Result of FASTA (ccds) for
pF1KB4163
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4163, 939 aa
1>>>pF1KB4163 939 - 939 aa - 939 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.7208+/-0.00114; mu= 10.3102+/- 0.069
mean_var=135.4556+/-27.398, 0's: 0 Z-trim(106.6): 30 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.110199
statistics sampled from 9078 (9099) to 9078 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.631), E-opt: 0.2 (0.28), width: 16
Scan time: 4.380
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS13856.2 AP1B1 gene_id:162|Hs108|chr22 ( 939) 6060 975.8 0
CCDS13855.1 AP1B1 gene_id:162|Hs108|chr22 ( 949) 5880 947.2 0
CCDS32622.1 AP2B1 gene_id:163|Hs108|chr17 ( 937) 5195 838.3 0
CCDS54515.1 AP1B1 gene_id:162|Hs108|chr22 ( 919) 4613 745.8 8.9e-215
CCDS32621.1 AP2B1 gene_id:163|Hs108|chr17 ( 951) 3880 629.2 1.1e-179
CCDS865.1 AP4B1 gene_id:10717|Hs108|chr1 ( 739) 1001 171.5 5.4e-42
CCDS61736.1 AP3B2 gene_id:8120|Hs108|chr15 (1050) 634 113.2 2.7e-24
CCDS76192.1 AP4B1 gene_id:10717|Hs108|chr1 ( 571) 593 106.6 1.5e-22
CCDS45331.1 AP3B2 gene_id:8120|Hs108|chr15 (1082) 548 99.5 3.6e-20
CCDS61737.1 AP3B2 gene_id:8120|Hs108|chr15 (1101) 548 99.5 3.7e-20
CCDS64186.1 AP3B1 gene_id:8546|Hs108|chr5 (1045) 533 97.1 1.8e-19
CCDS4041.1 AP3B1 gene_id:8546|Hs108|chr5 (1094) 533 97.2 1.9e-19
>>CCDS13856.2 AP1B1 gene_id:162|Hs108|chr22 (939 aa)
initn: 6060 init1: 6060 opt: 6060 Z-score: 5212.5 bits: 975.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6060; 100.0% identity (100.0% similar) in 939 aa overlap (1-939:1-939)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MTDSKYFTTTKKGEIFELKAELNSDKKEKKKEAVKKVIASMTVGKDVSALFPDVVNCMQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MTDSKYFTTTKKGEIFELKAELNSDKKEKKKEAVKKVIASMTVGKDVSALFPDVVNCMQT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 DNLELKKLVYLYLMNYAKSQPDMAIMAVNTFVKDCEDPNPLIRALAVRTMGCIRVDKITE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 DNLELKKLVYLYLMNYAKSQPDMAIMAVNTFVKDCEDPNPLIRALAVRTMGCIRVDKITE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 YLCEPLRKCLKDEDPYVRKTAAVCVAKLHDINAQLVEDQGFLDTLKDLISDSNPMVVANA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 YLCEPLRKCLKDEDPYVRKTAAVCVAKLHDINAQLVEDQGFLDTLKDLISDSNPMVVANA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 VAALSEIAESHPSSNLLDLNPQSINKLLTALNECTEWGQIFILDCLANYMPKDDREAQSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 VAALSEIAESHPSSNLLDLNPQSINKLLTALNECTEWGQIFILDCLANYMPKDDREAQSI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 CERVTPRLSHANSAVVLSAVKVLMKFMEMLSKDLDYYGTLLKKLAPPLVTLLSAEPELQY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 CERVTPRLSHANSAVVLSAVKVLMKFMEMLSKDLDYYGTLLKKLAPPLVTLLSAEPELQY
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 VALRNINLIVQKRPEILKHEMKVFFVKYNDPIYVKLEKLDIMIRLASQANIAQVLAELKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 VALRNINLIVQKRPEILKHEMKVFFVKYNDPIYVKLEKLDIMIRLASQANIAQVLAELKE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 YATEVDVDFVRKAVRAIGRCAIKVEQSAERCVSTLLDLIQTKVNYVVQEAIVVIKDIFRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 YATEVDVDFVRKAVRAIGRCAIKVEQSAERCVSTLLDLIQTKVNYVVQEAIVVIKDIFRK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 YPNKYESVIATLCENLDSLDEPEARAAMIWIVGEYAERIDNADELLESFLEGFHDESTQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 YPNKYESVIATLCENLDSLDEPEARAAMIWIVGEYAERIDNADELLESFLEGFHDESTQV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 QLQLLTAIVKLFLKKPTETQELVQQVLSLATQDSDNPDLRDRGYIYWRLLSTDPVAAKEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 QLQLLTAIVKLFLKKPTETQELVQQVLSLATQDSDNPDLRDRGYIYWRLLSTDPVAAKEV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 VLAEKPLISEETDLIEPTLLDELICYIGTLASVYHKPPSAFVEGGRGVVHKSLPPRTASS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 VLAEKPLISEETDLIEPTLLDELICYIGTLASVYHKPPSAFVEGGRGVVHKSLPPRTASS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 ESAESPETAPTGAPPGEQPDVIPAQGDLLGDLLNLDLGPPVSGPPLATSSVQMGAVDLLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 ESAESPETAPTGAPPGEQPDVIPAQGDLLGDLLNLDLGPPVSGPPLATSSVQMGAVDLLG
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB4 GGLDSLIGGTNFVAPPTAAVPANLGAPIGSGLSDLFDLTSGVGTLSGSYVAPKAVWLPAM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GGLDSLIGGTNFVAPPTAAVPANLGAPIGSGLSDLFDLTSGVGTLSGSYVAPKAVWLPAM
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB4 KAKGLEISGTFTRQVGSISMDLQLTNKALQVMTDFAIQFNRNSFGLAPAAPLQVHAPLSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 KAKGLEISGTFTRQVGSISMDLQLTNKALQVMTDFAIQFNRNSFGLAPAAPLQVHAPLSP
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB4 NQTVEISLPLSTVGSVMKMEPLNNLQVAVKNNIDVFYFSTLYPLHILFVEDGKMDRQMFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 NQTVEISLPLSTVGSVMKMEPLNNLQVAVKNNIDVFYFSTLYPLHILFVEDGKMDRQMFL
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB4 ATWKDIPNENEAQFQIRDCPLNAEAASSKLQSSNIFTVAKRNVEGQDMLYQSLKLTNGIW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 ATWKDIPNENEAQFQIRDCPLNAEAASSKLQSSNIFTVAKRNVEGQDMLYQSLKLTNGIW
850 860 870 880 890 900
910 920 930
pF1KB4 VLAELRIQPGNPSCTLSLKCRAPEVSQHVYQAYETILKN
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 VLAELRIQPGNPSCTLSLKCRAPEVSQHVYQAYETILKN
910 920 930
>>CCDS13855.1 AP1B1 gene_id:162|Hs108|chr22 (949 aa)
