-20
CCDS44751.1 DDX6 gene_id:1656|Hs108|chr11          ( 483)  621 98.9 2.5e-20
CCDS3282.1 EIF4A2 gene_id:1974|Hs108|chr3          ( 407)  609 97.2 6.9e-20
CCDS12308.1 DDX39A gene_id:10212|Hs108|chr19       ( 427)  579 93.1 1.3e-18
CCDS2120.1 DDX18 gene_id:8886|Hs108|chr2           ( 670)  582 93.6 1.3e-18
CCDS4697.1 DDX39B gene_id:7919|Hs108|chr6          ( 428)  578 92.9 1.4e-18
CCDS10889.1 DDX19A gene_id:55308|Hs108|chr16       ( 478)  553 89.5 1.7e-17
CCDS10888.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16       ( 479)  550 89.1 2.2e-17
CCDS8770.1 DDX23 gene_id:9416|Hs108|chr12          ( 820)  554 89.9 2.2e-17
CCDS42187.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16       ( 370)  521 85.0   3e-16
CCDS44766.1 DDX25 gene_id:29118|Hs108|chr11        ( 483)  519 84.8 4.3e-16
CCDS59053.1 DDX56 gene_id:54606|Hs108|chr7         ( 507)  514 84.1 7.3e-16
CCDS82009.1 DDX19A gene_id:55308|Hs108|chr16       ( 447)  498 81.9 3.1e-15
CCDS32475.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16       ( 448)  495 81.5 4.1e-15
CCDS58478.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16       ( 453)  495 81.5 4.1e-15
CCDS81646.1 DDX25 gene_id:29118|Hs108|chr11        ( 369)  477 78.9   2e-14
CCDS842.1 DDX20 gene_id:11218|Hs108|chr1           ( 824)  480 79.6 2.7e-14
CCDS58511.1 EIF4A1 gene_id:1973|Hs108|chr17        ( 347)  458 76.3 1.2e-13
CCDS5492.1 DDX56 gene_id:54606|Hs108|chr7          ( 547)  452 75.6 2.9e-13
CCDS6952.1 DDX31 gene_id:64794|Hs108|chr9          ( 585)  426 72.0 3.7e-12


>>CCDS32704.1 DDX42 gene_id:11325|Hs108|chr17             (938 aa)
 initn: 6322 init1: 6322 opt: 6322  Z-score: 4732.6  bits: 887.0 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 6322; 100.0% identity (100.0% similar) in 938 aa overlap (1-938:1-938)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB4 MNWNKGGPGTKRGFGFGGFAISAGKKEEPKLPQQSHSAFGATSSSSGFGKSAPPQLPSFY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MNWNKGGPGTKRGFGFGGFAISAGKKEEPKLPQQSHSAFGATSSSSGFGKSAPPQLPSFY
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB4 KIGSKRANFDEENAYFEDEEEDSSNVDLPYIPAENSPTRQQFHSKPVDSDSDDDPLEAFM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KIGSKRANFDEENAYFEDEEEDSSNVDLPYIPAENSPTRQQFHSKPVDSDSDDDPLEAFM
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB4 AEVEDQAARDMKRLEEKDKERKNVKGIRDDIEEEDDQEAYFRYMAENPTAGVVQEEEEDN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 AEVEDQAARDMKRLEEKDKERKNVKGIRDDIEEEDDQEAYFRYMAENPTAGVVQEEEEDN
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB4 LEYDSDGNPIAPTKKIIDPLPPIDHSEIDYPPFEKNFYNEHEEITNLTPQQLIDLRHKLN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LEYDSDGNPIAPTKKIIDPLPPIDHSEIDYPPFEKNFYNEHEEITNLTPQQLIDLRHKLN
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB4 LRVSGAAPPRPGSSFAHFGFDEQLMHQIRKSEYTQPTPIQCQGVPVALSGRDMIGIAKTG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LRVSGAAPPRPGSSFAHFGFDEQLMHQIRKSEYTQPTPIQCQGVPVALSGRDMIGIAKTG
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB4 SGKTAAFIWPMLIHIMDQKELEPGDGPIAVIVCPTRELCQQIHAECKRFGKAYNLRSVAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SGKTAAFIWPMLIHIMDQKELEPGDGPIAVIVCPTRELCQQIHAECKRFGKAYNLRSVAV
