Result of FASTA (ccds) for
pF1KB4307
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4307, 334 aa
1>>>pF1KB4307 334 - 334 aa - 334 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.3949+/-0.00124; mu= 5.7999+/- 0.072
mean_var=252.5858+/-57.802, 0's: 0 Z-trim(107.8): 667 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.080699
statistics sampled from 9009 (9799) to 9009 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.675), E-opt: 0.2 (0.301), width: 16
Scan time: 2.590
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11686.1 MAP2K6 gene_id:5608|Hs108|chr17 ( 334) 2229 273.2 2.1e-73
CCDS82194.1 MAP2K6 gene_id:5608|Hs108|chr17 ( 278) 1853 229.3 2.9e-60
CCDS11217.1 MAP2K3 gene_id:5606|Hs108|chr17 ( 347) 1792 222.3 4.5e-58
CCDS11218.1 MAP2K3 gene_id:5606|Hs108|chr17 ( 318) 1759 218.4 6.2e-57
CCDS11162.1 MAP2K4 gene_id:6416|Hs108|chr17 ( 399) 1200 153.5 2.7e-37
CCDS62095.1 MAP2K4 gene_id:6416|Hs108|chr17 ( 410) 1200 153.5 2.8e-37
CCDS42491.1 MAP2K7 gene_id:5609|Hs108|chr19 ( 419) 912 120.0 3.5e-27
CCDS74277.1 MAP2K7 gene_id:5609|Hs108|chr19 ( 435) 912 120.0 3.6e-27
CCDS55970.1 MAP2K5 gene_id:5607|Hs108|chr15 ( 412) 783 104.9 1.2e-22
CCDS10224.1 MAP2K5 gene_id:5607|Hs108|chr15 ( 448) 783 105.0 1.2e-22
CCDS74278.1 MAP2K7 gene_id:5609|Hs108|chr19 ( 426) 765 102.9 5e-22
CCDS12120.1 MAP2K2 gene_id:5605|Hs108|chr19 ( 400) 640 88.3 1.2e-17
CCDS10216.1 MAP2K1 gene_id:5604|Hs108|chr15 ( 393) 636 87.8 1.6e-17
CCDS54673.1 TNIK gene_id:23043|Hs108|chr3 (1268) 495 72.1 2.8e-12
CCDS54674.1 TNIK gene_id:23043|Hs108|chr3 (1276) 495 72.1 2.8e-12
CCDS54677.1 TNIK gene_id:23043|Hs108|chr3 (1297) 495 72.1 2.8e-12
CCDS54678.1 TNIK gene_id:23043|Hs108|chr3 (1305) 495 72.1 2.8e-12
CCDS54675.1 TNIK gene_id:23043|Hs108|chr3 (1323) 495 72.1 2.9e-12
CCDS54676.1 TNIK gene_id:23043|Hs108|chr3 (1331) 495 72.1 2.9e-12
CCDS54679.1 TNIK gene_id:23043|Hs108|chr3 (1352) 495 72.1 2.9e-12
CCDS46956.1 TNIK gene_id:23043|Hs108|chr3 (1360) 495 72.1 2.9e-12
CCDS34290.1 STK10 gene_id:6793|Hs108|chr5 ( 968) 490 71.3 3.6e-12
CCDS82487.1 MAP4K4 gene_id:9448|Hs108|chr2 (1165) 488 71.2 4.7e-12
CCDS56130.1 MAP4K4 gene_id:9448|Hs108|chr2 (1239) 488 71.2 4.9e-12
CCDS74546.1 MAP4K4 gene_id:9448|Hs108|chr2 (1273) 488 71.2 4.9e-12
CCDS13341.1 STK4 gene_id:6789|Hs108|chr20 ( 487) 477 69.4 6.8e-12
CCDS7148.1 MYO3A gene_id:53904|Hs108|chr10 (1616) 484 70.9 7.9e-12
CCDS59108.1 STK3 gene_id:6788|Hs108|chr8 ( 519) 475 69.2 8.3e-12
CCDS47900.1 STK3 gene_id:6788|Hs108|chr8 ( 491) 473 68.9 9.4e-12
CCDS45589.1 MINK1 gene_id:50488|Hs108|chr17 (1303) 474 69.6 1.5e-11