initn: 4431 init1: 4289 opt: 5880 Z-score: 5057.8 bits: 947.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6020; 98.9% identity (98.9% similar) in 949 aa overlap (1-939:1-949)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MTDSKYFTTTKKGEIFELKAELNSDKKEKKKEAVKKVIASMTVGKDVSALFPDVVNCMQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MTDSKYFTTTKKGEIFELKAELNSDKKEKKKEAVKKVIASMTVGKDVSALFPDVVNCMQT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 DNLELKKLVYLYLMNYAKSQPDMAIMAVNTFVKDCEDPNPLIRALAVRTMGCIRVDKITE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 DNLELKKLVYLYLMNYAKSQPDMAIMAVNTFVKDCEDPNPLIRALAVRTMGCIRVDKITE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 YLCEPLRKCLKDEDPYVRKTAAVCVAKLHDINAQLVEDQGFLDTLKDLISDSNPMVVANA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 YLCEPLRKCLKDEDPYVRKTAAVCVAKLHDINAQLVEDQGFLDTLKDLISDSNPMVVANA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 VAALSEIAESHPSSNLLDLNPQSINKLLTALNECTEWGQIFILDCLANYMPKDDREAQSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 VAALSEIAESHPSSNLLDLNPQSINKLLTALNECTEWGQIFILDCLANYMPKDDREAQSI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 CERVTPRLSHANSAVVLSAVKVLMKFMEMLSKDLDYYGTLLKKLAPPLVTLLSAEPELQY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 CERVTPRLSHANSAVVLSAVKVLMKFMEMLSKDLDYYGTLLKKLAPPLVTLLSAEPELQY
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 VALRNINLIVQKRPEILKHEMKVFFVKYNDPIYVKLEKLDIMIRLASQANIAQVLAELKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 VALRNINLIVQKRPEILKHEMKVFFVKYNDPIYVKLEKLDIMIRLASQANIAQVLAELKE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 YATEVDVDFVRKAVRAIGRCAIKVEQSAERCVSTLLDLIQTKVNYVVQEAIVVIKDIFRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 YATEVDVDFVRKAVRAIGRCAIKVEQSAERCVSTLLDLIQTKVNYVVQEAIVVIKDIFRK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 YPNKYESVIATLCENLDSLDEPEARAAMIWIVGEYAERIDNADELLESFLEGFHDESTQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 YPNKYESVIATLCENLDSLDEPEARAAMIWIVGEYAERIDNADELLESFLEGFHDESTQV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 QLQLLTAIVKLFLKKPTETQELVQQVLSLATQDSDNPDLRDRGYIYWRLLSTDPVAAKEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 QLQLLTAIVKLFLKKPTETQELVQQVLSLATQDSDNPDLRDRGYIYWRLLSTDPVAAKEV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 VLAEKPLISEETDLIEPTLLDELICYIGTLASVYHKPPSAFVEGGRGVVHKSLPPRTASS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 VLAEKPLISEETDLIEPTLLDELICYIGTLASVYHKPPSAFVEGGRGVVHKSLPPRTASS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 ESAESPETAPTGAPPGEQPDVIPAQGDLLGDLLNLDLGPPVSGPPLATSSVQMGAVDLLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 ESAESPETAPTGAPPGEQPDVIPAQGDLLGDLLNLDLGPPVSGPPLATSSVQMGAVDLLG
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710
pF1KB4 GGLDSL-------IGGTNFVAPPTAAVPANLGAPIGSGLSDLFDLTSGVGTLSGSYVAPK
:::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GGLDSLMGDEPEGIGGTNFVAPPTAAVPANLGAPIGSGLSDLFDLTSGVGTLSGSYVAPK
670 680 690 700 710 720
720 730 740 750 760 770
pF1KB4 AVWLPAMKAKGLEISGTFTRQVGSISMDLQLTNKALQVMTDFAIQFNRNSFGLAPAAPLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 AVWLPAMKAKGLEISGTFTRQVGSISMDLQLTNKALQVMTDFAIQFNRNSFGLAPAAPLQ
730 740 750 760 770 780
780 790 800 810 820 830
pF1KB4 VHAPLSPNQTVEISLPLSTVGSVMKMEPLNNLQVAVKNNIDVFYFSTLYPLHILFVEDGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 VHAPLSPNQTVEISLPLSTVGSVMKMEPLNNLQVAVKNNIDVFYFSTLYPLHILFVEDGK
790 800 810 820 830 840
840 850 860 870 880 890
pF1KB4 MDRQMFLATWKDIPNENEAQFQIRDCPLNAEAASSKLQSSNIFTVAKRNVEGQDMLYQSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MDRQMFLATWKDIPNENEAQFQIRDCPLNAEAASSKLQSSNIFTVAKRNVEGQDMLYQSL
850 860 870 880 890 900
900 910 920 930
pF1KB4 KLTNGIWVLAELRIQPGNPSCT---LSLKCRAPEVSQHVYQAYETILKN
:::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::
CCDS13 KLTNGIWVLAELRIQPGNPSCTDLELSLKCRAPEVSQHVYQAYETILKN
910 920 930 940
>>CCDS32622.1 AP2B1 gene_id:163|Hs108|chr17 (937 aa)
initn: 5198 init1: 3615 opt: 5195 Z-score: 4469.3 bits: 838.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5195; 84.1% identity (95.1% similar) in 941 aa overlap (1-939:1-937)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MTDSKYFTTTKKGEIFELKAELNSDKKEKKKEAVKKVIASMTVGKDVSALFPDVVNCMQT
:::::::::.:::::::::::::..::::.:::::::::.::::::::.:::::::::::
CCDS32 MTDSKYFTTNKKGEIFELKAELNNEKKEKRKEAVKKVIAAMTVGKDVSSLFPDVVNCMQT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 DNLELKKLVYLYLMNYAKSQPDMAIMAVNTFVKDCEDPNPLIRALAVRTMGCIRVDKITE
:::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DNLELKKLVYLYLMNYAKSQPDMAIMAVNSFVKDCEDPNPLIRALAVRTMGCIRVDKITE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 YLCEPLRKCLKDEDPYVRKTAAVCVAKLHDINAQLVEDQGFLDTLKDLISDSNPMVVANA
::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::.:.:::.::::::::::
CCDS32 YLCEPLRKCLKDEDPYVRKTAAVCVAKLHDINAQMVEDQGFLDSLRDLIADSNPMVVANA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 VAALSEIAESHPSSNLLDLNPQSINKLLTALNECTEWGQIFILDCLANYMPKDDREAQSI
:::::::.::::.:::::::::.:::::::::::::::::::::::.:: ::::::::::
CCDS32 VAALSEISESHPNSNLLDLNPQNINKLLTALNECTEWGQIFILDCLSNYNPKDDREAQSI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 CERVTPRLSHANSAVVLSAVKVLMKFMEMLSKDLDYYGTLLKKLAPPLVTLLSAEPELQY
::::::::::::::::::::::::::.:.: :: :::. ::::::::::::::.:::.::
CCDS32 CERVTPRLSHANSAVVLSAVKVLMKFLELLPKDSDYYNMLLKKLAPPLVTLLSGEPEVQY
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 VALRNINLIVQKRPEILKHEMKVFFVKYNDPIYVKLEKLDIMIRLASQANIAQVLAELKE
::::::::::::::::::.:.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VALRNINLIVQKRPEILKQEIKVFFVKYNDPIYVKLEKLDIMIRLASQANIAQVLAELKE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 YATEVDVDFVRKAVRAIGRCAIKVEQSAERCVSTLLDLIQTKVNYVVQEAIVVIKDIFRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::
CCDS32 YATEVDVDFVRKAVRAIGRCAIKVEQSAERCVSTLLDLIQTKVNYVVQEAIVVIRDIFRK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 YPNKYESVIATLCENLDSLDEPEARAAMIWIVGEYAERIDNADELLESFLEGFHDESTQV
:::::::.::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 YPNKYESIIATLCENLDSLDEPDARAAMIWIVGEYAERIDNADELLESFLEGFHDESTQV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 QLQLLTAIVKLFLKKPTETQELVQQVLSLATQDSDNPDLRDRGYIYWRLLSTDPVAAKEV
:: :::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::
CCDS32 QLTLLTAIVKLFLKKPSETQELVQQVLSLATQDSDNPDLRDRGYIYWRLLSTDPVTAKEV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 VLAEKPLISEETDLIEPTLLDELICYIGTLASVYHKPPSAFVEGGRGVVHKSLPPRTASS
::.::::::::::::::::::::::.::.:::::::::.:::::..:. .: :: . .:.