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB4 YGGGSMWEQAKALQEGAEIVVCTPGRLIDHVKKKATNLQRVSYLVFDEADRMFDMGFEYQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 YGGGSMWEQAKALQEGAEIVVCTPGRLIDHVKKKATNLQRVSYLVFDEADRMFDMGFEYQ
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB4 VRSIASHVRPDRQTLLFSATFRKKIEKLARDILIDPIRVVQGDIGEANEDVTQIVEILHS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VRSIASHVRPDRQTLLFSATFRKKIEKLARDILIDPIRVVQGDIGEANEDVTQIVEILHS
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB4 GPSKWNWLTRRLVEFTSSGSVLLFVTKKANAEELANNLKQEGHNLGLLHGDMDQSERNKV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GPSKWNWLTRRLVEFTSSGSVLLFVTKKANAEELANNLKQEGHNLGLLHGDMDQSERNKV
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB4 ISDFKKKDIPVLVATDVAARGLDIPSIKTVINYDVARDIDTHTHRIGRTGRAGEKGVAYT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ISDFKKKDIPVLVATDVAARGLDIPSIKTVINYDVARDIDTHTHRIGRTGRAGEKGVAYT
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB4 LLTPKDSNFAGDLVRNLEGANQHVSKELLDLAMQNAWFRKSRFKGGKGKKLNIGGGGLGY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LLTPKDSNFAGDLVRNLEGANQHVSKELLDLAMQNAWFRKSRFKGGKGKKLNIGGGGLGY
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB4 RERPGLGSENMDRGNNNVMSNYEAYKPSTGAMGDRLTAMKAAFQSQYKSHFVAASLSNQK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RERPGLGSENMDRGNNNVMSNYEAYKPSTGAMGDRLTAMKAAFQSQYKSHFVAASLSNQK
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB4 AGSSAAGASGWTSAGSLNSVPTNSAQQGHNSPDSPVTSAAKGIPGFGNTGNISGAPVTYP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 AGSSAAGASGWTSAGSLNSVPTNSAQQGHNSPDSPVTSAAKGIPGFGNTGNISGAPVTYP
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB4 SAGAQGVNNTASGNNSREGTGGSNGKRERYTENRGSSRHSHGETGNRHSDSPRHGDGGRH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SAGAQGVNNTASGNNSREGTGGSNGKRERYTENRGSSRHSHGETGNRHSDSPRHGDGGRH
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KB4 GDGYRHPESSSRHTDGHRHGENRHGGSAGRHGENRGANDGRNGESRKEAFNRESKMEPKM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GDGYRHPESSSRHTDGHRHGENRHGGSAGRHGENRGANDGRNGESRKEAFNRESKMEPKM
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930        
pF1KB4 EPKVDSSKMDKVDSKTDKTADGFAVPEPPKRKKSRWDS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 EPKVDSSKMDKVDSKTDKTADGFAVPEPPKRKKSRWDS
              910       920       930        

>>CCDS34240.1 DDX46 gene_id:9879|Hs108|chr5               (1031 aa)
 initn: 1294 init1: 561 opt: 1363  Z-score: 1028.3  bits: 201.7 E(32554): 5.9e-51
Smith-Waterman score: 1363; 40.3% identity (69.1% similar) in 583 aa overlap (94-661:207-779)

            70        80        90       100       110       120   
pF1KB4 SKRANFDEENAYFEDEEEDSSNVDLPYIPAENSPTRQQFHSKPVDSDSDDDPLEAFMAEV
                                     :..:.. . ... .... . :::.:.: ::
CCDS34 KAMENIGELKKEIEEMKQGKKWSLEDDDDDEDDPAEAEKEGNEMEGE-ELDPLDAYMEEV
        180       190       200       210       220        230     

            130        140       150       160       170       180 
pF1KB4 EDQAAR-DMKRLEEKD-KERKNVKGIRDDIEEEDDQEAYFRYMAENPTAGVVQEEEEDNL
       .... . .:. ..    .:.:.   .   .     ..:    .  .   : ..:...: .