CCDS45590.1 MINK1 gene_id:50488|Hs108|chr17 (1312) 474 69.6 1.6e-11
CCDS45588.1 MINK1 gene_id:50488|Hs108|chr17 (1332) 474 69.6 1.6e-11
CCDS46446.1 MYO3B gene_id:140469|Hs108|chr2 (1314) 469 69.1 2.3e-11
CCDS42773.1 MYO3B gene_id:140469|Hs108|chr2 (1341) 469 69.1 2.4e-11
CCDS58707.1 MAP4K3 gene_id:8491|Hs108|chr2 ( 873) 464 68.2 2.7e-11
CCDS1803.1 MAP4K3 gene_id:8491|Hs108|chr2 ( 894) 464 68.2 2.8e-11
CCDS32001.1 STK24 gene_id:8428|Hs108|chr13 ( 431) 456 66.9 3.4e-11
CCDS2549.1 STK25 gene_id:10494|Hs108|chr2 ( 426) 451 66.3 5.1e-11
CCDS9488.1 STK24 gene_id:8428|Hs108|chr13 ( 443) 451 66.3 5.2e-11
CCDS14631.1 STK26 gene_id:51765|Hs108|chrX ( 416) 445 65.6 8.1e-11
>>CCDS11686.1 MAP2K6 gene_id:5608|Hs108|chr17 (334 aa)
initn: 2229 init1: 2229 opt: 2229 Z-score: 1431.2 bits: 273.2 E(32554): 2.1e-73
Smith-Waterman score: 2229; 100.0% identity (100.0% similar) in 334 aa overlap (1-334:1-334)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MSQSKGKKRNPGLKIPKEAFEQPQTSSTPPRDLDSKACISIGNQNFEVKADDLEPIMELG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MSQSKGKKRNPGLKIPKEAFEQPQTSSTPPRDLDSKACISIGNQNFEVKADDLEPIMELG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 RGAYGVVEKMRHVPSGQIMAVKRIRATVNSQEQKRLLMDLDISMRTVDCPFTVTFYGALF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RGAYGVVEKMRHVPSGQIMAVKRIRATVNSQEQKRLLMDLDISMRTVDCPFTVTFYGALF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 REGDVWICMELMDTSLDKFYKQVIDKGQTIPEDILGKIAVSIVKALEHLHSKLSVIHRDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 REGDVWICMELMDTSLDKFYKQVIDKGQTIPEDILGKIAVSIVKALEHLHSKLSVIHRDV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 KPSNVLINALGQVKMCDFGISGYLVDSVAKTIDAGCKPYMAPERINPELNQKGYSVKSDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KPSNVLINALGQVKMCDFGISGYLVDSVAKTIDAGCKPYMAPERINPELNQKGYSVKSDI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 WSLGITMIELAILRFPYDSWGTPFQQLKQVVEEPSPQLPADKFSAEFVDFTSQCLKKNSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 WSLGITMIELAILRFPYDSWGTPFQQLKQVVEEPSPQLPADKFSAEFVDFTSQCLKKNSK
250 260 270 280 290 300
310 320 330
pF1KB4 ERPTYPELMQHPFFTLHESKGTDVASFVKLILGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ERPTYPELMQHPFFTLHESKGTDVASFVKLILGD
310 320 330
>>CCDS82194.1 MAP2K6 gene_id:5608|Hs108|chr17 (278 aa)
initn: 1853 init1: 1853 opt: 1853 Z-score: 1195.5 bits: 229.3 E(32554): 2.9e-60
Smith-Waterman score: 1853; 100.0% identity (100.0% similar) in 278 aa overlap (57-334:1-278)
30 40 50 60 70 80
pF1KB4 STPPRDLDSKACISIGNQNFEVKADDLEPIMELGRGAYGVVEKMRHVPSGQIMAVKRIRA
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 MELGRGAYGVVEKMRHVPSGQIMAVKRIRA
