FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB4196, 957 aa 1>>>pF1KB4196 957 - 957 aa - 957 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.2327+/-0.000955; mu= 13.1536+/- 0.058 mean_var=127.6314+/-25.798, 0's: 0 Z-trim(109.2): 48 B-trim: 73 in 1/50 Lambda= 0.113526 statistics sampled from 10685 (10731) to 10685 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.68), E-opt: 0.2 (0.33), width: 16 Scan time: 3.690 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS14480.2 DRP2 gene_id:1821|Hs108|chrX ( 957) 6406 1061.2 0 CCDS55465.1 DRP2 gene_id:1821|Hs108|chrX ( 879) 5833 967.3 0 CCDS75965.1 DMD gene_id:1756|Hs108|chrX ( 956) 2708 455.5 2.3e-127 CCDS48091.1 DMD gene_id:1756|Hs108|chrX (1225) 2708 455.5 2.8e-127 CCDS55395.1 DMD gene_id:1756|Hs108|chrX (3681) 2708 455.8 6.9e-127 CCDS14233.1 DMD gene_id:1756|Hs108|chrX (3685) 2708 455.8 7e-127 CCDS55394.1 DMD gene_id:1756|Hs108|chrX (1115) 2649 445.9 2.1e-124 CCDS34547.1 UTRN gene_id:7402|Hs108|chr6 (3433) 2527 426.2 5.5e-118 CCDS14232.1 DMD gene_id:1756|Hs108|chrX ( 622) 2281 385.4 1.8e-106 CCDS14234.1 DMD gene_id:1756|Hs108|chrX ( 617) 1699 290.1 9e-78 CCDS14231.1 DMD gene_id:1756|Hs108|chrX ( 635) 1699 290.1 9.2e-78 CCDS45848.1 DTNA gene_id:1837|Hs108|chr18 ( 686) 575 106.0 2.6e-22 CCDS59311.1 DTNA gene_id:1837|Hs108|chr18 ( 683) 571 105.4 4e-22 CCDS59312.1 DTNA gene_id:1837|Hs108|chr18 ( 724) 571 105.4 4.2e-22 CCDS59309.1 DTNA gene_id:1837|Hs108|chr18 ( 513) 561 103.7 9.9e-22 CCDS59310.1 DTNA gene_id:1837|Hs108|chr18 ( 510) 557 103.0 1.5e-21 CCDS56061.1 DTNA gene_id:1837|Hs108|chr18 ( 690) 557 103.1 2e-21 CCDS46502.1 DYTN gene_id:391475|Hs108|chr2 ( 578) 552 102.2 3e-21 CCDS42426.1 DTNA gene_id:1837|Hs108|chr18 ( 374) 478 90.0 9.4e-18 CCDS56060.1 DTNA gene_id:1837|Hs108|chr18 ( 371) 474 89.3 1.5e-17 CCDS11908.1 DTNA gene_id:1837|Hs108|chr18 ( 567) 474 89.5 2.1e-17 CCDS46234.1 DTNB gene_id:1838|Hs108|chr2 ( 567) 468 88.5 4.1e-17 CCDS46233.1 DTNB gene_id:1838|Hs108|chr2 ( 560) 466 88.1 5.1e-17 CCDS82428.1 DTNB gene_id:1838|Hs108|chr2 ( 590) 466 88.2 5.3e-17 CCDS46235.1 DTNB gene_id:1838|Hs108|chr2 ( 597) 