Result of FASTA (ccds) for
pF1KB4122
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4122, 614 aa
1>>>pF1KB4122 614 - 614 aa - 614 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6244+/- 0.001; mu= 18.5917+/- 0.060
mean_var=86.0577+/-17.078, 0's: 0 Z-trim(105.3): 80 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.138255
statistics sampled from 8275 (8356) to 8275 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.623), E-opt: 0.2 (0.257), width: 16
Scan time: 3.470
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11659.1 DDX5 gene_id:1655|Hs108|chr17 ( 614) 4159 840.0 0
CCDS82190.1 DDX5 gene_id:1655|Hs108|chr17 ( 614) 4062 820.6 0
CCDS46706.1 DDX17 gene_id:10521|Hs108|chr22 ( 731) 2676 544.2 2.2e-154
CCDS33646.1 DDX17 gene_id:10521|Hs108|chr22 ( 729) 2666 542.2 8.7e-154
CCDS32704.1 DDX42 gene_id:11325|Hs108|chr17 ( 938) 1231 256.1 1.5e-67
CCDS34240.1 DDX46 gene_id:9879|Hs108|chr5 (1031) 1215 252.9 1.5e-66
CCDS75306.1 DDX46 gene_id:9879|Hs108|chr5 (1032) 1215 252.9 1.5e-66
CCDS4977.1 DDX43 gene_id:55510|Hs108|chr6 ( 648) 1171 244.0 4.6e-64
CCDS35214.1 DDX53 gene_id:168400|Hs108|chrX ( 631) 1130 235.8 1.3e-61
CCDS47208.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 690) 1000 209.9 9e-54
CCDS54854.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 704) 1000 209.9 9.1e-54
CCDS3969.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 724) 1000 209.9 9.3e-54
CCDS54855.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 575) 998 209.4 1e-53
CCDS55404.1 DDX3X gene_id:1654|Hs108|chrX ( 646) 990 207.9 3.4e-53
CCDS43931.1 DDX3X gene_id:1654|Hs108|chrX ( 662) 990 207.9 3.5e-53
CCDS14782.1 DDX3Y gene_id:8653|Hs108|chrY ( 660) 973 204.5 3.6e-52
CCDS30964.1 DDX59 gene_id:83479|Hs108|chr1 ( 619) 819 173.8 6.1e-43
CCDS8655.1 DDX47 gene_id:51202|Hs108|chr12 ( 455) 726 155.1 1.8e-37
CCDS73144.1 DDX21 gene_id:9188|Hs108|chr10 ( 715) 725 155.1 3e-37
CCDS4427.1 DDX41 gene_id:51428|Hs108|chr5 ( 622) 724 154.8 3.1e-37
CCDS31211.1 DDX21 gene_id:9188|Hs108|chr10 ( 783) 725 155.1 3.2e-37
CCDS7283.1 DDX50 gene_id:79009|Hs108|chr10 ( 737) 696 149.3 1.7e-35
CCDS11767.1 EIF4A3 gene_id:9775|Hs108|chr17 ( 411) 678 145.5 1.3e-34
CCDS13416.1 DDX27 gene_id:55661|Hs108|chr20 ( 796) 680 146.1 1.6e-34
CCDS3282.1 EIF4A2 gene_id:1974|Hs108|chr3 ( 407) 676 145.1 1.7e-34
CCDS11113.1 EIF4A1 gene_id:1973|Hs108|chr17 ( 406) 672 144.3 2.9e-34
CCDS12390.1 DDX49 gene_id:54555|Hs108|chr19 ( 483) 650 140.0 7e-33
CCDS31907.1 DDX54 gene_id:79039|Hs108|chr12 ( 881) 627 135.6 2.7e-31
CCDS44984.1 DDX54 gene_id:79039|Hs108|chr12 ( 882) 627 135.6 2.7e-31
CCDS2120.1 DDX18 gene_id:8886|Hs108|chr2 ( 670) 618 133.7 7.6e-31
CCDS8342.1 DDX10 gene_id:1662|Hs108|chr11 ( 875) 612 132.6 2.1e-30
CCDS11323.1 DDX52 gene_id:11056|Hs108|chr17 ( 599) 602 130.5 6.3e-30
CCDS12308.1 DDX39A gene_id:10212|Hs108|chr19 ( 427) 554 120.8 3.7e-27
CCDS4697.1 DDX39B gene_id:7919|Hs108|chr6 ( 428) 546 119.2 1.1e-26
CCDS44766.1 DDX25 gene_id:29118|Hs108|chr11 ( 483) 534 116.8 6.5e-26
CCDS81646.1 DDX25 gene_id:29118|Hs108|chr11 ( 369) 519 113.8 4.2e-25
