Result of FASTA (ccds) for
pF1KB4125
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4125, 1050 aa
1>>>pF1KB4125 1050 - 1050 aa - 1050 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.6572+/-0.00104; mu= -1.1528+/- 0.062
mean_var=317.9024+/-65.459, 0's: 0 Z-trim(114.4): 102 B-trim: 195 in 1/51
Lambda= 0.071933
statistics sampled from 14903 (15004) to 14903 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.761), E-opt: 0.2 (0.461), width: 16
Scan time: 4.660
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS5847.1 TRIM24 gene_id:8805|Hs108|chr7 (1050) 7175 759.0 1.1e-218
CCDS47720.1 TRIM24 gene_id:8805|Hs108|chr7 (1016) 3750 403.6 1.1e-111
CCDS873.1 TRIM33 gene_id:51592|Hs108|chr1 (1110) 3161 342.5 3e-93
CCDS872.1 TRIM33 gene_id:51592|Hs108|chr1 (1127) 2942 319.8 2.1e-86
CCDS12985.1 TRIM28 gene_id:10155|Hs108|chr19 ( 835) 949 112.9 3e-24
>>CCDS5847.1 TRIM24 gene_id:8805|Hs108|chr7 (1050 aa)
initn: 7175 init1: 7175 opt: 7175 Z-score: 4039.3 bits: 759.0 E(32554): 1.1e-218
Smith-Waterman score: 7175; 100.0% identity (100.0% similar) in 1050 aa overlap (1-1050:1-1050)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MEVAVEKAVAAAAAASAAASGGPSAAPSGENEAESRQGPDSERGGEAARLNLLDTCAVCH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MEVAVEKAVAAAAAASAAASGGPSAAPSGENEAESRQGPDSERGGEAARLNLLDTCAVCH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 QNIQSRAPKLLPCLHSFCQRCLPAPQRYLMLPAPMLGSAETPPPVPAPGSPVSGSSPFAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 QNIQSRAPKLLPCLHSFCQRCLPAPQRYLMLPAPMLGSAETPPPVPAPGSPVSGSSPFAT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 QVGVIRCPVCSQECAERHIIDNFFVKDTTEVPSSTVEKSNQVCTSCEDNAEANGFCVECV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 QVGVIRCPVCSQECAERHIIDNFFVKDTTEVPSSTVEKSNQVCTSCEDNAEANGFCVECV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 EWLCKTCIRAHQRVKFTKDHTVRQKEEVSPEAVGVTSQRPVFCPFHKKEQLKLYCETCDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 EWLCKTCIRAHQRVKFTKDHTVRQKEEVSPEAVGVTSQRPVFCPFHKKEQLKLYCETCDK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 LTCRDCQLLEHKEHRYQFIEEAFQNQKVIIDTLITKLMEKTKYIKFTGNQIQNRIIEVNQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LTCRDCQLLEHKEHRYQFIEEAFQNQKVIIDTLITKLMEKTKYIKFTGNQIQNRIIEVNQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 NQKQVEQDIKVAIFTLMVEINKKGKALLHQLESLAKDHRMKLMQQQQEVAGLSKQLEHVM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 NQKQVEQDIKVAIFTLMVEINKKGKALLHQLESLAKDHRMKLMQQQQEVAGLSKQLEHVM
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 HFSKWAVSSGSSTALLYSKRLITYRLRHLLRARCDASPVTNNTIQFHCDPSFWAQNIINL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 HFSKWAVSSGSSTALLYSKRLITYRLRHLLRARCDASPVTNNTIQFHCDPSFWAQNIINL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 GSLVIEDKESQPQMPKQNPVVEQNSQPPSGLSSNQLSKFPTQISLAQLRLQHMQQQVMAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GSLVIEDKESQPQMPKQNPVVEQNSQPPSGLSSNQLSKFPTQISLAQLRLQHMQQQVMAQ
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 RQQVQRRPAPVGLPNPRMQGPIQQPSISHQQPPPRLINFQNHSPKPNGPVLPPHPQQLRY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RQQVQRRPAPVGLPNPRMQGPIQQPSISHQQPPPRLINFQNHSPKPNGPVLPPHPQQLRY
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 PPNQNIPRQAIKPNPLQMAFLAQQAIKQWQISSGQGTPSTTNSTSSTPSSPTITSAAGYD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PPNQNIPRQAIKPNPLQMAFLAQQAIKQWQISSGQGTPSTTNSTSSTPSSPTITSAAGYD