466 88.2 5.4e-17 CCDS46236.1 DTNB gene_id:1838|Hs108|chr2 ( 609) 466 88.2 5.5e-17 CCDS74496.1 DTNB gene_id:1838|Hs108|chr2 ( 620) 466 88.2 5.6e-17 CCDS46237.1 DTNB gene_id:1838|Hs108|chr2 ( 627) 466 88.2 5.6e-17 CCDS58702.1 DTNB gene_id:1838|Hs108|chr2 ( 545) 388 75.4 3.5e-13 >>CCDS14480.2 DRP2 gene_id:1821|Hs108|chrX (957 aa) initn: 6406 init1: 6406 opt: 6406 Z-score: 5673.4 bits: 1061.2 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 6406; 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CCDS55 PQDTSTGLEEVMEQLNNSFPSSRGRNTPGKPMREDTM 3650 3660 3670 3680 >>CCDS14233.1 DMD gene_id:1756|Hs108|chrX (3685 aa) initn: 3123 init1: 2656 opt: 2708 Z-score: 2391.4 bits: 455.8 E(32554): 7e-127 Smith-Waterman score: 3351; 55.0% identity (82.3% similar) in 902 aa overlap (79-954:2782-3680) 50 60 70 80 90 100 pF1KB4 PPQDGAGVPCLSLKLLNGSVGASGPLEPPAMNLCWNEIKKKSHNLRARLEAFSDHSGKLQ ::. :.:..::: :.:..::: ::. .:. CCDS14 YHNLDENSQKILRSLEGSDDAVLLQRRLDNMNFKWSELRKKSLNIRSHLEASSDQWKRLH 2760 2770 2780 2790 2800 2810 110 120 130 140 150 160 pF1KB4 LPLQEIIDWLSQKDEELSAQLPLQGDVALVQQEKETHAAFMEEVKSRGPYIYSVLESAQA : :::.. ::. ::.::: : :. :: ::.....: :: .:.:.. : :.:.::... CCDS14 LSLQELLVWLQLKDDELSRQAPIGGDFPAVQKQNDVHRAFKRELKTKEPVIMSTLETVRI 2820 2830 2840 2850 2860 2870 170 180 190 200 210 220 pF1KB4 FLSQHPFEELEEPHSESKDTSPKQRIQNLSRFVWKQATVASELWEKLTARCVDQHRHIER ::...:.: ::. ..: .. :..: ::..:.. ::: .. ::::. . .: .:.:.. CCDS14 FLTEQPLEGLEKLYQEPRELPPEERAQNVTRLLRKQAEEVNTEWEKLNLHSADWQRKIDE 2880 2890 2900 2910 2920 2930 230 240 250 260 270 280 pF1KB4 TLEQLLEIQGAMEELSTTLSQAEGVRATWEPIGDLFIDSLPEHIQAIKLFKEEFSPMKDG :::.: :.: : .::. : ::: ....:.:.:::.:::: .:.. .: .. :..:.:.. CCDS14 TLERLRELQEATDELDLKLRQAEVIKGSWQPVGDLLIDSLQDHLEKVKALRGEIAPLKEN 2940 2950 2960 2970 2980 2990 290 300 310 320 330 340 pF1KB4 VKLVNDLAHQLAISDVHLSMENSQALEQINVRWKQLQASVSERLKQLQDAHRDFGPGSQH :. :::::.::. ..:: : ..::..:.::: ::..: .:..::..:::::::.::: CCDS14 VSHVNDLARQLTTLGIQLSPYNLSTLEDLNTRWKLLQVAVEDRVRQLHEAHRDFGPASQH 3000 3010 3020 3030 3040 3050 350 360 370 380 390 400 pF1KB4 FLSSSVQVPWERAISPNKVPYYINHQAQTTCWDHPKMTELYQTLADLNNIKFSAYRTAMK :::.::: :::::::::::::::::..:::::::::::::::.::::::..::::::::: CCDS14 FLSTSVQGPWERAISPNKVPYYINHETQTTCWDHPKMTELYQSLADLNNVRFSAYRTAMK 3060 3070 3080 3090 3100 3110 410 420 430 440 450 460 pF1KB4 LRRVQKALRLDLVTLTTALEIFNEHDLQASEHVMDVVEVIHCLTALYERLEEERGILVNV :::.:::: :::..:..: . ...:.:. ... ::....:.:::..:.:::.:.. :::: CCDS14 LRRLQKALCLDLLSLSAACDALDQHNLKQNDQPMDILQIINCLTTIYDRLEQEHNNLVNV 3120 3130 3140 3150 3160 3170 470 480 490 500 510 520 pF1KB4 PLCVDMSLNWLLNVFDSGRSGKMRALSFKTGIACLCGTEVKEKLQYLFSQVANSGSQCDQ :::::: :::::::.:.::.:..:.::::::: :: .....: .:::.:::.: . ::: CCDS14 PLCVDMCLNWLLNVYDTGRTGRIRVLSFKTGIISLCKAHLEDKYRYLFKQVASSTGFCDQ 3180 3190 3200 3210 3220 3230 530 540 550 560 570 580 pF1KB4 RHLGVLLHEAIQVPRQLGEVAAFGGSNVEPSVRSCFRFSTGKPVIEASQFLEWVNLEPQS :.::.:::..::.::::::::.:::::.::::::::.:...:: :::. ::.:. ::::: CCDS14 RRLGLLLHDSIQIPRQLGEVASFGGSNIEPSVRSCFQFANNKPEIEAALFLDWMRLEPQS 3240 3250 3260 3270 3280 3290 590 600 610 620 630 640 pF1KB4 MVWLAVLHRVTIAEQVKHQTKCSICRQCPIKGFRYRSLKQFNVDICQTCFLTGRASKGNK :::: :::::. :: .:::.::.::..::: ::::::::.:: ::::.::..::..::.: CCDS14 MVWLPVLHRVAAAETAKHQAKCNICKECPIIGFRYRSLKHFNYDICQSCFFSGRVAKGHK 3300 3310 3320 3330 3340 3350 650 660 670 680 690 700 pF1KB4 LHYPIMEYYTPTTSSENMRDFATTLKNKFRSKHYFSKHPQRGYLPVQSVLEADYSETP-- .:::..:: :::::.:..:::: .::::::.:.::.:::. ::::::.:::.: ::: CCDS14 MHYPMVEYCTPTTSGEDVRDFAKVLKNKFRTKRYFAKHPRMGYLPVQTVLEGDNMETPVT 3360 3370 3380 3390 3400 3410 710 720 730 740 750 pF1KB4 -----------ASSPMWPHADTHSRIEHFASRLAEMESQNCSFFNDSLSPDDSIDEDQYL ::::. : ::::::::.::::::::..: :..:::.::..:::... : CCDS14 LINFWPVDSAPASSPQLSHDDTHSRIEHYASRLAEMENSNGSYLNDSISPNESIDDEHLL 3420 3430 3440 3450 3460 3470 760 770 780 790 800 pF1KB4 LRH-------SSPITD-REPAFGQQAPCSVATESKGELQKILAHLEDENRILQGELRRLK ..: .::... : :: : :. .: .:::..::: ::.::: ::.: ::: CCDS14 IQHYCQSLNQDSPLSQPRSPA---QILISLESEERGELERILADLEEENRNLQAEYDRLK 3480 3490 3500 3510 3520 810 820 830 840 850 860 pF1KB4 WQHEEAAEAP--SLADGSTEAATDHRNEELLAEARILRQHKSRLETRMQILEDHNKQLES :::. . .: : . . . :. ::.:::..:::::.:::.:::::::::::::: CCDS14 QQHEHKGLSPLPSPPEMMPTSPQSPRDAELIAEAKLLRQHKGRLEARMQILEDHNKQLES 3530 3540 3550 3560 3570 3580 870 880 