Result of FASTA (ccds) for
pF1KB4121
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4121, 603 aa
1>>>pF1KB4121 603 - 603 aa - 603 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9672+/-0.000927; mu= 15.2477+/- 0.056
mean_var=68.8655+/-13.688, 0's: 0 Z-trim(104.9): 36 B-trim: 0 in 0/48
Lambda= 0.154552
statistics sampled from 8103 (8136) to 8103 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.618), E-opt: 0.2 (0.25), width: 16
Scan time: 2.490
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS14694.1 MTM1 gene_id:4534|Hs108|chrX ( 603) 4053 913.1 0
CCDS8305.1 MTMR2 gene_id:8898|Hs108|chr11 ( 643) 2687 608.5 8.3e-174
CCDS8306.1 MTMR2 gene_id:8898|Hs108|chr11 ( 571) 2676 606.1 4.1e-173
CCDS14695.1 MTMR1 gene_id:8776|Hs108|chrX ( 665) 2465 559.0 6.8e-159
CCDS78512.1 MTMR1 gene_id:8776|Hs108|chrX ( 673) 2451 555.9 6e-158
CCDS14379.1 MTMR8 gene_id:55613|Hs108|chrX ( 704) 1256 289.5 1e-77
CCDS9313.1 MTMR6 gene_id:9107|Hs108|chr13 ( 621) 1245 287.0 4.9e-77
CCDS34851.1 MTMR7 gene_id:9108|Hs108|chr8 ( 660) 1206 278.3 2.2e-74
CCDS5979.1 MTMR9 gene_id:66036|Hs108|chr8 ( 549) 1043 241.9 1.6e-63
CCDS78513.1 MTMR1 gene_id:8776|Hs108|chrX ( 363) 1033 239.7 5.1e-63
CCDS46682.1 MTMR3 gene_id:8897|Hs108|chr22 (1161) 910 212.4 2.7e-54
CCDS13871.1 MTMR3 gene_id:8897|Hs108|chr22 (1170) 910 212.4 2.7e-54
CCDS13870.1 MTMR3 gene_id:8897|Hs108|chr22 (1198) 910 212.4 2.8e-54
CCDS11608.1 MTMR4 gene_id:9110|Hs108|chr17 (1195) 878 205.2 3.9e-52
CCDS31427.1 SBF2 gene_id:81846|Hs108|chr11 (1849) 466 113.4 2.6e-24
CCDS14091.2 SBF1 gene_id:6305|Hs108|chr22 (1893) 462 112.5 5e-24
CCDS45204.1 MTMR10 gene_id:54893|Hs108|chr15 ( 777) 436 106.6 1.2e-22
CCDS77998.1 MTMR12 gene_id:54545|Hs108|chr5 ( 693) 403 99.3 1.8e-20
CCDS34138.1 MTMR12 gene_id:54545|Hs108|chr5 ( 747) 387 95.7 2.3e-19
CCDS72901.1 MTMR11 gene_id:10903|Hs108|chr1 ( 640) 369 91.7 3.2e-18
CCDS72902.1 MTMR11 gene_id:10903|Hs108|chr1 ( 709) 369 91.7 3.5e-18
>>CCDS14694.1 MTM1 gene_id:4534|Hs108|chrX (603 aa)
initn: 4053 init1: 4053 opt: 4053 Z-score: 4880.4 bits: 913.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4053; 100.0% identity (100.0% similar) in 603 aa overlap (1-603:1-603)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MASASTSKYNSHSLENESIKRTSRDGVNRDLTEAVPRLPGETLITDKEVIYICPFNGPIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MASASTSKYNSHSLENESIKRTSRDGVNRDLTEAVPRLPGETLITDKEVIYICPFNGPIK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 GRVYITNYRLYLRSLETDSSLILDVPLGVISRIEKMGGATSRGENSYGLDITCKDMRNLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GRVYITNYRLYLRSLETDSSLILDVPLGVISRIEKMGGATSRGENSYGLDITCKDMRNLR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 FALKQEGHSRRDMFEILTRYAFPLAHSLPLFAFLNEEKFNVDGWTVYNPVEEYRRQGLPN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 FALKQEGHSRRDMFEILTRYAFPLAHSLPLFAFLNEEKFNVDGWTVYNPVEEYRRQGLPN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 HHWRITFINKCYELCDTYPALLVVPYRASDDDLRRVATFRSRNRIPVLSWIHPENKTVIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 HHWRITFINKCYELCDTYPALLVVPYRASDDDLRRVATFRSRNRIPVLSWIHPENKTVIV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 RCSQPLVGMSGKRNKDDEKYLDVIRETNKQISKLTIYDARPSVNAVANKATGGGYESDDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 RCSQPLVGMSGKRNKDDEKYLDVIRETNKQISKLTIYDARPSVNAVANKATGGGYESDDA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 YHNAELFFLDIHNIHVMRESLKKVKDIVYPNVEESHWLSSLESTHWLEHIKLVLTGAIQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 YHNAELFFLDIHNIHVMRESLKKVKDIVYPNVEESHWLSSLESTHWLEHIKLVLTGAIQV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 ADKVSSGKSSVLVHCSDGWDRTAQLTSLAMLMLDSFYRSIEGFEILVQKEWISFGHKFAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 ADKVSSGKSSVLVHCSDGWDRTAQLTSLAMLMLDSFYRSIEGFEILVQKEWISFGHKFAS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 RIGHGDKNHTDADRSPIFLQFIDCVWQMSKQFPTAFEFNEQFLIIILDHLYSCRFGTFLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 RIGHGDKNHTDADRSPIFLQFIDCVWQMSKQFPTAFEFNEQFLIIILDHLYSCRFGTFLF
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 NCESARERQKVTERTVSLWSLINSNKEKFKNPFYTKEINRVLYPVASMRHLELWVNYYIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 NCESARERQKVTERTVSLWSLINSNKEKFKNPFYTKEINRVLYPVASMRHLELWVNYYIR
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 WNPRIKQQQPNPVEQRYMELLALRDEYIKRLEELQLANSAKLSDPPTSPSSPSQMMPHVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 WNPRIKQQQPNPVEQRYMELLALRDEYIKRLEELQLANSAKLSDPPTSPSSPSQMMPHVQ
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 THF
:::
CCDS14 THF
>>CCDS8305.1 MTMR2 gene_id:8898|Hs108|chr11 (643 aa)
initn: 2543 init1: 2543 opt: 2687 Z-score: 3233.9 bits: 608.5 E(32554): 8.3e-174
Smith-Waterman score: 2687; 65.0% identity (84.1% similar) in 603 aa overlap (2-601:42-641)
10 20 30
pF1KB4 MASASTSKYNSHSLENESIK-RTSRDGVNRD
::. .: : : .: : :. :.. .
