FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB4303, 635 aa 1>>>pF1KB4303 635 - 635 aa - 635 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.7035+/-0.000961; mu= 4.4163+/- 0.056 mean_var=278.5145+/-62.443, 0's: 0 Z-trim(113.6): 538 B-trim: 390 in 1/51 Lambda= 0.076851 statistics sampled from 13615 (14256) to 13615 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.766), E-opt: 0.2 (0.438), width: 16 Scan time: 4.270 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS46117.1 DMPK gene_id:1760|Hs108|chr19 ( 625) 3951 452.0 1.1e-126 CCDS46119.1 DMPK gene_id:1760|Hs108|chr19 ( 639) 3754 430.1 4.3e-120 CCDS46118.1 DMPK gene_id:1760|Hs108|chr19 ( 624) 3308 380.7 3.3e-105 CCDS12674.1 DMPK gene_id:1760|Hs108|chr19 ( 629) 3288 378.5 1.5e-104 CCDS74400.1 DMPK gene_id:1760|Hs108|chr19 ( 530) 3189 367.4 2.7e-101 CCDS1559.1 CDC42BPA gene_id:8476|Hs108|chr1 (1638) 1580 189.6 2.9e-47 CCDS1558.1 CDC42BPA gene_id:8476|Hs108|chr1 (1719) 1580 189.6 3e-47 CCDS31601.1 CDC42BPG gene_id:55561|Hs108|chr11 (1551) 1552 186.4 2.4e-46 CCDS9978.1 CDC42BPB gene_id:9578|Hs108|chr14 (1711) 1540 185.1 6.5e-46 CCDS11870.2 ROCK1 gene_id:6093|Hs108|chr18 (1354) 1206 148.0 7.8e-35 CCDS42654.1 ROCK2 gene_id:9475|Hs108|chr2 (1388) 1191 146.4 2.5e-34 CCDS9192.1 CIT gene_id:11113|Hs108|chr12 (2027) 1080 134.2 1.6e-30 CCDS55891.1 CIT gene_id:11113|Hs108|chr12 (2069) 1080 134.2 1.7e-30 CCDS46014.1 MAST3 gene_id:23031|Hs108|chr19 (1309) 709 92.9 3e-18 CCDS41326.1 MAST2 gene_id:23139|Hs108|chr1 (1798) 703 92.4 5.8e-18 CCDS75254.1 MAST4 gene_id:375449|Hs108|chr5 (2429) 693 91.4 1.5e-17 CCDS47225.1 MAST4 gene_id:375449|Hs108|chr5 (2434) 693 91.4 1.5e-17 CCDS1824.1 PRKCE gene_id:5581|Hs108|chr2 ( 737) 682 89.6 1.6e-17 CCDS54861.1 MAST4 gene_id:375449|Hs108|chr5 (2623) 693 91.4 1.6e-17 CCDS32921.1 MAST1 gene_id:22983|Hs108|chr19 (1570) 680 89.8 3.1e-17 CCDS73313.1 RPS6KA4 gene_id:8986|Hs108|chr11 ( 765) 660 87.2 8.9e-17 CCDS8073.1 RPS6KA4 gene_id:8986|Hs108|chr11 ( 772) 660 87.2 9e-17 CCDS45149.1 RPS6KA5 gene_id:9252|Hs108|chr14 ( 549) 657 86.7 9e-17 CCDS3212.2 PRKCI gene_id:5584|Hs108|chr3 ( 596) 657 86.7 9.5e-17 CCDS9893.1 RPS6KA5 gene_id:9252|Hs108|chr14 ( 802) 657 86.9 1.2e-16 CCDS41229.1 PRKCZ gene_id:5590|Hs108|chr1 ( 409) 640 84.7 2.7e-16 CCDS55563.1 PRKCZ gene_id:5590|Hs108|chr1 ( 488) 640 84.8 3.1e-16 CCDS37.1 PRKCZ gene_id:5590|Hs108|chr1 ( 592) 640 84.9 3.5e-16 CCDS4822.1 STK38 gene_id:11329|Hs108|chr6 ( 465) 614 81.9 2.2e-15 CCDS31761.1 STK38L gene_id:23012|Hs108|chr12 ( 464) 612 81.6 2.6e-15 CCDS9752.1 PRKCH gene_id:5583|Hs108|chr14 ( 683) 583 78.6 3.1e-14 CCDS11664.1 PRKCA gene_id:5578|Hs108|chr17 ( 672) 577 77.9 4.8e-14 CCDS10618.1 