Result of FASTA (ccds) for
pF1KB4239
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4239, 1208 aa
1>>>pF1KB4239 1208 - 1208 aa - 1208 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.2372+/-0.0014; mu= 13.8285+/- 0.082
mean_var=187.9721+/-39.218, 0's: 0 Z-trim(105.7): 206 B-trim: 206 in 2/46
Lambda= 0.093547
statistics sampled from 8366 (8595) to 8366 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.614), E-opt: 0.2 (0.264), width: 16
Scan time: 5.140
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS58812.1 CHL1 gene_id:10752|Hs108|chr3 (1208) 8165 1116.4 0
CCDS2556.1 CHL1 gene_id:10752|Hs108|chr3 (1224) 6604 905.7 0
CCDS74887.1 CHL1 gene_id:10752|Hs108|chr3 (1171) 5328 733.5 7.3e-211
CCDS48192.1 L1CAM gene_id:3897|Hs108|chrX (1248) 2548 358.3 6.7e-98
CCDS14734.1 L1CAM gene_id:3897|Hs108|chrX (1253) 2534 356.4 2.5e-97
CCDS14733.1 L1CAM gene_id:3897|Hs108|chrX (1257) 2534 356.4 2.5e-97
CCDS55153.1 NRCAM gene_id:4897|Hs108|chr7 (1192) 2457 346.0 3.2e-94
CCDS5751.1 NRCAM gene_id:4897|Hs108|chr7 (1183) 2022 287.3 1.5e-76
CCDS47686.1 NRCAM gene_id:4897|Hs108|chr7 (1304) 1951 277.8 1.2e-73
CCDS75652.1 NRCAM gene_id:4897|Hs108|chr7 (1211) 1940 276.3 3.3e-73
CCDS30982.1 NFASC gene_id:23114|Hs108|chr1 (1169) 1863 265.8 4.3e-70
CCDS53462.1 NFASC gene_id:23114|Hs108|chr1 (1174) 1863 265.8 4.3e-70
CCDS53461.1 NFASC gene_id:23114|Hs108|chr1 ( 619) 1448 209.5 2e-53
CCDS1449.1 CNTN2 gene_id:6900|Hs108|chr1 (1040) 1426 206.8 2.3e-52
CCDS33790.1 CNTN3 gene_id:5067|Hs108|chr3 (1028) 1417 205.6 5.2e-52
CCDS43041.1 CNTN4 gene_id:152330|Hs108|chr3 (1026) 1357 197.5 1.4e-49
CCDS2557.1 CNTN6 gene_id:27255|Hs108|chr3 (1028) 1339 195.1 7.7e-49
CCDS53696.1 CNTN5 gene_id:53942|Hs108|chr11 (1100) 1333 194.3 1.4e-48
CCDS53697.1 CNTN5 gene_id:53942|Hs108|chr11 (1026) 1330 193.9 1.8e-48
CCDS58168.1 CNTN5 gene_id:53942|Hs108|chr11 ( 911) 1236 181.1 1.1e-44
CCDS8738.1 CNTN1 gene_id:1272|Hs108|chr12 (1007) 1048 155.8 5e-37
CCDS8737.1 CNTN1 gene_id:1272|Hs108|chr12 (1018) 1048 155.8 5.1e-37
CCDS45769.1 SDK2 gene_id:54549|Hs108|chr17 (2172) 1032 154.0 3.8e-36
CCDS53460.1 NFASC gene_id:23114|Hs108|chr1 (1240) 979 146.6 3.7e-34
CCDS2558.1 CNTN4 gene_id:152330|Hs108|chr3 ( 698) 954 142.9 2.6e-33
CCDS11952.1 DCC gene_id:1630|Hs108|chr18 (1447) 671 105.1 1.3e-21
CCDS8384.1 DSCAML1 gene_id:57453|Hs108|chr11 (2113) 607 96.6 6.9e-19
CCDS75813.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9 (1496) 566 90.9 2.5e-17
CCDS43786.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9 (1912) 558 90.0 6.3e-17
CCDS58225.1 CNTN1 gene_id:1272|Hs108|chr12 ( 627) 539 86.9 1.7e-16
CCDS490.2 PTPRF gene_id:5792|Hs108|chr1 (1898) 545 88.2 2.1e-16
CCDS489.2 PTPRF gene_id:5792|Hs108|chr1 (1907) 542 87.8 2.8e-16
CCDS2971.1 BOC gene_id:91653|Hs108|chr3 (1114) 520 84.6 1.5e-15
CCDS77788.1 BOC gene_id:91653|Hs108|chr3 (1115) 508 83.0 4.7e-15
CCDS44254.1 IGSF9 gene_id:57549|Hs108|chr1 (1179) 492 80.8 2.2e-14
CCDS53957.1 NEO1 gene_id:4756|Hs108|chr15 (1408) 490 80.6 3e-14
CCDS58378.1 NEO1 gene_id:4756|Hs108|chr15 (1450) 490 80.6 3e-14
