FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB4325, 436 aa 1>>>pF1KB4325 436 - 436 aa - 436 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0457+/-0.000808; mu= 15.4140+/- 0.049 mean_var=105.5102+/-21.407, 0's: 0 Z-trim(110.4): 49 B-trim: 0 in 0/51 Lambda= 0.124861 statistics sampled from 11515 (11564) to 11515 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.725), E-opt: 0.2 (0.355), width: 16 Scan time: 3.290 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS13692.1 PKNOX1 gene_id:5316|Hs108|chr21 ( 436) 2855 524.8 6.7e-149 CCDS68211.1 PKNOX1 gene_id:5316|Hs108|chr21 ( 319) 2063 382.0 4.7e-106 CCDS41730.1 PKNOX2 gene_id:63876|Hs108|chr11 ( 472) 794 153.5 4.1e-37 CCDS42014.1 MEIS2 gene_id:4212|Hs108|chr15 ( 381) 456 92.6 7.4e-19 CCDS45218.1 MEIS2 gene_id:4212|Hs108|chr15 ( 394) 456 92.6 7.6e-19 CCDS10045.1 MEIS2 gene_id:4212|Hs108|chr15 ( 470) 457 92.8 7.7e-19 CCDS46309.1 MEIS1 gene_id:4211|Hs108|chr2 ( 390) 443 90.2 3.8e-18 CCDS10044.1 MEIS2 gene_id:4212|Hs108|chr15 ( 477) 441 89.9 5.7e-18 CCDS74406.1 MEIS3 gene_id:56917|Hs108|chr19 ( 375) 438 89.3 6.9e-18 CCDS45219.1 MEIS2 gene_id:4212|Hs108|chr15 ( 388) 436 89.0 9.1e-18 CCDS45217.1 MEIS2 gene_id:4212|Hs108|chr15 ( 401) 436 89.0 9.3e-18 CCDS45220.1 MEIS2 gene_id:4212|Hs108|chr15 ( 306) 377 78.3 1.2e-14 CCDS46132.1 MEIS3 gene_id:56917|Hs108|chr19 ( 358) 368 76.7 4.2e-14 >>CCDS13692.1 PKNOX1 gene_id:5316|Hs108|chr21 (436 aa) initn: 2855 init1: 2855 opt: 2855 Z-score: 2786.7 bits: 524.8 E(32554): 6.7e-149 Smith-Waterman score: 2855; 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CCDS41 KPFFSDDPELDNLMVKAIQVLRIHLLELEKVNELCKDFCNRYITCLKTKMHSDNLLRNDL 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 pF1KB4 GSPYSPVQ------SQQI----QSAITG-TISPQGIVVPASALQQGNVAMATV-----AG :.:::: : ::.. ....: . .:::::::::::::::.::.:: .: CCDS41 GGPYSPNQPSINLHSQDLLQNSPNSMSGVSNNPQGIVVPASALQQGNIAMTTVNSQVVSG 190 200 210 220 230 240 210 220 230 240 250 260 pF1KB4 GTVYQPVTVVTPQGQVVTQTLSPGTIRIQNSQLQLQLNQDLSILHQDDGSSKNKRGVLPK :..:::::.:: :::::::.. :.:.:::.:..:.:. :.: ..: .:::::::::: CCDS41 GALYQPVTMVTSQGQVVTQAIPQGAIQIQNTQVNLDLT---SLLDNEDKKSKNKRGVLPK 250 260 270 280 290 270 280 290 300 310 320 pF1KB4 