PRKCB gene_id:5579|Hs108|chr16 ( 671) 576 77.8 5.2e-14 CCDS81839.1 RPS6KA5 gene_id:9252|Hs108|chr14 ( 723) 572 77.4 7.4e-14 CCDS83480.1 RPS6KA6 gene_id:27330|Hs108|chrX ( 745) 565 76.6 1.3e-13 CCDS14451.1 RPS6KA6 gene_id:27330|Hs108|chrX ( 745) 565 76.6 1.3e-13 CCDS9994.1 AKT1 gene_id:207|Hs108|chr14 ( 480) 558 75.7 1.7e-13 CCDS7666.1 STK32C gene_id:282974|Hs108|chr10 ( 486) 556 75.4 2e-13 CCDS5170.1 SGK1 gene_id:6446|Hs108|chr6 ( 431) 551 74.8 2.6e-13 CCDS47478.1 SGK1 gene_id:6446|Hs108|chr6 ( 445) 551 74.8 2.7e-13 CCDS47477.1 SGK1 gene_id:6446|Hs108|chr6 ( 459) 551 74.9 2.8e-13 CCDS47476.1 SGK1 gene_id:6446|Hs108|chr6 ( 526) 551 74.9 3e-13 CCDS10619.1 PRKCB gene_id:5579|Hs108|chr16 ( 673) 551 75.0 3.6e-13 CCDS6195.1 SGK3 gene_id:23678|Hs108|chr8 ( 496) 545 74.2 4.6e-13 CCDS3380.1 STK32B gene_id:55351|Hs108|chr4 ( 414) 540 73.6 6e-13 CCDS58411.1 PDPK1 gene_id:5170|Hs108|chr16 ( 454) 540 73.6 6.4e-13 CCDS12867.1 PRKCG gene_id:5582|Hs108|chr19 ( 697) 543 74.2 6.7e-13 CCDS10472.1 PDPK1 gene_id:5170|Hs108|chr16 ( 556) 540 73.7 7.3e-13 CCDS14197.1 RPS6KA3 gene_id:6197|Hs108|chrX ( 740) 542 74.1 7.6e-13 CCDS30649.1 RPS6KA1 gene_id:6195|Hs108|chr1 ( 744) 542 74.1 7.6e-13 >>CCDS46117.1 DMPK gene_id:1760|Hs108|chr19 (625 aa) initn: 3947 init1: 3947 opt: 3951 Z-score: 2387.7 bits: 452.0 E(32554): 1.1e-126 Smith-Waterman score: 3951; 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95.4% identity (96.5% similar) in 520 aa overlap (45-559:36-554) 20 30 40 50 60 70 pF1KB4 MWGSPWEADSPRVKLRGREKGRQTEGGAFPLVSSALSGDPRFFSPTTPPAEPIVVRLKEV : .: :. : .. . ::::::::::: CCDS12 RLRRLQQLVLDPGFLGLEPLLDLLLGVHQELGASELAQD-KYVADFLQWAEPIVVRLKEV 10 20 30 40 50 60 80 90 100 110 120 130 pF1KB4 RLQRDDFEILKVIGRGAFSEVAVVKMKQTGQVYAMKIMNKWDMLKRGEVSCFREERDVLV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 RLQRDDFEILKVIGRGAFSEVAVVKMKQTGQVYAMKIMNKWDMLKRGEVSCFREERDVLV 70 80 90 100 110 120 140 150 160 170 180 190 pF1KB4 NGDRRWITQLHFAFQDENYLYLVMEYYVGGDLLTLLSKFGERIPAEMARFYLAEIVMAID :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 NGDRRWITQLHFAFQDENYLYLVMEYYVGGDLLTLLSKFGERIPAEMARFYLAEIVMAID 130 140 150 160 170 180 200 210 220 230 240 250 pF1KB4 SVHRLGYVHRDIKPDNILLDRCGHIRLADFGSCLKLRADGTVRSLVAVGTPDYLSPEILQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 SVHRLGYVHRDIKPDNILLDRCGHIRLADFGSCLKLRADGTVRSLVAVGTPDYLSPEILQ 190 200 210 220 230 240 260 270 280 290 300 310 pF1KB4 AVGGGPGTGSYGPECDWWALGVFAYEMFYGQTPFYADSTAETYGKIVHYKEHLSLPLVDE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 AVGGGPGTGSYGPECDWWALGVFAYEMFYGQTPFYADSTAETYGKIVHYKEHLSLPLVDE 250 260 270 280 290 300 320 330 340 350 360 370 pF1KB4 