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KB4 TVNSQEQKRLLMDLDISMRTVDCPFTVTFYGALFREGDVWICMELMDTSLDKFYKQVIDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 TVNSQEQKRLLMDLDISMRTVDCPFTVTFYGALFREGDVWICMELMDTSLDKFYKQVIDK
40 50 60 70 80 90
150 160 170 180 190 200
pF1KB4 GQTIPEDILGKIAVSIVKALEHLHSKLSVIHRDVKPSNVLINALGQVKMCDFGISGYLVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 GQTIPEDILGKIAVSIVKALEHLHSKLSVIHRDVKPSNVLINALGQVKMCDFGISGYLVD
100 110 120 130 140 150
210 220 230 240 250 260
pF1KB4 SVAKTIDAGCKPYMAPERINPELNQKGYSVKSDIWSLGITMIELAILRFPYDSWGTPFQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 SVAKTIDAGCKPYMAPERINPELNQKGYSVKSDIWSLGITMIELAILRFPYDSWGTPFQQ
160 170 180 190 200 210
270 280 290 300 310 320
pF1KB4 LKQVVEEPSPQLPADKFSAEFVDFTSQCLKKNSKERPTYPELMQHPFFTLHESKGTDVAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 LKQVVEEPSPQLPADKFSAEFVDFTSQCLKKNSKERPTYPELMQHPFFTLHESKGTDVAS
220 230 240 250 260 270
330
pF1KB4 FVKLILGD
::::::::
CCDS82 FVKLILGD
>>CCDS11217.1 MAP2K3 gene_id:5606|Hs108|chr17 (347 aa)
initn: 1769 init1: 1769 opt: 1792 Z-score: 1156.0 bits: 222.3 E(32554): 4.5e-58
Smith-Waterman score: 1792; 80.0% identity (91.6% similar) in 335 aa overlap (1-334:12-345)
10 20 30 40
pF1KB4 MSQSKGK-KRNPGLKIPKEAFEQPQTSSTPPRDLDSKACISIGNQNFEV
: ::::: ::. :.: . . : . ::::.:::.. :.::..::::
CCDS11 MESPASSQPASMPQSKGKSKRKKDLRISCMS-KPPAPNPTPPRNLDSRTFITIGDRNFEV
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KB4 KADDLEPIMELGRGAYGVVEKMRHVPSGQIMAVKRIRATVNSQEQKRLLMDLDISMRTVD
.:::: : ::::::::::::.::. :: :::::::::::::::::::::::::.:::::
CCDS11 EADDLVTISELGRGAYGVVEKVRHAQSGTIMAVKRIRATVNSQEQKRLLMDLDINMRTVD
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KB4 CPFTVTFYGALFREGDVWICMELMDTSLDKFYKQVIDKGQTIPEDILGKIAVSIVKALEH
: .:::::::::::::::::::::::::::::..:.::..::::::::.::::::.::::
CCDS11 CFYTVTFYGALFREGDVWICMELMDTSLDKFYRKVLDKNMTIPEDILGEIAVSIVRALEH
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB4 LHSKLSVIHRDVKPSNVLINALGQVKMCDFGISGYLVDSVAKTIDAGCKPYMAPERINPE
:::::::::::::::::::: :.:::::::::::::::::::.::::::::::::::::
CCDS11 LHSKLSVIHRDVKPSNVLINKEGHVKMCDFGISGYLVDSVAKTMDAGCKPYMAPERINPE
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB4 LNQKGYSVKSDIWSLGITMIELAILRFPYDSWGTPFQQLKQVVEEPSPQLPADKFSAEFV
::::::.::::.:::::::::.:::::::.:::::::::::::::::::::::.:: :::
CCDS11 LNQKGYNVKSDVWSLGITMIEMAILRFPYESWGTPFQQLKQVVEEPSPQLPADRFSPEFV
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330
pF1KB4 DFTSQCLKKNSKERPTYPELMQHPFFTLHESKGTDVASFVKLILGD
:::.:::.:: :: .: :::.:::::::..: ::.:.::: :::.
