Result of FASTA (ccds) for pF1KB4264
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB4264, 711 aa
  1>>>pF1KB4264 711 - 711 aa - 711 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9889+/-0.000978; mu= 16.0155+/- 0.058
 mean_var=72.3620+/-14.794, 0's: 0 Z-trim(104.5): 35  B-trim: 40 in 1/47
 Lambda= 0.150771
 statistics sampled from 7875 (7910) to 7875 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.603), E-opt: 0.2 (0.243), width:  16
 Scan time:  3.580

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS14548.1 ACSL4 gene_id:2182|Hs108|chrX          ( 711) 4747 1042.3       0
CCDS14549.1 ACSL4 gene_id:2182|Hs108|chrX          ( 670) 4492 986.9       0
CCDS2455.1 ACSL3 gene_id:2181|Hs108|chr2           ( 720) 3246 715.8 5.4e-206
CCDS7573.1 ACSL5 gene_id:51703|Hs108|chr10         ( 683)  723 167.0 8.2e-41
CCDS7572.1 ACSL5 gene_id:51703|Hs108|chr10         ( 739)  723 167.1 8.8e-41
CCDS56382.1 ACSL6 gene_id:23305|Hs108|chr5         ( 622)  710 164.2 5.4e-40
CCDS56381.1 ACSL6 gene_id:23305|Hs108|chr5         ( 697)  706 163.3 1.1e-39
CCDS56383.1 ACSL6 gene_id:23305|Hs108|chr5         ( 708)  706 163.3 1.1e-39
CCDS34228.1 ACSL6 gene_id:23305|Hs108|chr5         ( 722)  706 163.4 1.1e-39
CCDS34229.1 ACSL6 gene_id:23305|Hs108|chr5         ( 722)  706 163.4 1.1e-39
CCDS75213.1 ACSL1 gene_id:2180|Hs108|chr4          ( 527)  700 162.0 2.1e-39
CCDS68825.1 ACSL1 gene_id:2180|Hs108|chr4          ( 664)  700 162.0 2.6e-39
CCDS68826.1 ACSL1 gene_id:2180|Hs108|chr4          ( 698)  700 162.0 2.7e-39
CCDS3839.1 ACSL1 gene_id:2180|Hs108|chr4           ( 698)  700 162.0 2.7e-39
CCDS82282.1 ACSBG2 gene_id:81616|Hs108|chr19       ( 616)  416 100.3 9.5e-21
CCDS12159.1 ACSBG2 gene_id:81616|Hs108|chr19       ( 666)  416 100.3   1e-20
CCDS10298.1 ACSBG1 gene_id:23205|Hs108|chr15       ( 724)  387 94.0 8.7e-19
CCDS74269.1 ACSBG2 gene_id:81616|Hs108|chr19       ( 479)  371 90.4 6.7e-18


