FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB4148, 524 aa 1>>>pF1KB4148 524 - 524 aa - 524 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.2731+/-0.00101; mu= 1.6781+/- 0.062 mean_var=236.5838+/-47.190, 0's: 0 Z-trim(112.5): 26 B-trim: 9 in 1/52 Lambda= 0.083384 statistics sampled from 13266 (13291) to 13266 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.717), E-opt: 0.2 (0.408), width: 16 Scan time: 3.200 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS7328.1 PPP3CB gene_id:5532|Hs108|chr10 ( 524) 3574 442.9 4.1e-124 CCDS44437.1 PPP3CB gene_id:5532|Hs108|chr10 ( 525) 3562 441.5 1.1e-123 CCDS44436.1 PPP3CB gene_id:5532|Hs108|chr10 ( 515) 3103 386.3 4.6e-107 CCDS34037.1 PPP3CA gene_id:5530|Hs108|chr4 ( 521) 2970 370.3 3e-102 CCDS34859.1 PPP3CC gene_id:5533|Hs108|chr8 ( 512) 2834 353.9 2.5e-97 CCDS59093.1 PPP3CC gene_id:5533|Hs108|chr8 ( 521) 2827 353.1 4.6e-97 CCDS47114.1 PPP3CA gene_id:5530|Hs108|chr4 ( 511) 2696 337.3 2.5e-92 CCDS59094.1 PPP3CC gene_id:5533|Hs108|chr8 ( 502) 2596 325.3 1e-88 CCDS47113.1 PPP3CA gene_id:5530|Hs108|chr4 ( 469) 1925 244.5 1.9e-64 CCDS10669.1 PPP4C gene_id:5531|Hs108|chr16 ( 307) 703 97.4 2.5e-20 CCDS6079.1 PPP2CB gene_id:5516|Hs108|chr8 ( 309) 695 96.4 4.9e-20 CCDS8160.1 PPP1CA gene_id:5499|Hs108|chr11 ( 330) 680 94.7 1.8e-19 CCDS31618.1 PPP1CA gene_id:5499|Hs108|chr11 ( 341) 680 94.7 1.8e-19 CCDS4173.1 PPP2CA gene_id:5515|Hs108|chr5 ( 309) 677 94.3 2.2e-19 CCDS9150.1 PPP1CC gene_id:5501|Hs108|chr12 ( 323) 676 94.2 2.5e-19 CCDS58279.1 PPP1CC gene_id:5501|Hs108|chr12 ( 337) 676 94.2 2.6e-19 CCDS33169.1 PPP1CB gene_id:5500|Hs108|chr2 ( 327) 670 93.5 4.1e-19 CCDS6861.1 PPP6C gene_id:5537|Hs108|chr9 ( 305) 664 92.7 6.4e-19 CCDS48018.1 PPP6C gene_id:5537|Hs108|chr9 ( 342) 664 92.7 7e-19 CCDS12684.1 PPP5C gene_id:5536|Hs108|chr19 ( 499) 639 89.9 7.6e-18 CCDS8161.1 PPP1CA gene_id:5499|Hs108|chr11 ( 286) 627 88.2 1.3e-17 CCDS48019.1 PPP6C gene_id:5537|Hs108|chr9 ( 283) 494 72.2 8.7e-13 >>CCDS7328.1 PPP3CB gene_id:5532|Hs108|chr10 (524 aa) initn: 3574 init1: 3574 opt: 3574 Z-score: 2341.7 bits: 442.9 E(32554): 4.1e-124 Smith-Waterman score: 3574; 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CCDS34 MSEPKAIDPKLSTTDRVVKAVPFPPSHRLTAKEVFDNDGKPRVDILKAHLM 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KB4 KEGRVDEEIALRIINEGAAILRREKTMIEVEAPITVCGDIHGQFFDLMKLFEVGGSPANT ::::..: .:::::.:::.:::.::......::.:::::::::::::::::::::::::: CCDS34 KEGRLEESVALRIITEGASILRQEKNLLDIDAPVTVCGDIHGQFFDLMKLFEVGGSPANT 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KB4 