FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB4218, 798 aa 1>>>pF1KB4218 798 - 798 aa - 798 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4304+/-0.00102; mu= 19.3020+/- 0.061 mean_var=66.3434+/-13.382, 0's: 0 Z-trim(103.0): 195 B-trim: 4 in 1/52 Lambda= 0.157462 statistics sampled from 7002 (7201) to 7002 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.582), E-opt: 0.2 (0.221), width: 16 Scan time: 4.130 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS4256.1 PCDHB14 gene_id:56122|Hs108|chr5 ( 798) 5163 1182.5 0 CCDS4244.1 PCDHB2 gene_id:56133|Hs108|chr5 ( 798) 4054 930.6 0 CCDS4253.1 PCDHB11 gene_id:56125|Hs108|chr5 ( 797) 4018 922.4 0 CCDS4251.1 PCDHB16 gene_id:57717|Hs108|chr5 ( 776) 3977 913.1 0 CCDS4245.1 PCDHB3 gene_id:56132|Hs108|chr5 ( 796) 3975 912.7 0 CCDS4254.1 PCDHB12 gene_id:56124|Hs108|chr5 ( 795) 3962 909.7 0 CCDS4246.1 PCDHB4 gene_id:56131|Hs108|chr5 ( 795) 3931 902.7 0 CCDS4247.1 PCDHB5 gene_id:26167|Hs108|chr5 ( 795) 3909 897.7 0 CCDS4257.1 PCDHB15 gene_id:56121|Hs108|chr5 ( 787) 3894 894.3 0 CCDS75328.1 PCDHB9 gene_id:56127|Hs108|chr5 ( 797) 3885 892.2 0 CCDS4252.1 PCDHB10 gene_id:56126|Hs108|chr5 ( 800) 3882 891.5 0 CCDS4249.1 PCDHB7 gene_id:56129|Hs108|chr5 ( 793) 3872 889.3 0 CCDS4250.1 PCDHB8 gene_id:56128|Hs108|chr5 ( 801) 3867 888.1 0 CCDS4248.1 PCDHB6 gene_id:56130|Hs108|chr5 ( 794) 3862 887.0 0 CCDS4255.1 PCDHB13 gene_id:56123|Hs108|chr5 ( 798) 3839 881.8 0 CCDS78067.1 PCDHB6 gene_id:56130|Hs108|chr5 ( 658) 3355 771.8 0 CCDS4243.1 PCDHB1 gene_id:29930|Hs108|chr5 ( 818) 2586 597.1 3.8e-170 CCDS54922.1 PCDHGA1 gene_id:56114|Hs108|chr5 ( 931) 2172 503.1 8.6e-142 CCDS75340.1 PCDHGB5 gene_id:56101|Hs108|chr5 ( 818) 2113 489.7 8.3e-138 CCDS75339.1 PCDHGB5 gene_id:56101|Hs108|chr5 ( 923) 2113 489.7 9.2e-138 CCDS75332.1 PCDHGB2 gene_id:56103|Hs108|chr5 ( 811) 2104 487.6 3.4e-137 CCDS54924.1 PCDHGB2 gene_id:56103|Hs108|chr5 ( 931) 2104 487.7 3.8e-137 CCDS75341.1 PCDHGA9 gene_id:56107|Hs108|chr5 ( 828) 2085 483.3 6.9e-136 CCDS58981.1 PCDHGA9 gene_id:56107|Hs108|chr5 ( 932) 2085 483.3 7.6e-136 CCDS75336.1 PCDHGA7 gene_id:56108|Hs108|chr5 ( 817) 2084 483.1 8e-136 CCDS54927.1 PCDHGA7 gene_id:56108|Hs108|chr5 ( 932) 2084 483.1 8.9e-136 CCDS75335.1 PCDHGA6 gene_id:56109|Hs108|chr5 ( 818) 2082 482.6 1.1e-135 CCDS54926.1 PCDHGA6 gene_id:56109|Hs108|chr5 ( 932) 2082 482.7 1.2e-135 CCDS75344.1 PCDHGB7 gene_id:56099|Hs108|chr5 ( 808) 2065 478.8 1.6e-134 CCDS47293.1 PCDHGB7 gene_id:56099|Hs108|chr5 ( 929) 2065 478.8 1.8e-134 CCDS75330.1 PCDHGB1 gene_id:56104|Hs108|chr5 ( 810) 2062 478.1 2.5e-134 CCDS75343.1 PCDHGA10 gene_id:56106|Hs108|chr5 ( 850) 2062 478.1 2.6e-134 CCDS54923.1 PCDHGB1 gene_id:56104|Hs108|chr5 ( 927) 2062 478.1 2.8e-134 CCDS47292.1 PCDHGA10 gene_id:56106|Hs108|chr5 ( 936) 2062 478.1 2.9e-134 CCDS75333.1 PCDHGA5 gene_id:56110|Hs108|chr5 ( 813) 2059 477.4 4.1e-134 CCDS54925.1 PCDHGA5 gene_id:56110|Hs108|chr5 ( 931) 2059 477.4 4.6e-134 CCDS75337.1 PCDHGB4 gene_id:8641|Hs108|chr5 ( 803) 2055 476.5 7.6e-134 CCDS54928.1 PCDHGB4 gene_id:8641|Hs108|chr5 ( 923) 2055 476.5 8.5e-134 CCDS75331.1 PCDHGA4 gene_id:56111|Hs108|chr5 ( 851) 2048 474.9 2.4e-133 CCDS58979.2 PCDHGA4 gene_id:56111|Hs108|chr5 ( 962) 2048 474.9 2.7e-133 CCDS75345.1 PCDHGA11 gene_id:56105|Hs108|chr5 ( 837) 2046 474.5 3.2e-133 CCDS47294.1 PCDHGA11 gene_id:56105|Hs108|chr5 ( 935) 2046 474.5 3.6e-133 CCDS75346.1 PCDHGA12 gene_id:26025|Hs108|chr5 ( 820) 2045 474.2 3.7e-133 CCDS4260.1 PCDHGA12 gene_id:26025|Hs108|chr5 ( 932) 2045 474.3 4.2e-133 CCDS75338.1 PCDHGA8 gene_id:9708|Hs108|chr5 ( 820) 2040 473.1 8.2e-133 CCDS47291.1 PCDHGA8 gene_id:9708|Hs108|chr5 ( 932) 2040 473.1 9.1e-133 CCDS47289.1 PCDHGA2 gene_id:56113|Hs108|chr5 ( 932) 2030 470.8 4.4e-132 CCDS75334.1 PCDHGB3 gene_id:56102|Hs108|chr5 ( 814) 2029 470.6 4.6e-132 CCDS58980.1 PCDHGB3 