CCDS32 VLSEKPLISEETDLIEPTLLDELICHIGSLASVYHKPPNAFVEGSHGIHRKHLPIHHGST
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 ESAESPETAPTGAPPGEQPDVIPAQGDLLGDLLNLDLGPPVSGPPLATSSVQMGAVDLLG
....:: .. : : :::.:::.:::::::::::::::::. : . ::.:::::::::
CCDS32 DAGDSP-VGTTTATNLEQPQVIPSQGDLLGDLLNLDLGPPVNVPQV--SSMQMGAVDLLG
610 620 630 640 650
670 680 690 700 710
pF1KB4 GGLDSLIGGTNFVAP--PTAAVPANLGAPIGSGLSDLFDLTSGVGTLSGSYVAPKAVWLP
::::::.: . :. :.. .:. : ..:::.:::.:..:.: :.::::::::::
CCDS32 GGLDSLVGQS-FIPSSVPATFAPSPTPAVVSSGLNDLFELSTGIGMAPGGYVAPKAVWLP
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KB4 AMKAKGLEISGTFTRQVGSISMDLQLTNKALQVMTDFAIQFNRNSFGLAPAAPLQVHAPL
:.::::::::::::.. : : :....:::::: :::::::::.::::. :..:: .:.::
CCDS32 AVKAKGLEISGTFTHRQGHIYMEMNFTNKALQHMTDFAIQFNKNSFGVIPSTPLAIHTPL
720 730 740 750 760 770
780 790 800 810 820 830
pF1KB4 SPNQTVEISLPLSTVGSVMKMEPLNNLQVAVKNNIDVFYFSTLYPLHILFVEDGKMDRQM
:::....::::.:.: :::::::::::::::::::::::: : ::..::::::::.::.
CCDS32 MPNQSIDVSLPLNTLGPVMKMEPLNNLQVAVKNNIDVFYFSCLIPLNVLFVEDGKMERQV
780 790 800 810 820 830
840 850 860 870 880 890
pF1KB4 FLATWKDIPNENEAQFQIRDCPLNAEAASSKLQSSNIFTVAKRNVEGQDMLYQSLKLTNG
::::::::::::: ::::..: :::...:::::..:..:.::::::::::::::::::::
CCDS32 FLATWKDIPNENELQFQIKECHLNADTVSSKLQNNNVYTIAKRNVEGQDMLYQSLKLTNG
840 850 860 870 880 890
900 910 920 930
pF1KB4 IWVLAELRIQPGNPSCTLSLKCRAPEVSQHVYQAYETILKN
::.:::::::::::. :::::::::::::..::.:..::::
CCDS32 IWILAELRIQPGNPNYTLSLKCRAPEVSQYIYQVYDSILKN
900 910 920 930
>>CCDS54515.1 AP1B1 gene_id:162|Hs108|chr22 (919 aa)
initn: 4593 init1: 4593 opt: 4613 Z-score: 3969.4 bits: 745.8 E(32554): 8.9e-215
Smith-Waterman score: 5877; 97.9% identity (97.9% similar) in 939 aa overlap (1-939:1-919)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MTDSKYFTTTKKGEIFELKAELNSDKKEKKKEAVKKVIASMTVGKDVSALFPDVVNCMQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MTDSKYFTTTKKGEIFELKAELNSDKKEKKKEAVKKVIASMTVGKDVSALFPDVVNCMQT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 DNLELKKLVYLYLMNYAKSQPDMAIMAVNTFVKDCEDPNPLIRALAVRTMGCIRVDKITE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 DNLELKKLVYLYLMNYAKSQPDMAIMAVNTFVKDCEDPNPLIRALAVRTMGCIRVDKITE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 YLCEPLRKCLKDEDPYVRKTAAVCVAKLHDINAQLVEDQGFLDTLKDLISDSNPMVVANA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 YLCEPLRKCLKDEDPYVRKTAAVCVAKLHDINAQLVEDQGFLDTLKDLISDSNPMVVANA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 VAALSEIAESHPSSNLLDLNPQSINKLLTALNECTEWGQIFILDCLANYMPKDDREAQSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VAALSEIAESHPSSNLLDLNPQSINKLLTALNECTEWGQIFILDCLANYMPKDDREAQSI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 CERVTPRLSHANSAVVLSAVKVLMKFMEMLSKDLDYYGTLLKKLAPPLVTLLSAEPELQY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 CERVTPRLSHANSAVVLSAVKVLMKFMEMLSKDLDYYGTLLKKLAPPLVTLLSAEPELQY
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 VALRNINLIVQKRPEILKHEMKVFFVKYNDPIYVKLEKLDIMIRLASQANIAQVLAELKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VALRNINLIVQKRPEILKHEMKVFFVKYNDPIYVKLEKLDIMIRLASQANIAQVLAELKE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 YATEVDVDFVRKAVRAIGRCAIKVEQSAERCVSTLLDLIQTKVNYVVQEAIVVIKDIFRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 YATEVDVDFVRKAVRAIGRCAIKVEQSAERCVSTLLDLIQTKVNYVVQEAIVVIKDIFRK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 YPNKYESVIATLCENLDSLDEPEARAAMIWIVGEYAERIDNADELLESFLEGFHDESTQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 YPNKYESVIATLCENLDSLDEPEARAAMIWIVGEYAERIDNADELLESFLEGFHDESTQV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 QLQLLTAIVKLFLKKPTETQELVQQVLSLATQDSDNPDLRDRGYIYWRLLSTDPVAAKEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 QLQLLTAIVKLFLKKPTETQELVQQVLSLATQDSDNPDLRDRGYIYWRLLSTDPVAAKEV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 VLAEKPLISEETDLIEPTLLDELICYIGTLASVYHKPPSAFVEGGRGVVHKSLPPRTASS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VLAEKPLISEETDLIEPTLLDELICYIGTLASVYHKPPSAFVEGGRGVVHKSLPPRTASS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 ESAESPETAPTGAPPGEQPDVIPAQGDLLGDLLNLDLGPPVSGPPLATSSVQMGAVDLLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ESAESPETAPTGAPPGEQPDVIPAQGDLLGDLLNLDLGPPVSGPPLATSSVQMGAVDLLG