CCDS10247.1 NEO1 gene_id:4756|Hs108|chr15 (1461) 490 80.7 3e-14
CCDS55289.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9 (1505) 470 78.0 2e-13
CCDS55288.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9 (1502) 460 76.6 5.1e-13
CCDS6472.2 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9 (1505) 415 70.5 3.4e-11
CCDS55290.1 PTPRD gene_id:5789|Hs108|chr9 (1506) 415 70.5 3.4e-11
CCDS46221.1 PXDN gene_id:7837|Hs108|chr2 (1479) 414 70.4 3.7e-11
CCDS10205.1 IGDCC3 gene_id:9543|Hs108|chr15 ( 814) 404 68.8 6.3e-11
>>CCDS58812.1 CHL1 gene_id:10752|Hs108|chr3 (1208 aa)
initn: 8165 init1: 8165 opt: 8165 Z-score: 5968.2 bits: 1116.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8165; 99.8% identity (100.0% similar) in 1208 aa overlap (1-1208:1-1208)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MEPLLLGRGLIVYLMFLLLKFSKAIEIPSSVQQVPTIIKQSKVQVAFPFDEYFQIECEAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MEPLLLGRGLIVYLMFLLLKFSKAIEIPSSVQQVPTIIKQSKVQVAFPFDEYFQIECEAK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 GNPEPTFSWTKDGNPFYFTDHRIIPSNNSGTFRIPNEGHISHFQGKYRCFASNKLGIAMS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GNPEPTFSWTKDGNPFYFTDHRIIPSNNSGTFRIPNEGHISHFQGKYRCFASNKLGIAMS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 EEIEFIVPSVPKFPKEKIDPLEVEEGDPIVLPCNPPKGLPPLHIYWMNIELEHIEQDERV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 EEIEFIVPSVPKFPKEKIDPLEVEEGDPIVLPCNPPKGLPPLHIYWMNIELEHIEQDERV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 YMSQKGDLYFANVEEKDSRNDYCCFAAFPRLRTIVQKMPMKLTVNSSNSIKQRKPKLLLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 YMSQKGDLYFANVEEKDSRNDYCCFAAFPRLRTIVQKMPMKLTVNSSNSIKQRKPKLLLP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 PTESGSESSITILKGEILLLECFAEGLPTPQVDWNKIGGDLPKGREAKENYGKTLKIENV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::
CCDS58 PTESGSESSITILKGEILLLECFAEGLPTPQVDWNKIGGDLPKGRETKENYGKTLKIENV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 SYQDKGNYRCTASNFLGTATHDFHVIVEEPPRWTKKPQSAVYSTGSNGILLCEAEGEPQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SYQDKGNYRCTASNFLGTATHDFHVIVEEPPRWTKKPQSAVYSTGSNGILLCEAEGEPQP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 TIKWRVNGSPVDNHPFAGDVVFPREISFTNLQPNHTAVYQCEASNVHGTILANANIDVVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 TIKWRVNGSPVDNHPFAGDVVFPREISFTNLQPNHTAVYQCEASNVHGTILANANIDVVD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 VRPLIQTKDGENYATVVGYSAFLHCEFFASPEAVVSWQKVEEVKPLEGRRYHIYENGTLQ
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CCDS58 VRPLIQTKDGENYATVVGYSAFLHCEFFASPEAVVSWQKVEEVKPLEGRRYHIYENGTLQ
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 INRTTEEDAGSYSCWVENAIGKTAVTANLDIRNATKLRVSPKNPRIPKLHMLELHCESKC
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CCDS58 INRTTEEDAGSYSCWVENAIGKTAVTANLDIRNATKLRVSPKNPRIPKLHMLELHCESKC
