Result of FASTA (ccds) for
pF1KB4203
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4203, 318 aa
1>>>pF1KB4203 318 - 318 aa - 318 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.1352+/-0.0011; mu= 7.4588+/- 0.064
mean_var=245.9740+/-56.729, 0's: 0 Z-trim(109.3): 660 B-trim: 5 in 2/50
Lambda= 0.081777
statistics sampled from 10013 (10826) to 10013 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.694), E-opt: 0.2 (0.333), width: 16
Scan time: 2.580
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11218.1 MAP2K3 gene_id:5606|Hs108|chr17 ( 318) 2123 263.8 1.3e-70
CCDS11217.1 MAP2K3 gene_id:5606|Hs108|chr17 ( 347) 2123 263.8 1.4e-70
CCDS11686.1 MAP2K6 gene_id:5608|Hs108|chr17 ( 334) 1759 220.9 1.1e-57
CCDS82194.1 MAP2K6 gene_id:5608|Hs108|chr17 ( 278) 1623 204.7 6.8e-53
CCDS11162.1 MAP2K4 gene_id:6416|Hs108|chr17 ( 399) 1147 148.8 6.8e-36
CCDS62095.1 MAP2K4 gene_id:6416|Hs108|chr17 ( 410) 1147 148.8 6.9e-36
CCDS42491.1 MAP2K7 gene_id:5609|Hs108|chr19 ( 419) 874 116.6 3.5e-26
CCDS74277.1 MAP2K7 gene_id:5609|Hs108|chr19 ( 435) 874 116.6 3.5e-26
CCDS74278.1 MAP2K7 gene_id:5609|Hs108|chr19 ( 426) 742 101.0 1.7e-21
CCDS55970.1 MAP2K5 gene_id:5607|Hs108|chr15 ( 412) 638 88.7 8.2e-18
CCDS10224.1 MAP2K5 gene_id:5607|Hs108|chr15 ( 448) 638 88.8 8.6e-18
CCDS12120.1 MAP2K2 gene_id:5605|Hs108|chr19 ( 400) 620 86.6 3.5e-17
CCDS10216.1 MAP2K1 gene_id:5604|Hs108|chr15 ( 393) 608 85.2 9.3e-17
CCDS47900.1 STK3 gene_id:6788|Hs108|chr8 ( 491) 496 72.1 1e-12
CCDS59108.1 STK3 gene_id:6788|Hs108|chr8 ( 519) 496 72.1 1e-12
CCDS34290.1 STK10 gene_id:6793|Hs108|chr5 ( 968) 495 72.4 1.6e-12
CCDS13341.1 STK4 gene_id:6789|Hs108|chr20 ( 487) 490 71.4 1.6e-12
CCDS54673.1 TNIK gene_id:23043|Hs108|chr3 (1268) 466 69.1 2e-11
CCDS54674.1 TNIK gene_id:23043|Hs108|chr3 (1276) 466 69.1 2e-11
CCDS54677.1 TNIK gene_id:23043|Hs108|chr3 (1297) 466 69.1 2.1e-11
CCDS54678.1 TNIK gene_id:23043|Hs108|chr3 (1305) 466 69.1 2.1e-11
CCDS54675.1 TNIK gene_id:23043|Hs108|chr3 (1323) 466 69.2 2.1e-11
CCDS54676.1 TNIK gene_id:23043|Hs108|chr3 (1331) 466 69.2 2.1e-11
CCDS54679.1 TNIK gene_id:23043|Hs108|chr3 (1352) 466 69.2 2.1e-11
CCDS46956.1 TNIK gene_id:23043|Hs108|chr3 (1360) 466 69.2 2.1e-11
CCDS45589.1 MINK1 gene_id:50488|Hs108|chr17 (1303) 461 68.6 3.1e-11
CCDS45590.1 MINK1 gene_id:50488|Hs108|chr17 (1312) 461 68.6 3.1e-11
CCDS45588.1 MINK1 gene_id:50488|Hs108|chr17 (1332) 461 68.6 3.2e-11
CCDS82487.1 MAP4K4 gene_id:9448|Hs108|chr2 (1165) 457 68.0 4e-11
CCDS56130.1 MAP4K4 gene_id:9448|Hs108|chr2 (1239) 457 68.0 4.2e-11
CCDS74546.1 MAP4K4 gene_id:9448|Hs108|chr2 (1273) 457 68.1 4.3e-11
CCDS9488.1 STK24 gene_id:8428|Hs108|chr13 ( 443) 443 65.8 7.2e-11
