Result of FASTA (ccds) for pF1KB4321
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB4321, 1004 aa
  1>>>pF1KB4321 1004 - 1004 aa - 1004 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.4147+/-0.00132; mu= 6.5269+/- 0.078
 mean_var=308.7860+/-65.840, 0's: 0 Z-trim(108.1): 662  B-trim: 93 in 1/53
 Lambda= 0.072987
 statistics sampled from 9221 (9996) to 9221 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.654), E-opt: 0.2 (0.307), width:  16
 Scan time:  4.750

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS75132.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4          (1004) 6820 733.8 4.2e-211
CCDS75133.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4          (1038) 6820 733.8 4.3e-211
CCDS3513.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4           (1037) 6797 731.4 2.3e-210
CCDS75131.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4          (1016) 4068 444.0 7.2e-124
CCDS3514.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4           (1015) 4045 441.6 3.8e-123
CCDS46875.1 EPHA3 gene_id:2042|Hs108|chr3          ( 539) 2456 273.9 6.1e-73
CCDS46876.1 EPHA6 gene_id:285220|Hs108|chr3        (1130) 2296 257.5 1.1e-67
CCDS225.1 EPHA8 gene_id:2046|Hs108|chr1            (1005) 2207 248.1   7e-65
CCDS2922.1 EPHA3 gene_id:2042|Hs108|chr3           ( 983) 2057 232.3 3.9e-60
CCDS5031.1 EPHA7 gene_id:2045|Hs108|chr6           ( 998) 2004 226.7 1.9e-58
CCDS2447.1 EPHA4 gene_id:2043|Hs108|chr2           ( 986) 1984 224.6 8.1e-58
CCDS230.1 EPHB2 gene_id:2048|Hs108|chr1            ( 987) 1896 215.3   5e-55
CCDS229.2 EPHB2 gene_id:2048|Hs108|chr1            ( 986) 1880 213.6 1.6e-54
CCDS81279.1 EPHB2 gene_id:2048|Hs108|chr1          (1055) 1880 213.7 1.7e-54
CCDS30626.1 EPHA8 gene_id:2046|Hs108|chr1          ( 495) 1856 210.7   6e-54
CCDS3268.1 EPHB3 gene_id:2049|Hs108|chr3           ( 998) 1816 206.9 1.7e-52
CCDS46921.1 EPHB1 gene_id:2047|Hs108|chr3          ( 984) 1793 204.5 9.1e-52
CCDS169.1 EPHA2 gene_id:1969|Hs108|chr1            ( 976) 1756 200.6 1.4e-50
CCDS41305.1 EPHA10 gene_id:284656|Hs108|chr1       (1008) 1747 199.6 2.7e-50
CCDS5706.1 EPHB4 gene_id:2050|Hs108|chr7           ( 987) 1718 196.6 2.2e-49
CCDS5884.1 EPHA1 gene_id:2041|Hs108|chr7           ( 976) 1333 156.0 3.5e-37
CCDS75494.1 EPHA7 gene_id:2045|Hs108|chr6          ( 279) 1245 146.1 9.9e-35
CCDS425.1 EPHA10 gene_id:284656|Hs108|chr1         ( 295) 1071 127.8 3.3e-29
CCDS5873.2 EPHB6 gene_id:2051|Hs108|chr7           (1022)  892 109.6 3.4e-23
CCDS54456.1 HCK gene_id:3055|Hs108|chr20           ( 504)  771 96.5 1.5e-19
CCDS54455.1 HCK gene_id:3055|Hs108|chr20           ( 505)  771 96.5 1.5e-19
CCDS54453.1 HCK gene_id:3055|Hs108|chr20           ( 525)  771 96.5 1.5e-19
CCDS33460.1 HCK gene_id:3055|Hs108|chr20           ( 526)  771 96.5 1.5e-19
CCDS6381.1 PTK2 gene_id:5747|Hs108|chr8            (1052)  758 95.5 6.1e-19
CCDS56557.1 PTK2 gene_id:5747|Hs108|chr8           (1065)  758 95.5 6.1e-19
CCDS47859.1 LYN gene_id:4067|Hs108|chr8            ( 491)  751 94.3 6.4e-19
CCDS6162.1 LYN gene_id:4067|Hs108|chr8             ( 512)  751 94.4 6.5e-19
CCDS11824.1 YES1 gene_id:7525|Hs108|chr18          ( 543)  749 94.2 7.8e-19
CCDS359.1 LCK gene_id:3932|Hs108|chr1              ( 509)  748 94.1 8.1e-19
CCDS5103.1 FRK gene_id:2444|Hs108|chr6             ( 505)  747 93.9 8.7e-19
CCDS5094.1 FYN gene_id:2534|Hs108|chr6             ( 537)  745 93.8   1e-18
CCDS5095.1 FYN gene_id:2534|Hs108|chr6             ( 534)  742 93.4 1.3e-18
CCDS3481.1 TEC gene_id:7006|Hs108|chr4             ( 631)  742 93.5 1.4e-18
CCDS13294.1 SRC gene_id:6714|Hs108|chr20           ( 536)  740 93.2 1.5e-18
CCDS3480.1 TXK gene_id:7294|Hs108|chr4             ( 527)  732 92.4 2.7e-18
CCDS78044.1 FER gene_id:2241|Hs108|chr5            ( 453)  718 90.8 6.7e-18
CCDS44283.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1             ( 542)  718 90.9 7.5e-18
CCDS5096.1 FYN gene_id:2534|Hs108|chr6             ( 482)  716 90.7 8.1e-18
CCDS4098.1 FER gene_id:2241|Hs108|chr5             ( 822)  718 91.2 9.7e-18
CCDS33255.1 ZAP70 gene_id:7535|Hs108|chr2          ( 312)  709 89.7   1e-17
CCDS6058.1 PTK2B gene_id:2185|Hs108|chr8           ( 967)  718 91.3 1.1e-17
CCDS6057.1 PTK2B gene_id:2185|Hs108|chr8           (1009)  718 91.3 1.1e-17
CCDS35166.1 ABL1 gene_id:25|Hs108|chr9             (1130)  718 91.3 1.2e-17
CCDS35165.1 ABL1 gene_id:25|Hs108|chr9             (1149)  718 91.3 1.2e-17
CCDS33254.1 ZAP70 gene_id:7535|Hs108|chr2          ( 619)  710 90.2 1.5e-17