CCDS58511.1 EIF4A1 gene_id:1973|Hs108|chr17 ( 347) 508 111.6 1.8e-24
CCDS842.1 DDX20 gene_id:11218|Hs108|chr1 ( 824) 510 112.2 2.7e-24
CCDS44751.1 DDX6 gene_id:1656|Hs108|chr11 ( 483) 499 109.9 8.2e-24
CCDS10888.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16 ( 479) 472 104.5 3.4e-22
CCDS10889.1 DDX19A gene_id:55308|Hs108|chr16 ( 478) 467 103.5 6.8e-22
CCDS42187.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16 ( 370) 447 99.4 8.8e-21
CCDS8770.1 DDX23 gene_id:9416|Hs108|chr12 ( 820) 437 97.7 6.5e-20
CCDS32475.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16 ( 448) 421 94.3 3.7e-19
CCDS58478.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16 ( 453) 421 94.3 3.8e-19
CCDS82009.1 DDX19A gene_id:55308|Hs108|chr16 ( 447) 419 93.9 4.9e-19
CCDS9251.1 DDX55 gene_id:57696|Hs108|chr12 ( 600) 403 90.8 5.6e-18
CCDS6952.1 DDX31 gene_id:64794|Hs108|chr9 ( 585) 400 90.2 8.4e-18
CCDS73782.1 BLM gene_id:641|Hs108|chr15 (1286) 294 69.3 3.6e-11
CCDS10363.1 BLM gene_id:641|Hs108|chr15 (1417) 294 69.3 3.8e-11
>>CCDS11659.1 DDX5 gene_id:1655|Hs108|chr17 (614 aa)
initn: 4159 init1: 4159 opt: 4159 Z-score: 4484.9 bits: 840.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4159; 100.0% identity (100.0% similar) in 614 aa overlap (1-614:1-614)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MSGYSSDRDRGRDRGFGAPRFGGSRAGPLSGKKFGNPGEKLVKKKWNLDELPKFEKNFYQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MSGYSSDRDRGRDRGFGAPRFGGSRAGPLSGKKFGNPGEKLVKKKWNLDELPKFEKNFYQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 EHPDLARRTAQEVETYRRSKEITVRGHNCPKPVLNFYEANFPANVMDVIARQNFTEPTAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 EHPDLARRTAQEVETYRRSKEITVRGHNCPKPVLNFYEANFPANVMDVIARQNFTEPTAI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 QAQGWPVALSGLDMVGVAQTGSGKTLSYLLPAIVHINHQPFLERGDGPICLVLAPTRELA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 QAQGWPVALSGLDMVGVAQTGSGKTLSYLLPAIVHINHQPFLERGDGPICLVLAPTRELA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 QQVQQVAAEYCRACRLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLECGKTNLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 QQVQQVAAEYCRACRLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLECGKTNLR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 RTTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRPDRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLKDYIHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RTTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRPDRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLKDYIHI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 NIGALELSANHNILQIVDVCHDVEKDEKLIRLMEEIMSEKENKTIVFVETKRRCDELTRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 NIGALELSANHNILQIVDVCHDVEKDEKLIRLMEEIMSEKENKTIVFVETKRRCDELTRK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 MRRDGWPAMGIHGDKSQQERDWVLNEFKHGKAPILIATDVASRGLDVEDVKFVINYDYPN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MRRDGWPAMGIHGDKSQQERDWVLNEFKHGKAPILIATDVASRGLDVEDVKFVINYDYPN