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB4 GGLDSLIGGTNFVAPPTAAVPANLGAPIGSGLSDLFDLTSGVGTLSGSYVAPKAVWLPAM
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GGLDSLIGGTNFVAPPTAAVPANLGAPIGSGLSDLFDLTSGVGTLSGSYVAPKAV-----
670 680 690 700 710
730 740 750 760 770 780
pF1KB4 KAKGLEISGTFTRQVGSISMDLQLTNKALQVMTDFAIQFNRNSFGLAPAAPLQVHAPLSP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ---------------GSISMDLQLTNKALQVMTDFAIQFNRNSFGLAPAAPLQVHAPLSP
720 730 740 750 760
790 800 810 820 830 840
pF1KB4 NQTVEISLPLSTVGSVMKMEPLNNLQVAVKNNIDVFYFSTLYPLHILFVEDGKMDRQMFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 NQTVEISLPLSTVGSVMKMEPLNNLQVAVKNNIDVFYFSTLYPLHILFVEDGKMDRQMFL
770 780 790 800 810 820
850 860 870 880 890 900
pF1KB4 ATWKDIPNENEAQFQIRDCPLNAEAASSKLQSSNIFTVAKRNVEGQDMLYQSLKLTNGIW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ATWKDIPNENEAQFQIRDCPLNAEAASSKLQSSNIFTVAKRNVEGQDMLYQSLKLTNGIW
830 840 850 860 870 880
910 920 930
pF1KB4 VLAELRIQPGNPSCTLSLKCRAPEVSQHVYQAYETILKN
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VLAELRIQPGNPSCTLSLKCRAPEVSQHVYQAYETILKN
890 900 910
>>CCDS32621.1 AP2B1 gene_id:163|Hs108|chr17 (951 aa)
initn: 5196 init1: 3615 opt: 3880 Z-score: 3339.3 bits: 629.2 E(32554): 1.1e-179
Smith-Waterman score: 5177; 83.0% identity (93.9% similar) in 954 aa overlap (1-939:1-951)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MTDSKYFTTTKKGEIFELKAELNSDKKEKKKEAVKKVIASMTVGKDVSALFPDVVNCMQT
:::::::::.:::::::::::::..::::.:::::::::.::::::::.:::::::::::
CCDS32 MTDSKYFTTNKKGEIFELKAELNNEKKEKRKEAVKKVIAAMTVGKDVSSLFPDVVNCMQT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 DNLELKKLVYLYLMNYAKSQPDMAIMAVNTFVKDCEDPNPLIRALAVRTMGCIRVDKITE
:::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DNLELKKLVYLYLMNYAKSQPDMAIMAVNSFVKDCEDPNPLIRALAVRTMGCIRVDKITE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 YLCEPLRKCLKDEDPYVRKTAAVCVAKLHDINAQLVEDQGFLDTLKDLISDSNPMVVANA
::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::.:.:::.::::::::::
CCDS32 YLCEPLRKCLKDEDPYVRKTAAVCVAKLHDINAQMVEDQGFLDSLRDLIADSNPMVVANA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 VAALSEIAESHPSSNLLDLNPQSINKLLTALNECTEWGQIFILDCLANYMPKDDREAQSI
:::::::.::::.:::::::::.:::::::::::::::::::::::.:: ::::::::::
CCDS32 VAALSEISESHPNSNLLDLNPQNINKLLTALNECTEWGQIFILDCLSNYNPKDDREAQSI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 CERVTPRLSHANSAVVLSAVKVLMKFMEMLSKDLDYYGTLLKKLAPPLVTLLSAEPELQY
::::::::::::::::::::::::::.:.: :: :::. ::::::::::::::.:::.::
CCDS32 CERVTPRLSHANSAVVLSAVKVLMKFLELLPKDSDYYNMLLKKLAPPLVTLLSGEPEVQY
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 VALRNINLIVQKRPEILKHEMKVFFVKYNDPIYVKLEKLDIMIRLASQANIAQVLAELKE
::::::::::::::::::.:.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VALRNINLIVQKRPEILKQEIKVFFVKYNDPIYVKLEKLDIMIRLASQANIAQVLAELKE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 YATEVDVDFVRKAVRAIGRCAIKVEQSAERCVSTLLDLIQTKVNYVVQEAIVVIKDIFRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::
CCDS32 YATEVDVDFVRKAVRAIGRCAIKVEQSAERCVSTLLDLIQTKVNYVVQEAIVVIRDIFRK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 YPNKYESVIATLCENLDSLDEPEARAAMIWIVGEYAERIDNADELLESFLEGFHDESTQV
:::::::.::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 YPNKYESIIATLCENLDSLDEPDARAAMIWIVGEYAERIDNADELLESFLEGFHDESTQV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 QLQLLTAIVKLFLKKPTETQELVQQVLSLATQDSDNPDLRDRGYIYWRLLSTDPVAAKEV
:: :::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::
CCDS32 QLTLLTAIVKLFLKKPSETQELVQQVLSLATQDSDNPDLRDRGYIYWRLLSTDPVTAKEV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 VLAEKPLISEETDLIEPTLLDELICYIGTLASVYHKPPSAFVEGGRGVVHKSLPPRTASS
::.::::::::::::::::::::::.::.:::::::::.:::::..:. .: :: . .:.