>>CCDS75132.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4               (1004 aa)
 initn: 6820 init1: 6820 opt: 6820  Z-score: 3903.5  bits: 733.8 E(32554): 4.2e-211
Smith-Waterman score: 6820; 100.0% identity (100.0% similar) in 1004 aa overlap (1-1004:1-1004)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB4 MRGSGPRGAGRRRPPSGGGDTPITPASLAGCYSAPRRAPLWTCLLLCAALRTLLASPSNE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 MRGSGPRGAGRRRPPSGGGDTPITPASLAGCYSAPRRAPLWTCLLLCAALRTLLASPSNE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB4 VNLLDSRTVMGDLGWIAFPKNGWEEIGEVDENYAPIHTYQVCKVMEQNQNNWLLTSWISN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 VNLLDSRTVMGDLGWIAFPKNGWEEIGEVDENYAPIHTYQVCKVMEQNQNNWLLTSWISN
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB4 EGASRIFIELKFTLRDCNSLPGGLGTCKETFNMYYFESDDQNGRNIKENQYIKIDTIAAD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 EGASRIFIELKFTLRDCNSLPGGLGTCKETFNMYYFESDDQNGRNIKENQYIKIDTIAAD
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB4 ESFTELDLGDRVMKLNTEVRDVGPLSKKGFYLAFQDVGACIALVSVRVYYKKCPSVVRHL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 ESFTELDLGDRVMKLNTEVRDVGPLSKKGFYLAFQDVGACIALVSVRVYYKKCPSVVRHL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB4 AVFPDTITGADSSQLLEVSGSCVNHSVTDEPPKMHCSAEGEWLVPIGKCMCKAGYEEKNG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 AVFPDTITGADSSQLLEVSGSCVNHSVTDEPPKMHCSAEGEWLVPIGKCMCKAGYEEKNG
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB4 TCQVCRPGFFKASPHIQSCGKCPPHSYTHEEASTSCVCEKDYFRRESDPPTMACTRPPSA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 TCQVCRPGFFKASPHIQSCGKCPPHSYTHEEASTSCVCEKDYFRRESDPPTMACTRPPSA
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB4 PRNAISNVNETSVFLEWIPPADTGGRKDVSYYIACKKCNSHAGVCEECGGHVRYLPRQSG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 PRNAISNVNETSVFLEWIPPADTGGRKDVSYYIACKKCNSHAGVCEECGGHVRYLPRQSG
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB4 LKNTSVMMVDLLAHTNYTFEIEAVNGVSDLSPGARQYVSVNVTTNQAAPSPVTNVKKGKI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LKNTSVMMVDLLAHTNYTFEIEAVNGVSDLSPGARQYVSVNVTTNQAAPSPVTNVKKGKI
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB4 AKNSISLSWQEPDRPNGIILEYEIKYFEKDQETSYTIIKSKETTITAEGLKPASVYVFQI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 AKNSISLSWQEPDRPNGIILEYEIKYFEKDQETSYTIIKSKETTITAEGLKPASVYVFQI
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB4 RARTAAGYGVFSRRFEFETTPVSVAASSDQSQIPVIAVSVTVGVILLAVVIGVLLSGSCC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 RARTAAGYGVFSRRFEFETTPVSVAASSDQSQIPVIAVSVTVGVILLAVVIGVLLSGSCC
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB4 ECGCGRASSLCAVAHPSLIWRCGYSKAKQDPEEEKMHFHNGHIKLPGVRTYIDPHTYEDP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 ECGCGRASSLCAVAHPSLIWRCGYSKAKQDPEEEKMHFHNGHIKLPGVRTYIDPHTYEDP
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB4 NQAVHEFAKEIEASCITIERVIGAGEFGEVCSGRLKLPGKRELPVAIKTLKVGYTEKQRR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 NQAVHEFAKEIEASCITIERVIGAGEFGEVCSGRLKLPGKRELPVAIKTLKVGYTEKQRR
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB4 DFLGEASIMGQFDHPNIIHLEGVVTKSKPVMIVTEYMENGSLDTFLKKNDGQFTVIQLVG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 DFLGEASIMGQFDHPNIIHLEGVVTKSKPVMIVTEYMENGSLDTFLKKNDGQFTVIQLVG
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB4 MLRGISAGMKYLSDMGYVHRDLAARNILINSNLVCKVSDFGLSRVLEDDPEAAYTTRGGK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 MLRGISAGMKYLSDMGYVHRDLAARNILINSNLVCKVSDFGLSRVLEDDPEAAYTTRGGK
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KB4 IPIRWTAPEAIAFRKFTSASDVWSYGIVMWEVVSYGERPYWEMTNQDVIKAVEEGYRLPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 IPIRWTAPEAIAFRKFTSASDVWSYGIVMWEVVSYGERPYWEMTNQDVIKAVEEGYRLPS
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KB4 PMDCPAALYQLMLDCWQKERNSRPKFDEIVNMLDKLIRNPSSLKTLVNASCRVSNLLAEH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 PMDCPAALYQLMLDCWQKERNSRPKFDEIVNMLDKLIRNPSSLKTLVNASCRVSNLLAEH
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000    
pF1KB4 SPLGSGAYRSVGEWLEAIKMGRYTEIFMENGYSSMDAVAQVTLE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 SPLGSGAYRSVGEWLEAIKMGRYTEIFMENGYSSMDAVAQVTLE
              970       980       990      1000    