GVPEEARDFIQRLLCPPETRLGRGGAGDFRTHPFFFGLDWDGLRDSVPPFTPDFEGATDT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 GVPEEARDFIQRLLCPPETRLGRGGAGDFRTHPFFFGLDWDGLRDSVPPFTPDFEGATDT 310 320 330 340 350 360 380 390 400 410 420 pF1KB4 CNFDLVEDGLTAM-----ETLSDIREGAPLGVHLPFVGYSYSCMALRDSEVPGPTPMELE ::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 CNFDLVEDGLTAMVSGGGETLSDIREGAPLGVHLPFVGYSYSCMALRDSEVPGPTPMELE 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KB4 AEQLLEPHVQAPSLEPSVSPQDETAEVAVPAAVPAAEAEAEVTLRELQEALEEEVLTRQS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 AEQLLEPHVQAPSLEPSVSPQDETAEVAVPAAVPAAEAEAEVTLRELQEALEEEVLTRQS 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KB4 LSREMEAIRTDNQNFASQLREAEARNRDLEAHVRQLQERMELLQAEGATAVTGVPSPRAT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 LSREMEAIRTDNQNFASQLREAEARNRDLEAHVRQLQERMELLQAEGATAVTGVPSPRAT 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 pF1KB4 DPPSHMAPRPWLWASARWWGQAPCTAATCCSLPGSLGLAYRRRFPCSCSPLFCLVPPPWA :::::. : CCDS12 DPPSHLDGPPAVAVGQCPLVGPGPMHRRHLLLPARVPRPGLSEALSLLLFAVVLSRAAAL 550 560 570 580 590 600 >>CCDS74400.1 DMPK gene_id:1760|Hs108|chr19 (530 aa) initn: 3185 init1: 3185 opt: 3189 Z-score: 1931.9 bits: 367.4 E(32554): 2.7e-101 Smith-Waterman score: 3189; 97.0% identity (98.0% similar) in 494 aa overlap (45-538:36-528) 20 30 40 50 60 70 pF1KB4 MWGSPWEADSPRVKLRGREKGRQTEGGAFPLVSSALSGDPRFFSPTTPPAEPIVVRLKEV : .: :. : .. . ::::::::::: CCDS74 RLRRLQQLVLDPGFLGLEPLLDLLLGVHQELGASELAQD-KYVADFLQWAEPIVVRLKEV 10 20 30 40 50 60 80 90 100 110 120 130 pF1KB4 RLQRDDFEILKVIGRGAFSEVAVVKMKQTGQVYAMKIMNKWDMLKRGEVSCFREERDVLV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS74 RLQRDDFEILKVIGRGAFSEVAVVKMKQTGQVYAMKIMNKWDMLKRGEVSCFREERDVLV 70 80 90 100 110 120 140 150 160 170 180 190 pF1KB4 NGDRRWITQLHFAFQDENYLYLVMEYYVGGDLLTLLSKFGERIPAEMARFYLAEIVMAID :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS74 NGDRRWITQLHFAFQDENYLYLVMEYYVGGDLLTLLSKFGERIPAEMARFYLAEIVMAID 130 140 150 160 170 180 200 210 220 230 240 250 pF1KB4 SVHRLGYVHRDIKPDNILLDRCGHIRLADFGSCLKLRADGTVRSLVAVGTPDYLSPEILQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS74 SVHRLGYVHRDIKPDNILLDRCGHIRLADFGSCLKLRADGTVRSLVAVGTPDYLSPEILQ 190 200 210 220 230 240 260 270 280 290 300 310 pF1KB4 AVGGGPGTGSYGPECDWWALGVFAYEMFYGQTPFYADSTAETYGKIVHYKEHLSLPLVDE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS74 AVGGGPGTGSYGPECDWWALGVFAYEMFYGQTPFYADSTAETYGKIVHYKEHLSLPLVDE 250 260 270 280 290 300 320 330 340 350 360 370 pF1KB4 GVPEEARDFIQRLLCPPETRLGRGGAGDFRTHPFFFGLDWDGLRDSVPPFTPDFEGATDT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS74 GVPEEARDFIQRLLCPPETRLGRGGAGDFRTHPFFFGLDWDGLRDSVPPFTPDFEGATDT 310 320 330 340 350 360 380 390 400 410 420 430 