CCDS34 KEEVKKFNMRSVKGGGGNEKKSGPTVTKVVTVVTTKKAV---VDSDKKKGELMENDQDAM
         240       250       260       270          280       290  

             190              200       210       220       230    
pF1KB4 EYDSDGNPI----APT---KKIIDPLPPIDHSEIDYPPFEKNFYNEHEEITNLTPQQLID
       ::.:. . .    : :    :    : :.::..:.: ::.:::: :  :..... ...  
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pF1KB4 DHSEIDY---PPFEKNFYNEHEEITNLTPQQLIDLRHKLNLRVSGA-APPRPGSSFAHFG
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CCDS46 RKKKWDLSELPKFEKNFYVEHPEVARLTPYEVDELRRKKEITVRGGDVCPKPVFAFHHAN
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pF1KB4 FDEQLMHQIRKSEYTQPTPIQCQGVPVALSGRDMIGIAKTGSGKTAAFIWPMLIHIMDQK
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CCDS46 FPQYVMDVLMDQHFTEPTPIQCQGFPLALSGRDMVGIAQTGSGKTLAYLLPAIVHINHQP
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pF1KB4 ELEPGDGPIAVIVCPTRELCQQIHAECKRFGKAYNLRSVAVYGGGSMWEQAKALQEGAEI
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pF1KB4 TFRKKIEKLARDILIDPIRVVQGDIG-EANEDVTQIVEILHSGPSKWNWLTRRLVEFTSS
       :. :....::.:.: :  ..  :..   ::... :::..   .  : . : . . :. . 
CCDS46 TWPKEVRQLAEDFLRDYTQINVGNLELSANHNILQIVDVCMESE-KDHKLIQLMEEIMAE
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pF1KB4 --GSVLLFVTKKANAEELANNLKQEGHNLGLLHGDMDQSERNKVISDFKKKDIPVLVATD
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CCDS46 KENKTIIFVETKRRCDDLTRRMRRDGWPAMCIHGDKSQPERDWVLNEFRSGKAPILIATD
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CCDS46 VASRGLDVEDVKFVINYDYPNSSEDYVHRIGRTARSTNKGTAYTFFTPGNLKQARELIKV
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CCDS46 LEEANQAINPKLMQLV-------DHRGGGGGGGK----GGRSRYRTTSSANNPNLMYQDE
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pF1KB4 GNNNVMSNYEAYKPSTGAMGDRLTAMKAAFQ--SQY---KSHFVAA----SLSNQKAGSS
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CCDS46 CDRRLRGVKDGGRRDSASYRDRSETDRAGYANGSGYGSPNSAFGAQAGQYTYGQGTYGAA
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pF1KB4 AAGASGWTS----AGSLNSVPTNSAQQGHNSPDSPVTSAAKGIPGFGNTGNISGAPVTYP
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CCDS46 AYGTSSYTAQEYGAGTYGASSTTST--GRSSQ-----SSSQQFSGIGRSGQQPQPLMSQQ
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        :   :..:                                                   
CCDS46 FAQPPGATNMIGYMGQTAYQYPPPPPPPPPSRK                           
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>>CCDS33646.1 DDX17 gene_id:10521|Hs108|chr22             (729 aa)
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                                     .....:   . . :.   : ::. .:   .
CCDS33 EPQALPSPAIRAPLPDLYPFGTMRGGGFGDRDRDRDRGGFGARGGGGLPPKKFGNPGERL
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        ... :    : :::::: :: :.. ::: .. .::.: .. : :. . :.:  .: : .
CCDS33 RKKKWDLSELPKFEKNFYVEHPEVARLTPYEVDELRRKKEITVRGGDVCPKPVFAFHHAN
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       : . .:  .  ...:.:::::::: :.:::::::.:::.:::::: :.. : ..::  : 
CCDS33 FPQYVMDVLMDQHFTEPTPIQCQGFPLALSGRDMVGIAQTGSGKTLAYLLPAIVHINHQP
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        :: ::::: ... ::::: ::..     .::   :.:. .:::.    : . :..:.::
CCDS33 YLERGDGPICLVLAPTRELAQQVQQVADDYGKCSRLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEI
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        . ::::::: ...  :::.: .:::.::::::.::::: :.:.:....:::::::..::
CCDS33 CIATPGRLIDFLESGKTNLRRCTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRPDRQTLMWSA
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pF1KB4 TFRKKIEKLARDILIDPIRVVQGDIG-EANEDVTQIVEILHSGPSKWNWLTRRLVEFTSS
       :. :....::.:.: :  ..  :..   ::... :::..   .  : . : . . :. . 