CCDS32001.1 STK24 gene_id:8428|Hs108|chr13 ( 431) 441 65.5 8.4e-11
CCDS76334.1 SLK gene_id:9748|Hs108|chr10 (1204) 447 66.9 9.4e-11
CCDS7553.1 SLK gene_id:9748|Hs108|chr10 (1235) 447 66.9 9.5e-11
>>CCDS11218.1 MAP2K3 gene_id:5606|Hs108|chr17 (318 aa)
initn: 2123 init1: 2123 opt: 2123 Z-score: 1381.3 bits: 263.8 E(32554): 1.3e-70
Smith-Waterman score: 2123; 100.0% identity (100.0% similar) in 318 aa overlap (1-318:1-318)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MSKPPAPNPTPPRNLDSRTFITIGDRNFEVEADDLVTISELGRGAYGVVEKVRHAQSGTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MSKPPAPNPTPPRNLDSRTFITIGDRNFEVEADDLVTISELGRGAYGVVEKVRHAQSGTI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 MAVKRIRATVNSQEQKRLLMDLDINMRTVDCFYTVTFYGALFREGDVWICMELMDTSLDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MAVKRIRATVNSQEQKRLLMDLDINMRTVDCFYTVTFYGALFREGDVWICMELMDTSLDK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 FYRKVLDKNMTIPEDILGEIAVSIVRALEHLHSKLSVIHRDVKPSNVLINKEGHVKMCDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 FYRKVLDKNMTIPEDILGEIAVSIVRALEHLHSKLSVIHRDVKPSNVLINKEGHVKMCDF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 GISGYLVDSVAKTMDAGCKPYMAPERINPELNQKGYNVKSDVWSLGITMIEMAILRFPYE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GISGYLVDSVAKTMDAGCKPYMAPERINPELNQKGYNVKSDVWSLGITMIEMAILRFPYE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 SWGTPFQQLKQVVEEPSPQLPADRFSPEFVDFTAQCLRKNPAERMSYLELMEHPFFTLHK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SWGTPFQQLKQVVEEPSPQLPADRFSPEFVDFTAQCLRKNPAERMSYLELMEHPFFTLHK
250 260 270 280 290 300
310
pF1KB4 TKKTDIAAFVKEILGEDS
::::::::::::::::::
CCDS11 TKKTDIAAFVKEILGEDS
310
>>CCDS11217.1 MAP2K3 gene_id:5606|Hs108|chr17 (347 aa)
initn: 2123 init1: 2123 opt: 2123 Z-score: 1380.9 bits: 263.8 E(32554): 1.4e-70
Smith-Waterman score: 2123; 100.0% identity (100.0% similar) in 318 aa overlap (1-318:30-347)
10 20 30
pF1KB4 MSKPPAPNPTPPRNLDSRTFITIGDRNFEVE
:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MESPASSQPASMPQSKGKSKRKKDLRISCMSKPPAPNPTPPRNLDSRTFITIGDRNFEVE
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB4 ADDLVTISELGRGAYGVVEKVRHAQSGTIMAVKRIRATVNSQEQKRLLMDLDINMRTVDC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ADDLVTISELGRGAYGVVEKVRHAQSGTIMAVKRIRATVNSQEQKRLLMDLDINMRTVDC
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB4 FYTVTFYGALFREGDVWICMELMDTSLDKFYRKVLDKNMTIPEDILGEIAVSIVRALEHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 FYTVTFYGALFREGDVWICMELMDTSLDKFYRKVLDKNMTIPEDILGEIAVSIVRALEHL
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB4 HSKLSVIHRDVKPSNVLINKEGHVKMCDFGISGYLVDSVAKTMDAGCKPYMAPERINPEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 HSKLSVIHRDVKPSNVLINKEGHVKMCDFGISGYLVDSVAKTMDAGCKPYMAPERINPEL