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 DSHLKHSLKLSWSKDGEAFEINGTEDGRIIIDGANLTISNVTLEDQGIYCCSAHTALDSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 DSHLKHSLKLSWSKDGEAFEINGTEDGRIIIDGANLTISNVTLEDQGIYCCSAHTALDSA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 ADITQVTVLDVPDPPENLHLSERQNRSVRLTWEAGADHNSNISEYIVEFEGNKEEPGRWE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 ADITQVTVLDVPDPPENLHLSERQNRSVRLTWEAGADHNSNISEYIVEFEGNKEEPGRWE
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB4 ELTRVQGKKTTVILPLAPFVRYQFRVIAVNEVGRSQPSQPSDHHETPPAAPDRNPQNIRV
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CCDS58 ELTRVQGKKTTVILPLAPFVRYQFRVIAVNEVGRSQPSQPSDHHETPPAAPDRNPQNIRV
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB4 QASQPKEMIIKWEPLKSMEQNGPGLEYRVTWKPQGAPVEWEEETVTNHTLRVMTPAVYAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 QASQPKEMIIKWEPLKSMEQNGPGLEYRVTWKPQGAPVEWEEETVTNHTLRVMTPAVYAP
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB4 YDVKVQAINQLGSGPDPQSVTLYSGEDYPDTAPVIHGVDVINSTLVKVTWSTVPKDRVHG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 YDVKVQAINQLGSGPDPQSVTLYSGEDYPDTAPVIHGVDVINSTLVKVTWSTVPKDRVHG
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB4 RLKGYQINWWKTKSLLDGRTHPKEVNILRFSGQRNSGMVPSLDAFSEFHLTVLAYNSKGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RLKGYQINWWKTKSLLDGRTHPKEVNILRFSGQRNSGMVPSLDAFSEFHLTVLAYNSKGA
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB4 GPESEPYIFQTPEGVPEQPTFLKVIKVDKDTATLSWGLPKKLNGNLTGYLLQYQIINDTY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GPESEPYIFQTPEGVPEQPTFLKVIKVDKDTATLSWGLPKKLNGNLTGYLLQYQIINDTY
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB4 EIGELNDINITTPSKPSWHLSNLNATTKYKFYLRACTSQGCGKPITEESSTLGEGSKGIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 EIGELNDINITTPSKPSWHLSNLNATTKYKFYLRACTSQGCGKPITEESSTLGEGSKGIG
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB4 KISGVNLTQKTHPVEVFEPGAEHIVRLMTKNWGDNDSIFQDVIETRGREYAGLYDDISTQ
:::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 KISGVNLTQKTHPIEVFEPGAEHIVRLMTKNWGDNDSIFQDVIETRGREYAGLYDDISTQ
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KB4 GWFIGLMCAIALLTLLLLTVCFVKRNRGGKYSVKEKEDLHPDPEIQSVKDETFGEYSDSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GWFIGLMCAIALLTLLLLTVCFVKRNRGGKYSVKEKEDLHPDPEIQSVKDETFGEYSDSD
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KB4 EKPLKGSLRSLNRDMQPTESADSLVEYGEGDHGLFSEDGSFIGAYAGSKEKGSVESNGSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 EKPLKGSLRSLNRDMQPTESADSLVEYGEGDHGLFSEDGSFIGAYAGSKEKGSVESNGSS
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KB4 TATFPLRA
::::::::
CCDS58 TATFPLRA
>>CCDS2556.1 CHL1 gene_id:10752|Hs108|chr3 (1224 aa)
initn: 6604 init1: 6604 opt: 6604 Z-score: 4829.6 bits: 905.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8119; 98.4% identity (98.7% similar) in 1224 aa overlap (1-1208:1-1224)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MEPLLLGRGLIVYLMFLLLKFSKAIEIPSSVQQVPTIIKQSKVQVAFPFDEYFQIECEAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 MEPLLLGRGLIVYLMFLLLKFSKAIEIPSSVQQVPTIIKQSKVQVAFPFDEYFQIECEAK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 GNPEPTFSWTKDGNPFYFTDHRIIPSNNSGTFRIPNEGHISHFQGKYRCFASNKLGIAMS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 GNPEPTFSWTKDGNPFYFTDHRIIPSNNSGTFRIPNEGHISHFQGKYRCFASNKLGIAMS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 EEIEFIVPSVPKFPKEKIDPLEVEEGDPIVLPCNPPKGLPPLHIYWMNIELEHIEQDERV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 EEIEFIVPSVPKFPKEKIDPLEVEEGDPIVLPCNPPKGLPPLHIYWMNIELEHIEQDERV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220