CCDS32 VLSEKPLISEETDLIEPTLLDELICHIGSLASVYHKPPNAFVEGSHGIHRKHLPIHHGST
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 ESAESPETAPTGAPPGEQPDVIPAQGDLLGDLLNLDLGPPVSGPPLATSSVQMGAVDLLG
....:: .. : : :::.:::.:::::::::::::::::. : . ::.:::::::::
CCDS32 DAGDSP-VGTTTATNLEQPQVIPSQGDLLGDLLNLDLGPPVNVPQV--SSMQMGAVDLLG
610 620 630 640 650
670 680 690 700
pF1KB4 GGLDSLIG-------------GTNFVAP--PTAAVPANLGAPIGSGLSDLFDLTSGVGTL
::::::.: : .:. :.. .:. : ..:::.:::.:..:.:
CCDS32 GGLDSLLGSDLGGGIGGSPAVGQSFIPSSVPATFAPSPTPAVVSSGLNDLFELSTGIGMA
660 670 680 690 700 710
710 720 730 740 750 760
pF1KB4 SGSYVAPKAVWLPAMKAKGLEISGTFTRQVGSISMDLQLTNKALQVMTDFAIQFNRNSFG
:.:::::::::::.::::::::::::.. : : :....:::::: :::::::::.::::
CCDS32 PGGYVAPKAVWLPAVKAKGLEISGTFTHRQGHIYMEMNFTNKALQHMTDFAIQFNKNSFG
720 730 740 750 760 770
770 780 790 800 810 820
pF1KB4 LAPAAPLQVHAPLSPNQTVEISLPLSTVGSVMKMEPLNNLQVAVKNNIDVFYFSTLYPLH
. :..:: .:.:: :::....::::.:.: :::::::::::::::::::::::: : ::.
CCDS32 VIPSTPLAIHTPLMPNQSIDVSLPLNTLGPVMKMEPLNNLQVAVKNNIDVFYFSCLIPLN
780 790 800 810 820 830
830 840 850 860 870 880
pF1KB4 ILFVEDGKMDRQMFLATWKDIPNENEAQFQIRDCPLNAEAASSKLQSSNIFTVAKRNVEG
.::::::::.::.::::::::::::: ::::..: :::...:::::..:..:.:::::::
CCDS32 VLFVEDGKMERQVFLATWKDIPNENELQFQIKECHLNADTVSSKLQNNNVYTIAKRNVEG
840 850 860 870 880 890
890 900 910 920 930
pF1KB4 QDMLYQSLKLTNGIWVLAELRIQPGNPSCTLSLKCRAPEVSQHVYQAYETILKN
:::::::::::::::.:::::::::::. :::::::::::::..::.:..::::
CCDS32 QDMLYQSLKLTNGIWILAELRIQPGNPNYTLSLKCRAPEVSQYIYQVYDSILKN
900 910 920 930 940 950
>>CCDS865.1 AP4B1 gene_id:10717|Hs108|chr1 (739 aa)
initn: 961 init1: 423 opt: 1001 Z-score: 867.3 bits: 171.5 E(32554): 5.4e-42
Smith-Waterman score: 1003; 30.7% identity (66.3% similar) in 609 aa overlap (29-629:28-619)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MTDSKYFTTTKKGEIFELKAELNSDKKEKKKEAVKKVIASMTVGKDVSALFPDVVNCMQT
. ......:: :: : :.:..: ..:. :
CCDS86 MPYLGSEDVVKELKKALCNPHIQADRLRYRNVIQRVIRYMTQGLDMSGVFMEMVKASAT
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 DNLELKKLVYLYLMNYAKSQPDMAIMAVNTFVKDCEDPNPLIRALAVRTMGCIRVDKITE
.. :::::::. .:: .::.:..:.::. ::: ::::..:.::.:.: .:. . :
CCDS86 VDIVQKKLVYLYMCTYAPLKPDLALLAINTLCKDCSDPNPMVRGLALRSMCSLRMPGVQE
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 YLCEPLRKCLKDEDPYVRKTAAVCVAKLHDINAQLVEDQGFLDTLKDLISDSNPMVVANA
:. .:. . :.:. :::..:.. ::.:..... : .... : .:. :..:.::.:
CCDS86 YIQQPILNGLRDKASYVRRVAVLGCAKMHNLHGDSEVDGALVNELYSLLRDQDPIVVVNC
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 VAALSEIAESHPSSNLLDLNPQSINKLLTALNECTEWGQIFILDCLANYMPKDDREAQSI
. .: :: ... . . .: ..::. ... .::: .:. : :.:....: .:
CCDS86 LRSLEEILKQEGG---VVINKPIAHHLLNRMSKLDQWGQAEVLNFLLRYQPRSEEELFDI
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290
pF1KB4 CERVTPRLSHANSAVVLSAVKVLMKFMEMLSKDLDYYGT-LLKKLAPPLVTLLSAEP-EL
. . :. .. .::..:.:... .:.: . . : .: .. ::.. :.: ::
CCDS86 LNLLDSFLKSSSPGVVMGATKLFL----ILAKMFPHVQTDVLVRVKGPLLAACSSESREL
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB4 QYVALRNINLIVQKRPEILKHEMKVFFVKYNDPIYVKLEKLDIMIRLASQANIAQVLAEL
.::: .. :... : .. ..: :: .:..: :.::.:.... .:... :. ::: ::
CCDS86 CFVALCHVRQILHSLPGHFSSHYKKFFCSYSEPHYIKLQKVEVLCELVNDENVQQVLEEL
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB4 KEYATEVDVDFVRKAVRAIGRCAIKVEQSAERCVSTLLDLIQTKVNYVVQEAIVVIKDIF
. : :.:..::.. :. ::: : . ...::. : .:. . .... .. ...:.
CCDS86 RGYCTDVSADFAQAAIFAIGGIA---RTYTDQCVQILTELLGLRQEHITTVVVQTFRDLV
360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KB4 RKYPNKYESVIATL--CENLDSLDEPEARAAMIWIVGEYAERIDNADELLESFLEGFHDE
:. :.: .: :: ..... :.. :.::..: ..::: :: .::.:.:. ..:
CCDS86 WLCPQCTEAVCQALPGCE--ENIQDSEGKQALIWLLGVHGERIPNAPYVLEDFVENVKSE
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KB4 S-TQVQLQLLTAIVKLFLKKPTETQELVQQVLSLATQDSDNPDLRDRGYIYWRLLSTDPV
. :...::::...:::..:.: :... ..: .. . .:::: .:.::: .
CCDS86 TFPAVKMELLTALLRLFLSRPAECQDMLGRLLYYCIEEEKDMAVRDRGLFYYRLLLVGID
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KB4 AAKEVVLAEK--PLISEETDLIE-PTLLDELICYIGTLASVYHKPPSAFVEGGRGVVHKS
.:... . : : .. : : : .. ..::. :: : : . .:. ..
CCDS86 EVKRILCSPKSDPTLGLLEDPAERP--VNSWASDFNTLVPVYGKAHWATISKCQGA-ERC
530 540 550 560 570 580
600 610 620 630 640 650
pF1KB4 LPPRTASSESAESPETAPTGAPPGEQPDVIPAQGDLLGDLLNLDLGPPVSGPPLATSSVQ
: .: : : : :. . .: .: :.