gene_id:56102|Hs108|chr5 ( 929) 2029 470.6 5.1e-132 CCDS75329.1 PCDHGA3 gene_id:56112|Hs108|chr5 ( 829) 2024 469.5 1e-131 >>CCDS4256.1 PCDHB14 gene_id:56122|Hs108|chr5 (798 aa) initn: 5163 init1: 5163 opt: 5163 Z-score: 6332.3 bits: 1182.5 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 5163; 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CCDS42 LAVRGARVVSKGKKMHLQFDRQTGDLLLNEKLDREELCGPTEPCVLPFQVLLENPLQFFQ 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KB4 FELCVKDINDHSPTFLDKEILIKISEGTTVGATFLMESAQDLDVGSNSLQNYTISPNSHF :: ..:.:::::.:::::::.:: :. : :.:::.: :::::::.::::::::::: :: CCDS42 AELRIRDVNDHSPVFLDKEILLKIPESITPGTTFLIERAQDLDVGTNSLQNYTISPNFHF 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KB4 YIKIPDSSDRKIYPELVLDRALDYEQEAELRLTLTAVDGGSPPKSGTTLVLIKVLDINDN .... :: : : :.:::.:::: :.. :.::::::.::::::.:::.:: :.:.::::: CCDS42 HLNLQDSLDGIILPQLVLNRALDREEQPEIRLTLTALDGGSPPRSGTALVRIEVVDINDN 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KB4 APEFPQSLYEVQVPEDRPLGSWIATISAKDLDAGNYGKISYTFFHASEDIRKTFEINPIS .::: . :::::.::: :.:: .: .::.::: :. :.:::.: .:::::::::... : CCDS42 VPEFAKLLYEVQIPEDSPVGSQVAIVSARDLDIGTNGEISYAFSQASEDIRKTFRLSAKS 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 340 350 pF1KB4 GEVNLRSPLDFEVIQSYTINIQATDGGGLSGKCTLLVKVMDINDNPPEVTISSITKRIPE ::. ::. :::: ::.::.:::::::::::: :...:.:::.::::::.:.:.. ..::: CCDS42 GELLLRQKLDFESIQTYTVNIQATDGGGLSGTCVVFVQVMDLNDNPPELTMSTLINQIPE 310 320 330 340 350 360 360 370 380 390 400 410 pF1KB4 NASETLVALFSILDQDSGDNGRMICSIQDNLPFFLKPTFKNFFTLVSEKALDRESQAEYN : ..::.:.::. : ::::::::.:::::.:::::::. .::.::: :::::...::: CCDS42 NLQDTLIAVFSVSDPDSGDNGRMVCSIQDDLPFFLKPSVENFYTLVISTALDRETRSEYN 370 380 390 400 410 420 420 430 440 450 460 470 pF1KB4 ITITVTDLGTPRLKTEYNITVLLSDVNDNAPTFTQTSYTLFVRENNSPALHIGSVSATDR :::::::.::::::::.:::::.::::::::.:::::::::::::::::::::::::::: CCDS42 ITITVTDFGTPRLKTEHNITVLVSDVNDNAPAFTQTSYTLFVRENNSPALHIGSVSATDR 430 440 450 460 470 480 480 490 500 510 520 530 pF1KB4 DSGTNAQVNYSLLPPQDRHLPLASLVSINADNGHLFALRSLDYEALQEFEFRVGATDRGS ::::::::.:::::::: ::::::::::::::::::::.:::::::: :::::::.:::: CCDS42 DSGTNAQVTYSLLPPQDPHLPLASLVSINADNGHLFALQSLDYEALQAFEFRVGAADRGS 490 500 510 520 530 540 540 550 560 570 580 590 pF1KB4 PALSSEALVRVLVLDANDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPRAAEPGYLVTKVVAVDGDSGQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS42 PALSSEALVRVLVLDANDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPRAAEPGYLVTKVVAVDGDSGQ 550 560 570 580 590 600 600 610 620 630 640 650 pF1KB4 NAWLSYQLLKATEPGLFGVWAHNGEVRTARLLSERDAAKHRLVVLVKDNGEPPRSATATL :::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::.:::::::::::::::::::: CCDS42 NAWLSYQLLKATEPGLFGVWAHNGEVRTARLLRERDAAKQRLVVLVKDNGEPPRSATATL 610 620 630 640 650 660 660 670 680 690 700 710 pF1KB4 HVLLVDGFSQPYLPLPEAAPAQAQADSLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVAVRLCRRSR ::::::::::::: :::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS42 HVLLVDGFSQPYLLLPEAAPAQAQADLLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVAVRLCRRSR 670 680 690 700 710 720 720 730 740 750 760 770 pF1KB4 AASVGRCSVPEGPFPGHLVDVSGTGTLSQSYQYEVCLTGGSGTNEFKFLKPIIPNFQVHD ::::::::::::::::..:::::::::::::::::::::::::::::::::::::: .. CCDS42 AASVGRCSVPEGPFPGQMVDVSGTGTLSQSYQYEVCLTGGSGTNEFKFLKPIIPNFVAQG 730 740 750 760 770 780 780 790 pF1KB4 TGRNMGEIENFRNSFGLNIQ . : .::.:: CCDS42 AERVSEANPSFRKSFEFT 790 >>CCDS4253.1 PCDHB11 gene_id:56125|Hs108|chr5 (797 aa) initn: 4375 init1: 4018 opt: 4018 Z-score: 4926.5 bits: 922.4 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 4018; 77.0% identity (90.6% similar) in 796 aa overlap (1-796:1-796) 10 20 30 40 50 60 pF1KB4 MEIRGALDLRKRQVLIFLVLLGLSRAGTESAHYSVAEETEIGSFVANLARDLGLGVEELS :: .:. . ::::...::::.:.::.:. .::::: . ::::.:::.:::: :.::: CCDS42 MENQGTRTQQIRQVLLLFVLLGMSQAGSETWSFSVAEEMQSGSFVGNLAKDLGLKVRELS 