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 GKAFGSPMIDLSSPVGGSYNLPSLPDIDCSSTIMLDNIVRKDTNIDHGQPRPPSNRTVQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GKAFGSPMIDLSSPVGGSYNLPSLPDIDCSSTIMLDNIVRKDTNIDHGQPRPPSNRTVQS
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB4 PNSSVPSPGLAGPVTMTSVHPPIRSPSASSVGSRGSSGSSSKPAGADSTHKVPVVMLEPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PNSSVPSPGLAGPVTMTSVHPPIRSPSASSVGSRGSSGSSSKPAGADSTHKVPVVMLEPI
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB4 RIKQENSGPPENYDFPVVIVKQESDEESRPQNANYPRSILTSLLLNSSQSSTSEETVLRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RIKQENSGPPENYDFPVVIVKQESDEESRPQNANYPRSILTSLLLNSSQSSTSEETVLRS
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB4 DAPDSTGDQPGLHQDNSSNGKSEWLDPSQKSPLHVGETRKEDDPNEDWCAVCQNGGELLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 DAPDSTGDQPGLHQDNSSNGKSEWLDPSQKSPLHVGETRKEDDPNEDWCAVCQNGGELLC
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB4 CEKCPKVFHLSCHVPTLTNFPSGEWICTFCRDLSKPEVEYDCDAPSHNSEKKKTEGLVKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 CEKCPKVFHLSCHVPTLTNFPSGEWICTFCRDLSKPEVEYDCDAPSHNSEKKKTEGLVKL
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB4 TPIDKRKCERLLLFLYCHEMSLAFQDPVPLTVPDYYKIIKNPMDLSTIKKRLQEDYSMYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 TPIDKRKCERLLLFLYCHEMSLAFQDPVPLTVPDYYKIIKNPMDLSTIKKRLQEDYSMYS
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB4 KPEDFVADFRLIFQNCAEFNEPDSEVANAGIKLENYFEELLKNLYPEKRFPKPEFRNESE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 KPEDFVADFRLIFQNCAEFNEPDSEVANAGIKLENYFEELLKNLYPEKRFPKPEFRNESE
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050
pF1KB4 DNKFSDDSDDDFVQPRKKRLKSIEERQLLK
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 DNKFSDDSDDDFVQPRKKRLKSIEERQLLK
1030 1040 1050
>>CCDS47720.1 TRIM24 gene_id:8805|Hs108|chr7 (1016 aa)
initn: 3730 init1: 3730 opt: 3750 Z-score: 2118.5 bits: 403.6 E(32554): 1.1e-111
Smith-Waterman score: 6856; 96.8% identity (96.8% similar) in 1050 aa overlap (1-1050:1-1016)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MEVAVEKAVAAAAAASAAASGGPSAAPSGENEAESRQGPDSERGGEAARLNLLDTCAVCH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MEVAVEKAVAAAAAASAAASGGPSAAPSGENEAESRQGPDSERGGEAARLNLLDTCAVCH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 QNIQSRAPKLLPCLHSFCQRCLPAPQRYLMLPAPMLGSAETPPPVPAPGSPVSGSSPFAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 QNIQSRAPKLLPCLHSFCQRCLPAPQRYLMLPAPMLGSAETPPPVPAPGSPVSGSSPFAT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 QVGVIRCPVCSQECAERHIIDNFFVKDTTEVPSSTVEKSNQVCTSCEDNAEANGFCVECV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 QVGVIRCPVCSQECAERHIIDNFFVKDTTEVPSSTVEKSNQVCTSCEDNAEANGFCVECV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 EWLCKTCIRAHQRVKFTKDHTVRQKEEVSPEAVGVTSQRPVFCPFHKKEQLKLYCETCDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 EWLCKTCIRAHQRVKFTKDHTVRQKEEVSPEAVGVTSQRPVFCPFHKKEQLKLYCETCDK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 LTCRDCQLLEHKEHRYQFIEEAFQNQKVIIDTLITKLMEKTKYIKFTGNQIQNRIIEVNQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LTCRDCQLLEHKEHRYQFIEEAFQNQKVIIDTLITKLMEKTKYIKFTGNQIQNRIIEVNQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 NQKQVEQDIKVAIFTLMVEINKKGKALLHQLESLAKDHRMKLMQQQQEVAGLSKQLEHVM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 NQKQVEQDIKVAIFTLMVEINKKGKALLHQLESLAKDHRMKLMQQQQEVAGLSKQLEHVM