CCDS11 DFTAQCLRKNPAERMSYLELMEHPFFTLHKTKKTDIAAFVKEILGEDS
300 310 320 330 340
>>CCDS11218.1 MAP2K3 gene_id:5606|Hs108|chr17 (318 aa)
initn: 1751 init1: 1751 opt: 1759 Z-score: 1135.7 bits: 218.4 E(32554): 6.2e-57
Smith-Waterman score: 1759; 82.7% identity (93.9% similar) in 312 aa overlap (23-334:5-316)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MSQSKGKKRNPGLKIPKEAFEQPQTSSTPPRDLDSKACISIGNQNFEVKADDLEPIMELG
: . ::::.:::.. :.::..::::.:::: : :::
CCDS11 MSKPPAPNPTPPRNLDSRTFITIGDRNFEVEADDLVTISELG
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 RGAYGVVEKMRHVPSGQIMAVKRIRATVNSQEQKRLLMDLDISMRTVDCPFTVTFYGALF
:::::::::.::. :: :::::::::::::::::::::::::.:::::: .:::::::::
CCDS11 RGAYGVVEKVRHAQSGTIMAVKRIRATVNSQEQKRLLMDLDINMRTVDCFYTVTFYGALF
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 REGDVWICMELMDTSLDKFYKQVIDKGQTIPEDILGKIAVSIVKALEHLHSKLSVIHRDV
::::::::::::::::::::..:.::..::::::::.::::::.::::::::::::::::
CCDS11 REGDVWICMELMDTSLDKFYRKVLDKNMTIPEDILGEIAVSIVRALEHLHSKLSVIHRDV
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 KPSNVLINALGQVKMCDFGISGYLVDSVAKTIDAGCKPYMAPERINPELNQKGYSVKSDI
:::::::: :.:::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::.::::.
CCDS11 KPSNVLINKEGHVKMCDFGISGYLVDSVAKTMDAGCKPYMAPERINPELNQKGYNVKSDV
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 WSLGITMIELAILRFPYDSWGTPFQQLKQVVEEPSPQLPADKFSAEFVDFTSQCLKKNSK
:::::::::.:::::::.:::::::::::::::::::::::.:: ::::::.:::.::
CCDS11 WSLGITMIEMAILRFPYESWGTPFQQLKQVVEEPSPQLPADRFSPEFVDFTAQCLRKNPA
230 240 250 260 270 280
310 320 330
pF1KB4 ERPTYPELMQHPFFTLHESKGTDVASFVKLILGD
:: .: :::.:::::::..: ::.:.::: :::.
CCDS11 ERMSYLELMEHPFFTLHKTKKTDIAAFVKEILGEDS
290 300 310
>>CCDS11162.1 MAP2K4 gene_id:6416|Hs108|chr17 (399 aa)
initn: 1201 init1: 586 opt: 1200 Z-score: 782.9 bits: 153.5 E(32554): 2.7e-37
Smith-Waterman score: 1200; 54.9% identity (81.1% similar) in 317 aa overlap (21-332:69-385)
10 20 30 40
pF1KB4 MSQSKGKKRNPGLKIPKEAFEQPQTSSTPPRDLDSKACISIG-NQNFEVK
..:. ....:.. ..:. .:...