>>CCDS75133.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4               (1038 aa)
 initn: 6820 init1: 6820 opt: 6820  Z-score: 3903.3  bits: 733.8 E(32554): 4.3e-211
Smith-Waterman score: 6820; 100.0% identity (100.0% similar) in 1004 aa overlap (1-1004:1-1004)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB4 MRGSGPRGAGRRRPPSGGGDTPITPASLAGCYSAPRRAPLWTCLLLCAALRTLLASPSNE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 MRGSGPRGAGRRRPPSGGGDTPITPASLAGCYSAPRRAPLWTCLLLCAALRTLLASPSNE
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB4 VNLLDSRTVMGDLGWIAFPKNGWEEIGEVDENYAPIHTYQVCKVMEQNQNNWLLTSWISN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 VNLLDSRTVMGDLGWIAFPKNGWEEIGEVDENYAPIHTYQVCKVMEQNQNNWLLTSWISN
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CCDS35 MNSLQEMKVQLVNGMVPL
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>>CCDS75131.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4               (1016 aa)
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CCDS35 MNSLQEMKVQLVNGMVPL
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                                     :: :..: .   :. .::::::::::.:..
CCDS46                      MDCQLSILLLLSCSVLDSFGELIPQPSNEVNLLDSKTIQ
                                    10        20        30         

               80        90       100       110       120       130
pF1KB4 GDLGWIAFPKNGWEEIGEVDENYAPIHTYQVCKVMEQNQNNWLLTSWISNEGASRIFIEL
       :.::::..:..:::::. :::.:.::.:::::.::...::::: :.:.  ..:..:..::
CCDS46 GELGWISYPSHGWEEISGVDEHYTPIRTYQVCNVMDHSQNNWLRTNWVPRNSAQKIYVEL
      40        50        60        70        80        90         

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pF1KB4 KFTLRDCNSLPGGLGTCKETFNMYYFESDDQNGRNIKENQYIKIDTIAADESFTELDLGD
       :::::::::.:  :::::::::.::.::::..: ...:.:. ::::::::::::..::::
CCDS46 KFTLRDCNSIPLVLGTCKETFNLYYMESDDDHGVKFREHQFTKIDTIAADESFTQMDLGD
     100       110       120       130       140       150         