pF1KB4 YMSQKGDLYFANVEEKDSRNDYCCFAAFPRLRTIVQKMPMKLTVNS--------------
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 YMSQKGDLYFANVEEKDSRNDYCCFAAFPRLRTIVQKMPMKLTVNSLKHANDSSSSTEIG
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KB4 --SNSIKQRKPKLLLPPTESGSESSITILKGEILLLECFAEGLPTPQVDWNKIGGDLPKG
.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 SKANSIKQRKPKLLLPPTESGSESSITILKGEILLLECFAEGLPTPQVDWNKIGGDLPKG
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KB4 REAKENYGKTLKIENVSYQDKGNYRCTASNFLGTATHDFHVIVEEPPRWTKKPQSAVYST
::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 RETKENYGKTLKIENVSYQDKGNYRCTASNFLGTATHDFHVIVEEPPRWTKKPQSAVYST
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KB4 GSNGILLCEAEGEPQPTIKWRVNGSPVDNHPFAGDVVFPREISFTNLQPNHTAVYQCEAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 GSNGILLCEAEGEPQPTIKWRVNGSPVDNHPFAGDVVFPREISFTNLQPNHTAVYQCEAS
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KB4 NVHGTILANANIDVVDVRPLIQTKDGENYATVVGYSAFLHCEFFASPEAVVSWQKVEEVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 NVHGTILANANIDVVDVRPLIQTKDGENYATVVGYSAFLHCEFFASPEAVVSWQKVEEVK
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510 520
pF1KB4 PLEGRRYHIYENGTLQINRTTEEDAGSYSCWVENAIGKTAVTANLDIRNATKLRVSPKNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 PLEGRRYHIYENGTLQINRTTEEDAGSYSCWVENAIGKTAVTANLDIRNATKLRVSPKNP
490 500 510 520 530 540
530 540 550 560 570 580
pF1KB4 RIPKLHMLELHCESKCDSHLKHSLKLSWSKDGEAFEINGTEDGRIIIDGANLTISNVTLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 RIPKLHMLELHCESKCDSHLKHSLKLSWSKDGEAFEINGTEDGRIIIDGANLTISNVTLE
550 560 570 580 590 600
590 600 610 620 630 640
pF1KB4 DQGIYCCSAHTALDSAADITQVTVLDVPDPPENLHLSERQNRSVRLTWEAGADHNSNISE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 DQGIYCCSAHTALDSAADITQVTVLDVPDPPENLHLSERQNRSVRLTWEAGADHNSNISE
610 620 630 640 650 660
650 660 670 680 690 700
pF1KB4 YIVEFEGNKEEPGRWEELTRVQGKKTTVILPLAPFVRYQFRVIAVNEVGRSQPSQPSDHH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 YIVEFEGNKEEPGRWEELTRVQGKKTTVILPLAPFVRYQFRVIAVNEVGRSQPSQPSDHH
670 680 690 700 710 720
710 720 730 740 750 760
pF1KB4 ETPPAAPDRNPQNIRVQASQPKEMIIKWEPLKSMEQNGPGLEYRVTWKPQGAPVEWEEET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 ETPPAAPDRNPQNIRVQASQPKEMIIKWEPLKSMEQNGPGLEYRVTWKPQGAPVEWEEET
730 740 750 760 770 780
770 780 790 800 810 820
pF1KB4 VTNHTLRVMTPAVYAPYDVKVQAINQLGSGPDPQSVTLYSGEDYPDTAPVIHGVDVINST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 VTNHTLRVMTPAVYAPYDVKVQAINQLGSGPDPQSVTLYSGEDYPDTAPVIHGVDVINST
790 800 810 820 830 840
830 840 850 860 870 880