>>CCDS14548.1 ACSL4 gene_id:2182|Hs108|chrX               (711 aa)
 initn: 4747 init1: 4747 opt: 4747  Z-score: 5576.4  bits: 1042.3 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 4747; 100.0% identity (100.0% similar) in 711 aa overlap (1-711:1-711)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB4 MKLKLNVLTIILLPVHLLITIYSALIFIPWYFLTNAKKKNAMAKRIKAKPTSDKPGSPYR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MKLKLNVLTIILLPVHLLITIYSALIFIPWYFLTNAKKKNAMAKRIKAKPTSDKPGSPYR
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB4 SVTHFDSLAVIDIPGADTLDKLFDHAVSKFGKKDSLGTREILSEENEMQPNGKVFKKLIL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SVTHFDSLAVIDIPGADTLDKLFDHAVSKFGKKDSLGTREILSEENEMQPNGKVFKKLIL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB4 GNYKWMNYLEVNRRVNNFGSGLTALGLKPKNTIAIFCETRAEWMIAAQTCFKYNFPLVTL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GNYKWMNYLEVNRRVNNFGSGLTALGLKPKNTIAIFCETRAEWMIAAQTCFKYNFPLVTL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB4 YATLGKEAVVHGLNESEASYLITSVELLESKLKTALLDISCVKHIIYVDNKAINKAEYPE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 YATLGKEAVVHGLNESEASYLITSVELLESKLKTALLDISCVKHIIYVDNKAINKAEYPE
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB4 GFEIHSMQSVEELGSNPENLGIPPSRPTPSDMAIVMYTSGSTGRPKGVMMHHSNLIAGMT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GFEIHSMQSVEELGSNPENLGIPPSRPTPSDMAIVMYTSGSTGRPKGVMMHHSNLIAGMT
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB4 GQCERIPGLGPKDTYIGYLPLAHVLELTAEISCFTYGCRIGYSSPLTLSDQSSKIKKGSK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GQCERIPGLGPKDTYIGYLPLAHVLELTAEISCFTYGCRIGYSSPLTLSDQSSKIKKGSK
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB4 GDCTVLKPTLMAAVPEIMDRIYKNVMSKVQEMNYIQKTLFKIGYDYKLEQIKKGYDAPLC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GDCTVLKPTLMAAVPEIMDRIYKNVMSKVQEMNYIQKTLFKIGYDYKLEQIKKGYDAPLC
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB4 NLLLFKKVKALLGGNVRMMLSGGAPLSPQTHRFMNVCFCCPIGQGYGLTESCGAGTVTEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 NLLLFKKVKALLGGNVRMMLSGGAPLSPQTHRFMNVCFCCPIGQGYGLTESCGAGTVTEV
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB4 TDYTTGRVGAPLICCEIKLKDWQEGGYTINDKPNPRGEIVIGGQNISMGYFKNEEKTAED
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TDYTTGRVGAPLICCEIKLKDWQEGGYTINDKPNPRGEIVIGGQNISMGYFKNEEKTAED
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB4 YSVDENGQRWFCTGDIGEFHPDGCLQIIDRKKDLVKLQAGEYVSLGKVEAALKNCPLIDN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 YSVDENGQRWFCTGDIGEFHPDGCLQIIDRKKDLVKLQAGEYVSLGKVEAALKNCPLIDN
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB4 ICAFAKSDQSYVISFVVPNQKRLTLLAQQKGVEGTWVDICNNPAMEAEILKEIREAANAM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 ICAFAKSDQSYVISFVVPNQKRLTLLAQQKGVEGTWVDICNNPAMEAEILKEIREAANAM
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710 
pF1KB4 KLERFEIPIKVRLSPEPWTPETGLVTDAFKLKRKELRNHYLKDIERMYGGK
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 KLERFEIPIKVRLSPEPWTPETGLVTDAFKLKRKELRNHYLKDIERMYGGK
              670       680       690       700       710 

>>CCDS14549.1 ACSL4 gene_id:2182|Hs108|chrX               (670 aa)
 initn: 4492 init1: 4492 opt: 4492  Z-score: 5277.0  bits: 986.9 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 4492; 100.0% identity (100.0% similar) in 670 aa overlap (42-711:1-670)

              20        30        40        50        60        70 
pF1KB4 LLPVHLLITIYSALIFIPWYFLTNAKKKNAMAKRIKAKPTSDKPGSPYRSVTHFDSLAVI
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14                               MAKRIKAKPTSDKPGSPYRSVTHFDSLAVI
                                             10        20        30

              80        90       100       110       120       130 
pF1KB4 DIPGADTLDKLFDHAVSKFGKKDSLGTREILSEENEMQPNGKVFKKLILGNYKWMNYLEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 DIPGADTLDKLFDHAVSKFGKKDSLGTREILSEENEMQPNGKVFKKLILGNYKWMNYLEV
               40        50        60        70        80        90

             140       150       160       170       180       190 
pF1KB4 NRRVNNFGSGLTALGLKPKNTIAIFCETRAEWMIAAQTCFKYNFPLVTLYATLGKEAVVH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 NRRVNNFGSGLTALGLKPKNTIAIFCETRAEWMIAAQTCFKYNFPLVTLYATLGKEAVVH
              100       110       120       130       140       150

             200       210       220       230       240       250 
pF1KB4 GLNESEASYLITSVELLESKLKTALLDISCVKHIIYVDNKAINKAEYPEGFEIHSMQSVE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GLNESEASYLITSVELLESKLKTALLDISCVKHIIYVDNKAINKAEYPEGFEIHSMQSVE
              160       170       180       190       200       210