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pF1KB4 RVMKLNTEVRDVGPLSKKGFYLAFQDVGACIALVSVRVYYKKCPSVVRHLAVFPDTITGA
       :..:::::.:.:::..::::::::::::::.::::::::.:::: .:..::.::::.   
CCDS46 RILKLNTEIREVGPVNKKGFYLAFQDVGACVALVSVRVYFKKCPFTVKNLAMFPDTVP-M
     160       170       180       190       200       210         

              260       270       280       290       300       310
pF1KB4 DSSQLLEVSGSCVNHSVTDEPPKMHCSAEGEWLVPIGKCMCKAGYEEKNGTCQVCRPGFF
       ::..:.:: :::::.:  ..::.:.::.::::::::::: :.:::::..  ::.:::::.
CCDS46 DSQSLVEVRGSCVNNSKEEDPPRMYCSTEGEWLVPIGKCSCNAGYEERGFMCQACRPGFY
      220       230       240       250       260       270        

              320       330       340       350       360       370
pF1KB4 KASPHIQSCGKCPPHSYTHEEASTSCVCEKDYFRRESDPPTMACTRPPSAPRNAISNVNE
       ::    ..:.:::::: :.:..: .: ::..::: ..:::.::::::::.:::.:::.::
CCDS46 KALDGNMKCAKCPPHSSTQEDGSMNCRCENNYFRADKDPPSMACTRPPSSPRNVISNINE
      280       290       300       310       320       330        

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pF1KB4 TSVFLEWIPPADTGGRKDVSYYIACKKCNSHAGVCEECGGHVRYLPRQSGLKNTSVMMVD
       :::.:.:  : ::::::::.. : ::::. .   :: :. .::.:::: :: ::.: ..:
CCDS46 TSVILDWSWPLDTGGRKDVTFNIICKKCGWNIKQCEPCSPNVRFLPRQFGLTNTTVTVTD
      340       350       360       370       380       390        

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pF1KB4 LLAHTNYTFEIEAVNGVSDLSPGARQYVSVNVTTNQAAPSPVTNVKKGKIAKNSISLSWQ
       :::::::::::.::::::.::   ::...:..:::::::::: ..:: . ..::::::::
CCDS46 LLAHTNYTFEIDAVNGVSELSSPPRQFAAVSITTNQAAPSPVLTIKKDRTSRNSISLSWQ
      400       410       420       430       440       450        

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pF1KB4 EPDRPNGIILEYEIKYFEK-DQETSYTIIKSKETTITAEGLKPASVYVFQIRARTAAGYG
       ::..::::::.::.::.:: .:::::::.... :..:  .::: ..::::::::::::::
CCDS46 EPEHPNGIILDYEVKYYEKQEQETSYTILRARGTNVTISSLKPDTIYVFQIRARTAAGYG
      460       470       480       490       500       510        

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pF1KB4 VFSRRFEFETTPVSVAASSDQSQIPVIAVSVTVGVILLAVVIGVLLSGSCCECGCGRASS
       . ::.:::::.:                                                
CCDS46 TNSRKFEFETSPDCMYYFNAV                                       
      520       530                                                

>>CCDS46876.1 EPHA6 gene_id:285220|Hs108|chr3             (1130 aa)
 initn: 3370 init1: 2087 opt: 2296  Z-score: 1328.4  bits: 257.5 E(32554): 1.1e-67
Smith-Waterman score: 4050; 59.7% identity (80.5% similar) in 995 aa overlap (58-1004:126-1093)

        30        40        50        60        70        80       
pF1KB4 LAGCYSAPRRAPLWTCLLLCAALRTLLASPSNEVNLLDSRTVMGDLGWIAFPKNGWEEIG
                                     .:.: :::. ::.:.::: ..: :::. : 
CCDS46 GGCEVREFLLQFGFFLPLLTAWPGDCSHVSNNQVVLLDTTTVLGELGWKTYPLNGWDAIT
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pF1KB4 EVDENYAPIHTYQVCKVMEQNQNNWLLTSWISNEGASRIFIELKFTLRDCNSLPGGLGTC
       :.::.  ::::::::.::: :::::: :.::: ..:..:..:.:::::::::.:  ::::
CCDS46 EMDEHNRPIHTYQVCNVMEPNQNNWLRTNWISRDAAQKIYVEMKFTLRDCNSIPWVLGTC
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pF1KB4 KETFNMYYFESDDQNGRNIKENQYIKIDTIAADESFTELDLGDRVMKLNTEVRDVGPLSK
       :::::..:.:::...: ..: ::: ::::::::::::..:::::..:::::.:.:::. .
CCDS46 KETFNLFYMESDESHGIKFKPNQYTKIDTIAADESFTQMDLGDRILKLNTEIREVGPIER
         220       230       240       250       260       270     