CCDS11 GKRKALKLNFANPPFKSTARFTLNPNPTGVQNPHIERLRTHSIESSGKLKISPEQHWDFT
40 50 60 70 80 90
50 60 70 80 90 100
pF1KB4 ADDLEPIMELGRGAYGVVEKMRHVPSGQIMAVKRIRATVNSQEQKRLLMDLDISMRTVDC
:.::. . :.:::::: :.:: : ::::::::::::.::. .:::.::::::. ::. ::
CCDS11 AEDLKDLGEIGRGAYGSVNKMVHKPSGQIMAVKRIRSTVDEKEQKQLLMDLDVVMRSSDC
100 110 120 130 140 150
110 120 130 140 150 160
pF1KB4 PFTVTFYGALFREGDVWICMELMDTSLDKFYKQVIDK-GQTIPEDILGKIAVSIVKALEH
:. : :::::::::: :::::::.::.::::: : . ..:::.:::::... ::::.:
CCDS11 PYIVQFYGALFREGDCWICMELMSTSFDKFYKYVYSVLDDVIPEEILGKITLATVKALNH
160 170 180 190 200 210
170 180 190 200 210 220
pF1KB4 LHSKLSVIHRDVKPSNVLINALGQVKMCDFGISGYLVDSVAKTIDAGCKPYMAPERINPE
:. .:..::::.::::.:.. :..:.::::::: ::::.::: ::::.::::::::.:
CCDS11 LKENLKIIHRDIKPSNILLDRSGNIKLCDFGISGQLVDSIAKTRDAGCRPYMAPERIDPS
220 230 240 250 260 270
230 240 250 260 270 280
pF1KB4 LNQKGYSVKSDIWSLGITMIELAILRFPYDSWGTPFQQLKQVVEEPSPQLPADK---FSA
...::.:.::.::::::. ::: :::: .:.. :.:: :::. ::: .. ::
CCDS11 ASRQGYDVRSDVWSLGITLYELATGRFPYPKWNSVFDQLTQVVKGDPPQLSNSEEREFSP
280 290 300 310 320 330
290 300 310 320 330
pF1KB4 EFVDFTSQCLKKNSKERPTYPELMQHPFFTLHESKGTDVASFVKLILGD
:..:.. :: :. ..:: : ::..:::. ..: ....:: .: ::
CCDS11 SFINFVNLCLTKDESKRPKYKELLKHPFILMYEERAVEVACYVCKILDQMPATPSSPMYV
340 350 360 370 380 390
CCDS11 D
>>CCDS62095.1 MAP2K4 gene_id:6416|Hs108|chr17 (410 aa)
initn: 1201 init1: 586 opt: 1200 Z-score: 782.8 bits: 153.5 E(32554): 2.8e-37
Smith-Waterman score: 1200; 54.9% identity (81.1% similar) in 317 aa overlap (21-332:80-396)
10 20 30 40
pF1KB4 MSQSKGKKRNPGLKIPKEAFEQPQTSSTPPRDLDSKACISIG-NQNFEVK
..:. ....:.. ..:. .:...
CCDS62 SKRKALKLNFANPPFKSTARFTLNPNPTGVQNPHIERLRTHSIESSGKLKISPEQHWDFT
50 60 70 80 90 100
50 60 70 80 90 100
pF1KB4 ADDLEPIMELGRGAYGVVEKMRHVPSGQIMAVKRIRATVNSQEQKRLLMDLDISMRTVDC
:.::. . :.:::::: :.:: : ::::::::::::.::. .:::.::::::. ::. ::
CCDS62 AEDLKDLGEIGRGAYGSVNKMVHKPSGQIMAVKRIRSTVDEKEQKQLLMDLDVVMRSSDC
110 120 130 140 150 160
110 120 130 140 150 160
pF1KB4 PFTVTFYGALFREGDVWICMELMDTSLDKFYKQVIDK-GQTIPEDILGKIAVSIVKALEH
:. : :::::::::: :::::::.::.::::: : . ..:::.:::::... ::::.:
CCDS62 PYIVQFYGALFREGDCWICMELMSTSFDKFYKYVYSVLDDVIPEEILGKITLATVKALNH
170 180 190 200 210 220
170 180 190 200 210 220
pF1KB4 LHSKLSVIHRDVKPSNVLINALGQVKMCDFGISGYLVDSVAKTIDAGCKPYMAPERINPE
:. .:..::::.::::.:.. :..:.::::::: ::::.::: ::::.::::::::.:
CCDS62 LKENLKIIHRDIKPSNILLDRSGNIKLCDFGISGQLVDSIAKTRDAGCRPYMAPERIDPS
230 240 250 260 270 280
230 240 250 260 270 280
pF1KB4 LNQKGYSVKSDIWSLGITMIELAILRFPYDSWGTPFQQLKQVVEEPSPQLPADK---FSA