pF1KB4 CNFDLVEDGLTAMETLSDIREGAPLGVHLPFVGYSYSCMALRDSEVPGPTPMELEAEQLL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS74 CNFDLVEDGLTAMETLSDIREGAPLGVHLPFVGYSYSCMALRDSEVPGPTPMELEAEQLL 370 380 390 400 410 420 440 450 460 470 480 490 pF1KB4 EPHVQAPSLEPSVSPQDETAEVAVPAAVPAAEAEAEVTLRELQEALEEEVLTRQSLSREM :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS74 EPHVQAPSLEPSVSPQDETAEVAVPAAVPAAEAEAEVTLRELQEALEEEVLTRQSLSREM 430 440 450 460 470 480 500 510 520 530 540 550 pF1KB4 EAIRTDNQNFASQLREAEARNRDLEAHVRQLQERMELLQAEGATAVTGVPSPRATDPPSH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS74 EAIRTDNQNFASQLREAEARNRDLEAHVRQLQERMELLQAEGATGP 490 500 510 520 530 560 570 580 590 600 610 pF1KB4 MAPRPWLWASARWWGQAPCTAATCCSLPGSLGLAYRRRFPCSCSPLFCLVPPPWAALGWW >>CCDS1559.1 CDC42BPA gene_id:8476|Hs108|chr1 (1638 aa) initn: 1585 init1: 1013 opt: 1580 Z-score: 961.9 bits: 189.6 E(32554): 2.9e-47 Smith-Waterman score: 1611; 52.3% identity (75.5% similar) in 493 aa overlap (64-535:60-543) 40 50 60 70 80 90 pF1KB4 KGRQTEGGAFPLVSSALSGDPRFFSPTTPPAEPIVVRLKEVRLQRDDFEILKVIGRGAFS :.:.. ..:..::.:.:::::::::::::. CCDS15 TLLDILICLYDECNNSPLRREKNILEYLEWAKPFTSKVKQMRLHREDFEILKVIGRGAFG 30 40 50 60 70 80 100 110 120 130 140 150 pF1KB4 EVAVVKMKQTGQVYAMKIMNKWDMLKRGEVSCFREERDVLVNGDRRWITQLHFAFQDENY ::::::.:.. .:.::::.:::.::::.:..::::::::::::: .::: ::.::::.: CCDS15 EVAVVKLKNADKVFAMKILNKWEMLKRAETACFREERDVLVNGDNKWITTLHYAFQDDNN 90 100 110 120 130 140 160 170 180 190 200 210 pF1KB4 LYLVMEYYVGGDLLTLLSKFGERIPAEMARFYLAEIVMAIDSVHRLGYVHRDIKPDNILL :::::.:::::::::::::: .:.: .::::::::.:.::::::.: ::::::::::::. CCDS15 LYLVMDYYVGGDLLTLLSKFEDRLPEDMARFYLAEMVIAIDSVHQLHYVHRDIKPDNILM 150 160 170 180 190 200 220 230 240 250 260 270 pF1KB4 DRCGHIRLADFGSCLKLRADGTVRSLVAVGTPDYLSPEILQAVGGGPGTGSYGPECDWWA : :::::::::::::: ::::.: ::::::::.:::::::. : : ::::::::. CCDS15 DMNGHIRLADFGSCLKLMEDGTVQSSVAVGTPDYISPEILQAMEDGKG--RYGPECDWWS 210 220 230 240 250 260 280 290 300 310 320 330 pF1KB4 LGVFAYEMFYGQTPFYADSTAETYGKIVHYKEHLSLPLVDEGVPEEARDFIQRLLCPPET ::: :::.::.:::::.: .::::::...::....: : :.:.:.:.::.: : CCDS15 LGVCMYEMLYGETPFYAESLVETYGKIMNHKERFQFPAQVTDVSENAKDLIRRLICSREH 270 280 290 300 310 320 340 350 360 370 380 390 pF1KB4 RLGRGGAGDFRTHPFFFGLDWDGLRDSVPPFTPDFEGATDTCNFDLVEDGLTAMETLSDI :::..: ::. :::: :.:::..:. :. :. . ::: :::. .: : ::. CCDS15 RLGQNGIEDFKKHPFFSGIDWDNIRNCEAPYIPEVSSPTDTSNFDVDDDCLKNSETMPPP 330 340 350 360 370 380 400 410 420 430 440 pF1KB4 REGAPLGVHLPFVGYSY--SCMALRDSE----VPGPTPMELEA--EQLLEPHVQAPSLEP . : : ::::::..: ::. : : . ::: ..:.. .. :. .. . . : CCDS15 THTAFSGHHLPFVGFTYTSSCV-LSDRSCLRVTAGPTSLDLDVNVQRTLDNNLATEAYER 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 pF1KB4 