RYLFLGDYVDRGYFSIECVLYLWVLKILYPSTLFLLRGNHECRHLTEYFTFKQECKIKYS :::::::::::::::::::::::.::::::.::::::::::::::::::::::::::::: CCDS34 RYLFLGDYVDRGYFSIECVLYLWALKILYPKTLFLLRGNHECRHLTEYFTFKQECKIKYS 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KB4 ERVYEACMEAFDSLPLAALLNQQFLCVHGGLSPEIHTLDDIRRLDRFKEPPAFGPMCDLL ::::.:::.::: ::::::.:::::::::::::::.::::::.:::::::::.:::::.: CCDS34 ERVYDACMDAFDCLPLAALMNQQFLCVHGGLSPEINTLDDIRKLDRFKEPPAYGPMCDIL 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KB4 WSDPSEDFGNEKSQEHFSHNTVRGCSYFYNYPAVCEFLQNNNLLSIIRAHEAQDAGYRMY :::: :::::::.::::.:::::::::::.:::::::::.::::::.::::::::::::: CCDS34 WSDPLEDFGNEKTQEHFTHNTVRGCSYFYSYPAVCEFLQHNNLLSILRAHEAQDAGYRMY 240 250 260 270 280 290 310 320 330 340 350 360 pF1KB4 RKSQTTGFPSLITIFSAPNYLDVYNNKAAVLKYENNVMNIRQFNCSPHPYWLPNFMDVFT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS34 RKSQTTGFPSLITIFSAPNYLDVYNNKAAVLKYENNVMNIRQFNCSPHPYWLPNFMDVFT 300 310 320 330 340 350 370 380 390 400 410 pF1KB4 WSLPFVGEKVTEMLVNVLSICSDDELMTEGEDQFDG-SAAARKEIIRNKIRAIGKMARVF ::::::::::::::::::.::::::: .: :: ::: .::::::.::::::::::::::: CCDS34 WSLPFVGEKVTEMLVNVLNICSDDELGSE-EDGFDGATAAARKEVIRNKIRAIGKMARVF 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KB4 SVLREESESVLTLKGLTPTGMLPSGVLAGGRQTLQSATVEAIEAEKAIRGFSPPHRICSF :::::::::::::::::::::::::::.::.:::::::::::::..::.:::: :.: :: CCDS34 SVLREESESVLTLKGLTPTGMLPSGVLSGGKQTLQSATVEAIEADEAIKGFSPQHKITSF 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 pF1KB4 EEAKGLDRINERMPPRKDAVQQDG-FNSLNTAHATENHGTGNHTAQ ::::::::::::::::.::. .:. .::.: : ..:..:: .. CCDS34 EEAKGLDRINERMPPRRDAMPSDANLNSINKALTSETNGTDSNGSNSSNIQ 480 490 500 510 520 >>CCDS34859.1 PPP3CC gene_id:5533|Hs108|chr8 (512 aa) initn: 2810 init1: 2174 opt: 2834 Z-score: 1860.8 bits: 353.9 E(32554): 2.5e-97 Smith-Waterman score: 2834; 83.0% identity (95.3% similar) in 494 aa overlap (24-516:12-502) 10 20 30 40 50 60 pF1KB4 MAAPEPARAAPPPPPPPPPPPGADRVVKAVPFPPTHRLTSEEVFDLDGIPRVDVLKNHLV :::.::::::::.::: .:::. .: :.::::::::: CCDS34 MSGRRFHLSTTDRVIKAVPFPPTQRLTFKEVFE-NGKPKVDVLKNHLV 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 pF1KB4 KEGRVDEEIALRIINEGAAILRREKTMIEVEAPITVCGDIHGQFFDLMKLFEVGGSPANT ::::..::.::.:::.::::::.:::::::.::::::::::::::::::::::::::.:: CCDS34 KEGRLEEEVALKIINDGAAILRQEKTMIEVDAPITVCGDIHGQFFDLMKLFEVGGSPSNT 50 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 180 pF1KB4 RYLFLGDYVDRGYFSIECVLYLWVLKILYPSTLFLLRGNHECRHLTEYFTFKQECKIKYS ::::::::::::::::::::::: ::: .:.:::::::::::::::.::::::::.:::: CCDS34 