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB4 SREARVVSDDNKKYLHLDLLTGNLLLNEKLDRDELCGSTEPCVLHFQVVLENPLQFFRFE :: :::::.:.:. :.::. ::.:::.: :::.::::: ::::::.::...:: ::...: CCDS42 SRGARVVSNDKKQRLQLDINTGDLLLSETLDREELCGSIEPCVLHLQVLMQNPTQFLQIE 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB4 LCVKDINDHSPTFLDKEILIKISEGTTVGATFLMESAQDLDVGSNSLQNYTISPNSHFYI : :.::::::: : .:..:..: :.. :::.::.:::.::::: :....:::::::::.: CCDS42 LQVRDINDHSPIFSEKQMLLEIPENSPVGAVFLLESAKDLDVGINAVKSYTISPNSHFHI 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KB4 KIPDSSDRKIYPELVLDRALDYEQEAELRLTLTAVDGGSPPKSGTTLVLIKVLDINDNAP :. : . :::::::.:::::. :: . :.:.::::::.:::.:: . :.:::::.: CCDS42 KMRVIPDNRKYPELVLDKALDYEELPELSFILSALDGGSPPRSGTALVRVVVVDINDNSP 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KB4 EFPQSLYEVQVPEDRPLGSWIATISAKDLDAGNYGKISYTFFHASEDIRKTFEINPISGE :: :..:::.. :. ::: : .:: :::.:. :.: ::: ::::::::::::: ::: CCDS42 EFEQAFYEVKIRENSILGSLILIVSAWDLDSGTNGEICYTFSHASEDIRKTFEINQKSGE 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KB4 VNLRSPLDFEVIQSYTINIQATDGGGLSGKCTLLVKVMDINDNPPEVTISSITKRIPENA ..::.:::::.:.::.: ::::::::: :: :....:.:.::: ::.:.::::. ::::. CCDS42 ITLRAPLDFETIESYSIIIQATDGGGLFGKSTVIIHVIDVNDNAPEITVSSITSPIPENT 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KB4 SETLVALFSILDQDSGDNGRMICSIQDNLPFFLKPTFKNFFTLVSEKALDRESQAEYNIT ::.: .::: : :::::::..::: ..::: :: . .:..:: .:. ::::: :::::: CCDS42 PETVVMVFSIQDIDSGDNGRIVCSIPEDLPFVLKSSVENYYTLETERPLDRESTAEYNIT 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KB4 ITVTDLGTPRLKTEYNITVLLSDVNDNAPTFTQTSYTLFVRENNSPALHIGSVSATDRDS ::::::: ::::::.: :::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS42 ITVTDLGIPRLKTEHNTTVLVSDVNDNAPTFTQTSYTLFVRENNSPALHIGSVSATDRDS 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KB4 GTNAQVNYSLLPPQDRHLPLASLVSINADNGHLFALRSLDYEALQEFEFRVGATDRGSPA ::::::::::::::: :::::::::::.::::::::::::::::: :.:::::::::::: CCDS42 GTNAQVNYSLLPPQDLHLPLASLVSINTDNGHLFALRSLDYEALQAFDFRVGATDRGSPA 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 pF1KB4 LSSEALVRVLVLDANDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPRAAEPGYLVTKVVAVDGDSGQNA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS42 LSSEALVRVLVLDANDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPRAAEPGYLVTKVVAVDGDSGQNA 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 pF1KB4 WLSYQLLKATEPGLFGVWAHNGEVRTARLLSERDAAKHRLVVLVKDNGEPPRSATATLHV ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.: CCDS42 WLSYQLLKATEPGLFGVWAHNGEVRTARLLSERDAAKHRLVVLVKDNGEPPRSATATLQV 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 pF1KB4 LLVDGFSQPYLPLPEAAPAQAQADSLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVAVRLCRRSRAA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS42 LLVDGFSQPYLPLPEAAPAQAQADSLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVAVRLCRRSRAA 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 pF1KB4 SVGRCSVPEGPFPGHLVDVSGTGTLSQSYQYEVCLTGGSGTNEFKFLKPIIPNFQVHDTG ::: ::::.:::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::.:::.:.. : CCDS42 SVGSCSVPKGPFPGHLVDVSGTGTLSQSYQYEVCLTGGSETNEFKFLKPVIPNIQAKGLG 730 740 750 760 770 780 790 pF1KB4 RNMGEIENFRNSFGLNIQ .: : .::::::.: CCDS42 KNSEENSTFRNSFGFNF 790 >>CCDS4251.1 PCDHB16 gene_id:57717|Hs108|chr5 (776 aa) initn: 3977 init1: 3977 opt: 3977 Z-score: 4876.4 bits: 913.1 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 3977; 77.4% identity (91.6% similar) in 774 aa overlap (1-774:1-774) 10 20 30 40 50 60 pF1KB4 MEIRGALDLRKRQVLIFLVLLGLSRAGTESAHYSVAEETEIGSFVANLARDLGLGVEELS ::: . :.::::.:.:::.:: ::.: . :::.:::: :::::::..:::::. :.: CCDS42 MEIGWMHNRRQRQVLVFFVLLSLSGAGAELGSYSVVEETERGSFVANLGKDLGLGLTEMS 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB4 SREARVVSDDNKKYLHLDLLTGNLLLNEKLDRDELCGSTEPCVLHFQVVLENPLQFFRFE .:.::..:. ::..:.: ::.::.::::::.:::: ::::.:::::..::::..:. : CCDS42 