890 900 910 920 pF1KB4 QLQRLRELLLQPPTESDGSGSAGSSLASSPQQSEGSHP---REKGQTTPDTEAADDVGSK ::.:::.:: :: .:. .:.. :: ..: :.:..:.: : :. : :. . .:. : CCDS14 QLHRLRQLLEQPQAEAKVNGTTVSSPSTSLQRSDSSQPMLLRVVGSQTSDSMGEEDLLSP 3590 3600 3610 3620 3630 3640 930 940 950 pF1KB4 SQDVSLCLEDIMEKLRHAFPSVRSSDVTANTLLAS ::.: ::..::.: ..::: :. .. .. . CCDS14 PQDTSTGLEEVMEQLNNSFPSSRGRNTPGKPMREDTM 3650 3660 3670 3680 >>CCDS55394.1 DMD gene_id:1756|Hs108|chrX (1115 aa) initn: 3043 init1: 2644 opt: 2649 Z-score: 2346.9 bits: 445.9 E(32554): 2.1e-124 Smith-Waterman score: 2878; 50.3% identity (75.5% similar) in 881 aa overlap (79-954:322-1110) 50 60 70 80 90 100 pF1KB4 PPQDGAGVPCLSLKLLNGSVGASGPLEPPAMNLCWNEIKKKSHNLRARLEAFSDHSGKLQ ::. :.:..::: :.:..::: ::. .:. CCDS55 YHNLDENSQKILRSLEGSDDAVLLQRRLDNMNFKWSELRKKSLNIRSHLEASSDQWKRLH 300 310 320 330 340 350 110 120 130 140 150 160 pF1KB4 LPLQEIIDWLSQKDEELSAQLPLQGDVALVQQEKETHAAFMEEVKSRGPYIYSVLESAQA : :::.. ::. ::.::: : :. :: ::.....: :: .:.:.. : :.:.::... CCDS55 LSLQELLVWLQLKDDELSRQAPIGGDFPAVQKQNDVHRAFKRELKTKEPVIMSTLETVRI 360 370 380 390 400 410 170 180 190 200 210 220 pF1KB4 FLSQHPFEELEEPHSESKDTSPKQRIQNLSRFVWKQATVASELWEKLTARCVDQHRHIER ::...:.: ::. ..: .. :..: ::..:.. ::: .. ::::. . .: .:.:.. CCDS55 FLTEQPLEGLEKLYQEPRELPPEERAQNVTRLLRKQAEEVNTEWEKLNLHSADWQRKIDE 420 430 440 450 460 470 230 240 250 260 270 280 pF1KB4 TLEQLLEIQGAMEELSTTLSQAEGVRATWEPIGDLFIDSLPEHIQAIKLFKEEFSPMKDG :::.: :.: : .::. : ::: ....:.:.:::.:::: .:.. .: .. :..:.:.. CCDS55 TLERLRELQEATDELDLKLRQAEVIKGSWQPVGDLLIDSLQDHLEKVKALRGEIAPLKEN 480 490 500 510 520 530 290 300 310 320 330 340 pF1KB4 VKLVNDLAHQLAISDVHLSMENSQALEQINVRWKQLQASVSERLKQLQDAHRDFGPGSQH :. :::::.::. ..:: : ..::..:.::: ::..: .:..::..:::::::.::: CCDS55 VSHVNDLARQLTTLGIQLSPYNLSTLEDLNTRWKLLQVAVEDRVRQLHEAHRDFGPASQH 540 550 560 570 580 590 350 360 370 380 390 400 pF1KB4 FLSSSVQVPWERAISPNKVPYYINHQAQTTCWDHPKMTELYQTLADLNNIKFSAYRTAMK :::.::: :::::::::::::::::..:::::::::::::::.::::::..::::::::: CCDS55 FLSTSVQGPWERAISPNKVPYYINHETQTTCWDHPKMTELYQSLADLNNVRFSAYRTAMK 600 610 620 630 640 650 410 420 430 440 450 460 pF1KB4 LRRVQKALRLDLVTLTTALEIFNEHDLQASEHVMDVVEVIHCLTALYERLEEERGILVNV :::.:::: :::..:..: . ...:.:. ... ::....:.:::..:.:::.:.. :::: CCDS55 LRRLQKALCLDLLSLSAACDALDQHNLKQNDQPMDILQIINCLTTIYDRLEQEHNNLVNV 660 670 680 690 700 710 470 480 490 500 510 520 pF1KB4 PLCVDMSLNWLLNVFDSGRSGKMRALSFKTGIACLCGTEVKEKLQYLFSQVANSGSQCDQ :::::: :::::::.:.::.:..:.::::::: :: .....: .:::.:::.: . ::: CCDS55 PLCVDMCLNWLLNVYDTGRTGRIRVLSFKTGIISLCKAHLEDKYRYLFKQVASSTGFCDQ 720 730 740 750 760 770 530 540 550 560 570 580 pF1KB4 RHLGVLLHEAIQVPRQLGEVAAFGGSNVEPSVRSCFRFSTGKPVIEASQFLEWVNLEPQS :.::.:::..::.::::::::.:::::.::::::::.:...:: :::. ::.:. ::::: CCDS55 RRLGLLLHDSIQIPRQLGEVASFGGSNIEPSVRSCFQFANNKPEIEAALFLDWMRLEPQS 780 790 800 810 820 830 590 600 610 620 630 640 pF1KB4 MVWLAVLHRVTIAEQVKHQTKCSICRQCPIKGFRYRSLKQFNVDICQTCFLTGRASKGNK :::: :::::. :: .:::.::.::..::: ::::::::.:: ::::.::..::..::.: CCDS55 MVWLPVLHRVAAAETAKHQAKCNICKECPIIGFRYRSLKHFNYDICQSCFFSGRVAKGHK 840 850 860 870 880 890 650 660 670 680 690 700 pF1KB4 LHYPIMEYYTPTTSSENMRDFATTLKNKFRSKHYFSKHPQRGYLPVQSVLEADYSETPAS .:::..:: :::::.:..:::: .::::::.:.::.:::. ::::::.:::.: :: CCDS55 MHYPMVEYCTPTTSGEDVRDFAKVLKNKFRTKRYFAKHPRMGYLPVQTVLEGDNMETN-- 900 910 920 930 940 710 720 730 740 750 760 pF1KB4 SPMWPHADTHSRIEHFASRLAEMESQNCSFFNDSLSPDDSIDEDQYLLRHSSPITDREPA CCDS55 ------------------------------------------------------------ 770 780 790 800 810 820 pF1KB4 FGQQAPCSVATESKGELQKILAHLEDENRILQGELRRLKWQHEEAAEAP--SLADGSTEA ::.: ::: :::. . .: : . . CCDS55 ------------------------------LQAEYDRLKQQHEHKGLSPLPSPPEMMPTS 950 960 970 830 840 850 860 870 880 pF1KB4 ATDHRNEELLAEARILRQHKSRLETRMQILEDHNKQLESQLQRLRELLLQPPTESDGSGS . :. ::.:::..:::::.:::.::::::::::::::::.:::.:: :: .:. .:. CCDS55 PQSPRDAELIAEAKLLRQHKGRLEARMQILEDHNKQLESQLHRLRQLLEQPQAEAKVNGT 980 990 1000 1010 1020 1030 890 900 910 920 930 940 pF1KB4 AGSSLASSPQQSEGSHP---REKGQTTPDTEAADDVGSKSQDVSLCLEDIMEKLRHAFPS . :: ..: :.:..:.: : :. : :. . .:. : ::.: ::..::.: ..::: CCDS55 TVSSPSTSLQRSDSSQPMLLRVVGSQTSDSMGEEDLLSPPQDTSTGLEEVMEQLNNSFPS 1040 1050 1060 1070 1080 1090 950 pF1KB4 VRSSDVTANTLLAS :. .. .. . CCDS55 SRGRNTPGKPMREDTM 1100 1110 >>CCDS34547.1 UTRN gene_id:7402|Hs108|chr6 (3433 