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 SSEDYIHRIGRTARSTKTGTAYTFFTPNNIKQVSDLISVLREANQAINPKLLQLVEDRGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SSEDYIHRIGRTARSTKTGTAYTFFTPNNIKQVSDLISVLREANQAINPKLLQLVEDRGS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 GRSRGRGGMKDDRRDRYSAGKRGGFNTFRDRENYDRGYSSLLKRDFGAKTQNGVYSAANY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GRSRGRGGMKDDRRDRYSAGKRGGFNTFRDRENYDRGYSSLLKRDFGAKTQNGVYSAANY
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 TNGSFGSNFVSAGIQTSFRTGNPTGTYQNGYDSTQQYGSNVPNMHNGMNQQAYAYPATAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TNGSFGSNFVSAGIQTSFRTGNPTGTYQNGYDSTQQYGSNVPNMHNGMNQQAYAYPATAA
550 560 570 580 590 600
610
pF1KB4 APMIGYPMPTGYSQ
::::::::::::::
CCDS11 APMIGYPMPTGYSQ
610
>>CCDS82190.1 DDX5 gene_id:1655|Hs108|chr17 (614 aa)
initn: 4053 init1: 4053 opt: 4062 Z-score: 4380.3 bits: 820.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4062; 99.2% identity (99.5% similar) in 606 aa overlap (9-614:9-614)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MSGYSSDRDRGRDRGFGAPRFGGSRAGPLSGKKFGNPGEKLVKKKWNLDELPKFEKNFYQ
:.: . :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 MKAGRFEADEGTSVRFGAPRFGGSRAGPLSGKKFGNPGEKLVKKKWNLDELPKFEKNFYQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 EHPDLARRTAQEVETYRRSKEITVRGHNCPKPVLNFYEANFPANVMDVIARQNFTEPTAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 EHPDLARRTAQEVETYRRSKEITVRGHNCPKPVLNFYEANFPANVMDVIARQNFTEPTAI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 QAQGWPVALSGLDMVGVAQTGSGKTLSYLLPAIVHINHQPFLERGDGPICLVLAPTRELA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 QAQGWPVALSGLDMVGVAQTGSGKTLSYLLPAIVHINHQPFLERGDGPICLVLAPTRELA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 QQVQQVAAEYCRACRLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLECGKTNLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 QQVQQVAAEYCRACRLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLECGKTNLR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 RTTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRPDRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLKDYIHI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 RTTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRPDRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLKDYIHI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 NIGALELSANHNILQIVDVCHDVEKDEKLIRLMEEIMSEKENKTIVFVETKRRCDELTRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 NIGALELSANHNILQIVDVCHDVEKDEKLIRLMEEIMSEKENKTIVFVETKRRCDELTRK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 MRRDGWPAMGIHGDKSQQERDWVLNEFKHGKAPILIATDVASRGLDVEDVKFVINYDYPN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 MRRDGWPAMGIHGDKSQQERDWVLNEFKHGKAPILIATDVASRGLDVEDVKFVINYDYPN
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 SSEDYIHRIGRTARSTKTGTAYTFFTPNNIKQVSDLISVLREANQAINPKLLQLVEDRGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 SSEDYIHRIGRTARSTKTGTAYTFFTPNNIKQVSDLISVLREANQAINPKLLQLVEDRGS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 GRSRGRGGMKDDRRDRYSAGKRGGFNTFRDRENYDRGYSSLLKRDFGAKTQNGVYSAANY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 GRSRGRGGMKDDRRDRYSAGKRGGFNTFRDRENYDRGYSSLLKRDFGAKTQNGVYSAANY