TRKARIISQGNKQHLQLKAQTGDLLINEKLDREELCGPTEPCILHFQVLMENPLEIFQAE 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB4 LCVKDINDHSPTFLDKEILIKISEGTTVGATFLMESAQDLDVGSNSLQNYTISPNSHFYI : : ::::::: : .::...:: :.. .:. : .. : :::::::..::: :::.::: . CCDS42 LRVIDINDHSPMFTEKEMILKIPENSPLGTEFPLNHALDLDVGSNNVQNYKISPSSHFRV 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KB4 KIPDSSDRKIYPELVLDRALDYEQEAELRLTLTAVDGGSPPKSGTTLVLIKVLDINDNAP : . : . :::::::. :: :.: .:::::::.::::::.:::. : :.:.::::::: CCDS42 LIHEFRDGRKYPELVLDKELDREEEPQLRLTLTALDGGSPPRSGTAQVRIEVVDINDNAP 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KB4 EFPQSLYEVQVPEDRPLGSWIATISAKDLDAGNYGKISYTFFHASEDIRKTFEINPISGE :: : .:.::.::. :::: .::.::.:::.: ::::::.:. :::: ::.:.::..:: CCDS42 EFEQPIYKVQIPENSPLGSLVATVSARDLDGGANGKISYTLFQPSEDISKTLEVNPMTGE 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KB4 VNLRSPLDFEVIQSYTINIQATDGGGLSGKCTLLVKVMDINDNPPEVTISSITKRIPENA : ::. .:::.. :: . :.::::::::::::::..:.:.:::::.::.:..:. ::::. CCDS42 VRLRKQVDFEMVTSYEVRIKATDGGGLSGKCTLLLQVVDVNDNPPQVTMSALTSPIPENS 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KB4 SETLVALFSILDQDSGDNGRMICSIQDNLPFFLKPTFKNFFTLVSEKALDRESQAEYNIT : .::.::. : :::.::. : :::..:::.:::. :::.:::.:.:::::..:::::: CCDS42 PEIVVAVFSVSDPDSGNNGKTISSIQEDLPFLLKPSVKNFYTLVTERALDREARAEYNIT 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KB4 ITVTDLGTPRLKTEYNITVLLSDVNDNAPTFTQTSYTLFVRENNSPALHIGSVSATDRDS .::::.::::::::.:::: .::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS42 LTVTDMGTPRLKTEHNITVQISDVNDNAPTFTQTSYTLFVRENNSPALHIGSVSATDRDS 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KB4 GTNAQVNYSLLPPQDRHLPLASLVSINADNGHLFALRSLDYEALQEFEFRVGATDRGSPA ::::::.:::::::: ::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::: CCDS42 GTNAQVTYSLLPPQDPHLPLASLVSINADNGHLFALRSLDYEALQAFEFRVGATDRGSPA 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 pF1KB4 LSSEALVRVLVLDANDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPRAAEPGYLVTKVVAVDGDSGQNA :: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS42 LSREALVRVLVLDANDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPRAAEPGYLVTKVVAVDGDSGQNA 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 pF1KB4 WLSYQLLKATEPGLFGVWAHNGEVRTARLLSERDAAKHRLVVLVKDNGEPPRSATATLHV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::: CCDS42 WLSYQLLKATEPGLFGVWAHNGEVRTARLLSERDAAKQRLVVLVKDNGEPPRSATATLHV 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 pF1KB4 LLVDGFSQPYLPLPEAAPAQAQADSLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVAVRLCRRSRAA :::::::::.::::::::.:.::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS42 LLVDGFSQPFLPLPEAAPGQTQANSLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVAVRLCRRSRAA 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 pF1KB4 SVGRCSVPEGPFPGHLVDVSGTGTLSQSYQYEVCLTGGSGTNEFKFLKPIIPNFQVHDTG ::::::.:::::::.:::::::::::::::::::::::: :.:::::::::::: CCDS42 SVGRCSMPEGPFPGRLVDVSGTGTLSQSYQYEVCLTGGSETSEFKFLKPIIPNFSP 730 740 750 760 770 790 pF1KB4 RNMGEIENFRNSFGLNIQ >>CCDS4245.1 PCDHB3 gene_id:56132|Hs108|chr5 (796 aa) initn: 3975 init1: 3975 opt: 3975 Z-score: 4873.7 bits: 912.7 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 3975; 76.4% identity (90.9% similar) in 793 aa overlap (1-793:1-793) 10 20 30 40 50 60 pF1KB4 MEIRGALDLRKRQVLIFLVLLGLSRAGTESAHYSVAEETEIGSFVANLARDLGLGVEELS :: : ::.::::...:.:: : ::.:: .:::::: : : ..::::.:::: ::::. CCDS42 MEAGGERFLRQRQVLLLFVFLGGSLAGSESRRYSVAEEKEKGFLIANLAKDLGLRVEELA 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB4 SREARVVSDDNKKYLHLDLLTGNLLLNEKLDRDELCGSTEPCVLHFQVVLENPLQFFRFE .: :.::: ::....:. ::.:::::::::.:::: ::::.::::..:.::::: : CCDS42 ARGAQVVSKGNKQHFQLSHQTGDLLLNEKLDREELCGPTEPCILHFQILLQNPLQFVTNE 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB4 LCVKDINDHSPTFLDKEILIKISEGTTVGATFLMESAQDLDVGSNSLQNYTISPNSHFYI : . :.:::::.:...:. .:: :.: :... . .:.::::: ::::::::.:::::.. CCDS42 LRIIDVNDHSPVFFENEMHLKILESTLPGTVIPLGNAEDLDVGRNSLQNYTITPNSHFHV 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KB4 KIPDSSDRKIYPELVLDRALDYEQEAELRLTLTAVDGGSPPKSGTTLVLIKVLDINDNAP . : . :::::::.::: :.. :: :::::.::::::.:::. . :.::::::::: CCDS42 LTRSRRDGRKYPELVLDKALDPEEQPELSLTLTALDGGSPPRSGTAQINIQVLDINDNAP 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KB4 EFPQSLYEVQVPEDRPLGSWIATISAKDLDAGNYGKISYTFFHASEDIRKTFEINPISGE :: : :::: : :. :..: :.:.::.:::.:..: :::.::::::.:::::..:::.:. CCDS42 EFAQPLYEVAVLENTPVNSVIVTVSASDLDTGSFGTISYAFFHASEEIRKTFQLNPITGD 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KB4 VNLRSPLDFEVIQSYTINIQATDGGGLSGKCTLLVKVMDINDNPPEVTISSITKRIPENA ..: . :.::.:.:: ..:.: :::::::: :..:.:.:.::::::.:.::... ::::. CCDS42 MQLVKYLNFEAINSYEVDIEAKDGGGLSGKSTVIVQVVDVNDNPPELTLSSVNSPIPENS 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KB4 SETLVALFSILDQDSGDNGRMICSIQDNLPFFLKPTFKNFFTLVSEKALDRESQAEYNIT .::..:.::. : :::::::..:::..::::::::. .::.::::: :::::...::::: CCDS42 GETVLAVFSVSDLDSGDNGRVMCSIENNLPFFLKPSVENFYTLVSEGALDRETRSEYNIT 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KB4 ITVTDLGTPRLKTEYNITVLLSDVNDNAPTFTQTSYTLFVRENNSPALHIGSVSATDRDS ::.::::::::::.::::::.::::::::.::: :::::::::::::::::::::::::: CCDS42 ITITDLGTPRLKTKYNITVLVSDVNDNAPAFTQISYTLFVRENNSPALHIGSVSATDRDS 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KB4 GTNAQVNYSLLPPQDRHLPLASLVSINADNGHLFALRSLDYEALQEFEFRVGATDRGSPA ::::::.:::::::: ::::.:::::::::::::::::::::::: :::::::::::::: CCDS42 GTNAQVTYSLLPPQDPHLPLSSLVSINADNGHLFALRSLDYEALQAFEFRVGATDRGSPA 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 pF1KB4 LSSEALVRVLVLDANDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPRAAEPGYLVTKVVAVDGDSGQNA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS42 LSSEALVRVLVLDANDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPRAAEPGYLVTKVVAVDGDSGQNA 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 pF1KB4 WLSYQLLKATEPGLFGVWAHNGEVRTARLLSERDAAKHRLVVLVKDNGEPPRSATATLHV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS42 WLSYQLLKATEPGLFGVWAHNGEVRTARLLSERDAAKHRLVVLVKDNGEPPRSATATLHV 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 pF1KB4 LLVDGFSQPYLPLPEAAPAQAQADSLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVAVRLCRRSRAA :::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS42 LLVDGFSQPYLPLPEAAPAQAQADLLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVAVRLCRRSRAA 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 pF1KB4 SVGRCSVPEGPFPGHLVDVSGTGTLSQSYQYEVCLTGGSGTNEFKFLKPIIPNFQVHDTG ::::::::::::::..:::::::::::::::::::::::::::::::::::::: .. . CCDS42 SVGRCSVPEGPFPGQMVDVSGTGTLSQSYQYEVCLTGGSGTNEFKFLKPIIPNFVAQGAE 730 740 750 760 770 780 790 pF1KB4 RNMGEIENFRNSFGLNIQ : .::.:: CCDS42 RVSEANPSFRKSFEFS 790 >>CCDS4254.1 PCDHB12 gene_id:56124|Hs108|chr5 (795 aa) initn: 4295 init1: 3941 opt: 3962 Z-score: 4857.8 bits: 909.7 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 3962; 76.0% identity (90.8% similar) in 795 aa overlap (1-795:1-795) 10 20 30 40 50 60 pF1KB4 MEIRGALDLRKRQVLIFLVLLGLSRAGTESAHYSVAEETEIGSFVANLARDLGLGVEELS :: :: :. ::::.:.::::.:.::.:.... : :: . ::::.:::. ::: : ::: CCDS42 MENGGAGTLQIRQVLLFFVLLGMSQAGSETGNFLVMEELQSGSFVGNLAKTLGLEVSELS 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB4 SREARVVSDDNKKYLHLDLLTGNLLLNEKLDRDELCGSTEPCVLHFQVVLENPLQFFRFE :: :::::.:::. :.:: ::.::: : :::.:::::.:::::.:::...:: ::...: CCDS42 SRGARVVSNDNKECLQLDTNTGDLLLREMLDREELCGSNEPCVLYFQVLMKNPTQFLQIE 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB4 LCVKDINDHSPTFLDKEILIKISEGTTVGATFLMESAQDLDVGSNSLQNYTISPNSHFYI : :.:::::::.::.::.:..: :.. :::.::.:::.::::: :....:::.:::::.. CCDS42 LQVRDINDHSPVFLEKEMLLEIPENSPVGAVFLLESAKDLDVGINAVKSYTINPNSHFHV 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KB4 KIPDSSDRKIYPELVLDRALDYEQEAELRLTLTAVDGGSPPKSGTTLVLIKVLDINDNAP :: . : . :::::::.:::::.. :: . :::.::::::.:::.:: . :.:::::.: CCDS42 KIRVNPDNRKYPELVLDKALDYEERPELSFILTALDGGSPPRSGTALVRVVVVDINDNSP 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KB4 EFPQSLYEVQVPEDRPLGSWIATISAKDLDAGNYGKISYTFFHASEDIRKTFEINPISGE :: :..:::.. :. ::: ..:.:: :::.:. ...:::: ::::::::::::: ::. CCDS42 EFEQAFYEVKILENSILGSLVVTVSAWDLDSGTNSELSYTFSHASEDIRKTFEINQKSGD 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KB4 VNLRSPLDFEVIQSYTINIQATDGGGLSGKCTLLVKVMDINDNPPEVTISSITKRIPENA ..: .:::::.:.::.: ::::::::: :: :. ..:::.::: ::.:.::::. ::::. CCDS42 ITLTAPLDFEAIESYSIIIQATDGGGLFGKSTVRIQVMDVNDNAPEITVSSITSPIPENT 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KB4 SETLVALFSILDQDSGDNGRMICSIQDNLPFFLKPTFKNFFTLVSEKALDRESQAEYNIT ::.: .: : :.::::::.:.::: ...:: :: . .:..:: .:. :::::.:::::: CCDS42 PETVVMVFRIRDRDSGDNGKMVCSIPEDIPFVLKSSVNNYYTLETERPLDRESRAEYNIT 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KB4 ITVTDLGTPRLKTEYNITVLLSDVNDNAPTFTQTSYTLFVRENNSPALHIGSVSATDRDS ::::::::::::::.:::::.::::::::.::::::.:::::::::::::::.::::::: CCDS42 ITVTDLGTPRLKTEHNITVLVSDVNDNAPAFTQTSYALFVRENNSPALHIGSISATDRDS 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KB4 GTNAQVNYSLLPPQDRHLPLASLVSINADNGHLFALRSLDYEALQEFEFRVGATDRGSPA :::::::::::: :: ::::::::::::::::::::::::::::: :.:::::::.:::: CCDS42 GTNAQVNYSLLPSQDPHLPLASLVSINADNGHLFALRSLDYEALQGFQFRVGATDHGSPA 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 pF1KB4 LSSEALVRVLVLDANDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPRAAEPGYLVTKVVAVDGDSGQNA ::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::: CCDS42 LSSEALVRVLVLDANDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPWAAEPGYLVTKVVAVDGDSGQNA 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 pF1KB4 WLSYQLLKATEPGLFGVWAHNGEVRTARLLSERDAAKHRLVVLVKDNGEPPRSATATLHV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS42 WLSYQLLKATEPGLFGVWAHNGEVRTARLLSERDAAKHRLVVLVKDNGEPPRSATATLHV 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 pF1KB4 LLVDGFSQPYLPLPEAAPAQAQADSLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVAVRLCRRSRAA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS42 LLVDGFSQPYLPLPEAAPAQAQADSLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVAVRLCRRSRAA 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 pF1KB4 SVGRCSVPEGPFPGHLVDVSGTGTLSQSYQYEVCLTGGSGTNEFKFLKPIIPNFQVHDTG ::::::::::::::::::::::::::::.::::.:::: .:.::::::::::: ..:: CCDS42 PVGRCSVPEGPFPGHLVDVSGTGTLSQSYHYEVCVTGGSRSNKFKFLKPIIPNFLPQSTG 730 740 750 760 770 780 790 pF1KB4 RNMGEIENFRNSFGLNIQ .. : :.:..:. CCDS42 SEVEENPPFQNNLGF 790 >>CCDS4246.1 PCDHB4 gene_id:56131|Hs108|chr5 (795 aa) initn: 4207 init1: 3931 opt: 3931 Z-score: 4819.7 bits: 902.7 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 3931; 76.5% identity (90.4% similar) in 782 aa overlap (12-793:11-792) 10 20 30 40 50 60 pF1KB4 MEIRGALDLRKRQVLIFLVLLGLSRAGTESAHYSVAEETEIGSFVANLARDLGLGVEELS :::: :.... ::.. : .::: :::: :::::.::.:::::. ::. CCDS42 MKKLGRIHPNRQVLAFILMVFLSQVRLEPIRYSVLEETESGSFVAHLAKDLGLGIGELA 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KB4 SREARVVSDDNKKYLHLDLLTGNLLLNEKLDRDELCGSTEPCVLHFQVVLENPLQFFRFE :: :::.:::.:. :.:: ::.::: :::::.:::: ::::::::: :: :.:::. : CCDS42 SRSARVLSDDDKQRLQLDRQTGDLLLREKLDREELCGPIEPCVLHFQVFLEMPVQFFQGE 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KB4 LCVKDINDHSPTFLDKEILIKISEGTTVGATFLMESAQDLDVGSNSLQNYTISPNSHFYI : ..::::::: : ..:.:.:: :.. :. : . :.:::::::.::.:::::::::.: CCDS42 LLIQDINDHSPIFPEREVLLKILENSQPGTLFPLLIAEDLDVGSNGLQKYTISPNSHFHI 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KB4 KIPDSSDRKIYPELVLDRALDYEQEAELRLTLTAVDGGSPPKSGTTLVLIKVLDINDNAP . :. : ::.:: :. :: :.. :. :::.:.::::::.:::..: : ..::::::: CCDS42 LTRNHSEGKKYPDLVQDKPLDREEQPEFSLTLVALDGGSPPRSGTVMVRILIMDINDNAP 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KB4 