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KB4 NQKGYNVKSDVWSLGITMIEMAILRFPYESWGTPFQQLKQVVEEPSPQLPADRFSPEFVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 NQKGYNVKSDVWSLGITMIEMAILRFPYESWGTPFQQLKQVVEEPSPQLPADRFSPEFVD
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310
pF1KB4 FTAQCLRKNPAERMSYLELMEHPFFTLHKTKKTDIAAFVKEILGEDS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 FTAQCLRKNPAERMSYLELMEHPFFTLHKTKKTDIAAFVKEILGEDS
310 320 330 340
>>CCDS11686.1 MAP2K6 gene_id:5608|Hs108|chr17 (334 aa)
initn: 1751 init1: 1751 opt: 1759 Z-score: 1148.9 bits: 220.9 E(32554): 1.1e-57
Smith-Waterman score: 1759; 82.7% identity (93.9% similar) in 312 aa overlap (5-316:23-334)
10 20 30 40
pF1KB4 MSKPPAPNPTPPRNLDSRTFITIGDRNFEVEADDLVTISELG
: . ::::.:::.. :.::..::::.:::: : :::
CCDS11 MSQSKGKKRNPGLKIPKEAFEQPQTSSTPPRDLDSKACISIGNQNFEVKADDLEPIMELG
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB4 RGAYGVVEKVRHAQSGTIMAVKRIRATVNSQEQKRLLMDLDINMRTVDCFYTVTFYGALF
:::::::::.::. :: :::::::::::::::::::::::::.:::::: .:::::::::
CCDS11 RGAYGVVEKMRHVPSGQIMAVKRIRATVNSQEQKRLLMDLDISMRTVDCPFTVTFYGALF
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB4 REGDVWICMELMDTSLDKFYRKVLDKNMTIPEDILGEIAVSIVRALEHLHSKLSVIHRDV
::::::::::::::::::::..:.::..::::::::.::::::.::::::::::::::::
CCDS11 REGDVWICMELMDTSLDKFYKQVIDKGQTIPEDILGKIAVSIVKALEHLHSKLSVIHRDV
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB4 KPSNVLINKEGHVKMCDFGISGYLVDSVAKTMDAGCKPYMAPERINPELNQKGYNVKSDV
:::::::: :.:::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::.::::.
CCDS11 KPSNVLINALGQVKMCDFGISGYLVDSVAKTIDAGCKPYMAPERINPELNQKGYSVKSDI
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KB4 WSLGITMIEMAILRFPYESWGTPFQQLKQVVEEPSPQLPADRFSPEFVDFTAQCLRKNPA
:::::::::.:::::::.:::::::::::::::::::::::.:: ::::::.:::.::
CCDS11 WSLGITMIELAILRFPYDSWGTPFQQLKQVVEEPSPQLPADKFSAEFVDFTSQCLKKNSK
250 260 270 280 290 300
290 300 310
pF1KB4 ERMSYLELMEHPFFTLHKTKKTDIAAFVKEILGEDS
:: .: :::.:::::::..: ::.:.::: :::.
CCDS11 ERPTYPELMQHPFFTLHESKGTDVASFVKLILGD
310 320 330
>>CCDS82194.1 MAP2K6 gene_id:5608|Hs108|chr17 (278 aa)
initn: 1623 init1: 1623 opt: 1623 Z-score: 1063.1 bits: 204.7 E(32554): 6.8e-53
Smith-Waterman score: 1623; 85.9% identity (95.7% similar) in 277 aa overlap (40-316:2-278)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 TPPRNLDSRTFITIGDRNFEVEADDLVTISELGRGAYGVVEKVRHAQSGTIMAVKRIRAT
::::::::::::.::. :: ::::::::::
CCDS82 MELGRGAYGVVEKMRHVPSGQIMAVKRIRAT
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 VNSQEQKRLLMDLDINMRTVDCFYTVTFYGALFREGDVWICMELMDTSLDKFYRKVLDKN
:::::::::::::::.:::::: .:::::::::::::::::::::::::::::..:.::.