...::.:.::.::::::. ::: :::: .:.. :.:: :::. ::: .. ::
CCDS62 ASRQGYDVRSDVWSLGITLYELATGRFPYPKWNSVFDQLTQVVKGDPPQLSNSEEREFSP
290 300 310 320 330 340
290 300 310 320 330
pF1KB4 EFVDFTSQCLKKNSKERPTYPELMQHPFFTLHESKGTDVASFVKLILGD
:..:.. :: :. ..:: : ::..:::. ..: ....:: .: ::
CCDS62 SFINFVNLCLTKDESKRPKYKELLKHPFILMYEERAVEVACYVCKILDQMPATPSSPMYV
350 360 370 380 390 400
CCDS62 D
410
>>CCDS42491.1 MAP2K7 gene_id:5609|Hs108|chr19 (419 aa)
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Smith-Waterman score: 917; 42.9% identity (72.5% similar) in 345 aa overlap (2-332:58-398)
10 20 30
pF1KB4 MSQSKGKKRNPGLKIPKEAFEQPQTSSTPPR
:.:. .. .: . :.. . :.: ::
CCDS42 IDLNLDISPQRPRPTLQLPLANDGGSRSPSSESSPQHPTPPAR-PRHMLGLPSTLFTPRS
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40 50 60 70
pF1KB4 ----DLDSK--------ACISIGNQNFEVKADDLEPIMELGRGAYGVVEKMRHVPSGQIM
..:.: . ..::.: .... .::: . :.: :. : : ::: .:...
CCDS42 MESIEIDQKLQEIMKQTGYLTIGGQRYQAEINDLENLGEMGSGTCGQVWKMRFRKTGHVI
90 100 110 120 130 140
80 90 100 110 120 130
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:::..: . :..:.::.:::::. ... :::. : .:... . ::.: :::: : .:.
CCDS42 AVKQMRRSGNKEENKRILMDLDVVLKSHDCPYIVQCFGTFITNTDVFIAMELMGTCAEKL
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140 150 160 170 180 190
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CCDS42 KKRM--QGP-IPERILGKMTVAIVKALYYLKEKHGVIHRDVKPSNILLDERGQIKLCDFG
210 220 230 240 250 260
200 210 220 230 240 250
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::: :::: ::: .::: :::::::.: . .. :....:.:::::...::: .:::
CCDS42 ISGRLVDSKAKTRSAGCAAYMAPERIDPPDPTKPDYDIRADVWSLGISLVELATGQFPYK
270 280 290 300 310 320
260 270 280 290 300 310
pF1KB4 SWGTPFQQLKQVVEEPSPQLPADK-FSAEFVDFTSQCLKKNSKERPTYPELMQHPFFTLH
. : :. : .:..: : ::. ::..: .:...:: :. ..:: : .:..: :. .
CCDS42 NCKTDFEVLTKVLQEEPPLLPGHMGFSGDFQSFVKDCLTKDHRKRPKYNKLLEHSFIKRY
330 340 350 360 370 380
320 330
pF1KB4 ESKGTDVASFVKLILGD
:. .::::. : ..
CCDS42 ETLEVDVASWFKDVMAKTESPRTSGVLSQPHLPFFR
390 400 410
>>CCDS74277.1 MAP2K7 gene_id:5609|Hs108|chr19 (435 aa)
initn: 921 init1: 359 opt: 912 Z-score: 601.3 bits: 120.0 E(32554): 3.6e-27
Smith-Waterman score: 917; 42.9% identity (72.5% similar) in 345 aa overlap (2-332:74-414)
10 20 30
pF1KB4 MSQSKGKKRNPGLKIPKEAFEQPQTSSTPPR
:.:. .. .: . :.. . :.: ::
CCDS74 VITLSPAPAPSQRAALQLPLANDGGSRSPSSESSPQHPTPPAR-PRHMLGLPSTLFTPRS
50 60 70 80 90 100
40 50 60 70
pF1KB4 ----DLDSK--------ACISIGNQNFEVKADDLEPIMELGRGAYGVVEKMRHVPSGQIM
..:.: . ..::.: .... .::: . :.: :. : : ::: .:...