HATNVMRSWLFQHIGHPYPTEDEKKQIAAQTNLTLLQVNNWFINARRRILQPMLDSSCSE ::::.::::::::. :::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::.: . CCDS41 HATNIMRSWLFQHLMHPYPTEDEKRQIAAQTNLTLLQVNNWFINARRRILQPMLDASNPD 300 310 320 330 340 350 330 340 350 360 370 380 pF1KB4 -TPKTKKKTAQNRPVQRFWPDSIASGVAQPPPSELTMSEGAVVTITTPVNMNVDSLQSLS .::.:: .:.::.:::::.:::.:: : ..:.. . ..:.:.::::: CCDS41 PAPKAKKIKSQHRPTQRFWPNSIAAGVLQ--------QQGGAPGTNPDGSINLDNLQSLS 360 370 380 390 400 390 400 410 420 430 pF1KB4 SDGATLAVQQVMMAGQSEDESVDSTEED----------------AGALAPAHISGLVLEN ::.::.:.::.::: ..:.:.:.:::. . : ...: : ::. CCDS41 SDSATMAMQQAMMA--AHDDSLDGTEEEDEDEMEEEEEEELEEEVDELQTTNVSDLGLEH 410 420 430 440 450 460 pF1KB4 SDSLQ ::::. CCDS41 SDSLE 470 >>CCDS42014.1 MEIS2 gene_id:4212|Hs108|chr15 (381 aa) initn: 759 init1: 348 opt: 456 Z-score: 452.0 bits: 92.6 E(32554): 7.4e-19 Smith-Waterman score: 749; 41.7% identity (65.3% similar) in 326 aa overlap (54-367:63-373) 30 40 50 60 70 pF1KB4 LKTEQDPNCSEPDAEGVSPPPVESQTPMDVDKQAIYRHPLFPLLALLFEKCEQST----- ::.::: :::::::::.::::: .: CCDS42 HATQHYGAHAPHPNVMPASMGSAVNDALKRDKDAIYGHPLFPLLALVFEKCELATCTPRE 40 50 60 70 80 90 80 90 100 110 120 130 pF1KB4 ---QGSEGTTSASFDVDIENFVRKQEKEGKPFFCEDPETDNLMVKAIQVLRIHLLELEKV :.. .: ::. :: :. :: . ::.: .:: ::::..::::::.:::::::: CCDS42 PGVAGGDVCSSDSFNEDIAVFA-KQVRAEKPLFSSNPELDNLMIQAIQVLRFHLLELEKV 100 110 120 130 140 150 140 150 160 170 180 190 pF1KB4 NELCKDFCSRYIACLKTKMNSETLLSGEPGSPYSPVQSQQIQSAITGTISPQGIVVPASA .::: .:: :::.::: :: . ... . :: : . . .:. . .:.. .: CCDS42 HELCDNFCHRYISCLKGKMPIDLVIDERDGSSKSDHEELSGSSTNLADHNPSSWRDHDDA 160 170 180 190 200 210 200 210 220 230 240 250 pF1KB4 LQQGNVAM-ATVAGGTVYQPVTVVTPQGQVVTQTL-SPGTIRIQNSQLQLQLNQDLSILH . ... . .:: . : . ::. . ... :::: ..: . CCDS42 TSTHSAGTPGPSSGGHASQSGDNSSEQGDGLDNSVASPGT------------GDDDD--P 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 pF1KB4 QDDGSSKNKRGVLPKHATNVMRSWLFQHIGHPYPTEDEKKQIAAQTNLTLLQVNNWFINA . : . ..:::..:: :::.::.:::::. ::::.:..:::.: .:.::.:::::::::: CCDS42 DKDKKRQKKRGIFPKVATNIMRAWLFQHLTHPYPSEEQKKQLAQDTGLTILQVNNWFINA 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 pF1KB4 RRRILQPMLDSSCSETPKTKKKTAQNRPVQRFWPDSIASGVAQP--PPSELTMSEGAVVT ::::.:::.:.: . . . ...:. : :. .: : : . :. : CCDS42 RRRIVQPMIDQSNRAVSQGAAYSPEGQPMGSFVLDGQQHMGIRPAGPMSGMGMNMGMDGQ 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 pF1KB4 ITTPVNMNVDSLQSLSSDGATLAVQQVMMAGQSEDESVDSTEEDAGALAPAHISGLVLEN CCDS42 WHYM 380 >>CCDS45218.1 MEIS2 gene_id:4212|Hs108|chr15 (394 aa) initn: 759 init1: 348 opt: 456 Z-score: 451.8 bits: 92.6 E(32554): 7.6e-19 Smith-Waterman score: 749; 41.7% identity (65.3% similar) in 326 aa overlap (54-367:76-386) 30 40 50 60 70 pF1KB4 LKTEQDPNCSEPDAEGVSPPPVESQTPMDVDKQAIYRHPLFPLLALLFEKCEQST----- ::.::: :::::::::.::::: .: CCDS45 HATQHYGAHAPHPNVMPASMGSAVNDALKRDKDAIYGHPLFPLLALVFEKCELATCTPRE 50 60 70 80 90 100 80 90 100 110 120 130 pF1KB4 ---QGSEGTTSASFDVDIENFVRKQEKEGKPFFCEDPETDNLMVKAIQVLRIHLLELEKV :.. .: ::. :: :. :: . ::.: .:: ::::..::::::.:::::::: CCDS45 PGVAGGDVCSSDSFNEDIAVFA-KQVRAEKPLFSSNPELDNLMIQAIQVLRFHLLELEKV 110 120 130 140 150 160 140 150 160 170 180 190 pF1KB4 NELCKDFCSRYIACLKTKMNSETLLSGEPGSPYSPVQSQQIQSAITGTISPQGIVVPASA .::: .:: :::.::: :: . ... . :: : . . .:. . .:.. .: CCDS45 HELCDNFCHRYISCLKGKMPIDLVIDERDGSSKSDHEELSGSSTNLADHNPSSWRDHDDA 170 180 190 200 210 220 200 210 220 230 240 250 pF1KB4 LQQGNVAM-ATVAGGTVYQPVTVVTPQGQVVTQTL-SPGTIRIQNSQLQLQLNQDLSILH . ... . .:: . : . ::. . ... :::: ..: . CCDS45 TSTHSAGTPGPSSGGHASQSGDNSSEQGDGLDNSVASPGT------------GDDDD--P 230 240 250 260 270 260 270 280 290 300 310 pF1KB4 QDDGSSKNKRGVLPKHATNVMRSWLFQHIGHPYPTEDEKKQIAAQTNLTLLQVNNWFINA . : . ..:::..:: :::.::.:::::. ::::.:..:::.: .:.::.:::::::::: CCDS45 DKDKKRQKKRGIFPKVATNIMRAWLFQHLTHPYPSEEQKKQLAQDTGLTILQVNNWFINA 280 290 300 310 320 330 320 330 340 350 360 370 pF1KB4 RRRILQPMLDSSCSETPKTKKKTAQNRPVQRFWPDSIASGVAQP--PPSELTMSEGAVVT ::::.:::.:.: . . . ...:. : :. .: : : . :. : CCDS45 RRRIVQPMIDQSNRAVSQGAAYSPEGQPMGSFVLDGQQHMGIRPAGPMSGMGMNMGMDGQ 340 350 360 370 380 390 380 390 400 410 420 430 pF1KB4 ITTPVNMNVDSLQSLSSDGATLAVQQVMMAGQSEDESVDSTEEDAGALAPAHISGLVLEN CCDS45 WHYM >>CCDS10045.1 MEIS2 gene_id:4212|Hs108|chr15 (470 aa) initn: 759 init1: 348 opt: 457 Z-score: 451.8 bits: 92.8 E(32554): 7.7e-19 Smith-Waterman score: 750; 40.8% identity (64.5% similar) in 338 aa overlap (54-380:76-395) 30 40 50 60 70 pF1KB4 