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pF1KB4 KGFYLAFQDVGACIALVSVRVYYKKCPSVVRHLAVFPDTITGADSSQLLEVSGSCVNHSV
       :::::::::.:::::::::::.::::: .::.::.:::::  .:::.:.:: ::::. . 
CCDS46 KGFYLAFQDIGACIALVSVRVFYKKCPFTVRNLAMFPDTIPRVDSSSLVEVRGSCVKSAE
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pF1KB4 TDEPPKMHCSAEGEWLVPIGKCMCKAGYEEKNGTCQVCRPGFFKASPHIQSCGKCPPHSY
         . ::..:.:.:.::::.:.:.:..:::: .:.:..:::::.::     .:.:::::: 
CCDS46 ERDTPKLYCGADGDWLVPLGRCICSTGYEEIEGSCHACRPGFYKAFAGNTKCSKCPPHSL
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pF1KB4 THEEASTSCVCEKDYFRRESDPPTMACTRPPSAPRNAISNVNETSVFLEWIPPADTGGRK
       :. ::.. : ::: ::: :.:::.::::::::::::.. :.:::...::: ::.::::::
CCDS46 TYMEATSVCQCEKGYFRAEKDPPSMACTRPPSAPRNVVFNINETALILEWSPPSDTGGRK
         400       410       420       430       440       450     

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pF1KB4 DVSYYIACKKCNSHAGVCEECGGHVRYLPRQSGLKNTSVMMVDLLAHTNYTFEIEAVNGV
       :..: . ::::.  .. ::.::: .:..::..:: :.::...:...:.::::::::.:::
CCDS46 DLTYSVICKKCGLDTSQCEDCGGGLRFIPRHTGLINNSVIVLDFVSHVNYTFEIEAMNGV
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pF1KB4 SDLSPGARQYVSVNVTTNQAAPSPVTNVKKGKIAKNSISLSWQEPDRPNGIILEYEIKYF
       :.:: . . .....:::.: ::: .  :.:   ..:::.:::: :   :: ::.:::::.
CCDS46 SELSFSPKPFTAITVTTDQDAPSLIGVVRKDWASQNSIALSWQAPAFSNGAILDYEIKYY
         520       530       540       550       560       570     

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pF1KB4 EKDQET-SYTIIKSKETTITAEGLKPASVYVFQIRARTAAGYGVFSRRFEFETTPVSVAA
       ::..:  .:.  .::  ..   :::::. :::.::.:::.::. .:..:::::   .   
CCDS46 EKEHEQLTYSSTRSKAPSVIITGLKPATKYVFHIRVRTATGYSGYSQKFEFETGDETSDM
         580       590       600       610       620       630     

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pF1KB4 SSDQSQIPVIAVSVTVGVILLAVV-IGVLLSGSCCECGCGRASSLCAVAHPSLIWRCGYS
       ...:.:: :::.... :  ::... .  :..: :                    :   : 
CCDS46 AAEQGQILVIATAAVGGFTLLVILTLFFLITGRC-------------------QW---YI
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pF1KB4 KAKQDPEEEKM-HFHNGHIKLPGVRTYIDPHTYEDPNQAVHEFAKEIEASCITIERVIGA
       :::.  ::..  :..:::...::..::::: :::::. :::::::::. : : :::::::
CCDS46 KAKMKSEEKRRNHLQNGHLRFPGIKTYIDPDTYEDPSLAVHEFAKEIDPSRIRIERVIGA
           680       690       700       710       720       730   

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pF1KB4 GEFGEVCSGRLKLPGKRELPVAIKTLKVGYTEKQRRDFLGEASIMGQFDHPNIIHLEGVV
       :::::::::::: :::::.:::::::: :. ..:::::: ::::::::::::::.:::::
CCDS46 GEFGEVCSGRLKTPGKREIPVAIKTLKGGHMDRQRRDFLREASIMGQFDHPNIIRLEGVV
           740       750       760       770       780       790   

                                                    750       760  
pF1KB4 TK------------------------------------------SKPVMIVTEYMENGSL
       ::                                          ..:::::.::::::::
CCDS46 TKRSFPAIGVEAFCPSFLRAGFLNSIQAPHPVPGGGSLPPRIPAGRPVMIVVEYMENGSL
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pF1KB4 DTFLKKNDGQFTVIQLVGMLRGISAGMKYLSDMGYVHRDLAARNILINSNLVCKVSDFGL
       :.::.:.::.:::::::::::::..:::::::::::::::::::::.:::::::::::::
CCDS46 DSFLRKHDGHFTVIQLVGMLRGIASGMKYLSDMGYVHRDLAARNILVNSNLVCKVSDFGL
           860       870       880       890       900       910   