aa) initn: 2785 init1: 2191 opt: 2527 Z-score: 2231.7 bits: 426.2 E(32554): 5.5e-118 Smith-Waterman score: 3002; 51.5% identity (78.9% similar) in 890 aa overlap (79-943:2536-3421) 50 60 70 80 90 100 pF1KB4 PPQDGAGVPCLSLKLLNGSVGASGPLEPPAMNLCWNEIKKKSHNLRARLEAFSDHSGKLQ :: ::..: :: ..::.::: ... ..: CCDS34 FKSIDGNRQKMVKALGNSEEATMLQHRLDDMNQRWNDLKAKSASIRAHLEASAEKWNRLL 2510 2520 2530 2540 2550 2560 110 120 130 140 150 160 pF1KB4 LPLQEIIDWLSQKDEELSAQLPLQGDVALVQQEKETHAAFMEEVKSRGPYIYSVLESAQA . :.:.: ::..:::::. :.:. ::: .: . . :. .:.: . . .....:.. CCDS34 MSLEELIKWLNMKDEELKKQMPIGGDVPALQLQYDHCKALRRELKEKEYSVLNAVDQARV 2570 2580 2590 2600 2610 2620 170 180 190 200 210 220 pF1KB4 FLSQHPFEELEEPHS--ESK-DTSPKQRIQNLSRFVWKQATVASELWEKLTARCVDQHRH ::...:.: :::. .:: . .:..: :.... . ::.. ..: ::.:.: . ... CCDS34 FLADQPIEAPEEPRRNLQSKTELTPEERAQKIAKAMRKQSSEVKEKWESLNAVTSNWQKQ 2630 2640 2650 2660 2670 2680 230 240 250 260 270 280 pF1KB4 IERTLEQLLEIQGAMEELSTTLSQAEGVRATWEPIGDLFIDSLPEHIQAIKLFKEEFSPM ....::.: ..::::..:.. ...::.:: :.:.:::.:::: .::. : :.::..:. CCDS34 VDKALEKLRDLQGAMDDLDADMKEAESVRNGWKPVGDLLIDSLQDHIEKIMAFREEIAPI 2690 2700 2710 2720 2730 2740 290 300 310 320 330 340 pF1KB4 KDGVKLVNDLAHQLAISDVHLSMENSQALEQINVRWKQLQASVSERLKQLQDAHRDFGPG . :: ::::. ::. :.: :.. :. :...:.::: ::.::..::::::.:::::::. CCDS34 NFKVKTVNDLSSQLSPLDLHPSLKMSRQLDDLNMRWKLLQVSVDDRLKQLQEAHRDFGPS 2750 2760 2770 2780 2790 2800 350 360 370 380 390 400 pF1KB4 SQHFLSSSVQVPWERAISPNKVPYYINHQAQTTCWDHPKMTELYQTLADLNNIKFSAYRT ::::::.:::.::.:.:: ::::::::::.:::::::::::::.:.::::::..:::::: CCDS34 SQHFLSTSVQLPWQRSISHNKVPYYINHQTQTTCWDHPKMTELFQSLADLNNVRFSAYRT 2810 2820 2830 2840 2850 2860 410 420 430 440 450 460 pF1KB4 AMKLRRVQKALRLDLVTLTTALEIFNEHDLQASEHVMDVVEVIHCLTALYERLEEERGIL :.:.::.:::: :::. :.:. :::..: :. ......: .::.:::. :. ::. . : CCDS34 AIKIRRLQKALCLDLLELSTTNEIFKQHKLNQNDQLLSVPDVINCLTTTYDGLEQMHKDL 2870 2880 2890 2900 2910 2920 470 480 490 500 510 520 pF1KB4 VNVPLCVDMSLNWLLNVFDSGRSGKMRALSFKTGIACLCGTEVKEKLQYLFSQVANSGSQ ::::::::: :::::::.:.::.::.:. :.: :. : ..:: .:::..::. . CCDS34 VNVPLCVDMCLNWLLNVYDTGRTGKIRVQSLKIGLMSLSKGLLEEKYRYLFKEVAGPTEM 2930 2940 