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 TNGSFGSNFVSAGIQTSFRTGNPTGTYQNGYDSTQQYGSNVPNMHNGMNQQAYAYPATAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 TNGSFGSNFVSAGIQTSFRTGNPTGTYQNGYDSTQQYGSNVPNMHNGMNQQAYAYPATAA
550 560 570 580 590 600
610
pF1KB4 APMIGYPMPTGYSQ
::::::::::::::
CCDS82 APMIGYPMPTGYSQ
610
>>CCDS46706.1 DDX17 gene_id:10521|Hs108|chr22 (731 aa)
initn: 2426 init1: 2305 opt: 2676 Z-score: 2885.2 bits: 544.2 E(32554): 2.2e-154
Smith-Waterman score: 2721; 67.9% identity (81.1% similar) in 645 aa overlap (3-612:83-717)
10 20 30
pF1KB4 MSGYSSDRDRGRDRGFGAPRFGGSRAGPLSGK
: .:::: :::: : ::. .: : :
CCDS46 VVTRPEPQALPSPAIRAPLPDLYPFGTMRGGGFGDRDRDRDRG-G---FGARGGGGLPPK
60 70 80 90 100
40 50 60 70 80 90
pF1KB4 KFGNPGEKLVKKKWNLDELPKFEKNFYQEHPDLARRTAQEVETYRRSKEITVRGHN-CPK
:::::::.: ::::.:.:::::::::: :::..:: : ::. ::.::::::: . :::
CCDS46 KFGNPGERLRKKKWDLSELPKFEKNFYVEHPEVARLTPYEVDELRRKKEITVRGGDVCPK
110 120 130 140 150 160
100 110 120 130 140 150
pF1KB4 PVLNFYEANFPANVMDVIARQNFTEPTAIQAQGWPVALSGLDMVGVAQTGSGKTLSYLLP
::. :..:::: ::::. :.::::: :: ::.:.:::: ::::.:::::::::.::::
CCDS46 PVFAFHHANFPQYVMDVLMDQHFTEPTPIQCQGFPLALSGRDMVGIAQTGSGKTLAYLLP
170 180 190 200 210 220
160 170 180 190 200 210
pF1KB4 AIVHINHQPFLERGDGPICLVLAPTRELAQQVQQVAAEYCRACRLKSTCIYGGAPKGPQI
:::::::::.:::::::::::::::::::::::::: .: . :::::::::::::::::
CCDS46 AIVHINHQPYLERGDGPICLVLAPTRELAQQVQQVADDYGKCSRLKSTCIYGGAPKGPQI
230 240 250 260 270 280
220 230 240 250 260 270
pF1KB4 RDLERGVEICIATPGRLIDFLECGKTNLRRTTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRP
:::::::::::::::::::::: ::::::: :::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 RDLERGVEICIATPGRLIDFLESGKTNLRRCTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRP
290 300 310 320 330 340
280 290 300 310 320 330
pF1KB4 DRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLKDYIHINIGALELSANHNILQIVDVCHDVEKDEKLIR
:::::::::::::::::::::::.:: .::.: :::::::::::::::: . :::.:::.
CCDS46 DRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLRDYTQINVGNLELSANHNILQIVDVCMESEKDHKLIQ
350 360 370 380 390 400
340 350 360 370 380 390
pF1KB4 LMEEIMSEKENKTIVFVETKRRCDELTRKMRRDGWPAMGIHGDKSQQERDWVLNEFKHGK
::::::.:::::::.:::::::::.:::.::::::::: ::::::: :::::::::. ::
CCDS46 LMEEIMAEKENKTIIFVETKRRCDDLTRRMRRDGWPAMCIHGDKSQPERDWVLNEFRSGK
410 420 430 440 450 460
400 410 420 430 440 450
pF1KB4 APILIATDVASRGLDVEDVKFVINYDYPNSSEDYIHRIGRTARSTKTGTAYTFFTPNNIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::. :::::::::.:.:
CCDS46 APILIATDVASRGLDVEDVKFVINYDYPNSSEDYVHRIGRTARSTNKGTAYTFFTPGNLK
470 480 490 500 510 520
460 470 480 490
pF1KB4 QVSDLISVLREANQAINPKLLQLVEDRGSGRSRGRGG---------------MKDDRRDR
:. .::.::.::::::::::.:::. ::.: . :.:: : .:. ::
CCDS46 QARELIKVLEEANQAINPKLMQLVDHRGGGGGGGKGGRSRYRTTSSANNPNLMYQDECDR
530 540 550 560 570 580
500 510 520 530 540
pF1KB4 YSAG-KRGGFN---TFRDRENYDR-------GYSSLLKRDFGAKTQN-----GVYSAANY
: : :: ..::: . :: ::.: . :::.. . :.:.:: :
CCDS46 RLRGVKDGGRRDSASYRDRSETDRAGYANGSGYGSP-NSAFGAQAGQYTYGQGTYGAAAY