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pF1KB4 SRVLEDDPEAAYTTRGGKIPIRWTAPEAIAFRKFTSASDVWSYGIVMWEVVSYGERPYWE
       :::::::::::::: :::::::::::::::.:::.::::.::::::::::.:::::::::
CCDS46 SRVLEDDPEAAYTTTGGKIPIRWTAPEAIAYRKFSSASDAWSYGIVMWEVMSYGERPYWE
           920       930       940       950       960       970   

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pF1KB4 MTNQDVIKAVEEGYRLPSPMDCPAALYQLMLDCWQKERNSRPKFDEIVNMLDKLIRNPSS
       :.::::: ..:::::::.:: :::.:.:::: ::::::: :::: .::..:::::::::.
CCDS46 MSNQDVILSIEEGYRLPAPMGCPASLHQLMLHCWQKERNHRPKFTDIVSFLDKLIRNPSA
           980       990      1000      1010      1020      1030   

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pF1KB4 LKTLVNASCRVSNLLAEHSPLGSGAYR---SVGEWLEAIKMGRYTEIFMENGYSSMDAVA
       :.:::.     . :.  .::     :    .::.::..::::.: . :.  :....: ..
CCDS46 LHTLVE-----DILVMPESPGEVPEYPLFVTVGDWLDSIKMGQYKNNFVAAGFTTFDLIS
               1040      1050      1060      1070      1080        

    1000                                         
pF1KB4 QVTLE                                     
       .....                                     
CCDS46 RMSIDDIRRIGVILIGHQRRIVSSIQTLRLHMMHIQEKGFHV
     1090      1100      1110      1120      1130

>>CCDS225.1 EPHA8 gene_id:2046|Hs108|chr1                 (1005 aa)
 initn: 3969 init1: 2048 opt: 2207  Z-score: 1278.3  bits: 248.1 E(32554): 7e-65
Smith-Waterman score: 3926; 58.1% identity (79.7% similar) in 988 aa overlap (34-998:2-962)

            10        20        30            40        50         
pF1KB4 SGPRGAGRRRPPSGGGDTPITPASLAGCYSAPRRA--P--LWTCLLLCAALRTLLASPSN
                                     :: :.  :  ::. .   ::  : ...  .
CCDS22                              MAPARGRLPPALWV-VTAAAAAATCVSAARG
                                            10         20        30

      60        70        80        90       100       110         
pF1KB4 EVNLLDSRTVMGDLGWIAFPKNGWEEIGEVDENYAPIHTYQVCKVMEQNQNNWLLTSWIS
       ::::::. :. :: ::...: .::. :.::::.. ::::::::.::  :::::: :::. 
CCDS22 EVNLLDTSTIHGDWGWLTYPAHGWDSINEVDESFQPIHTYQVCNVMSPNQNNWLRTSWVP
               40        50        60        70        80        90

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pF1KB4 NEGASRIFIELKFTLRDCNSLPGGLGTCKETFNMYYFESDDQNGRNIKENQYIKIDTIAA
        .:: :.. :.:::::::::.:: :::::::::.::.::: . : . .:.:..:::::::
CCDS22 RDGARRVYAEIKFTLRDCNSMPGVLGTCKETFNLYYLESDRDLGASTQESQFLKIDTIAA
              100       110       120       130       140       150