RYLFLGDYVDRGYFSIECVLYLWSLKINHPKTLFLLRGNHECRHLTDYFTFKQECRIKYS 110 120 130 140 150 160 190 200 210 220 230 240 pF1KB4 ERVYEACMEAFDSLPLAALLNQQFLCVHGGLSPEIHTLDDIRRLDRFKEPPAFGPMCDLL :.::.::::.:: :::::::::::::::::.:::: .:::::.:::: :::::::.:::: CCDS34 EQVYDACMETFDCLPLAALLNQQFLCVHGGMSPEITSLDDIRKLDRFTEPPAFGPVCDLL 170 180 190 200 210 220 250 260 270 280 290 300 pF1KB4 WSDPSEDFGNEKSQEHFSHNTVRGCSYFYNYPAVCEFLQNNNLLSIIRAHEAQDAGYRMY :::::::.::::. ::..:::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::: CCDS34 WSDPSEDYGNEKTLEHYTHNTVRGCSYFYSYPAVCEFLQNNNLLSIIRAHEAQDAGYRMY 230 240 250 260 270 280 310 320 330 340 350 360 pF1KB4 RKSQTTGFPSLITIFSAPNYLDVYNNKAAVLKYENNVMNIRQFNCSPHPYWLPNFMDVFT ::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS34 RKSQATGFPSLITIFSAPNYLDVYNNKAAVLKYENNVMNIRQFNCSPHPYWLPNFMDVFT 290 300 310 320 330 340 370 380 390 400 410 420 pF1KB4 WSLPFVGEKVTEMLVNVLSICSDDELMTEGEDQFDGSAAARKEIIRNKIRAIGKMARVFS ::::::::::::::::::.:::::::.. .:. .::...:::::::::::::::::::: CCDS34 WSLPFVGEKVTEMLVNVLNICSDDELIS--DDEAEGSTTVRKEIIRNKIRAIGKMARVFS 350 360 370 380 390 400 430 440 450 460 470 480 pF1KB4 VLREESESVLTLKGLTPTGMLPSGVLAGGRQTLQSATVEAIEAEKAIRGFSPPHRICSFE .::.::::::::::::::: :: :::.::.::...:::::.::..:::::: :.: ::: CCDS34 ILRQESESVLTLKGLTPTGTLPLGVLSGGKQTIETATVEAVEAREAIRGFSLQHKIRSFE 410 420 430 440 450 460 490 500 510 520 pF1KB4 EAKGLDRINERMPPRKDAVQQDG-FNSLNTAHATENHGTGNHTAQ ::.::::::::::::::... : ..:...::. : CCDS34 EARGLDRINERMPPRKDSIHAGGPMKSVTSAHSHAAHRSDQGKKAHS 470 480 490 500 510 >>CCDS59093.1 PPP3CC gene_id:5533|Hs108|chr8 (521 aa) initn: 2817 init1: 2154 opt: 2827 Z-score: 1856.1 bits: 353.1 E(32554): 4.6e-97 Smith-Waterman score: 2827; 82.2% identity (94.4% similar) in 501 aa overlap (24-516:12-511) 10 20 30 40 50 60 pF1KB4 MAAPEPARAAPPPPPPPPPPPGADRVVKAVPFPPTHRLTSEEVFDLDGIPRVDVLKNHLV :::.::::::::.::: .:::. .: :.::::::::: CCDS59 MSGRRFHLSTTDRVIKAVPFPPTQRLTFKEVFE-NGKPKVDVLKNHLV 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 pF1KB4 KEGRVDEEIALRIINEGAAILRREKTMIEVEAPITVCGDIHGQFFDLMKLFEVGGSPANT ::::..::.::.:::.::::::.:::::::.::::::::::::::::::::::::::.:: CCDS59 KEGRLEEEVALKIINDGAAILRQEKTMIEVDAPITVCGDIHGQFFDLMKLFEVGGSPSNT 50 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 180 pF1KB4 RYLFLGDYVDRGYFSIECVLYLWVLKILYPSTLFLLRGNHECRHLTEYFTFKQECKIKYS ::::::::::::::::::::::: ::: .:.:::::::::::::::.::::::::.:::: CCDS59 RYLFLGDYVDRGYFSIECVLYLWSLKINHPKTLFLLRGNHECRHLTDYFTFKQECRIKYS 110 120 130 140 150 160 190 200 210 220 230 240 pF1KB4 ERVYEACMEAFDSLPLAALLNQQFLCVHGGLSPEIHTLDDIRRLDRFKEPPAFGPMCDLL :.::.::::.:: :::::::::::::::::.:::: .:::::.:::: :::::::.:::: CCDS59 EQVYDACMETFDCLPLAALLNQQFLCVHGGMSPEITSLDDIRKLDRFTEPPAFGPVCDLL 170 180 190 200 210 220 250 260 270 280 290 300 pF1KB4 WSDPSEDFGNEKSQEHFSHNTVRGCSYFYNYPAVCEFLQNNNLLSIIRAHEAQDAGYRMY :::::::.::::. ::..:::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::: CCDS59 WSDPSEDYGNEKTLEHYTHNTVRGCSYFYSYPAVCEFLQNNNLLSIIRAHEAQDAGYRMY 230 240 250 260 270 280 310 320 330 340 350 360 pF1KB4 RKSQTTGFPSLITIFSAPNYLDVYNNKAAVLKYENNVMNIRQFNCSPHPYWLPNFMDVFT ::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS59 RKSQATGFPSLITIFSAPNYLDVYNNKAAVLKYENNVMNIRQFNCSPHPYWLPNFMDVFT 290 300 310 320 330 340 370 380 390 400 410 pF1KB4 WSLPFVGEKVTEMLVNVLSICSDDELMT--EGEDQF-----DGSAAARKEIIRNKIRAIG ::::::::::::::::::.:::::::.. :.::.. ::...::::::::::::: CCDS59 WSLPFVGEKVTEMLVNVLNICSDDELISDDEAEDHYIPSYQKGSTTVRKEIIRNKIRAIG 350 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 470 pF1KB4 KMARVFSVLREESESVLTLKGLTPTGMLPSGVLAGGRQTLQSATVEAIEAEKAIRGFSPP :::::::.::.::::::::::::::: :: :::.::.::...:::::.::..:::::: CCDS59 KMARVFSILRQESESVLTLKGLTPTGTLPLGVLSGGKQTIETATVEAVEAREAIRGFSLQ 410 420 430 440 450 460 480 490 500 510 520 pF1KB4 HRICSFEEAKGLDRINERMPPRKDAVQQDG-FNSLNTAHATENHGTGNHTAQ :.: :::::.::::::::::::::... : ..:...::. : CCDS59 HKIRSFEEARGLDRINERMPPRKDSIHAGGPMKSVTSAHSHAAHRSDQGKKAHS 470 480 490 500 510 520 >>CCDS47114.1 PPP3CA gene_id:5530|Hs108|chr4 (511 aa) initn: 2852 init1: 2659 opt: 2696 Z-score: 1771.1 bits: 337.3 E(32554): 2.5e-92 Smith-Waterman score: 2895; 82.8% identity (93.2% similar) in 511 aa overlap (13-521:4-503) 10 20 30 40 50 60 pF1KB4 MAAPEPARAAPPPPPPPPPPPGADRVVKAVPFPPTHRLTSEEVFDLDGIPRVDVLKNHLV : : .:::::::::::.::::..:::: :: ::::.:: ::. CCDS47 MSEPKAIDPKLSTTDRVVKAVPFPPSHRLTAKEVFDNDGKPRVDILKAHLM 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KB4 KEGRVDEEIALRIINEGAAILRREKTMIEVEAPITVCGDIHGQFFDLMKLFEVGGSPANT ::::..: .:::::.:::.:::.::......::.:::::::::::::::::::::::::: CCDS47 KEGRLEESVALRIITEGASILRQEKNLLDIDAPVTVCGDIHGQFFDLMKLFEVGGSPANT 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KB4 RYLFLGDYVDRGYFSIECVLYLWVLKILYPSTLFLLRGNHECRHLTEYFTFKQECKIKYS :::::::::::::::::::::::.::::::.::::::::::::::::::::::::::::: CCDS47 RYLFLGDYVDRGYFSIECVLYLWALKILYPKTLFLLRGNHECRHLTEYFTFKQECKIKYS 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KB4 ERVYEACMEAFDSLPLAALLNQQFLCVHGGLSPEIHTLDDIRRLDRFKEPPAFGPMCDLL ::::.:::.::: ::::::.:::::::::::::::.::::::.:::::::::.:::::.: CCDS47 ERVYDACMDAFDCLPLAALMNQQFLCVHGGLSPEINTLDDIRKLDRFKEPPAYGPMCDIL 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KB4 