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 HFSKWAVSSGSSTALLYSKRLITYRLRHLLRARCDASPVTNNTIQFHCDPSFWAQNIINL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 HFSKWAVSSGSSTALLYSKRLITYRLRHLLRARCDASPVTNNTIQFHCDPSFWAQNIINL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 GSLVIEDKESQPQMPKQNPVVEQNSQPPSGLSSNQLSKFPTQISLAQLRLQHMQQQVMAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 GSLVIEDKESQPQMPKQNPVVEQNSQPPSGLSSNQLSKFPTQISLAQLRLQHMQQQ----
430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 RQQVQRRPAPVGLPNPRMQGPIQQPSISHQQPPPRLINFQNHSPKPNGPVLPPHPQQLRY
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ------------------------------QPPPRLINFQNHSPKPNGPVLPPHPQQLRY
480 490 500
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 PPNQNIPRQAIKPNPLQMAFLAQQAIKQWQISSGQGTPSTTNSTSSTPSSPTITSAAGYD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 PPNQNIPRQAIKPNPLQMAFLAQQAIKQWQISSGQGTPSTTNSTSSTPSSPTITSAAGYD
510 520 530 540 550 560
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 GKAFGSPMIDLSSPVGGSYNLPSLPDIDCSSTIMLDNIVRKDTNIDHGQPRPPSNRTVQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 GKAFGSPMIDLSSPVGGSYNLPSLPDIDCSSTIMLDNIVRKDTNIDHGQPRPPSNRTVQS
570 580 590 600 610 620
670 680 690 700 710 720
pF1KB4 PNSSVPSPGLAGPVTMTSVHPPIRSPSASSVGSRGSSGSSSKPAGADSTHKVPVVMLEPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 PNSSVPSPGLAGPVTMTSVHPPIRSPSASSVGSRGSSGSSSKPAGADSTHKVPVVMLEPI
630 640 650 660 670 680
730 740 750 760 770 780
pF1KB4 RIKQENSGPPENYDFPVVIVKQESDEESRPQNANYPRSILTSLLLNSSQSSTSEETVLRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 RIKQENSGPPENYDFPVVIVKQESDEESRPQNANYPRSILTSLLLNSSQSSTSEETVLRS
690 700 710 720 730 740
790 800 810 820 830 840
pF1KB4 DAPDSTGDQPGLHQDNSSNGKSEWLDPSQKSPLHVGETRKEDDPNEDWCAVCQNGGELLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 DAPDSTGDQPGLHQDNSSNGKSEWLDPSQKSPLHVGETRKEDDPNEDWCAVCQNGGELLC
750 760 770 780 790 800
850 860 870 880 890 900
pF1KB4 CEKCPKVFHLSCHVPTLTNFPSGEWICTFCRDLSKPEVEYDCDAPSHNSEKKKTEGLVKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 CEKCPKVFHLSCHVPTLTNFPSGEWICTFCRDLSKPEVEYDCDAPSHNSEKKKTEGLVKL
810 820 830 840 850 860
910 920 930 940 950 960
pF1KB4 TPIDKRKCERLLLFLYCHEMSLAFQDPVPLTVPDYYKIIKNPMDLSTIKKRLQEDYSMYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 TPIDKRKCERLLLFLYCHEMSLAFQDPVPLTVPDYYKIIKNPMDLSTIKKRLQEDYSMYS
870 880 890 900 910 920
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB4 KPEDFVADFRLIFQNCAEFNEPDSEVANAGIKLENYFEELLKNLYPEKRFPKPEFRNESE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 KPEDFVADFRLIFQNCAEFNEPDSEVANAGIKLENYFEELLKNLYPEKRFPKPEFRNESE
930 940 950 960 970 980
1030 1040 1050
pF1KB4 DNKFSDDSDDDFVQPRKKRLKSIEERQLLK
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 DNKFSDDSDDDFVQPRKKRLKSIEERQLLK
990 1000 1010
>>CCDS873.1 TRIM33 gene_id:51592|Hs108|chr1 (1110 aa)
initn: 2703 init1: 1139 opt: 3161 Z-score: 1787.6 bits: 342.5 E(32554): 3e-93
Smith-Waterman score: 3374; 50.9% identity (73.1% similar) in 1088 aa overlap (3-1046:67-1105)
10 20
pF1KB4 MEVAVEKAVAAAAAASAAAS------GGPSAA
::. .. .: ::.: ::: :: ..