EFPQSLYEVQVPEDRPLGSWIATISAKDLDAGNYGKISYTFFHASEDIRKTFEINPISGE :: .. : ::: :. :: : :. . :.:.::::.:..:: .:.::..:..:: :: ..:: CCDS42 EFVHTPYGVQVLENSPLDSPIVRVLARDIDAGNFGSVSYGLFQASDEIKQTFSINEVTGE 240 250 260 270 280 290 310 320 330 340 350 360 pF1KB4 VNLRSPLDFEVIQSYTINIQATDGGGLSGKCTLLVKVMDINDNPPEVTISSITKRIPENA . :.. :::: :.:: ..:.:::::::::: :....:.:.::::::. :::.:. ::::: CCDS42 ILLKKKLDFEKIKSYHVEIEATDGGGLSGKGTVVIEVVDVNDNPPELIISSLTSSIPENA 300 310 320 330 340 350 370 380 390 400 410 420 pF1KB4 SETLVALFSILDQDSGDNGRMICSIQDNLPFFLKPTFKNFFTLVSEKALDRESQAEYNIT ::.:..: : :.:::.::.::::: :::::.::::.:::.:::.:. ::::..:::::: CCDS42 PETVVSIFRIRDRDSGENGKMICSIPDNLPFILKPTLKNFYTLVTERPLDRETSAEYNIT 360 370 380 390 400 410 430 440 450 460 470 480 pF1KB4 ITVTDLGTPRLKTEYNITVLLSDVNDNAPTFTQTSYTLFVRENNSPALHIGSVSATDRDS :.:::::::::::. :::: .::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::: CCDS42 IAVTDLGTPRLKTQQNITVQVSDVNDNAPAFTQTSYTLFVRENNSPALHIGSVSATDRDS 420 430 440 450 460 470 490 500 510 520 530 540 pF1KB4 GTNAQVNYSLLPPQDRHLPLASLVSINADNGHLFALRSLDYEALQEFEFRVGATDRGSPA ::::::.:::::::: ::::::::::::::::::::::::::::: :::::::.:::::: CCDS42 GTNAQVTYSLLPPQDPHLPLASLVSINADNGHLFALRSLDYEALQAFEFRVGASDRGSPA 480 490 500 510 520 530 550 560 570 580 590 600 pF1KB4 LSSEALVRVLVLDANDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPRAAEPGYLVTKVVAVDGDSGQNA :::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS42 LSSEALVRVLVLDTNDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPRAAEPGYLVTKVVAVDGDSGQNA 540 550 560 570 580 590 610 620 630 640 650 660 pF1KB4 WLSYQLLKATEPGLFGVWAHNGEVRTARLLSERDAAKHRLVVLVKDNGEPPRSATATLHV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS42 WLSYQLLKATEPGLFGVWAHNGEVRTARLLSERDAAKHRLVVLVKDNGEPPRSATATLHV 600 610 620 630 640 650 670 680 690 700 710 720 pF1KB4 LLVDGFSQPYLPLPEAAPAQAQADSLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVAVRLCRRSRAA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS42 LLVDGFSQPYLPLPEAAPAQAQADSLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVAVRLCRRSRAA 660 670 680 690 700 710 730 740 750 760 770 780 pF1KB4 SVGRCSVPEGPFPGHLVDVSGTGTLSQSYQYEVCLTGGSGTNEFKFLKPIIPNFQVHDTG ::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::.::::::::.::. :.::: CCDS42 SVGRCSVPEGPFPGHLVDVSGTGTLSQSYQYEVCLTGDSGTGEFKFLKPIFPNLLVQDTG 720 730 740 750 760 770 790 pF1KB4 RNMGEIENFRNSFGLNIQ :.. : .::::. CCDS42 REVKENPKFRNSLVFS 780 790 >>CCDS4247.1 PCDHB5 gene_id:26167|Hs108|chr5 (795 aa) initn: 2819 init1: 2819 opt: 3909 Z-score: 4792.7 bits: 897.7 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 3909; 74.6% identity (89.8% similar) in 796 aa overlap (1-796:1-795) 10 20 30 40 50 60 pF1KB4 MEIRGALDLRKRQVLIFLVLLGLSRAGTESAHYSVAEETEIGSFVANLARDLGLGVEELS :: : .::::... .:: : .::.:...::. :::: : :::::.:::::: ::. CCDS42 METALAKTPQKRQVMFLAILLLLWEAGSEAVRYSIPEETESGYSVANLAKDLGLGVGELA 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB4 SREARVVSDDNKKYLHLDLLTGNLLLNEKLDRDELCGSTEPCVLHFQVVLENPLQFFRFE .: ::. ::. :.::. :::::: :::::. .::.::::.::::..::::.:::. . CCDS42 TRGARMHYKGNKELLQLDIKTGNLLLYEKLDREVMCGATEPCILHFQLLLENPVQFFQTD 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB4 LCVKDINDHSPTFLDKEILIKISEGTTVGATFLMESAQDLDVGSNSLQNYTISPNSHFYI : . :::::.: : .::.:.:: :.: :..: .. :::.:.:::..:::::::::::.. CCDS42 LQLTDINDHAPEFPEKEMLLKIPESTQPGTVFPLKIAQDFDIGSNTVQNYTISPNSHFHV 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KB4 KIPDSSDRKIYPELVLDRALDYEQEAELRLTLTAVDGGSPPKSGTTLVLIKVLDINDNAP . .: . :::::::.::: :.. :: :::::.:::.::.:::: . : ::: ::::: CCDS42 ATHNRGDGRKYPELVLDKALDREERPELSLTLTALDGGAPPRSGTTTIRIVVLDNNDNAP 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KB4 EFPQSLYEVQVPEDRPLGSWIATISAKDLDAGNYGKISYTFFHASEDIRKTFEINPISGE :: ::.:::::::. ::.: ....::.::::: ::...:..:...: . . : :. ..: CCDS42 EFLQSFYEVQVPENSPLNSLVVVVSARDLDAGAYGSVAYALFQGDE-VTQPFVIDEKTAE 250 260 270 280 290 310 320 330 340 350 