WSDPSEDFGNEKSQEHFSHNTVRGCSYFYNYPAVCEFLQNNNLLSIIRAHEAQDAGYRMY :::: :::::::.::::.:::::::::::.:::::::::.::::::.::::::::::::: CCDS47 WSDPLEDFGNEKTQEHFTHNTVRGCSYFYSYPAVCEFLQHNNLLSILRAHEAQDAGYRMY 240 250 260 270 280 290 310 320 330 340 350 360 pF1KB4 RKSQTTGFPSLITIFSAPNYLDVYNNKAAVLKYENNVMNIRQFNCSPHPYWLPNFMDVFT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS47 RKSQTTGFPSLITIFSAPNYLDVYNNKAAVLKYENNVMNIRQFNCSPHPYWLPNFMDVFT 300 310 320 330 340 350 370 380 390 400 410 pF1KB4 WSLPFVGEKVTEMLVNVLSICSDDELMTEGEDQFDG-SAAARKEIIRNKIRAIGKMARVF ::::::::::::::::::.::::::: .: :: ::: .::::::.::::::::::::::: CCDS47 WSLPFVGEKVTEMLVNVLNICSDDELGSE-EDGFDGATAAARKEVIRNKIRAIGKMARVF 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KB4 SVLREESESVLTLKGLTPTGMLPSGVLAGGRQTLQSATVEAIEAEKAIRGFSPPHRICSF :::::::::::::::::::::::::::.::.:::::: :.:::: :.: :: CCDS47 SVLREESESVLTLKGLTPTGMLPSGVLSGGKQTLQSA----------IKGFSPQHKITSF 420 430 440 450 460 480 490 500 510 520 pF1KB4 EEAKGLDRINERMPPRKDAVQQDG-FNSLNTAHATENHGTGNHTAQ ::::::::::::::::.::. .:. .::.: : ..:..:: .. CCDS47 EEAKGLDRINERMPPRRDAMPSDANLNSINKALTSETNGTDSNGSNSSNIQ 470 480 490 500 510 >>CCDS59094.1 PPP3CC gene_id:5533|Hs108|chr8 (502 aa) initn: 2759 init1: 2174 opt: 2596 Z-score: 1706.2 bits: 325.3 E(32554): 1e-88 Smith-Waterman score: 2763; 81.8% identity (93.1% similar) in 494 aa overlap (24-516:12-492) 10 20 30 40 50 60 pF1KB4 MAAPEPARAAPPPPPPPPPPPGADRVVKAVPFPPTHRLTSEEVFDLDGIPRVDVLKNHLV :::.::::::::.::: .:::. .: :.::::::::: CCDS59 MSGRRFHLSTTDRVIKAVPFPPTQRLTFKEVFE-NGKPKVDVLKNHLV 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 pF1KB4 KEGRVDEEIALRIINEGAAILRREKTMIEVEAPITVCGDIHGQFFDLMKLFEVGGSPANT ::::..::.::.:::.::::::.:::::::.::::::::::::::::::::::::::.:: CCDS59 KEGRLEEEVALKIINDGAAILRQEKTMIEVDAPITVCGDIHGQFFDLMKLFEVGGSPSNT 50 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 180 pF1KB4 RYLFLGDYVDRGYFSIECVLYLWVLKILYPSTLFLLRGNHECRHLTEYFTFKQECKIKYS ::::::::::::::::::::::: ::: .:.:::::::::::::::.::::::::.:::: CCDS59 RYLFLGDYVDRGYFSIECVLYLWSLKINHPKTLFLLRGNHECRHLTDYFTFKQECRIKYS 110 120 130 140 150 160 190 200 210 220 230 240 pF1KB4 ERVYEACMEAFDSLPLAALLNQQFLCVHGGLSPEIHTLDDIRRLDRFKEPPAFGPMCDLL :.::.::::.:: :::::::::::::::::.:::: .:::::.:::: :::::::.:::: CCDS59 EQVYDACMETFDCLPLAALLNQQFLCVHGGMSPEITSLDDIRKLDRFTEPPAFGPVCDLL 170 180 190 200 210 220 250 260 270 280 290 300 pF1KB4 WSDPSEDFGNEKSQEHFSHNTVRGCSYFYNYPAVCEFLQNNNLLSIIRAHEAQDAGYRMY :::::::.::::. ::..:::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::: CCDS59 