CCDS87 PLTAVLVEEEEEEGGRAGAEGGAAGPDDGGVAAASSGSAQAASSPAASVGTGVAGGAVST
40 50 60 70 80 90
30 40 50 60 70 80
pF1KB4 PSGENEAESRQGPDS-ERGGEAARLNLLDTCAVCHQNIQSR---APKLLPCLHSFCQRCL
:. . ::.. : : .::::::::.:..::: ::::::::::: :::
CCDS87 PAPAPASAPAPGPSAGPPPGPPA--SLLDTCAVCQQSLQSRREAEPKLLPCLHSFCLRCL
100 110 120 130 140 150
90 100 110 120 130 140
pF1KB4 PAPQRYLMLPAPMLGSAETPPPVPAPGSPVSGSSPFATQVGVIRCPVCSQECAERHIIDN
: :.: : :: :: ::. :::::::::: ::: . ..::
CCDS87 PEPERQL--------------SVPIPG----GSNGDIQQVGVIRCPVCRQECRQIDLVDN
160 170 180 190
150 160 170 180 190 200
pF1KB4 FFVKDTTEVPSSTVEKSNQVCTSCEDNAEANGFCVECVEWLCKTCIRAHQRVKFTKDHTV
.:::::.:.:::. :::.:::::::::: : :::::: ::::::::.::::::::::: .
CCDS87 YFVKDTSEAPSSSDEKSEQVCTSCEDNASAVGFCVECGEWLCKTCIEAHQRVKFTKDHLI
200 210 220 230 240 250
210 220 230 240 250 260
pF1KB4 RQKEEVSPEAVGVTSQRPVFCPFHKKEQLKLYCETCDKLTCRDCQLLEHKEHRYQFIEEA
:.::.:: :.::...::::::: ::.:::::.:::::.::::::::::::::::::.:::
CCDS87 RKKEDVS-ESVGASGQRPVFCPVHKQEQLKLFCETCDRLTCRDCQLLEHKEHRYQFLEEA
260 270 280 290 300 310
270 280 290 300 310 320
pF1KB4 FQNQKVIIDTLITKLMEKTKYIKFTGNQIQNRIIEVNQNQKQVEQDIKVAIFTLMVEINK
::::: :..:..::.:: .:..:...:.:::: :::...:.:::.::::::::. ::::
CCDS87 FQNQKGAIENLLAKLLEKKNYVHFAATQVQNRIKEVNETNKRVEQEIKVAIFTLINEINK
320 330 340 350 360 370
330 340 350 360 370 380
pF1KB4 KGKALLHQLESLAKDHRMKLMQQQQEVAGLSKQLEHVMHFSKWAVSSGSSTALLYSKRLI
:::.::.:::...:...:::.:::....:::.:..:::.:..::..::::::::::::::
CCDS87 KGKSLLQQLENVTKERQMKLLQQQNDITGLSRQVKHVMNFTNWAIASGSSTALLYSKRLI
380 390 400 410 420 430
390 400 410 420 430 440
pF1KB4 TYRLRHLLRARCDASPVTNNTIQFHCDPSFWAQNIINLGSLVIEDKESQPQMPKQNPVVE
:..:::.:.:::: :..:..:.:::::.:::.:..:::.::::.: . : : ::
CCDS87 TFQLRHILKARCDPVPAANGAIRFHCDPTFWAKNVVNLGNLVIESKPAPGYTP--NVVVG
440 450 460 470 480 490
450 460 470 480 490
pF1KB4 QNSQPPSGLSSNQLSKFPTQISLAQLRLQHMQQQVMAQRQQ------VQRRPAPVGLPNP
: ::. .:..:: : ::.:::::::::::::.::..: .:. :::: .