590 600 610 620 630 640
550 560 570 580 590
pF1KB4 TNGSFGSNFVSAGIQTSFRTGNPTGTYQNGYDSTQQY---GSNVPNMHNGMNQQAYAYPA
..:. .. .:: .. ... :.: ... .:.::. : . . . :.:: .: :
CCDS46 GTSSYTAQEYGAG---TYGASSTTSTGRSSQSSSQQFSGIGRSGQQPQPLMSQQ-FAQPP
650 660 670 680 690 700
600 610
pF1KB4 TAAAPMIGYPMPTGYSQ
.:. :::: :.:
CCDS46 -GATNMIGYMGQTAYQYPPPPPPPPPSRK
710 720 730
>>CCDS33646.1 DDX17 gene_id:10521|Hs108|chr22 (729 aa)
initn: 2407 init1: 2286 opt: 2666 Z-score: 2874.5 bits: 542.2 E(32554): 8.7e-154
Smith-Waterman score: 2713; 68.3% identity (81.2% similar) in 643 aa overlap (3-612:83-715)
10 20 30
pF1KB4 MSGYSSDRDRGRDRGFGAPRFGGSRAGPLSGK
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CCDS33 VVTRPEPQALPSPAIRAPLPDLYPFGTMRGGGFGDRDRDRDRG-G---FGARGGGGLPPK
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pF1KB4 KFGNPGEKLVKKKWNLDELPKFEKNFYQEHPDLARRTAQEVETYRRSKEITVRGHN-CPK
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CCDS33 KFGNPGERLRKKKWDLSELPKFEKNFYVEHPEVARLTPYEVDELRRKKEITVRGGDVCPK
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pF1KB4 PVLNFYEANFPANVMDVIARQNFTEPTAIQAQGWPVALSGLDMVGVAQTGSGKTLSYLLP
::. :..:::: ::::. :.::::: :: ::.:.:::: ::::.:::::::::.::::
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:::::::::.:::::::::::::::::::::::::: .: . :::::::::::::::::
CCDS33 AIVHINHQPYLERGDGPICLVLAPTRELAQQVQQVADDYGKCSRLKSTCIYGGAPKGPQI
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220 230 240 250 260 270
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:::::::::::::::::::::: ::::::: :::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 RDLERGVEICIATPGRLIDFLESGKTNLRRCTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRP
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280 290 300 310 320 330
pF1KB4 DRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLKDYIHINIGALELSANHNILQIVDVCHDVEKDEKLIR
:::::::::::::::::::::::.:: .::.: :::::::::::::::: . :::.:::.
CCDS33 DRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLRDYTQINVGNLELSANHNILQIVDVCMESEKDHKLIQ
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::::::.:::::::.:::::::::.:::.::::::::: ::::::: :::::::::. ::
CCDS33 LMEEIMAEKENKTIIFVETKRRCDDLTRRMRRDGWPAMCIHGDKSQPERDWVLNEFRSGK
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pF1KB4 APILIATDVASRGLDVEDVKFVINYDYPNSSEDYIHRIGRTARSTKTGTAYTFFTPNNIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::. :::::::::.:.:
CCDS33 APILIATDVASRGLDVEDVKFVINYDYPNSSEDYVHRIGRTARSTNKGTAYTFFTPGNLK
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pF1KB4 QVSDLISVLREANQAINPKLLQLVEDRGSG-----RSRGRGG--------MKDDRRDRYS
:. .::.::.::::::::::.:::. ::.: ::: : : .:. ::
CCDS33 QARELIKVLEEANQAINPKLMQLVDHRGGGGGGGGRSRYRTTSSANNPNLMYQDECDRRL
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pF1KB4 AG-KRGGFN---TFRDRENYDR-------GYSSLLKRDFGAKTQN-----GVYSAANYTN
: : :: ..::: . :: ::.: . :::.. . :.:.:: : .
CCDS33 RGVKDGGRRDSASYRDRSETDRAGYANGSGYGSP-NSAFGAQAGQYTYGQGTYGAAAYGT
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pF1KB4 GSFGSNFVSAGIQTSFRTGNPTGTYQNGYDSTQQY---GSNVPNMHNGMNQQAYAYPATA
.:. .. .:: .. ... :.: ... .:.::. : . . . :.:: .: : .