WSDPSEDYGNEKTLEHYTHNTVRGCSYFYSYPAVCEFLQNNNLLSIIRAHEAQDAGYRMY 230 240 250 260 270 280 310 320 330 340 350 360 pF1KB4 RKSQTTGFPSLITIFSAPNYLDVYNNKAAVLKYENNVMNIRQFNCSPHPYWLPNFMDVFT ::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS59 RKSQATGFPSLITIFSAPNYLDVYNNKAAVLKYENNVMNIRQFNCSPHPYWLPNFMDVFT 290 300 310 320 330 340 370 380 390 400 410 420 pF1KB4 WSLPFVGEKVTEMLVNVLSICSDDELMTEGEDQFDGSAAARKEIIRNKIRAIGKMARVFS ::::::::::::::::::.:::::::.. .:. .::...:::::::::::::::::::: CCDS59 WSLPFVGEKVTEMLVNVLNICSDDELIS--DDEAEGSTTVRKEIIRNKIRAIGKMARVFS 350 360 370 380 390 400 430 440 450 460 470 480 pF1KB4 VLREESESVLTLKGLTPTGMLPSGVLAGGRQTLQSATVEAIEAEKAIRGFSPPHRICSFE .::.::::::::::::::: :: :::.::.::. : :::::: :.: ::: CCDS59 ILRQESESVLTLKGLTPTGTLPLGVLSGGKQTI----------ETAIRGFSLQHKIRSFE 410 420 430 440 450 490 500 510 520 pF1KB4 EAKGLDRINERMPPRKDAVQQDG-FNSLNTAHATENHGTGNHTAQ ::.::::::::::::::... : ..:...::. : CCDS59 EARGLDRINERMPPRKDSIHAGGPMKSVTSAHSHAAHRSDQGKKAHS 460 470 480 490 500 >>CCDS47113.1 PPP3CA gene_id:5530|Hs108|chr4 (469 aa) initn: 2135 init1: 1907 opt: 1925 Z-score: 1270.3 bits: 244.5 E(32554): 1.9e-64 Smith-Waterman score: 2492; 74.6% identity (84.9% similar) in 511 aa overlap (13-521:4-461) 10 20 30 40 50 60 pF1KB4 MAAPEPARAAPPPPPPPPPPPGADRVVKAVPFPPTHRLTSEEVFDLDGIPRVDVLKNHLV : : .:::::::::::.::::..:::: :: ::::.:: ::. CCDS47 MSEPKAIDPKLSTTDRVVKAVPFPPSHRLTAKEVFDNDGKPRVDILKAHLM 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KB4 KEGRVDEEIALRIINEGAAILRREKTMIEVEAPITVCGDIHGQFFDLMKLFEVGGSPANT ::::..: .:::::.:::.:::.::......::.:::::::::::::::::::::::::: CCDS47 KEGRLEESVALRIITEGASILRQEKNLLDIDAPVTVCGDIHGQFFDLMKLFEVGGSPANT 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KB4 RYLFLGDYVDRGYFSIECVLYLWVLKILYPSTLFLLRGNHECRHLTEYFTFKQECKIKYS :::::::::::::::::::::::.::::::.::::::::::::::::::::::::::::: CCDS47 RYLFLGDYVDRGYFSIECVLYLWALKILYPKTLFLLRGNHECRHLTEYFTFKQECKIKYS 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KB4 ERVYEACMEAFDSLPLAALLNQQFLCVHGGLSPEIHTLDDIRRLDRFKEPPAFGPMCDLL ::::.:::.::: ::::::.:::::::::::::::.::::::.:::::::::.:::::.: CCDS47 ERVYDACMDAFDCLPLAALMNQQFLCVHGGLSPEINTLDDIRKLDRFKEPPAYGPMCDIL 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KB4 WSDPSEDFGNEKSQEHFSHNTVRGCSYFYNYPAVCEFLQNNNLLSIIRAHEAQDAGYRMY :::: :::::::.::::.:::::::::::.:::::::::.::::::.::::::::::::: CCDS47 WSDPLEDFGNEKTQEHFTHNTVRGCSYFYSYPAVCEFLQHNNLLSILRAHEAQDAGYRMY 240 250 260 270 280 290 310 320 330 340 350 360 pF1KB4 RKSQTTGFPSLITIFSAPNYLDVYNNKAAVLKYENNVMNIRQFNCSPHPYWLPNFMDVFT ::::::::::::::::::::::::::: CCDS47 