CCDS82 VNSQEQKRLLMDLDISMRTVDCPFTVTFYGALFREGDVWICMELMDTSLDKFYKQVIDKG
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 MTIPEDILGEIAVSIVRALEHLHSKLSVIHRDVKPSNVLINKEGHVKMCDFGISGYLVDS
.::::::::.::::::.:::::::::::::::::::::::: :.:::::::::::::::
CCDS82 QTIPEDILGKIAVSIVKALEHLHSKLSVIHRDVKPSNVLINALGQVKMCDFGISGYLVDS
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 VAKTMDAGCKPYMAPERINPELNQKGYNVKSDVWSLGITMIEMAILRFPYESWGTPFQQL
::::.::::::::::::::::::::::.::::.:::::::::.:::::::.:::::::::
CCDS82 VAKTIDAGCKPYMAPERINPELNQKGYSVKSDIWSLGITMIELAILRFPYDSWGTPFQQL
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 KQVVEEPSPQLPADRFSPEFVDFTAQCLRKNPAERMSYLELMEHPFFTLHKTKKTDIAAF
::::::::::::::.:: ::::::.:::.:: :: .: :::.:::::::..: ::.:.:
CCDS82 KQVVEEPSPQLPADKFSAEFVDFTSQCLKKNSKERPTYPELMQHPFFTLHESKGTDVASF
220 230 240 250 260 270
310
pF1KB4 VKEILGEDS
:: :::.
CCDS82 VKLILGD
>>CCDS11162.1 MAP2K4 gene_id:6416|Hs108|chr17 (399 aa)
initn: 1153 init1: 589 opt: 1147 Z-score: 757.9 bits: 148.8 E(32554): 6.8e-36
Smith-Waterman score: 1150; 52.3% identity (78.0% similar) in 327 aa overlap (7-316:63-387)
10 20
pF1KB4 MSKPPAPNPTPPRN-----LDSRTFITIG------D
:::: .: : .... . : .
CCDS11 AVSSMQGKRKALKLNFANPPFKSTARFTLNPNPTGVQNPHIERLRTHSIESSGKLKISPE
40 50 60 70 80 90
30 40 50 60 70 80
pF1KB4 RNFEVEADDLVTISELGRGAYGVVEKVRHAQSGTIMAVKRIRATVNSQEQKRLLMDLDIN
.... :.:: ..:.:::::: :.:. : :: ::::::::.::. .:::.::::::.
CCDS11 QHWDFTAEDLKDLGEIGRGAYGSVNKMVHKPSGQIMAVKRIRSTVDEKEQKQLLMDLDVV
100 110 120 130 140 150
90 100 110 120 130 140
pF1KB4 MRTVDCFYTVTFYGALFREGDVWICMELMDTSLDKFYR---KVLDKNMTIPEDILGEIAV
::. :: : : :::::::::: :::::::.::.::::. .::: .:::.:::.:..
CCDS11 MRSSDCPYIVQFYGALFREGDCWICMELMSTSFDKFYKYVYSVLDD--VIPEEILGKITL
160 170 180 190 200 210
150 160 170 180 190 200
pF1KB4 SIVRALEHLHSKLSVIHRDVKPSNVLINKEGHVKMCDFGISGYLVDSVAKTMDAGCKPYM
. :.::.::. .:..::::.::::.:... :..:.::::::: ::::.::: ::::.:::
CCDS11 ATVKALNHLKENLKIIHRDIKPSNILLDRSGNIKLCDFGISGQLVDSIAKTRDAGCRPYM
220 230 240 250 260 270
210 220 230 240 250 260
pF1KB4 APERINPELNQKGYNVKSDVWSLGITMIEMAILRFPYESWGTPFQQLKQVVEEPSPQLPA
:::::.: ...::.:.:::::::::. :.: :::: .:.. :.:: :::. :::
CCDS11 APERIDPSASRQGYDVRSDVWSLGITLYELATGRFPYPKWNSVFDQLTQVVKGDPPQLSN
280 290 300 310 320 330
270 280 290 300 310
pF1KB4 DR---FSPEFVDFTAQCLRKNPAERMSYLELMEHPFFTLHKTKKTDIAAFVKEILGEDS
.. ::: :..:. :: :. ..: .: ::..:::. ... . ...: .: .:: .
CCDS11 SEEREFSPSFINFVNLCLTKDESKRPKYKELLKHPFILMYEERAVEVACYVCKILDQMPA
340 350 360 370 380 390
CCDS11 TPSSPMYVD
>>CCDS62095.1 MAP2K4 gene_id:6416|Hs108|chr17 (410 aa)
initn: 1153 init1: 589 opt: 1147 Z-score: 757.8 bits: 148.8 E(32554): 6.9e-36
Smith-Waterman score: 1150; 52.3% identity (78.0% similar) in 327 aa overlap (7-316:74-398)
10 20
pF1KB4 MSKPPAPNPTPPRN-----LDSRTFITIG------D
:::: .: : .... . : .