CCDS83 SQPAAARPPSVDSLSSASTSHSENSVHTKSASVVSSDSISTSADNFSPDLRVLRESNKLA
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80
pF1KB4 LTEAVPRLPGETLITD--KEVIYICPFNGPIKGRVYITNYRLYLRSLETDSSLILDVPLG
: : ::::. : : :.: :::::.: ..: . .::::::..:.: : ..::. ::
CCDS83 EMEEPPLLPGEN-IKDMAKDVTYICPFTGAVRGTLTVTNYRLYFKSMERDPPFVLDASLG
80 90 100 110 120 130
90 100 110 120 130 140
pF1KB4 VISRIEKMGGATSRGENSYGLDITCKDMRNLRFALKQEGHSRRDMFEILTRYAFPLAHSL
::.:.::.:::.:::::::::. .:::.:::::: : ::..::..:: : .::::....:
CCDS83 VINRVEKIGGASSRGENSYGLETVCKDIRNLRFAHKPEGRTRRSIFENLMKYAFPVSNNL
140 150 160 170 180 190
150 160 170 180 190 200
pF1KB4 PLFAFLNEEKFNVDGWTVYNPVEEYRRQGLPNHHWRITFINKCYELCDTYPALLVVPYRA
::::: .: : .:: .:.:. ::::::.::. :::: ::. ::::::::::::::
CCDS83 PLFAFEYKEVFPENGWKLYDPLLEYRRQGIPNESWRITKINERYELCDTYPALLVVPANI
200 210 220 230 240 250
210 220 230 240 250 260
pF1KB4 SDDDLRRVATFRSRNRIPVLSWIHPENKTVIVRCSQPLVGMSGKRNKDDEKYLDVIRETN
:..:.:::.::::.:::::::::::....:.:::::.::.::::.:.:::::..: ..:
CCDS83 PDEELKRVASFRSRGRIPVLSWIHPESQATITRCSQPMVGVSGKRSKEDEKYLQAIMDSN
260 270 280 290 300 310
270 280 290 300 310 320
pF1KB4 KQISKLTIYDARPSVNAVANKATGGGYESDDAYHNAELFFLDIHNIHVMRESLKKVKDIV
: :. :.::::::::::::: ::::::.:::.:::: ::::::::::::::.:.:.::
CCDS83 AQSHKIFIFDARPSVNAVANKAKGGGYESEDAYQNAELVFLDIHNIHVMRESLRKLKEIV
320 330 340 350 360 370
330 340 350 360 370 380
pF1KB4 YPNVEESHWLSSLESTHWLEHIKLVLTGAIQVADKVSSGKSSVLVHCSDGWDRTAQLTSL
:::.::.::::.::::::::::::.:.::...:::: :::.::.::::::::::::::::
CCDS83 YPNIEETHWLSNLESTHWLEHIKLILAGALRIADKVESGKTSVVVHCSDGWDRTAQLTSL
380 390 400 410 420 430
390 400 410 420 430 440
pF1KB4 AMLMLDSFYRSIEGFEILVQKEWISFGHKFASRIGHGDKNHTDADRSPIFLQFIDCVWQM
::::::..::.:.:::.::.:::.::::.: :.:::::::.::::::.:::::::::::
CCDS83 AMLMLDGYYRTIRGFEVLVEKEWLSFGHRFQLRVGHGDKNHADADRSPVFLQFIDCVWQM
440 450 460 470 480 490
450 460 470 480 490 500
pF1KB4 SKQFPTAFEFNEQFLIIILDHLYSCRFGTFLFNCESARERQKVTERTVSLWSLINSNKEK
..:::::::::: ::: :::::::: ::::: : :. : .... .::::::: :::. :
CCDS83 TRQFPTAFEFNEYFLITILDHLYSCLFGTFLCNSEQQRGKENLPKRTVSLWSYINSQLED
500 510 520 530 540 550
510 520 530 540 550 560
pF1KB4 FKNPFYTKEINRVLYPVASMRHLELWVNYYIRWNPRIKQQQPNPVEQRYMELLALRDEYI
: ::.: . :.:::::::::::::::.::::::::.: :.: ...:: :::: : :
CCDS83 FTNPLYGSYSNHVLYPVASMRHLELWVGYYIRWNPRMKPQEP--IHNRYKELLAKRAELQ
560 570 580 590 600
570 580 590 600
pF1KB4 KRLEELQLANSAKLSDPPTSPSSPSQMMPHVQTHF
:..:::: : . .. :::.: . :::
CCDS83 KKVEELQREISNRSTSSSERASSPAQCVTPVQTVV
610 620 630 640
>>CCDS8306.1 MTMR2 gene_id:8898|Hs108|chr11 (571 aa)
initn: 2543 init1: 2543 opt: 2676 Z-score: 3221.5 bits: 606.1 E(32554): 4.1e-173
Smith-Waterman score: 2676; 67.1% identity (86.0% similar) in 571 aa overlap (33-601:2-569)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 SASTSKYNSHSLENESIKRTSRDGVNRDLTEAVPRLPGETLITD--KEVIYICPFNGPIK
: : ::::. : : :.: :::::.: ..