CCDS33 TWPKEVRQLAEDFLRDYTQINVGNLELSANHNILQIVDVCMESE-KDHKLIQLMEEIMAE
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pF1KB4 --GSVLLFVTKKANAEELANNLKQEGHNLGLLHGDMDQSERNKVISDFKKKDIPVLVATD
         .....::  :   ..:.  ....:     .::: .: ::. :...:..   :.:.:::
CCDS33 KENKTIIFVETKRRCDDLTRRMRRDGWPAMCIHGDKSQPERDWVLNEFRSGKAPILIATD
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pF1KB4 VAARGLDIPSIKTVINYDVARDIDTHTHRIGRTGRAGEKGVAYTLLTPKDSNFAGDLVRN
       ::.::::. ..: :::::   . . ..::::::.:. .::.:::..:: . . : .:.. 
CCDS33 VASRGLDVEDVKFVINYDYPNSSEDYVHRIGRTARSTNKGTAYTFFTPGNLKQARELIKV
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pF1KB4 LEGANQHVSKELLDLAMQNAWFRKSRFKGGKGKKLNIGGGGLG-YRERPGLGSENM---D
       :: ::: .. .:..:. .         .:: :     :::: . ::   . .. :.   :
CCDS33 LEEANQAINPKLMQLVDH---------RGGGG-----GGGGRSRYRTTSSANNPNLMYQD
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pF1KB4 RGNNNVMSNYEAYKPSTGAMGDRLTAMKAAFQ--SQY---KSHFVAA----SLSNQKAGS
       . .  . .  .. . ..... ::  . .:..   : :   .: : :     . ..   :.
CCDS33 ECDRRLRGVKDGGRRDSASYRDRSETDRAGYANGSGYGSPNSAFGAQAGQYTYGQGTYGA
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pF1KB4 SAAGASGWTS----AGSLNSVPTNSAQQGHNSPDSPVTSAAKGIPGFGNTGNISGAPVTY
       .: :.:..:.    ::. ..  :.:.  :..:      :... . :.: .:.     .. 
CCDS33 AAYGTSSYTAQEYGAGTYGASSTTST--GRSSQ-----SSSQQFSGIGRSGQQPQPLMSQ
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pF1KB4 PSAGAQGVNNTASGNNSREGTGGSNGKRERYTENRGSSRHSHGETGNRHSDSPRHGDGGR
         :   :..:                                                  
CCDS33 QFAQPPGATNMIGYMGQTAYQYPPPPPPPPPSRK                          
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                                     : .:..     .:    . : ::::::.::
CCDS82 EADEGTSVRFGAPRFGGSRAGPLSGKKFGNPGEKLVKKKWNLD----ELPKFEKNFYQEH
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pF1KB4 EEITNLTPQQLIDLRHKLNLRVSGAAPPRPGSSFAHFGFDEQLMHQIRKSEYTQPTPIQC
        ...  : :..   :.. .. : :   :.:  .: . .:  ..:  : ....:.:: :: 
CCDS82 PDLARRTAQEVETYRRSKEITVRGHNCPKPVLNFYEANFPANVMDVIARQNFTEPTAIQA
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       :: :::::: ::.:.:.:::::: ... : ..::  :  :: ::::: ... ::::: ::
CCDS82 QGWPVALSGLDMVGVAQTGSGKTLSYLLPAIVHINHQPFLERGDGPICLVLAPTRELAQQ
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       ..    .. .:  :.:. .:::.    : . :..:.:: . ::::::: ..   :::.:.
CCDS82 VQQVAAEYCRACRLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLECGKTNLRRT
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pF1KB4 SYLVFDEADRMFDMGFEYQVRSIASHVRPDRQTLLFSATFRKKIEKLARDILIDPIRVVQ
       .:::.::::::.::::: :.:.:....:::::::..:::. :....::.:.: : :..  