SVSP-QDETAEVAVPAAVPAAEAEAEVTLRELQEALEEEVLTR------QSLSREMEAIR .. ..: :.. :. :.. :: . . :: ..:..:.: .: CCDS15 RIKRLEQEKLELSRKLQ------ESTQTVQALQYSTVDGPLTASKDLEIKNLKEEIEKLR 450 460 470 480 490 500 500 510 520 530 540 550 pF1KB4 ---TDNQNFASQLREAEARNRDLEAHVRQLQ---ERMELLQAEGATAVTGVPSPRATDPP :..... .::.::.: ..:. ::.. .... :: : CCDS15 KQVTESSHLEQQLEEANAVRQELDDAFRQIKAYEKQIKTLQQEREDLNKLEVHTEALAAE 510 520 530 540 550 560 560 570 580 590 600 610 pF1KB4 SHMAPRPWLWASARWWGQAPCTAATCCSLPGSLGLAYRRRFPCSCSPLFCLVPPPWAALG CCDS15 ASKDRKLREQSEHYSKQLENELEGLKQKQISYSPGVCSIEHQQEITKLKTDLEKKSIFYE 570 580 590 600 610 620 >>CCDS1558.1 CDC42BPA gene_id:8476|Hs108|chr1 (1719 aa) initn: 1585 init1: 1013 opt: 1580 Z-score: 961.7 bits: 189.6 E(32554): 3e-47 Smith-Waterman score: 1611; 52.3% identity (75.5% similar) in 493 aa overlap (64-535:60-543) 40 50 60 70 80 90 pF1KB4 KGRQTEGGAFPLVSSALSGDPRFFSPTTPPAEPIVVRLKEVRLQRDDFEILKVIGRGAFS :.:.. ..:..::.:.:::::::::::::. CCDS15 TLLDILICLYDECNNSPLRREKNILEYLEWAKPFTSKVKQMRLHREDFEILKVIGRGAFG 30 40 50 60 70 80 100 110 120 130 140 150 pF1KB4 EVAVVKMKQTGQVYAMKIMNKWDMLKRGEVSCFREERDVLVNGDRRWITQLHFAFQDENY ::::::.:.. .:.::::.:::.::::.:..::::::::::::: .::: ::.::::.: CCDS15 EVAVVKLKNADKVFAMKILNKWEMLKRAETACFREERDVLVNGDNKWITTLHYAFQDDNN 90 100 110 120 130 140 160 170 180 190 200 210 pF1KB4 LYLVMEYYVGGDLLTLLSKFGERIPAEMARFYLAEIVMAIDSVHRLGYVHRDIKPDNILL :::::.:::::::::::::: .:.: .::::::::.:.::::::.: ::::::::::::. CCDS15 LYLVMDYYVGGDLLTLLSKFEDRLPEDMARFYLAEMVIAIDSVHQLHYVHRDIKPDNILM 150 160 170 180 190 200 220 230 240 250 260 270 pF1KB4 DRCGHIRLADFGSCLKLRADGTVRSLVAVGTPDYLSPEILQAVGGGPGTGSYGPECDWWA : :::::::::::::: ::::.: ::::::::.:::::::. : : ::::::::. CCDS15 DMNGHIRLADFGSCLKLMEDGTVQSSVAVGTPDYISPEILQAMEDGKG--RYGPECDWWS 210 220 230 240 250 260 280 290 300 310 320 330 pF1KB4 LGVFAYEMFYGQTPFYADSTAETYGKIVHYKEHLSLPLVDEGVPEEARDFIQRLLCPPET ::: :::.::.:::::.: .::::::...::....: : :.:.:.:.::.: : CCDS15 LGVCMYEMLYGETPFYAESLVETYGKIMNHKERFQFPAQVTDVSENAKDLIRRLICSREH 270 280 290 300 310 320 340 350 360 370 380 390 pF1KB4 RLGRGGAGDFRTHPFFFGLDWDGLRDSVPPFTPDFEGATDTCNFDLVEDGLTAMETLSDI :::..: ::. :::: :.:::..:. :. :. . ::: :::. .: : ::. CCDS15 RLGQNGIEDFKKHPFFSGIDWDNIRNCEAPYIPEVSSPTDTSNFDVDDDCLKNSETMPPP 330 340 350 360 370 380 400 410 420 430 440 pF1KB4 REGAPLGVHLPFVGYSY--SCMALRDSE----VPGPTPMELEA--EQLLEPHVQAPSLEP . : : ::::::..: ::. : : . ::: ..:.. .. :. .. . . : CCDS15 THTAFSGHHLPFVGFTYTSSCV-LSDRSCLRVTAGPTSLDLDVNVQRTLDNNLATEAYER 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 pF1KB4 SVSP-QDETAEVAVPAAVPAAEAEAEVTLRELQEALEEEVLTR------QSLSREMEAIR .. ..: :.. :. :.. :: . . :: ..:..:.: .: CCDS15 RIKRLEQEKLELSRKLQ------ESTQTVQALQYSTVDGPLTASKDLEIKNLKEEIEKLR 450 460 