CCDS74 MESIEIDQKLQEIMKQTGYLTIGGQRYQAEINDLENLGEMGSGTCGQVWKMRFRKTGHVI
110 120 130 140 150 160
80 90 100 110 120 130
pF1KB4 AVKRIRATVNSQEQKRLLMDLDISMRTVDCPFTVTFYGALFREGDVWICMELMDTSLDKF
:::..: . :..:.::.:::::. ... :::. : .:... . ::.: :::: : .:.
CCDS74 AVKQMRRSGNKEENKRILMDLDVVLKSHDCPYIVQCFGTFITNTDVFIAMELMGTCAEKL
170 180 190 200 210 220
140 150 160 170 180 190
pF1KB4 YKQVIDKGQTIPEDILGKIAVSIVKALEHLHSKLSVIHRDVKPSNVLINALGQVKMCDFG
:.. .: ::: ::::..:.::::: .:. : .::::::::::.:.. ::.:.::::
CCDS74 KKRM--QGP-IPERILGKMTVAIVKALYYLKEKHGVIHRDVKPSNILLDERGQIKLCDFG
230 240 250 260 270
200 210 220 230 240 250
pF1KB4 ISGYLVDSVAKTIDAGCKPYMAPERINP-ELNQKGYSVKSDIWSLGITMIELAILRFPYD
::: :::: ::: .::: :::::::.: . .. :....:.:::::...::: .:::
CCDS74 ISGRLVDSKAKTRSAGCAAYMAPERIDPPDPTKPDYDIRADVWSLGISLVELATGQFPYK
280 290 300 310 320 330
260 270 280 290 300 310
pF1KB4 SWGTPFQQLKQVVEEPSPQLPADK-FSAEFVDFTSQCLKKNSKERPTYPELMQHPFFTLH
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CCDS74 NCKTDFEVLTKVLQEEPPLLPGHMGFSGDFQSFVKDCLTKDHRKRPKYNKLLEHSFIKRY
340 350 360 370 380 390
320 330
pF1KB4 ESKGTDVASFVKLILGD
:. .::::. : ..
CCDS74 ETLEVDVASWFKDVMAKTESPRTSGVLSQPHLPFFR
400 410 420 430
>>CCDS55970.1 MAP2K5 gene_id:5607|Hs108|chr15 (412 aa)
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10 20 30
pF1KB4 MSQSKGKKRNPGLKIPKEA----FEQPQTSSTPPR
:.. :::. .: .: .:.. :
CCDS55 SYYYSTVMEQQVNGQLIEPLQIFPRACKPPGERNIHGLKVNTRAGPSQHSSPAVSDSLPS
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40 50 60 70 80
pF1KB4 DLDSKACISIGN--QNFEVKADDLEPIMELGRGAYGVVEKMRHVPSGQIMAVKRIRATVN
. .:. . . : ... .:.. ::.: :.: : :::::.:.::: : ..
CCDS55 NSLKKSSAELKKILANGQMNEQDIRYRDTLGHGNGGTVYKAYHVPSGKILAVKVILLDIT
110 120 130 140 150 160
90 100 110 120 130 140
pF1KB4 SQEQKRLLMDLDISMRTVDCPFTVTFYGALFREGDVWICMELMDT-SLDKFYKQVIDKGQ
. ::... .:.: . : . . ::::.: :. . :: :.:: ::: . :
CCDS55 LELQKQIMSELEI-LYKCDSSYIIGFYGAFFVENRISICTEFMDGGSLDVYRK-------
170 180 190 200 210
150 160 170 180 190 200
pF1KB4 TIPEDILGKIAVSIVKALEHLHSKLSVIHRDVKPSNVLINALGQVKMCDFGISGYLVDSV
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CCDS55 -MPEHVLGRIAVAVVKGLTYLWS-LKILHRDVKPSNMLVNTRGQVKLCDFGVSTQLVNSI
220 230 240 250 260 270
210 220 230 240 250 260
pF1KB4 AKTIDAGCKPYMAPERINPELNQKGYSVKSDIWSLGITMIELAILRFPYD----SWGT--
::: .: . :::::::. : :...::.:::::...:::. :::: . :.