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pF1KB4 AAPMIGYPMPTGYSQ
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CCDS33 ATNMIGYMGQTAYQYPPPPPPPPPSRK
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pF1KB4 TYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRPDRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLKDYIHINI
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CCDS32 SYLVFDEADRMFDMGFEYQVRSIASHVRPDRQTLLFSATFRKKIEKLARDILIDPIRVVQ
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pF1KB4 SEDYIHRIGRTARSTKTGTAYTFFTPNNIKQVSDLISVLREANQAINPKLLQL-VEDRGS
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CCDS32 IDTHTHRIGRTGRAGEKGVAYTLLTPKDSNFAGDLVRNLEGANQHVSKELLDLAMQNAWF
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.:: .:: . . . : :: .:.: ::.::: ..... . : ..:..
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CCDS32 GDRLTAMKAAFQSQYKSHFVAASL-SNQKAGSSAAGASGWTSAGSLNSVPTNSAQQGHNS
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pF1KB4 YAYPATAAAPMIGYPMPTGYSQ
:.:.:: : :
CCDS32 PDSPVTSAAK--GIPGFGNTGNISGAPVTYPSAGAQGVNNTASGNNSREGTGGSNGKRER
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CCDS34 QVIV---IEEEKKFLKLLELLGHYQESGSVIIFVDKQEHADGLLKDLMRASYPCMSLHGG
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. . : ::::.: .. . ..:.:..:. .. :. : : .: : . . ...:.
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CCDS34 FSGKGFKFDETEQALANERKKLQKAALGLQDSDDEDAAVDIDEQIESMFNSKKRVKDMAA
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pF1KB4 RFGGSRAGPLSGKKFGNPGEKLVKKKWNLDELPKFEKNFYQEHPDLARRTAQEVETYRRS
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CCDS75 MEGITVKGKGCPKPIKSWVQCGISMKILNSLKKHGYEKPTPIQTQAIPAIMSGRDLIGIA
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pF1KB4 QTGSGKTLSYLLPAIVHINHQPFLERGDGPICLVLAPTRELAQQVQQVAAEYCRACRLKS
.::::::...::: . :: : ::.:.::: ....:::::: :. . .. .. :.
CCDS75 KTGSGKTIAFLLPMFRHIMDQRSLEEGEGPIAVIMTPTRELALQITKECKKFSKTLGLRV
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pF1KB4 TCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFL--ECGK-TNLRRTTYLVLDEADRMLD
.:.:::. . :: .:.::.:: . ::::.::.: . :. :::::.::.::::::::.:
CCDS75 VCVYGGTGISEQIAELKRGAEIIVCTPGRMIDMLAANSGRVTNLRRVTYVVLDEADRMFD
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pF1KB4 MGFEPQIRKIVDQIRPDRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLKDYIHINIGALELSANHNILQ
::::::. .:::..::::::.:.:::.:. .. ::. .:. :....:. . . .. :
CCDS75 MGFEPQVMRIVDNVRPDRQTVMFSATFPRAMEALARRILSKPIEVQVGGRSVVCS-DVEQ
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pF1KB4 IVDVCHDVEKDEKLIRLMEEIMSEKENKT-IVFVETKRRCDELTRKMRRDGWPAMGIHGD
: : .:...:...:.: . .:. . :.::. ... : : . . : ..: :..::
CCDS75 QVIV---IEEEKKFLKLLELLGHYQESGSVIIFVDKQEHADGLLKDLMRASYPCMSLHGG
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pF1KB4 KSQQERDWVLNEFKHGKAPILIATDVASRGLDVEDVKFVINYDYPNSSEDYIHRIGRTAR
.: .:: ..:.::.: .:.::.::.:::::. . .:.::. :: :::.:: :::.:
CCDS75 IDQYDRDSIINDFKNGTCKLLVATSVAARGLDVKHLILVVNYSCPNHYEDYVHRAGRTGR
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pF1KB4 STKTGTAYTFFTPNNIKQVSDLISVLREANQAINPKLLQLVED-RGSGRSRGRGGMKDDR
. . : ::::.: .. . ..:.:..:. .. :. : : .: : . . ...:.