470 480 490 500 500 510 520 530 540 550 pF1KB4 ---TDNQNFASQLREAEARNRDLEAHVRQLQ---ERMELLQAEGATAVTGVPSPRATDPP :..... .::.::.: ..:. ::.. .... :: : CCDS15 KQVTESSHLEQQLEEANAVRQELDDAFRQIKAYEKQIKTLQQEREDLNKELVQASERLKN 510 520 530 540 550 560 560 570 580 590 600 610 pF1KB4 SHMAPRPWLWASARWWGQAPCTAATCCSLPGSLGLAYRRRFPCSCSPLFCLVPPPWAALG CCDS15 QSKELKDAHCQRKLAMQEFMEINERLTELHTQKQKLARHVRDKEEEVDLVMQKVESLRQE 570 580 590 600 610 620 >>CCDS31601.1 CDC42BPG gene_id:55561|Hs108|chr11 (1551 aa) initn: 1611 init1: 965 opt: 1552 Z-score: 945.4 bits: 186.4 E(32554): 2.4e-46 Smith-Waterman score: 1582; 49.9% identity (73.2% similar) in 523 aa overlap (64-535:54-574) 40 50 60 70 80 90 pF1KB4 KGRQTEGGAFPLVSSALSGDPRFFSPTTPPAEPIVVRLKEVRLQRDDFEILKVIGRGAFS : :.: ..::.::::::::::::::::::. CCDS31 GLLDLLLALHHELSSGPLRRERSVAQFLSWASPFVSKVKELRLQRDDFEILKVIGRGAFG 30 40 50 60 70 80 100 110 120 130 140 150 pF1KB4 EVAVVKMKQTGQVYAMKIMNKWDMLKRGEVSCFREERDVLVNGDRRWITQLHFAFQDENY ::.::....:::..:::...::.::::.:..::::::::::.:: ::.: ::.:::::.: CCDS31 EVTVVRQRDTGQIFAMKMLHKWEMLKRAETACFREERDVLVKGDSRWVTTLHYAFQDEEY 90 100 110 120 130 140 160 170 180 190 200 210 pF1KB4 LYLVMEYYVGGDLLTLLSKFGERIPAEMARFYLAEIVMAIDSVHRLGYVHRDIKPDNILL :::::.::.:::::::::.: .:.: :.:.:::::.:.:: :.:.:::::::.::::.:: CCDS31 LYLVMDYYAGGDLLTLLSRFEDRLPPELAQFYLAEMVLAIHSLHQLGYVHRDVKPDNVLL 150 160 170 180 190 200 220 230 240 250 260 270 pF1KB4 DRCGHIRLADFGSCLKLRADGTVRSLVAVGTPDYLSPEILQAVGGGPGTGSYGPECDWWA : ::::::::::::.: ..: : : ::::::::.:::::::. : : :::.::::. CCDS31 DVNGHIRLADFGSCLRLNTNGMVDSSVAVGTPDYISPEILQAME--EGKGHYGPQCDWWS 210 220 230 240 250 260 280 290 300 310 320 330 pF1KB4 LGVFAYEMFYGQTPFYADSTAETYGKIVHYKEHLSLPLVDEGVPEEARDFIQRLLCPPET ::: :::...:.:::::.: .::::::.....::..: :: :.:.:..::: : CCDS31 LGVCAYELLFGETPFYAESLVETYGKIMNHEDHLQFPPDVPDVPASAQDLIRQLLCRQEE 270 280 290 300 310 320 340 350 360 370 380 390 pF1KB4 RLGRGGAGDFRTHPFFFGLDWDGLRDSVPPFTPDFEGATDTCNFDLVEDGLTAMETLSDI :::::: :::.:::: :.::. : .:. :. :...: :: :::. .: :. :: CCDS31 RLGRGGLDDFRNHPFFEGVDWERLASSTAPYIPELRGPMDTSNFDVDDDTLNHPGTLPPP 330 340 350 360 370 380 400 410 420 430 440 pF1KB4 REGAPLGVHLPFVGYSYSCMALR-DSEVPGPTPME-----LEAEQ--LLEPH---VQAPS .:: : ::::::..:. . .: . . .: :: :. : . : ..::. CCDS31 SHGAFSGHHLPFVGFTYTSGSHSPESSSEAWAALERKLQCLEQEKVELSRKHQEALHAPT 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KB4 -------LEPSVSP-QDETAEV-----------AVPAAVPAAEAEAEVTL----RELQEA :. :. .:. :. . ::. :. ... . : ::: :. CCDS31 DHRELEQLRKEVQTLRDRLPEMLRDKASLSQTDGPPAGSPGQDSDLRQELDRLHRELAEG 450 460 470 480 490 500 480 490 500 510 520 pF1KB4 ----------------LEEEVLTRQSLSREMEAIR-TDNQNFASQLREAEARNRDLEAHV .::.: : . ..: :: .... ..:::.::.: .:.:::.: CCDS31 