FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB4251, 973 aa 1>>>pF1KB4251 973 - 973 aa - 973 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.0398+/-0.000406; mu= 8.6971+/- 0.025 mean_var=133.0206+/-27.056, 0's: 0 Z-trim(115.7): 68 B-trim: 22 in 1/52 Lambda= 0.111203 statistics sampled from 26305 (26373) to 26305 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.651), E-opt: 0.2 (0.309), width: 16 Scan time: 12.820 The best scores are: opt bits E(85289) NP_060538 (OMIM: 610312) piwi-like protein 2 isofo ( 973) 6629 1075.6 0 NP_001129193 (OMIM: 610312) piwi-like protein 2 is ( 973) 6629 1075.6 0 NP_001317409 (OMIM: 610312) piwi-like protein 2 is ( 937) 5996 974.0 0 XP_005273608 (OMIM: 610312) PREDICTED: piwi-like p ( 804) 5407 879.5 0 NP_004755 (OMIM: 605571) piwi-like protein 1 isofo ( 861) 2324 384.9 9.5e-106 XP_011537306 (OMIM: 605571) PREDICTED: piwi-like p ( 861) 2324 384.9 9.5e-106 XP_011537304 (OMIM: 605571) PREDICTED: piwi-like p ( 861) 2324 384.9 9.5e-106 XP_011537305 (OMIM: 605571) PREDICTED: piwi-like p ( 861) 2324 384.9 9.5e-106 NP_001177900 (OMIM: 605571) piwi-like protein 1 is ( 829) 2153 357.5 1.7e-97 XP_016875718 (OMIM: 605571) PREDICTED: piwi-like p ( 832) 2153 357.5 1.7e-97 NP_689644 (OMIM: 610315) piwi-like protein 4 [Homo ( 852) 1952 325.3 8.7e-88 XP_011537307 (OMIM: 605571) PREDICTED: piwi-like p ( 819) 1851 309.0 6.3e-83 NP_001242904 (OMIM: 610314) piwi-like protein 3 is ( 873) 1823 304.6 1.5e-81 NP_001008496 (OMIM: 610314) piwi-like protein 3 is ( 882) 1791 299.4 5.3e-80 XP_011537308 (OMIM: 605571) PREDICTED: piwi-like p ( 481) 1521 256.0 3.4e-67 XP_005270633 (OMIM: 607355) PREDICTED: protein arg ( 585) 421 79.6 5.4e-14 XP_016856017 (OMIM: 607355) PREDICTED: protein arg ( 585) 421 79.6 5.4e-14 XP_016856014 (OMIM: 607355) PREDICTED: protein arg ( 626) 421 79.6 5.7e-14 XP_016856013 (OMIM: 607355) PREDICTED: protein arg ( 626) 421 79.6 5.7e-14 XP_011539184 (OMIM: 607355) PREDICTED: protein arg ( 626) 421 79.6 5.7e-14 NP_803171 (OMIM: 607355) protein argonaute-3 isofo ( 626) 421 79.6 5.7e-14 XP_016856016 (OMIM: 607355) PREDICTED: protein arg ( 626) 421 79.6 5.7e-14 XP_016856015 (OMIM: 607355) PREDICTED: protein arg ( 626) 421 79.6 5.7e-14 XP_011539181 (OMIM: 607355) PREDICTED: protein arg ( 845) 421 79.6 7.5e-14 XP_005270632 (OMIM: 607355) PREDICTED: protein arg ( 860) 421 79.6 7.6e-14 XP_016856012 (OMIM: 607355) PREDICTED: protein arg ( 860) 421 79.6 7.6e-14 NP_079128 (OMIM: 607355) protein argonaute-3 isofo ( 860) 421 79.6 7.6e-14 XP_016856508 (OMIM: 606228) PREDICTED: protein arg ( 706) 419 79.3 8e-14 NP_001304052 (OMIM: 606228) protein argonaute-1 is ( 782) 419 79.3 8.7e-14 NP_036331 (OMIM: 606228) protein argonaute-1 isofo ( 857) 419 79.3 9.5e-14 XP_011539538 (OMIM: 606228) PREDICTED: protein arg ( 860) 419 79.3 9.5e-14 NP_001304051 (OMIM: 606228) protein argonaute-1 is ( 891) 419 79.3 9.8e-14 XP_016868806 (OMIM: 606229) PREDICTED: protein arg ( 782) 412 78.2 1.9e-13 XP_011515268 (OMIM: 606229) PREDICTED: protein arg ( 813) 412 78.2 2e-13 NP_036286 (OMIM: 606229) protein argonaute-2 isofo ( 859) 412 78.2 2.1e-13 XP_011515267 (OMIM: 606229) PREDICTED: protein arg ( 873) 412 78.2 2.1e-13 XP_011515270 (OMIM: 606229) PREDICTED: protein arg ( 918) 412 78.2 2.2e-13 XP_016856507 (OMIM: 606228) PREDICTED: protein arg ( 725) 383 73.5 4.5e-12 XP_016856505 (OMIM: 606228) PREDICTED: protein arg ( 876) 383 73.5 5.3e-12 XP_016856506 (OMIM: 606228) PREDICTED: protein arg ( 873) 374 72.1 1.4e-11 XP_011539186 (OMIM: 607356) PREDICTED: protein arg ( 660) 356 69.2 8.3e-11 XP_011539185 (OMIM: 607356) PREDICTED: protein arg ( 711) 356 69.2 8.9e-11 XP_005270635 (OMIM: 607356) PREDICTED: protein arg ( 794) 356 69.2 9.8e-11 XP_005270636 (OMIM: 607356) PREDICTED: protein arg ( 794) 356 69.2 9.8e-11 NP_060099 (OMIM: 607356) protein argonaute-4 [Homo ( 861) 356 69.2 1.1e-10 >>NP_060538 (OMIM: 610312) piwi-like protein 2 isoform 1 (973 aa) initn: 6629 init1: 6629 opt: 6629 Z-score: 5751.3 bits: 1075.6 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 6629; 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NP_004 IDYNPLMEARRLRSALLFQHEDLIGKCHAFDGTILFLPKRLQQKVTEVFSKTR-NGEDVR 140 150 160 170 180 190 310 320 330 340 350 360 pF1KB4 IKIQMTKILEPCSDLCIPFYNVVFRRVMKLLDMKLVGRNFYDPTSAMVLQQHRLQIWPGY : : .:. : : : :. :::..:::..:..... .:::.:.:.. . . .::: ::::. NP_004 ITITLTNELPPTSPTCLQFYNIIFRRLLKIMNLQQIGRNYYNPNDPIDIPSHRLVIWPGF 200 210 220 230 240 250 370 380 390 400 410 420 pF1KB4 AASIRRTDGGLFLLADVSHKVIRNDCVLDVMHAIYQQNKEH-FQDECTKLLVGNIVITRY ..:: . .....: .::::::.:.. ::: : .:.:..:: ::.. .: :.: .:.:.: NP_004 TTSILQYENSIMLCTDVSHKVLRSETVLDFMFNFYHQTEEHKFQEQVSKELIGLVVLTKY 260 270 280 290 300 310 430 440 450 460 470 480 pF1KB4 NNRTYRIDDVDWNKTPKDSFTMSDGKEITFLEYYSKNYGITVKEEDQPLLIHRPSERQDN ::.:::.::.::...::..: .::.:..::::: :.:. . . ::.:. .:..:. . 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