CCDS83 MEEPPLLPGEN-IKDMAKDVTYICPFTGAVR
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 GRVYITNYRLYLRSLETDSSLILDVPLGVISRIEKMGGATSRGENSYGLDITCKDMRNLR
: . .::::::..:.: : ..::. ::::.:.::.:::.:::::::::. .:::.::::
CCDS83 GTLTVTNYRLYFKSMERDPPFVLDASLGVINRVEKIGGASSRGENSYGLETVCKDIRNLR
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 FALKQEGHSRRDMFEILTRYAFPLAHSLPLFAFLNEEKFNVDGWTVYNPVEEYRRQGLPN
:: : ::..::..:: : .::::....:::::: .: : .:: .:.:. ::::::.::
CCDS83 FAHKPEGRTRRSIFENLMKYAFPVSNNLPLFAFEYKEVFPENGWKLYDPLLEYRRQGIPN
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 HHWRITFINKCYELCDTYPALLVVPYRASDDDLRRVATFRSRNRIPVLSWIHPENKTVIV
. :::: ::. :::::::::::::: :..:.:::.::::.:::::::::::....:.
CCDS83 ESWRITKINERYELCDTYPALLVVPANIPDEELKRVASFRSRGRIPVLSWIHPESQATIT
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 RCSQPLVGMSGKRNKDDEKYLDVIRETNKQISKLTIYDARPSVNAVANKATGGGYESDDA
:::::.::.::::.:.:::::..: ..: : :. :.::::::::::::: ::::::.::
CCDS83 RCSQPMVGVSGKRSKEDEKYLQAIMDSNAQSHKIFIFDARPSVNAVANKAKGGGYESEDA
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 YHNAELFFLDIHNIHVMRESLKKVKDIVYPNVEESHWLSSLESTHWLEHIKLVLTGAIQV
:.:::: ::::::::::::::.:.:.:::::.::.::::.::::::::::::.:.::...
CCDS83 YQNAELVFLDIHNIHVMRESLRKLKEIVYPNIEETHWLSNLESTHWLEHIKLILAGALRI
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 ADKVSSGKSSVLVHCSDGWDRTAQLTSLAMLMLDSFYRSIEGFEILVQKEWISFGHKFAS
:::: :::.::.::::::::::::::::::::::..::.:.:::.::.:::.::::.:
CCDS83 ADKVESGKTSVVVHCSDGWDRTAQLTSLAMLMLDGYYRTIRGFEVLVEKEWLSFGHRFQL
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 RIGHGDKNHTDADRSPIFLQFIDCVWQMSKQFPTAFEFNEQFLIIILDHLYSCRFGTFLF
:.:::::::.::::::.:::::::::::..:::::::::: ::: :::::::: :::::
CCDS83 RVGHGDKNHADADRSPVFLQFIDCVWQMTRQFPTAFEFNEYFLITILDHLYSCLFGTFLC
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 NCESARERQKVTERTVSLWSLINSNKEKFKNPFYTKEINRVLYPVASMRHLELWVNYYIR
: :. : .... .::::::: :::. : : ::.: . :.:::::::::::::::.::::
CCDS83 NSEQQRGKENLPKRTVSLWSYINSQLEDFTNPLYGSYSNHVLYPVASMRHLELWVGYYIR
460 470 480 490 500 510
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 WNPRIKQQQPNPVEQRYMELLALRDEYIKRLEELQLANSAKLSDPPTSPSSPSQMMPHVQ
::::.: :. :...:: :::: : : :..:::: : . .. :::.: . ::
CCDS83 WNPRMKPQE--PIHNRYKELLAKRAELQKKVEELQREISNRSTSSSERASSPAQCVTPVQ
520 530 540 550 560
pF1KB4 THF
:
CCDS83 TVV
570
>>CCDS14695.1 MTMR1 gene_id:8776|Hs108|chrX (665 aa)
initn: 2479 init1: 2147 opt: 2465 Z-score: 2966.1 bits: 559.0 E(32554): 6.8e-159
Smith-Waterman score: 2465; 58.3% identity (82.5% similar) in 606 aa overlap (1-601:61-663)
10 20
pF1KB4 MASASTSKYNSHSLENESIKRTS---RDGV
. .:. :. : :. .:...: :::
CCDS14 AAGGATAGSRQPSVETLDSPTGSHVEWCKQLIAATISSQISGSVTSENVSRDYKALRDGN
40 50 60 70 80 90
30 40 50 60 70 80
pF1KB4 NRDLTEAVPRLPGETL-ITDKEVIYICPFNGPIKGRVYITNYRLYLRSLETDSSLILDVP
. : .: .:::.. :.:.::::: : ..: . .:...::....: : .:::::
CCDS14 KLAQMEEAPLFPGESIKAIVKDVMYICPFMGAVSGTLTVTDFKLYFKNVERDPHFILDVP
100 110 120 130 140 150
90 100 110 120 130 140
pF1KB4 LGVISRIEKMGGATSRGENSYGLDITCKDMRNLRFALKQEGHSRRDMFEILTRYAFPLAH
::::::.::.: : :.:.:: :..:.::::::::.: ::: .:. .:: :...::::..