LKTEQDPNCSEPDAEGVSPPPVESQTPMDVDKQAIYRHPLFPLLALLFEKCEQST----- ::.::: :::::::::.::::: .: CCDS10 HATQHYGAHAPHPNVMPASMGSAVNDALKRDKDAIYGHPLFPLLALVFEKCELATCTPRE 50 60 70 80 90 100 80 90 100 110 120 130 pF1KB4 ---QGSEGTTSASFDVDIENFVRKQEKEGKPFFCEDPETDNLMVKAIQVLRIHLLELEKV :.. .: ::. :: :. :: . ::.: .:: ::::..::::::.:::::::: CCDS10 PGVAGGDVCSSDSFNEDIAVFA-KQVRAEKPLFSSNPELDNLMIQAIQVLRFHLLELEKV 110 120 130 140 150 160 140 150 160 170 180 190 pF1KB4 NELCKDFCSRYIACLKTKMNSETLLSGEPGSPYSPVQSQQIQSAITGTISPQGIVVPASA .::: .:: :::.::: :: . ... . :: : . . .:. . .:.. .: CCDS10 HELCDNFCHRYISCLKGKMPIDLVIDERDGSSKSDHEELSGSSTNLADHNPSSWRDHDDA 170 180 190 200 210 220 200 210 220 230 240 250 pF1KB4 LQQGNVAM-ATVAGGTVYQPVTVVTPQGQVVTQTL-SPGTIRIQNSQLQLQLNQDLSILH . ... . .:: . : . ::. . ... :::: ..: CCDS10 TSTHSAGTPGPSSGGHASQSGDNSSEQGDGLDNSVASPGTGD----------DDD----P 230 240 250 260 270 260 270 280 290 300 310 pF1KB4 QDDGSSKNKRGVLPKHATNVMRSWLFQHIGHPYPTEDEKKQIAAQTNLTLLQVNNWFINA . : . ..:::..:: :::.::.:::::. ::::.:..:::.: .:.::.:::::::::: CCDS10 DKDKKRQKKRGIFPKVATNIMRAWLFQHLTHPYPSEEQKKQLAQDTGLTILQVNNWFINA 280 290 300 310 320 330 320 330 340 350 360 370 pF1KB4 RRRILQPMLDSSCSETPKTKKKTAQNRPVQRFWPDSIAS-GVAQPPPSELTMSEGAVVTI ::::.:::.:.: . . . ...:. : :. :. :. : : :. CCDS10 RRRIVQPMIDQSNRAVSQGAAYSPEGQPMGSFVLDGQQHMGIR---PAGLQSMPGDYVSQ 340 350 360 370 380 380 390 400 410 420 430 pF1KB4 TTPVNMNVDSLQSLSSDGATLAVQQVMMAGQSEDESVDSTEEDAGALAPAHISGLVLENS :..:.. CCDS10 GGPMGMSMAQPSYTPPQMTPHPTQLRHGPPMHSYLPSHPHHPAMMMHGGPPTHPGMTMSA 390 400 410 420 430 440 >>CCDS46309.1 MEIS1 gene_id:4211|Hs108|chr2 (390 aa) initn: 756 init1: 348 opt: 443 Z-score: 439.2 bits: 90.2 E(32554): 3.8e-18 Smith-Waterman score: 750; 39.4% identity (65.5% similar) in 368 aa overlap (11-367:32-382) 10 20 30 40 pF1KB4 MMATQTLSIDSYQDGQQMQVVTELKTEQDPNCSEPDAEGV :.: .... :...: :. .. .: . CCDS46 AQRYDDLPHYGGMDGVGIPSTMYGDPHAARSMQPVHHLNHGPPLHSHQYPHTAHTNA--M 10 20 30 40 50 50 60 70 80 90 pF1KB4 SPPPVES-QTPMDVDKQAIYRHPLFPLLALLFEKCEQST--------QGSEGTTSASFDV .: : . . ::.::: :::::::::.::::: .: :.. .: ::. CCDS46 APSMGSSVNDALKRDKDAIYGHPLFPLLALIFEKCELATCTPREPGVAGGDVCSSESFNE 60 70 80 90 100 110 100 110 120 130 140 150 pF1KB4 DIENFVRKQEKEGKPFFCEDPETDNLMVKAIQVLRIHLLELEKVNELCKDFCSRYIACLK :: :. :: . ::.: .:: ::::..::::::.::::::::.::: .:: :::.::: CCDS46 DIAVFA-KQIRAEKPLFSSNPELDNLMIQAIQVLRFHLLELEKVHELCDNFCHRYISCLK 120 130 140 150 160 170 160 170 180 190 200 210 pF1KB4 TKMNSETLLSGEPGSPYSPVQSQQIQSAITGTISPQGIVVPASALQQGNVAMATVAGGTV :: . ... . :. : .:..: ..... : :. .. ..: .: .::: CCDS46 GKMPIDLVIDDREGGSKS--DSEDITR--SANLTDQ----PSWNRDHDDTA-STRSGGTP 180 190 200 210 220 220 230 240 250 260 270 pF1KB4 YQPVTVVTPQGQVVTQTLSPGTIRIQNSQLQLQLNQDLSILHQDDGSSKNKRGVLPKHAT : .. .. . : ..:: . . ..: . . : . ..:::..:: :: CCDS46 GPSSGGHTSHSGDNSSEQGDG---LDNSVASPSTGDDDD--PDKDKKRHKKRGIFPKVAT 230 240 250 260 270 280 280 290 300 310 320 330 pF1KB4 NVMRSWLFQHIGHPYPTEDEKKQIAAQTNLTLLQVNNWFINARRRILQPMLDSSCSETPK :.::.:::::. ::::.:..:::.: .:.::.::::::::::::::.:::.:.: . . CCDS46 NIMRAWLFQHLTHPYPSEEQKKQLAQDTGLTILQVNNWFINARRRIVQPMIDQSNRAVSQ 290 300 310 320 330 340 340 350 360 370 380 pF1KB4 TKKKTAQNRPVQRFWPDSIAS-GVAQPPP-SELTMSEGAVVTITTPVNMNVDSLQSLSSD . ...:. : :. :. : : : . :. : CCDS46 GTPYNPDGQPMGGFVMDGQQHMGIRAPGPMSGMGMNMGMEGQWHYM 350 360 370 380 390 390 400 410 420 430 pF1KB4 GATLAVQQVMMAGQSEDESVDSTEEDAGALAPAHISGLVLENSDSLQ >>CCDS10044.1 MEIS2 gene_id:4212|Hs108|chr15 (477 aa) initn: 759 init1: 348 opt: 441 Z-score: 436.1 bits: 89.9 E(32554): 5.7e-18 Smith-Waterman score: 734; 40.6% identity (64.3% similar) in 345 aa overlap (54-380:76-402) 30 40 50 60 70 pF1KB4 LKTEQDPNCSEPDAEGVSPPPVESQTPMDVDKQAIYRHPLFPLLALLFEKCEQST----- ::.::: :::::::::.::::: .: CCDS10 HATQHYGAHAPHPNVMPASMGSAVNDALKRDKDAIYGHPLFPLLALVFEKCELATCTPRE 50 60 70 80 90 100 80 90 100 110 120 130 pF1KB4 ---QGSEGTTSASFDVDIENFVRKQEKEGKPFFCEDPETDNLMVKAIQVLRIHLLELEKV :.. .: ::. :: :. :: . ::.: .:: ::::..::::::.:::::::: CCDS10 PGVAGGDVCSSDSFNEDIAVFA-KQVRAEKPLFSSNPELDNLMIQAIQVLRFHLLELEKV 110 120 130 140 150 160 140 150 160 170 180 190 pF1KB4 NELCKDFCSRYIACLKTKMNSETLLSGEPGSPYSPVQSQQIQSAITGTISPQGIVVPASA .::: .:: :::.::: :: . ... . :: : . . .:. . .:.. .: CCDS10 HELCDNFCHRYISCLKGKMPIDLVIDERDGSSKSDHEELSGSSTNLADHNPSSWRDHDDA 170 180 190 200 210 220 200 210 220 230 240 250 pF1KB4 LQQGNVAM-ATVAGGTVYQPVTVVTPQGQVVTQTL-SPGTIRIQNSQLQLQLNQDLSILH . ... . .:: . : . ::. . ... :::: ..: CCDS10 TSTHSAGTPGPSSGGHASQSGDNSSEQGDGLDNSVASPGTGD----------DDD----P 