CCDS55 AKTY-VGTNAYMAPERISGEQ----YGIHSDVWSLGISFMELALGRFPYPQIQKNQGSLM
280 290 300 310 320 330
270 280 290 300 310 320
pF1KB4 PFQQLKQVVEEPSPQLPADKFSAEFVDFTSQCLKKNSKERPTYPELMQHPFFTLHESKGT
:.: :. .:.: :: ::. .:: :: : .::..:. ::::. ::: :::.. .. ..
CCDS55 PLQLLQCIVDEDSPVLPVGEFSEPFVHFITQCMRKQPKERPAPEELMGHPFIVQFNDGNA
340 350 360 370 380 390
330
pF1KB4 DVASFVKLILGD
:.:
CCDS55 AVVSMWVCRALEERRSQQGPP
400 410
>>CCDS10224.1 MAP2K5 gene_id:5607|Hs108|chr15 (448 aa)
initn: 765 init1: 195 opt: 783 Z-score: 520.0 bits: 105.0 E(32554): 1.2e-22
Smith-Waterman score: 783; 41.6% identity (67.7% similar) in 334 aa overlap (6-326:113-431)
10 20 30
pF1KB4 MSQSKGKKRNPGLKIPKEA----FEQPQTSSTPPR
:.. :::. .: .: .:.. :
CCDS10 SYYYSTVMEQQVNGQLIEPLQIFPRACKPPGERNIHGLKVNTRAGPSQHSSPAVSDSLPS
90 100 110 120 130 140
40 50 60 70 80
pF1KB4 DLDSKACISIGN--QNFEVKADDLEPIMELGRGAYGVVEKMRHVPSGQIMAVKRIRATVN
. .:. . . : ... .:.. ::.: :.: : :::::.:.::: : ..
CCDS10 NSLKKSSAELKKILANGQMNEQDIRYRDTLGHGNGGTVYKAYHVPSGKILAVKVILLDIT
150 160 170 180 190 200
90 100 110 120 130 140
pF1KB4 SQEQKRLLMDLDISMRTVDCPFTVTFYGALFREGDVWICMELMDT-SLDKFYKQVIDKGQ
. ::... .:.: . : . . ::::.: :. . :: :.:: ::: . :
CCDS10 LELQKQIMSELEI-LYKCDSSYIIGFYGAFFVENRISICTEFMDGGSLDVYRK-------
210 220 230 240 250
150 160 170 180 190 200
pF1KB4 TIPEDILGKIAVSIVKALEHLHSKLSVIHRDVKPSNVLINALGQVKMCDFGISGYLVDSV
.:: .::.:::..::.: .: : :...::::::::.:.:. ::::.::::.: ::.:.
CCDS10 -MPEHVLGRIAVAVVKGLTYLWS-LKILHRDVKPSNMLVNTRGQVKLCDFGVSTQLVNSI
260 270 280 290 300 310
210 220 230 240 250 260
pF1KB4 AKTIDAGCKPYMAPERINPELNQKGYSVKSDIWSLGITMIELAILRFPYD----SWGT--
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CCDS10 AKTY-VGTNAYMAPERISGEQ----YGIHSDVWSLGISFMELALGRFPYPQIQKNQGSLM
320 330 340 350 360
270 280 290 300 310 320
pF1KB4 PFQQLKQVVEEPSPQLPADKFSAEFVDFTSQCLKKNSKERPTYPELMQHPFFTLHESKGT
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CCDS10 PLQLLQCIVDEDSPVLPVGEFSEPFVHFITQCMRKQPKERPAPEELMGHPFIVQFNDGNA
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:.:
CCDS10 AVVSMWVCRALEERRSQQGPP
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]