CCDS86 DPELPKTSSFAASGPLIPEENK--ERVQELPDSGALMLVPNRQLTADYFEKTWLSLKVAH
590 600 610 620 630 640
660 670 680 690 700 710
pF1KB4 MGAVDLLGGGLDSLIGGTNFVAPPTAAVPANLGAPIGSGLSDLFDLTSGVGTLSGSYVAP
CCDS86 QQVLPWRGEFHPDTLQMALQVVNIQTIAMSRAGSRPWKAYLSAQDDTGCLFLTELLLEPG
650 660 670 680 690 700
>>CCDS61736.1 AP3B2 gene_id:8120|Hs108|chr15 (1050 aa)
initn: 663 init1: 423 opt: 634 Z-score: 549.7 bits: 113.2 E(32554): 2.7e-24
Smith-Waterman score: 749; 28.2% identity (57.4% similar) in 613 aa overlap (17-583:41-608)
10 20 30 40
pF1KB4 MTDSKYFTTTKKGEIFELKAELNSDKKEKKKEAVKKVIASMTVGKD
.:: :...: : ::.:...: .. ::.
CCDS61 KGGSAGPGEPEYGHDPASGGIFSSDYKRHDDLKEMLDTNKDSLKLEAMKRIVAMIARGKN
20 30 40 50 60 70
50 60 70 80 90 100
pF1KB4 VSALFPDVVNCMQTDNLELKKLVYLYLMNYAKSQPDMAIMAVNTFVKDCEDPNPLIRALA
.: ::: ::. :. :. :::: :::: :
CCDS61 ASDLFPAVVK--------------------------------NVACKNIEDPNQLIRASA
80 90
110 120 130 140 150 160
pF1KB4 VRTMGCIRVDKITEYLCEPLRKCLKDEDPYVRKTAAVCVAKLHDINAQLVEDQGFLDTLK
.:... ::: :. . ... .: .:::::::: . ::...... .:: ......
CCDS61 LRVLSSIRVPIIVPIMMLAIKEAASDMSPYVRKTAAHAIPKLYSLDSDQ-KDQ-LIEVIE
100 110 120 130 140 150
170 180 190 200 210 220
pF1KB4 DLISDSNPMVVANAVAALSEIAESHPSSNLLDLNPQSINKLLTALNECTEWGQIFILDCL
:..:.. .:....: :. :. : .:: .. :: . : . ::::. :.. :
CCDS61 KLLADKTTLVAGSVVMAFEEVC---PER--IDLIHKNYRKLCNLLIDVEEWGQVVIISML
160 170 180 190 200 210
230 240 250
pF1KB4 ANYM------P-----------------KDDREAQSICERVT---------PRLSHANSA
. : : ... ::.. . : : . .
CCDS61 TRYARTQFLSPTQNESLLEENAEKAFYGSEEDEAKGAGSEETAAAAAPSRKPYVMDPDHR
220 230 240 250 260 270
260 270 280 290 300
pF1KB4 VVLSAVKVLM--KFMEMLSKDLDYYGTLLKK-----LAPPLVTLLSAEPELQYVALRNIN
..: .: :. . .. . : : : .: :: :: .. :.:::.:.:.
CCDS61 LLLRNTKPLLQSRSAAVVMAVAQLYFHLAPKAEVGVIAKALVRLLRSHSEVQYVVLQNVA
280 290 300 310 320 330
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 LIVQKRPEILKHEMKVFFVKYNDPIYVKLEKLDIMIRLASQANIAQVLAELKEYATEVDV
. :: ... .: :... .:: .:. ::... ::...:: :: :.. : .:
CCDS61 TMSIKRRGMFEPYLKSFYIRSTDPTQIKILKLEVLTNLANETNIPTVLREFQTYIRSMDK
340 350 360 370 380 390
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 DFVRKAVRAIGRCAIKVEQSAERCVSTLLDLIQTKVNYVVQEAIVVIKDIFRKYPNKYES
::: ...:::::: .. . . :.. :..:.... . :: :..:::: ... : ..
CCDS61 DFVAATIQAIGRCATNIGRVRDTCLNGLVQLLSNRDELVVAESVVVIKKLLQMQPAQHGE
400 410 420 430 440 450
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 VIATLCENLDSLDEPEARAAMIWIVGEYAERIDN-ADELLESFLEGFHDESTQVQLQLLT
.: : . :... : :::...:..::: :.. : ..:... ..: : :.::...
CCDS61 IIKHLAKLTDNIQVPMARASILWLIGEYCEHVPRIAPDVLRKMAKSFTAEEDIVKLQVIN
460 470 480 490 500 510
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 AIVKLFLKKPTETQELVQQVLSLATQDSDNPDLRDRGYIYWRLLSTDPVA------AKEV
.::.: . .:. :.: ::::: :. : :.:::. . .:. . . ::..
CCDS61 LAAKLYLTNSKQTKLLTQYVLSLAKYDQ-NYDIRDRARFTRQLIVPSEQGGALSRHAKKL
520 530 540 550 560 570
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 VLAEKPLISEETDLIEPTLLDELICYIGTLASVYHKPPSAFVEGGRGVVHKSLPPRTASS
:: :: . ..: .. :. .:.:. . . ... :
CCDS61 FLAPKP-----APVLESSFKDRDHFQLGSLSHLLNAKATGYQELPDWPEEAPDPSVRNVE
580 590 600 610 620
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 ESAESPETAPTGAPPGEQPDVIPAQGDLLGDLLNLDLGPPVSGPPLATSSVQMGAVDLLG
CCDS61 VPEWTKCSNREKRKEKEKPFYSDSEGESGPTESADSDPESESESDSKSSSESGSGESSSE
630 640 650 660 670 680
>>CCDS76192.1 AP4B1 gene_id:10717|Hs108|chr1 (571 aa)
initn: 458 init1: 225 opt: 593 Z-score: 518.5 bits: 106.6 E(32554): 1.5e-22
Smith-Waterman score: 593; 27.2% identity (62.2% similar) in 463 aa overlap (174-629:2-451)
150 160 170 180 190 200
pF1KB4 CVAKLHDINAQLVEDQGFLDTLKDLISDSNPMVVANAVAALSEIAESHPSSNLLDLNPQS
:.. .. :. . : .: . : ..
CCDS76 MPYLGSEDVVKELKKALCNPHIQADRLRYRN
10 20 30
210 220 230 240 250 260
pF1KB4 INKLLTALNECTEWGQIFILDCLANYMPKDDREAQSICERVTPRLSHANSAVVLSAVKVL
. . . ... .::: .:. : :.:....: .: . . :. .. .::..:.:..