360 pF1KB4 VNLRSPLDFEVIQSYTINIQATDGGGLSGKCTLLVKVMDINDNPPEVTISSITKRIPENA . :. ::::. :...: ::::::::::::. ..:.:.::: ::.:.:.... :::: CCDS42 IRLKRALDFEATPYYNVEIVATDGGGLSGKCTVAIEVVDVNDNAPELTMSTLSSPTPENA 300 310 320 330 340 350 370 380 390 400 410 420 pF1KB4 SETLVALFSILDQDSGDNGRMICSIQDNLPFFLKPTFKNFFTLVSEKALDRESQAEYNIT ::.::.::. : :::::::::::::..:::.::::.:::.:::....:::::::::::: CCDS42 PETVVAVFSVSDPDSGDNGRMICSIQNDLPFLLKPTLKNFYTLVTQRTLDRESQAEYNIT 360 370 380 390 400 410 430 440 450 460 470 480 pF1KB4 ITVTDLGTPRLKTEYNITVLLSDVNDNAPTFTQTSYTLFVRENNSPALHIGSVSATDRDS :::::.::::::::.:::::.::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::: CCDS42 ITVTDMGTPRLKTEHNITVLVSDVNDNAPAFTQTSYTLFVRENNSPALHIGSVSATDRDS 420 430 440 450 460 470 490 500 510 520 530 540 pF1KB4 GTNAQVNYSLLPPQDRHLPLASLVSINADNGHLFALRSLDYEALQEFEFRVGATDRGSPA ::::::.:::::::. :: :::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::: CCDS42 GTNAQVTYSLLPPQNPHLRLASLVSINADNGHLFALRSLDYEALQAFEFRVGATDRGSPA 480 490 500 510 520 530 550 560 570 580 590 600 pF1KB4 LSSEALVRVLVLDANDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPRAAEPGYLVTKVVAVDGDSGQNA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS42 LSSEALVRVLVLDANDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPRAAEPGYLVTKVVAVDGDSGQNA 540 550 560 570 580 590 610 620 630 640 650 660 pF1KB4 WLSYQLLKATEPGLFGVWAHNGEVRTARLLSERDAAKHRLVVLVKDNGEPPRSATATLHV :::::::::::::::..::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS42 WLSYQLLKATEPGLFSMWAHNGEVRTARLLSERDAAKHRLVVLVKDNGEPPRSATATLHV 600 610 620 630 640 650 670 680 690 700 710 720 pF1KB4 LLVDGFSQPYLPLPEAAPAQAQADSLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVAVRLCRRSRAA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS42 LLVDGFSQPYLPLPEAAPAQAQADSLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVAVRLCRRSRAA 660 670 680 690 700 710 730 740 750 760 770 780 pF1KB4 SVGRCSVPEGPFPGHLVDVSGTGTLSQSYQYEVCLTGGSGTNEFKFLKPIIPNFQVHDTG ::::::::::::::::::::::::::::.::::::: ::..:::::::::::. . .: CCDS42 PVGRCSVPEGPFPGHLVDVSGTGTLSQSYHYEVCLTGDSGAGEFKFLKPIIPNLLPQGAG 720 730 740 750 760 770 790 pF1KB4 RNMGEIENFRNSFGLNIQ ...:. :::::::: CCDS42 EEIGKTAAFRNSFGLN 780 790 >>CCDS4257.1 PCDHB15 gene_id:56121|Hs108|chr5 (787 aa) initn: 3884 init1: 3884 opt: 3894 Z-score: 4774.4 bits: 894.3 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 3894; 75.9% identity (90.7% similar) in 781 aa overlap (1-781:1-781) 10 20 30 40 50 60 pF1KB4 MEIRGALDLRKRQVLIFLVLLGLSRAGTESAHYSVAEETEIGSFVANLARDLGLGVEELS :: : ..:::::.:.:: .. :: : .::: :::: :::::::: :::::: ::. CCDS42 MEPAGERFPEQRQVLILLLLLEVTLAGWEPRRYSVMEETERGSFVANLANDLGLGVGELA 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB4 SREARVVSDDNKKYLHLDLLTGNLLLNEKLDRDELCGSTEPCVLHFQVVLENPLQFFRFE : :::::.::.. :.::: ::.:.:::::::..::: ::::..::::.:..::. :: : CCDS42 ERGARVVSEDNEQGLQLDLQTGQLILNEKLDREKLCGPTEPCIMHFQVLLKKPLEVFRAE 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB4 LCVKDINDHSPTFLDKEILIKISEGTTVGATFLMESAQDLDVGSNSLQNYTISPNSHFYI : : ::::::: : ..:. .:: : ...:..: ...:.:::::::..:::.:::::::.. CCDS42 LLVTDINDHSPEFPEREMTLKIPETSSLGTVFPLKKARDLDVGSNNVQNYNISPNSHFHV 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KB4 KIPDSSDRKIYPELVLDRALDYEQEAELRLTLTAVDGGSPPKSGTTLVLIKVLDINDNAP . .: . ::::::: :: :..::::::::::::::::.:::. .:: ::: ::::: CCDS42 STRTRGDGRKYPELVLDTELDREEQAELRLTLTAVDGGSPPRSGTVQILILVLDANDNAP 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KB4 EFPQSLYEVQVPEDRPLGSWIATISAKDLDAGNYGKISYTFFHASEDIRKTFEINPISGE :: :.::::::::. :.:: .. .::.:::.:. :.:::.....:..: : ::.. .::: CCDS42 EFVQALYEVQVPENSPVGSLVVKVSARDLDTGTNGEISYSLYYSSQEIDKPFELSSLSGE 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KB4 VNLRSPLDFEVIQSYTINIQATDGGGLSGKCTLLVKVMDINDNPPEVTISSITKRIPENA . : . ::::...:: ..:.:.:::::::::.. :::.:.::: ::..:::.:. ::::. 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