pF1KB4 LVKVTWSTVPKDRVHGRLKGYQINWWKTKSLLDGRTHPKEVNILRFSGQRNSGMVPSLDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 LVKVTWSTVPKDRVHGRLKGYQINWWKTKSLLDGRTHPKEVNILRFSGQRNSGMVPSLDA
850 860 870 880 890 900
890 900 910 920 930 940
pF1KB4 FSEFHLTVLAYNSKGAGPESEPYIFQTPEGVPEQPTFLKVIKVDKDTATLSWGLPKKLNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 FSEFHLTVLAYNSKGAGPESEPYIFQTPEGVPEQPTFLKVIKVDKDTATLSWGLPKKLNG
910 920 930 940 950 960
950 960 970 980 990 1000
pF1KB4 NLTGYLLQYQIINDTYEIGELNDINITTPSKPSWHLSNLNATTKYKFYLRACTSQGCGKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 NLTGYLLQYQIINDTYEIGELNDINITTPSKPSWHLSNLNATTKYKFYLRACTSQGCGKP
970 980 990 1000 1010 1020
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KB4 ITEESSTLGEGSKGIGKISGVNLTQKTHPVEVFEPGAEHIVRLMTKNWGDNDSIFQDVIE
:::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 ITEESSTLGEGSKGIGKISGVNLTQKTHPIEVFEPGAEHIVRLMTKNWGDNDSIFQDVIE
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CCDS25 TRGREYAGLYDDISTQGWFIGLMCAIALLTLLLLTVCFVKRNRGGKYSVKEKEDLHPDPE
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CCDS25 YAGSKEKGSVESNGSSTATFPLRA
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CCDS74 YAGSKEKGSVESNGSSTATFPLRA
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:.::.: ..: : .. :.:. :.:::.:::.::: . : . .: .: : . .:..::
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.:.::: . ::.:: ::.. . : . ..:.::. : : :::: : :: .:::
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: :::: : .:.: : : . : ..... ::: ...::.. .:.. : .
CCDS48 YANGTLGIRDLQANDTGRYFCLAANDQNNVTIMANLKVKDATQITQGPRSTIEKKGSRVT
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CCDS48 FTCQASFDPSLQPSI--TWRGDGRDLQELGDSDKYFIEDG-RLVIHSLDYSDQGNYSCVA
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: :: . . .:. :. : : : ::. . . .::..: . :::. : .: .:::
CCDS48 STELDVVESRAQLLVVGSPGPVPRLVLSDLHLLTQSQVRVSWSPAEDHNAPIEKYDIEFE
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pF1KB4 GNKEEPGRWEELTRVQGKKTTVILPLAPFVRYQFRVIAVNEVGRSQPSQPSDHHETPPAA
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CCDS48 DKEMAPEKWYSLGKVPGNQTSTTLKLSPYVHYTFRVTAINKYGPGEPSPVSETVVTPEAA
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:..:: ... .... .:.: :.::. :. :.: ..::: :.:::. :.:. :.. :
CCDS48 PEKNPVDVKGEGNETTNMVITWKPLRWMDWNAPQVQYRVQWRPQGTRGPWQEQIVSDPFL
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CCDS48 VVSNTSTFVPYEIKVQAVNSQGKGPEPQVTIGYSGEDYPQAIPELEGIEILNSSAVLVKW
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: .:.:.:.::....:. : .. : .. ... .. .: .. .: .: .:
CCDS48 RPVDLAQVKGHLRGYNVTYWREGSQRKHSKRHIHKDHVV-VPANTTSVILSGLRPYSSYH
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: : :.:..:.:: :: . :.:::::: .: :.. .. . : : : . :: ::::
CCDS48 LEVQAFNGRGSGPASE-FTFSTPEGVPGHPEALHLECQSNTSLLLRWQPPLSHNGVLTGY
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pF1KB4 LLQYQIINDTYEIGELNDINITTPSKPSWHLSNLNATTKYKFYLRACTSQGCGKPITEES
.:.:. ... . :.:. .:. : . .:..:. .:.: :.: :..: :. :..:.
CCDS48 VLSYHPLDEGGK-GQLS-FNLRDPELRTHNLTDLSPHLRYRFQLQATTKEGPGEAIVREG
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.:.. : . .:.:: : : . . : : .:. :: . ..