RAGLQAQEQELCRAQGQQEELLQRLQEAQEREAATASQTRALSSQLEEARAAQRELEAQV 510 520 530 540 550 560 530 540 550 560 570 580 pF1KB4 RQLQERMELLQAEGATAVTGVPSPRATDPPSHMAPRPWLWASARWWGQAPCTAATCCSLP .:.... ::.. CCDS31 SSLSRQVTQLQGQWEQRLEESSQAKTIHTASETNGMGPPEGGPQEAQLRKEVAALREQLE 570 580 590 600 610 620 >>CCDS9978.1 CDC42BPB gene_id:9578|Hs108|chr14 (1711 aa) initn: 1141 init1: 987 opt: 1540 Z-score: 937.7 bits: 185.1 E(32554): 6.5e-46 Smith-Waterman score: 1551; 49.1% identity (72.9% similar) in 509 aa overlap (48-529:44-549) 20 30 40 50 60 70 pF1KB4 SPWEADSPRVKLRGREKGRQTEGGAFPLVSSALSGDPRFFSPTTPPAEPIVVRLKEVRLQ ::: : .. . :.:.. .::..:. CCDS99 LLDGPWRNESALSVETLLDVLVCLYTECSHSALRRD-KYVAEFLEWAKPFTQLVKEMQLH 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 pF1KB4 RDDFEILKVIGRGAFSEVAVVKMKQTGQVYAMKIMNKWDMLKRGEVSCFREERDVLVNGD :.::::.::::::::.::::::::.: ..:::::.:::.::::.:..::::::::::::: CCDS99 REDFEIIKVIGRGAFGEVAVVKMKNTERIYAMKILNKWEMLKRAETACFREERDVLVNGD 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 pF1KB4 RRWITQLHFAFQDENYLYLVMEYYVGGDLLTLLSKFGERIPAEMARFYLAEIVMAIDSVH .::: ::.::::::.:::::.:::::::::::::: ...: .:::::..:.:.::::.: CCDS99 CQWITALHYAFQDENHLYLVMDYYVGGDLLTLLSKFEDKLPEDMARFYIGEMVLAIDSIH 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 pF1KB4 RLGYVHRDIKPDNILLDRCGHIRLADFGSCLKLRADGTVRSLVAVGTPDYLSPEILQAVG .: ::::::::::.::: :::::::::::::. ::::.: ::::::::.:::::::. CCDS99 QLHYVHRDIKPDNVLLDVNGHIRLADFGSCLKMNDDGTVQSSVAVGTPDYISPEILQAME 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 pF1KB4 GGPGTGSYGPECDWWALGVFAYEMFYGQTPFYADSTAETYGKIVHYKEHLSLPLVDEGVP : :.::::::::.::: :::.::.:::::.: .::::::....:....: : CCDS99 D--GMGKYGPECDWWSLGVCMYEMLYGETPFYAESLVETYGKIMNHEERFQFPSHVTDVS 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 pF1KB4 EEARDFIQRLLCPPETRLGRGGAGDFRTHPFFFGLDWDGLRDSVPPFTPDFEGATDTCNF :::.:.::::.: : :::..: ::. : :: ::.:...:. :. :: . .:: :: CCDS99 EEAKDLIQRLICSRERRLGQNGIEDFKKHAFFEGLNWENIRNLEAPYIPDVSSPSDTSNF 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KB4 DLVEDGLTAMETLSDIREGAPLGVHLPFVGYSY---SCMALR--------------DSEV :. .: : : : . . :.::::.:... ::.. : : .: CCDS99 DVDDDVLRNTEILPPGSHTGFSGLHLPFIGFTFTTESCFSDRGSLKSIMQSNTLTKDEDV 380 390 400 410 420 430 430 440 450 460 470 pF1KB4 PGPTP--MELEAEQLLEPHVQAPSLEPSVSPQDETAEV----AVPAAVPAAEAEAEVT-L ...:: . ... .:: : . :. : : . :. .. . :. : CCDS99 QRDLEHSLQMEAYERRIRRLEQEKLELSRKLQESTQTVQSLHGSSRALSNSNRDKEIKKL 440 450 460 470 480 490 480 490 500 510 520 530 pF1KB4 RELQEALEEEVLTRQSLSREME---AIRTDNQNFASQLREAEARNRDLEAHVRQLQERME : : :.... . : :..: :.: . .. ...:: : ..: .. . ..:.... CCDS99 NEEIERLKNKIADSNRLERQLEDTVALRQEREDSTQRLRGLEKQHRVVRQEKEELHKQLV 500 510 520 530 540 550 540 550 560 570 580 590 pF1KB4 