CCDS82 TYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRPDRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLKDYIHINI
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pF1KB4 GDIG-EANEDVTQIVEILHSGPSKWNWLTRRLVEFTSS--GSVLLFVTKKANAEELANNL
       : .   ::... :::.. :.   : . : : . :. :   .....::  :   .::. ..
CCDS82 GALELSANHNILQIVDVCHD-VEKDEKLIRLMEEIMSEKENKTIVFVETKRRCDELTRKM
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pF1KB4 KQEGHNLGLLHGDMDQSERNKVISDFKKKDIPVLVATDVAARGLDIPSIKTVINYDVARD
       ...:     .::: .:.::. :...::.   :.:.:::::.::::. ..: :::::   .
CCDS82 RRDGWPAMGIHGDKSQQERDWVLNEFKHGKAPILIATDVASRGLDVEDVKFVINYDYPNS
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pF1KB4 IDTHTHRIGRTGRAGEKGVAYTLLTPKDSNFAGDLVRNLEGANQHVSKELLDLAMQNAWF
        . . ::::::.:. . :.:::..::.. . ..::.  :. ::: .. .::.: ...   
CCDS82 SEDYIHRIGRTARSTKTGTAYTFFTPNNIKQVSDLISVLREANQAINPKLLQL-VEDRGS
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pF1KB4 RKSRFKGG----KGKKLNIG--GGGLGYRERPGLGSENMDRGNNNVMSNYEAYKPSTGAM
        .:: .::    .  . . :  ::   .:.:     ::.::: .....   . : ..:..
CCDS82 GRSRGRGGMKDDRRDRYSAGKRGGFNTFRDR-----ENYDRGYSSLLKRDFGAKTQNGVY
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pF1KB4 GDRLTAMKAAFQSQYKSHFVAASL-SNQKAGSSAAGASGWTSAGSLNSVPTNSAQQGHNS
       .   .  ...: :.. :  . .:. ... .:.   : ..  . ::  .::.    .....
CCDS82 SAA-NYTNGSFGSNFVSAGIQTSFRTGNPTGTYQNGYDSTQQYGS--NVPNMHNGMNQQA
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pF1KB4 PDSPVTSAAK--GIPGFGNTGNISGAPVTYPSAGAQGVNNTASGNNSREGTGGSNGKRER
          :.:.::   : :                                             
CCDS82 YAYPATAAAPMIGYPMPTGYSQ                                      
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>>CCDS11659.1 DDX5 gene_id:1655|Hs108|chr17               (614 aa)
 initn: 1147 init1: 790 opt: 1231  Z-score: 932.7  bits: 183.3 E(32554): 1.2e-45
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pF1KB4 RYMAENPTAGVVQEEEEDNLEYDSDGNPIAPTKKIIDPLPPIDHSEIDYPPFEKNFYNEH
                                     : .:..     .:    . : ::::::.::
CCDS11 DRDRGRDRGFGAPRFGGSRAGPLSGKKFGNPGEKLVKKKWNLD----ELPKFEKNFYQEH
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pF1KB4 EEITNLTPQQLIDLRHKLNLRVSGAAPPRPGSSFAHFGFDEQLMHQIRKSEYTQPTPIQC
        ...  : :..   :.. .. : :   :.:  .: . .:  ..:  : ....:.:: :: 
CCDS11 PDLARRTAQEVETYRRSKEITVRGHNCPKPVLNFYEANFPANVMDVIARQNFTEPTAIQA
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pF1KB4 QGVPVALSGRDMIGIAKTGSGKTAAFIWPMLIHIMDQKELEPGDGPIAVIVCPTRELCQQ
       :: :::::: ::.:.:.:::::: ... : ..::  :  :: ::::: ... ::::: ::
CCDS11 QGWPVALSGLDMVGVAQTGSGKTLSYLLPAIVHINHQPFLERGDGPICLVLAPTRELAQQ
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       ..    .. .:  :.:. .:::.    : . :..:.:: . ::::::: ..   :::.:.
CCDS11 VQQVAAEYCRACRLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLECGKTNLRRT
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       .:::.::::::.::::: :.:.:....:::::::..:::. :....::.:.: : :..  