CCDS87 Q--VPPG---TNHISKTPGQINLAQLRLQHMQQQVYAQKHQQLQQMRMQQPPAPVPTTTT
500 510 520 530 540
500 510 520 530 540 550
pF1KB4 R-MQGPIQQPSISHQQPPPRLINFQNHSPKPNGPVLPPHPQQLRYPPNQN-IPRQAIKPN
.: : : :: :::::. :. . . : . .:.: : :: . .
CCDS87 TTQQHPRQAAPQMLQQQPPRLISVQTMQ-RGNMNCGAFQAHQMRLAQNAARIPGIPRHSG
550 560 570 580 590 600
560 570 580 590 600
pF1KB4 PLQMAFLAQQAIKQWQISSGQGTP---STTNSTSSTPSSPTITSAAGYDGKAFGSP---M
: :.... : ... . . :.. : ....:. .:.::: .. :. . .. ::
CCDS87 P-QYSMM-QPHLQRQHSNPGHAGPFPVVSVHNTTINPTSPTTATMANAN-RGPTSPSVTA
610 620 630 640 650 660
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 IDLSSPVGGSYNLPSLPDI------DCSSTIMLDNIVRKDTNIDHGQPRPPSNRTVQSPN
:.: : . :::::::: : .:. :::.. . . .: :.: :. . ::.
CCDS87 IELIPSVTNPENLPSLPDIPPIQLEDAGSS-SLDNLLSRYISGSHLPPQPTSTMN-PSPG
670 680 690 700 710 720
670 680 690 700 710 720
pF1KB4 SSVPSPGLAGPVTMTSVHPPIRSPSASSVGSRGSSGSSSKPAGADSTHKVPVVMLEPIRI
:. ::: .: ... : :.: ::.::.::::: :::.. : : . ...
CCDS87 PSALSPGSSG---LSNSHTPVRPPSTSSTGSRGSCGSSGRTAEKTSLS----FKSDQVKV
730 740 750 760 770
730 740 750 760 770
pF1KB4 KQENSGPPENYDFPVVIVKQESDEESR--------PQNANYPRSILTSLLLNSSQSS-TS
::: . : .: ::::. :..: :... : . :.: :.: .. .:
CCDS87 KQEPGTEDEICSFSGG-VKQEKTEDGRRSACMLSSPESSLTP-PLSTNLHLESELDALAS
780 790 800 810 820 830
780 790 800 810 820 830
pF1KB4 EETVLRSDAPD--STGDQPGLHQDNSSNGKSEWLDPSQKSPLHVGE-TRKEDDPNEDWCA
:. .. . : . : :: .. :::: . ..: :. . :.:::::::::
CCDS87 LENHVKIEPADMNESCKQSGL--SSLVNGKSPIRSLMHRSARIGGDGNNKDDDPNEDWCA
840 850 860 870 880 890
840 850 860 870 880 890
pF1KB4 VCQNGGELLCCEKCPKVFHLSCHVPTLTNFPSGEWICTFCRDLSKPEVEYDCDAPSHNSE
::::::.:::::::::::::.:::::: .::::.::::::::..::::::::: .:...