CCDS48 GTMALSGISDFGNISATAGENYSVVSWVPKEGQCNFRFHILFKALGEEKGGASLSPQYVS
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pF1KB4 KN------WG---DND---SIFQD-------VIETRGREYAGLYD-DISTQGWFIGLMCA
: : :.: .:.. ...: : . : ..:.:::::.. :
CCDS48 YNQSSYTQWDLQPDTDYEIHLFKERMFRHQMAVKTNGTGRVRLPPAGFATEGWFIGFVSA
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pF1KB4 IALLTLLLLTVCFVKRNRGGKYSVKEKEDLHPDPEIQSVKDETFGEYSDSDEKPLKGSLR
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CCDS48 IILLLLVLLILCFIKRSKGGKYSVKDKEDTQVDSEARPMKDETFGEYSDNEEKAFGSSQP
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CCDS48 SLNGDIKPLGSDDSLADYGGSVDVQFNEDGSFIGQYSGKKEKEAAGGNDSSGATSPINPA
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CCDS48 VALE
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pF1KB4 MEPLLLGRGLIVYLMFLLLKFSKAIEIPSSVQQVPTIIKQS-KVQVAFPFDEYFQIECE
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CCDS14 MVVALRYVWPLLLCSPCLLIQIPEEYE-GHHVMEPPVITEQSPRRLVVFPTDD-ISLKCE
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CCDS14 ASGKPEVQFRWTRDGVHFKPKEELGVTVYQSPHSGSFTITGNNSNFAQRFQGIYRCFASN
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pF1KB4 KLGIAMSEEIEFIVPSVPKFPKEKIDPLEVEEGDPIVLPCNPPKGLPPLHIYWMNIELEH
::: :::.::.... ..::.::: . :.:::::. .::::::: . ::.::::: .. :
CCDS14 KLGTAMSHEIRLMAEGAPKWPKETVKPVEVEEGESVVLPCNPPPSAEPLRIYWMNSKILH
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pF1KB4 IEQDERVYMSQKGDLYFANVEEKDSRNDYCCFAAFPRLRTIVQKMPMKLTVNSSNSIKQR
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CCDS14 IKQDERVTMGQNGNLYFANVLTSDNHSDYICHAHFPGTRTIIQKEPIDLRVKATNSMIDR
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pF1KB4 KPKLLLPPTESGSESSITILKGEILLLECFAEGLPTPQVDWNKIGGDLPKGREAKENYGK
::.::.: ..: : .. :.:. :.:::.:::.::: . : . .: .: : . .:..:
CCDS14 KPRLLFP---TNSSSHLVALQGQPLVLECIAEGFPTPTIKWLRPSGPMPADRVTYQNHNK
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pF1KB4 TLKIENVSYQDKGNYRCTASNFLGTATHDFHVIVEEPPRWTKKPQSAVYSTGSNGILLCE
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CCDS14 TLQLLKVGEEDDGEYRCLAENSLGSARHAYYVTVEAAPYWLHKPQSHLYGPGETARLDCQ
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pF1KB4 AEGEPQPTIKWRVNGSPVDNHPFAGDVVFPR-EISFTNLQPNHTAVYQCEASNVHGTILA
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CCDS14 VQGRPQPEVTWRINGIPVEELAKDQKYRIQRGALILSNVQPSDTMVTQCEARNRHGLLLA
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pF1KB4 NANIDVVDVRPLIQTKDGENYATVVGYSAFLHCEFFASPEAVVSWQKVEEVKPLEGRRYH
:: : ::.. : : :...: .: : .:.: :. :..: :.: . . :. .:.
CCDS14 NAYIYVVQLPAKILTADNQTYMAVQGSTAYLLCKAFGAPVPSVQWLDEDGTTVLQDERFF
420 430 440 450 460 470
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pF1KB4 IYENGTLQINRTTEEDAGSYSCWVENAIGKTAVTANLDIRNATKLRVSPKNPRIPKLHML
: :::: : .:.: : : . : ..... ::: ...::.. .:.. : .
CCDS14 PYANGTLGIRDLQANDTGRYFCLAANDQNNVTIMANLKVKDATQITQGPRSTIEKKGSRV
480 490 500 510 520 530
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