CCDS14 LGVISRVEKIG-AQSHGDNSCGIEIVCKDMRNLRLAYKQEEQSKLGIFENLNKHAFPLSN
160 170 180 190 200
150 160 170 180 190 200
pF1KB4 SLPLFAFLNEEKFNVDGWTVYNPVEEYRRQGLPNHHWRITFINKCYELCDTYPALLVVPY
. :::: .::: ..:: ::.:: ::.::::::. :.:. ::. ::.::::::..:::
CCDS14 GQALFAFSYKEKFPINGWKVYDPVSEYKRQGLPNESWKISKINSNYEFCDTYPAIIVVPT
210 220 230 240 250 260
210 220 230 240 250 260
pF1KB4 RASDDDLRRVATFRSRNRIPVLSWIHPENKTVIVRCSQPLVGMSGKRNKDDEKYLDVIRE
..:::: .::.::...:.:::::::::....:.:::::::: . :: :.:::::..: .
CCDS14 SVKDDDLSKVAAFRAKGRVPVLSWIHPESQATITRCSQPLVGPNDKRCKEDEKYLQTIMD
270 280 290 300 310 320
270 280 290 300 310 320
pF1KB4 TNKQISKLTIYDARPSVNAVANKATGGGYESDDAYHNAELFFLDIHNIHVMRESLKKVKD
.: : :: :.::: . : .::. ::::::..:: :::: ::.:::::::::::.:.:.
CCDS14 ANAQSHKLIIFDARQNSVADTNKTKGGGYESESAYPNAELVFLEIHNIHVMRESLRKLKE
330 340 350 360 370 380
330 340 350 360 370 380
pF1KB4 IVYPNVEESHWLSSLESTHWLEHIKLVLTGAIQVADKVSSGKSSVLVHCSDGWDRTAQLT
::::...:..:::....:::::.:...:.::...:::. :::.::.::::::::::::::
CCDS14 IVYPSIDEARWLSNVDGTHWLEYIRMLLAGAVRIADKIESGKTSVVVHCSDGWDRTAQLT
390 400 410 420 430 440
390 400 410 420 430 440
pF1KB4 SLAMLMLDSFYRSIEGFEILVQKEWISFGHKFASRIGHGDKNHTDADRSPIFLQFIDCVW
:::::::::.::.:.::: ::.::::::::.:: :.:::. ::.:::::::::::.::::
CCDS14 SLAMLMLDSYYRTIKGFETLVEKEWISFGHRFALRVGHGNDNHADADRSPIFLQFVDCVW
450 460 470 480 490 500
450 460 470 480 490 500
pF1KB4 QMSKQFPTAFEFNEQFLIIILDHLYSCRFGTFLFNCESARERQKVTERTVSLWSLINSNK
::..:::.:::::: ::: :::::::: ::::: :::. : .. : .:.:::: :::.
CCDS14 QMTRQFPSAFEFNELFLITILDHLYSCLFGTFLCNCEQQRFKEDVYTKTISLWSYINSQL
510 520 530 540 550 560
510 520 530 540 550 560
pF1KB4 EKFKNPFYTKEINRVLYPVASMRHLELWVNYYIRWNPRIKQQQPNPVEQRYMELLALRDE
..:.:::... :.:::::::. :::::::::.:::::.. :.: ..: ::::.: :
CCDS14 DEFSNPFFVNYENHVLYPVASLSHLELWVNYYVRWNPRMRPQMP--IHQNLKELLAVRAE
570 580 590 600 610 620
570 580 590 600
pF1KB4 YIKRLEELQLANSAK-LSDPPTSPSSPSQMMPHVQTHF
::.: :: ... .:. ::::. :.:
CCDS14 LQKRVEGLQREVATRAVSSSSERGSSPSHSATSVHTSV
630 640 650 660
>>CCDS78512.1 MTMR1 gene_id:8776|Hs108|chrX (673 aa)
initn: 2479 init1: 2147 opt: 2451 Z-score: 2949.2 bits: 555.9 E(32554): 6e-158
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10 20 30 40
pF1KB4 MASASTSKYNSHSLENESIKRTSRDGVNRDLTEAVPRLPGETL-ITDKEV
:. ::: . : .: .:::.. :.:
CCDS78 IAATISSQISGSVTSENVSRDYKVFRRPDLRALRDGNKLAQMEEAPLFPGESIKAIVKDV
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50 60 70 80 90 100
pF1KB4 IYICPFNGPIKGRVYITNYRLYLRSLETDSSLILDVPLGVISRIEKMGGATSRGENSYGL
.::::: : ..: . .:...::....: : .:::::::::::.::.: : :.:.:: :.