CCDS76 VIQRVIRMSKLDQWGQAEVLNFLLRYQPRSEEELFDILNLLDSFLKSSSPGVVMGATKLF
40 50 60 70 80 90
270 280 290 300 310 320
pF1KB4 MKFMEMLSKDLDYYGTLLKKLAPPLVTLLSAEP-ELQYVALRNINLIVQKRPEILKHEMK
. . .:. . .: .. ::.. :.: :: .::: .. :... : .. ..:
CCDS76 LILAKMFPH---VQTDVLVRVKGPLLAACSSESRELCFVALCHVRQILHSLPGHFSSHYK
100 110 120 130 140
330 340 350 360 370 380
pF1KB4 VFFVKYNDPIYVKLEKLDIMIRLASQANIAQVLAELKEYATEVDVDFVRKAVRAIGRCAI
:: .:..: :.::.:.... .:... :. ::: ::. : :.:..::.. :. ::: :
CCDS76 KFFCSYSEPHYIKLQKVEVLCELVNDENVQQVLEELRGYCTDVSADFAQAAIFAIGGIA-
150 160 170 180 190 200
390 400 410 420 430 440
pF1KB4 KVEQSAERCVSTLLDLIQTKVNYVVQEAIVVIKDIFRKYPNKYESVIATL--CENLDSLD
. ...::. : .:. . .... .. ...:. :. :.: .: :: ....
CCDS76 --RTYTDQCVQILTELLGLRQEHITTVVVQTFRDLVWLCPQCTEAVCQALPGCE--ENIQ
210 220 230 240 250 260
450 460 470 480 490
pF1KB4 EPEARAAMIWIVGEYAERIDNADELLESFLEGFHDES-TQVQLQLLTAIVKLFLKKPTET
. :.. :.::..: ..::: :: .::.:.:. ..:. :...::::...:::..:.:
CCDS76 DSEGKQALIWLLGVHGERIPNAPYVLEDFVENVKSETFPAVKMELLTALLRLFLSRPAEC
270 280 290 300 310 320
500 510 520 530 540 550
pF1KB4 QELVQQVLSLATQDSDNPDLRDRGYIYWRLLSTDPVAAKEVVLAEK--PLISEETDLIE-
:... ..: .. . .:::: .:.::: . .:... . : : .. : :
CCDS76 QDMLGRLLYYCIEEEKDMAVRDRGLFYYRLLLVGIDEVKRILCSPKSDPTLGLLEDPAER
330 340 350 360 370 380
560 570 580 590 600 610
pF1KB4 PTLLDELICYIGTLASVYHKPPSAFVEGGRGVVHKSLPPRTASSESAESPETAPTGAPPG
: .. ..::. :: : : . .:. .. : .: : : :
CCDS76 P--VNSWASDFNTLVPVYGKAHWATISKCQGA-ERCDPELPKTSSFAASGPLIPEENK--
390 400 410 420 430
620 630 640 650 660 670
pF1KB4 EQPDVIPAQGDLLGDLLNLDLGPPVSGPPLATSSVQMGAVDLLGGGLDSLIGGTNFVAPP
:. . .: .: :.
CCDS76 ERVQELPDSGALMLVPNRQLTADYFEKTWLSLKVAHQQVLPWRGEFHPDTLQMALQVVNI
440 450 460 470 480 490
>>CCDS45331.1 AP3B2 gene_id:8120|Hs108|chr15 (1082 aa)
initn: 867 init1: 423 opt: 548 Z-score: 475.6 bits: 99.5 E(32554): 3.6e-20
Smith-Waterman score: 921; 30.3% identity (61.5% similar) in 613 aa overlap (17-583:41-640)
10 20 30 40
pF1KB4 MTDSKYFTTTKKGEIFELKAELNSDKKEKKKEAVKKVIASMTVGKD
.:: :...: : ::.:...: .. ::.
CCDS45 KGGSAGPGEPEYGHDPASGGIFSSDYKRHDDLKEMLDTNKDSLKLEAMKRIVAMIARGKN
20 30 40 50 60 70
50 60 70 80 90 100
pF1KB4 VSALFPDVVNCMQTDNLELKKLVYLYLMNYAKSQPDMAIMAVNTFVKDCEDPNPLIRALA
.: ::: ::. . :.:.:::::.::. ::. : :.:.....:: . .::: :::: :
CCDS45 ASDLFPAVVKNVACKNIEVKKLVYVYLVRYAEEQQDLALLSISTFQRGLKDPNQLIRASA
80 90 100 110 120 130
110 120 130 140 150 160
pF1KB4 VRTMGCIRVDKITEYLCEPLRKCLKDEDPYVRKTAAVCVAKLHDINAQLVEDQGFLDTLK
.:... ::: :. . ... .: .:::::::: . ::...... .:: ......
CCDS45 LRVLSSIRVPIIVPIMMLAIKEAASDMSPYVRKTAAHAIPKLYSLDSDQ-KDQ-LIEVIE
140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB4 DLISDSNPMVVANAVAALSEIAESHPSSNLLDLNPQSINKLLTALNECTEWGQIFILDCL
:..:.. .:....: :. :. : .:: .. :: . : . ::::. :.. :
CCDS45 KLLADKTTLVAGSVVMAFEEVC---PER--IDLIHKNYRKLCNLLIDVEEWGQVVIISML
190 200 210 220 230 240
230 240 250
pF1KB4 ANYM------P-----------------KDDREAQSICERVT---------PRLSHANSA
. : : ... ::.. . : : . .
CCDS45 TRYARTQFLSPTQNESLLEENAEKAFYGSEEDEAKGAGSEETAAAAAPSRKPYVMDPDHR
250 260 270 280 290 300
260 270 280 290 300
pF1KB4 VVLSAVKVLM--KFMEMLSKDLDYYGTLLKK-----LAPPLVTLLSAEPELQYVALRNIN
..: .: :. . .. . : : : .: :: :: .. :.:::.:.:.
CCDS45 LLLRNTKPLLQSRSAAVVMAVAQLYFHLAPKAEVGVIAKALVRLLRSHSEVQYVVLQNVA
310 320 330 340 350 360
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 LIVQKRPEILKHEMKVFFVKYNDPIYVKLEKLDIMIRLASQANIAQVLAELKEYATEVDV
. :: ... .: :... .:: .:. ::... ::...:: :: :.. : .:
CCDS45 TMSIKRRGMFEPYLKSFYIRSTDPTQIKILKLEVLTNLANETNIPTVLREFQTYIRSMDK
370 380 390 400 410 420
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 DFVRKAVRAIGRCAIKVEQSAERCVSTLLDLIQTKVNYVVQEAIVVIKDIFRKYPNKYES
::: ...:::::: .. . . :.. :..:.... . :: :..:::: ... : ..