             260       270       280       290       300       310 
pF1KB4 ELGSNPENLGIPPSRPTPSDMAIVMYTSGSTGRPKGVMMHHSNLIAGMTGQCERIPGLGP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 ELGSNPENLGIPPSRPTPSDMAIVMYTSGSTGRPKGVMMHHSNLIAGMTGQCERIPGLGP
              220       230       240       250       260       270

             320       330       340       350       360       370 
pF1KB4 KDTYIGYLPLAHVLELTAEISCFTYGCRIGYSSPLTLSDQSSKIKKGSKGDCTVLKPTLM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 KDTYIGYLPLAHVLELTAEISCFTYGCRIGYSSPLTLSDQSSKIKKGSKGDCTVLKPTLM
              280       290       300       310       320       330

             380       390       400       410       420       430 
pF1KB4 AAVPEIMDRIYKNVMSKVQEMNYIQKTLFKIGYDYKLEQIKKGYDAPLCNLLLFKKVKAL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 AAVPEIMDRIYKNVMSKVQEMNYIQKTLFKIGYDYKLEQIKKGYDAPLCNLLLFKKVKAL
              340       350       360       370       380       390

             440       450       460       470       480       490 
pF1KB4 LGGNVRMMLSGGAPLSPQTHRFMNVCFCCPIGQGYGLTESCGAGTVTEVTDYTTGRVGAP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LGGNVRMMLSGGAPLSPQTHRFMNVCFCCPIGQGYGLTESCGAGTVTEVTDYTTGRVGAP
              400       410       420       430       440       450

             500       510       520       530       540       550 
pF1KB4 LICCEIKLKDWQEGGYTINDKPNPRGEIVIGGQNISMGYFKNEEKTAEDYSVDENGQRWF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LICCEIKLKDWQEGGYTINDKPNPRGEIVIGGQNISMGYFKNEEKTAEDYSVDENGQRWF
              460       470       480       490       500       510

             560       570       580       590       600       610 
pF1KB4 CTGDIGEFHPDGCLQIIDRKKDLVKLQAGEYVSLGKVEAALKNCPLIDNICAFAKSDQSY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 CTGDIGEFHPDGCLQIIDRKKDLVKLQAGEYVSLGKVEAALKNCPLIDNICAFAKSDQSY
              520       530       540       550       560       570

             620       630       640       650       660       670 
pF1KB4 VISFVVPNQKRLTLLAQQKGVEGTWVDICNNPAMEAEILKEIREAANAMKLERFEIPIKV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VISFVVPNQKRLTLLAQQKGVEGTWVDICNNPAMEAEILKEIREAANAMKLERFEIPIKV
              580       590       600       610       620       630

             680       690       700       710 
pF1KB4 RLSPEPWTPETGLVTDAFKLKRKELRNHYLKDIERMYGGK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 RLSPEPWTPETGLVTDAFKLKRKELRNHYLKDIERMYGGK
              640       650       660       670

>>CCDS2455.1 ACSL3 gene_id:2181|Hs108|chr2                (720 aa)
 initn: 3246 init1: 3144 opt: 3246  Z-score: 3811.7  bits: 715.8 E(32554): 5.4e-206
Smith-Waterman score: 3246; 65.5% identity (87.1% similar) in 711 aa overlap (1-711:12-720)

                          10        20        30        40         
pF1KB4            MKLKLNVLTIILLPVHLLITIYSALIFIPWYFLTNAKKKNAMAKRIKAK
                  :::: ..  :.:  .:.::..:. : .::.::.........  .:::::
CCDS24 MNNHVSSKPSTMKLKHTINPILLYFIHFLISLYTILTYIPFYFFSESRQEKS--NRIKAK
               10        20        30        40        50          

      50        60        70        80        90       100         
pF1KB4 PTSDKPGSPYRSVTHFDSLAVIDIPGADTLDKLFDHAVSKFGKKDSLGTREILSEENEMQ
       :...:: : ::::. .:.:: .  :: :::::.: .: .:: .:  :::::.:.::.:.:
CCDS24 PVNSKPDSAYRSVNSLDGLASVLYPGCDTLDKVFTYAKNKFKNKRLLGTREVLNEEDEVQ
       60        70        80        90       100       110        