CCDS78 MYICPFMGAVSGTLTVTDFKLYFKNVERDPHFILDVPLGVISRVEKIG-AQSHGDNSCGI
130 140 150 160 170 180
110 120 130 140 150 160
pF1KB4 DITCKDMRNLRFALKQEGHSRRDMFEILTRYAFPLAHSLPLFAFLNEEKFNVDGWTVYNP
.:.::::::::.: ::: .:. .:: :...::::... :::: .::: ..:: ::.:
CCDS78 EIVCKDMRNLRLAYKQEEQSKLGIFENLNKHAFPLSNGQALFAFSYKEKFPINGWKVYDP
190 200 210 220 230 240
170 180 190 200 210 220
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: ::.::::::. :.:. ::. ::.::::::..::: ..:::: .::.::...:.::::
CCDS78 VSEYKRQGLPNESWKISKINSNYEFCDTYPAIIVVPTSVKDDDLSKVAAFRAKGRVPVLS
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230 240 250 260 270 280
pF1KB4 WIHPENKTVIVRCSQPLVGMSGKRNKDDEKYLDVIRETNKQISKLTIYDARPSVNAVANK
:::::....:.:::::::: . :: :.:::::..: ..: : :: :.::: . : .::
CCDS78 WIHPESQATITRCSQPLVGPNDKRCKEDEKYLQTIMDANAQSHKLIIFDARQNSVADTNK
310 320 330 340 350 360
290 300 310 320 330 340
pF1KB4 ATGGGYESDDAYHNAELFFLDIHNIHVMRESLKKVKDIVYPNVEESHWLSSLESTHWLEH
. ::::::..:: :::: ::.:::::::::::.:.:.::::...:..:::....:::::.
CCDS78 TKGGGYESESAYPNAELVFLEIHNIHVMRESLRKLKEIVYPSIDEARWLSNVDGTHWLEY
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350 360 370 380 390 400
pF1KB4 IKLVLTGAIQVADKVSSGKSSVLVHCSDGWDRTAQLTSLAMLMLDSFYRSIEGFEILVQK
:...:.::...:::. :::.::.:::::::::::::::::::::::.::.:.::: ::.:
CCDS78 IRMLLAGAVRIADKIESGKTSVVVHCSDGWDRTAQLTSLAMLMLDSYYRTIKGFETLVEK
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410 420 430 440 450 460
pF1KB4 EWISFGHKFASRIGHGDKNHTDADRSPIFLQFIDCVWQMSKQFPTAFEFNEQFLIIILDH
:::::::.:: :.:::. ::.:::::::::::.::::::..:::.:::::: ::: ::::
CCDS78 EWISFGHRFALRVGHGNDNHADADRSPIFLQFVDCVWQMTRQFPSAFEFNELFLITILDH
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:::: ::::: :::. : .. : .:.:::: :::. ..:.:::... :.:::::::.
CCDS78 LYSCLFGTFLCNCEQQRFKEDVYTKTISLWSYINSQLDEFSNPFFVNYENHVLYPVASLS
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pF1KB4 HLELWVNYYIRWNPRIKQQQPNPVEQRYMELLALRDEYIKRLEELQLANSAK-LSDPPTS
:::::::::.:::::.. :.: ..: ::::.: : ::.: :: ... .:.
CCDS78 HLELWVNYYVRWNPRMRPQMP--IHQNLKELLAVRAELQKRVEGLQREVATRAVSSSSER
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590 600
pF1KB4 PSSPSQMMPHVQTHF
::::. :.:
CCDS78 GSSPSHSATSVHTSV
660 670
>>CCDS14379.1 MTMR8 gene_id:55613|Hs108|chrX (704 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KB4 STSKYNSHSLENESIKRTSRDGVNRDLTEAVPRLPGETLITDKEVIYICPFNGPIKGRVY
::.. . :. :. :. . : .: .:
CCDS14 MDHITVPKVENVKLV-DR---YVS--KKPANGILY
10 20
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pF1KB4 ITNYRLYLRSLETDSSLILDVPLGVISRIEKMGGATSRGENSYGLDITCKDMRNLRFALK
.: .: . . : :. .::. :: : : . ::..: .:.:
CCDS14 LTATHLIYVEASGAARKETWIALHHIATVEKLP-ITSLGCP---LTLRCKNFRVAHFVLD
30 40 50 60 70 80
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pF1KB4 QEGHSRRDMFEILTRYAFPLAHSLP--LFAFLNEEKFNVD----GWTVYNPVEEYRRQGL
.. .... : . . : .:: :.:: . : . . :: . .:. .. :.:.
CCDS14 SD-LVCHEVYISLLKLSQP---ALPEDLYAFSYNPKSSKEMRESGWKLIDPISDFGRMGI
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pF1KB4 PNHHWRITFINKCYELCDTYPALLVVPYRASDDDLRRVATFRSRNRIPVLSWIHPENKTV
::..: :: :. ::.:.::: .::: .. . . :::..:.::::... ::...