CCDS62 FCEKAQSKRKALKLNFANPPFKSTARFTLNPNPTGVQNPHIERLRTHSIESSGKLKISPE
50 60 70 80 90 100
30 40 50 60 70 80
pF1KB4 RNFEVEADDLVTISELGRGAYGVVEKVRHAQSGTIMAVKRIRATVNSQEQKRLLMDLDIN
.... :.:: ..:.:::::: :.:. : :: ::::::::.::. .:::.::::::.
CCDS62 QHWDFTAEDLKDLGEIGRGAYGSVNKMVHKPSGQIMAVKRIRSTVDEKEQKQLLMDLDVV
110 120 130 140 150 160
90 100 110 120 130 140
pF1KB4 MRTVDCFYTVTFYGALFREGDVWICMELMDTSLDKFYR---KVLDKNMTIPEDILGEIAV
::. :: : : :::::::::: :::::::.::.::::. .::: .:::.:::.:..
CCDS62 MRSSDCPYIVQFYGALFREGDCWICMELMSTSFDKFYKYVYSVLDD--VIPEEILGKITL
170 180 190 200 210 220
150 160 170 180 190 200
pF1KB4 SIVRALEHLHSKLSVIHRDVKPSNVLINKEGHVKMCDFGISGYLVDSVAKTMDAGCKPYM
. :.::.::. .:..::::.::::.:... :..:.::::::: ::::.::: ::::.:::
CCDS62 ATVKALNHLKENLKIIHRDIKPSNILLDRSGNIKLCDFGISGQLVDSIAKTRDAGCRPYM
230 240 250 260 270 280
210 220 230 240 250 260
pF1KB4 APERINPELNQKGYNVKSDVWSLGITMIEMAILRFPYESWGTPFQQLKQVVEEPSPQLPA
:::::.: ...::.:.:::::::::. :.: :::: .:.. :.:: :::. :::
CCDS62 APERIDPSASRQGYDVRSDVWSLGITLYELATGRFPYPKWNSVFDQLTQVVKGDPPQLSN
290 300 310 320 330 340
270 280 290 300 310
pF1KB4 DR---FSPEFVDFTAQCLRKNPAERMSYLELMEHPFFTLHKTKKTDIAAFVKEILGEDS
.. ::: :..:. :: :. ..: .: ::..:::. ... . ...: .: .:: .
CCDS62 SEEREFSPSFINFVNLCLTKDESKRPKYKELLKHPFILMYEERAVEVACYVCKILDQMPA
350 360 370 380 390 400
CCDS62 TPSSPMYVD
410
>>CCDS42491.1 MAP2K7 gene_id:5609|Hs108|chr19 (419 aa)
initn: 907 init1: 352 opt: 874 Z-score: 583.6 bits: 116.6 E(32554): 3.5e-26
Smith-Waterman score: 874; 43.5% identity (76.3% similar) in 299 aa overlap (20-316:105-400)
10 20 30 40
pF1KB4 MSKPPAPNPTPPRNLDSRTFITIGDRNFEVEADDLVTISELGRGAYGVV
..::: . ...: .:: ...:.: :. : :
CCDS42 LGLPSTLFTPRSMESIEIDQKLQEIMKQTGYLTIGGQRYQAEINDLENLGEMGSGTCGQV
80 90 100 110 120 130
50 60 70 80 90 100
pF1KB4 EKVRHAQSGTIMAVKRIRATVNSQEQKRLLMDLDINMRTVDCFYTVTFYGALFREGDVWI
:.: ..: ..:::..: . :..:.::.:::::. ... :: : : .:... . ::.:
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pF1KB4 PAERMSYLELMEHPFFTLHKTKKTDIAAFVKEILGEDS
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CCDS55 NEQDIRYRDTLGHGNGGTVYKAYHVPSGKILAVKVILLDITLELQKQIMSELEI-LYKCD
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CCDS55 YLWS-LKILHRDVKPSNMLVNTRGQVKLCDFGVSTQLVNSIAKTY-VGTNAYMAPERISG
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CCDS55 PP
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]