2950 2960 2970 2980 530 540 550 560 570 580 pF1KB4 CDQRHLGVLLHEAIQVPRQLGEVAAFGGSNVEPSVRSCFRFSTGKPVIEASQFLEWVNLE ::::.::.:::.:::.::::::::::::::.::::::::. ...:: : ...:..:..:: CCDS34 CDQRQLGLLLHDAIQIPRQLGEVAAFGGSNIEPSVRSCFQQNNNKPEISVKEFIDWMHLE 2990 3000 3010 3020 3030 3040 590 600 610 620 630 640 pF1KB4 PQSMVWLAVLHRVTIAEQVKHQTKCSICRQCPIKGFRYRSLKQFNVDICQTCFLTGRASK ::::::: :::::. :: .:::.::.::..::: ::::::::.:: :.::.::..::..: CCDS34 PQSMVWLPVLHRVAAAETAKHQAKCNICKECPIVGFRYRSLKHFNYDVCQSCFFSGRTAK 3050 3060 3070 3080 3090 3100 650 660 670 680 690 700 pF1KB4 GNKLHYPIMEYYTPTTSSENMRDFATTLKNKFRSKHYFSKHPQRGYLPVQSVLEADYSET :.:::::..:: ::::.:..:::. .::::::::.::.:::. ::::::.:::.: :: CCDS34 GHKLHYPMVEYCIPTTSGEDVRDFTKVLKNKFRSKKYFAKHPRLGYLPVQTVLEGDNLET 3110 3120 3130 3140 3150 3160 710 720 730 740 750 pF1KB4 PASS-PMWP------------HADTHSRIEHFASRLAEMESQNCSFFNDSLSPDDSIDED : . ::: : :::::::..:.:::.:: : ::..:: : :.... CCDS34 PITLISMWPEHYDPSQSPQLFHDDTHSRIEQYATRLAQMERTNGSFLTDSSSTTGSVEDE 3170 3180 3190 3200 3210 3220 760 770 780 790 800 pF1KB4 QYLLR-HSSPITDREPAFGQQAPC----SVATESKGELQKILAHLEDENRILQGELRRLK . :.. . . . . :. :.: :: : .:::..:.: ::.:.: :: : ..:: CCDS34 HALIQQYCQTLGGESPVSQPQSPAQILKSVEREERGELERIIADLEEEQRNLQVEYEQLK 3230 3240 3250 3260 3270 3280 810 820 830 840 850 860 pF1KB4 WQHEEAAEAPSLADGSTEAATDHRNE--ELLAEARILRQHKSRLETRMQILEDHNKQLES :: . . : . . . : .: ::.:::..:::::.:::.:::::::::::::: CCDS34 DQHLRRG-LPVGSPPESIISPHHTSEDSELIAEAKLLRQHKGRLEARMQILEDHNKQLES 3290 3300 3310 3320 3330 3340 870 880 890 900 910 920 pF1KB4 QLQRLRELLLQPPTESDGSGSAGSSLASSPQQSEGSHPREKGQTTPDTE--AADDVGSKS ::.:::.:: :: ::: : : : .:::.: :. . . :. . :..:. . CCDS34 QLHRLRQLLEQP--ESD-SRINGVSPWASPQHSALSYSLDPDASGPQFHQAAGEDLLAPP 3350 3360 3370 3380 3390 3400 930 940 950 pF1KB4 QDVSLCLEDIMEKLRHAFPSVRSSDVTANTLLAS .:.: : ..::... .::: CCDS34 HDTSTDLTEVMEQIHSTFPSCCPNVPSRPQAM 3410 3420 3430 >>CCDS14232.1 DMD gene_id:1756|Hs108|chrX (622 aa) initn: 2351 init1: 1880 opt: 2281 Z-score: 2024.9 bits: 385.4 E(32554): 1.8e-106 Smith-Waterman score: 2382; 59.5% identity (84.6% similar) in 590 aa overlap (373-949:8-594) 350 360 370 380 390 400 pF1KB4 