CCDS14 PNRNWTITDANRNYEICSTYPPEIVVPKSVTLGTVVGSSKFRSKERVPVLSYLYKENNAA
150 160 170 180 190 200
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 IVRCSQPLVGMSGKRNKDDEKYLDVIRETNKQISKLTIYDARPSVNAVANKATGGGYESD
: :::::: :. : ::: :..: .:: . . . :.::..::.::.:.: :::..
CCDS14 ICRCSQPLSGFY-TRCVDDELLLEAISQTNPGSQFMYVVDTRPKLNAMANRAAGKGYENE
210 220 230 240 250 260
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pF1KB4 DAYHNAELFFLDIHNIHVMRESLKKVKDIVYPNVEE-SHWLSSLESTHWLEHIKLVLTGA
: : : .. :. :.:::::: ::.:. .. .. :..::.:::. ::.::: .. ..
CCDS14 DNYANIRFRFMGIENIHVMRSSLQKLLEVCELKTPTMSEFLSGLESSGWLRHIKAIMDAG
270 280 290 300 310 320
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pF1KB4 IQVADKVSSGKSSVLVHCSDGWDRTAQLTSLAMLMLDSFYRSIEGFEILVQKEWISFGHK
: .. :. :.:::::::::::::::. :.: ..:: :::...:. ::..:::::.:::
CCDS14 IFITKAVKVEKASVLVHCSDGWDRTAQVCSVASILLDPFYRTFKGLMILIEKEWISMGHK
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pF1KB4 FASRIGHGDKNHTDADRSPIFLQFIDCVWQMSKQFPTAFEFNEQFLIIILDHLYSCRFGT
:..: :: : . .. :::: ::.::.::. .::: ::::::.::. : ::..::.::.
CCDS14 FSQRCGHLDGDSKEV--SPIFTQFLDCIWQLMEQFPCAFEFNENFLLEIHDHVFSCQFGN
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pF1KB4 FLFNCESARERQKVTERTVSLWSLINSNKEKFKNPFYTK-EINRVLYPVASMRHLELWVN
:: ::.. :: .: :.: :.: .. . : :.::.: . :: : . ....: .
CCDS14 FLGNCQKDREDLRVYEKTHSVWPFLVQRKPDFRNPLYKGFTMYGVLNPSTVPYNIQFWCG
440 450 460 470 480 490
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pF1KB4 YYIRWNPRIKQQQPNPVEQRYME-LLALRDEY-IKRLEELQLANSAKLSD-PPTSPSSPS
.: :.. : :: .: ..: :: .. . . . . .: .. :. : :: . :
CCDS14 MYNRFD---KGLQP---KQSMLESLLEIKKQRAMLETDVHELEKKLKVRDEPPEEICTCS
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600
pF1KB4 QMMPHVQTHF
:. .. :.
CCDS14 QLGNILSQHLGSPLTNPLGFMGINGDLNTLMENGTLSREGGLRAQMDQVKSQGADLHHNC
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>>CCDS9313.1 MTMR6 gene_id:9107|Hs108|chr13 (621 aa)
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30 40 50 60 70 80
pF1KB4 GVNRDLTEAVPRLPGETLITDKEVIYICPFNGPIKGRVYITNYRLYLRSLETDSSLILDV
: . : .:.: .: . . . . ::
CCDS93 MEHIRTTKVEQVKLLDRFSTSNKSLTGTLYLTATHLLFIDSHQKETWILHH
10 20 30 40 50
90 100 110 120 130 140
pF1KB4 PLGVISRIEKMGGATSRGENSYGLDITCKDMRNLRFALKQEGHSRRDMFEILTRYAFPLA
:. .::.. .:: . : : ::..:...: . .: .. .:... : . . :
CCDS93 H---IASVEKLALTTS----GCPLVIQCKNFRTVHFIVPRE-RDCHDIYNSLLQLS-KQA
60 70 80 90 100
150 160 170 180 190 200
pF1KB4 HSLPLFAFLNEEKFN----VDGWTVYNPVEEYRRQGLPNHHWRITFINKCYELCDTYPAL
. :.:: . : : ..:: . . .:::.:.:.:: ::... :. :..:.:::
CCDS93 KYEDLYAFSYNPKQNDSERLQGWQLIDLAEEYKRMGVPNSHWQLSDANRDYKICETYPRE
110 120 130 140 150 160
210 220 230 240 250 260
pF1KB4 LVVPYRASDDDLRRVATFRSRNRIPVLSWIHPENKTVIVRCSQPLVGMSGKRNKDDEKYL
: :: :: . . :::..:.::::. : .....: :::::: :.:. : .::. :
CCDS93 LYVPRIASKPIIVGSSKFRSKGRFPVLSYYHQDKEAAICRCSQPLSGFSA-RCLEDEHLL
170 180 190 200 210 220
270 280 290 300 310 320
pF1KB4 DVIRETNKQISKLTIYDARPSVNAVANKATGGGYESDDAYHNAELFFLDIHNIHVMRESL
..: ..: . ..:.::..::.::.:.: :::..: : : .. :. :.:::::: ::
CCDS93 QAISKANPVNRYMYVMDTRPKLNAMANRAAGKGYENEDNYSNIRFQFVGIENIHVMRSSL
230 240 250 260 270 280
330 340 350 360 370 380
pF1KB4 KKVKDIV-YPNVEESHWLSSLESTHWLEHIKLVLTGAIQVADKVSSGKSSVLVHCSDGWD