     180       190       200       210       220       230         
pF1KB4 DESFTELDLGDRVMKLNTEVRDVGPLSKKGFYLAFQDVGACIALVSVRVYYKKCPSVVRH
       :::::  ::: : .:::::::.::::::.::::::::.:::.:..:.:.::::::..::.
CCDS22 DESFTGADLGVRRLKLNTEVRSVGPLSKRGFYLAFQDIGACLAILSLRIYYKKCPAMVRN
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pF1KB4 LAVFPDTITGADSSQLLEVSGSCVNHSVTDEPPKMHCSAEGEWLVPIGKCMCKAGYEEKN
       ::.: ...::::::.:.:: :.:: ::   . :::.::::::::::::::.:.:::::. 
CCDS22 LAAFSEAVTGADSSSLVEVRGQCVRHSEERDTPKMYCSAEGEWLVPIGKCVCSAGYEERR
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pF1KB4 GTCQVCRPGFFKASPHIQSCGKCPPHSYTHEEASTSCVCEKDYFRRESDPPTMACTRPPS
        .: .:. ::.:..:  : :..:::::..   :. .: :. .:.:   :::. :::::::
CCDS22 DACVACELGFYKSAPGDQLCARCPPHSHSAAPAAQACHCDLSYYRAALDPPSSACTRPPS
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pF1KB4 APRNAISNVNETSVFLEWIPPADTGGRKDVSYYIACKKCNSHAGVCEECGGHVRYLPRQS
       :: : ::.:: ::: ::: :: : :::.:..:  .:..:    . :: ::. .:..:.:.
CCDS22 APVNLISSVNGTSVTLEWAPPLDPGGRSDITYNAVCRRCPWALSRCEACGSGTRFVPQQT
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       .: ..:.....:::: ::.: ::::::::::::  :. . ::.:::::::: :. ... .
CCDS22 SLVQASLLVANLLAHMNYSFWIEAVNGVSDLSPEPRRAAVVNITTNQAAPSQVVVIRQER
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pF1KB4 IAKNSISLSWQEPDRPNGIILEYEIKYFEKDQET-SYTIIKSKETTITAEGLKPASVYVF
        ...:.:: ::::..::::::::::::.:::.:  ::. .:.  :  :. ::::.. :::
CCDS22 AGQTSVSLLWQEPEQPNGIILEYEIKYYEKDKEMQSYSTLKAVTTRATVSGLKPGTRYVF
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       :.::::.:: : ::. .: ::         :   :  : ... .:...: ...       
CCDS22 QVRARTSAGCGRFSQAMEVETGKPR--PRYDTRTIVWICLTLITGLVVLLLLL-------
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                  .:   :      :::::: :: .:::::..::.              ::
CCDS22 -----------ICKKRH------CGYSKAFQDSDEEKMHYQNGQAPPPVFLPLHHPPGKL
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pF1KB4 PGVRTYIDPHTYEDPNQAVHEFAKEIEASCITIERVIGAGEFGEVCSGRLKLPGKRELPV
       :  . : .:::::.:..: . :..::::: : ::..::.:. :::: :::..::.:..::
CCDS22 PEPQFYAEPHTYEEPGRAGRSFTREIEASRIHIEKIIGSGDSGEVCYGRLRVPGQRDVPV
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       :::.::.::::.::::::.::::::::::::::.::::::... .:::::::::::::::
CCDS22 AIKALKAGYTERQRRDFLSEASIMGQFDHPNIIRLEGVVTRGRLAMIVTEYMENGSLDTF
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       :. .:::::..::::::::..:::.::::.:::::::::::.:..:::::::::::::::
CCDS22 LRTHDGQFTIMQLVGMLRGVGAGMRYLSDLGYVHRDLAARNVLVDSNLVCKVSDFGLSRV
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pF1KB4 LEDDPEAAYTTRGGKIPIRWTAPEAIAFRKFTSASDVWSYGIVMWEVVSYGERPYWEMTN
       :::::.::::: ::::::::::::::::: :.:::::::.:.:::::..:::::::.:::
CCDS22 LEDDPDAAYTTTGGKIPIRWTAPEAIAFRTFSSASDVWSFGVVMWEVLAYGERPYWNMTN
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pF1KB4 QDVIKAVEEGYRLPSPMDCPAALYQLMLDCWQKERNSRPKFDEIVNMLDKLIRNPSSLKT
       .:::..::::::::.:: :: ::.:::::::.:.: .::.:..::..:: :::.: ::..
CCDS22 RDVISSVEEGYRLPAPMGCPHALHQLMLDCWHKDRAQRPRFSQIVSVLDALIRSPESLRA
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pF1KB4 LVNAS-CR----VSNLLAEHSPLGSGAYRSVGEWLEAIKMGRYTEIFMENGYSSMDAVAQ
        ...: :     : . .  ..  :.:.  .::.::..:.:::: . :  .::::.  :  
CCDS22 TATVSRCPPPAFVRSCFDLRGGSGGGGGLTVGDWLDSIRMGRYRDHFAAGGYSSLGMVLR
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CCDS22 MNAQDVRALGITLMGHQKKILGSIQTMRAQLTSTQGPRRHL
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CCDS29                      MDCQLSILLLLSCSVLDSFGELIPQPSNEVNLLDSKTIQ
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CCDS29 GELGWISYPSHGWEEISGVDEHYTPIRTYQVCNVMDHSQNNWLRTNWVPRNSAQKIYVEL