     110       120       130       140       150       160         
pF1KB4 PNGKVFKKLILGNYKWMNYLEVNRRVNNFGSGLTALGLKPKNTIAIFCETRAEWMIAAQT
       ::::.:::.:::.:.:..: .:  :. :::.::  :: :::..::::::::::::::::.
CCDS24 PNGKIFKKVILGQYNWLSYEDVFVRAFNFGNGLQMLGQKPKTNIAIFCETRAEWMIAAQA
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       :: ::: :::::::::  :.::.:::.:.. .::: :::..:::  .  .  ..::: ::
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       .:  . .:.:.:. .:.: .:: ::..    . : :.: :::.:..:::::::: :::::
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pF1KB4 MHHSNLIAGMTGQCERIPGLGPKDTYIGYLPLAHVLELTAEISCFTYGCRIGYSSPLTLS
       . :::.:::.::. :::: :: .:.:::::::::::::.::. :...::::::::: ::.
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       :.::: ::  :.  :::::::.::::::::.:::::.:::::::::::::::::::::::
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       ::::: ::.:::::.:.: .::::.:::::::.:: ::..::..::: ..::.  :: :.
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     710 
pF1KB4 GK
        :
CCDS24 RK
      720

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CCDS75 DAKTMYEVFQRGLAVSDNGPCLGYRKPNQPYRWLSYKQVSDRAEYLGSCLLHKGYKSSPD
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pF1KB4 NTIAIFCETRAEWMIAAQTCFKYNFPLVTLYATLGKEAVVHGLNESEASYLITSVE----
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pF1KB4 LLESKLKTALLDISCVKHIIYVD--NKAINKAEYPEGFEIHSMQSVEELGSNPENLGIPP
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pF1KB4 RMMLSGGAPLSPQTHRFMNVCFCCPIGQGYGLTESCGAGTVTEVTDYTTGRVGAPLICCE
       :....:.::.: ..  :. . . : . ..:: ::  :. : :   :.:.:.::.:: :  
CCDS75 RVIVTGAAPMSTSVMTFFRAAMGCQVYEAYGQTECTGGCTFTLPGDWTSGHVGVPLACNY
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CCDS75 VKLEDVADMNYFTVNNE----GEVCIKGTNVFKGYLKDPEKTQE--ALDSDG--WLHTGD
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pF1KB4 IGEFHPDGCLQIIDRKKDLVKLQAGEYVSLGKVEAALKNCPLIDNICAFAKSDQSYVISF
       ::.. :.: :.::::::.. ::  :::..  :.:   .    . .: . ..: .: ... 
CCDS75 IGRWLPNGTLKIIDRKKNIFKLAQGEYIAPEKIENIYNRSQPVLQIFVHGESLRSSLVGV
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pF1KB4 VVPNQKRLTLLAQQKGVEGTWVDICNNPAMEAEILKEIREAANAMKLERFEIPIKVRLSP
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CCDS75 VVPDTDVLPSFAAKLGVKGSFEELCQNQVVREAILEDLQKIGKESGLKTFEQVKAIFLHP
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pF1KB4 EPWTPETGLVTDAFKLKRKELRNHYLKDIERMYGGK  
       ::.. :.::.: ..: :: :: ...  .:. .:     
CCDS75 EPFSIENGLLTPTLKAKRGELSKYFRTQIDSLYEHIQD
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>>CCDS56382.1 ACSL6 gene_id:23305|Hs108|chr5              (622 aa)
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>>CCDS56381.1 ACSL6 gene_id:23305|Hs108|chr5              (697 aa)
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>>CCDS56383.1 ACSL6 gene_id:23305|Hs108|chr5              (708 aa)
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CCDS56 DARTMYQVFRRGLSISGNGPCLGFRKPKQPYQWLSYQEVADRAEFLGSGLLQHNCKACTD
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CCDS56 NRMYDKIFS--QANTPLKRWLLEFAAKRKQAEVRSGIIRNDSIWDELFFNKIQASLGGCV
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CCDS56 HIKLVDVEELNYWAC---KGEGEICVRGPNVFKGYLKDPDRTKE--ALDSDG--WLHTGD
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711 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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