.:. .. .. . . :.:::. ::.::: :. .:: .: .. ..:::::::::::
CCDS93 QKLLEVNGTKGLSVNDFYSGLESSGWLRHIKAVMDAAIFLAKAITVENASVLVHCSDGWD
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pF1KB4 RTAQLTSLAMLMLDSFYRSIEGFEILVQKEWISFGHKFASRIGHGDKNHTDADRSPIFLQ
::.:. ::. :.:::.::.:.:: .:..:.::::::::. : :. : . .. ::.: :
CCDS93 RTSQVCSLGSLLLDSYYRTIKGFMVLIEKDWISFGHKFSERCGQLDGDPKEV--SPVFTQ
350 360 370 380 390
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pF1KB4 FIDCVWQMSKQFPTAFEFNEQFLIIILDHLYSCRFGTFLFNCESARERQKVTERTVSLWS
:..:::....::: ::::.: ::. : .:..::.::.:: ::.. ::. :. :.: :::
CCDS93 FLECVWHLTEQFPQAFEFSEAFLLQIHEHIHSCQFGNFLGNCQKEREELKLKEKTYSLWP
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pF1KB4 LINSNKEKFKNPFYTKEINR--VLYPVASMRHLELWVNYYIRWNPRIKQQQPNPVEQRYM
.. ...:. ::.:..: .: :: : . ....: :.: ... .. .:
CCDS93 FLLEDQKKYLNPLYSSESHRFTVLEPNTVSFNFKFWRNMYHQFDRTLHPRQSVFNIIMNM
460 470 480 490 500 510
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pF1KB4 ELLALRDEYIKRLEELQLANSAKLSDPPTSPSSPSQMMPHVQTHF
CCDS93 NEQNKQLEKDIKDLESKIKQRKNKQTDGILTKELLHSVHPESPNLKTSLCFKEQTLLPVN
520 530 540 550 560 570
>>CCDS34851.1 MTMR7 gene_id:9108|Hs108|chr8 (660 aa)
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60 70 80 90 100 110
pF1KB4 KGRVYITNYRLYLRSLETDSSLILDVPLGVISRIEKMGGATSRGENSYGLDITCKDMRNL
:: :::.. .:. : : : ::... .
CCDS34 LGTLYLTATHVIFVENSPDPRKETWILHSQISTIEKQA-TTATGCP---LLIRCKNFQII
30 40 50 60 70 80
120 130 140 150 160 170
pF1KB4 RFALKQEGHSRRDMFEILTRYAFPLAHS-LPLFAF---LNEEKFNVDGWTVYNPVEEYRR
.. . :: .. .:.. : : : :. . : :.: :..:. . .::.. . ::: :
CCDS34 QLIIPQE-RDCHDVYISLIRLARPVKYEELYCFSFNPMLDKEERE-QGWVLIDLSEEYTR
90 100 110 120 130
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pF1KB4 QGLPNHHWRITFINKCYELCDTYPALLVVPYRASDDDLRRVATFRSRNRIPVLSWIHPEN
.:::::.:... .:. :..::.::. : :: :. . . :::: :.::::. . .:
CCDS34 MGLPNHYWQLSDVNRDYRVCDSYPTELYVPKSATAHIIVGSSKFRSRRRFPVLSYYYKDN
140 150 160 170 180 190
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pF1KB4 KTVIVRCSQPLVGMSGKRNKDDEKYLDVIRETNKQISKLTIYDARPSVNAVANKATGGGY
.. : : :::: :.:. : .::..:..::..: . . . :.::..::.::.:.: ::
CCDS34 HASICRSSQPLSGFSA-RCLEDEQMLQAIRKANPGSDFVYVVDTRPKLNAMANRAAGKGY
200 210 220 230 240 250
300 310 320 330 340 350
pF1KB4 ESDDAYHNAELFFLDIHNIHVMRESLKKVKDIVY---PNVEESHWLSSLESTHWLEHIKL
:..: : : .. :. :.::::::.::.:. .. :.. . : .::.. ::.:::
CCDS34 ENEDNYSNIKFQFIGIENIHVMRNSLQKMLEVCELKSPSMSDFLW--GLENSGWLRHIKA
260 270 280 290 300 310
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pF1KB4 VLTGAIQVADKVSSGKSSVLVHCSDGWDRTAQLTSLAMLMLDSFYRSIEGFEILVQKEWI
.. ..: .: :: .:::::::::::::::. :.: :.:: ::...:: .:..:.::
CCDS34 IMDAGIFIAKAVSEEGASVLVHCSDGWDRTAQVCSVASLLLDPHYRTLKGFMVLIEKDWI
320 330 340 350 360 370
420 430 440 450 460 470
pF1KB4 SFGHKFASRIGHGDKNHTDADRSPIFLQFIDCVWQMSKQFPTAFEFNEQFLIIILDHLYS
:::::: : :. : . . ::.. :::.::::. .::: ::::::.::: : :.::
CCDS34 SFGHKFNHRYGNLDGDPKEI--SPVIDQFIECVWQLMEQFPCAFEFNERFLIHIQHHIYS
380 390 400 410 420 430
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pF1KB4 CRFGTFLFNCESARERQKVTERTVSLWSLINSNKEKFKNPFY----TKEINRVLYPVASM
:.::.:: : .. :.. :. ::: :::. . .:. . ::.. .. . . :..