CCDS45 DFVAATIQAIGRCATNIGRVRDTCLNGLVQLLSNRDELVVAESVVVIKKLLQMQPAQHGE
430 440 450 460 470 480
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 VIATLCENLDSLDEPEARAAMIWIVGEYAERIDN-ADELLESFLEGFHDESTQVQLQLLT
.: : . :... : :::...:..::: :.. : ..:... ..: : :.::...
CCDS45 IIKHLAKLTDNIQVPMARASILWLIGEYCEHVPRIAPDVLRKMAKSFTAEEDIVKLQVIN
490 500 510 520 530 540
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 AIVKLFLKKPTETQELVQQVLSLATQDSDNPDLRDRGYIYWRLLSTDPVA------AKEV
.::.: . .:. :.: ::::: :. : :.:::. . .:. . . ::..
CCDS45 LAAKLYLTNSKQTKLLTQYVLSLAKYDQ-NYDIRDRARFTRQLIVPSEQGGALSRHAKKL
550 560 570 580 590 600
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 VLAEKPLISEETDLIEPTLLDELICYIGTLASVYHKPPSAFVEGGRGVVHKSLPPRTASS
:: :: . ..: .. :. .:.:. . . ... :
CCDS45 FLAPKP-----APVLESSFKDRDHFQLGSLSHLLNAKATGYQELPDWPEEAPDPSVRNVE
610 620 630 640 650
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 ESAESPETAPTGAPPGEQPDVIPAQGDLLGDLLNLDLGPPVSGPPLATSSVQMGAVDLLG
CCDS45 VPEWTKCSNREKRKEKEKPFYSDSEGESGPTESADSDPESESESDSKSSSESGSGESSSE
660 670 680 690 700 710
>>CCDS61737.1 AP3B2 gene_id:8120|Hs108|chr15 (1101 aa)
initn: 867 init1: 423 opt: 548 Z-score: 475.5 bits: 99.5 E(32554): 3.7e-20
Smith-Waterman score: 921; 30.3% identity (61.5% similar) in 613 aa overlap (17-583:41-640)
10 20 30 40
pF1KB4 MTDSKYFTTTKKGEIFELKAELNSDKKEKKKEAVKKVIASMTVGKD
.:: :...: : ::.:...: .. ::.
CCDS61 KGGSAGPGEPEYGHDPASGGIFSSDYKRHDDLKEMLDTNKDSLKLEAMKRIVAMIARGKN
20 30 40 50 60 70
50 60 70 80 90 100
pF1KB4 VSALFPDVVNCMQTDNLELKKLVYLYLMNYAKSQPDMAIMAVNTFVKDCEDPNPLIRALA
.: ::: ::. . :.:.:::::.::. ::. : :.:.....:: . .::: :::: :
CCDS61 ASDLFPAVVKNVACKNIEVKKLVYVYLVRYAEEQQDLALLSISTFQRGLKDPNQLIRASA
80 90 100 110 120 130
110 120 130 140 150 160
pF1KB4 VRTMGCIRVDKITEYLCEPLRKCLKDEDPYVRKTAAVCVAKLHDINAQLVEDQGFLDTLK
.:... ::: :. . ... .: .:::::::: . ::...... .:: ......
CCDS61 LRVLSSIRVPIIVPIMMLAIKEAASDMSPYVRKTAAHAIPKLYSLDSDQ-KDQ-LIEVIE
140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB4 DLISDSNPMVVANAVAALSEIAESHPSSNLLDLNPQSINKLLTALNECTEWGQIFILDCL
:..:.. .:....: :. :. : .:: .. :: . : . ::::. :.. :
CCDS61 KLLADKTTLVAGSVVMAFEEVC---PER--IDLIHKNYRKLCNLLIDVEEWGQVVIISML
190 200 210 220 230 240
230 240 250
pF1KB4 ANYM------P-----------------KDDREAQSICERVT---------PRLSHANSA
. : : ... ::.. . : : . .
CCDS61 TRYARTQFLSPTQNESLLEENAEKAFYGSEEDEAKGAGSEETAAAAAPSRKPYVMDPDHR
250 260 270 280 290 300
260 270 280 290 300
pF1KB4 VVLSAVKVLM--KFMEMLSKDLDYYGTLLKK-----LAPPLVTLLSAEPELQYVALRNIN
..: .: :. . .. . : : : .: :: :: .. :.:::.:.:.
CCDS61 LLLRNTKPLLQSRSAAVVMAVAQLYFHLAPKAEVGVIAKALVRLLRSHSEVQYVVLQNVA
310 320 330 340 350 360
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 LIVQKRPEILKHEMKVFFVKYNDPIYVKLEKLDIMIRLASQANIAQVLAELKEYATEVDV
. :: ... .: :... .:: .:. ::... ::...:: :: :.. : .:
CCDS61 TMSIKRRGMFEPYLKSFYIRSTDPTQIKILKLEVLTNLANETNIPTVLREFQTYIRSMDK
370 380 390 400 410 420
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 DFVRKAVRAIGRCAIKVEQSAERCVSTLLDLIQTKVNYVVQEAIVVIKDIFRKYPNKYES
::: ...:::::: .. . . :.. :..:.... . :: :..:::: ... : ..
CCDS61 DFVAATIQAIGRCATNIGRVRDTCLNGLVQLLSNRDELVVAESVVVIKKLLQMQPAQHGE
430 440 450 460 470 480
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 VIATLCENLDSLDEPEARAAMIWIVGEYAERIDN-ADELLESFLEGFHDESTQVQLQLLT
.: : . :... : :::...:..::: :.. : ..:... ..: : :.::...
CCDS61 IIKHLAKLTDNIQVPMARASILWLIGEYCEHVPRIAPDVLRKMAKSFTAEEDIVKLQVIN
490 500 510 520 530 540
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 AIVKLFLKKPTETQELVQQVLSLATQDSDNPDLRDRGYIYWRLLSTDPVA------AKEV
.::.: . .:. :.: ::::: :. : :.:::. . .:. . . ::..
CCDS61 LAAKLYLTNSKQTKLLTQYVLSLAKYDQ-NYDIRDRARFTRQLIVPSEQGGALSRHAKKL
550 560 570 580 590 600
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 VLAEKPLISEETDLIEPTLLDELICYIGTLASVYHKPPSAFVEGGRGVVHKSLPPRTASS
:: :: . ..: .. :. .:.:. . . ... :
CCDS61 FLAPKP-----APVLESSFKDRDHFQLGSLSHLLNAKATGYQELPDWPEEAPDPSVRNVE
610 620 630 640 650
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 ESAESPETAPTGAPPGEQPDVIPAQGDLLGDLLNLDLGPPVSGPPLATSSVQMGAVDLLG
CCDS61 EEDLSLIETHVGLLGEYTEVPEWTKCSNREKRKEKEKPFYSDSEGESGPTESADSDPESE
660 670 680 690 700 710
939 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 02:51:52 2016 done: Fri Nov 4 02:51:52 2016
Total Scan time: 4.380 Total Display time: 0.310
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]