RKSQTTGFPSLITIFSAPNYLDVYNNK--------------------------------- 300 310 370 380 390 400 410 pF1KB4 WSLPFVGEKVTEMLVNVLSICSDDELMTEGEDQFDG-SAAARKEIIRNKIRAIGKMARVF :::::::::.::::::: .: :: ::: .::::::.::::::::::::::: CCDS47 ---------VTEMLVNVLNICSDDELGSE-EDGFDGATAAARKEVIRNKIRAIGKMARVF 320 330 340 350 360 420 430 440 450 460 470 pF1KB4 SVLREESESVLTLKGLTPTGMLPSGVLAGGRQTLQSATVEAIEAEKAIRGFSPPHRICSF :::::::::::::::::::::::::::.::.:::::: :.:::: :.: :: CCDS47 SVLREESESVLTLKGLTPTGMLPSGVLSGGKQTLQSA----------IKGFSPQHKITSF 370 380 390 400 410 480 490 500 510 520 pF1KB4 EEAKGLDRINERMPPRKDAVQQDG-FNSLNTAHATENHGTGNHTAQ ::::::::::::::::.::. .:. .::.: : ..:..:: .. CCDS47 EEAKGLDRINERMPPRRDAMPSDANLNSINKALTSETNGTDSNGSNSSNIQ 420 430 440 450 460 >>CCDS10669.1 PPP4C gene_id:5531|Hs108|chr16 (307 aa) initn: 721 init1: 383 opt: 703 Z-score: 478.4 bits: 97.4 E(32554): 2.5e-20 Smith-Waterman score: 745; 41.0% identity (67.7% similar) in 310 aa overlap (42-348:3-291) 20 30 40 50 60 70 pF1KB4 PPPPPPPPPPGADRVVKAVPFPPTHRLTSEEVFDLDGIPRVDVLKN-HLVKEGRVDEEIA :. ::: ... :. .:.::..: : CCDS10 MAEISDLDR--QIEQLRRCELIKESEVKALCA 10 20 30 80 90 100 110 120 130 pF1KB4 LRIINEGAAILRREKTMIEVEAPITVCGDIHGQFFDLMKLFEVGGSPANTRYLFLGDYVD .. :: .:... .:..:.::::::::::.:: .::.:::. .: :::.::.:: CCDS10 -----KAREILVEESNVQRVDSPVTVCGDIHGQFYDLKELFRVGGDVPETNYLFMGDFVD 40 50 60 70 80 140 150 160 170 180 pF1KB4 RGYFSIECVLYLWVLKILYPSTLFLLRGNHECRHLTEYFTFKQECKIKY-SERVYEACME ::..:.: : : .::. ::. . :.::::: :..:. . : .:: :: : :.. : : CCDS10 RGFYSVETFLLLLALKVRYPDRITLIRGNHESRQITQVYGFYDECLRKYGSVTVWRYCTE 90 100 110 120 130 140 190 200 210 220 230 240 pF1KB4 AFDSLPLAALLNQQFLCVHGGLSPEIHTLDDIRRLDRFKEPPAFGPMCDLLWSDPSEDFG :: : :.:... ...:::::::: :.:::.:: .:: .: : ::::::::::: . : CCDS10 IFDYLSLSAIIDGKIFCVHGGLSPSIQTLDQIRTIDRKQEVPHDGPMCDLLWSDPEDTTG 150 160 170 180 190 200 250 260 270 280 290 300 pF1KB4 NEKSQEHFSHNTVRGCSYFYNYPAVCEFLQNNNLLSIIRAHEAQDAGYRMYRKSQTTGFP : :: .:... .: .: :.. : :::. ::. . . CCDS10 WGVSP--------RGAGYLFGSDVVAQFNAANDIDMICRAHQLVMEGYKWHFNE------ 210 220 230 240 250 310 320 330 340 350 360 pF1KB4 SLITIFSAPNYLDVYNNKAAVLKYENNVM-NIRQFNCSPHPYWLPNFMDVFTWSLPFVGE ...:..::::: .: ::.:. ..... .. :. .:. CCDS10 TVLTVWSAPNYCYRCGNVAAILELDEHLQKDFIIFEAAPQETRGIPSKKPVADYFL 260 270 280 290 300 370 380 390 400 410 420 pF1KB4 KVTEMLVNVLSICSDDELMTEGEDQFDGSAAARKEIIRNKIRAIGKMARVFSVLREESES 524 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sat Nov 5 02:30:01 2016 done: Sat Nov 5 02:30:01 2016 Total Scan time: 3.200 Total Display time: 0.080 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]