CCDS34 CQFGNFLCNSQKERRELKIQERTYSLWAHLWKNRADYLNPLFRADHSQTQGTLHLPTTPC
440 450 460 470 480 490
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pF1KB4 RHL-ELWVNYYIRWNPRIKQQQP---------NPVEQRYMELLALRDEYIKRLEELQLAN
. ..: ..: :.. .. .: . ..: :: :: .: .......:: :
CCDS34 NFMYKFWSGMYNRFEKGMQPRQSVTDYLMAVKEETQQLEEELEAL-EERLEKIQKVQL-N
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pF1KB4 SAKLSDPPTSPSSPSQMMPHVQTHF
.:... . ::. :
CCDS34 CTKVKSKQSEPSKHSGFSTSDNSIANTPQDYSGNMKSFPSRSPSQGDEDSALILTQDNLK
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>>CCDS5979.1 MTMR9 gene_id:66036|Hs108|chr8 (549 aa)
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pF1KB4 RDGVNRDLTEAVPRLPGETLITDKEVIYICPFNGPIKGRVYITNYRLYLRSLETDSSLIL
:: ..: . .:...: : : . :.. :
CCDS59 MEFAELIKTPRVDNVVLHRPFYPAVEGTLCLTGHHLILSS-RQDNTEEL
10 20 30 40
90 100 110 120 130 140
pF1KB4 DVPLGVISRIEKMGGATSRGENSYG-LDITCKDMRNLRFALKQEGHSRRDMFEILTRY-A
. . :. :.: : .: : . : :::.: ... . . .. ..: . :
CCDS59 WLLHSNIDAIDK------RFVGSLGTIIIKCKDFRIIQLDIP----GMEECLNIASSIEA
50 60 70 80 90
150 160 170 180 190
pF1KB4 FPLAHSLPL-FAFLNEEKFNV--DGWTVYNPVEEYRRQGLPNHHWRITFINKCYELCDTY
. :. : . :. . :.: ::: . : .:.. . . .::....:: . .: .:
CCDS59 LSTLDSITLMYPFFYRPMFEVIEDGWHSFLPEQEFELYSSATSEWRLSYVNKEFAVCPSY
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KB4 PALLVVPYRASDDDLRRVATFRSRNRIPVLSWIHPENKTVIVRCSQPLVGMSGKRNKDDE
: ...:: .:. ::.::::: .:.::::. : .: ::.: .:::.: .:.: :.::
CCDS59 PPIVTVPKSIDDEALRKVATFRHGGRFPVLSYYHKKNGMVIMRSGQPLTGTNGRRCKEDE
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KB4 KYLDVIRETNKQISKLTIYDARPSVNAVANKATGGGYESDDAYHNAELFFLDIHNIHVMR
: ... ...: . : :.: : ..: :::.:.. : . . . .:. :...
CCDS59 KLINATLRAGK---RGYIIDTRSLNVAQQTRAKGGGFEQEAHYPQWRRIHKSIERYHILQ
220 230 240 250 260 270
320 330 340 350 360 370
pF1KB4 ESLKKVKDIVYPNVEE-SHWLSSLESTHWLEHIKLVLTGAIQVADKVSSGKSSVLVHCSD
::: :. . .... ..:::.::...:: ::: .:: : .:. .. .:.:.: ..
CCDS59 ESLIKLVEACNDQTHNMDRWLSKLEASNWLTHIKEILTTACLAAQCIDREGASILIHGTE
280 290 300 310 320 330
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pF1KB4 GWDRTAQLTSLAMLMLDSFYRSIEGFEILVQKEWISFGHKFASRIGHGDKNHTDAD-RSP
: : : :.::::...:. :.:.::: :...::.. :: : .: ... .: ..:
CCDS59 GTDSTLQVTSLAQIILEPRSRTIRGFEALIEREWLQAGHPFQQRCAQSAYCNTKQKWEAP
340 350 360 370 380 390
440 450 460 470 480 490
pF1KB4 IFLQFIDCVWQMSKQFPTAFEFNEQFLIIILDHLYSCRFGTFLFNCESARERQKVTERTV
.:: :.:::::. .::: .:::::.:::....: :. .::::: : :: : . :. ..:.
CCDS59 VFLLFLDCVWQILRQFPCSFEFNENFLIMLFEHAYASQFGTFLGNNESERCKLKLQQKTM
400 410 420 430 440 450
500 510 520 530 540 550
pF1KB4 SLWSLINSNKE--KFKNPFYTKEINRVLYPVASMRHLELWVNYYIRWNPRIKQQQPNPVE
:::: .:. .: :: ::.. . : :..: .. . : :: . ..::: : ..
CCDS59 SLWSWVNQPSELSKFTNPLFEAN-NLVIWPSVAPQSLPLWEGIFLRWNRSSKY-----LD
460 470 480 490 500
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pF1KB4 QRYMELLALRDEYIKRLEELQLANSAKLSDPPTSPSSPSQMMPHVQTHF
. : :.. . :: :.:.
CCDS59 EAYEEMVNII-EYNKELQAKVNILRRQLAELETEDGMQESP
510 520 530 540
>>CCDS78513.1 MTMR1 gene_id:8776|Hs108|chrX (363 aa)
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10 20
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]