CCDS87 VCQNGGDLLCCEKCPKVFHLTCHVPTLLSFPSGDWICTFCRDIGKPEVEYDCDNLQHSKK
900 910 920 930 940 950
900 910 920 930 940 950
pF1KB4 KKKTEGLVKLTPIDKRKCERLLLFLYCHEMSLAFQDPVPLTVPDYYKIIKNPMDLSTIKK
: ..:: .:.:.::::::::.:::::.:. ::.::: ..:.::::::.::::::.::
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960 970 980 990 1000
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CCDS87 KLQKKHSQHYQIPDDFVADVRLIFKNCERFNEADSEVAQAGKAVALYFEDKLTEIYSDRT
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1010 1020 1030 1040 1050
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CCDS87 FAPLPEFEQEEDDGEVTEDSDEDFIQPRRKRLKS-DERPVHIK
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10 20
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30 40 50 60 70 80
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210 220 230 240 250 260
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: :.... : ... . . :.. : ....:. .:.::: .. :. . .. ::
CCDS87 P-QYSMM-QPHLQRQHSNPGHAGPFPVVSVHNTTINPTSPTTATMANAN-RGPTSPSVTA
610 620 630 640 650 660
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 IDLSSPVGGSYNLPSLPDI------DCSSTIMLDNIVRKDTNIDHGQPRPPSNRTVQSPN
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CCDS87 IELIPSVTNPENLPSLPDIPPIQLEDAGSS-SLDNLLSRYISGSHLPPQPTSTMN-PSPG
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670 680 690 700 710 720
pF1KB4 SSVPSPGLAGPVTMTSVHPPIRSPSASSVGSRGSSGSSSKPAGADSTHKVPVVMLEPIRI
:. ::: .: ... : :.: ::.::.::::: :::.. : : . ...
CCDS87 PSALSPGSSG---LSNSHTPVRPPSTSSTGSRGSCGSSGRTAEKTSLS----FKSDQVKV
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730 740 750 760 770
pF1KB4 KQENSGPPENYDFPVVIVKQESDEESR--------PQNANYPRSILTSLLLNSSQSS-TS
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CCDS87 KQEPGTEDEICSFSGG-VKQEKTEDGRRSACMLSSPESSLTP-PLSTNLHLESELDALAS
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780 790 800 810 820 830
pF1KB4 EETVLRSDAPD--STGDQPGLHQDNSSNGKSEWLDPSQKSPLHVGE-TRKEDDPNEDWCA
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CCDS87 LENHVKIEPADMNESCKQSGL--SSLVNGKSPIRSLMHRSARIGGDGNNKDDDPNEDWCA
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840 850 860 870 880 890
pF1KB4 VCQNGGELLCCEKCPKVFHLSCHVPTLTNFPSGEWICTFCRDLSKPEVEYDCDAPSHNSE
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CCDS87 VCQNGGDLLCCEKCPKVFHLTCHVPTLLSFPSGDWICTFCRDIGKPEVEYDCDNLQHSKK
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900 910 920 930 940 950
pF1KB4 KKKTEGLVKLTPIDKRKCERLLLFLYCHEMSLAFQDPVPLTVPDYYKIIKNPMDLSTIKK
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CCDS87 GKTAQGL---SPVDQRKCERLLLYLYCHELSIEFQEPVPASIPNYYKIIKKPMDLSTVKK
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pF1KB4 RLQEDYSM-YSKPEDFVADFRLIFQNCAEFNE-----------------PDSEVANAGIK
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CCDS87 KLQKKHSQHYQIPDDFVADVRLIFKNCERFNEMMKVVQVYADTQEINLKADSEVAQAGKA
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pF1KB4 LENYFEELLKNLYPEKRF-PKPEFRNESEDNKFSDDSDDDFVQPRKKRLKSIEERQLLK
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CCDS87 VALYFEDKLTEIYSDRTFAPLPEFEQEEDDGEVTEDSDEDFIQPRRKRLKS-DERPVHIK
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CCDS12 ALELLEHCGVCRERLRPEREPRLLPCLHSACSACLG-------------------PAAPA
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CCDS12 AANS-SGDGGAAGDGTVVDCPVCKQQCFSKDIVENYFMRDSGSKAATDAQDANQCCTSCE
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CCDS12 DNAPATSYCVECSEPLCETCVEAHQRVKYTKDHTVRS---TGP-AKSRDGERTVYCNVHK
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pF1KB4 KEQLKLYCETCDKLTCRDCQLLEHKEHRYQFIEEAFQNQKVIIDTLITKLMEKTKYIKFT
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CCDS12 HEPLVLFCESCDTLTCRDCQLNAHKDHQYQFLEDAVRNQRKLLASLVKRLGDKHATLQKS
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pF1KB4 GNQIQNRIIEVNQNQKQVEQDIKVAIFTLMVEINKKGKALLHQLESLAKDHRMKLMQQQQ
..... : .:.. ::.:. :.:.::. .: :.::.:..:... ..... .. .: .:.