CCDS75 AGNKGYAYTFITEDQARYAGDIIKALELSGTAVPPDLEKLWSDFKDQQKAEGKIIKKSSG
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pF1KB4 RDRYSAGKRGGFNTFRDRENYDRGYSSLLKRDFGAKTQNGVYSAANYTNGSFGSNFVSAG
CCDS75 FSGKGFKFDETEQALANERKKLQKAALGLQDSDDEDAAVDIDEQIESMFNSKKRVKDMAA
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CCDS49 AKAVIDNFVKKLEENYNSECGIDTAFQPSVGKDGSTDNNVVAGDR--PLIDWDQIREEGL
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pF1KB4 KLVKKKWNLDELPKFEKNFYQEHPDLARRTAQEVETYRRSK-EITVR----GHN--CPKP
: : :: .:: ..::::.: . . :....:. . .:: :.. :.:
CCDS49 KWQKTKWA--DLPPIKKNFYKESTATSAMSKVEADSWRKENFNITWDDLKDGEKRPIPNP
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pF1KB4 VLNFYEA--NFPANVMDVIARQNFTEPTAIQAQGWPVALSGLDMVGVAQTGSGKTLSYLL
. .: .: .: .::. : . .: .:: ::.:.::..:.:.:..::::::.:::: ::.
CCDS49 TCTFDDAFQCYP-EVMENIKKAGFQKPTPIQSQAWPIVLQGIDLIGVAQTGTGKTLCYLM
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pF1KB4 PAIVHINHQPFLE-RGDGPICLVLAPTRELAQQVQQVAAEYCRACR--LKSTCIYGGAPK
:...:. :: :. . . : :::.:::::: ::. .: :. :.:.:.:::. .
CCDS49 PGFIHLVLQPSLKGQRNRPGMLVLTPTRELALQVE---GECCKYSYKGLRSVCVYGGGNR
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pF1KB4 GPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLECGKTNLRRTTYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVD
::..:..::.: ::::::: :. . .::. :::::::::.:::::::::: ::.
CCDS49 DEQIEELKKGVDIIIATPGRLNDLQMSNFVNLKNITYLVLDEADKMLDMGFEPQIMKILL
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pF1KB4 QIRPDRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLKDYIHINIGALELSANHNILQIVDVCHDVEKDE
..::::::.: :::::. :..::...::. . . .:.:.: : .. : . : . ::
CCDS49 DVRPDRQTVMTSATWPHSVHRLAQSYLKEPMIVYVGTLDLVAVSSVKQNIIVTTEEEKWS
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pF1KB4 KLIRLMEEIMSEKENKTIVFVETKRRCDELTRKMRRDGWPAMGIHGDKSQQERDWVLNEF
.. ... . : .:.:::: : :.:. . . . ..:::. :..:. .:..:
CCDS49 HMQTFLQSMSS--TDKVIVFVSRKAVADHLSSDLILGNISVESLHGDREQRDREKALENF
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pF1KB4 KHGKAPILIATDVASRGLDVEDVKFVINYDYPNSSEDYIHRIGRTARSTKTGTAYTFFTP
: ::. ::::::.:::::::.:: : :.:.: . :.:.::::::.:. .::.. : .:
CCDS49 KTGKVRILIATDLASRGLDVHDVTHVYNFDFPRNIEEYVHRIGRTGRAGRTGVSITTLTR
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pF1KB4 NNIKQVSDLISVLREANQAINPKLLQLVEDRGSGRSRGRGGMKDDRRDRYSAGKRGGFNT
:. . .:.::..:..:::.: .:....:
CCDS49 NDWRVASELINILERANQSIPEELVSMAERFKAHQQKREMERKMERPQGRPKKFH
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pF1KB4 DRGFGAPRFGGSRAGPLSGKKFGNPGEKLVKKKWNLDELPKFEKNFYQEHPDLARRTAQE
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CCDS35 GRNLGRNDIVGEAEPLSNWDRIRAAVVECEKRKWA--DLPPVKKNFYIESKATSCMSEMQ
140 150 160 170 180 190
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pF1KB4 VETYRRSK-EITV----RGHN--CPKPVLNFYEA--NFPANVMDVIARQNFTEPTAIQAQ
: ..:. . .:: :.. :::. : .: ..: ... : : ....:: ::.:
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