LLQAEGATAVTGVPSPRATDPPSHMAPRPWLWASARWWGQAPCTAATCCSLPGSLGLAYR CCDS99 EASERLKSQAKELKDAHQQRKLALQEFSELNERMAELRAQKQKVSRQLRDKEEEMEVATQ 560 570 580 590 600 610 >>CCDS11870.2 ROCK1 gene_id:6093|Hs108|chr18 (1354 aa) initn: 890 init1: 388 opt: 1206 Z-score: 738.8 bits: 148.0 E(32554): 7.8e-35 Smith-Waterman score: 1206; 39.9% identity (70.6% similar) in 479 aa overlap (68-533:63-527) 40 50 60 70 80 90 pF1KB4 TEGGAFPLVSSALSGDPRFFSPTTPPAEPIVVRLKEVRLQRDDFEILKVIGRGAFSEVAV . .....:.. .:.:..::::::::.:: . CCDS11 GLDALVYDLDFPALRKNKNIDNFLSRYKDTINKIRDLRMKAEDYEVVKVIGRGAFGEVQL 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 pF1KB4 VKMKQTGQVYAMKIMNKWDMLKRGEVSCFREERDVLVNGDRRWITQLHFAFQDENYLYLV :. :.: .:::::...:..:.::.. . : ::::... .. :..:: .::::. :::.: CCDS11 VRHKSTRKVYAMKLLSKFEMIKRSDSAFFWEERDIMAFANSPWVVQLFYAFQDDRYLYMV 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 pF1KB4 MEYYVGGDLLTLLSKFGERIPAEMARFYLAEIVMAIDSVHRLGYVHRDIKPDNILLDRCG :::. ::::..:.:.. .: . :::: ::.:.:.:..: .:..:::.::::.:::. : CCDS11 MEYMPGGDLVNLMSNYD--VPEKWARFYTAEVVLALDAIHSMGFIHRDVKPDNMLLDKSG 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 pF1KB4 HIRLADFGSCLKLRADGTVRSLVAVGTPDYLSPEILQAVGGGPGTGSYGPECDWWALGVF :..:::::.:.:. .: :: .:::::::.:::.:.. :: : :: :::::..::: CCDS11 HLKLADFGTCMKMNKEGMVRCDTAVGTPDYISPEVLKSQGGD---GYYGRECDWWSVGVF 220 230 240 250 260 280 290 300 310 320 330 pF1KB4 AYEMFYGQTPFYADSTAETYGKIVHYKEHLSLPLVDEGVPEEARDFIQRLLCPPETRLGR :::. :.::::::: . ::.::...:. :..: :. . .::...: .: :.:::: CCDS11 LYEMLVGDTPFYADSLVGTYSKIMNHKNSLTFPD-DNDISKEAKNLICAFLTDREVRLGR 270 280 290 300 310 320 340 350 360 370 380 390 pF1KB4 GGAGDFRTHPFFFGLD---WDGLRDSVPPFTPDFEGATDTCNFDLVEDGLTAMETLSDIR .:. ... : .:: : :. :::.: : .::. . :: ::: .:. ::. . CCDS11 NGVEEIKRH-LFFKNDQWAWETLRDTVAPVVPDLSSDIDTSNFDDLEEDKGEEETFPIPK 330 340 350 360 370 380 400 410 420 430 440 450 pF1KB4 EGAPLGVHLPFVGYSY-SCMALRDSEVPGPTPMELEAEQLLEPHVQAPSLEPSVSPQDET : .: .:::::..: : .: :. . .:.. :. ::. .. .: CCDS11 --AFVGNQLPFVGFTYYSNRRYLSSANPNDNRTSSNADKSLQE-----SLQKTIYKLEEQ 390 400 410 420 430 460 470 480 490 500 pF1KB4 --AEVAVPAAVPAAEAEAEVTLRELQEALEEEVLTRQSLSREMEAIRTDNQNFASQL--- :. . . ... : .... :.:: :..: . :. ... . .. CCDS11 LHNEMQLKDEMEQKCRTSNIKLDKIMKELDEEGNQRRNLESTVSQIEKEKMLLQHRINEY 440 450 460 470 480 490 510 520 530 540 550 560 pF1KB4 -REAEARN---RDLEAHVRQLQERMELLQAEGATAVTGVPSPRATDPPSHMAPRPWLWAS :.:: .: :..: .: :....: :. CCDS11 QRKAEQENEKRRNVENEVSTLKDQLEDLKKVSQNSQLANEKLSQLQKQLEEANDLLRTES 500 510 520 530 540 550 635 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Thu Nov 3 14:43:17 2016 done: Thu Nov 3 14:43:18 2016 Total Scan time: 4.270 Total Display time: 0.150 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]