CCDS12 TKEVRSSIRQVSDVQKRVQVDVKMAILQIMKELNKRGRVLVNDAQKVTEGQQERLERQHW
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pF1KB4 EVAGLSKQLEHVMHFSKWAVSSGSSTALLYSKRLITYRLRHLLRARCDASPVT-NNTIQF
.. ..:. ::...:..::. : ..:::: ::.:: ..:.. :. : :: .. ..:
CCDS12 TMTKIQKHQEHILRFASWALESDNNTALLLSKKLIYFQLHRALKMIVD--PVEPHGEMKF
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pF1KB4 HCDPSFWAQNIINLGSLVIEDKESQPQMPKQNPVVEQNSQPPSGLSSNQLSKFPTQISLA
. : . :... .:..: : .: : .:.
CCDS12 QWDLNAWTKSAEAFGKIVAE-------------------RP--GTNSTG-----------
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pF1KB4 QLRLQHMQQQVMAQRQQVQRRPAPVGLPNPRMQGPIQQPSISHQQPPPRLINFQNHSPKP
:::.. : :: ::... . . .:: .. :.
CCDS12 ---------------------PAPMA-P-PRAPGPLSKQGSGSSQP----MEVQEGYGFG
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pF1KB4 NGPVLPPHPQQLRYPPNQNIPRQAIKPNPLQMAFLAQQAIKQWQISSGQGTPSTTNSTSS
.: . : .. .:. ...:. . ::.: :
CCDS12 SG----------------DDPYSSAEPHV--------SGVKRSR--SGEGEVSGLMR---
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pF1KB4 TPSSPTITSAAGYDGKAFGSPMIDLSSPVGGSYNLPSLPDIDCSSTIMLDNIVRKDTNID
. : . : : .::.. . : . . .:: :.. :.
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pF1KB4 HGQPRPPSNRTVQSPNSSVPSPGLAGPVTMTSVHPPIRSPSASSVGSRGSSGSSSKPAGA
.: ... .: .. .: ::: :. :. . . ...:. :...
CCDS12 RGAAAAATGQPGTAPAGTPGAPPLAG---MAIVK---EEETEAAIGA--------PPTAT
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pF1KB4 DSTHKVPVVMLEPIRIKQENSGPPENYDFPVVIVKQESDEESRPQNANYPRSILTSLLLN
.. . ::.: :: .:. :: : .
CCDS12 EGPETKPVLM-------ALAEGP----------------------GAEGPR------LAS
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pF1KB4 SSQSSTSEETVLRSDAPDSTGDQPGLHQDNSSNGKSEWLDPSQKSPLHVGETRKEDDPNE
: :..: :. .. .. : :: .:...
CCDS12 PSGSTSSGLEVVAPEGTSAPGGGPGTLDDSATI---------------------------
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pF1KB4 DWCAVCQNGGELLCCEKCPKVFHLSCHVPTLTNFPSGEWICTFCRDLSKPEVEYDCDAPS
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pF1KB4 HNSEKKKTEGLV-KLTPIDKRKCERLLLFLYCHEMSLAFQDPVPLTVPDYYKIIKNP---
. . . :.: ::.: ..:::::.:: :.::: :. . : . .:
CCDS12 LSLDGADSTGVVAKLSPANQRKCERVLLALFCHEPC----RPLHQLATDSTFSLDQPGGT
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.. . . .:
CCDS12 NEAFGDTKFSAVLVEPPPMSLPGAGLSSQELSGGPGDGP
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1050 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]