CCDS11 TYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRPDRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLKDYIHINI
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pF1KB4 GDIG-EANEDVTQIVEILHSGPSKWNWLTRRLVEFTSS--GSVLLFVTKKANAEELANNL
       : .   ::... :::.. :.   : . : : . :. :   .....::  :   .::. ..
CCDS11 GALELSANHNILQIVDVCHD-VEKDEKLIRLMEEIMSEKENKTIVFVETKRRCDELTRKM
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pF1KB4 KQEGHNLGLLHGDMDQSERNKVISDFKKKDIPVLVATDVAARGLDIPSIKTVINYDVARD
       ...:     .::: .:.::. :...::.   :.:.:::::.::::. ..: :::::   .
CCDS11 RRDGWPAMGIHGDKSQQERDWVLNEFKHGKAPILIATDVASRGLDVEDVKFVINYDYPNS
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pF1KB4 IDTHTHRIGRTGRAGEKGVAYTLLTPKDSNFAGDLVRNLEGANQHVSKELLDLAMQNAWF
        . . ::::::.:. . :.:::..::.. . ..::.  :. ::: .. .::.: ...   
CCDS11 SEDYIHRIGRTARSTKTGTAYTFFTPNNIKQVSDLISVLREANQAINPKLLQL-VEDRGS
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pF1KB4 RKSRFKGG----KGKKLNIG--GGGLGYRERPGLGSENMDRGNNNVMSNYEAYKPSTGAM
        .:: .::    .  . . :  ::   .:.:     ::.::: .....   . : ..:..
CCDS11 GRSRGRGGMKDDRRDRYSAGKRGGFNTFRDR-----ENYDRGYSSLLKRDFGAKTQNGVY
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pF1KB4 GDRLTAMKAAFQSQYKSHFVAASL-SNQKAGSSAAGASGWTSAGSLNSVPTNSAQQGHNS
       .   .  ...: :.. :  . .:. ... .:.   : ..  . ::  .::.    .....
CCDS11 SAA-NYTNGSFGSNFVSAGIQTSFRTGNPTGTYQNGYDSTQQYGS--NVPNMHNGMNQQA
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pF1KB4 PDSPVTSAAK--GIPGFGNTGNISGAPVTYPSAGAQGVNNTASGNNSREGTGGSNGKRER
          :.:.::   : :                                             
CCDS11 YAYPATAAAPMIGYPMPTGYSQ                                      
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>>CCDS4977.1 DDX43 gene_id:55510|Hs108|chr6               (648 aa)
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CCDS49 DNFVKKLEENYNSECGIDTAFQPSVGKDGSTDNNVVAGDRPLIDWDQIREEGLKWQKTKW
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pF1KB4 IDYPPFEKNFYNEHEEITNLTPQQLIDLRHKLNLRVS------GAA-P-PRPGSSFAH-F
        : ::..::::.:    . ..  .  :  .: :. ..      :   : : :  .:   :
CCDS49 ADLPPIKKNFYKESTATSAMSKVE-ADSWRKENFNITWDDLKDGEKRPIPNPTCTFDDAF
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pF1KB4 GFDEQLMHQIRKSEYTQPTPIQCQGVPVALSGRDMIGIAKTGSGKTAAFIWPMLIHIMDQ
           ..:..:.:. . .::::: :. :..:.: :.::.:.::.:::  .. : .::.. :
CCDS49 QCYPEVMENIKKAGFQKPTPIQSQAWPIVLQGIDLIGVAQTGTGKTLCYLMPGFIHLVLQ
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pF1KB4 KELEPG-DGPIAVIVCPTRELCQQIHAECKRFGKAYNLRSVAVYGGGSMWEQAKALQEGA
         :.   . :  ... :::::  :...:: ...   .:::: :::::.  :: . :..:.
CCDS49 PSLKGQRNRPGMLVLTPTRELALQVEGECCKYSYK-GLRSVCVYGGGNRDEQIEELKKGV
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pF1KB4 EIVVCTPGRLIDHVKKKATNLQRVSYLVFDEADRMFDMGFEYQVRSIASHVRPDRQTLLF
       .:.. ::::: :   .. .::. ..:::.::::.:.::::: :. .:   :::::::.. 