GPGSQHFLSSSVQVPWERAISPNKVPYYINHQAQTTCWDHPKMTELYQTLADLNNIKFSA :..:::::::::::::::.::::::..::: CCDS14 MREQLKGHETQTTCWDHPKMTELYQSLADLNNVRFSA 10 20 30 410 420 430 440 450 460 pF1KB4 YRTAMKLRRVQKALRLDLVTLTTALEIFNEHDLQASEHVMDVVEVIHCLTALYERLEEER :::::::::.:::: :::..:..: . ...:.:. ... ::....:.:::..:.:::.:. CCDS14 YRTAMKLRRLQKALCLDLLSLSAACDALDQHNLKQNDQPMDILQIINCLTTIYDRLEQEH 40 50 60 70 80 90 470 480 490 500 510 520 pF1KB4 GILVNVPLCVDMSLNWLLNVFDSGRSGKMRALSFKTGIACLCGTEVKEKLQYLFSQVANS . :::::::::: :::::::.:.::.:..:.::::::: :: .....: .:::.:::.: CCDS14 NNLVNVPLCVDMCLNWLLNVYDTGRTGRIRVLSFKTGIISLCKAHLEDKYRYLFKQVASS 100 110 120 130 140 150 530 540 550 560 570 580 pF1KB4 GSQCDQRHLGVLLHEAIQVPRQLGEVAAFGGSNVEPSVRSCFRFSTGKPVIEASQFLEWV . ::::.::.:::..::.::::::::.:::::.::::::::.:...:: :::. ::.:. 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CCDS14 TGFCDQRRLGLLLHDSIQIPRQLGEVASFGGSNIEPSVRSCFQFANNKPEIEAALFLDWM 160 170 180 190 200 210 590 600 610 620 630 640 pF1KB4 NLEPQSMVWLAVLHRVTIAEQVKHQTKCSICRQCPIKGFRYRSLKQFNVDICQTCFLTGR ::::::::: :::::. :: .:::.::.::..::: ::::::::.:: ::::.::..:: CCDS14 RLEPQSMVWLPVLHRVAAAETAKHQAKCNICKECPIIGFRYRSLKHFNYDICQSCFFSGR 220 230 240 250 260 270 650 660 670 680 690 700 pF1KB4 ASKGNKLHYPIMEYYTPTTSSENMRDFATTLKNKFRSKHYFSKHPQRGYLPVQSVLEADY ..::.:.:::..:: :::::.:..:::: .::::::.:.::.:::. ::::::.:::.: CCDS14 VAKGHKMHYPMVEYCTPTTSGEDVRDFAKVLKNKFRTKRYFAKHPRMGYLPVQTVLEGDN 280 290 300 310 320 330 710 720 730 740 pF1KB4 SETP-------------ASSPMWPHADTHSRIEHFASRLAEMESQNCSFFNDSLSPDDSI ::: ::::. : ::::::::.::::::::..: :..:::.::..:: CCDS14 METPVTLINFWPVDSAPASSPQLSHDDTHSRIEHYASRLAEMENSNGSYLNDSISPNESI 340 350 360 370 380 390 750 760 770 780 790 800 pF1KB4 DEDQYLLRH-------SSPITD-REPAFGQQAPCSVATESKGELQKILAHLEDENRILQG :... :..: .::... : :: : :. .: .:::..::: ::.::: ::. 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CCDS14 EDLLSPPQDTSTGLEEVMEQLNNSFPSSRGRNTPGKPMREDTM 580 590 600 610 957 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Wed Nov 2 22:52:53 2016 done: Wed Nov 2 22:52:53 2016 Total Scan time: 3.690 Total Display time: 0.320 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]