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CCDS29 KFTLRDCNSIPLVLGTCKETFNLYYMESDDDHGVKFREHQFTKIDTIAADESFTQMDLGD
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CCDS29 RILKLNTEIREVGPVNKKGFYLAFQDVGACVALVSVRVYFKKCPFTVKNLAMFPDTVP-M
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CCDS29 DSQSLVEVRGSCVNNSKEEDPPRMYCSTEGEWLVPIGKCSCNAGYEERGFMCQACRPGFY
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       ::    ..:.:::::: :.:..: .: ::..::: ..:::.::::::::.:::.:::.::
CCDS29 KALDGNMKCAKCPPHSSTQEDGSMNCRCENNYFRADKDPPSMACTRPPSSPRNVISNINE
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pF1KB4 TSVFLEWIPPADTGGRKDVSYYIACKKCNSHAGVCEECGGHVRYLPRQSGLKNTSVMMVD
       :::.:.:  : ::::::::.. : ::::. .   :: :. .::.:::: :: ::.: ..:
CCDS29 TSVILDWSWPLDTGGRKDVTFNIICKKCGWNIKQCEPCSPNVRFLPRQFGLTNTTVTVTD
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pF1KB4 LLAHTNYTFEIEAVNGVSDLSPGARQYVSVNVTTNQAAPSPVTNVKKGKIAKNSISLSWQ
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CCDS29 LLAHTNYTFEIDAVNGVSELSSPPRQFAAVSITTNQAAPSPVLTIKKDRTSRNSISLSWQ
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pF1KB4 EPDRPNGIILEYEIKYFEK-DQETSYTIIKSKETTITAEGLKPASVYVFQIRARTAAGYG
       ::..::::::.::.::.:: .:::::::.... :..:  .::: ..::::::::::::::
CCDS29 EPEHPNGIILDYEVKYYEKQEQETSYTILRARGTNVTISSLKPDTIYVFQIRARTAAGYG
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pF1KB4 VFSRRFEFETTPVSVAASSDQSQIPVIAVSVTVGVILLAVVIGVLLSGSCCECGCGRASS
       . ::.:::::.: : . :...::. .::.:..:..:::.::: ::.         ::   
CCDS29 TNSRKFEFETSPDSFSISGESSQVVMIAISAAVAIILLTVVIYVLI---------GRF--
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CCDS29 ------------CGY-KSKHGADEKRLHFGNGHLKLPGLRTYVDPHTYEDPTQAVHEFAK
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pF1KB4 EIEASCITIERVIGAGEFGEVCSGRLKLPGKRELPVAIKTLKVGYTEKQRRDFLGEASIM
       :..:. :.:..:.::::::::::::::::.:.:. :::::::::::::::::::::::::
CCDS29 ELDATNISIDKVVGAGEFGEVCSGRLKLPSKKEISVAIKTLKVGYTEKQRRDFLGEASIM
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       :::::::::.::::::::::::::::::::::::.::.:.:.::::::::::::::..::
CCDS29 GQFDHPNIIRLEGVVTKSKPVMIVTEYMENGSLDSFLRKHDAQFTVIQLVGMLRGIASGM
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pF1KB4 KYLSDMGYVHRDLAARNILINSNLVCKVSDFGLSRVLEDDPEAAYTTRGGKIPIRWTAPE
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::
CCDS29 KYLSDMGYVHRDLAARNILINSNLVCKVSDFGLSRVLEDDPEAAYTTRGGKIPIRWTSPE
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pF1KB4 AIAFRKFTSASDVWSYGIVMWEVVSYGERPYWEMTNQDVIKAVEEGYRLPSPMDCPAALY
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CCDS29 AIAYRKFTSASDVWSYGIVLWEVMSYGERPYWEMSNQDVIKAVDEGYRLPPPMDCPAALY
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pF1KB4 QLMLDCWQKERNSRPKFDEIVNMLDKLIRNPSSLKTLVNASCRVSNLLAEHSPLGSGAYR
       :::::::::.::.::::..::..::::::::.::: ...:. : :::: ..: .   ..:
CCDS29 QLMLDCWQKDRNNRPKFEQIVSILDKLIRNPGSLKIITSAAARPSNLLLDQSNVDITTFR
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pF1KB4 SVGEWLEAIKMGRYTEIFMENGYSSMDAVAQVTLE                         
       ..:.::...  ..  :::    ::: :..:... .                         
CCDS29 TTGDWLNGVWTAHCKEIFTGVEYSSCDTIAKISTDDMKKVGVTVVGPQKKIISSIKALET
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CCDS29 QSKNGPVPV
          980   

>>CCDS5031.1 EPHA7 gene_id:2045|Hs108|chr6                (998 aa)
 initn: 4180 init1: 1924 opt: 2004  Z-score: 1162.9  bits: 226.7 E(32554): 1.9e-58
Smith-Waterman score: 4263; 63.8% identity (84.0% similar) in 983 aa overlap (37-1004:6-961)

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