CCDS49 DIIIATPGRLNDLQMSNFVNLKNITYLVLDEADKMLDMGFEPQIMKILLDVRPDRQTVMT
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pF1KB4 SATFRKKIEKLARDILIDPIRVVQGDIGE-ANEDVTQIVEILHSGPSKWNWLTRRLVEFT
       :::. .....::.. : .:. :  : .   :  .: : . :. .   ::. .   :  ..
CCDS49 SATWPHSVHRLAQSYLKEPMIVYVGTLDLVAVSSVKQNI-IVTTEEEKWSHMQTFLQSMS
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pF1KB4 SSGSVLLFVTKKANAEELANNLKQEGHNLGLLHGDMDQSERNKVISDFKKKDIPVLVATD
       :. .:..::..:: :..:...:   . ..  :::: .: .:.:.. .::   . .:.:::
CCDS49 STDKVIVFVSRKAVADHLSSDLILGNISVESLHGDREQRDREKALENFKTGKVRILIATD
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pF1KB4 VAARGLDIPSIKTVINYDVARDIDTHTHRIGRTGRAGEKGVAYTLLTPKDSNFAGDLVRN
       .:.::::. ..  : :.:  :.:. ..::::::::::. ::. : :: .:   :..:.  
CCDS49 LASRGLDVHDVTHVYNFDFPRNIEEYVHRIGRTGRAGRTGVSITTLTRNDWRVASELINI
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pF1KB4 LEGANQHVSKELLDLAMQNAWFRKSRFKGGKGKKLNIGGGGLGYRERPGLGSENMDRGNN
       :: ::: . .::...:         :::. . :.                          
CCDS49 LERANQSIPEELVSMA--------ERFKAHQQKREMERKMERPQGRPKKFH         
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pF1KB4 NVMSNYEAYKPSTGAMGDRLTAMKAAFQSQYKSHFVAASLSNQKAGSSAAGASGWTSAGS

>>CCDS35214.1 DDX53 gene_id:168400|Hs108|chrX             (631 aa)
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Smith-Waterman score: 979; 36.0% identity (69.7% similar) in 455 aa overlap (209-650:170-619)

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pF1KB4 DNLEYDSDGNPIAPTKKIIDPLPPIDHSEIDYPPFEKNFYNEHEEITNLTPQQLIDLRHK
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CCDS35 RNDIVGEAEPLSNWDRIRAAVVECEKRKWADLPPVKKNFYIESKATSCMSEMQVINWR-K
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pF1KB4 LNLRV------SGAAP--PRPGSSFAH-FGFDEQLMHQIRKSEYTQPTPIQCQGVPVALS
        :. .      ::     :.:   :   :    .:...: .   ..::::: :. :. :.
CCDS35 ENFNITCDDLKSGEKRLIPKPTCRFKDAFQQYPDLLKSIIRVGIVKPTPIQSQAWPIILQ
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pF1KB4 GRDMIGIAKTGSGKTAAFIWPMLIHIMDQKEL--EPGDGPIAVIVCPTRELCQQIHAECK
       : :.: .:.::.::: ... : .:: .:.. .  :  .::  ... :::::  ...:::.
CCDS35 GIDLIVVAQTGTGKTLSYLMPGFIH-LDSQPISREQRNGPGMLVLTPTRELALHVEAECS
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pF1KB4 RFGKAYNLRSVAVYGGGSMWEQAKALQEGAEIVVCTPGRLIDHVKKKATNLQRVSYLVFD
       ...   .:.:. .::: .   : . ...:..:.. ::::: :   ....::. ..:::.:
CCDS35 KYSYK-GLKSICIYGGRNRNGQIEDISKGVDIIIATPGRLNDLQMNNSVNLRSITYLVID
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pF1KB4 EADRMFDMGFEYQVRSIASHVRPDRQTLLFSATFRKKIEKLARDILIDPIRVVQGDIGE-
       :::.:.:: :: :.:.:   :::::::.. :::.   ...:: . : ::. :  :...  