230 240 250 260 270 260 270 280 290 300 310 pF1KB4 QDDGSSKNKRGVLPKHATNVMRSWLFQHIGHPYPTEDEKKQIAAQTNLTLLQVNNWFINA . : . ..:::..:: :::.::.:::::. ::::.:..:::.: .:.::.:::::::::: CCDS10 DKDKKRQKKRGIFPKVATNIMRAWLFQHLTHPYPSEEQKKQLAQDTGLTILQVNNWFINA 280 290 300 310 320 330 320 330 340 350 360 pF1KB4 RRRILQPMLDSSCSE----TPKTKKKTA---QNRPVQRFWPDSIAS-GVAQPPPSELTMS ::::.:::.:.: :.... .: ...:. : :. :. :. : CCDS10 RRRIVQPMIDQSNRAGFLLDPSVSQGAAYSPEGQPMGSFVLDGQQHMGIR---PAGLQSM 340 350 360 370 380 370 380 390 400 410 420 pF1KB4 EGAVVTITTPVNMNVDSLQSLSSDGATLAVQQVMMAGQSEDESVDSTEEDAGALAPAHIS : :. :..:.. CCDS10 PGDYVSQGGPMGMSMAQPSYTPPQMTPHPTQLRHGPPMHSYLPSHPHHPAMMMHGGPPTH 390 400 410 420 430 440 >>CCDS74406.1 MEIS3 gene_id:56917|Hs108|chr19 (375 aa) initn: 717 init1: 350 opt: 438 Z-score: 434.6 bits: 89.3 E(32554): 6.9e-18 Smith-Waterman score: 718; 39.8% identity (64.6% similar) in 342 aa overlap (42-365:45-365) 20 30 40 50 60 70 pF1KB4 YQDGQQMQVVTELKTEQDPNCSEPDAEGVSPPPVESQTPMDVDKQAIYRHPLFPLLALLF :: ..:. . .:. :: :::::::::.: CCDS74 VDGPAALASFPETVPAVPGPYGPHRPPQPLPPGLDSDG-LKREKDEIYGHPLFPLLALVF 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KB4 EKCEQST--------------QGSEGTTSASFDVDIENFVRKQEKEGKPFFCEDPETDNL :::: .: :.. .: ::. :: :. :: . .:.: .:: ::: CCDS74 EKCELATCSPRDGAGAGLGTPPGGDVCSSDSFNEDIAAFA-KQVRSERPLFSSNPELDNL 80 90 100 110 120 130 120 130 140 150 160 170 pF1KB4 MVKAIQVLRIHLLELEKVNELCKDFCSRYIACLKTKMNSETLLSGEPGSPYSPVQSQQIQ :..::::::.::::::::..:: .:: :::.::: :: . .. . :. .. CCDS74 MIQAIQVLRFHLLELEKVHDLCDNFCHRYITCLKGKMPIDLVIEDRDGGCREDFEDY--- 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KB4 SAITGTISPQGIVVPASALQQGNVAMAT---VAGGTVYQPVTVVTPQGQVV-TQTLSPGT : .. :. . . ..:.: ..: .:: . : . ::. . :.. ::.. CCDS74 PASCPSLPDQNNMWIRDHEDSGSVHLGTPGPSSGGLASQSGDNSSDQGDGLDTSVASPSS 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KB4 IRIQNSQLQLQLNQDLSILHQDDGSSKNKRGVLPKHATNVMRSWLFQHIGHPYPTEDEKK ... ..::. :. .: :::..:: :::.::.:::::..::::.:..:: CCDS74 ----GGE-----DEDLD---QERRRNK-KRGIFPKVATNIMRAWLFQHLSHPYPSEEQKK 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KB4 QIAAQTNLTLLQVNNWFINARRRILQPMLDSSCSETPKTKKKTAQNRPVQRFWPDSIASG :.: .:.::.::::::::::::::.:::.:.: ..: . . ...:. . CCDS74 QLAQDTGLTILQVNNWFINARRRIVQPMIDQS-NRTGQGAAFSPEGQPIGGY--TETQPH 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KB4 VAQPPPSELTMSEGAVVTITTPVNMNVDSLQSLSSDGATLAVQQVMMAGQSEDESVDSTE :: ::. . :: CCDS74 VAVRPPGSVGMSLNLEGEWHYL 360 370 >>CCDS45219.1 MEIS2 gene_id:4212|Hs108|chr15 (388 aa) initn: 759 init1: 348 opt: 436 Z-score: 432.4 bits: 89.0 E(32554): 9.1e-18 Smith-Waterman score: 733; 41.4% identity (65.2% similar) in 333 aa overlap (54-367:63-380) 30 40 50 60 70 pF1KB4 LKTEQDPNCSEPDAEGVSPPPVESQTPMDVDKQAIYRHPLFPLLALLFEKCEQST----- ::.::: :::::::::.::::: .: CCDS45 HATQHYGAHAPHPNVMPASMGSAVNDALKRDKDAIYGHPLFPLLALVFEKCELATCTPRE 40 50 60 70 80 90 80 90 100 110 120 130 pF1KB4 ---QGSEGTTSASFDVDIENFVRKQEKEGKPFFCEDPETDNLMVKAIQVLRIHLLELEKV :.. .: ::. :: :. :: . ::.: .:: ::::..::::::.:::::::: CCDS45 PGVAGGDVCSSDSFNEDIAVFA-KQVRAEKPLFSSNPELDNLMIQAIQVLRFHLLELEKV 100 110 120 130 140 150 140 150 160 170 180 190 pF1KB4 NELCKDFCSRYIACLKTKMNSETLLSGEPGSPYSPVQSQQIQSAITGTISPQGIVVPASA .::: .:: :::.::: :: . ... . :: : . . .:. . .:.. .: CCDS45 HELCDNFCHRYISCLKGKMPIDLVIDERDGSSKSDHEELSGSSTNLADHNPSSWRDHDDA 160 170 180 190 200 210 200 210 220 230 240 250 pF1KB4 LQQGNVAM-ATVAGGTVYQPVTVVTPQGQVVTQTL-SPGTIRIQNSQLQLQLNQDLSILH . ... . .:: . : . ::. . ... :::: ..: . CCDS45 TSTHSAGTPGPSSGGHASQSGDNSSEQGDGLDNSVASPGT------------GDDDD--P 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 pF1KB4 QDDGSSKNKRGVLPKHATNVMRSWLFQHIGHPYPTEDEKKQIAAQTNLTLLQVNNWFINA . : . ..:::..:: :::.::.:::::. ::::.:..:::.: .:.::.:::::::::: CCDS45 DKDKKRQKKRGIFPKVATNIMRAWLFQHLTHPYPSEEQKKQLAQDTGLTILQVNNWFINA 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KB4 RRRILQPMLDSSCSE----TPKTKKKTA---QNRPVQRFWPDSIASGVAQP--PPSELTM ::::.:::.:.: :.... .: ...:. : :. .: : : . : CCDS45 RRRIVQPMIDQSNRAGFLLDPSVSQGAAYSPEGQPMGSFVLDGQQHMGIRPAGPMSGMGM 320 330 340 350 360 370 370 380 390 400 410 420 pF1KB4 SEGAVVTITTPVNMNVDSLQSLSSDGATLAVQQVMMAGQSEDESVDSTEEDAGALAPAHI . : CCDS45 NMGMDGQWHYM 380 436 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Thu Nov 3 14:46:18 2016 done: Thu Nov 3 14:46:19 2016 Total Scan time: 3.290 Total Display time: 0.050 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]