CCDS35 EADKMLDMEFEPQIRKILLDVRPDRQTVMTSATWPDTVRQLALSYLKDPMIVYVGNLNLV
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pF1KB4 ANEDVTQIVEILHSGPSKWNWLTRRLVE-FTSSGSVLLFVTKKANAEELANNLKQEGHNL
       : . : :  .:. .  ..   ::...:: .. . .:..::..:  :..:..... .: . 
CCDS35 AVNTVKQ--NIIVTTEKEKRALTQEFVENMSPNDKVIMFVSQKHIADDLSSDFNIQGISA
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pF1KB4 GLLHGDMDQSERNKVISDFKKKDIPVLVATDVAARGLDIPSIKTVINYDVARDIDTHTHR
         :::. .::...... :::. .: .:..::...::::. ..  : :::  :.::...::
CCDS35 ESLHGNSEQSDQERAVEDFKSGNIKILITTDIVSRGLDLNDVTHVYNYDFPRNIDVYVHR
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pF1KB4 IGRTGRAGEKGVAYTLLTPKDSNFAGDLVRNLEGANQHVSKELLDLAMQNAWFRKSRFKG
       .:  ::.:. :.. ::.: .::..::.:.. :. ::: : ..:. .: :    ...: . 
CCDS35 VGYIGRTGKTGTSVTLITQRDSKMAGELIKILDRANQSVPEDLVVMAEQYKLNQQKRHRE
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pF1KB4 GKGKKLNIGGGGLGYRERPGLGSENMDRGNNNVMSNYEAYKPSTGAMGDRLTAMKAAFQS
        ...:                                                       
CCDS35 TRSRKPGQRRKEFYFLS                                           
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>>CCDS54855.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5               (575 aa)
 initn: 819 init1: 292 opt: 874  Z-score: 666.4  bits: 133.9 E(32554): 8.4e-31
Smith-Waterman score: 874; 36.3% identity (65.4% similar) in 474 aa overlap (177-632:74-526)

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pF1KB4 IRDDIEEEDDQEAYFRYMAENPTAGVVQEEEEDNLEYDSDGNPIAPTK--KI--IDPLPP
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CCDS54 RTGGLFGSRRPVLSGTGNGDTSQSRSGSGSERDSWKSEAEGGESSDTQGPKVTYIPPPPP
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pF1KB4 IDHSEIDYPPFEKNFYNEHEEITNLTPQQLIDLRHKLNLRVSGAAPPRPGSSFAHFGFDE
        :         : ... ...   :.      :    . ..:::   :    .: . .. .
CCDS54 ED---------EDSIFAHYQTGINF------DKYDTILVEVSGHDAPPAILTFEEANLCQ
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pF1KB4 QLMHQIRKSEYTQPTPIQCQGVPVALSGRDMIGIAKTGSGKTAAFIWPMLIHIMDQ----
        : ..: :. ::. ::.:  ..:. :.:::... :.:::::::::. :.: :.: .    
CCDS54 TLNNNIAKAGYTKLTPVQKYSIPIILAGRDLMACAQTGSGKTAAFLLPILAHMMHDGITA
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pF1KB4 ---KELEPGDGPIAVIVCPTRELCQQIHAECKRFGKAYNLRSVAVYGGGSMWEQAKALQE
          :::.    :  .:: ::::: .::. : ..:. .  .:.:..::: .. .. . . .
CCDS54 SRFKELQE---PECIIVAPTRELVNQIYLEARKFSFGTCVRAVVIYGGTQLGHSIRQIVQ
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pF1KB4 GAEIVVCTPGRLIDHVKKKATNLQRVSYLVFDEADRMFDMGFEYQVRSIAS----HVRPD
       : .:.  :::::.: . :.  .:....:::.::::::.::::  ..... :      . .
CCDS54 GCNILCATPGRLMDIIGKEKIGLKQIKYLVLDEADRMLDMGFGPEMKKLISCPGMPSKEQ
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pF1KB4 RQTLLFSATFRKKIEKLARDILI-DPIRVVQGDIGEANEDVTQIVEILHSGP-SKWNWLT
       ::::.::::: ..:..:: ..:  . . :. :..: : .:: : :  :. :  :: . :.
CCDS54 RQTLMFSATFPEEIQRLAAEFLKSNYLFVAVGQVGGACRDVQQTV--LQVGQFSKREKLV
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